4CGF | Genus

Total Genus 56

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	56
sequence length	153
structure length	148
Chain Sequence	SPGIWQLDCTHLEGKVILVAVHVASGYIEAEVIPAETGQETAYFLLKLAGRWPVKTVHTDNGSNFTSTTVKAACWWAGIKQEDGIPYNPQSQGVIESMNKELKKIIGQVRDQAEHLKTAVQMAVFIHNHKRKYSAGERIVDIIATDIQ

Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__8130129458323134__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__8130129458323134__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/4CGF/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__8130129458323134__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"8130129458323134","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/4CGF/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__8130129458323134__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

Viewer cachePut cache://localLOAD_/file/5d039daf346ed81bcf8bba27/pdb.gz

Viewer cachePut https://genus.fuw.edu.pl/file/5d039daf346ed81bcf8bba27/pdb.gz

FileManager.getAtomSetCollectionFromFile(/file/5d039daf346ed81bcf8bba27/pdb.gz)

loadScript /static/js/j2s/core/corezip.z.js

The Resolver thinks Pdb

loadScript /static/js/j2s/core/corebio.z.js

Time for openFile(/file/5d039daf346ed81bcf8bba27/pdb.gz): 56 ms

reading 148 atoms

ModelSet: haveSymmetry:false haveUnitcells:false haveFractionalCoord:false

1 model in this collection. Use getProperty "modelInfo" or getProperty "auxiliaryInfo" to inspect them.

Default Van der Waals type for model set to Jmol

148 atoms created

ModelSet: autobonding; use autobond=false to not generate bonds automatically

Time for creating model: 18 ms

Adding embedded #jmolscript: select ({0:147});backbone only;select *;

platformSpeed = 8

cartoonsFancy = true

sheetSmoothing = 1.0

traceAlpha = true

loadScript /static/js/j2s/core/corescriptcmd.z.js

specularPower = 9

ambientPercent = 20

antialiasDisplay = true

Script completed

Jmol script terminated

loadScript /static/js/j2s/J/g3d/HermiteRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/renderbio/BioMeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/render/MeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/shape/Mesh.js

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase
source organism	Human immunodeficiency virus 1
publication title	Interrogating HIV Integrase for Compounds that Bind- a Sampl Challenge. pubmed doi rcsb
molecule keywords	INTEGRASE
total genus	56
structure length	148
sequence length	153
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.7.7.7: DNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date	2013-11-23

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00665	rve	Integrase core domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.420.10	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H	4cgfA00

