4CEO | Genus

Total Genus 57

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	57
sequence length	153
structure length	149
Chain Sequence	SPGIWQLDCTHLEGKVILVAVHVASGYIEAEVIPAETGQETAYFLLKLAGRWPVKTVHTDNGSNFTSTTVKAACWWAGIKQEDGIPYNPQSQGVIESMNKELKKIIGQVRDQAEHLKTAVQMAVFIHNHKRKGYSAGERIVDIIATDIQ

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__998742788013725__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__998742788013725__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/4CEO/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__998742788013725__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"998742788013725","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/4CEO/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__998742788013725__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

Viewer cachePut cache://localLOAD_/file/5d039d0516de1128b5985601/pdb.gz

Viewer cachePut https://genus.fuw.edu.pl/file/5d039d0516de1128b5985601/pdb.gz

FileManager.getAtomSetCollectionFromFile(/file/5d039d0516de1128b5985601/pdb.gz)

loadScript /static/js/j2s/core/corezip.z.js

The Resolver thinks Pdb

loadScript /static/js/j2s/core/corebio.z.js

Time for openFile(/file/5d039d0516de1128b5985601/pdb.gz): 90 ms

reading 149 atoms

ModelSet: haveSymmetry:false haveUnitcells:false haveFractionalCoord:false

1 model in this collection. Use getProperty "modelInfo" or getProperty "auxiliaryInfo" to inspect them.

Default Van der Waals type for model set to Jmol

149 atoms created

ModelSet: autobonding; use autobond=false to not generate bonds automatically

Time for creating model: 18 ms

Adding embedded #jmolscript: select ({0:148});backbone only;select *;

platformSpeed = 8

cartoonsFancy = true

sheetSmoothing = 1.0

traceAlpha = true

loadScript /static/js/j2s/core/corescriptcmd.z.js

specularPower = 9

ambientPercent = 20

antialiasDisplay = true

Script completed

Jmol script terminated

loadScript /static/js/j2s/J/g3d/HermiteRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/renderbio/BioMeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/render/MeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/shape/Mesh.js

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase
source organism	Human immunodeficiency virus 1
publication title	Interrogating HIV Integrase for Compounds that Bind- a Sampl Challenge. pubmed doi rcsb
molecule keywords	INTEGRASE
total genus	57
structure length	149
sequence length	153
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.7.7.7: DNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date	2013-11-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00665	rve	Integrase core domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.420.10	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H	4ceoA00

