4EHTA

Activator of the 2-hydroxyisocaproyl-coa dehydratase from clostridium difficile with bound adp
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MYTMGLDIGSTASKGVILKNGEDIVASETISSGTGTTGPSRVLEKLYGKTGLAREDIKKVVVTGYGRMNYSDADKQISELSCHARGVNFIIPETRTIIDIGGQDAKVLKLDNNGRLLNFLMNDKCAAGTGRFLDVMAKIIEVDVSELGSISMNSQNEVSISSTCTVFAESEVISHLSENAKIEDIVAGIHTSVAKRVSSLVKRIGVQRNVVMVGGVARNSGIVRAMAREINTEIIVPDIPQLTGALGAALYAFDEAKESQKEVKNISA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title On the ATP-Dependent Activation of the Radical Enzyme (R)-2-Hydroxyisocaproyl-CoA Dehydratase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase
molecule tags Electron transport
source organism Clostridium difficile
total genus 83
structure length 268
sequence length 268
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehtA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehtA01
4FWOA 2V7ZA 4B1YB 4XH5A 3D2EA 4H5VA 3FFKB 2ZGYA 3LDNA 3JS6A 2CGKA 4BRLA 4RCHA 3RSEA 4FSVA 4H0VB 4FPAA 1ESVA 2GWJA 2E2OA 5BPLA 4XH1A 3LDOA 2P9IB 5BRFA 2J4RA 3DXMA 4FOIA 3H1QA 1NBWA 2YJFA 2QWNA 1ZXOA 4BRDA 5JICA 3O08A 4XH4A 5JLFA 4CZKA 2P9PB 4MLHA 4BRCA 5AQGA 3VF4A 3FGUA 3BEXA 3FLCO 2A5XA 5ADXH 1HKBA 2IVPA 1NGBA 4M63C 1Z05A 2E2NA 2IVNA 1XUPO 4BR9A 1GLFO 2PBDA 4M7XA 2D0OA 3TPQA 3WXLA 2E8AA 3WQTA 2FLOA 5AQIA 4QS8A 1H1VA 2Q97A 1JCGA 1BA0A 3A8YA 3QFUA 4O5FA 3VESA 3WXIA 1K8KA 2E2QA 3TU5A 2BUPA 1J6ZA 4JHDB 1QQOA 3OHRA 4A2AA 1NGJA 1K8KB 2W40A 4H0YB 1RDWX 4CZHA 3SLCA 3M6GA 5AQOA 5AQTA 3LDQA 5AQVA 1TYQA 5EX5A 3SK3A 5KPRA 3GE1A 3C7NA 2A42A 4PL8A 1DEJA 4LC9B 4B1WB 2A41A 3CI5A 3O6WA 2I7NA 3C7NB 4PKHA 1BOTO 4BR5A 4I6MB 4EHTA 5AR0A 5LJVA 3ULEB 5AZIA 3UKUA 3L6QA 5F2RA 3U9DA 2V7YA 4A62A 3QICA 3BUZB 3ATUA 2HF4A 3ZX3A 3CJCA 3R6MA 3UKRA 3VETA 4JD2A 1NGIA 3O1BA 3JXUA 3HM8A 4FWMA 3GDQA 4IZ9A 4DCHA 3O4WA 2P9UB 3M3ZA 4H0PA 4K42A 4BG9A 1RFQA 4AM6A 4QS7A 5AZJB 3CJ1A 3ENHA 5JLHA 1NGCA 2ASOA 1V4SA 5LY3A 1LOTB 2CH5A 1SQKA 4B1ZA 1HLUA 5BPMA 5EY4A 4H0TB 1BG3A 4BREA 1Q18A 2HF3A 4E1JA 1LCUA 5E26A 1X3MA 2WUSA 4BGAA 3GBTA 2Q0RA 3WXJA 1MDUB 1NGHA 4CZMA 4HWIA 5CE3A 4BC2A 