4CJ7A

Structure of crenactin, an archeal actin-like protein
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
426
structure length
426
Chain Sequence
SDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crenactin from Pyrobaculum Calidifontis is Closely Related to Actin in Structure and Forms Steep Helical Filaments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN/ACTIN FAMILY PROTEIN
molecule tags Structural protein
source organism Pyrobaculum calidifontis
total genus 105
structure length 426
sequence length 426
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cj7A01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cj7A02
4WQ5C 3WUHA 1NGDA 2FXUA 3VEWA 4GY2B 4CJ7A 1HPMA 2P9IA 3P4IA 3QMLA 3O1WA 4BVPA 4FOIA 4O8KA 4KBOA 2ASMA 1U2VA 2A42A 2A41A 3ID8A 4AM7A 1J6ZA 1CZAN 3QDKA 1YUWA 2QWNA 4H0OA 3ZEUB 4IJAA 1GLBG 2FSNA 5KQ8A 5AZIA 4XH1A 3ZETA 1T6DA 1JCGA 4JHDB 2I7NA 5F2RA 2PBDA 3AARA 5KQDA 5AQKA 5ADXH 3VGKA 2P9IB 3SMPA 3VERA 5AQHA 3WXLA 3EKSA 1TUUA 3O1BA 2QM1A 3J8AA 3L0QA 3CJ9A 1TUYA 3U4LA 4C23A 4JN4A 3IMXA 5FPEA 3A5OC 4O5FA 4BC2A 1V4SA 2ITMA 2ZGYA 4BR0A 1DEJA 1ATSA 1DKGD 4PKGA 2QWMA 2A6AA 5AZIB 3WEEA 1IJJA 3ZETB 1NGGA 3O5BA 4BGBA 3KZBA 1YXQA 2V51B 3AAQA 3ATUA 3DXKA 1KAZA 1QZ6A 2YCHA 2ZWHA 3HM8A 3VEVA 1E4FT 1MWKA 3GOIA 3A5LC 3ULEA 5I9EB 1WUAA 3CJ1A 2GEMA 2IVPA 2NRHA 5ADXA 4K43A 3DXMA 4JNEA 4CD3A 1IG8A 2ASPA 3LDPA 3WEEB 2J4RA 1S3XA 3QBXA 4CBUA 2UYTA 3BF1A 1DGKN 5B8HA 5AQWA 3EO3A 2FSKA 3DXKB 5FPNA 2FF6A 2VWBA 4FOEA 5ELZA 4BRNA 5AFUH 3CI5A 5BREA 4IWVA 3MN5A 2AA4A 1G99A 1ESVA 3H46O 1GLDG 3B8AX 3CIPA 3DXMB 3UKRA 1NGIA 4M63C 4PKHA 2W41A 4PL8A 3UB5A 5EVZA 4XH4A 3EZWA 2GUPA 3VESA 4BRKA 4H5NA 3CQYA 1NGCA 3H1QA 4WQ4A 4CBWA 3L6QA 5BPMA 2KHOA 4AM6A 2Q0UA 3I8BA 3H1VX 3LM2A 3FR0A 2E1ZA 1ATRA 1YVNA 5EOYA 2YJFA 2WUSA 3QFPA 3EN9A 4CI6A 5AFUA 3UKRB 2CGJA 4BC4A 2ZGZA 2IVNA 5AQLA 4FWSA 2NZTA 3GDQA 2V7YA 4FWNA 2W40A 1LCUA 4WYBA 5AQZA 4A2BA 2A40A 4CZFA 3BP8A 1GLJO 2YHWA 4BR5A 5JMVA 5AQTA 5FPMA 3VGLA 4RTFD 3GG4A 1NGFA 3DWLA 2P9NA 5AQQA 5TKYA 3CJBA 