4EHTA

Activator of the 2-hydroxyisocaproyl-coa dehydratase from clostridium difficile with bound adp
Total Genus 83

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MYTMGLDIGSTASKGVILKNGEDIVASETISSGTGTTGPSRVLEKLYGKTGLAREDIKKVVVTGYGRMNYSDADKQISELSCHARGVNFIIPETRTIIDIGGQDAKVLKLDNNGRLLNFLMNDKCAAGTGRFLDVMAKIIEVDVSELGSISMNSQNEVSISSTCTVFAESEVISHLSENAKIEDIVAGIHTSVAKRVSSLVKRIGVQRNVVMVGGVARNSGIVRAMAREINTEIIVPDIPQLTGALGAALYAFDEAKESQKEVKNISA

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTIV1 (18-21)AH8 (242-261)S1 (2-8)TI1 (9-12)TIV2 (33-36)S2 (13-19)TI'1 (19-22)AH1 (37-50)S3 (23-30)3H1 (54-56)S4 (57-63)TIV5 (73-76)S5 (75-76)TIV3 (64-67)TII1 (67-70)AH2 (79-90)TII2 (91-94)S6 (94-100)TIV9 (207-210)3H3 (215-218)TIV6 (101-104)AH3 (130-140)S7 (105-110)AH6 (182-204)TI2 (111-114)S8 (116-122)TII3 (126-129)3H2 (144-146)AH4 (147-152)AH7 (220-230)TIV8 (154-157)TIV10 (237-240)TI3 (239-242)S9 (209-213)TIV7 (122-125)S10 (234-235)AH5 (165-178)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Electron transport
source organism Clostridium difficile
publication title On the ATP-Dependent Activation of the Radical Enzyme (R)-2-Hydroxyisocaproyl-CoA Dehydratase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase
total genus 83
structure length 268
sequence length 268
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehtA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehtA01
3HBTA 1NGJA 3SK3A 2A42A 3D2EB 3GOIA 5AQPA 3O1WA 3AAQA 4O8KA 1NGIA 3D2FB 1NGFA 4YDUC 4CI6A 2HF3A 1GLBG 3MMVA 3C7NA 2QWPA 3LDLA 4PKHA 5AQWA 1S22A 4ISGA 4CBWA 5AQVA 4DHYA 2A41A 2P9NA 1C0GA 3ZX2A 1BO5O 1HLUA 3QICA 2W41A 4FWSA 2E1YA 3CQYA 4J8FA 2QXLA 3VF6A 2OANA 1ZXOA 4GY2B 1XC3A 2E1ZA 1HX1A 3ID8A 3UE5A 2YHYA 4C23A 2VWBA 3IDHA 2GEMA 3SJHA 3WEEA 5AQIA 4B1ZA 4BC5A 1U2VA 5BRDA 3GE1A 1KAYA 4K42A 1YUWA 3H1QA 4JNEA 4BVOA 2E8AA 4BRFA 1Z05A 4BRHA 4LC9B 3QBWA 3C7NB 3UKUB 1QQMA 3U4LA 4CZLA 2J4RA 1E4GT 4FWPA 5ELZA 3U9DA 4BR5A 4BRNA 3RSEA 3WQTA 4RCHA 2IIRA 5LJVA 4PKGA 1NWKA 2CH6A 1GLLO 2NLXA 2E2PA 4CBXA 2UYTA 2F9WA 3KVGA 3SLCA 4I6MB 3HSCA 4H0YB 1IG8A 3A5OC 5AZJA 2GUPA 4BC3A 2VYPA 2BTFA 3SMPA 