4DHYA

Crystal structure of human glucokinase in complex with glucose and activator
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
455
structure length
448
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase/transferase activator
source organism Homo sapiens
total genus 179
structure length 448
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4dhyA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4dhyA01
2YHYA 3FFKB 3BEXA 1NMDA 3EKUA 3FZFA 2QWOA 2VCPA 1WOQA 2GWKA 4BRQA 5BRHA 1RFQA 2ASOA 4XH4A 3CJBA 4FWPA 1HUXA 3IDHA 5AFUH 3B8AX 1ZBSA 4WQ5A 4QS7A 1BA0A 1SQKA 3H46O 5KQDA 4XEIA 3WQUA 5EXWA 3UKRA 4DCHA 1YAGA 4CD1A 4GY2B 3VEYA 4JN4A 1U2VA 3CQYA 1OKJA 2W41A 1HJOA 3CIPA 4J8FA 1YUWA 4MLHA 4B1XB 3VESA 1NGAA 5F2RA 3A8YA 5AQXA 2HMPA 4K25A 2NLXA 2ZGZA 3UKRB 4A2BA 3L4IA 1NWKA 3LM9A 1U2VB 1GLEG 1KAYA 3DXKA 5TKYA 2P9IA 3VETA 1T44A 2ZGYA 1GLLO 3H3NO 4JD2A 4PKIA 1J6ZA 1ZC6A 3RSEB 4C23A 4CBUA 3GOIA 5AZJB 3O80A 4BREA 4HTLA 3LDLA 3H45C 5FPNA 4AM7A 5AFUA 5BPNA 4HWIA 1HKBA 3DXMA 3BP8A 4JD2B 5AQVA 2GEMA 3FR0A 1DGKN 3HI0A 4H5TA 2IVOA 2NRHA 3FE1A 4JHDA 3AARA 4BRDA 3F9MA 5AQJA 1G99A 2AP1A 4FO0A 4BROA 4CZMA 3DXMB 4O8KA 4M7XA 2BUPA 4FWOA 4DB3A 5AQQA 3LDOA 2P9NA 2YJEA 3EKSA 3SLCA 3U9DA 4JHDB 1GLAG 1R59O 5EVZA 4JNEA 3M6GA 3QICA 2YHXA 3ATVA 3VEVA 3CJ9A 3HSCA 2FSJA 3KHYA 1DEJA 1NGJA 4CZEA 3EO3A 3GE1A 4WQ4C 4BGBA 3O5BA 2Q0RA 1GLFO 4DHYA 4BRIA 1KAXA 5CE3A 4B1YB 4IXCA 1C0GA 1HKCA 3C0BA 3VEWA 3FGUA 1C0FA 2ASPA 4IJNA 1XQSC 2CGLA 2DPNA 5AZIB 1XUPO 1S22A 1HLUA 3H1QA 5BN9A 5JICA 2V51B 4FPAA 2QWNA 3LDPA 4I6MB 4BRCA 2P9SA 3H3OB 4M7YA 4A2AA 3D7EO 5ELZA 2E20A 2EWSA 4FSVA 4JAXA 3ZX2A 3A0IX 2QM1A 5KPZA 2GTDA 4AM6A 1U6ZA 1BU6O 1V4SA 4IO8A 3R9PA 3VF6A 3A5MC 1QZ5A 3JS6A 3LL3A 4QS8A 4BR4A 3IUCA 2P9PA 3EL2A 4H5VA 5AQHA 4BRNA 4CI6A 1MWKA 3VENA 3VEOA 1E4GT 3MN5A 3WXIA 2W40A 4IZ9A 4H0TB 3VOVA 4IWVA 2P9PB 3W3DA 3J8AA 1RGIA 2E2NA 3ENOA 5AQPA 2QWRA 4Y0WA 5EOYA 1YVNA 3IFRA 2E88A 3OHRA 2E1YA 4WQ4A 2I7NA 3SMPA 3HM8A 1QQOA 