4EHTA

Activator of the 2-hydroxyisocaproyl-coa dehydratase from clostridium difficile with bound adp
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MYTMGLDIGSTASKGVILKNGEDIVASETISSGTGTTGPSRVLEKLYGKTGLAREDIKKVVVTGYGRMNYSDADKQISELSCHARGVNFIIPETRTIIDIGGQDAKVLKLDNNGRLLNFLMNDKCAAGTGRFLDVMAKIIEVDVSELGSISMNSQNEVSISSTCTVFAESEVISHLSENAKIEDIVAGIHTSVAKRVSSLVKRIGVQRNVVMVGGVARNSGIVRAMAREINTEIIVPDIPQLTGALGAALYAFDEAKESQKEVKNISA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title On the ATP-Dependent Activation of the Radical Enzyme (R)-2-Hydroxyisocaproyl-CoA Dehydratase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase
molecule tags Electron transport
source organism Clostridium difficile
total genus 83
structure length 268
sequence length 268
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehtA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehtA01
3TPQA 3DXMB 1NGDA 2YHXA 3EKUA 5ADXA 3CJ7A 3VGKA 4XH1A 3MN7A 1QHAA 5LY3A 1QQOA 3KZBA 3EL2A 2BUPA 2CGLA 2CH6A 3A0IX 1NGFA 1IG8A 4QS8A 4K25A 4WQ5A 3LDQA 4FWPA 3M1FA 3SMSA 3GOIA 3R8EA 4JNEA 3UKRB 2AP1A 4NO7A 5AQQA 4BRHA 2FF3B 3IDHA 4JAXA 4B1VA 3ULEA 1K8KB 3AARA 2Q1NA 2ZGZA 4FWSA 2IVOA 2J4RA 4FWKA 4JN4A 2UYTA 5EY4A 1U2VA 3VEZA 3A5LC 4ISFA 3CQXA 4BC5A 3FGUA 3R6MA 5AQUA 3VGLA 2ZF5O 3O1BA 4BGAA 5FPDA 1C0FA 3GL1A 1GLCG 3BP8A 4H5NA 3FLCO 1RDWX 3CJ1A 4BR7A 3D2EB 4FL9A 4K41A 4PL7A 3WEEB 4BVOA 3W3DA 3ZX0A 3ZETA 2FSJA 4IJAA 1MA9B 1SQKA 4O5FA 1JCFA 4C23A 4IO8A 3BUZB 2I7NA 4JHDB 2GWKA 2D0OA 3ZX2A 4PL8A 3H6EA 4BRIA 4FWRA 3LDNA 2FF6A 3DXKB 3QB0A 4BQZA 2E2QA 5AQHA 5FPNA 1SZ2A 1ZXOA 4BC2A 4H0TB 1G99A 1ATSA 3H1QA 2GELA 3LDLA 4AM6A 4FOEA 4BC3A 2HOEA 3AAQA 1X3MA 4FWOA 1KXPA 2W40A 4L3QA 5AZJB 4A61A 1MWKA 4Z94A 5JICA 2HMPA 2P9IB 4BC4A 3CI5A 1MDUB 4IJNA 5AQKA 3CERA 5AQPA 4B9QA 2VWBA 2QWPA 2ITMA 4H5WA 4CZLA 1E4FT 4DB3A 3P4IA 3BF3A 3H1VX 3EO3A 5ELZA 1NGAA 1ZC6A 2P9SB 3D7EO 3WXJA 4ISEA 3O4WA 2E1ZA 4J8FA 3UKRA 1C0GA 5EVZA 5FPMA 3UKUB 2CGJA 4PKHA 1K8KA 1T6CA 4MLEA 3VPZA 4E1JA 1X9JA 4B1UB 3KVGA 2P9KA 3O5BA 1HKCA 1ATRA 2A42A 4H0YB 1BUPA 2YCHA 3D2EA 1P8ZA 3WEEA 5BREA 