4C23A

L-fuculose kinase
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
473
structure length
473
Chain Sequence
LVPRGSHEAVLAIDLGATSGRAIVGYLSENKLVMEEINRFSNLPIRVKGHLSWDIDFLLAKILESIRLANTSYKILSIGIDTWGVDFGLIDNEGKLLLQPVHYRDERTKGVLKEISEMTELEKLYSETGNQIMEINTLFQLFKARQESPDSFYKTNKILLMPDLFNYLLTGKFATEKSIASTTQLFDPRSQNWNQNILKLFELDSSLLPEIVSEGNVLGRIKEEYGLGDIPVVNVCSHDTASAIVSVPKTEGSLFISSGTWSLVGVELTSPILTTESFSYGFTNEVGKDGVITFLKNCTGLWIIEELRRSFERRGKAYSFDDIRTMVEKEKENLPLIDTESTEFATESDMHKTLTEYLAYHHETREWTDGQLFKIVYESLAETYRKAIELLEELTHKVYKRIYVIGGGARASYFNQMIADRTGKEVLTGLTEATAVGNIVVQLIAMGQLKGMEEAHHVIEEFLQLESYYSQKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural and Functional Analysis of Fucose-Processing Enzymes from Streptococcus Pneumoniae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords L-FUCULOSE KINASE FUCK
molecule tags Transferase
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 167
structure length 473
sequence length 473
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.51: L-fuculokinase.
pdb deposition date 2013-08-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4c23A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4c23A02
3QFUA 3AARA 3ZX2A 3H6EA 5LJWA 3D7EO 2FSNA 3VOVA 2ASMA 1BWFO 5E84A 3VEOA 1ZXOA 4BRKA 3U8XA 1NGFA 4H03B 3MK6A 1Z6RA 4CBUA 3CERA 3ZEUB 4JHDB 2CH6A 4H5NA 5BPMA 4DHYA 5BRFA 5KPRA 3EO3A 4H0TB 2P9UB 1HLUA 3L6QA 3EN9A 2D0PA 4XEIA 3WXLA 1ESVA 3ENOA 3ULEA 4A2BA 3WXIA 4CBWA 2A42A 4YDUC 2V52B 5AQGA 2Q0RA 3O4WA 3UKUB 4BRAA 5B8HA 3D2FA 1MA9B 3F9MA 5AQPA 5E26A 1TUUA 4FWSA 5LJVA 5AQXA 3HI0A 1NBWA 3FZHA 1GLDG 1NGEA 3W0LA 3FGUA 3KHYA 4H5TA 2QM1A 3GG4A 3BF1A 5BPNA 4BC4A 2Q31A 4QS9A 2E8AA 1T6CA 2PBDA 3O5BA 4NO7A 3KVGA 4WQ5A 5AQFA 4C23A 2QWQA 4FWNA 1Y64A 1T44A 2QXLA 1QZ6A 4PKGA 2A5XA 5KPZA 1E4FT 2QWMA 3A5NC 5FPNA 4FWRA 2NLXA 1NWKA 4XH1A 3O80A 2GWJA 2GWKA 3VF6A 4ISFA 3LDPA 3AY9A 2HMPA 2Q97A 5AQQA 4FOIA 1IJJA 1YXQA 4PL8A 3CJBA 3OHRA 5JLFA 3R9PA 3QFPA 5AQTA 3GOIA 4A2AA 3WEEB 2D1KA 4BRCA 4FO0A 4A62A 3RSEA 3KZBA 2OANA 5LY3A 2A3ZA 1NGBA 1R59O 5AR0A 4M7XA 4AM6A 2CGKA 4JD2B 5BR9A 3VGKA 2HOEA 3VEXA 2YHYA 2Q0UA 3CHWA 1GLLO 5AQNA 1BU6O 5AQUA 5AZIA 2Q1NA 