4EHTA

Activator of the 2-hydroxyisocaproyl-coa dehydratase from clostridium difficile with bound adp
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MYTMGLDIGSTASKGVILKNGEDIVASETISSGTGTTGPSRVLEKLYGKTGLAREDIKKVVVTGYGRMNYSDADKQISELSCHARGVNFIIPETRTIIDIGGQDAKVLKLDNNGRLLNFLMNDKCAAGTGRFLDVMAKIIEVDVSELGSISMNSQNEVSISSTCTVFAESEVISHLSENAKIEDIVAGIHTSVAKRVSSLVKRIGVQRNVVMVGGVARNSGIVRAMAREINTEIIVPDIPQLTGALGAALYAFDEAKESQKEVKNISA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title On the ATP-Dependent Activation of the Radical Enzyme (R)-2-Hydroxyisocaproyl-CoA Dehydratase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Clostridium difficile
molecule keywords Activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase
total genus 83
structure length 268
sequence length 268
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehtA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehtA01
3W0LA 4RWTA 3H1VX 4RCHA 4ISGA 4WQ4C 4EFHA 2E88A 2CGLA 1NGCA 3C0BA 5AQLA 5FPNA 4K41A 4BR7A 4BVOA 1BG3A 4EHUA 2QWQA 3FE1A 3M1FA 2Q36A 3GDQA 5AQVA 3EN9A 5AZIA 5JLHA 3BEXA 1Z05A 4CZFA 5TKYA 2ZF5O 4JD2A 4BC3A 2FF3B 2BTFA 2W41A 3G25A 1NGDA 1K8KB 2IIRA 3B8AX 1ZC6A 4CZEA 4F9OA 5JLFA 2IVOA 4EIAA 3LDNA 5AZIB 2OANA 4CD1A 4JN4A 2VCPA 4FWOA 3S41A 1OKJA 2V7ZA 3HTVA 2V51B 4FWQA 4RTFD 2A41A 3R6MA 3QICA 2P9IA 4QS7A 3CQXA 4CZLA 4Y0WA 4BRKA 3LDPA 3UKRB 3VGMA 3SMSA 5AZJB 4B1XB 5EY4A 4CJ7A 3SLCA 1CZAN 3IMXA 3MN5A 3U4LA 4BRNA 2FSKA 1KAXA 5BPMA 3VGLA 3MCPA 1BWFO 3DXKB 1RFQA 1S3XA 1YAGA 2ASMA 4NO7A 5AQPA 1X9JA 1EQYA 1HLUA 4BREA 1IJJA 2EWSA 3MN7A 2CH6A 1LCUA 4FPAA 5EVZA 3F9MA 2E1ZA 4CD3A 1X3NA 1HKBA 4JNEA 1DGKN 3L4IA 2QWOA 4PL8A 4CBXA 3EKUA 2P9KB 5B8HA 4MLHA 5BRDA 4WQ5A 5AQKA 2FF6A 1C0FA 3W3DA 1T6CA 2ASPA 3BP8A 1MA9B 3WXKA 1ESVA 3VESA 3ZX2A 3FZMA 2P9UB 4H0VB 3ATUA 3DAWA 3O4WA 1TYQA 4FSVA 3H3NO 2A6AA 4H5WA 3A0IX 3QB0A 3VF4A 2I7PA 4GNIA 1GLDG 3CJ1A 1KAYA 2QWMA 3LL3A 1E4FT 5ADXH 5FPMA 2V7YA 3IUCA 3L0QA 2QWPA 4MO4A 3WT0A 2D0PA 2W40A 1ZBSA 4WQ5C 4LC9B 4A2BA 1HKCA 4FPBA 1U6ZA 4BR2A 4A2AA 1D4XA 3EKSA 1Q18A 4L3QA 4M7YA 1WOQA 