4CGJ | Genus

Total Genus 54

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	54
sequence length	153
structure length	149
Chain Sequence	SPGIWQLDCTHLEGKVILVAVHVASGYIEAEVIPAETGQETAYFLLKLAGRWPVKTVHTDNGSNFTSTTVKAACWWAGIKQEDGIPYNPQSQGVIESMNKELKKIIGQVRDQAEHLKTAVQMAVFIHNHKRKGYSAGERIVDIIATDIQ

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__8467023839829655__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__8467023839829655__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/4CGJ/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__8467023839829655__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"8467023839829655","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/4CGJ/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__8467023839829655__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

Viewer cachePut cache://localLOAD_/file/5d039d8516de1128b5985629/pdb.gz

Viewer cachePut https://genus.fuw.edu.pl/file/5d039d8516de1128b5985629/pdb.gz

FileManager.getAtomSetCollectionFromFile(/file/5d039d8516de1128b5985629/pdb.gz)

loadScript /static/js/j2s/core/corezip.z.js

The Resolver thinks Pdb

loadScript /static/js/j2s/core/corebio.z.js

Time for openFile(/file/5d039d8516de1128b5985629/pdb.gz): 250 ms

reading 149 atoms

ModelSet: haveSymmetry:false haveUnitcells:false haveFractionalCoord:false

1 model in this collection. Use getProperty "modelInfo" or getProperty "auxiliaryInfo" to inspect them.

Default Van der Waals type for model set to Jmol

149 atoms created

ModelSet: autobonding; use autobond=false to not generate bonds automatically

Time for creating model: 20 ms

Adding embedded #jmolscript: select ({0:148});backbone only;select *;

platformSpeed = 8

cartoonsFancy = true

sheetSmoothing = 1.0

traceAlpha = true

loadScript /static/js/j2s/core/corescriptcmd.z.js

specularPower = 9

ambientPercent = 20

antialiasDisplay = true

Script completed

Jmol script terminated

loadScript /static/js/j2s/J/g3d/HermiteRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/renderbio/BioMeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/render/MeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/shape/Mesh.js

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase
source organism	Human immunodeficiency virus 1
publication title	Interrogating HIV Integrase for Compounds that Bind- a Sampl Challenge. pubmed doi rcsb
molecule keywords	INTEGRASE
total genus	54
structure length	149
sequence length	153
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.7.7.7: DNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date	2013-11-25

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00665	rve	Integrase core domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.420.10	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H	4cgjA00