1QQOA 3H3NO 3VEVA 3WQUA 4CBUA 2I7PA 4H0OA 4B1UB 3ULEA 2P9LA 5KQ8A 5EOYA 3IMXA 3G25A 1X9JA 4FWMA 3QDKA 5AQJA 4A62A 3MN7A 2WUSA 1T6CA 3JXUA 4MO4A 5AQKA 1NGDA 4FL9A 2P9KA 4QS7A 3D7EO 2YJFA 4IO8A 4RWTA 3M6GA 4AM6A 1X3NA 2HMPA 4B1YB 3H3OB 5BPMA 3OHRA 2Q31A 3WT0A 2FSJA 4XEIA 1DGKN 3VETA 1QZ5A 5EVZA 3M1FA 3GL1A 4HTLA 4CZMA 3LDPA 1RDWX 3ULEB 2P9LB 2EWSA 3CJAA 3L0QA 3R6MA 3ZX3A 2AP1A 3D2EA 2FF6A 4RTFD 4BR4A 3FR0A 5FPMA 3O08A 4EAHD 1RGIA 1K8KB 1P8ZA 1X3MA 3D2FA 4DCHA 2Q36A 4Z94A 1NGAA 5KPRA 2E2QA 1TYQB 4K25A 2E2NA 5BPLA 4BRGA 2QWQA 4H0XB 3UKRB 3ZEUA 4B1XB 2P9IB 4M7YA 4XH1A 1IJJA 3L6QA 2CH5A 3DXKB 1HPMA 3KZBA 2Q2RA 1XQSC 3UB5A 4BRCA 2CGJA 1BUPA 4BVPA 5LY3A 2PBDA 3H1VX 2H3GX 2YJEA 4WQ4A 3MDQA 4FOEA 5EY4A 4BR7A 4JN4A 2CGLA 1LCUA 4K41A 5E26A 5BN8A 4A2AA 2ZGZA 3EO3A 4DQ8A 4BC4A 4FO0A 3WXJA 3HTVA 2P9PB 1BA0A 1QQNA 4BG9A 3SMSA 2Q0RA 3ZEUB 1NGHA 3VERA 3CJ1A 3UKUA 2D1KA 2YHWA 1HKCA 3LDOA 5FPDA 3WXLA 4H5WA 2HF4A 3U9ZA 3VGLA 3BP8A 3O1BA 3ZETB 4KBOA 3L4IA 5E84A 4BREA 4BR9A 4BRLA 4IWVA 4E1JA 5JMVA 3ATVA 3LL3A 5AQLA 3DAWA 2YI1A 1ATSA 1Q18A 4BG8A 4H5VA 3GBTA 4I6MA 2D0OA 2ASMA 1NGEA 4B1WB 2I7NA 4H03B 2QW9A 3LDQA 1NMDA 4QS8A 3VPZA 2AA4A 3CETA 4FPAA 2ITMA 3DJCA 3VOVA 5AFUA 4XH4A 4JAXA 3QMLA 4CJ7A 4PL8A 2E20A 2ZWHA 1WOQA 3LM9A 2QWMA 3C0BA 1C0FA 3LDNA 2IVNA 5FPNA 4H0PA 4BRMA 3A0IX 3CIPA 5AQZA 2GWKA 5AQNA 5EXWA 4M7XA 4MLEA 3FFKB 3A5NC 1R59O 3W3DA 3CHWA 1NBWA 2E88A 1ESVA 1JCEA 3FLCO 1QZ6A 4WQ4C 4EHUA 5KQDA 1GLDG 3VEXA 4FOIA 2A3ZA 4NB4A 3VF4A 4BRDA 3QBXA 1RFQA 3H45C 3O8MA 1BDGA 5B8HA 4H0VB 1XUPO 4CD1A 4BRQA 3ZX0A 1HKBA 5F2RA 1U6ZA 3M3ZA 1K8KA 2ZF5O 2BUPA 3O80A 5AQRA 4EFHA 1TYQA 2V7ZA 3U8XA 2FSNA 3UKRA 1S3XA 4BRAA 5JICA 2P9IA 2V7YA 3DXMA 3VEZA 5AZIA 2E2OA 3DXKA 4WYBA 3GDQA 4HWIA 4CZGA 1ZBSA 1D4XA 1BG3A 3O5BA 4M63C 3HM8A 4FPBA 2A40A 3FZLA 3GG4A 3CI5A 4IXCA 3BF3A 1GLJO 4A2BA 4L3QA 5FPEA 4ISEA 1NGCA 3O6WA 5JLHA 4BGBA 4PL7A 3QFUA 4EHTA 5AR0A 2P9PA 3I8BA 3F9MA 5JLFA 3BEXA 5AQQA 3DXMB 5AZIB 4MO5A 3EL2A 5CE3A 3R8EA 2GTDA 2IVPA 3CJCA 1HUXA 2W40A 3EN9A 4Y0WA 3ZETA 4BRIA 5AFUH 4FWLA 3WXIA 3VEYA 2FF3B 1QHAA 4BR0A 3EZWA 3FZMA 4NO7A 1E4FT 5BN9A 3VGMA 1MDUB 4H0TB 4JD2B 4H5TA 3DWLA 4K43A 