2GEMA 1NGDA 1GLJO 1T6DA 2QWOA 4LC9B 2DPNA 2V51B 2Q2RA 5KQDA 1HUXA 1SQKA 3EKSA 3H46O 4FSVA 5FPDA 3EL2A 5AQJA 2BTFA 4EFHA 3GL1A 5AQVA 4EHUA 1K8KA 5AFUA 2CGJA 4EHTA 4K42A 4B1VA 4MLEA 1U6ZA 5I9EB 4BRIA 2V7YA 5JLHA 3MN7A 2NZTA 4BGBA 5BRDA 2GTDA 1C0FA 1V4SA 3WXJA 4AM7A 1KAYA 1MDUB 2ZWHA 5AQHA 3D2EB 1HKGA 4BRMA 2W41A 1J6ZA 2F9TA 3MMVA 3H1QA 1S3XA 1E4GT 3TU5A 3CJ1A 1TYQA 3ZEUA 4FWKA 3BUZB 1HPMA 4JHDA 3JS6A 3FFKB 4MO4A 3ENHA 5AZJB 3ZETB 1BOTO 4F9OA 3DXMB 4BC2A 3VEZA 4B9QA 4A61A 4BRLA 4BREA 5BPLA 4BRHA 3FE1A 3CJ9A 2PAVA 3CIPA 3FLCO 4XH4A 3GBTA 5EXWA 3C7NB 3VF2A 1SAZA 3EKUA 3QDKA 4BRPA 1BG3A 1NM1A 3MN6A 5AQMA 4BR7A 3HSCA 2CGLA 1NGJA 3ID8A 3O08A 3AAQA 2YI1A 4M7YA 5FPEA 2FSJA 3IFRA 4BG9A 1Z05A 4IJAA 2E2PA 4RCHA 1NGIA 4I6MB 5KQ8A 1X3NA 5EX5A 1HJOA 1MWKA 2IIRA 3SMSA 1V4TA 2E2NA 4DB3A 4BGAA 1H1VA 4BQLA 2ASPA 2A40A 4CD3A 3WT0A 5AQIA 2YCHA 2F9WA 2P9IA 4CZHA 3VGMA 1ATNA 4QS7A 2J4RA 4CZIA 3UE5A 4FOEA 2P9KB 3ATVA 3DAWA 4BRGA 2WUSA 3MN5A 3S41A 4BRFA 3H3NO 3FZMA 1ATSA 2IVPA 3MDQA 1XUPO 3DWLA 3I33A 2P9PB 3MN9A 3ULEB 2QWPA 4H0VB 3TPQA 3H3OB 3H45C 4CZJA 1QQMA 1IG8A 2KHOA 3UKRB 4WQ5C 3GDQA 4H5WA 3D2FB 2V7ZA 3LDOA 1D4XA 1LCUA 3SK3A 2H3GX 4BRDA 5AQWA 1QQNA 2ZGZA 2QWRA 1NGAA 2A41A 2P9LB 2FXUA 1U2VA 2I7NA 3JXUA 1YAGA 3A5MC 3WUHA 3VGLA 5FPMA 4BRNA 2IVOA 5AFUH 3VENA 3LL3A 3LM9A 1LOTB 1BA1A 2P9NA 3ZX3A 4H5RA 1ZBSA 3W3DA 4WQ4A 3VESA 4ISEA 1C0GA 1GLBG 1RFQA 4RWTA 3L4IA 1WOQA 3QMLA 4WYBA 4B1YB 3M3ZA 5AQRA 4H0XB 1Q18A 3J8AA 4FWQA 1BO5O 4BVOA 5AQYA 4EIAA 2P9SA 4EAHD 5JMVA 5AQOA 3O6WA 4CD1A 4O5FA 4J8FA 4K25A 3RSEB 2FSKA 3DXKB 2ASOA 4BG8A 3EZWA 1YVNA 5JICA 5CE3A 4B1XB 3SMPA 2FLOA 4O8KA 4BC3A 2E2QA 1HKCA 3VPZA 3IUCA 1P8ZA 3CJ7A 2GELA 1QHAA 5F2RA 4QS8A 3CETA 2HF3A 4FL9A 4BC5A 5BN8A 4HTLA 4BR0A 3P4IA 2UYTA 1S22A 4IZ9A 1CZAN 3CQYA 1JCGA 2P9UA 2W40A 3O1BA 4BVPA 1XQSC 3C0BA 4BRQA 1GLEG 3ATUA 4DQ8A 1BUPA 3UB5A 4CJ7A 5EY4A 3A0IX 2EWSA 2YHWA 1KAXA 4IO8A 3BF3A 4K41A 3UKUA 2D0OA 2ITMA 4B1WB 3L0QA 4Z94A 4FWMA 4HWIA 3HM8A 3WQTA 3FZKA 3FZLA 3U9ZA 1JCEA 3BEXA 5ADXA 2BUPA 5F1XA 2CH5A 2FF6A 1DGKN 4H0YB 2IVNA 1TYQB 3GE1A 4YDUA 4BR2A 2E2OA 3ZX0A 4FWOA 3CJAA 2P9KA 4JNEA 2FF3B 5EVZA 3O8MA 4H5VA 3SJHA 1ATRA 2P9PA 1X3MA 1GLFO 