3KZBA 4B9QA 5BRDA 4FWNA 4CD3A 3WEEA 4J8FA 3UB5A 2GTDA 4IXCA 1ZBSA 3VENA 1GLAG 1U2VB 2I7PA 3L0QA 4MLEA 3VPZA 5AFUA 1U6ZA 1TUUA 5ADXA 3C0BA 1SAZA 3ZX2A 2W41A 3DXKA 4PKGA 2AA4A 3EKUA 3WUHA 3U8XA 1XQSC 4K25A 4BRNA 3LDLA 2QWMA 2Q1NA 4BC4A 3WQUA 4CZJA 4EHUA 4H5RA 1HX1A 4FWSA 4K41A 3D2EB 2D1KA 5AQZA 4MO5A 3GL1A 1JCFA 5AQSA 3MCPA 3RSEB 5KPTA 2P9LA 2F9WA 1NGGA 5AQYA 1BWFO 2D0PA 3HI0A 3DXMB 2Q2RA 3IUCA 4BRGA 4JNEA 3FZFA 4BQZA 3VF6A 4JAXA 1GLJO 1C0FA 2YI1A 3EN9A 3ENOA 2QXLA 2CGLA 4O8KA 2EWSA 5AFUH 4HTLA 2D4WA 2F9TA 3M1FA 4BRIA 4ISEA 1MA9B 4FWKA 5AQFA 4CJ7A 1HKCA 3CJ9A 2PAVA 2UYTA 4FWQA 2HOEA 3QBWA 4QS9A 3SJHA 3EZWA 5FPNA 3AY9A 5E84A 1HUXA 4IO8A 1ATNA 5AQNA 4DB3A 1C0GA 4PKIA 4BRFA 3WXKA 2Q36A 3IDHA 2NZTA 5F0XA 4CI6A 3QDKA 3ZEUA 1YAGA 2FF3B 3LL3A 1JCEA 3EL2A 4BVOA 3ZEUB 2P9SA 3H3NO 5AQPA 3R9PA 3S41A 4CZGA 3QMLA 5F1XA 1TYQB 4EIAA 5I9EB 5EOYA 3VGKA 2ZF5O 3CJBA 5AQRA 4Y0WA 1NGAA 1NGEA 3VOVA 5FPEA 2VWBA 3D2FA 2QM1A 2V52B 3A5NC 4M7YA 4BR4A 5AZIB 4FPBA 4BQLA 3UKUB 3CJAA 2FSNA 3A5LC 2ITMA 1X9JA 2CH6A 3AARA 4CBWA 3ATVA 4ISGA 4MO4A 5AQJA 5BRHA 5FPDA 2ASPA 2FXUA 3WT0A 2QW9A 3UKRB 1BUPA 4JD2B 1NLVA 3A5OC 2YJEA 4IJAA 2P9NA 3F9MA 1BO5O 4JN4A 4BR2A 1SZ2A 3VERA 4CZLA 3IMXA 1OKJA 4FO0A 1DGKN 4B1UB 1WOQA 2QWRA 4A2BA 3A5MC 2YCHA 3R8EA 1IJJA 2ZGZA 3CIPA 2VCPA 1QQNA 3LM9A 4GY2B 3I33A 4BG8A 2GELA 5AQLA 4Z94A 5AQUA 4BRAA 3VEXA 4IJNA 1BA1A 2DPNA 1RGIA 3CERA 3WEEB 1NWKA 2VYPA 3G25A 3UE5A 1S3XA 3J8AA 3VEYA 2P9KA 3FZMA 1EQYA 4NO7A 2A3ZA 1V4TA 3CQXA 3VGMA 5BPNA 4RWTA 4H5TA 5AQWA 4BGBA 1YXQA 3ZETA 2ASMA 5FPMA 3DXKB 1P8ZA 3FZHA 1QQMA 3H46O 1X3NA 2NRHA 1S22A 3MN9A 4C23A 5BN9A 1MWMA 3FZLA 1ATRA 3MDQA 1G99A 2YHYA 1NGFA 4DHYA 2P9LB 3VEZA 4FWRA 1HKGA 1GLCG 1NMDA 2QWPA 4K43A 1D4XA 4H0XB 3MK6A 4WYBA 3DWLA 1BU6O 4RTFD 4FL9A 1T6DA 3IFRA 2E88A 5BREA 1Y64A 2GUPA 2P9IA 3CJ7A 2YHXA 3QBXA 2NLXA 2A6AA 4B1XB 4CZFA 5BR9A 3MN5A 4CZIA 3H3OB 2P9PA 4BRQA 5KQ8A 3FE1A 5AQXA 3HBTA 4NB4A 3GOIA 4H03B 5KQDA 2AP1A 1R59O 4H5WA 1BDGA 3GG4A 3W3DA 3H1VX 1KAXA 2E20A 2E1ZA 5JMVA 3O80A 2FSKA 4EAHD 3LM2A 5AQHA 4XEIA 4L3QA 2QWQA 3O8MA 1HPMA 2IVOA 5ELZA 2YHWA 4FWLA 