1REVA 3A2FA 4CJLA 3F9KA 4CF8A 4CJRA 3MXIA 4CHPA 1R0AA 4MQ3A 2D0BA 4E1NA 1BISA 4KB1A 4H8KA 5C42A 3MXMA 4M3UA 3IRXA 3RMDA 2G8FA 2E6LA 4QCLA 1ZBUA 4YFUA 2I5JA 4CHNA 4N41A 1B9FA 4AILC 4W5RA 3U3GA 4KTQA 2YNFA 1UA0A 1WSIA 3OYCA 4CEEA 4CERA 3C6UA 3L2WA 4FK4A 2YKNA 4RG8A 3SPYA 1NJXA 3RMAA 3KLGA 4FZYA 1KLMA 3K5LA 3TAQA 3VQ4A 4EZ6A 3OYHA 1TKZA 2HB5A 4OVLA 5CZ1A 2DFHA 3HM9A 3EYZA 4CJ3A 4G1QA 4DG1A 2P1JA 1SKRA 1QHTA 3OYEA 4K8ZA 2HVIA 5KGXA 5E41A 3OJUA 1CLQA 2HNDA 5CYQA 3NBPA 4C8LA 2HHUA 3LPTA 3KD1E 4CEBA 4LD0A 4HHTA 3V9WA 2PY5A 3U3YA 2ZD1A 1TVRA 2IOCA 3PUFA 4B3OA 3NFAA 4MFBA 3TAFA 4KHWA 4KO0A 1S9GA 1IKVA 1C0TA 2OZSA 4J2AA 3LZIA 4ELTA 1TL3A 2FBTA 1J5OA 3NGZA 2VG5A 3CG7A 3HK2A 4Z4FA 3WNFA 3G0ZA 3SCXA 1BIUA 4DWIA 1WSHA 3AVJA 1TGOA 4UQGA 2QXFA 1U45A 1SL0A 3OYLA 3VQDA 3ITHA 4WE1A 3TWHA 4FJHA 3QINA 2JGUA 2X6NA 5C24A 4JS4A 4LH4A 4E3SA 3VQ6A 4CFCA 3F73A 1JLEA 4KPYA 1J54A 1EXQA 1DTQA 3KLHA 3HVTA 2QK9A 3QNOA 3OYMA 4E89A 4CGFA 3M8RA 3QESA 2YNGA 1TKXA 1ZBLA 1WSEA 3DI6A 3IAYA 3OS2A 4E0DA 1LWEA 3QIOA 1HRHA 1VSMA 1N6QA 4Z4EA 3NGIA 3DRRA 1S1XA 3V9SA 3QEPA 4DFPA 4KTWA 1NK0A 1L3SA 2F8SA 4CHQA 4O55A 4DQQA 2QKBA 3HVRA 3IG1A 2F8TA 4IG3A 1WSGA 4KB0A 4KFBA 5T7BA 3KJVA 2HHTA 1RT6A 3NAEA 4I2PA 2PYLA 1ZBIA 3SZ2A 1T8EA 3RWUA 4DS5A 3S3OA 4CCHA 4FXDA 4FW1A 3L2UA 2DFEA 3QO9A 1SL1A 3PX6A 2HVHA 1X1PA 1KLNA 3V9XA 1F21A 4LSLA 4YNQA 1TAUA 3KLIA 3HT3A 3OS0A 1O1WA 4I2QA 4KHSA 2E4LA 1ZBFA 1LWCA 4I9QA 4Z4GA 3SQ0A 1C1AA 4GW6A 3VQQA 3ZSWA 4R5PA 4DQRA 2FBXA 2E6MA 4CFAA 1SKWA 2P51A 4NCGA 1S1VA 1RBUA 4CEOA 1HMVA 1K6YA 3ZT4A 2YHAA 3OS1A 4CECA 3TANA 1XHZA 3QNNA 3L2QA 5FDLA 3V1OA 3L8BA 1D8YA 4BDZA 3OYFA 1XHXA 3LP0A 3MAQA 1RCHA 4GVMA 1VSKA 4RW9A 4KKOA 1JLGA 4N47A 4QOZB 1DLOA 1T03A 2G8HA 1IKYA 1Q9YA 3CFOA 4OKKA 5J1EA 3NF9A 3L3UA 3FFIA 4AH9A 1D9DA 2P5GA 1XI1A 4DQSA 3NH2A 1KVAA 3V9UA 4NYFA 4CGGA 1YT3A 1LW2A 1MU2A 3T1AA 3SQ4A 2IC3A 1WN7A 3K5NA 1I3AA 4HUEA 2Q3SA 1EX4A 2GV9A 4CF9A 4FZZA 4FJ7A 4CK2A 4AHVA 3QEIA 3SV4A 4DQPA 4OPKA 1J9AA 1RDBA 2ATQA 5CZ2A 5CYMA 4OPJA 4CEQA 2W42A 3DLBA 4FJLA 4LSNA 