1ZBSA 2BUPA 2E20A 2GELA 1YAGA 3MMVA 4FWKA 2F9WA 3FZKA 1MDUB 1BA1A 1HUXA 3OHRA 5AZJA 1BU6O 3LDQA 5KPZA 3LDLA 4M7XA 3IDHA 4DB3A 4BQZA 3TU5A 3HBTA 2NLXA 1QQNA 1Z05A 3FZFA 2E88A 3CQXA 2E2NA 4BR9A 1HKGA 1GLCG 3VEOA 2P9NB 4K25A 5E26A 4MO5A 4BR2A 1BO5O 3C0BA 3L4IA 5AZJB 2HF4A 5KPTA 2QXLA 4RCHA 4BRHA 4K41A 1NGBA 1Y64A 5JLHA 4BVOA 1HKCA 1NGJA 4BR4A 4IO8A 2PAVA 2ASOA 5AQVA 1BDGA 1MA9B 1U2VB 2VYPA 1R59O 3A8YA 3H3OB 4I6MA 3QICA 4F9OA 5FPDA 2E1YA 3H45C 4FWLA 4IXCA 4FWQA 3VF2A 3A5MC 1H1VA 1ZXOA 4Y0WA 3ZX3A 4WQ5A 2HOEA 1GLEG 3W0LA 5KPRA 5BRDA 3HTVA 1HJOA 1U6ZA 2CH5A 4XEIA 3R6MA 5BRFA 1X9JA 1RGIA 3WQTA 5E84A 4BR7A 5BPLA 4A2AA 4FSVA 4I6MB 3QFUA 5AQJA 4B1VA 1XQSC 2VCPA 2Q97A 4H0VB 3WXKA 3VETA 3LDOA 5AQMA 4IZ9A 4E1JA 5JICA 5AQPA 1Q18A 2EWSA 1NM1A 5AQOA 1GLAG 3MN6A 4JD2A 4BGAA 1C0FA 3U9DA 4FWPA 3AY9A 3MCPA 4BRIA 4H0TB 3ULEB 3S41A 1T44A 3FZLA 1BG3A 1SAZA 3IUCA 3D7EO 2AP1A 2OANA 3D2FA 1OKJA 1T6CA 1BUPA 4H03B 2P9LA 4RWTA 3HZ6A 2YJEA 3A0IX 3SK3A 3HI0A 1E4GT 4ISEA 3JXUA 2P9SA 3R9PA 4JD2B 3ATVA 3GL1A 4HWIA 4A61A 3UKUA 4H5VA 3BEXA 3O4WA 5AQGA 3MN7A 3D2FB 1LOTB 4B9QA 5LY3A 4FWOA 4FPAA 1Z6RA 1KAYA 4BC5A 2QWRA 3SJHA 4BRMA 5AQFA 2FF3B 2A3ZA 2P9SB 3LDNA 3WXIA 2H3GX 4CZEA 1ATNA 4H5WA 1HX1A 4PL7A 1NLVA 2D1KA 2IVOA 2P9PA 3IFRA 3LM9A 4ISGA 3UKUB 3WXJA 1QZ5A 3JS6A 5BN8A 3FFKB 4YDUC 4BRPA 3QBWA 3W3DA 2D0OA 2E2PA 4BRLA 3I33A 3U8XA 1NGAA 2DPNA 2QWLA 3BF3A 5AQXA 3DJCA 2YHXA 2BTFA 5BPNA 3M6GA 4HTLA 3VEZA 2A5XA 4IJNA 3VGMA 5AQRA 3VF4A 3CJCA 3A5NC 2I7PA 2P9PB 1NBWA 3VPZA 3VF6A 3H3NO 3R8EA 1QHAA 2QWOA 3SMSA 1XC3A 2FSJA 3KVGA 3GE1A 3CHWA 3FZMA 4CZIA 3ENHA 2Q0RA 3O8MA 4FO0A 4B1UB 4CZGA 4B1ZA 3U9ZA 3O80A 2D4WA 3EL2A 1C0GA 1NGHA 1TYQA 4Z94A 3FZHA 4JAXA 4CZJA 4EIAA 1SZ2A 3SLCA 4FL9A 3M1FA 4YDUA 3D2EA 3ENOA 2V7ZA 4H5TA 1MWMA 4BROA 5LJVA 4GNIA 2E2OA 3C7NA 2FLOA 4H0XB 4EHTA 1NWKA 2GWKA 1GLLO 2HMPA 2P9KA 2Q1NA 3H6EA 1NGEA 1TYQB 1QQOA 2QWPA 1X3MA 4BRQA 2E8AA 2D0PA 4B1XB 5F1XA 4BG8A 4A62A 3CETA 3EKUA 3D2EB 4J8FA 3TPQA 3KHYA 3WT0A 2Q2RA 3VENA 1HLUA 1ZC6A 2GWJA 1BA0A 4WQ4C 2CGKA 4H0PA 4PKIA 