4CJ7A

Structure of crenactin, an archeal actin-like protein
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
426
structure length
426
Chain Sequence
SDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crenactin from Pyrobaculum Calidifontis is Closely Related to Actin in Structure and Forms Steep Helical Filaments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN/ACTIN FAMILY PROTEIN
molecule tags Structural protein
source organism Pyrobaculum calidifontis
total genus 105
structure length 426
sequence length 426
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cj7A01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cj7A02
1CZAN 5BRDA 1BA0A 4BR0A 3U4LA 4IJNA 4A2AA 1BUPA 3VOVA 5AQJA 2ZGYA 5FPEA 2ITMA 4H5TA 2ZWHA 3DWLA 3UKUB 3EKSA 5AQPA 1NGDA 5LJVA 3WEEB 1GLJO 3IMXA 4Y0WA 2CGLA 1JCGA 2P9SA 3C7NA 3U9ZA 1Z6RA 2QM1A 3HM8A 3CJ1A 1ESVA 3MMVA 4FPBA 2IVOA 1E4FT 2A5XA 3FGUA 4ISEA 2I7PA 2ASPA 2P9KA 2VYPA 5ADXH 4FWQA 2FF6A 2YCHA 4JAXA 2F9TA 4XH5A 3O8MA 4BRMA 3FZMA 3M6GA 4IO8A 3WXJA 3SLCA 5AQOA 2P9NB 4H0XB 1NGFA 3L4IA 3VGMA 4JNEA 3AY9A 5AFUH 2H3GX 2F9WA 4ISFA 3SJHA 1BO5O 1DGKN 1NGEA 4IWVA 1XUPO 3A5NC 3ZETA 4JN4A 5TKYA 2QXLA 3TU5A 3DJCA 4EIAA 1ZC6A 3UE5A 5AQTA 4FSVA 2E88A 4YDUC 4MLEA 4CZIA 1XQSC 1NGHA 3C0BA 2E1ZA 1YUWA 3LDNA 1U2VA 3VF2A 1IJJA 3L0QA 3EN9A 3FZKA 2HMPA 1NGJA 4H5RA 5AQZA 3OHRA 3HBTA 3VEZA 4Z94A 3ID8A 2GTDA 4CZKA 4H03B 3VEYA 3LM9A 3U8XA 4NO7A 4M7XA 3H1VX 5LY3A 4JD2A 3MN7A 4BG9A 4BRQA 5CE3A 3JS6A 3U9DA 2IVNA 3HSCA 2IVPA 5ELZA 5JMVA 4M63C 4XEIA 4BRNA 4CD1A 1KXPA 1J6ZA 2QWMA 3ENHA 3UKRB 3CQYA 4H0VB 1RGIA 2QWRA 3R9PA 4O5FA 3DXKB 2A42A 2GELA 4F9OA 2P9LA 4CZLA 1MA9B 5FPNA 3ZEUA 2E2QA 4K25A 2V7ZA 5BPLA 2YJFA 4FO0A 5F2RA 3D7EO 4PL8A 4CZEA 3BUZB 1MDUB 3GL1A 5F1XA 1ATRA 3TPQA 2GEMA 3GOIA 4H5VA 2J4RA 1YVNA 2Q36A 4CBWA 5AQRA 5AQNA 4BRIA 3QFUA 2QWQA 1NWKA 1YAGA 5AQGA 4EHUA 1RFQA 1GLCG 2NZTA 5EX5A 3SK3A 3A5OC 4B1WB 3CI5A 2DPNA 1JCFA 1NGCA 1QZ5A 3A0IX 2VCPA 4PL7A 1NGGA 3W0LA 1JCEA 1Y64A 4JHDB 2QWOA 2OANA 4EHTA 2D4WA 3VERA 3ATVA 4LC9B 2ZGZA 5AQIA 4BGAA 3LL3A 1K8KA 4DCHA 2CGKA 1EQYA 5AR0A 2PAVA 4BRKA 3FE1A 2YHXA 3UB5A 3GBTA 3WQUA 3VEXA 2YHWA 3CQXA 1S22A 3ULEB 2P9IB 1KAXA 3R8EA 3H3NO 2E20A 1HPMA 5KPZA 2UYTA 3EZWA 3DXMB 4BR4A 3FFKB 4I6MA 4PKIA 2ASMA 3RSEB 3CIPA 4HTLA 5I9EB 2FSKA 1NGBA 2FSNA 2V7YA 5E84A 2P9UA 3CERA 2YHYA 4H0OA 4B9QA 3WUHA 4AM6A 3QMLA 3S41A 4FOIA 2Q2RA 2E2NA 4FWRA 4O8KA 4B1YB 1LOTB 3H46O 4A61A 4FWNA 1QQMA 1X3MA 3GE1A 1V4TA 3BF1A 1QQNA 2WUSA 4NB4A 2A41A 2FLOA 2P9PB 2GUPA 1QHAA 2A3ZA 5AQLA 3IUCA 5AZIA 4EFHA 2A40A 1GLDG 3QFPA 3FZLA 2KHOA 4WQ4C 4BR2A 5AQMA 5AQSA 4BVPA 4BR7A 5ADXA 1ZBSA 2YJEA 3KZBA 3O1WA 5AQQA 4BRAA 3O08A 1BG3A 4RCHA 5AQUA 1GLBG 3UKUA 3D2FB 4H5NA 3VGLA 3HTVA 5KQ8A 4H0PA 3WEEA 4M7YA 4K42A 2ASOA 3KVGA 1TUYA 5B8HA 4H0TB 4BRDA 3H3OB 3FR0A 3VEWA 5AFUA 1E4GT 3QB0A 4XH4A 4FL9A 4DHYA 5LJWA 1X3NA 5BPNA 2V52B 2Q97A 3VEOA 3LDLA 1HKGA 5AQVA 3D2EB 1MWKA 2HOEA 1X9JA 2EWSA 5AQHA 1ATNA 4ISGA 4BGBA 5BPMA 3HI0A 2NRHA 1T6CA 3MN6A 3GG4A 4K41A 3LM2A 4BC5A 4BG8A 1Q18A 5AQFA 2P9NA 4MO4A 5AQYA 3CJCA 1BA1A 2AP1A 1H1VA 2P9SB 3C7NB 1P8ZA 2HF3A 4AM7A 4HWIA 3IFRA 3O5BA 3KHYA 2W41A 2P9KB 4BQLA 4IXCA 3ZX3A 4FWLA 1IG8A 3SMPA 4BROA 2BUPA 3FLCO 4BREA 3O80A 3QDKA 2D1KA 1HX1A 4YDUA 3VF4A 1C0FA 3WT0A 3QICA 4GNIA 1GLAG 5AZJB 4BC3A 1Z05A 4PKHA 3M1FA 4BQZA 3VF6A 4L3QA 4B1UB 5F0XA 4BC2A 4CBUA 1QQOA 2NLXA 3ZETB 1D4XA 5EOYA 4K43A 1R59O 5EXWA 1T6DA 3F9MA 2PBDA 4QS9A 1U6ZA 5JLFA 4H0YB 4FWOA 2YI1A 1SAZA 4CZMA 3G25A 1DEJA 3QBXA 3WXIA 1ATSA 1U2VB 3L6QA 5AQXA 1HUXA 3UKRA 4RWTA 4WQ5A 3O6WA 3AAQA 1LCUA 3BEXA 4FWPA 1V4SA 3DXKA 3D2EA 3P4IA 2Q0UA 2QWLA 3H45C 1BOTO 3CETA 5FPDA 4JD2B 2FSJA 1C0GA 3EL2A 1NLVA 1NM1A 2A6AA 3CJAA 1HKBA 1G99A 2BTFA 3CHWA 3B8AX 4FWKA 5BN9A 3ZX2A 4E1JA 3M3ZA 3CJ9A 1SQKA 2QW9A 2VWBA 3CJ7A 4H5WA 5AQWA 3J8AA 1BU6O 2QWNA 3EO3A 4B1ZA 4KBOA 5KPRA 3AARA 1GLLO 2P9LB 2Q31A 3JXUA 1YXQA 1NMDA 3WXKA 4FWSA 5FPMA 3BP8A 4IJAA 3ZEUB 5AZJA 2V51B 4FPAA 4JHDA 1TYQB 3ATUA 4WYBA 5BRFA 2E2OA 1S3XA 3MDQA 3EKUA 2FXUA 3A5LC 3FZFA 2HF4A 1WOQA 4A62A 4C23A 1GLEG 1TUUA 1HKCA 3O4WA 5BR9A 1QZ6A 1HJOA 