4B8CA 5KGWA 3HO1A 3MECA 1TKDA 4DSJA 5HRNA 3K5MA 4CJUA 1NKEA 4M3WA 1Y97A 4FJGA 3KK1A 3DOKA 3M8QA 4CJPA 4M3XA 3RRGA 1JLCA 2DFFA 4JRPA 4Z0UA 4RW7A 2EHGA 3ISNC 1I39A 4OGCA 2FBVA 3RR8A 4W5NA 1BI4B 3TAEA 1RNHA 3M8PA 1UOCA 1LWFA 4J2EA 4FJNA 5JS1A 3HSTB 3WNEA 3MEGA 1RTIA 5KI6A 4O0IA 5KRTA 3LWMA 2BGGA 4OLAA 1U04A 3VA3A 1FK9A 1U49A 4OLBA 1J53A 4F8RA 4K8XA 5CY4A 1HQEA 3ALYA 1JXBA 4C8MA 4IKFA 4DSKA 2PYJA 4FK2A 4PQUA 4W5OA 3AO3A 1VRUA 1DTTA 4ICLA 1N5YA 4FM2A 3AVKA 3C95A 3OYBA 3TARA 3VQAA 3KKRA 4CF1A 1X9SA 1NK9A 3HP6A 1L5UA 4QAGA 3DMJA 3OY9A 4F3OA 5FRNA 2YNIA 1BGXT 3RMBA 4M3YA 1B9DA 1KTQA 5FROA 4PUOA 3TABA 2OPRA 3NF8A 4OJRA 3OYDA 1YTUA 1UWBA 1A5VA 1BHLA 4E1MA 2B6AA 4C8NA 3AVAA 4BWJA 4BE2A 4DTNA 4ZTJA 2A1RA 3KTQA 1A5XA 4JRQA 4IFYA 4DSLA 1QE1A 1VSLA 3PX4A 4CESA 3I0RA 2Z1IA 4OKJA 4XIUA 1ASVA 3P1GA 2HHXA 4BWMA 3NCIA 2LSNA 3ZCMA 1T7PA 1TV6A 3V1RA 1JL1A 4CFDA 2B5JA 4CJKA 2ZQBA 5JS2A 3K58A 3ULDA 3ZT2A 3SI6A 4B9LA 2KZZA 3S9HA 2IGIA 3ZSYA 2HHVA 2XHBA 3LAKA 4DTPA 2OPQA 4Q5VA 3CYMA 4KHQA 4PWDA 3ZSRA 1U48A 4KAZA 3D45A 4DTMA 5D3GA 3AVGA 4KV8A 4CGJA 4N56A 4JS5A 3OYJA 4BE1A 3TI0A 2VG6A 3VQ7A 3CM5A 3OYKA 1Z26A 4GMJB 4DTJA 3AVHA 3L2RA 3PV8A 1VSEA 4ELVA 1RT5A 3AO2A 4DSFA 1A5WA 2YHBA 1NK4A 3KK2A 1GOCA 4DTOA 1QS4A 1RBTA 3DM2A 3JYTA 5J2PA 3DLHA 4C8OA 1JKHA 2VWJA 1TK0A 1KFDA 3AVCA 3CFPA 3AVIA 4KHYA 4M41A 4CJEA 1TK8A 3DOLA 3WNHA 3WNGA 1UAXA 4FZXC 4DU1A 4EP4A 4CEZA 3VQCA 1C6VA 3AVMA 5C25A 4CIGA 1KVCA 4E7KA 3CM6A 4DF4A 5I3UA 1LV5A 4L8RB 5HLFA 3LALA 4FM1A 3O3GA 4OKEA 3SPZA 4CJQA 3S3MA 1L3VA 1S6QA 4CJTA 4M45A 3DLEA 4DTSA 2G8KA 1RT3A 1VK0A 4DTXA 4CJ4A 3NHGA 4EZ9A 5HBMA 2HMIA 4FK0A 1BQMA 3RRHA 1NK6A 4CF2A 1VSHA 1JL2A 3TAPA 4B9NA 3SQ2A 4RW4A 1NKCA 3ASMA 1RBSA 4I9LA 1RT1A 2HW3A 3CQ8A 5KRSA 1ITGA 3ZSVA 1BL3A 4O44A 1NKBA 3MEEA 2P5OA 1S5JA 3AV9A 1CZ9A 3LAMA 4TSXA 1BCOA 5HROA 5HP1A 4KI6A 1LAVA 3AO5A 4HTUA 4IG0A 3RR7A 3QERA 4Z4CA 3P83D 4CIFA 4FYDA 4IFVA 3AVBA 1SUQA 3B6PA 2FC0A 5DK5A 1L3TA 2D5RA 4NCBA 2KTQA 2Z1HA 1Z25A 3V81A 3T19A 4HUGA 2DTUA 1JXEA 2OZMA 2B4JA 4HUFA 3KLEA 4FJIA 