3LANA 1YTAA 1TVRA 2YHAA 1TAUA 1TL1A 4EZ6A 3K2PA 1U4BA 3HXMA 4Z4CA 2D0AA 3WNFA 4KI4A 4CE9A 1ASWA 3SPZA 4FZYA 1FK9A 1IKXA 3AA2A 3AVKA 4CHPA 4O55A 3ZT1A 1KVCA 1REVA 1IO2A 1X1PA 3OS0A 4DQRA 3AVAA 2I5JA 1RT1A 4M3WA 3VQ7A 3WNGA 1I39A 3OYDA 3OYBA 5J2PA 4CEDA 4OPKA 4FZZA 4KKOA 1I3AA 1VSEA 3C6TA 4CF0A 1N5YA 1KVAA 1MU2A 1Q8IA 4CK2A 3HO1A 4DS4A 4KPYA 1RT2A 3I0SA 3THVA 3MXMA 3HP9A 4CK3A 3ALYA 4DSKA 4DS5A 3QETA 3OYNA 1NK5A 3ZT2A 4CJSA 4Z4GA 3A2FA 1EETA 2BANA 4DQQA 1WSJA 3CFRA 4DFPA 3QERA 4KI6A 4CFBA 1NOZA 3DLKA 4E19A 3CYMA 3LZJA 4FLWA 5KGXA 3K5MA 4RG8A 2A1SA 2GUIA 4FLUA 3BDPA 2HHSA 2Z1JA 3KJVA 1VRTA 3V1OA 3MEEA 1QSLA 3LDSA 3KIOA 4JS4A 2F8TA 1SKSA 4IFYA 2BGGA 4JRPA 3PX0A 3RR8A 1D5AA 3NGYA 3OS2A 2DFFA 1VSDA 3ZCMA 4CFCA 1WSFA 1S1TA 4CF8A 3DRSA 3LZIA 1RILA 1NJXA 5CYQA 2YHBA 2XY5A 2Y1IA 3L3UA 5FROA 4CHYA 4N76A 5EU7A 3NF9A 3OYIA 1J54A 3V4IA 3RRGA 3VQ5A 1EX4A 2QK9A 4QCLA 4CEFA 3VA3A 3SQ0A 3TAEA 2KFNA 4NCAA 4M3YA 5SZTA 1VSLA 5KGWA 3SZ2A 1JXBA 1J5OA 1W9HA 1Z25A 3TAPA 2OYQA 4DSLA 2HHUA 1YVUA 1SL2A 1JLAA 1HNVA 4XIUA 1BGXT 1WSGA 1VSJA 3CFOA 4BDZA 4CGIA 4RW4A 4RW9A 4E7KA 4M45A 2B5JA 1EKEA 4PUOA 5CZ1A 2YV0X 3ZT0A 1XHZA 4FCYA 3AA4A 1L3VA 1WAJA 4JLHA 3OYAA 2QKBA 1IH7A 4IG3A 4R5PA 3OYFA 3D45A 3VQAA 5HRPA 4F4KA 1RDAA 1ZBLA 1CXUA 4DTOA 4H4OA 4EP4A 4F2SA 2DTUA 4GMJB 3HYFA 3VQDA 2RKIA 5HROA 1NJWA 1NKCA 1DTTA 4B08A 2OA8A 1K6YA 3U3YA 3TABA 3TI0A 3VQ4A 3KK1A 4DQSA 1KFSA 1RTHA 3ZSRA 4YNQA 3L3VA 2XO7A 3LP0A 3SJJA 3KK2A 2RF2A 3MAQA 1ASVA 4CIFA 1U49A 3OYEA 4DFMA 1NK7A 4PY5A 4ICLA 3L2VA 3DRPA 1LW2A 3C94A 1RBVA 3PY8A 1XWLA 1XHXA 1JKHA 1TKTA 1IKYA 4CGJA 3PV8A 4FK2A 4FM1A 3MXJA 4FYDA 3VQEA 4CGGA 1WAFA 4O0JA 3KLIA 3LWMA 2G8VA 4KTWA 1YTUA 5J1EA 4B3OA 1BI4B 4DU3A 1T8EA 3LAKA 4LH4A 3TAGA 1RT7A 4KV8A 3KKRA 4CEEA 4O44A 4CEQA 4CJLA 1WNSA 2HMIA 4B9VA 1NK9A 4HVJA 2XHBA 4DTNA 2W42A 3G10A 3V9XA 3AO3A 