3A5OC 4CJ7A 5AQLA 1XUPO 4K43A 4EFHA 3A5MC 2A3ZA 1BG3A 3A8YA 1DKGD 1GLBG 3G25A 5BN8A 4CZEA 5ADXH 1NM1A 3ZEUB 2P9LB 2E20A 3QFPA 4IXCA 2F9WA 1WUAA 3VOVA 2QXLA 1NGHA 4I6MB 4DHYA 2P9NB 3MN9A 1WOQA 4GNIA 1XC3A 4B1YB 2Q2RA 3AAPA 4F9OA 5AFUA 2E2PA 3ATVA 2DPNA 3CJCA 3FR0A 4BR9A 2QWLA 2FLOA 1YUWA 1NGGA 1NGCA 2CH5A 1BWFO 4XH4A 1QQNA 3FFKB 3QBWA 3HM8A 3W0LA 5AQMA 4CZHA 3ID8A 1Z05A 3C7NB 5B8HA 1NMDA 3BF1A 2A41A 2IVPA 2IIRA 4B1ZA 5KPRA 1HLUA 2P9IA 3JXUA 3LL3A 3U4LA 1TYQB 2E8AA 1BDGA 3VEVA 3O1WA 1NGJA 3FZKA 1BO5O 5AQYA 5E26A 2E2OA 1DGKN 1V4SA 1GLJO 2FSNA 2YHWA 3CHWA 4CD1A 4EHTA 3SMPA 4CZKA 1YVNA 3C0BA 3R9PA 3AY9A 4B1XB 2P9SA 1LOTB 3VESA 3RSEB 1NLVA 4MO4A 5AQIA 3VERA 4FSVA 4YDUC 1NBWA 2NRHA 4CZMA 3WXLA 4H5TA 5AQWA 1GLFO 4BRAA 4HTLA 3WQTA 4B1WB 4CBWA 5BR9A 3L6QA 3DJCA 4FWQA 3O80A 3EKSA 3FZHA 1Z6RA 4IWVA 4EAHD 2GUPA 3QBXA 1LCUA 4BRGA 3EN9A 4WQ4C 5KPTA 1MWMA 3VF4A 1T6DA 3UE5A 2YJFA 4DQ8A 2V52B 4BREA 1KAXA 3DXMA 3WT0A 4CZJA 3FZMA 1T44A 4PKIA 3WQUA 3GE1A 3L4IA 3ZEUA 1S3XA 5AQZA 2P9LA 2A40A 4FO0A 4HWIA 5KQDA 1XQSC 2Q0RA 3ATUA 2P9NA 4FPBA 4EIAA 2P9UB 1ZBSA 3GDQA 2E2NA 2QM1A 1DEJA 2GTDA 4H5VA 4PKGA 2Q97A 4JD2B 4KBOA 3CJ9A 4BR2A 2OANA 4MLHA 3H45C 1X3NA 3ULEB 4BRDA 4BR5A 4CI6A 1Q18A 2IVNA 2Q36A 3SK3A 1U2VB 2V7YA 4M7XA 1ATNA 5BRFA 3VEYA 1RFQA 2WUSA 3OHRA 1GLLO 1GLEG 2HF4A 3O08A 1S22A 5BPMA 3J8AA 1YXQA 3VF2A 4CD3A 3H3NO 3EZWA 1OKJA 2ASOA 4IZ9A 2FXUA 3ENOA 2GWJA 3H3OB 3QFUA 3LDPA 4BRNA 5I9EB 2VCPA 4BRLA 3LM2A 5BN9A 5JLHA 4BR4A 3MDQA 2QWRA 3LM9A 1EQYA 5AQVA 5AR0A 1TUYA 4CBUA 3M6GA 1SAZA 1JCGA 4ISGA 1HPMA 4BGBA 3U9DA 1BU6O 4JHDA 3MK6A 1TUUA 2D4WA 2ZGYA 3FZLA 2W41A 1YAGA 3F9MA 3DXKA 1BA1A 2V7ZA 5JMVA 3FE1A 3QICA 4RWTA 2BTFA 3GBTA 4WQ5C 5AQSA 1GLDG 5AFUH 1QZ6A 4O8KA 3VEOA 2CGKA 2NLXA 4WYBA 5EOYA 1HKGA 2P9PB 5F2RA 3O8MA 2NZTA 4BROA 4DCHA 4M63C 1HJOA 5BRHA 3D2FB 5AZJA 4CZGA 4FWMA 3IFRA 3I8BA 3KHYA 3L0QA 4RTFD 2E1YA 1KAZA 4XH5A 2P9UA 1BOTO 1V4TA 3QDKA 4BQLA 2FSKA 5F1XA 1QZ5A 5AQJA 3MN5A 2GEMA 4Y0WA 4H5RA 3S41A 4A62A 1Y64A 3CIPA 4JD2A 5AQOA 1HKBA 5AZIB 3MCPA 3HI0A 4RCHA 2A5XA 4A2BA 3UKUA 4BVPA 2Q31A 5BRDA 3WUHA 4AM7A 2P9KB 