5BPNA 2FXUA 2VYPA 3C7NB 4BQZA 1GLLO 1NGBA 3WUHA 4B1ZA 2P9LA 1BDGA 5F2RA 1BA0A 3QBWA 4B9QA 3KZBA 4FWKA 1NGHA 1ATNA 3O1WA 5AR0A 3FZHA 4WYBA 1QZ6A 4FWLA 4CBWA 4CZHA 3WXIA 3O1BA 1QQNA 2QWLA 4BRHA 1WUAA 3DXMA 3WEEA 3CETA 4Z94A 4BRCA 4BC2A 3QBXA 3WQUA 5KPTA 5EXWA 2P9PA 3FFKB 4IJAA 2QWNA 3VEOA 2P9NA 3ID8A 4C23A 2ZGZA 2YHXA 2PBDA 1P8ZA 2H3GX 1ATRA 2VWBA 3KHYA 1V4TA 5AQQA 3M3ZA 1J6ZA 3GBTA 4H03B 3D7EO 3U8XA 1KXPA 3DXMB 3FLCO 3WEEB 3VOVA 4M7XA 5KPZA 4BROA 1YXQA 3CJBA 4PKIA 5AQYA 3ZETA 3J8AA 5AFUA 3ZX3A 4BRLA 2AP1A 1MDUB 3ENHA 3U9DA 3CJAA 3A5OC 4H0XB 2QXLA 2ZGYA 1NLVA 4XEIA 3AAQA 5F1XA 5F0XA 3HBTA 4FWMA 5FPEA 1GLCG 3ZEUA 3DJCA 3A8YA 4H5NA 2YHWA 3FZFA 5BRHA 3VPZA 4DQ8A 2ITMA 2YJEA 2Q1NA 4JD2B 5AQFA 1NGJA 2GEMA 1G99A 5LY3A 2D4WA 4GY2B 3H3OB 4BRMA 4BR4A 3U9ZA 4H0PA 4J8FA 3FZKA 4IZ9A 5EOYA 3ZEUB 3DWLA 3JS6A 1NGFA 4BRGA 4AM6A 3O6WA 2V52B 4B1WB 2P9IB 4HTLA 4XH5A 5AQWA 2YI1A 2GTDA 1T6DA 4FL9A 3MDQA 2AA4A 3VERA 4ISFA 3TU5A 1YUWA 3IFRA 4FWNA 4CZKA 3MN6A 5E84A 4O5FA 3VETA 3OHRA 3P4IA 5E26A 3D2EA 4M63C 4AM7A 2F9WA 4FWRA 3LM9A 1HX1A 4FWPA 5BRFA 5ELZA 2CH5A 2IVPA 2WUSA 4PKGA 4QS8A 3GL1A 5BN8A 3H46O 3WXLA 3O80A 1NM1A 3SMPA 5BR9A 3I33A 2ZWHA 3QFUA 4BC5A 1NWKA 2P9SA 3I8BA 3H1QA 1T44A 4BR0A 1JCFA 4MO5A 3WQTA 3A5NC 3CJCA 1S22A 2ASOA 5AQGA 4CBUA 3QMLA 5AQUA 4QS9A 1LOTB 3VEYA 4BC4A 5BPLA 5BN9A 2GWJA 1TYQB 5AQMA 1MWKA 1BA1A 1R59O 1DKGD 4CI6A 2YJFA 3CJ7A 1Z6RA 3UB5A 2CGKA 3CHWA 1QQMA 5AQOA 2E2PA 1NGEA 2I7NA 2UYTA 3ULEA 2QW9A 5AQIA 4H0OA 1NBWA 3A5MC 3D2FA 2BUPA 4BR5A 5BREA 2Q0UA 3EL2A 3LDOA 4BVPA 1GLAG 4B1UB 3VEVA 3ZX0A 4EAHD 4EHTA 2E2OA 1HPMA 4HWIA 4WQ4A 5AQZA 1BUPA 2IVNA 2P9LB 3VGKA 5JMVA 2NRHA 1YVNA 3FR0A 3CJ9A 3ENOA 2E2NA 3GG4A 3QDKA 1JCGA 3GOIA 1E4GT 1ZXOA 2GWKA 2Q31A 3QFPA 4CZIA 1BU6O 2A40A 2D0OA 5AQSA 2NZTA 4XH4A 5AQNA 3BUZB 4H0YB 5KQ8A 2P9PB 1QQOA 2HF3A 2P9NB 1NMDA 4ISEA 3VEXA 3LM2A 2A42A 2J4RA 3AARA 3VEWA 1SZ2A 3AY9A 5AQXA 4IJNA 1SAZA 3R8EA 5ADXA 4IO8A 5LJVA 1QZ5A 4FOEA 3FZLA 4BGBA 4MLEA 3ZETB 1NGGA 2E1YA 1K8KA 1DEJA 5CE3A 5FPDA 2A5XA 1C0GA 1TUYA 3MMVA 5AQJA 5AQRA 3VF2A 5KPRA 1SQKA 3O5BA 4H5TA 1NGAA 