3RR7A 1ASWA 4CK3A 4K8ZA 4CERA 3OJUA 3RRHA 3ITHA 4FJ8A 3VQBA 2VG7A 4CJTA 5CYMA 2WOMA 4FW2A 4LSNA 3L2UA 3QEIA 3V81A 4J2AA 2F8SA 4PA1A 4BWJA 4QOZB 3AA5X 4W5TA 3SQ4A 4CESA 2EX3A 3AO3A 4BWMA 2VWJA 2D5RA 2O4GA 4EP4A 1SKRA 1RDDA 4FJXA 2G8KA 3C6TA 2F8TA 1VSFA 1QHTA 4KV8A 1WSEA 3AVAA 4M45A 3OYGA 2D0AA 2RN2A 4MFBA 1ZBHA 3VA0A 1I3AA 1VRTA 3ZT0A 2HHTA 3DMJA 3L8BA 1LV5A 4KPYA 5C24A 2G8IA 4C8NA 5KRSA 3BDPA 2KZZA 1JKHA 1SL1A 1BQNA 1HQUA 4TSXA 4FJ5A 4WE1A 4M3RA 4CEAA 1JLAA 2PZSA 3TAMA 4OGCA 1SKSA 3PX6A 4BDPA 4CJWA 5JS1A 3HM9A 4RG8A 3SI6A 1VRUA 3C95A 1BGXT 4CEOA 4CHNA 1S6PA 2LSNA 2HW3A 3VQ5A 1D9DA 2VG6A 1NJWA 4DSIA 3B6PA 3SPYA 2G8VA 2Z1IA 5HRNA 1VSEA 1WSGA 1C0MA 1FKOA 1WLJA 1VSMA 3V9UA 4C8MA 3C6UA 4AHUA 3U3GA 1NK6A 4N76A 1VSKA 4CJUA 4PWDA 3G10A 3HJFA 4HVJA 1RT5A 4DS5A 3RMBA 3V1RA 4DU1A 2DFEA 3ZSXA 3ZT1A 1NJXA 1Q9YA 4AHTA 2HHXA 2IOCA 3DLGA 3ULDA 3MXMA 4F3OA 1XHZA 3AVHA 4DQPA 4OVLA 1CXQA 3ZSVA 4E7KA 4H8KA 1SL2A 4FJNA 4DTUA 4C8OA 5FRNA 4CJFA 4PY5A 1FXXA 3MECA 4ID5A 4CJVA 3PX4A 4CCHA 2BANA 3LZIA 1HNVA 1UA0A 3SV4A 2IS3A 3KLHA 3LP1A 3V4IA 1QS4A 3DLKA 3NGZA 4DF8A 1NK0A 3OYNA 1JLBA 3CM5A 1CZ9A 3RR8A 3OJSA 4J2BA 2YKMA 2HHVA 4CF9A 1WSIA 3O3GA 1S1WA 1T8EA 4FZYA 3AA3A 1C0UA 3DM2A 3VQ6A 4L8RB 1RT3A 4E7JA 2F96A 4Z4EA 2KFNA 4DF4A 1C1CA 3TAFA 1EKEA 3DLBA 1L3TA 3HP9A 1RT2A 4E7IA 3LALA 3OS2A 3PY8A 4DTNA 4FJMA 4CF1A 5FRMA 2FC0A 1NOYA 4QCLA 3DRSA 5J2MA 3SV3A 3RTVA 3VQPA 1DTTA 1W9HA 2PYLA 4B9UA 4FJ7A 4DSKA 1HYVA 3OS1A 3NAEA 3CFPA 1RTHA 1UA1A 4NCBA 1KSPA 3M8SA 3K5NA 3AVFA 1CXUA 1RBSA 3DOLA 4AILC 2Y1IA 2P5GA 3AVNA 3H08A 3T3FA 2DY4A 2D0BA 5KI6A 2B5JA 2R7YA 4E7HA 2Y1JA 4JRQA 3UIQA 2O4IA 3HYFA 4Y1DA 4DTRA 1TK5A 1A5VA 4CF2A 2OA8A 5CZ1A 1WSFA 2G8WA 4CFAA 2PY5A 1UWBA 4CFDA 4E19A 3D0PA 4M42A 1TAQA 1VSHA 4CHYA 4DQQA 1WSJA 1RDAA 3L2RA 3QESA 4OPKA 4E1MA 4EP5A 4KHSA 3LAMA 3E01A 4LY7A 3AVKA 4AHCA 