4BC2A 3FLCO 4H03B 3I8BA 3ZEUA 2ZF5O 4A62A 5BPMA 2AA4A 5F1XA 1HX1A 3C7NB 1SAZA 3WEEA 3MN7A 4FWQA 3VGMA 5FPMA 5E84A 2PBDA 4BQLA 3VGKA 2A42A 1DKGD 2IIRA 3ZEUB 3TPQA 1NGCA 4NB4A 3RSEA 3ULEA 3AAPA 4H5NA 3WEEB 4CZKA 4BRHA 5AZJA 1GLDG 4PKGA 1NGEA 2Q31A 5F0XA 3EZWA 4FWKA 1X9JA 2Q0UA 2I7PA 4MO4A 3D2EA 2P9KB 3CJ7A 2A3ZA 3ULEB 4FWRA 5BRFA 4PKHA 4EHUA 2Q2RA 1IG8A 3CHWA 5KQ8A 5JMVA 4ISGA 1KXPA 2HOEA 3H6EA 4CJ7A 2D0PA 2P9UB 3EN9A 3D2EB 1X3NA 1XC3A 3CJAA 3ZETB 4KBOA 4FWNA 1ATNA 1WUAA 4FWLA 1T6CA 4CBXA 3MCPA 1TUYA 4L3QA 4O5FA 2J4RA 4EAHD 5JLHA 2FF6A 5AQZA 3MMVA 4NO7A 4CZGA 1NGGA 4PL8A 3UB5A 2IVPA 2QWQA 1H1VA 1QHAA 1ATSA 3UKUB 4FWSA 2ASMA 2YHWA 4BVOA 5B8HA 2F9WA 4CZHA 3CQXA 2UYTA 4K42A 4BRLA 2P9LB 2H3GX 5AZIA 3U8XA 3KZBA 3QMLA 3WQTA 3H1VX 1LOTB 4H0VB 3MK6A 3MDQA 5BRDA 4PL7A 3O1BA 3WXKA 5AQWA 1CZAN 4I6MA 2V7ZA 3D2FB 4FOEA 2KHOA 1ATRA 5I9EB 5AQSA 3DJCA 3I33A 3O4WA 1SZ2A 1Z6RA 3BF3A 5AQUA 4BRGA 4BRFA 5FPDA 4BR7A 1JCEA 2Q1NA 3CJ1A 4RTFD 3FZKA 2FLOA 1NGBA 4FPBA 3VERA 1TYQA 5E26A 2NZTA 2HF3A 3CJCA 3WT0A 3A5LC 3G25A 5AQRA 3VGLA 3L0QA 2GWJA 2QXLA 3R6MA 4FL9A 4IJAA 4FWMA 1BA1A 4FOIA 4B1UB 1GLBG 5AQNA 4BG8A 1TYQB 3UE5A 1NBWA 2CGKA 2QWLA 4EFHA 1QQMA 1K8KB 4ISEA 4B1ZA 3C7NA 1QZ6A 3HBTA 3WXLA 4BC5A 4K41A 2D0OA 4CBWA 5BN8A 4M63C 1RDWX 4XH1A 3FZHA 4E1JA 3M1FA 5LJVA 1YXQA 2PAVA 2D4WA 1GLCG 3HZ6A 4B1WB 2Q97A 1T6DA 2FSNA 3TU5A 4BRMA 5AQIA 3R8EA 4H0PA 2BTFA 4BR0A 2YI1A 1BOTO 2P9KA 5AQGA 3ZX0A 4CZJA 3ATUA 3WXJA 3FZLA 1Y64A 2CH6A 3BF1A 2E1ZA 5AR0A 4BG9A 3CETA 1S3XA 2YCHA 3O8MA 1NGFA 2P9UA 3ZETA 4H5WA 3VF2A 4LC9B 4BRKA 2FF3B 4BQZA 1MDUB 3VEXA 3QDKA 4CZIA 3A5NC 4H0XB 5EY4A 3BUZB 5AQLA 3M3ZA 5AQOA 4RWTA 3P4IA 2FSKA 4GNIA 4BR2A 2E2PA 4B1VA 2A6AA 2ZWHA 5AQFA 2V52B 3MN9A 1BUPA 1NGDA 3U4LA 4MLEA 3O6WA 5KPTA 1P8ZA 3DWLA 3W0LA 5KPRA 2HF4A 3QFPA 5AQMA 3UKUA 3JXUA 5LJWA 2OANA 5EX5A 1TUUA 4EHTA 1ZXOA 4H0YB 3MN6A 5ADXH 2P9LA 3DXKB 2P9IB 3L6QA 1NGHA 3O08A 4BC3A 2FXUA 1HKGA 1MA9B 1BDGA 3D2FA 4BR5A 1JCGA 3KVGA 1NGIA 2D1KA 1V4TA 2A40A 