2IIRA 3VEYA 4BRFA 3C7NB 4BRCA 4CZKA 4LC9B 1RFQA 1JCEA 2P9KB 2Q31A 2YI1A 4MLEA 5EY4A 3GBTA 5EX5A 4QS8A 3AAPA 4BQLA 4EAHD 1BWFO 4FWRA 4NO7A 4ISFA 5LJWA 4QS7A 4EFHA 4CBXA 3MDQA 4CZMA 3VEXA 3FLCO 2QW9A 4FPBA 1JCFA 4BREA 4CD1A 1GLFO 5AQYA 1EQYA 2P9UA 4CZHA 3ZX0A 3FE1A 5EXWA 2F9TA 4B1WB 5BR9A 3UE5A 1HKBA 3LL3A 5AR0A 1X3NA 5BRHA 3BUZB 4BRAA 2CGLA 4BRGA 3G25A 4FWMA 4B1YB 4EHUA 2QWQA 3QB0A 2P9LB 2HF3A 4K42A 4XH5A 1K8KA 3F9MA 4BG9A 3VOVA 3HSCA 5JLFA 2ZF5O 5CE3A 5AQNA 2P9UB 4QS9A 2YHYA 5F0XA 5BN9A 3RSEA 2E2QA 4NB4A 3MN9A 1NMDA 3WQUA 1XUPO 4CZLA 3DAWA 4H0YB 1KAXA 3CERA 4H5RA 1P8ZA 3M3ZA 1RDWX 1BOTO 1V4TA 1QQMA 2Q36A 3O6WA 4DCHA 1K8KB 1S22A 1SQKA 1D4XA 3MK6A 1WOQA 4L3QA 4M7YA 2V52B 3RSEB 4BRDA 4MO4A 3O08A 3ZX2A 1KXPA 3CJ7A 3CJAA 3FGUA 4DQ8A 4MLHA 3ZEUA 4DHYA 2GTDA 5AQUA 2CH6A 5AQSA 4BC3A 5AQIA 4JHDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CHQA 2O4GA 3ZSYA 2YX6A 3WNGA 4GY2B 3QEPA 4ID5A 2P9IA 3P4IA 1NNEA 4I7FA 3O1WA 4BVPA 4FOIA 4O8KA 4CIGA 3V9ZA 4FCYA 2A41A 3ID8A 3LAMA 4M3TA 4X62K 2E4LA 2FSNA 4H4MA 3SUQA 4IFYA 1S1XA 1NKBA 1T6DA 3V4IA 1RDUA 1REVA 3VERA 5CYQA 3O1BA 3J8AA 3L0QA 4YOUA 4W5OA 4DR1K 2VQEK 3NF6A 3DRRA 3U4LA 1GOAA 2VQFK 3A5OC 4Y1CA 4JKHA 2ZGYA 5M1QA 5DM7L 1DEJA 1DKGD 3TANA 2QWMA 2WONA 1NGGA 3KZBA 4GV9A 3CPEA 4CJKA 4KI4A 2YCHA 4CF9A 2R7YA 2ZWHA 1VK0A 4DFJA 4EP4A 5M1FA 3DRSA 1ASUA 4BDYA 2GEMA 2NRHA 3PX6A 4JNEA 4DR4K 1ASVA 1S1TA 2E6LA 3WEEB 3HSTB 3QBXA 3CCUN 3OYIA 2UYTA 3BF1A 1DGKN 5B8HA 3QETA 5AQWA 3DXKB 4NCBA 4FOEA 4OGCA 5ELZA 2HMIA 5TKWA 5GIPA 5AFUH 4B3RK 5BREA 1G99A 1GLDG 1NMNA 3NH2A 3MAQA 2G8WA 3O9QA 1LV5A 4JI3K 4XH4A 4H5NA 3H1QA 4WQ4A 4CBWA 3KKSA 1KVCA 1VSFA 3RRHA 4HCCA 2UUBK 4LF6K 3KLGA 4I9QA 3FR0A 5M1KA 3KIOA 4OPAA 4CIFA 4DV4K 1KCFA 4H8KA 2YJFA 4CI6A 3UKRB 4NYNA 5LL6Z 4BC4A 5AQLA 2RE2A 3HO1A 4QOZB 4GKKK 5I3UA 1ZBFA 4FLXA 4B9LA 4FJLA 3QESA 2BH1A 4RTFD 2P9NA 3G0ZA 3CJBA 3ZSZA 2E20A 3MMVA 2F9WA 3KKRA 4DQIA 3K9KA 4CF8A 5KPZA 1VQ9N 4FJMA 4HCBA 4DV0K 2O4IA 3WNEA 3IDHA 4CEFA 3SNNA 3CC7N 1BISA 4DB3A 4BQZA 1YITN 3VQEA 4PA1A 4CFDA 1QQNA 