The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
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sequence length |
116
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structure length |
116
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Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| molecule keywords |
16S rRNA
|
| molecule tags |
Ribosome
|
| total genus |
25
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5IT9 O; 4CVN E; 4JI8 K; 2VQF K; 4DR2 K; 4YY3 K; 1N32 K; 4B3M K; 4DR6 K; 4LFB K; 4DR3 K; 4X66 K; 4KHP K; 5FLX O; 2VQE K; 4K0K K; 2ZM6 K; 3OTO K; 1J5E K; 2UUB K; 4B3S K; 1XMO K; 3J81 O; 4GKK K; 4DUZ K; 1IBL K; 4DUY K; 4GKJ K; 2HHH K; 2UUC K; 4LFA K; 2F4V K; 3J80 O; 4DV6 K; 4LF4 K; 4JI7 K; 4V19 S; 4JI6 K; 1N34 K; 1HNW K; 3T1H K; 2E5L K; 4JI2 K; 1XMQ K; 3JAM O; 4JI4 K; 1HNX K; 2UXC K; 4DV2 K; 4DR7 K; 4AQY K; 5BR8 K; 3T1Y K; 3J7A P; 5AJ3 K; 4B3R K; 4LFC K; 4DV1 K; 4JI5 K; 1I94 K; 4JI1 K; 4YHH K; 1N33 K; 5LL6 Z; 5IWA K; 3J7Y P; 1HNZ K; 4NXN K; 4DV3 K; 4JI3 K; 1HR0 K; 4LF5 K; 4DR1 K; 1XNQ K; 2UXD K; 4DR4 K; 4B3T K; 1IBM K; 4X65 K; 4JV5 K; 2UUA K; 5A2Q O; 4LF9 K; 4DR5 K; 2UXB K; 1IBK K; 4DV5 K; 4DV4 K; 4X64 K; 5LMN K; 4DV7 K; 4JI0 K; 1N36 K; 4NXM K; 5LMU K; 4OX9 K; 1XNR K; 2UU9 K; 4LF6 K; 4CW7 B; 4JYA K; 4LF7 K; 1FJG K; 4DV0 K; 4X62 K; 4LF8 K; #chains in the Genus database with same CATH topology 3QEP A; 4CZG A; 1WB9 A; 4CJV A; 1D9D A; 4FWQ A; 3L8B A; 1JXB A; 1KLN A; 4DR3 K; 4M3W A; 2VWK A; 4KHP K; 3ZT1 A; 1RT1 A; 4CJU A; 1YF5 L; 4FZY A; 4C23 A; 4B9L A; 3MN9 A; 5KRT A; 1B9D A; 3O9U A; 2E20 A; 5HRR A; 4FWP A; 2D0O A; 4JD2 B; 3OYC A; 3L6Q A; 3AAP A; 3ENH A; 4DTJ A; 3IDH A; 1NGD A; 1UAX A; 3P1G A; 3CCE N; 1ZC6 A; 2GV9 A; 2FSK A; 1IG9 A; 4BR0 A; 1J5O A; 3TAM A; 1BHL A; 4CHY A; 1N6Q A; 2G8I A; 3P39 A; 3CJB A; 4FVM A; 3LAM A; 4MO4 A; 2W6L A; 3HK2 A; 1HPZ A; 3SQ0 A; 2YKN A; 1L3T A; 4LY7 A; 4M3R A; 1JLB A; 1VQL N; 3CI5 A; 3O4N A; 3FR0 A; 1X9J A; 