2Q0RA 4BRPA 4K42A 2F9TA 3LDLA 1GLFO 4BGAA 3H6EA 5I9EB 3UKRA 4B1VA 4H0TB 5AZJA 4H5RA 3BF3A 4IWVA 1XQSC 1RGIA 4I6MA 3UE5A 2HMPA 2NLXA 3RSEA 3HI0A 4JAXA 2Q2RA 2QM1A 1QHAA 3UKUA 4DCHA 1ATSA 4PL7A 4BG9A 3DXKA 1XC3A 1XUPO 3O08A 4BRAA 3HZ6A 2QWRA 4YDUA 4H5VA 3WXJA 3ATVA 1GLJO 4I6MB 1V4SA 3RSEB 4BR9A 1BOTO 1HJOA 4BRFA 2HOEA 3VEZA 2E2QA 3UKUB 3KVGA 1HKGA 3H45C 3CI5A 3D2EB 5EX5A 3CERA 4FOIA 1JCEA 2P9KA 4FO0A 1X3MA 1RDWX 2GUPA 2FSNA 2YCHA 4BRIA 2HF4A 5KQDA 1KAZA 4PKHA 1TUUA 4E1JA 2P9UA 3BF1A 4CZGA 2GELA 4YDUC 2FLOA 4K25A 2P9SB 4IXCA 2CGJA 4K43A 5JICA 5LJWA 4BG8A 1U2VA 3VF6A 1Y64A 4KBOA 2Q97A 3EZWA 5AFUH 3MK6A 3EO3A 4DB3A 3TPQA 1IG8A 2DPNA 4JHDA 4NB4A 4BRQA 1U2VB 3VENA 5AQTA 4B1YB 1HUXA 3GE1A 4XH1A 4BRDA 4BQLA 2E8AA 5AQHA 3JXUA 2FSJA 4DHYA 3C7NA 4A62A 1MWMA 3FGUA 3CQYA 4FWSA 4JHDB 3SJHA 1GLBG 3SK3A 1GLEG 3HSCA 3ULEB 1H1VA 4A61A 3AAPA 3CIPA 3O8MA 2YHYA 3A5LC 3MN9A 3D2FB 3M6GA 3L6QA 3R9PA 4CZMA 2PAVA 1NGIA 2A3ZA 2E20A 1BO5O 4CZJA 3IDHA 3LDQA 4O8KA 3HM8A 2D1KA 2KHOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QS4A 4KHYA 2X6SA 4CEOA 1WNSA 3V1OA 2E88A 3AVCA 4BR7A 4E19A 1VQKN 4BVOA 1BG3A 2QEXN 2HSTA 4IKFA 4RW9A 1ITGA 1B92A 3DM2A 4WFNL 3GDQA 4W5QA 4LF7K 5AQVA 5CYQA 5AZIA 4CF2A 2ZF5O 2OZMA 2G8WA 2D0CA 1NGDA 2IIRA 3B8AX 2I5JA 5C12A 5M1NA 3LDNA 1QQCA 3IRXA 4FWOA 1QHTA 3AVHA 3S41A 2G8HA 3OYGA 4B3RK 2XY6A 3HT3A 1TAUA 4CIFA 4Y0WA 3LDPA 4OKKA 3T19A 4JYAK 3UKRB 1IBKK 1F21A 1SV5A 4B1XB 4KV8A 1VQNN 1T05A 2Z1JA 2GBZA 1Q9YA 3HO1A 2FSKA 4EZ6A 1BWFO 1I39A 4H8KA 4N47A 4B9UA 4RW8A 2ZE2A 4CF1A 1B9DA 4NO7A 4C8LA 4FPAA 1RNHA 3VQ6A 1LAVA 3F9MA 2E1ZA 4JNEA 3O9TA 3TWHA 4B3MK 4GW6A 3CMEN 4FJ9A 1IKYA 1IKWA 3VQ5A 4I2PA 2FF6A 3W3DA 5DM7L 1T6CA 4UY8O 3WXKA 1ESVA 3CPEA 3KD5E 2G8FA 2P9UB 1VRUA 4H5WA 3QO9A 2UUCK 3A0IX 4FVUA 3QB0A 3T1HK 2WFBA 4DTRA 2QWMA 4E7KA 4Y1DA 4JKFA 3ID6A 3TARA 3V9SA 1RT5A 2QWPA 3MEEA 2W40A 3O9SA 4DU4A 3N4PA 4IOXA 4FW2A 2UXBK 1S6QA 4CEZA 3EKSA 5EU7A 1LW2A 1W7AA 4FM2A 1KVBA 4IEEA 4CGHA 1NNEA 4B9TA 4X65K 3TAPA 2PY5A 4IFYA 2HBMA 2YNHA 3O4NA 2FXUA 2VYPA 1JLAA 5BPNA 1VQ7N 1YF5L 2P9LA 4IDHA 2Y1JA 