3SLCA 2QW9A 5AQFA 2YHYA 1E4GT 1QQMA 2E88A 3VF6A 3ENHA 4H0PA 1U6ZA 2ZWHA 1H1VA 5KPZA 4A2AA 3TU5A 5LJVA 2QWMA 5BPLA 3U8XA 4XEIA 2PAVA 3I33A 5JLFA 4H0VB 5FPEA 3IMXA 4YDUA 2ASMA 1CZAN 5AQRA 3A5NC 1IJJA 5AQXA 4BG8A 3HTVA 5AQNA 1NGEA 3HSCA 2HF3A 3HZ6A 3MN6A 3VGMA 3SJHA 5EXWA 5AQGA 1RGIA 4K42A 1NGIA 4H0OA 5KQ8A 5E84A 4EHUA 4WQ4A 4I6MA 5EX5A 4QS7A 1JCEA 3U9ZA 5AQTA 2QWOA 1HX1A 3QMLA 3VEXA 2F9TA 3CETA 2EWSA 5CE3A 3CJAA 1BA0A 2QWQA 4LC9B 4M7YA 2D0PA 3VEWA 2P9PA 1NWKA 2A6AA 3C7NA 4BR0A 1HUXA 3FZFA 2PBDA 3D2FA 1R59O 2H3GX 5TKYA 3DWLA 1TYQA 3BEXA 3UB5A 4BRQA 1KAYA 5BPNA 2D1KA 2QWNA 4BG9A 3CQYA 4GY2B 4MO5A 5F0XA 3CJBA 4H0XB 1ESVA 3ZETB 3MMVA 3VETA 4BRKA 2KHOA 4FWNA 5LJWA 5AZIA 4FWLA 3RSEA 3H46O 2VYPA 4H03B 4CZFA 3WXKA 4NB4A 1NGBA 4CBXA 3GG4A 2AA4A 3VENA 4BRMA 3DAWA 4BRFA 3JS6A 3HBTA 4CZIA 4QS9A 1GLAG 2Q0UA 2ASPA 3O6WA 3WXIA 3M3ZA 4BRPA 3LDOA 4FOIA 3ZX3A 1J6ZA 2YJEA 4FPAA 4BRCA 2YI1A 3IUCA 2I7PA 3B8AX 2V51B 1D4XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WBDA 1Y97A 4F4KA 4CEAA 1NGDA 2YHXA 4O4GA 1LWFA 1NKCA 4CK3A 4XH1A 2WBNA 3KZBA 2CGLA 1NGFA 1IG8A 3TANA 3O9UA 2G8UA 4KKOA 4BDPA 3AVNA 3LP0A 3N4PA 3O9RA 3GOIA 4K8ZA 1JXEA 4JI8K 3IDHA 4ELVA 4M3UA 1OVYA 3ULEA 4YOXA 4JI0K 1CXUA 1W97L 4KREA 3OBWA 1HYZA 1S1TA 1U2VA 3HYFA 1VQNN 3VGLA 4J2AA 3QINA 1U45A 1YT3A 1KC8O 4JI3K 3BP8A 3FLCO 1RDWX 3CJ1A 2B6AA 4BVOA 2E6MA 3W3DA 1U49A 4YORA 1XMOK 1RDBA 4O5FA 4BACA 4OPAA 1Q81O 3ZX2A 4JS4A 4FWRA 3LDNA 2P5GA 5KTQA 2FF6A 1IBLK 1HNVA 4EP5A 4I9LA 3DXKB 1NOYA 1ZXOA 1YHQN 1QVGM 4H0TB 4AHVA 3ALYA 4E19A 3SPZA 4HUFA 3ZLJA 4UQGA 2HOEA 1YVUA 1N36K 1BL3A 1JLBA 3HM9A 4CEBA 4KRFA 1OH6A 1Q82O 4JI7K 4Z94A 1XI1A 3DI6A 4KAZA 4JYAK 4IBNA 2P9IB 1MDUB 4DTPA 1YJWN 1QS4A 2O8BA 4FK0A 3CERA 4B9QA 3OS0A 1C6VA 1RTIA 1Q86O 4CJ3A 3QNOA 3O4QA 4LF9K 3D7EO 1K8AO 2E1ZA 5GIOA 3UKRA 1C0GA 3V9XA 1TL1A 3RMDA 4KHSA 3TTCA 4B9LA 4MLEA 4AF1A 3NDKA 4FZZA 3SQ2A 1OVQA 3O5BA 1ATRA 2HHUA 4DU1A 2O4IA 1D9FA 2YCHA 3WEEA 5BREA 2DFHA 4G9ZA 3SNNA 1T03A 2VG6A 3VTHA 4DTOA 5AQLA 1LV5A 2A3ZA 3OYKA 4LF6K 4AQYK 4ZTFA 3NAEA 1BIUA 2ZM6K 4M3TA 1WUAA 4O55A 4JLHA 2QXLA 1VQ7N 1HPZA 4DTSA 