2QWOA 4FOEA 4EFHA 3MMVA 1KAYA 5AQQA 3CQYA 2P9SB 4ISFA 3SMSA 4JHDA 2ZWHA 4GNIA 5BN8A 2QWLA 3BF1A 3CHWA 1YUWA 3HSCA 4BRKA 3BP8A 3P4IA 4H0OA 3KVGA 4DQ8A 1MWKA 3D2FB 3VEOA 3I8BA 5AQKA 2Q0UA 5LJWA 3MN7A 4CZEA 3L4IA 5KPZA 2V51B 2GWKA 2IIRA 3HTVA 4YDUA 1HJOA 4I6MA 3ULEA 4BC5A 3AAQA 4BR7A 1T6CA 1XC3A 3AAPA 4WQ4A 1NGDA 2KHOA 2P9NB 4A61A 1QHAA 4FWPA 1ATSA 3ID8A 1TUYA 1KXPA 2A40A 1T44A 1IG8A 2E2PA 2Q31A 2P9UA 1GLBG 2HMPA 5AZJA 4YDUC 3LDPA 4BRMA 3ZX0A 3U4LA 5B8HA 1WUAA 4B1VA 1Z6RA 4WQ4C 1NM1A 3KHYA 1GLLO 3QB0A 4BVPA 2BTFA 1E4GT 3H45C 3HZ6A 1GLEG 3D7EO 3BF3A 4CBXA 3H6EA 4AM7A 4F9OA 3DAWA 1QZ5A 4IWVA 3A0IX 1CZAN 1YVNA 4CD1A 3MN6A 4H5NA 2FSJA 1QZ6A 5TKYA 3QFPA 1GLDG 3DJCA 4BROA 4WQ5A 3O1WA 3VGLA 3VF2A 5EXWA 4CBUA 2OANA 2P9KB 3B8AX 2E1YA 3SMPA 1DKGD 1E4FT 3U9ZA 3FR0A 2H3GX 3EO3A 3O5BA 4BR0A 3EKSA 1KAZA 1ZC6A 3W0LA 3ZETB 4BC3A 1U2VA 2CGJA 4KBOA 3VEWA 5EVZA 3CETA 3FZKA 5AQMA 2FF6A 4BRHA 3VEVA 4PL7A 2GEMA 4BRPA 4WQ5C
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FWOA 1TK5A 1C0MA 5J2MA 1BGXT 2CGKA 4RCHA 1L5UA 4H0VB 4O4GA 1SL1A 3CQ8A 2P9IB 3BZCA 3DXMA 2YJFA 3PX4A 2QI2A 3HVTA 5JICA 3DLRA 5JLFA 2P9PB 1QHTA 3WXMB 5CYQA 3VF4A 3QEVA 1OH6A 3BEXA 1TV6A 3FLCO 4J2EA 4W5RA 3O4NA 2PY5A 4JI5K 1HKBA 4FK0A 3K5OA 1HJRA 4LSLA 2E2NA 1WSGA 1IKVA 4M7XA 4YFUA 4YOWA 3QFUA 1JCGA 3ZT2A 3WXIA 3ASMA 2QTDA 3VESA 2E2QA 3NF7A 3KTQA 3TU5A 4DKWA 4CJFA 3OHRA 5M1KA 4CZHA 1RDWX 2G8HA 3LP1A 4BE0A 5AQOA 1NK5A 3LDQA 3IKMA 1VSFA 5EX5A 2X6SA 3PO5A 3H08A 4PL8A 4LC9B 1JLQA 3F2KA 4BACA 3C7NB 4PKHA 1U49A 4O0JA 1BOTO 4EHTA 1OVQA 5LJVA 1IBLK 4CGIA 3L6QA 5F2RA 3D0PA 2V7YA 3QICA 3PSIA 2X78A 4CHYA 3OYLA 2HHXA 4V19S 3QIOA 4B9UA 3VETA 3VMFB 4L8RB 3O1BA 3V81A 1JLFA 3S3NA 3THXA 3HM8A 3GDQA 3O4WA 2P9UB 3M3ZA 3J7YP 3VQ8A 1C6VA 4DSFA 5JLHA 4C8KA 2G8KA 5KRTA 4JKGB 4CFDA 3CCRN 3OA9A 5BPMA 1RDBA 1NKEA 3KD1E 4QAGA 3SUPA 3HL8A 4OKJA 3DYAA 1U47A 1XI1A 4FJIA 1BCOA 4HWIA 5CE3A 3ZT3A 3OY9A 2O8BB 3KZBA 3VQQA 4B9QA 4KTQA 4CD3A 1DT9A 2QEXN 3HPGA 3CF5L 5J2NA 4I9LA 3CFRA 5ADXA 4A5BA 4AHSA 1HNZK 2W41A 4W5TA 4HUGA 2AA4A 3UIQA 3TI0A 1D5AA 4BRNA 1NKBA 4JYAK 1NNEA 4ELVA 4DV5K 2OZSA 