3TI0A 3AVCA 3HK2A 3MEEA 4LSLA 3CFRA 1JXEA 4B9LA 4EZ9A 1IKWA 1SL0A 5FROA 4ELTA 4KAZA 1TKZA 4Z4IA 4W5QA 3VQQA 1ZBIA 4KREA 1ZYQA 5J2NA 1Z25A 4R5PA 4DTOA 4IKFA 4DFKA 4Q5VA 4EZ6A 2E6LA 1RT7A 1X9WA 4F3TA 3OYEA 3KLGA 4LH5A 3SUOA 3SPZA 1REVA 2FBXA 1S1XA 2HB5A 3AVGA 3JYTA 4DSFA 3AO4A 5J2PA 3KTQA 4CGHA 2VWKA 1SKWA 4F2RA 1LAWA 1X9SA 4O55A 2BDPA 5I42A 4CK1A 4QAGA 4O44A 5CYQA 5DMRA 3VQCA 4CIFA 3L2WA 1T05A 1D8YA 4B9SA 3ISNC 3K57A 3TAQA 4F4KA 4PQUA 3RRGA 4YFUA 5FDLA 3KLFA 2Q3SA 1RILA 3L3VA 4CEFA 1KCFA 1U04A 3AO1A 1WAFA 1RNHA 3EZ5A 4H4MA 3WNEA 3K5MA 3VQDA 1XI1A 1HYSA 1NK5A 1L3UA 4HUFA 4FLUA 3V9XA 3RMDA 3AA4A 1GOBA 1A5WA 4FCYA 2VG5A 2I5JA 3TAGA 1N6QA 2XHBA 1BHLA 2DFFA 3C94A 1TAUA 3LAKA 2Z1HA 3DOKA 2OZSA 4AHSA 2HNDA 4M3UA 3G0ZA 4BDYA 4CGIA 1GOCA 1KFDA 1LWFA 4I2QA 4RW4A 4Y1CA 3LWLA 3U3YA 1JLEA 4OLBA 1T03A 4FW1A 1BI4A 4CJLA 4CHPA 4E0DA 2KW4A 3HPHA 4HUGA 1EETA 4CE9A 4Z4CA 3QNOA 1KVBA 2HMIA 4B9NA 1VSDA 1IKVA 5K14A 3OYLA 1XHXA 1C1AA 4KKOA 3OYHA 1ZBUA 2OPRA 3HL8A 4CF0A 3OYJA 4FLZA 4FM1A 3RMAA 3S9HA 4ELVA 4LH4A 3RWUA 3K2PA 2IDOA 4FM0A 3HVRA 4F2SA 2HHSA 1TKXA 2ATQA 1YTUA 3M8PA 4DWIA 1JL2A 4IFYA 4OGEA 4FJJA 3K5LA 1JLCA 1RT6A 1YVUA 3OS0A 3F9KA 4NYFA 1R0AA 3PUFA 3QIPA 3TANA 5C25A 4KHYA 3L2VA 4ELUA 3AVJA 3PX0A 4ZTJA 2WONA 2HNZA 3MEGA 1RBVA 2X74A 1NJZA 1WSHA 4ICLA 3PO5A 1EXQA 1VK0A 3HT3A 3CG7A 4FLXA 1B9FA 1VSLA 3LP3A 4IDKA 4CJKA 1B9DA 2A1SA 4FLTA 3SYZA 3QINA 3AA2A 3OYBA 4OKKA 2NUBA 3WNGA 3IRXA 1HJRA 3KKRA 1JL1A 4I9QA 3L3UA 4CJ4A 4CFBA 4B3OA 2BGGA 3ZSWA 2KTQA 1BL3A 1RBRA 4KTWA 1LWCA 2ITGA 5C42A 3MAQA 4CEBA 5SWMA 3LWMA 3HXMA 3QEXA 1XC9A 2GV9A 4DQIA 5KRTA 1O1WA 3LP0A 3VQ9A 1BIZA 4CJQA 3DRRA 3NDKA 2RPIA 1C0TA 1VSJA 4BDZA 1LWEA 3NBPA 5KGWA 4DLEA 2G8HA 1JLQA 5KTQA 3NF7A 1TKDA 4UQGA 3QO9A 3HP6A 4FZXC 4I2PA 3DLHA 4HCCA 1A5XA 2YNHA 4DFPA 3QNNA 3SJJA 4MQ3A 3L2QA 3VQEA 4OKEA 4KHNA 4NYNA 1L5UA 