1OKJA 3VEYA 3CQXA 2ZGYA 3B8AX 3UKRA 2I7PA 1JCFA 4MLHA 4FWLA 4L3QA 3I8BA 1NMDA 2VYPA 3A8YA 3IDHA 2P9LA 2VCPA 2E1YA 3QBXA 3WEEA 5AQLA 1YUWA 4JN4A 4XH5A 5TKYA 4B1UB 4CZFA 3G25A 4FWPA 1QQOA 3A5LC 4JD2A 3U9DA 1HKBA 4NB4A 3HZ6A 2GUPA 2P9IB 4Y0WA 2AA4A 4GNIA 1RGIA 2QWNA 2NRHA 1SZ2A 4FPBA 4CZLA 3VF4A 4BR5A 2QW9A 4BQZA 5BN9A 2Q36A 2E1ZA 5BRHA 3O1WA 4BROA 3VEVA 3A5OC 1BA0A 1HX1A 2VWBA 2A6AA 3VETA 3BP8A 5F0XA 4H0PA 4DCHA 1KAZA 1X9JA 1TUYA 4CI6A 1DKGD 3H1VX 1EQYA 3DXKA 1NLVA 4RTFD 3LDNA 2HF4A 3CI5A 3WXKA 4WQ4C 4E1JA 4H0OA 4B1ZA 1NGCA 3M6GA 4JAXA 4PKIA 1DEJA 1U2VB 1KXPA 3CJCA 4BR4A 3AAPA 3FZFA 4CBXA 3D2EA 5AQKA 5BREA 3FR0A 4PKHA 1QZ5A 5ELZA 2ZF5O 3LDLA 2YJEA 3SLCA 4IXCA 4M63C 1GLCG 3IMXA 1BDGA 1RDWX 3QB0A 2QWLA 4CZMA 1XC3A 2P9NB 3ZETA 5AZJA 2AP1A 2E20A 3R8EA 3DXMA 4PL7A 1NGHA 3HTVA 5EOYA 3MCPA 5AZIB 3QICA 4ISGA 1MWMA 2YJFA 3LDQA 4IWVA 3VEWA 4BR9A 3HBTA 2YHXA 1GLAG 5ADXH 3C7NA 1WUAA 3LM2A 1NGGA 3R6MA 4FPAA 5AQSA 4IJNA 4MO5A 2D4WA 4CZGA 1ZC6A 2P9SB 3U4LA 1K8KB 3VERA 3M1FA 1G99A 5KPTA 3WQUA 3DJCA 4KBOA 3QBWA 5AQZA 4CZEA 4CZKA 2E88A 4I6MA 4GY2B 4K43A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OJRA 3DLKA 4AQYK 3MXMA 4JV5K 2FSNA 4WE1A 5HLFA 4AHVA 5C25A 1BWFO 3L2VA 3A2FA 4IOAL 1KFSA 1RCHA 4H03B 3MK6A 3CERA 3ZEUB 3VTHA 4JHDB 1I94K 1XWLA 4F2RA 3KJVA 5LMNK 3K9JA 2P9UB 2G8KA 1S9EA 4M3XA 4IOCL 2D0PA 3WXLA 4N41A 1ESVA 3MX2A 4CK1A 3QEIA 3SZ2A 1F21A 3UKUB 5B8HA 1QSYA 3RR7A 3LANA 3SUNA 4Z0UA 3K5NA 4FW2A 3TAFA 3J81O 5BPNA 3AVNA 4CEZA 2Q31A 3O5BA 3TTDA 2WOMA 4FK2A 4KHUA 4HCCA 1KQSM 1CZ9A 4CW7B 1YJWN 4OPHA 3SAGA 1VQ5N 4OX9K 5KPZA 1TAUA 2QWMA 4NYNA 1NWKA 4XH1A 2GWKA 4FJGA 4ISFA 4JK9A 3V1OA 1N8RO 2Q97A 4CJUA 1YXQA 2DY4A 4PL8A 4PQUA 3SUQA 1EWRA 3WEEB 3V9XA 2D1KA 3HJFA 3M8PA 3JAMO 2OZMA 1NGBA 3L2QA 5AR0A 4M7XA 4MQ3A 1RBVA 3NCIA 3O4NA 4HUFA 2YHYA 2AJQA 2XRIA 3VQ9A 3BDPA 1OVYA 1NGDA 3J7ZO 1L3VA 3KKSA 4CJTA 2V51B 4EP4A 2QKKA 5KQDA 4WFAL 3EKSA 4FSVA 3EL2A 3IG1A 1OVQA 4EHTA 2KZMA 2EX3A 5I9EB 4BRIA 1WBDA 2IDOA 3DOKA 3AA2A 4XIUA 5J1EA 3AO5A 4OPAA 1RT7A 4DV5K 3F2KA 1MDUB 2ZWHA 5AQHA 1RDAA 2W41A 4BRMA 4CFBA 1J6ZA 3LP2A 3S3OA 3O9SA 3H1QA 1S3XA 1E4GT 3TU5A 3CJ1A 1TYQA 3BUZB 1HPMA 1BQMA 4M41A 3ISNC 