4ELU A; 4FW2 A; 2QWP A; 1ATN A; 2GTD A; 2HNZ A; 2H3G X; 4M63 C; 3IMX A; 2O8F B; 4JI5 K; 1VQ9 N; 3RTV A; 1I94 K; 5E41 A; 1KVB A; 5TKY A; 3UKR B; 1GLE G; 3RRG A; 4FZZ A; 3QBW A; 4FSV A; 4JEP A; 2HMI A; 4NCG A; 4LH5 A; 1S72 N; 1WSI A; 1QTM A; 3I55 N; 4B3O A; 4TSX A; 1CZ9 A; 1NK9 A; 1U04 A; 1D9F A; 4BRC A; 3BY5 A; 1ZBI A; 1LOT B; 1MA9 B; 4IFV A; 4H5V A; 1WSJ A; 4W5N A; 5CE3 A; 4BRK A; 3HZ6 A; 1HJR A; 3A5L C; 1N8R O; 1ATR A; 4WFA L; 4WE1 A; 4CGH A; 2IVP A; 4JN4 A; 1IKX A; 4FJH A; 2VG6 A; 4CD3 A; 1C1C A; 4B9N A; 4M42 A; 2AA4 A; 1BUP A; 2V51 B; 4K41 A; 5J2M A; 4KTW A; 4N56 A; 1L3V A; 4FJ5 A; 2XY8 A; 1EWR A; 1NU0 A; 3FZF A; 3LP1 A; 2J4R A; 4LF7 K; 3OYK A; 3VQ6 A; 1W97 L; 3S41 A; 4G1Q A; 5BPL A; 2YHB A; 2A3Z A; 4BR4 A; 2ZD1 A; 4CJL A; 4O44 A; 2P5O A; 2P9U A; 3E9O A; 3MWP A; 1VQ8 N; 4RW7 A; 3TAF A; 3PIP L; 3KLF A; 3A8Y A; 3F2K A; 3MEE A; 2FBY A; 4BRI A; 1Y64 A; 3EKU A; 3PX0 A; 4MLE A; 1QZ5 A; 1YIJ N; 2P9P B; 3VEZ A; 4DUY K; 4E7H A; 3ULD A; 2HF4 A; 1NGH A; 3ID6 A; 1HKB A; 1K6Y A; 3U9D A; 4LSN A; 1OH6 A; 3CMA N; 1YTU A; 4O4G A; 4CJR A; 3LAL A; 3ZSR A; 3J80 O; 3CPW M; 1YHQ N; 1KAX A; 4LF4 K; 1IJJ A; 3U3Y A; 1TKZ A; 2CH6 A; 4H5T A; 3ZT3 A; 3AVL A; 2ZJQ L; 3EZW A; 1BO5 O; 3O3F A; 4NO7 A; 1GLL O; 3D0P A; 4M3Z A; 1HPM A; 2VGN A; 5AJ3 K; 3A5O C; 3G10 A; 4DFP A; 3I8B A; 3L3V A; 3CME N; 3W0L A; 3HRG A; 1J54 A; 2ZGZ A; 4M45 A; 1HKG A; 1E4F T; 5I42 A; 4HVJ A; 2HND A; 4BE2 A; 1S1W A; 2RE2 A; 1NKB A; 2Q97 A; 1RBR A; 1WSH A; 4DFJ A; 4KAZ A; 1XNQ K; 4H0X B; 4CK2 A; 5JLF A; 4CHP A; 3ULE B; 4GVM A; 3VA0 A; 3EZ5 A; 1QZ6 A; 4FLT A; 4M7Y A; 4FPB A; 5JLH A; 2E1Y A; 2QXF A; 3CIP A; 4BR9 A; 3LZI A; 1QVG M; 3CC4 N; 2QI2 A; 1S9E A; 5J2Q A; 4GV3 A; 3QML A; 5AQQ A; 3V9X A; 3P38 A; 4H5N A; 3DOL A; 4BR2 A; 4CW7 B; 3CQ8 A; 4F8R A; 2KFZ A; 4CGD A; 3HSC A; 1ASW A; 3OYG A; 1YXQ A; 3F5T A; 2AP1 A; 3HPH A; 1X3M A; 1NGB A; 4YOW A; 3VQ7 A; 2KLA A; 4YY3 K; 4DR6 K; 5FRO A; 1WLJ A; 3AV9 A; 1S1U A; 2WON A; 4FWN A; 3QNO