1VRTA 3SV3A 4DS4A 2Y1IA 2HHSA 4FLUA 3LZJA 1XWLA 3DRSA 3SUOA 4OGEA 3NDKA 4DTRA 3AO1A 3VN5A 5HRRA 3PY8A 1HQUA 1RDAA 3OVNA 1TK5A 4E19A 1YVUA 2NUBA 4I7FA 4O4GA 2HHQA 3CFRA 4DLGA 5J2NA 1ZBHA 4FJ8A 2OYQA 2XY6A 3IS9A 3ZT0A 3VQEA 4ID5A 4FJMA 3NH0A 5I42A 2ZE2A 1RTJA 4EP5A 4CJVA 3SNNA 1SV5A 3HYFA 1C0UA 1X9MA 2PZSA 3EZ5A 4DFKA 4N76A 2RF2A 3QIPA 3V1QA 4E7JA 4F2RA 3UIQA 5SZTA 1HPZA 4CJWA 1RDCA 1Q8IA 1GOBA 1WSFA 4FCYA 3THVA 1WAJA 1RBVA 1QQCA 3TAMA 4Z4HA 4CJFA 2HNZA 1NJWA 2O4IA 1LW0A 3AVLA 2IAJA 1IKXA 5J2QA 3AA4A 3BGRA 3RMCA 4AHTA 1D5AA 1RTHA 3S3NA 3KK3A 3O4NA 4Y1DA 3HPOA 2G8WA 1C1CA 4M3TA 1NOYA 2GBZA 2GUIA 4CF0A 3I8DA 3B6OA 3K57A 3DLKA 3V4IA 2KZMA 4ZTFA 1IG9A 1SKSA 4NCAA 3MXJA 1VSJA 3ZSOA 4DU3A 3QEVA 2BE2A 2F96A 2DY4A 4LH5A 1JLAA 1S9EA 2IS3A 3AA3A 4H4OA 2KFZA 4KREA 2XO7A 3BDPA 2JLEA 3OYIA 1Q9XA 4HCBA 5J2MA 4CEDA 4FLTA 3KLFA 4B9UA 3AVNA 1KFSA 4B8AB 3JSMA 3LP2A 2KQ2A 3SUQA 2G8UA 4F4KA 4F3TA 3TAGA 2Y1JA 4DLEA 1SL2A 4FJKA 3L3VA 3HPGA 4AHCA 3K2PA 3ZSXA 3PX0A 1WAFA 1YTAA 1FXXA 1HYZA 1NJYA 1D9FA 3P5JA 1GOAA 1VSFA 3OYGA 1RBRA 4C8KA 3ZSZA 3E01A 1C0MA 4H4MA 4FLXA 3HPHA 2X78A 4E7IA 4E7LA 4DTUA 1QTMA 1NOZA 3T3FA 3SQ1A 1QSLA 3KD5E 2RPIA 3O4QA 4CGIA 4CJ5A 4FW2A 4B9SA 1L3UA 4Q0BA 4KHNA 4FLZA 3U6FA 4CGDA 4FLYA 4ZHRA 2RKIA 5HRSA 4M42A 1LAWA 5EU7A 1NK5A 1HJRA 3HXMA 4AHSA 5FRMA 2KW4A 1BCMA 3K59A 3HL8A 5K14A 3EY1A 1JLBA 3AA2A 4CK3A 3LPUA 4DQIA 3AVFA 3DLGA 1TAQA 1CXQA 4CIEA 3NH1A 4NYNA 4DMNA 4B9TA 3V9ZA 4HCCA 2AJQA 4ELUA 1RT7A 2FBYA 1IKWA 4IBNA 3SUPA 1HNVA 4FLVA 2XY7A 4M3ZA 4KTZA 4M3RA 2BDPA 3NF6A 3HP9A 4LY7A 3DLRA 2ITGA 3VQBA 2R7YA 4BDYA 1UA1A 4ID1A 4FJ5A 2YV0X 1NK8A 3QEXA 5DMRA 1IH7A 4B9MA 3LANA 4FM0A 2EX3A 4PY5A 4Y1CA 4J2BA 1VSDA 1RDDA 4IDKA 3VQ9A 4CE9A 3SJJA 1BQNA 2YKMA 3KKSA 3KIOA 3H08A 5SWMA 3M8SA 2OPSA 4CK1A 3SUNA 1ASWA 1NJZA 1TKTA 3QEWA 4DSIA 2KFNA 2BANA 1KRPA 2VG7A 2Z1GA 4AHUA 2OPPA 3D0PA 4KI4A 1BIZA 3O3HA 1CXUA 4BE0A 4JLHA 1ZYQA 1RT2A 3NF7A 4CFBA 3O3FA 1WLJA 2RN2A 4BACA 4DF8A 4FLWA 1KSPA 1KVBA 2Z1JA 4KRFA 1S1UA 2X74A 2G8IA 2A1SA 4BDPA 3ZT3A 3L2VA 4DFJA 