1L5UA 2O8BA 3M5RA 4BE1A 3O1WA 3HVTA 2G8UA 4FYDA 1A5XA 3ZLJA 3O1BA 1QQNA 2QWLA 3PIPL 1WUAA 4BRCA 3L2QA 3QBXA 5KPTA 4PQUA 1TL1A 2P9NA 2ZGZA 1VK0A 1P8ZA 1V4TA 5AQQA 3GBTA 4H03B 2O8EA 3VQPA 3WEEB 1KLMA 2EX3A 4OGEA 2XRIA 3QERA 1YJNN 1YJWN 1NJYA 5AFUA 5KTQA 1RT1A 1XI1A 1JLBA 2ZQBA 3VQAA 4CE9A 3L2RA 1DLOA 4KI4A 1NLVA 3OY9A 5F1XA 5HL7L 4KPYA 1GLCG 3ZEUA 1SL2A 4FJHA 4ELTA 3VQ7A 4B9LA 4I2QA 5LY3A 2YKMA 2D4WA 4GY2B 4JI3K 4BR4A 3NVKA 3R3LA 3DLLL 2F96A 1FJGK 3HVRA 2YNGA 1SKSA 1T3VA 3NE6A 3CCUN 3TANA 3S3MA 4AM6A 4M45A 2P9IB 4LF5K 3OYKA 2RKIA 1QVFM 2YI1A 3OYBA 2A1RA 1A5WA 4QAGA 2YV0X 1CZ9A 1TL3A 4B08A 4FWNA 1QSYA 3OHRA 3J81O 2F8SA 4JS4A 5E26A 4M63C 4H4MA 3EE8A 3LM9A 2NRXA 1VHXA 4LY7A 5BRFA 2CH5A 1BI4B 2IVPA 4PKGA 3OW2M 3GL1A 1HRHA 1KFSA 3WXLA 1KSPA 3I33A 3WNFA 3PSIA 3AVAA 3RMBA 3EEQA 1BIZA 3H1QA 3SUQA 1JKHA 1HYVA 1NU0A 1EX4A 4LD0A 4MO5A 3SQ1A 1JLCA 4FLXA 3OYAA 4DS4A 1NK9A 3RMCA 5AQGA 1RTHA 5AQUA 4ELVA 4M3YA 4FW1A 1EETA 5BPLA 1RTIA 3C65A 3QNOA 4J2BA 1MWKA 1BA1A 1R59O 2KKZA 1Q7YO 4DV0K 3ISNC 3LPUA 4DFKA 2YJFA 3CJ7A 4KH6A 4CFBA 1S9EA 5JVGL 4DUYK 4A59A 1YTUA 1SKWA 4DFPA 4Q0BA 4CF8A 2E5LK 1QQMA 1HNWK 5AQOA 2E2PA 3J80O 4K8ZA 1S6PA 2BUPA 3LP2A 5BREA 3LDOA 1RBUA 2AJQA 2OTJN 4B1UB 4CCHA 3ZX0A 4FJKA 4CF0A 2VQEK 4HWIA 2NRHA 3AVMA 3CJ9A 2WTUA 1RILA 3GG4A 1M90O 3KLGA 4JKBA 4CJTA 4IFVA 2A40A 4NCGA 5KQ8A 2P9PB 4BE0A 4ISEA 1NMDA 3LM2A 4JI6K 1VSLA 3AARA 3VEWA 3CC7N 4FM0A 2IAJA 3HL8A 1UOCA 3FZLA 3VQ9A 2E1YA 4C8KA 5CE3A 2R7YA 2A5XA 2ZJQL 3CCMN 3J7ZO 1TUYA 3MMVA 1QSLA 5GIOA 3EE9A 3RTVA 5AJ3K 1NMNA 4E7JA 1N33K 3H6EA 1ASUA 5I9EB 1BQMA 3UKRA 4B1VA 3SBTA 4H0TB 3AVLA 3NVMA 2WONA 2HMPA 1UA1A 1U04A 1QHAA 3UKUA 3ZSOA 4KRFA 3OYEA 1BCMA 3LWLA 4CIGA 2QA4N 4DV7K 1RBVA 5GAGP 4H5VA 4LSNA 1GLJO 4I6MB 3CC4N 1YT3A 2HOEA 1ASVA 1VSHA 1S5JA 2NRWA 3D2EB 3CERA 2O4GA 1VQ9N 1KD1O 1IKVA 1JCEA 1W9HA 4FO0A 1X3MA 3L2WA 2FSNA 4BRIA 2ZM6K 2W6LA 5KQDA 3V9WA 1KAZA 1WAFA 4DMNA 2UU9K 1TUUA 4E1JA 4NCBA 2P9UA 4CZGA 2GELA 1U48A 1IBLK 2FLOA 4K25A 5IT9O 1KCFA 2IS3A 2P9SB 2FBVA 3P38A 5JICA 5LJWA 4N5SA 4BG8A 4M3WA 4OKJA 3B6OA 4AHTA 