3AARA 1ATRA 3A5MC 2Q97A 1TUYA 2F9TA 1OKJA 5AQFA 2P9UB 4BROA 2V52B 2NRHA 1GLFO 1NM1A 2D4WA 1NGBA 4IJAA 3QB0A 5AQGA 4BQLA 1SQKA 3HI0A 2GWJA 2PAVA 3VESA 1G99A 4B1VA 5LJWA 4FSVA 5ADXA 1T6DA 1V4TA 4H5RA 5BPNA 2ASPA 3MCPA 4AM7A 2YCHA 1DKGD 2P9SB 4BRPA 1KXPA 1ZC6A 2A6AA 1GLAG 2Q0UA 1LOTB 1V4SA 4FWKA 5KPZA 4XH5A 2FXUA 4CZFA 1YAGA 4BQZA 4WQ5A 3FGUA 3JS6A 5BREA 3O4WA 1BOTO 1YXQA 2Q1NA 4CZKA 3LM2A 1SZ2A 2FLOA 1EQYA 5AQSA 3AAPA 1NGGA 3WXKA 2KHOA 4CZHA 3EKUA 3MK6A 2QWLA 1HJOA 3H6EA 2FSKA 3H46O 1Z6RA 1BWFO 5AQXA 1YVNA 2IVOA 3IUCA 3CQXA 3P4IA 2D0PA 4JHDA 4IJNA 4FWNA 4PKIA 4A61A 2P9NB 1JCFA 3ENOA 1CZAN 2ASOA 3FZHA 4FWOA 5AQYA 4IZ9A 1KAXA 3S41A 1BA1A 1MA9B 3CJ7A 1Y64A 1WUAA 4ISFA 5F1XA 1JCGA 5TKYA 3WEEB 3EKSA 3I33A 2V51B 2QWOA 3VENA 4EIAA 1U2VB 2ZGYA 5AQUA 4BGAA 5F0XA 3HZ6A 4CZIA 1NLVA 3A5LC 3BF1A 3ENHA 4BR2A 4F9OA 5I9EB 4GNIA 2QWNA 4YDUA 2QM1A 2GELA 2CGKA 1TUUA 5AQHA 1ATNA 1MWKA 3R9PA 2QWRA 5AQOA 4JHDB 1H1VA 1SAZA 1GLCG 3RSEB 4CD3A 5AQMA 4FWRA 2A5XA 2VCPA 4JD2A 4B9QA 5KPTA 3A8YA 3TPQA 3VEWA 3CJ9A 4BC2A 3TU5A 2NZTA 5EX5A 4MLHA 5AZJB 3VEOA 1DEJA 2HOEA 4WQ5C 5ADXH 4BRKA 2P9UA 3MN5A 3J8AA 3MN9A 3IFRA 1GLEG 3B8AX 3WUHA 5BR9A 2DPNA 4DB3A 3VGKA 1MWMA 3AY9A 5BRFA 3W0LA 1BU6O 1T44A 2P9KB 3FE1A 1HKGA 3CERA 4H5NA 3KHYA 3MN6A 4FWQA 1J6ZA 3FZKA 3QFPA 4QS9A 4CZEA 3VF2A 3FZFA 2P9SA 2YHXA 5BRHA 3ATUA 3CJBA 3BUZB 1KAZA 4O5FA 4CZJA 5AQTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CF0A 3SK3A 3E9OA 3P5JA 4A59A 4CF9A 4JKCA 1SL0A 1VSKA 3PO5A 2HF3A 1RBTA 4DSIA 4F4KA 2WFBA 4CCHA 3LWMA 4ILHA 3O3GA 1SV5A 4ISGA 4DHYA 4K8XA 4KFBA 1L5UA 2A41A 2P9NA 1BO5O 1JKHA 2W41A 4FWSA 3CQYA 4B9VA 1RCHA 4CGDA 2QXLA 2GBZA 1RDUA 3VF6A 4CF8A 4JS4A 3ENBA 3MXJA 1HX1A 4X64K 2YHYA 4C23A 1NKBA 3O3HA 2VWBA 2GEMA 3K9KA 1U2VA 3PUFA 3NVKA 4JNEA 1IV0A 5LMNK 4MQ3A 1NJWA 2P5OA 3C7NB 3KK1A 1QQMA 3QIPA 3U4LA 1L3VA 1FXXA 2UXCK 4CJKA 1E4GT 3AVIA 3U9DA 4ELVA 3WQTA 4RCHA 3VN5A 2RKIA 4LY7A 3OYIA 3THVA 1S6QA 3J7ZO 3KLHA 4JI8K 1NWKA 4CHNA 2E2PA 2HVIA 1VSIA 4E7IA 4FJMA 5CZ2A 3SLCA 3KD5E 1N32K 3T1HK 2GUPA 5KGXA 1M1KO 3OJUA 2VYPA 2BTFA 5M1PA 3I8DA 1QQOA 1A5WA 3EZ5A 4B1UB 2P9LA 2D5RA 1Q86O 4IFYA 5AQJA 1C1AA 1OVYA 