A; 1J5E K; 1GLJ O; 3SK3 A; 4CF8 A; 3D2F B; 3UE5 A; 4BG8 A; 4GKJ K; 3KLE A; 3NGY A; 1C1B A; 2FLO A; 3KTQ A; 2LSN A; 3FLC O; 4B1X B; 3NH0 A; 2D0A A; 4KKO A; 4DV6 K; 3RRH A; 1KLM A; 4NLC A; 3NHG A; 1HNW K; 3T1H K; 3D7E O; 3ZSW A; 3ZX2 A; 4K25 A; 1NK5 A; 1S1T A; 4DU3 A; 1T05 A; 3MDQ A; 4QOZ B; 2HHQ A; 1BG3 A; 3WQT A; 1QHA A; 1CXQ A; 4FVU A; 4CEA A; 3V9U A; 1ZBL A; 5AQS A; 5GAH P; 3VEN A; 3I56 N; 1K8K B; 2IS3 A; 1T8E A; 3D45 A; 1RDD A; 2OAN A; 3VF6 A; 1ZXO A; 4BAC A; 2OPP A; 4YNQ A; 3HOT A; 3AVF A; 3TTD A; 5AZJ B; 2YHX A; 3MED A; 1GLF O; 5BRE A; 3HM9 A; 4EP5 A; 5GAE P; 3AVG A; 4KHY A; 1TKT A; 3MWT A; 3TSU A; 4EIA A; 2ZJP L; 4DG1 A; 1BCM A; 3K58 A; 3PUF A; 4IG0 A; 4CZM A; 2QM1 A; 1W2B M; 3ZSQ A; 5C2F A; 1A5V A; 2HW3 A; 3SYZ A; 2I7N A; 2GX9 A; 3DAW A; 1BIZ A; 4GVE A; 4DQI A; 4LF9 K; 2RKI A; 3CFR A; 4MO5 A; 4PY5 A; 4FJN A; 3HPG A; 1R59 O; 3ATV A; 4JKD A; 4JK8 A; 4CK1 A; 3G71 N; 3B6P A; 2W42 A; 5CZ1 A; 1MWM A; 4J2D A; 4CJQ A; 4IG3 A; 4G9Z A; 1FJG K; 1VSM A; 3GL1 A; 4WF9 L; 3C7N A; 4MFB A; 1QQN A; 3SMP A; 4O5F A; 3ZSY A; 1VRU A; 2F9W A; 4XEI A; 4BRD A; 4DR2 K; 4KHW A; 2BH1 A; 3THY A; 4Q0B A; 4A59 A; 3BF1 A; 3ZEU B; 3TAP A; 4J2E A; 3BGR A; 3A5N C; 5BN9 A; 4DLE A; 1KVA A; 2ETJ A; 2YNI A; 4C8N A; 3VES A; 3DLR A; 3AVK A; 4H0V B; 3J81 O; 3VGM A; 3VQD A; 3V81 A; 2NZT A; 4CER A; 3OVN A; 4O0J A; 3SLC A; 1DT9 A; 1SKS A; 3VQC A; 3U4L A; 1IG8 A; 4CEO A; 3CPE A; 4H03 B; 3OYM A; 4IJN A; 3MK6 A; 3TWH A; 3KD5 E; 3OBY A; 4DTM A; 4RCH A; 4OVL A; 3CM5 A; 4DCH A; 2ZQB A; 2X78 A; 3QO9 A; 3DRR A; 4IOA L; 2IVO A; 3PLA A; 4AM6 A; 1SKR A; 1NGI A; 3KJV A; 3RMA A; 1WNS A; 2Z1J A; 4HWI A; 3MXI A; 4E1M A; 5FPD A; 1FKP A; 5AZI A; 2O8B A; 3V9W A; 4BQZ A; 3OYI A; 4F3O A; 3A2F A; 4HTU A; 1Z26 A; 3LM2 A; 3VEV A; 5AQK A; 3AVJ A; 3K57 A; 4FO0 A; 4RG8 A; 3EE8 A; 3TI0 A; 1KFS A; 1W0H A; 3O1W A; 1NWK A; 4FWM A; 2HF3 A; 3BZK A; 5JMV A; 2E2Q A; 4MDB A; 3M6G A; 3AA2 A; 1RNH A; 4X65 K; 3L3U A; 4PWD A; 4WFB L; 2P51 A; 