3LP3A 1HMVA 2A1RA 2LSNA 3OY9A 1C1AA 2B6AA 3P1GA 4CESA 3QEXA 3SPYA 1N6QA 4DSJA 1C6VA 1A5VA 4CJEA 2YNFA 4BE1A 3LPTA 3MEDA 3VQQA 4NCBA 3AO1A 3MXIA 4DF4A 2AJQA 4DQPA 4C8LA 3AO2A 4B9MA 4DQIA 4F3TA 4MQ3A 1RBSA 3ZSOA 4J2BA 1WN7A 4KHYA 3HJFA 4RW6A 4YFUA 2PZSA 1LWEA 4B9LA 2KZZA 3C6UA 2DFHA 3DYAA 3AVBA 3VQ8A 3KD5E 2XRIA 2IDOA 4KAZA 3U3GA 3QESA 3ZSWA 1BCOA 2Z1IA 4E1NA 4FJXA 2KTQA 4TSXA 4Z4HA 4CJ3A 4ID1A 1D9FA 2G8FA 2IC3A 3KLHA 1UA1A 1NK0A 4E89A 3AO4A 4PWDA 4FLZA 4N56A 4FLVA 4J2DA 3HP6A 1RBUA 1L3UA 1TKXA 1G15A 4CEOA 1FKOA 1HYVA 4OKJA 1KFDA 1Q9YA 4CGDA 4E7IA 4BWJA 4O0IA 1SL1A 4I2PA 1VRUA 4C8NA 4N5SA 5KRTA 5KI6A 3OYHA 1RT3A 2YNHA 3DLGA 4M42A 1W0HA 3VQ6A 4DSEA 1LW0A 3HPHA 4AHSA 4DSIA 2YNGA 3RWUA 3QIOA 1VSHA 3SCXA 1O1WA 2RN2A 3AO5A 4DTRA 1VSKA 3ZSVA 5HBMA 4HUEA 3NHGA 1HYSA 4LSLA 2Q3SA 4KTZA 3E01A 2X6NA 5HLFA 4M3TA 1C1CA 3MECA 1ASUA 1LWCA 1QHTA 3NF7A 4H8KA 4ELUA 2E6LA 2XY8A 1TK5A 3K57A 4IKFA 3LP1A 3K58A 3HVTA 3K59A 4CGFA 1RT6A 1SV5A 2ZQBA 1CZ9A 1SUQA 1RNHA 2FBTA 3ULDA 1Q9XA 4I2QA 2VWJA 3IRXA 3RMDA 4K8XA 1KSPA 2F8SA 2D0BA 1KVBA 3ZSXA 1BQNA 3CM6A 4CECA 3NGIA 2IOCA 1QSYA 3OYLA 3V9WA 3VA0A 5JS2A 4QOZB 3L8BA 3O3GA 4B9UA 1B92A 4E1MA 1C0MA 4WE1A 1LWFA 3QO9A 3TARA 1U47A 2HHXA 3P83D 3T1AA 3V9ZA 3B6PA 1UWBA 1RDBA 4CHOA 4DU4A 1SKWA 1BHLA 2OPPA 4Z0UA 1CZBA 4HUFA 4OJRA 1A5WA 2O4IA 3ZSZA 3V1RA 4DTXA 2HNZA 4J2AA 2IGIA 4DMNA 1FKPA 1D8YA 3D0PA 5D3GA 4NCGA 3OJUA 1JLGA 1UOCA 4AHTA 4HTUA 1B9FA 2X6SA 4CF1A 3CM5A 3DLHA 3F73A 1ITGA 1TKDA 3SQ2A 2E6MA 4CERA 4CJRA 4CGHA 2E4LA 4KRFA 3DM2A 1KRPA 3DLRA 4CJTA 4LSNA 4LD0A 4FJ7A 4DSFA 3I8DA 4DFJA 3HL8A 1HPZA 4ELTA 5JS1A 1TGOA 4BE2A 4BDYA 2KFZA 3SNNA 4EZ9A 5SWMA 4FLTA 4H4MA 5KRSA 2FBYA 1HQEA 4AHUA 1BQMA 4CK1A 3NDKA 1L3TA 2DY4A 3ZSQA 4DWIA 1IKWA 4FM2A 2HVIA 1JXEA 1WSEA 3L2RA 2RPIA 4IBNA 4FZXC 3DI6A 3AVMA 4AH9A 3TANA 4F2RA 2Z1GA 1B9DA 3V6DA 4CIGA 3HVRA 