4F3OA 2HNZA 4B1YB 1TV6A 1WSJA 3EY1A 5AFUA 3S3MA 3PO5A 1QSSA 4M3WA 2DPNA 3CJCA 1GOCA 3FR0A 2FLOA 4FLYA 3TR8A 2XRIA 3W0LA 1QQNA 5CYMA 4CZHA 5B8HA 3L3UA 2A41A 1QQCA 2IVPA 1KD1O 2DFFA 1HLUA 3JXUA 2E8AA 2HMIA 3VEVA 1JLGA 3FZKA 1NK5A 5DM6L 2E2OA 1SKSA 1WB9A 1V4SA 1GLJO 4CGFA 3HL8A 4CZKA 2I5JA 2OPQA 3RSEB 4GKJK 5KRTA 4OKKA 5AQIA 4CEOA 4FSVA 1A5WA 3L2VA 4YDUC 1B92A 3K0SA 2NNWA 4CBWA 4FWQA 3AV9A 4OO1J 3DLHA 4ID1A 4FK4A 4EAHD 2GUPA 3DLLL 3QEPA 3EN9A 5IWAK 3OW2M 3I56N 1S6QA 3SUPA 1M90O 1MWMA 1OH8A 4PUOA 4FW2A 4BE1A 2V52B 1KFDA 2EX3A 3E66A 1Q8IA 3CC2N 4KTZA 4EZ9A 4PKIA 3KLGA 3L4IA 3ZEUA 5M1NA 2YNHA 1KFSA 3K59A 4HWIA 1VSHA 1RDUA 5KQDA 4IG3A 1L3SA 1TAUA 2P9NA 5T7BA 3K5NA 3GDQA 3TAQA 2OTLN 2GTDA 2Q97A 4JD2B 4JKAA 4MLHA 4YNQA 3H45C 3ULEB 4A5BA 4BR5A 4A57A 4ZTJA 1Q18A 4HUEA 1BQNA 1U2VB 4X64K 1LAVA 1ATNA 4I9QA 4QAGA 3MAQA 4LF8K 1GLEG 1L5UA 1NOZA 1S22A 1YXQA 4CD3A 5C12A 3THWB 2GWJA 1ASWA 1CLQA 4JK7A 4LF4K 3AO4A 3P39A 4BRLA 4JV5K 3T19A 3WNFA 2X6SA 3VQBA 4EP4A 4KHYA 1SAZA 2UU9K 3IKMA 3CYMA 3QIOA 1HPMA 1BU6O 4R5PA 4NLCA 1SKWA 4W5RA 4LF7K 2IAJA 2VG7A 4BY9C 3KLEA 4DR2K 2ZGYA 5FLXO 3MWPA 2V7ZA 5HLFA 3FE1A 1YJ9N 4RWTA 3GBTA 3RRHA 1C0UA 3AVIA 3CCEN 3S3NA 4UY8O 1TK5A 2CGKA 3ZSXA 2OCEA 2P9PB 3SBGA 2PYLA 5BRHA 2O8BB 4JI2K 4CZGA 3NVKA 3I8BA 1CZBA 4ICLA 2QEXN 3L0QA 1MU2A 4RTFD 4E7LA 4CF2A 5I42A 3OS2A 3HRGA 3S41A 1Y64A 1IBMK 3AVFA 1HKBA 4FJIA 3HI0A 4RCHA 3LAMA 1NJIO 1WSIA 4Q5VA 4KHUA 3VQ7A 1X1PA 3D6RA 3VQQA 3SLCA 1N6QA 3EYZA 2YHYA 1K9MO 1E4GT 3TSUA 5I3UA 3QEVA 2ZWHA 3C95A 3KLFA 3J7ZO 4DS5A 3V4IA 4A2AA 3TU5A 3OYIA 4CGGA 1RDCA 3OYHA 5FDLA 3K2PA 4CEDA 4XEIA 2PAVA 3I33A 4DWIA 2YKNA 2ASMA 2YNIA 4N47A 3A5NC 5TKWA 4FLVA 1NGEA 4NCGA 1TGOA 1TAQA 3MN6A 4LSNA 2G8KA 5AQGA 5JS2A 4LY7A 1NGIA 4EHUA 4WQ4A 4CEZA 1JCEA 3LALA 2QWOA 2UUCK 5HRSA 4H4MA 2HNDA 3G6EN 4YOYA 3OJUA 4PQUA 1RT2A 1NJZA 2EWSA 3P31A 1XMQK 2HVHA 3E9LA 4DV6K 4DV0K 2D0PA 2HBKA 1NWKA 3C7NA 4F2RA 3FZFA 2OZSA 2YX6A 1R59O 3BGRA 4DSLA 1YITN 3TTFA 3QEIA 4DFKA 5BPNA 2D1KA 4BG9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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