1T44A 1HLUA 2E1YA 3I33A 2Q0RA 4A2BA 4BRHA 3ULEA 5KPTA 4RTFD 2GWKA 2P9IA 1GLFO 4DB3A 4CZJA 3QBWA 3H1QA 4BC4A 3SMSA 3FZHA 4BVOA 2GWJA 1RDWX 4XH1A 4CZHA 3DXMA 1K8KB 4BRGA 3A8YA 2I7NA 3VETA 3RSEA 4IZ9A 3HZ6A 3VGKA 4MO5A 1MWMA 2CGJA 3A5MC 4BR5A 3CJBA 2IIRA 2QWPA 4CZGA 3AAPA 2E8AA 1DKGD 1KAYA 4PKGA 5EVZA 4BRPA 5KQDA 5E26A 1NBWA 3LDPA 4GY2B 4BRLA 2CH6A 2D0OA 3DAWA 4WQ5C 3IDHA 4CZFA 4EAHD 4BR9A 4BRCA 1KAZA 4MLHA 5EY4A 3O1BA 2AA4A 3MN5A 2FF3B 4QS8A 4I6MB 5BN8A 2P9PA 1BDGA 4CI6A 4J8FA 1WUAA 1SZ2A 2P9UB 1XC3A 3LDQA 4WQ4A 5JLHA 3VESA 3WXLA 1ZXOA 4CBXA 1TYQA 3VEVA 3BF3A 5AQKA 2ZF5O 3LDOA 3MCPA 2E2PA 1OKJA 2CH5A 4DQ8A 3MN9A 4BRFA 4CD3A 2Q1NA 4B1VA 4B1XB 2W40A 2D0PA 4FOEA 3GDQA 3WQTA 3ZX0A 3W3DA 1NGAA 1BWFO 5AZIB 5JICA 1NGIA 4FWMA 3D2FA 3I8BA 3R6MA 3H6EA 4CJ7A 4QS7A 3VENA 3ENOA 5BRHA 3MK6A 5BREA 3VPZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5BRDA 4KV8A 1BA0A 5AJ3K 1YTUA 5DM7L 3U4LA 1BUPA 3VQDA 3CXCM 4DTRA 3OBWA 1D9DA 1TAUA 1JLQA 1VSKA 3U3GA 2RE2A 3NF7A 3IMXA 4Y0WA 4ZTJA 2P9SA 3K58A 4KRFA 3U9ZA 4ILJA 3CJ1A 1ESVA 1QSLA 4FJ7A 3OYJA 4J2BA 2I7PA 1UA1A 2HNYA 3SQ1A 3O8MA 4BRMA 1HNVA 3FZMA 1YIJN 3SPYA 1YITN 3KWGA 5AQOA 2YHAA 1NJWA 4I7FA 2NUBA 3QETA 2P9NB 1NGFA 3L4IA 1U48A 3VGMA 1BCMA 4OPJA 1NGEA 3FFIA 1XUPO 3ZETA 4GKKK 4FW1A 5TKYA 3LAMA 2OPPA 2E6LA 3CCEN 3CPEA 4IG3A 4YDUC 5CY4A 4CZIA 1I3AA 1NGHA 3BZCA 2E1ZA 4OPKA 3LWMA 1KFDA 4BDZA 1YUWA 3OYAA 2JWKA 2HMPA 3ID8A 2KZZA 4H03B 3VEYA 3LM9A 1NMNA 4NO7A 5LY3A 3MN7A 5CE3A 3EYZA 3U9DA 1EKEA 1NG9A 1WSEA 4M63C 5CHIA 3V1QA 1GOAA 1KXPA 2PYLA 3UKRB 3CQYA 4JKCA 4PHTX 3E9OA 4OPHA 4KB1A 4OPAA 3SNNA 3OJSA 2E5LK 3OY9A 4CJFA 1J53A 4CZLA 1FXXA 5FPNA 3ZEUA 2E2QA 3T19A 3RMDA 1BI4A 3EY1A 3HL8A 4E1MA 1VSDA 1ZBUA 4FO0A 5F2RA 4PL8A 3S3OA 1U47A 3BUZB 5F1XA 1ATRA 1ZYQA 4H5VA 2J4RA 4A5BA 2Q36A 3VQ8A 2GX9A 5AQNA 2QTDA 1RILA 3TSUA 1Q82O 5EX5A 3SBGA 3JAMO 2DPNA 1JCFA 1NGCA 1QZ5A 2VCPA 3A0IX 3AO3A 4CGHA 4ELTA 3CFOA 3TAMA 2HHWA 3KLIA 1FJGK 2ZM6K 1Y64A 2O8FA 4EHTA 2D4WA 4HUEA 1IKYA 4PA1A 5FRNA 3M8PA 3LL3A 4C8LA 1CLQA 5LL6Z 4BRKA 2FBXA 