4AHRA 1FKOA 2OA8A 1RILA 1RT4A 1U4BA 1XC9A 3OYNA 4CJSA 4HVJA 3I0SA 1EETA 1RTDA 1FKPA 4B9VA 3NE6A 2D0AA 1HNIA 2VWKA 3AO4A 3LP1A 3RTVA 3VA0A 2WOMA 4RW6A 3DYAA 1S1WA 2O4GA 1EP4A 3TR8A 4J2DA 1TL1A 4DFMA 2X6SA 1U47A 3SYZA 3OYAA 4FJ9A 4FJXA 1S6PA 3VQPA 5HRPA 4W5QA 1EKEA 4O0JA 1X9WA 2G8VA 4Z4IA 3NGYA 1IO2A 3QETA 3C94A 1QSYA 3MEDA 3AA5X 3QLHA 4E7HA 1B92A 1S1TA 2D0CA 1G15A 1BI4A 4W5TA 2XY5A 1W0HA 4CEFA 3OJSA 4CGHA 1W9HA 3K5OA 1QSSA 2YNHA 3C6TA 2XRIA 4CEAA 3LDSA 3DRPA 2XY8A 1CZBA 2HHWA 4DSEA 1ASUA 4O5BA 3VQ5A 4DU4A 3LP3A 3V6DA 1JLFA 4RW8A 2QKKA 4KHUA 1KCFA 1WNSA 3ZT1A 1HYVA 1C1BA 2ETJA 4PA1A 4B08A 4N5SA 3LWLA 4F2SA 3HJFA 1HYSA 2IDOA 3PO5A 4CHYA 1VSIA 2WONA 3PO4A 3G10A 1JLQA 4FJJA 1NK7A 5KTQA 1T05A 4FVMA 3ZSQA 1WSJA 3VQ8A 4CHZA 4CHOA 2HNYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1JCFA 4CJRA 4CHPA 1RGIA 3QB0A 4KB1A 1LCUA 2E6LA 1ZBUA 4AILC 4B1UB 3U3GA 3FZKA 1Q86O 2YCHA 4RG8A 1M90O 3RMAA 4NLBA 3DXKB 5AQWA 1I94K 3K5LA 2QWRA 3D2EA 2O8CB 4O5FA 2DFHA 3HM9A 1VHXA 4CJ3A 4DG1A 4DR6K 1Y64A 4K8ZA 1BOTO 4FPBA 1CLQA 1RDUA 5CYQA 3NBPA 3HOTA 4C8LA 3LPTA 2V51B 4CEBA 2PBDA 4HHTA 2ZGZA 2W6KA 1TVRA 3PUFA 2QWQA 1S72N 3NFAA 5A2QO 4KHWA 3UKRB 4H0VB 4IO8A 2E1ZA 3LZIA 4FWMA 4RCHA 2O8EA 2VG5A 2QA4N 4DUZK 3SCXA 3MN9A 5H1SQ 2O8FA 3GL1A 3EKSA 2FF3B 3ITHA 2FSKA 2KHOA 4FJHA 4YDUA 3O80A 2X6NA 5EXWA 4JS4A 4LH4A 4E3SA 4CFCA 3KLHA 3HVTA 3B8AX 3QNOA 4E89A 3M8RA 1TKXA 3CJBA 1K8AO 4E0DA 3QIOA 1HRHA 3NGIA 3DRRA 1S1XA 4DFPA 3IG1A 2BH1A 2FSJA 1NGDA 1VQ8N 4FXDA 3L2UA 1GLJO 1SL1A 4B3TK 1GLBG 4XH5A 4DV2K 3N4PA 2RE2A 3MCAB 4LSLA 4YNQA 4I2QA 4KHSA 1ZBFA 1LWCA 4H5NA 3SQ0A 3VQQA 4DQRA 4CFAA 2HHHK 4BVPA 1S1VA 3R9PA 1GLFO 3TANA 3QNNA 2F9TA 5FDLA 1KAZA 3L8BA 1NGFA 3H1QA 1RCHA 4GVMA 1XNRK 4BQLA 1DLOA 4FWSA 3CFOA 5JICA 2VWBA 2A5XA 1YT3A 3VF4A 1NLVA 4FWOA 4BRIA 2Q3SA 3I33A 3ZX0A 4EHTA 4CK2A 4AHVA 3QEIA 5AQVA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2O4G A;  1EP4 A;  3TR8 A;  4J2D A;  1TL1 A;  4DFM A;  2X6S A;  1U47 A;  3SYZ A;  3OYA A;  4FJ9 A;  4FJX A;  1S6P A;  3VQP A;  