2QW9A 3AAQA 2QWMA 4YDUC 4BRAA 4CZFA 2GUPA 4MO5A 1NM1A 3QFUA 4RCHA 3U9ZA 2E8AA 2VYPA 4BVPA 4DQ8A 2CH5A 1KAZA 1JCFA 1MWMA 3AY9A 5JLFA 3CI5A 4F9OA 3LM2A 3S41A 2E2OA 3FZMA 5AQKA 3SK3A 4H0OA 3WUHA 2E2QA 2P9NB 3VEZA 2A41A 4WQ5C 4ISFA 4K43A 4B9QA 1Q18A 2QWPA 3ENHA 5FPEA 4A61A 1EQYA 3DAWA 5LY3A 1BWFO 1HPMA 3SJHA 2GELA 3ZX3A 3GBTA 4BR9A 2Q36A 4CD3A 1E4FT 4XH5A 2ITMA 5ADXA 2WUSA 4Z94A 5BREA 3HTVA 3QB0A 4BGAA 1K8KA 1D4XA 3GDQA 1X3MA 3GL1A 4BRPA 4BC4A 3QBWA 2F9TA 3O1WA 1Z05A 5AQTA 3SMSA 2CGJA 1LCUA 2VWBA 1ESVA 1IJJA 1NLVA 3VF4A 5BR9A 2YJFA 3LDNA 3IMXA 1GLJO 3A5OC 4WYBA 4QS9A 3GG4A 5AQYA 1BO5O 2P9SB 4CZLA 3LDQA 4YDUA 5BPLA 3VPZA 2IVNA 1QQNA 2V7YA 1BG3A 4H5RA 3ID8A 3QBXA 4EIAA 3CERA 2A5XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OPKA 1NMDA 3QO9A 1IKYA 2UXDK 3L3VA 1SKSA 2ASOA 1MU2A 3CJBA 3MX2A 4KRFA 4DFJA 1RCHA 3AVHA 1F21A 4IOCL 3QERA 4DR1K 4WQ5A 1HNWK 3J7AP 2DFFA 3I0RA 5I3UA 3CC2N 4QS7A 1BA0A 4MFBA 3EY1A 3TANA 3WQUA 1WSHA 1RT5A 1RTHA 3VEYA 3CQYA 2W41A 3LDSA 1HJOA 1L5UA 4J8FA 4LH4A 3CXCM 4GKJK 3NF9A 1BI4B 4HCCA 5JVGL 3VQ7A 1BHLA 3T7ZA 3OYIA 3N4PA 3AVJA 3HPGA 4K8ZA 2F8TA 4G1QA 4LH5A 3IG1A 3O9UA 1WSGA 2ZGYA 1GLLO 1WSFA 4GMJB 1J5EK 2W42A 2VG6A 3OJSA 3GOIA 3H45C 4AM7A 4KV8A 5M1PA 3BP8A 3MXIA 4CGGA 4CEAA 4N76A 4DTPA 1O13A 1DGKN 5DM7L 1Q9XA 3HJFA 4E19A 2NRHA 3V81A 3WNFA 3AARA 4FO0A 1IH7A 3EZ5A 4KAZA 4KHSA 3CCUN 4DV4K 4PWDA 2HBMA 1HR0K 2ZJRL 5AQQA 3MXMA 1O1WA 4R5PA 1SKRA 3U9DA 4HUGA 1S1TA 4DTNA 4DSIA 3O9TA 4OGCA 3L2RA 3ATVA 1CXUA 1BQNA 3MWPA 2FSJA 4IFYA 1DEJA 1ZBLA 1NGJA 2FBXA 3O5BA 2Q0RA 3OYHA 3SAGA 4B1YB 4IXCA 1C0GA 1HKCA 2NRRA 4CHQA 1C0FA 3THXA 3HPHA 4KHQA 4DV7K 1XUPO 4DU3A 1XMQK 3ZT2A 2QWNA 2EX3A 3SUQA 1KQSM 3KKRA 1HNXK 4FCYA 3THXB 4LF5K 3D7EO 1VSLA 5ELZA 3QESA 3SV3A 3CCRN 3A0IX 2QM1A 3QEVA 3NDKA 1NG9A 3DLEA 1BU6O 4CF2A 2XO7A 1DTTA 3ZSVA 5C12A 3RTVA 3TSQA 4QS8A 1VSKA 4JI4K 4B8CA 3JSMA 4H5VA 1RTDA 4L8RB 4DSJA 3SV4A 3VENA 2XY8A 5C42A 4IZ9A 4CIFA 4H0TB 3ZT4A 4IWVA 2E2NA 4E7JA 3SPZA 2O8CA 