2YNFA 1W0HA 1IG9A 4H4OA 1RBUA 4FJLA 1KLMA 1U45A 3AO2A 1IO2A 2QKKA 1FKPA 4KI4A 3O3FA 1BISA 2XY8A 1X9MA 4CEQA 1KVCA 1TVRA 4N5SA 3S3MA 1BQMA 4M3ZA 3NH0A 3KLIA 4LD0A 4CJRA 2IC3A 4CGGA 1JLGA 1TK0A 1QE1A 1NOZA 3P83D 1IH7A 4KRFA 5I3UA 1HQEA 2ZE2A 3MEDA 4FZZA 3RMCA 3VQ8A 2P5OA 1NK8A 1LW2A 1Q9XA 3ZSZA 1TKTA 1QQCA 3T1AA 3SUNA 1N5YA 1LW0A 4DLGA 3OYDA 1FK9A 4JS5A 2IAJA 2OPQA 3LPUA 2G8UA 3DYAA 1UOCA 3NE6A 2QK9A 1BI4B 1S5JA 1UAXA 1L3SA 4F8RA 4CHQA 5HBMA 1S1TA 3ZSOA 3V9WA 1WNSA 4DFJA 1NKBA 3WNFA 1KVAA 1SV5A 3QLHA 4AH9A 4HUEA 3SQ1A 3OYAA 3CQ8A 2OZMA 1BCMA 4CECA 4K8XA 2W42A 2RF2A 3NF6A 4RW8A 3ZT4A 3QETA 4Z4GA 3FFIA 4HHTA 4KO0A 4XIUA 4DFMA 3SQ0A 2XY5A 4IFVA 3V1QA 3NH2A 4DTPA 3V9ZA 4CJSA 3TAEA 2FBVA 1T7PA 3I0SA 1K6YA 4DU3A 3ASMA 3HO1A 1ZBFA 4Q0BA 3KJVA 1KRPA 1G15A 1RDCA 4IBNA 3ZSQA 4CK2A 1QSYA 1CLQA 1S6QA 3LPTA 3WNHA 3F73A 4M3TA 4RW7A 4FYDA 4E89A 1B92A 4CF8A 1S1UA 4JRPA 4CJ5A 4GMJB 4BE0A 2OPPA 3CYMA 4N56A 4CIEA 1J53A 1CZBA 3LDSA 3CM6A 4OPJA 3LZJA 4CGFA 4DTSA 4AHRA 1RTDA 2KFZA 1Z26A 5D3GA 3I8DA 4Z4FA 5KGXA 3M8QA 1SUQA 4Z0UA 3QIOA 4DSLA 3OVNA 1NK9A 5HRPA 1L3VA 2IGIA 3DRPA 4CJ3A 3KK3A 1YT3A 3D45A 4FVMA 4DSEA 4BACA 2EHGA 2E4LA 2GUIA 4KB1A 4J2EA 4NCGA 4B9MA 4JS4A 3MXIA 4IG0A 1U47A 3NGIA 4PUOA 3ZT2A 4O5BA 1RDBA 1NKCA 1QSSA 2Z1GA 1RT4A 3AVMA 3VQAA 2DTUA 1EX4A 1LAVA 1WN7A 1RCHA 1NK7A 4N41A 5DK5A 4BE1A 4ID1A 3OYMA 3P1GA 1JLFA 3T19A 3BGRA 3TABA 1ASVA 2XY7A 4FK4A 2YNIA 3EY1A 1S1VA 4FLYA 2HVIA 3M8RA 2B4JA 5JS2A 1C1BA 4HTUA 4C8LA 3SUPA 1U4BA 4CEDA 2JGUA 5T7BA 1C6VA 4CGJA 4FLWA 3QEWA 2PYJA 4RW9A 3HSTB 1KFSA 4CGDA 1RTIA 3K5OA 3ZCMA 1J5OA 3KIOA 2B6AA 4I7FA 1IKYA 3NGYA 2JLEA 3THVA 4W5OA 4W5NA 3V1OA 1RTJA 1J9AA 1S9EA 3TR8A 4FLVA 2HHUA 4IG3A 4CJPA 3VQ7A 1U49A 3PO4A 2ZQBA 1EP4A 3QEVA 1WAJA 3SZ2A 1BCOA 4ZHRA 4KTQA 1S9GA 1NK4A 2YV0X 1MU2A 2ETJA 4O4GA 2BE2A 2P51A 1XWLA 2D0CA 4DQSA 3KK2A 