4FJ8A 1T05A 1CLQA 2EX3A 3VQPA 2X78A 3KLFA 4Z4FA 5CY4A 4ZTFA 4FJKA 3C95A 2IS3A 4NYFA 4W5QA 4ID5A 4NYNA 3KK3A 4M3UA 1WSIA 3AA5X 3O3HA 4KREA 4E7LA 3PX6A 1S1VA 4CCHA 4FVMA 4BWMA 4I9LA 3AVHA 3O4NA 4KHQA 3WNHA 4CJ5A 3AVCA 3AVGA 2PYLA 3ITHA 2ITGA 4OKKA 4CJQA 5HRSA 3L2QA 3RMCA 3SQ1A 1JL1A 3LAMA 1QS4A 3DLEA 3TR8A 4E7HA 4KFBA 5J2NA 2PYJA 2HW3A 4K8ZA 3OVNA 1NK8A 1L3SA 1J53A 1J9AA 3ASMA 3IG1A 4DLGA 3SQ4A 4BDPA 5FRMA 3ZT4A 1TL3A 2ATQA 4OVLA 4CIEA 5C24A 1JLFA 5E41A 5C25A 3QEPA 4B9NA 3O4QA 3M8QA 3PO5A 3QLHA 3JYTA 4E7JA 1KLNA 1L5UA 1S6QA 4DTPA 3HPGA 4HUGA 4AHVA 1BCMA 2BE2A 4F8RA 3OJSA 4M3XA 2VWKA 4CHQA 4FJ5A 4FM0A 2R7YA 3CQ8A 3KD1E 1R0AA 4BE0A 4CJ4A 2ETJA 1LAWA 1TAQA 2WOMA 3G0ZA 5C42A 2HHVA 1ZBUA 2O4GA 2QXFA 3OYMA 3RRHA 1IG9A 3I0RA 3M8RA 3OYCA 4Z4EA 4RW7A 4FJMA 1Y97A 4GVMA 4W5TA 1BL3A 4IG0A 3O3FA 3K5NA 2P5OA 2VG7A 2JLEA 3SYZA 4W5NA 3OS1A 1C0UA 3QIPA 4CJKA 5DK5A 3RMAA 2X74A 4JS5A 3DMJA 3EZ5A 3IAYA 3NE6A 4FJ9A 3ZT3A 3DOLA 4OLBA 1RDCA 1HRHA 1RTJA 2YKMA 3RTVA 1D9DA 3KKSA 4CFDA 2EHGA 3AA3A 1RTDA 1RT4A 2HHTA 4CEZA 3MEGA 4CEBA 1FXXA 1QTMA 4KTQA 3QNNA 1ZBHA 3CG7A 5FRNA 2G8IA 2B4JA 2FBVA 4OPJA 1ZYQA 1JLCA 5HRRA 3S3MA 4OLAA 4O5BA 2OPSA 3P5JA 3SI6A 3UIQA 2PY5A 2HNDA 1NKEA 2BDPA 4BACA 2D0CA 3NH1A 4AHRA 3OYKA 3S3OA 4RW8A 4DF8A 4M3ZA 3AVIA 3LP2A 4KB0A 3H08A 3EY1A 4Z4IA 1QQCA 1NJYA 2JGUA 3OYGA 3JSMA 3AVLA 4HHTA 1JLEA 1JL2A 5HRNA 4FW1A 1X9WA 3NBPA 4JRQA 2HHWA 3V81A 4C8KA 1BISA 1HYZA 1S1XA 1BIZA 1C1BA 3M8PA 3PUFA 3TAMA 3K5LA 3U6FA 2HB5A 1NK4A 3QEWA 4FK0A 3VQ9A 4KHNA 1RDDA 4CFAA 3VQBA 3QNOA 1JLBA 1LV5A 3T3FA 4J2EA 2IAJA 1DLOA 5T7BA 4LH5A 3PX4A 5HP1A 3HM9A 1RBRA 2KQ2A 2Y1JA 1X9SA 4HCBA 3LWLA 4N47A 1RBTA 3HPOA 4E0DA 1ZBFA 3ISNC 3S9HA 3FFIA 4PQUA 3TAQA 2P5GA 3QEIA 3KLGA 3F9KA 4CJVA 2F96A 3L2UA 2OZSA 4KHSA 1WSHA 1U48A 3AVNA 1X9MA 2QKKA 5DMRA 4OGCA 4W5RA 5J2MA 2KW4A 3SV4A 4DFKA 4CJPA 