2YHXA 1OVQA 2KFNA 4DR4K 3VEXA 4CESA 4C8MA 4OKJA 3CQXA 2YNIA 3O9SA 2P9IB 3R3LA 3C6HA 3VQ5A 3VQCA 5KTQA 3R8EA 4IO9L 2D0CA 2E20A 5KPZA 3KLHA 4HCCA 3K5MA 3T1YK 3FFKB 4UQGA 2ASMA 4CHZA 5I9EB 4JK7A 5E84A 1OH8A 1N34K 1RT5A 3LALA 3AVKA 4FJMA 2XY5A 3WNEA 4I9LA 3CCLN 4DFMA 4FOIA 4BWJA 3AA4A 2E2NA 1X3MA 3CC4N 4JRPA 5CZ1A 3RMBA 3TAQA 1FKOA 5AZIA 1KVBA 2XY7A 3TAGA 4AHCA 3CCRN 3QIPA 4BR2A 3OYGA 4NCGA 1JLCA 2ZJRL 4BR7A 1Q8IA 1W2BM 3HM9A 4M41A 4JI0K 2E6MA 4PWDA 3AO1A 5FDLA 5EU7A 3F9KA 5AQUA 3UKUA 3NGZA 4H0PA 4M7YA 4JI3K 4WFAL 3KVGA 4H0TB 4BRDA 3DLEA 4N56A 3FR0A 3V9ZA 4B8CA 3K2PA 3DLRA 4DHYA 3HVRA 4CJ3A 4N47A 4BDPA 2HHXA 3AVGA 2HVHA 5AQHA 4CHOA 1ATNA 2NRHA 1DTTA 3LM2A 2YNGA 4KH6A 5CYMA 4FJGA 3RR8A 1TGOA 2P9SB 4CIFA 4J2EA 3KK1A 4HWIA 2W41A 3SBTA 3VTHA 4FJ9A 4LF9K 3VTIA 1L3VA 4YOVA 4BROA 3O80A 2D1KA 1RDCA 1ASWA 3LP0A 1D9FA 3CMAN 4O8UA 1ZBIA 3KD5E 1GLAG 5AZJB 3ZYYX 1X9SA 4FJIA 2OA8A 4PKHA 1BQMA 4BQZA 4JK8A 3VF6A 4B1UB 4BC2A 4DR7K 3ZETB 5EOYA 1RDBA 1VQ6N 5EXWA 4B3OA 1T6DA 3HRGA 1JL1A 1HQUA 3G6EN 3K9KA 5FLXO 4CHPA 4FWOA 4F3TA 4M3UA 1EO1A 3QBXA 1G15A 1ATSA 3VMFB 5AQXA 1RBUA 1J54A 2NRWA 4CW7B 1Q81O 3NVMA 3BEXA 4YNQA 3DXKA 4FJ8A 1XC9A 1BOTO 3L2WA 2FSJA 1BIZA 1HKBA 4H4MA 3CD6N 2IGIA 1G99A 2BTFA 3LPUA 2Y1JA 5BN9A 2PZSA 4DSIA 1IBKK 3CJ7A 5AQWA 3J8AA 3HPHA 1TV6A 3EO3A 3KIOA 4DKWA 5A2QO 3QEPA 3T3FA 1NMDA 2A1RA 5FPMA 2RPIA 3ZEUB 1RTJA 3HYFA 3KKSA 1BI4B 2V51B 5HBMA 3ZT0A 4CJ5A 2JLEA 5HRSA 1BGXT 1O13A 1S3XA 2A1SA 2FXUA 3A5LC 4KKOA 3NGIA 1U45A 4G9ZA 1WOQA 5J2MA 1WAJA 1QSYA 1UOCA 4A62A 4C23A 4UY8O 1S72N 3AV9A 1RT7A 4K0KK 4LH5A 3G71N 3IKMA 4A2BA 3DLKA 2O8FB 2O4IA 1RBSA 4GV6A 3H1QA 4BVOA 4AHVA 2XY8A 4PUOA 3DXMA 1VSIA 3A8YA 5KGWA 2I7NA 4YOUA 3VETA 3BY5A 1QVFM 3KKRA 4F2SA 1MWMA 4B9MA 3U3YA 4LY7A 1TK5A 2IIRA 1KAYA 3OYNA 2HHQA 4CHNA 4AHSA 2KLAA 3HOSA 5C24A 5KQDA 3HVTA 3LDPA 4BRLA 2UUBK 3P83D 3IDHA 4CZFA 1C1CA 1GOBA 4IKFA 5BN8A 3TAPA 5C15A 2P9PA 4IOXA 4FLTA 4FJKA 2P51A 4WFBL 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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