2XY6A 2G8FA 2VG5A 3T1YK 2F4VK 2KZMA 3OS1A 2P5OA 3QO9A 4E1MA 1BO5O 4CGIA 1UWBA 3VTIA 3L4IA 5KPTA 3L2VA 4ZTFA 3CMAN 1S6QA 1NGJA 3MWTA 1D9DA 2YV0X 2NRXA 4WCEL 2YHAA 4Z4FA 1TL3A 4N5SA 1YVUA 3H3OB 2HB5A 4NYFA 4F9OA 3MCAB 5CR4A 2ZD1A 3KK3A 4DR2K 4YOYA 4IOXA 3TSQA 1Y97A 1TKZA 4Y0WA 5DMRA 2ZJQL 3H08A 3SV4A 3AVIA 2OZSA 1WAFA 1HJOA 3ZLJA 3ITHA 3M8QA 4XEIA 1NJYA 1X9JA 3QNNA 3TWHA 5E84A 4BR7A 1K9MO 2GUIA 3ZSVA 4A2AA 4FSVA 3MECA 1DT9A 4KHSA 5J2MA 3QFUA 2Q97A 3PLAA 4H0VB 4DFKA 4DTNA 3LDOA 5AQMA 2OCEA 1S9EA 3THYA 1BIZA 1LAVA 4E1JA 3P1GA 2EWSA 1WSIA 1GLAG 3MN6A 3THWA 5HLFA 3UIQA 4BDPA 1C0FA 2BDPA 3AY9A 4BRIA 1RT7A 3CFOA 4IEIA 4JKFA 4CEZA 4DR5K 4ILJA 3ZSXA 2OANA 1RDAA 1S1UA 1BUPA 4LH4A 4DSEA 2HHXA 2JWKA 1WB9A 4LFCK 3SK3A 3DLRA 5KI6A 1FKPA 3VTHA 2FBVA 1E4GT 1ZBHA 1L3SA 3SUOA 1XI1A 3SI6A 3OYKA 4LF7K 3ATVA 3C6AA 3GL1A 2BANA 4A61A 5JVHL 4ZTJA 2QKKA 3L2QA 4DLGA 1JLQA 1JJ2M 2NUBA 3ID6A 3RMBA 3VQ5A 1OVQA 2KFNA 3D2FB 4B9QA 3G4SN 3CCVN 2QWRA 3I0RA 1KVBA 4O8UA 2DY4A 3T1HK 4JI1K 3J7YP 1NJIO 3OW2M 1ATNA 3C65A 2D5RA 4PL7A 1IKWA 2NRVA 3SAFA 2P9PA 3WXJA 3HVRA 1T03A 3JS6A 5BN8A 3ZYYX 5J1EA 2G8IA 1Q8IA 3VQ8A 3TAPA 5HROA 2PY5A 1Q82O 3HOTA 1VQPN 3ISNC 3NH1A 2Y1JA 3O3HA 4DV1K 1NKEA 3M6GA 4UY8O 3VEZA 4IJNA 4E19A 4H4OA 4DUYK 4B8AB 1F21A 1KC8O 3H3NO 4CERA 4CHNA 4B3TK 3CHWA 3CM6A 4CK2A 2VGMA 1HYZA 3U9ZA 1A5XA 3TTFA 1GOBA 4A5BA 4XIUA 1TYQA 4Z94A 3DMJA 4CZJA 3M1FA 3RMCA 3MX5A 1QS4A 1HNZK 2V7ZA 3AVGA 1QTMA 3OVNA 4FZYA 5C0YA 4GNIA 2E2OA 3C7NA 3P31A 4FK4A 4N47A 3J7AP 2GWKA 3RMAA 2G8VA 4CIEA 3H6EA 5BR8K 3HRGA 4Q5VA 2D0PA 4FJNA 4B1XB 3DOLA 4NCAA 3U3YA 4A62A 3CETA 4B8CA 4J8FA 1RBUA 1J53A 4KKOA 4DTJA 4GKJK 1BA0A 3TAGA 4K8XA 4H0PA 3TAFA 2XRIA 1BQMA 3C6HA 4CZKA 4KAZA 1M90O 4A59A 2XY5A 1NK0A 4LC9B 2BE2A 4R79A 1KLNA 4QS8A 4CEEA 4BQLA 3MX2A 2OTJN 1BWFO 2VG6A 1Z25A 4YORA 1YIJN 4PWDA 5LJWA 4M45A 5M1OA 2KQ2A 4CJRA 4PQUA 1A5VA 4BREA 1GLFO 1KTQA 4CZHA 4DLEA 4MQ3A 3ALYA 1LAWA 4OPJA 5AR0A 3VQCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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