1JL1 A; 4JKA A; 4JHD B; 3H6E A; 2A42 A; 2HVH A; 3QEW A; 4R79 A; 1GOB A; 2OZS A; 3NFA A; 1VAZ A; 1NK0 A; 1O1W A; 3NF7 A; 3DLE A; 4L3Q A; 1WAJ A; 3QIO A; 4AHC A; 3TAG A; 3M1F A; 1JXE A; 3HI0 A; 5HP1 A; 5GAG P; 3SUO A; 3THW A; 1BU6 O; 4YDU C; 2E2N A; 4JI8 K; 3O80 A; 1VQO N; 3CJ9 A; 3SQ2 A; 5H1S Q; 4CJE A; 3V4I A; 4H4M A; 2IOC A; 2F8T A; 4GV9 A; 3QEI A; 3L2U A; 3AA5 X; 1TK8 A; 1VSL A; 3CCL N; 1IO2 A; 4CE9 A; 3RR7 A; 2P9K B; 4B9M A; 4IO8 A; 3FZL A; 1I39 A; 2F9T A; 4Z4I A; 4DUZ K; 1E4G T; 3WNF A; 4FLV A; 4UY8 O; 4C8M A; 2GUP A; 4B08 A; 3B6O A; 4YOT A; 2HHH K; 1YJW N; 3HP6 A; 3K5M A; 1HLU A; 3D6R A; 4ILJ A; 1NJI O; 1L3S A; 3PX6 A; 5E26 A; 2IC3 A; 3C6H A; 2YCH A; 4GW6 A; 3RSE B; 3WT0 A; 4ISG A; 2BE2 A; 1BGX T; 4ELV A; 3QIC A; 3GBT A; 4JKH A; 4DKW A; 1HJO A; 2D0P A; 4KHQ A; 2NNW A; 5B8H A; 3ZET B; 3ZT0 A; 5DK5 A; 3E9L A; 3OS1 A; 4DR7 K; 1T7P A; 5BR8 K; 5AQR A; 3O9S A; 3S3O A; 1JLF A; 1P8Z A; 1QQO A; 2KHO A; 2CGK A; 3CET A; 3VQ5 A; 2DPN A; 2P9I A; 1KAZ A; 3DJC A; 5M1O A; 4CJ3 A; 4JS4 A; 1EX4 A; 1C0U A; 4CIF A; 3OYL A; 1EXQ A; 4EHU A; 1RT3 A; 4CFA A; 4FM0 A; 3O1B A; 4DWI A; 2WFB A; 1T44 A; 3AAR A; 1UA0 A; 1EWQ A; 5KRS A; 3WEE A; 2RHK A; 1LAW A; 2KZZ A; 3WNE A; 4JKF A; 5KQD A; 2NRZ A; 4B8A B; 3HJF A; 4CJ5 A; 4DTN A; 1QSS A; 1NJW A; 2Z1I A; 2P9S A; 3ISN C; 2FBV A; 5I9E B; 1JCG A; 4YFU A; 5LY3 A; 1NGC A; 5BR9 A; 4C8O A; 3HO1 A; 4IWV A; 3LDQ A; 1DKG D; 4OGC A; 1ILY A; 1Z05 A; 1NMN A; 4CHO A; 3OYE A; 4M3U A; 3M8Q A; 2OPQ A; 4DV0 K; 1S22 A; 4BY9 C; 1WAF A; 3U8X A; 4GNI A; 1X9S A; 2VQF K; 2Q31 A; 4KI4 A; 1JLQ A; 3QET A; 1ZBF A; 3VQP A; 3VOV A; 1OVY A; 4IFE A; 4H5R A; 2O8E A; 3J7Z O; 1Q7Y O; 2HST A; 3OTO K; 4FWR A; 4A62 A; 2G8F A; 2UUB K; 4PKI A; 2V52 B; 1XMO K; 2BGG A; 4FZX C; 4FCY A; 3VA3 A; 1EQY A; 4GKK K; 4DSL A; 4YOR A; 3AA3 A; 1VQ5 N; 2D1K A; 1K73 O; 1SL2 A; 5HL7 L; 2HHS A; 2E1Z A; 3K59 A; 1NJZ A; 4DF8 A; 3CQX A; 3LAK A; 5AQZ A; 3VQ4 A; 4E19 A; 5JVG L; 4IDH A; 3AVM A; 1TK5 A; 3DMJ A; 1Y97 A; 3KK3 A; 2I5J A; 4U67 L; 3DXK B; 2E5L K; 2QWN A; 4AIL C; 5BPN A; 1N5Y A; 3AY9 A; 4YOY A; 1NK6 A; 1WUA A; 1RT2 A; 1DLO A; 5GIP A; 3DXM A; 5JVH L; 2CGL A; 2FF3 B; 1JLA A; 1Z25 A; 4CHQ A; 3THX B; 1CXU A; 4Z4E A; 5EVZ A; 2G8W A; 4JKC A; 2IVN A; 4FL9 A; 5C42 A; 5EXW A; 4FM1 A; 3BUZ B; 3ASM A; 4FJI A; 5KPZ A; 3FZK A; 4F4K A; 4FLW A; 2GBZ A; 5FDL A; 4E7K A; 3G4S N; 3OYN A; 1QHT A; 2VWJ A; 4HCC A; 5BRH A; 3AVH A; 1RCH A; 2UUA K; 2AJQ A; 1VSH A; 4BC5 A; 1NKC A; 3FFI A; 5A2Q O; 4F9O A; 1DGK N; 1VHX A; 3EEQ A; 3DLH A; 3QB0 A; 4N47 A; 5AQH A; 5LMN K; 2OA8 A; 1BWF O; 3B8A X; 1WSG A; 3LPU A; 4IBN A; 5ADX H; 2Y1J A; 4JYA K; 4PL7 A; 2FSJ A; 4E7L A; 2ZWH A; 2P9L B; 2WTU A; 1NGE A; 2O4I A; 4J2B A; 3AVA A; 3HOS A; 1RTD A; 1QVF M; 3H1V X; 3O6W A; 3L4Q A; 3THV A; 1BCO A; 4C8K A; 2P5G A; 1N32 K; 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1V4T A; 4KRE A; 2VQE K; 4Y0W A; 2ZM6 K; 5JIC A; 2G8U A; 4PHT X; 3EL2 A; 4PQU A; 2PYL A; 1H1V A; 2XHB A; 1NGJ A; 1RTJ A; 3CCV N; 2ASO A; 3EYZ A; 3VQ8 A; 4Z4F A; 2Q36 A; 4FJG A; 4WQ4 A; 1TYQ A; 5BN8 A; 3NVM A; 3IRX A; 4EZ9 A; 1KTQ A; 5AFU H; 3IKM A; 3JYT A; 5FPE A; 1J53 A; 2KW4 A; 4IOX A; 4V19 S; 3ZX0 A; 3O9R A; 3LZJ A; 1WSE A; 2PAV A; 1VSI A; 4DSK A; 5AQO A; 4BDP A; 1VQK N; 3UIQ A; 4LD0 A; 3J7A P; 1C0T A; 4IZ9 A; 2YJE A; 4CF9 A; 5HBM A; 4BG9 A; 2OZM A; 5C24 A; 5HRP A; 2KTQ A; 2IDO A; 4AHV A; 3E66 A; 2WC9 A; 1ZBU A; 1LW2 A; 4DQ8 A; 4CED A; 3AGR A; 3ALY A; 3DM2 A; 3J7Y P; 3EKS A; 1XWL A; 3PIO L; 3VGK A; 4NXN K; 2RPI A; 4FK0 A; 1JKH A; 3I33 A; 4DS4 A; 3L0Q A; 4DR4 K; 4N5S A; 5C25 A; 2VG5 A; 4YOU A; 1GLD G; 1SQK A; 5J2N A; 1T6D A; 3QNN A; 1QQM A; 1U2V A; 4W5Q A; 3VMF B; 5C10 A; 4W5O A; 2HHT A; 3CCM N; 4DV5 K; 3KLH A; 5T7B A; 2HHV A; 1RT4 A; 4BRN A; 2D0C A; 3ENO A; 2XY7 A; 3KLI A; 4NLB A; 3K5N A; 5LMU K; 2P9U B; 2IAJ A; 3SV4 A; 3CFO A; 4BRF A; 3LAN A; 4CFC A; 3I0R A; 2R7Y A; 2OTL N; 4CI6 A; 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