4B9TA 1S5JA 4Y1DA 3M8SA 3RR7A 4L8RB 4FK4A 1KLMA 3TWHA 3NH0A 4DLEA 3EYZA 4PA1A 4CJFA 5I3UA 5I42A 3RMBA 4I9QA 4CHZA 2GBZA 3AVFA 4O4GA 4LY7A 4DTMA 1HQUA 3BGRA 2YNIA 5CYMA 4FJLA 5K14A 1F21A 3AVJA 4B8AB 1S1UA 4CJUA 1KTQA 2FC0A 2XY6A 4ZTJA 4QAGA 3DRRA 3WNEA 1A5XA 3ZSYA 2WONA 4C8OA 3V1QA 1RT5A 1CXQA 3KTQA 4FLXA 4FJIA 4ZHRA 2G8HA 1TK0A 2P51A 4DTJA 3QEVA 1HNIA 1SL0A 4FW2A 1ZBIA 2XY7A 4CF2A 2HHQA 3TAFA 3AV9A 3B6OA 1GOBA 1XI1A 2YKNA 4FJGA 1UAXA 3LALA 1VK0A 3NFAA 4FXDA 4Y1CA 3NGZA 1T7PA 4Q0BA 4HCCA 1BI4A 2VG6A 1QSSA 4CEAA 2Z1HA 1UA0A 3NAEA 2NUBA 3SUPA 1IKVA 1EXQA 1GOCA 5FDLA 1NKBA 4B9SA 1LAVA 2ZE2A 3VQCA 3DLBA 2ZD1A 4M41A 1U45A 4IFVA 3L2WA 1S9GA 1YT3A 3DOKA 1VSMA 2D5RA 4W5OA 1NJZA 2G8KA 4AHCA 4B8CA 1Z26A 3QINA 4Q5VA 3SUOA 4E3SA 3NH2A 1S9EA 4KO0A 1XC9A 1S1WA 1VSIA 1GOAA 4G1QA 2KZMA 3SV3A 1TK8A 4C8MA 4FJHA 4CJWA 3K5OA 2DFEA 4OGEA 4F3OA 2OPQA 3S3NA 1SKRA 4FJJA 2HVHA 4CHNA 2VG5A 4FLYA 4M3RA 3VN5A 3SUQA 4IDKA 1JLQA 3NF8A 4DG1A 4KHUA 3PO4A 1NOYA 2G8UA 1RTIA 4DTSA 5CZ2A 4OKEA 4DTUA 5KTQA 4KHWA 4FJNA 1QE1A 1TKZA 1U04A 3T19A 2HNYA 1RCHA 1WLJA 4DU1A 2FBXA 1C0TA 1EP4A 1DTQA 3V9SA 1NK6A 4ELVA 2P1JA 4EP5A 1KCFA 4KB1A 4CF9A 1HJRA 4GW6A 3V9UA 5J2QA 1S6PA 3IS9A 1T03A 3KLEA 2G8WA 4I7FA 4MFBA 4AILC 2OPRA 1VSFA 3HT3A 3CFPA 4N41A 3HK2A 1TV6A 3NF6A 3SUNA 2OZMA 3NCIA 4UQGA 3OYJA 3LPUA 2GV9A 3HSTB 1BIUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1TVRA 4KBOA 4ISGA 5AQMA 3N4PA 4HWIA 4AM6A 1IKXA 1QVGM 1YHQN 2V7YA 4NLBA 1VHXA 1KVCA 1REVA 1N33K 4WFNL 5CHIA 1BDGA 1NM1A 3THWB 1RT1A 4M3WA 3WNGA 4JNEA 3GDQA 4OPKA 3VEWA 4KKOA 1OKJA 3C6TA 1Q8IA 3O8MA 1RT2A 1KAZA 4JKGB 3THVA 3HP9A 4CK3A 4DSKA 3PIPL 2QA4N 3QETA 1NK5A 3ZT2A 3J7AP 2FLOA 5AQYA 3FFKB 3A2FA 4DQQA 1GLAG 4E19A 1MWMA 3L4QA 4RG8A 3CJ7A 3MEEA 4JHDA 3ZX3A 2PBDA 4JS4A 2F8TA 1SKSA 4IFYA 4CZEA 3PX0A 4IZ9A 3OS2A 2RE2A 1VSDA 2HBLA 5AQRA 