4KTZA 2WC9A 4PUOA 4B9QA 3KIOA 4BRLA 3T1YK 2YHBA 3AGRA 3CJ9A 1RNHA 3CQ8A 4GKKK 4DTRA 4DF4A 3AVLA 3SPZA 3VF2A 1O13A 3EKUA 3SBTA 4B8CA 4YOUA 1NM1A 5J2NA 1O1WA 4BR7A 5I42A 3MWTA 1KLMA 1SKWA 3AVBA 5KRSA 1RDBA 3O08A 3AAQA 5FPEA 1XC9A 3L2RA 2YV0X 4EZ6A 3L2WA 3THXA 4IBNA 3TI0A 4X65K 3THYB 4ID1A 2PYLA 1HNVA 2IS3A 2IIRA 2UUBK 4RW6A 2E2NA 4DS5A 3I56N 2HHSA 3DLGA 2VG5A 2A40A 3D45A 2IAJA 3BZKA 2F9WA 2P9IA 3VGMA 3O3HA 4KHPK 2JGUA 4QS7A 4A5AA 2F7TA 1FKPA 1UA1A 4B8AB 4BRGA 2YNGA 4BRFA 4CJSA 1XUPO 3DWLA 3I33A 1VSJA 3ULEB 3E9LA 3H45C 1X9WA 1Q86O 1D9FA 1IG8A 3V9ZA 1IKXA 2V7ZA 3D2FB 2ITGA 1D4XA 3SK3A 4BRDA 1IKVA 4A59A 1QQNA 4CFDA 3QESA 5E41A 2XY8A 3A5MC 4E7KA 1E3MA 1S1VA 3L2UA 5GAGP 2IVOA 1ZBUA 2P9NA 1B92A 1U4BA 5C24A 1IO2A 1KVAA 1IV0A 1ZBSA 3D6RA 3QIPA 5H1SQ 3EE9A 1C0GA 2NUBA 4KV8A 3JYTA 1GLBG 1EXQA 5C42A 1VQON 1WOQA 4WYBA 4B1YB 1N5YA 1VRUA 5AQRA 4BE1A 3SI6A 3J8AA 2O8EA 4FWQA 4KTQA 1WAJA 2QI2A 4BVOA 4CEQA 3N4QA 4I2QA 4JRPA 1LAWA 4J8FA 2G8HA 1DTQA 1BISA 3P39A 4KI6A 3OYFA 2X74A 1M1KO 3SMPA 4YOXA 3QNNA 1VSFA 1SUQA 4CHNA 2OTJN 2NRWA 2UXDK 3QIOA 3V1QA 3AVCA 3G71N 5BN8A 4BC5A 3TAPA 4HTLA 3VQAA 4NCBA 2UYTA 1S22A 1CZAN 4F3TA 3P31A 1M90O 2P9UA 3L3UA 3O1BA 4KH5A 1XHXA 4OPJA 3T7ZA 2A1RA 3KK7A 4HHTA 4B3TK 3PLAA 1RT1A 4IO8A 3OYLA 4YORA 3UKUA 1VHXA 4KTWA 4LH4A 4PWDA 3L0QA 1WB9A 2WBNA 4FJ9A 4FWMA 3TAEA 1WSGA 3OA9A 1JCEA 1VSHA 5ADXA 1NKCA 4B9TA 1RT3A 4X66K 3P5JA 4CJ3A 2W42A 3ZX0A 4FVUA 4FWOA 2GUIA 1K6YA 5EVZA 4JKEA 1X3MA 1GLFO 1WBBA 3VEYA 1C1BA 5HROA 2I7PA 2VWKA 3THWB 5HOOA 3P83D 4FWLA 4MLHA 5FRNA 2O4IA 3A8YA 3IDHA 3AVJA 3WEEA 3QBXA 1VRTA 4O44A 3AO1A 3KD1E 4O0JA 4LH5A 3SNNA 5TKYA 2HHQA 3AVHA 4N56A 4B1UB 3CF5L 4CZFA 4ZTJA 4M45A 1YT3A 4JI2K 3K59A 2GUPA 1SZ2A 4FPBA 1QSSA 1GOAA 5K14A 5D3GA 4DR2K 3O1WA 3A5OC 1YTUA 5FRMA 4GV3A 2A6AA 2JWLA 1S6PA 1NNEA 1X9JA 5J2PA 1TUYA 1Q9XA 4ILJA 4FZZA 3CYMA 3F9KA 1IKYA 1NGCA 4E89A 3QLHA 4PKIA 1VK0A 1KXPA 4CF8A 4CBXA 3KK1A 5BREA 3NH1A 4FLYA 1BGXT 2HBLA 3LDLA 3NVMA 4M63C 3AA5X 3C6AA 4FJKA 3PUFA 4Q0BA 1HPZA 4PL7A 1FXXA 3MCPA 1K8AO 2GX9A 4ISGA 3ZT1A 3ZT0A 1HQUA 2YHXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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