1QSLA 2OPSA 2HNYA 4DQRA 3P5JA 5CZ2A 4B8AB 3AVIA 1D5AA 5J2QA 4KTZA 4E1NA 2HHQA 2XRIA 4CHZA 2G8FA 2E6MA 4FJGA 3SCXA 4JLHA 4FJKA 1IKXA 4OJRA 4KHWA 4C8KA 3LP2A 1DTQA 4E7LA 3K58A 4M41A 4W5RA 3U6FA 2XO7A 3VA3A 4KI6A 3O3HA 1X1PA 4CHOA 3OYIA 4FK0A 2ZD1A 3MXJA 4DTJA 4KHQA 1F21A 4FJ9A 2OYQA 1NJYA 3DI6A 4HCBA 2YKNA 4DMNA 4CIGA 1D9FA 4ZTFA 1BIUA 1TGOA 3IS9A 1RBTA 4CEZA 3HPOA 4E3SA 3ZSRA 3NH1A 1QTMA 3S3NA 4DS4A 4CFCA 3O4NA 5CY4A 3KLEA 2YHBA 4RW6A 2XY6A 1NKEA 1VSIA 4G1QA 3V6DA 1TK8A 4B08A 4KHUA 1J54A 3VQ4A 3VN5A 5SZTA 4N47A 3NCIA 3TWHA 4M3XA 3ZSYA 2YHAA 4BE2A 1DLOA 1YTAA 3LANA 3OYFA 3KK1A 3SUQA 1U48A 2HHWA 3K59A 2P1JA 1HNIA 3IG1A 3NHGA 1KTQA 2X6SA 3EYZA 3HPGA 1Y97A 5HP1A 5EU7A 3S3OA 1KLNA 4B9VA 3AVBA 4GW6A 3KD1E 3OYCA 3V9SA 5E41A 3OY9A 4FJIA 4DTXA 2HVHA 3JSMA 4CEEA 1TL3A 3DLRA 2X6NA 4YNQA 4FXDA 4KB0A 1HPZA 4GVMA 1ITGA 3AO5A 4AHVA 5J1EA 4OKJA 3KD5E 2DFHA 4I9LA 1RT1A 1ASUA 3QEPA 1TV6A 1HRHA 3I0RA 3OYKA 5HROA 3ZT3A 3SNNA 3CFOA 3DLEA 2KQ2A 5HRSA 4B8CA 4FM2A 3A2FA 3PV8A 2A1RA 2X78A 4KFBA 4J2DA 2QXFA 4OLAA 1HYZA 1TL1A 4O0JA 3B6OA 1ZBLA 4M3WA 4DTMA 2YNGA 4O0IA 2KZMA 4DSJA 3HVTA 5HLFA 2RKIA 2QKBA 1HMVA 3ALYA 4FK2A 3AV9A 3KKSA 5HRRA 1Q8IA 3TAPA 3QERA 4DU4A 3AVLA 3O4QA 2GBZA 4NCAA 3IAYA 1JXBA 2FBTA 1I39A 1GOAA 3NFAA 4FJHA 4CJEA 3TARA 3NF9A 4M3YA 2AJQA 2Z1JA 2FBYA 3NF8A 4DG1A 3SQ2A 4Z4HA 4B9TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1ASWA 1TYQB 2W41A 1Q82O 3RRHA 3VQBA 2G8IA 3QEIA 2E1YA 4J2AA 4BWJA 3AA5X 3IMXA 5AQYA 1XUPO 3AO3A 5AQQA 1SZ2A 4BWMA 2VWJA 1SKRA 1BDGA 3T69A 1S3XA 2G8KA 3C6TA 4B9QA 1WSEA 4YOXA 4MFBA 2PAVA 2VWBA 3DMJA 3L8BA 1JKHA 4PL8A 1SL1A 4BROA 3CPEA 4WE1A 4FJ5A 4M3RA 1XQSC 3CJ7A 3P4IA 1XNRK 4B1XB 3TAMA 3TSPA 5JS1A 5BPMA 4RG8A 3C95A 1E4GT 4WQ4C 2E2NA 4JKEA 3B6PA 3DWLA 3ID8A 1VSEA 4J8FA 1I94K 1C0MA 3I55N 1RGIA 4DV7K 3V9UA 4C8MA 4AHUA 1TYQA 5BR9A 3AGRA 