3THWB 3OHRA 4WQ4A 2I7NA 3G10A 3I55N 3I0SA 3HM9A 2E6MA 4BC2A 5IWAK 2W6LA 5HP1A 4Z4GA 3ZEUA 2ZF5O 5EU7A 3K5OA 5BPMA 2HSTA 1SS6A 4DTXA 2O8CB 2D0BA 1FJGK 3MN7A 3CCSN 4JV5K 5FPMA 5E84A 2PBDA 3HL8A 3R1XA 2A42A 1NK9A 4QAGA 4CK1A 3ZEUB 3KWIA 2HHXA 1VQLN 3VQAA 2VGNA 4WE1A 1TK0A 4B9TA 3RSEA 1HRHA 1GLDG 4PKGA 3TAGA 4Z4HA 3KWGA 1TKXA 3PIOL 4FK4A 1NJIO 3A2FA 2P9KB 5MLCQ 2WFBA 4DWIA 4FJ8A 1VAZA 3NAEA 3ULDA 4DF4A 4UQGA 5KQ8A 3J7ZO 3CFRA 3N4QA 3RR8A 3G0ZA 3SQ1A 1N33K 1ATNA 1WUAA 4YNQA 1NJYA 3MXJA 4O5FA 3OS0A 2FF6A 1JLGA 3NGZA 4DU4A 3RWUA 4NO7A 1WNSA 4CZGA 3K5MA 4PL8A 3UB5A 4YOTA 1EX4A 3K9KA 1Q9YA 1JLEA 5T7BA 1ATSA 1U45A 4DTOA 3AV9A 4FWSA 3K57A 2F9WA 3SBTA 3HOTA 2UYTA 5AZIA 2H3GX 1WSEA 2GX9A 3K9JA 4Q5VA 2F8SA 2O8DA 1LOTB 1N34K 1L3UA 1E3MA 3WXKA 4B3OA 5J2NA 2PY5A 4I6MA 2V7ZA 4DR7K 1VSFA 3O9SA 2G8VA 4BACA 2BDPA 2EHGA 1T7PA 5AQSA 1VQ4N 3O3GA 1U49A 1M1KO 3P38A 2YKMA 5FPDA 5JVHL 2WC9A 1NOZA 4JKFA 4WFBL 1KVAA 2XY5A 2Q1NA 3CJ1A 4W5TA 1J5OA 2FLOA 1RTJA 1VQPN 3CM5A 2NZTA 2HF3A 4Z0UA 1D9DA 3NFAA 5FDLA 5CZ1A 4OO1J 4MDBA 4O55A 4FL9A 2QXLA 1REVA 4O0JA 4DQQA 4BG8A 4RW6A 1YIJN 2BANA 2CGKA 3SQ0A 4CGDA 1Z26A 4ISEA 1VRTA 4CF9A 3LAMA 4OKEA 3C7NA 3HBTA 4BC5A 5BN8A 4K41A 3VA3A 4LFAK 3M1FA 3MCAB 1IKWA 4LD0A 3WNGA 4B08A 4A5AA 4JS5A 3TWHA 3BGRA 4IEEA 1T6DA 5JS2A 2IS3A 3SCXA 4H0PA 4CHNA 5M1QA 3CCMN 5C0YA 3MEGA 3HPOA 2WBNA 3ATUA 3OYKA 2E1ZA 2Y1JA 3CETA 1S3XA 2YCHA 3O3HA 4B3MK 1RDCA 5M1NA 4BRKA 2XY6A 4BQZA 1YTAA 1MDUB 3VEXA 4DF8A 4YOVA 3A5NC 4H0XB 5AQOA 3M3ZA 4B1VA 3LPUA 1NGDA 3CCVN 3SJJA 5BR8K 1P8ZA 3SI6A 5KPRA 1EWQA 3CPWM 1OVYA 3UKUA 4AHUA 2OYQA 3JXUA 2R7YA 1IV0A 1ZXOA 1ZBUA 1HYZA 2GBZA 3TAQA 2PZSA 1WSJA 4YOUA 3AVIA 1TK8A 3OYBA 2FXUA 1MA9B 4CJTA 1Q8IA 4B9NA 3P31A 3RRGA 2QW9A 1JLFA 3AAQA 4CEDA 3BDPA 2OPSA 1TV6A 4GW6A 3K5LA 1NM1A 1IO2A 3ZSQA 3PX4A 4I2QA 4JK7A 4DQ8A 1FK9A 4DV2K 4LY7A 1QVGM 1TAUA 3P5JA 5JLFA 4NLBA 5LMNK 3S41A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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