4FJGA 4DR1K 4CZJA 4GW6A 4FWSA 3AGKA 4KH4A 3TTCA 1J5OA 3SYZA 5SZTA 2F9WA 1ASUA 3SAHA 4F3OA 4KHQA 3DRPA 3VA0A 3M8RA 4OPJA 3EN9A 2QXLA 4O8KA 5HL7L 2W6LA 2F9TA 3M1FA 4BRIA 4JK7A 2NRZA 4AHCA 4K8XA 1KD1O 5CHIA 3PIPL 4Y1DA 3AVBA 4FW1A 3RRGA 2PAVA 2UYTA 1IO2A 3EZWA 4IBNA 1KRPA 5E84A 1U04A 4DWIA 5I3UA 3VQEA 3MXMA 1ATNA 5AQNA 3OTOK 4M3YA 1W0HA 3WXKA 1KVAA 3K5LA 4CHPA 4CK3A 2YHAA 3TTFA 2DFHA 1LAVA 2AJQA 4C1NI 1HYVA 2HBLA 3QMLA 4IDKA 5F1XA 5I9EB 3VGKA 2ZF5O 4LH4A 4Y0WA 5FPEA 1WAJA 4M7YA 4BR4A 2HB5A 4FM1A 3RVCA 3UKUB 3HJFA 2FSNA 1X9JA 5HP1A 5BRHA 5FPDA 2FXUA 4CJLA 3UKRB 1BUPA 2F7TA 2NRVA 2XRIA 3C6AA 4CW7B 3I56N 4DLEA 1VSMA 2WTUA 3OYJA 4BR2A 5CY4A 2D0BA 1WOQA 2QWRA 3ZT4A 4DUZK 2G8WA 5D3GA 4JK9A 4A2BA 1CXUA 3ZYYX 2ZGZA 5JS2A 4HHTA 4E7LA 4O44A 2BGGA 3VEXA 3KLFA 1XHXA 4U7BA 1TL3A 1C0TA 2HHWA 3QO9A 2Q3SA 2UUAK 4KFBA 4JKEA 3G25A 3J8AA 3NHGA 4EZ6A 4NO7A 3CC4N 3CQXA 5BPNA 1WB9A 4I9QA 3DXKB 3TWHA 1P8ZA 3FZHA 1ZYQA 2NRWA 3OYMA 3SUQA 2OZMA 4KH5A 3O3GA 4C23A 2Y1IA 2HNYA 4CGFA 1RDAA 4CHOA 2IS3A 4E89A 4IOXA 3BDPA 2KZZA 1NMDA 3NF8A 3CCLN 2IC3A 3MK6A 4C1NK 3MEEA 4DFMA 2P9IA 2Z1IA 1KTQA 2A6AA 2YKNA 4HCCA 2O8CB 2P9PA 2QKKA 3EE8A 3FE1A 1J53A 3Q7CA 5AQXA 3GOIA 4H4OA 3HP6A 3V1OA 4JI7K 1VSEA 4U67L 3T19A 2E20A 3HM9A 5FRMA 2FSKA 3AO5A 4EAHD 5AQHA 3LANA 4L3QA 1KFDA 5TKWA 2QWQA 5M1NA 3OBWA 1LW2A 2HHTA 3TARA 2QWOA 4EFHA 1Q81O 1E3MA 3OVNA 1ZBUA 2VG7A 2DFFA 3CQYA 3O4QA 3SMSA 1RCHA 1S1TA 2ZWHA 1BCMA 2QWLA 1NG9A 1JLGA 1N32K 3VQ9A 3BP8A 4H0OA 3KVGA 2UUCK 3VEOA 3MCAB 3I8BA 4ICLA 3I8DA 3NE6A 4FJ5A 4JKDA 4Q0BA 2OTJN 2V51B 2GWKA 3ZSYA 4WFAL 4YDUA 2XY7A 3AAPA 3THYB 3DOKA 2P9NB 4A61A 2HSTA 1QHAA 3ID8A 3AO4A 1XNRK 2P9UA 3HK2A 2IGIA 3BGRA 3LDPA 1JKHA 4CCHA 4MDAA 1WUAA 3NGIA 2Z1JA 1Z6RA 4AF1A 4JKGA 4WQ4C 3F9KA 4NCBA 1GLLO 4G9ZA 4JKHA 1RT3A 4F8RA 1VRUA 1EWRA 4IWVA 4H5NA 3T3FA 2FSJA 4HUFA 3A2FA 4ILHA 2HHVA 1GLDG 3DJCA 4FK2A 1Q86O 2O8BA 2RHKA 3ZT1A 1QS4A 3SMPA 4FZYA 3EO3A 1WBBA 3EKSA 1ZC6A 4G1QA 2A1RA 2NUBA 2BE2A 2RE2A 4M3RA 4DTPA 3NF9A 2GEMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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