3VF6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5JMV A;  4IG3 A;  3OYL A;  4JI0 K;  3FR0 A;  3TSP A;  3MX2 A;  3ENO A;  2OTL N;  3KKR A;  3SPZ A;  3QDK A;  1JCG A;  4IO9 L;  4FZX C;  3GOI A;  5KGX A;  1GOA A;  1LWF A;  2F8T A;  2D0O A;  1WSG A;  2NZT A;  2HVI A;  3BUZ B;  4H0Y B;  4DU3 A;  2KTQ A;  1QQO A;  4NLB A;  2HF3 A;  2P9N B;  4RW6 A;  4HUG A;  2OCE A;  1WSF A;  3BDP A;  1SZ2 A;  2G8K A;  4CVN E;  3AY9 A;  2DFH A;  4J2A A;  3HJF A;  3CCE N;  4IJN A;  1VSI A;  1WN7 A;  3TAE A;  4FOE A;  2VG7 A;  1JXE A;  3ENB A;  3HPG A;  1DEJ A;  3QEV A;  1YVU A;  3ZSW A;  2UUA K;  3K9K A;  3LP0 A;  1C0G A;  3NF6 A;  4OLA A;  4DTS A;  1K6Y A;  1SQK A;  3V9X A;  5J2M A;  1RTD A;  1NGA A;  3LP3 A;  4FJ5 A;  1XMO K;  5LMU K;  3ZSY A;  4B8A B;  2F9T A;  3THX A;  2F4V K;  5GIP A;  3S9H A;  2G8V A;  4MDA A;  4JI2 K;  3NF7 A;  3JSM A;  2QTD A;  5AZJ A;  5J2P A;  3HXM A;  1XQS C;  1X9W A;  2NLX A;  3RSE A;  4OVL A;  3HI0 A;  2HHT A;  2Q2R A;  2QM1 A;  4E3S A;  3AGK A;  5C2D A;  4LF6 K;  1ATS A;  4BG9 A;  3DXK A;  3ZSR A;  3RMA A;  1XUP O;  1W0H A;  4CFA A;  4FJM A;  3ATV A;  5K14 A;  4BR9 A;  4FLW A;  5IWA K;  1NOZ A;  3MXM A;  4ELU A;  5HRS A;  1WAJ A;  1C1A A;  5BR8 K;  4DSF A;  5I42 A;  3H45 C;  3F73 A;  3CI5 A;  5EX5 A;  4FOI A;  2RPI A;  4E1N A;  1L3U A;  1RDW X;  2GUP A;  2YCH A;  1CLQ A;  4PKH A;  4A57 A;  4UQG A;  2Q3S A;  4B9M A;  4YDU C;  3LPT A;  3NGZ A;  2OA8 A;  4K43 A;  3TTD A;  4DTJ A;  4FJI A;  1U2V A;  3KK7 A;  4FLV A;  3T69 A;  4CJR A;  4DTN A;  4CEF A;  3I0R A;  1SL1 A;  4CEA A;  3BGR A;  2Q97 A;  5GAD P;  3VQE A;  4DB3 A;  4JHD A;  3DLH A;  5M1O A;  4B1Y B;  1XHX A;  4KI6 A;  3V1Q A;  4GKK K;  1WSI A;  5SZT A;  5C25 A;  3FGU A;  1JJ2 M;  1IKX A;  1VQM N;  3K9J A;  3IG1 A;  4MQ3 A;  3F2K A;  4JV5 K;  2YHY A;  3MN9 A;  3P83 D;  3AA2 A;  3M6G A;  2W6K A;  4CZM A;  3R9P A;  3K57 A;  3AO5 A;  1D9D A;  3KK2 A;  3MXJ A;  3L3U A;  3IDH A;  3KLH A;  3LDQ A;  4GVM A;  3HM8 A;  5AQR A;  4YOX A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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