4CJUA 3G10A 3V1RA 2QWPA 4AHTA 3ULDA 3THYB 4F3OA 1XHZA 3AVHA 4DQPA 1K73O 4JEPA 2YJFA 4LFBK 3R9PA 1FXXA 4H5VA 4CJVA 3I56N 1IJJA 4YORA 3DLKA 1NK0A 1CZ9A 4Y0WA 3RR8A 2HHVA 4CF9A 4FZYA 1C0UA 3DM2A 1NBWA 1RT3A 2F96A 2KFNA 4DF4A 1C1CA 3TAFA 1EKEA 4GVEA 4E7IA 5FRMA 3PY8A 4FJMA 4GV6A 4CF1A 4FWOA 4QCLA 3MWTA 2IVPA 3WEEB 3VQPA 3SV3A 1DTTA 1HYVA 3OS1A 3CFPA 4H0YB 1RTHA 4NCBA 2Y1IA 1CXUA 3DOLA 2FF3B 4AILC 3H08A 2R7YA 2B5JA 3UIQA 5AQPA 1TK5A 1A5VA 3DAWA 4YDUA 1HNWK 1E3MA 2V51B 2G8WA 1NNEA 1UWBA 2PY5A 3D0PA 2A6AA 1WSJA 2GUPA 3CF5L 1VQLN 4KHSA 4LF6K 3LAMA 5AQGA 3AVKA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ASW A;  1TYQ B;  2W41 A;  1Q82 O;  3RRH A;  3VQB A;  2G8I A;  3QEI A;  2E1Y A;  4J2A A;  4BWJ A;  3AA5 X;  3IMX A;  5AQY A;  1XUP O;  3AO3 A;  5AQQ A;  1SZ2 A;  4BWM A;  2VWJ A;  1SKR A;  1BDG A;  3T69 A;  1S3X A;  2G8K A;  3C6T A;  4B9Q A;  1WSE A;  4YOX A;  4MFB A;  2PAV A;  2VWB A;  3DMJ A;  3L8B A;  1JKH A;  4PL8 A;  1SL1 A;  4BRO A;  3CPE A;  4WE1 A;  4FJ5 A;  4M3R A;  1XQS C;  3CJ7 A;  3P4I A;  1XNR K;  4B1X B;  3TAM A;  3TSP A;  5JS1 A;  5BPM A;  4RG8 A;  3C95 A;  1E4G T;  4WQ4 C;  2E2N A;  4JKE A;  3B6P A;  3DWL A;  3ID8 A;  1VSE A;  4J8F A;  1I94 K;  1C0M A;  3I55 N;  1RGI A;  4DV7 K;  3V9U A;  4C8M A;  4AHU A;  1TYQ A;  5BR9 A;  3AGR A;  4CJU A;  3G10 A;  3V1R A;  2QWP A;  4AHT A;  3ULD A;  3THY B;  4F3O A;  1XHZ A;  3AVH A;  4DQP A;  1K73 O;  4JEP A;  2YJF A;  4LFB K;  3R9P A;  1FXX A;  4H5V A;  4CJV A;  3I56 N;  1IJJ A;  4YOR A;  3DLK A;  1NK0 A;  1CZ9 A;  4Y0W A;  3RR8 A;  2HHV A;  4CF9 A;  4FZY A;  1C0U A;  3DM2 A;  1NBW A;  1RT3 A;  2F96 A;  2KFN A;  4DF4 A;  1C1C A;  3TAF A; 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4CGFA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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