3DRSA 4YOVA 2XY5A 4N76A 2E2OA 4H0OA 5FROA 4CHYA 2ZGZA 3OYIA 3V4IA 3C6AA 3SQ0A 3TAEA 3M5RA 4NCAA 4M3YA 1WBDA 2OYQA 2HHUA 1YVUA 3U9ZA 2E2PA 1BGXT 3VGKA 3L4IA 4M45A 1YJ9N 4PUOA 2YV0X 4I6MA 5DM7L 4FCYA 3OYAA 2QKBA 4FL9A 2CGLA 2F7TA 3OYFA 4DCHA 3D45A 4BGBA 3KWGA 2UXBK 1ZBLA 2O8FB 1CXUA 4JV5K 4CZKA 5LJWA 1NJWA 4B08A 1K6YA 3CCRN 3TABA 3VQ4A 3KK1A 2CGKA 2XO7A 1NGCA 1U49A 1ASVA 1P8ZA 3L2VA 1LW2A 4JKBA 4EFHA 1JKHA 4BRNA 1ATSA 3FZMA 4KTWA 1MA9B 4G9ZA 3TAGA 3O9TA 2ZJRL 4O44A 2W6KA 1NK9A 4A5AA 3CCUN 2EWSA 3DLLL 2A1RA 3AARA 2YNFA 3MXIA 2AJQA 4C8LA 4B9MA 3VGLA 3ZSOA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1TVR A;  4KBO A;  4ISG A;  5AQM A;  3N4P A;  4HWI A;  4AM6 A;  1IKX A;  1QVG M;  1YHQ N;  2V7Y A;  4NLB A;  1VHX A;  1KVC A;  1REV A;  1N33 K;  4WFN L;  5CHI A;  1BDG A;  1NM1 A;  3THW B;  1RT1 A;  4M3W A;  3WNG A;  4JNE A;  3GDQ A;  4OPK A;  3VEW A;  4KKO A;  1OKJ A;  3C6T A;  1Q8I A;  3O8M A;  1RT2 A;  1KAZ A;  4JKG B;  3THV A;  3HP9 A;  4CK3 A;  4DSK A;  3PIP L;  2QA4 N;  3QET A;  1NK5 A;  3ZT2 A;  3J7A P;  2FLO A;  5AQY A;  3FFK B;  3A2F A;  4DQQ A;  1GLA G;  4E19 A;  1MWM A;  3L4Q A;  4RG8 A;  3CJ7 A;  3MEE A;  4JHD A;  3ZX3 A;  2PBD A;  4JS4 A;  2F8T A;  1SKS A;  4IFY A;  4CZE A;  3PX0 A;  4IZ9 A;  3OS2 A;  2RE2 A;  1VSD A;  2HBL A;  5AQR A;  3DRS A;  4YOV A;  2XY5 A;  4N76 A;  2E2O A;  4H0O A;  5FRO A;  4CHY A;  2ZGZ A;  3OYI A;  3V4I A;  3C6A A;  3SQ0 A;  3TAE A;  3M5R A;  4NCA A;  4M3Y A;  1WBD A;  2OYQ A;  2HHU A;  1YVU A;  3U9Z A;  2E2P A;  1BGX T;  3VGK A;  3L4I A;  4M45 A;  1YJ9 N;  4PUO A;  2YV0 X;  4I6M A;  5DM7 L;  4FCY A;  3OYA A;  2QKB A;  4FL9 A;  2CGL A;  2F7T A;  3OYF A; 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4CGJA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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