5HRP A;  4W5Q A;  1EKE A;  4O0J A;  1X9W A;  2G8V A;  4Z4I A;  3NGY A;  1IO2 A;  3QET A;  3C94 A;  1QSY A;  3MED A;  3AA5 X;  3QLH A;  4E7H A;  1B92 A;  1S1T A;  2D0C A;  1G15 A;  1BI4 A;  4W5T A;  2XY5 A;  1W0H A;  4CEF A;  3OJS A;  4CGH A;  1W9H A;  3K5O A;  1QSS A;  2YNH A;  3C6T A;  2XRI A;  4CEA A;  3LDS A;  3DRP A;  2XY8 A;  1CZB A;  2HHW A;  4DSE A;  1ASU A;  4O5B A;  3VQ5 A;  4DU4 A;  3LP3 A;  3V6D A;  1JLF A;  4RW8 A;  2QKK A;  4KHU A;  1KCF A;  1WNS A;  3ZT1 A;  1HYV A;  1C1B A;  2ETJ A;  4PA1 A;  4B08 A;  4N5S A;  3LWL A;  4F2S A;  3HJF A;  1HYS A;  2IDO A;  3PO5 A;  4CHY A;  1VSI A;  2WON A;  3PO4 A;  3G10 A;  1JLQ A;  4FJJ A;  1NK7 A;  5KTQ A;  1T05 A;  4FVM A;  3ZSQ A;  1WSJ A;  3VQ8 A;  4CHZ A;  4CHO A;  2HNY A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1JCF A;  4CJR A;  4CHP A;  1RGI A;  3QB0 A;  4KB1 A;  1LCU A;  2E6L A;  1ZBU A;  4AIL C;  4B1U B;  3U3G A;  3FZK A;  1Q86 O;  2YCH A;  4RG8 A;  1M90 O;  3RMA A;  4NLB A;  3DXK B;  5AQW A;  1I94 K;  3K5L A;  2QWR A;  3D2E A;  2O8C B;  4O5F A;  2DFH A;  3HM9 A;  1VHX A;  4CJ3 A;  4DG1 A;  4DR6 K;  1Y64 A;  4K8Z A;  1BOT O;  4FPB A;  1CLQ A;  1RDU A;  5CYQ A;  3NBP A;  3HOT A;  4C8L A;  3LPT A;  2V51 B;  4CEB A;  2PBD A;  4HHT A;  2ZGZ A;  2W6K A;  1TVR A;  3PUF A;  2QWQ A;  1S72 N;  3NFA A;  5A2Q O;  4KHW A;  3UKR B;  4H0V B;  4IO8 A;  2E1Z A;  3LZI A;  4FWM A;  4RCH A;  2O8E A;  2VG5 A;  2QA4 N;  4DUZ K;  3SCX A;  3MN9 A;  5H1S Q;  2O8F A;  3GL1 A;  3EKS A;  2FF3 B;  3ITH A;  2FSK A;  2KHO A;  4FJH A;  4YDU A;  3O80 A;  2X6N A;  5EXW A;  4JS4 A;  4LH4 A;  4E3S A;  4CFC A;  3KLH A;  3HVT A;  3B8A X;  3QNO A;  4E89 A;  3M8R A;  1TKX A;  3CJB A;  1K8A O;  4E0D A;  3QIO A;  1HRH A;  3NGI A;  3DRR A;  1S1X A;  4DFP A;  3IG1 A;  2BH1 A;  2FSJ A;  1NGD A;  1VQ8 N;  4FXD A;  3L2U A;  1GLJ O;  1SL1 A; 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4CEOA

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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