1KTQA 1XNRK 2HVHA 3L3VA 2Q3SA 1WSGA 4AHUA 2P9KA 4DTPA 4OPHA 3KWIA 2IAJA 2BANA 3D7EO 3L2QA 4RWTA 3TSQA 4CFDA 3NMUA 1NKCA 1WBDA 5KRSA 4B1YB 1NU0A 5BPMA 1OH8A 4NXMK 2QEXN 1DGKN 1U04A 2OPSA 3VQCA 5EVZA 3M1FA 3G10A 3NF9A 3HP6A 3LDPA 4FLTA 2EWSA 3CJAA 3L2RA 3L0QA 3QINA 3PO4A 4RTFD 4BR4A 3O08A 4EAHD 1KRPA 3CM6A 4RW9A 1KQSM 3P31A 5KPRA 1NGAA 1VHXA 4O0JA 1TKDA 2QWQA 4B1XB 4M7YA 4XH1A 1IJJA 2D0BA 3C6HA 2CH5A 1HPMA 4RW4A 3N4PA 1JL2A 2CGJA 1VK0A 1IBMK 4DG1A 5LY3A 4DV1K 2PBDA 2KKZA 2H3GX 2YJEA 3MDQA 2O8CB 4BR7A 4C8LA 5D3GA 2CGLA 4K41A 1W2BM 4UY8O 4A2AA 3T3FA 4BWMA 4CEAA 3HTVA 1BA0A 4RW7A 3LPTA 3J80O 3CM5A 3C95A 1N34K 1SS6A 4J2EA 3Q7BA 4PA1A 2OTLN 3T69A 3PX6A 4E1MA 3HM9A 4BREA 4DV5K 4CK3A 2E6MA 4KTQA 4BRLA 4G1QA 4E1JA 5JMVA 3SAHA 5AQLA 2XO7A 4MDBA 4CECA 2ASMA 1NGEA 3I56N 4H03B 1NMDA 2ZM6K 2ITMA 2PZSA 4EP5A 2UU9K 1HYZA 3VOVA 3L2UA 3JYTA 4JAXA 3DOKA 3NF7A 5HRPA 2Z1HA 3SUQA 4OPAA 3C0BA 3OJSA 5FPNA 4BRMA 3A0IX 3RMDA 2QK9A 5AQZA 1VQNN 3G0ZA 4WFBL 1XHXA 2ZD1A 1HNIA 4WFNL 3V9XA 2OYQA 1UOCA 3AV9A 3P1GA 5I42A 4ZHRA 1YIJN 1ESVA 1JCEA 3FLCO 4DSKA 1XNQK 1GLDG 2XY5A 4FOIA 4BRDA 5B8HA 3QBXA 3H45C 3FFIA 1BDGA 1N5YA 5J2PA 1XUPO 3OYAA 3ZLJA 4CD1A 3ZX0A 4AHVA 1VSDA 4DFKA 3QEWA 4FK0A 3D6RA 4A5AA 2ZF5O 4LF7K 4K8ZA 3U8XA 2O4GA 4W5RA 4DSLA 4KHQA 5AZIA 3OYNA 3CC7N 4IFVA 4Z0UA 3DOLA 1RDAA 4WYBA 4ID5A 4HWIA 5J2MA 1X9SA 2O8DB 1ZBSA 4CHPA 3SQ2A 3HM8A 2ITGA 4Y1CA 3VQ9A 4DS5A 4KHPK 1I94K 3KLEA 5FRNA 3QFUA 4EHTA 1Q9YA 4O0IA 1JXEA 4DKWA 4FJJA 3BEXA 3DXMB 4KH6A 1K8AO 1ASVA 3J7AP 3ZT3A 1NNEA 2W40A 1WN7A 1RT1A 3QIOA 3HSTB 4ILJA 3FZMA 3E66A 5BN9A 1MDUB 2D0CA 4JD2B 4DU1A 3DLKA 4DFMA 4DTUA 4OKKA 3M8QA 4CGIA 3A5MC 4J2BA 2Q97A 3SUOA 2F9TA 1K6YA 2P9UB 2HHSA 3AVLA 3QNOA 4CVNE 2OPPA 5AJ3K 2DTUA 1GLFO 1XMQK 1TVRA 1EX4A 3LP2A 3TR8A 4YOYA 4B1VA 5LJWA 1D8YA 4Z4FA 3G4SN 3V9UA 1DKGD 4KAZA 3OYFA 4JI4K 3TWHA 3MXIA 1LOTB 4O8UA 4XH5A 3EYZA 4BWJA 2BDPA 2UXDK 5I3UA 1JLEA 1J5OA 1YXQA 2G8KA 3QERA 4OKEA 4B9SA 4M3TA 1A5VA 4DMNA 2OTJN 3AAPA 1NGGA 4FJXA 1BI4B 4DUYK 2KHOA 4CZHA 4ILGB 2QWLA 5KTQA 3SQ1A 3Q7CA 5AQXA 2HHHK 2IVOA 2O8DA 3IUCA 3CQXA 1T05A 4N5SA 4FWNA 1S1WA 3K0SA 4CJ3A 1WSIA 5CHIA 3QETA 3TSUA 3SJJA 3VQ8A 2VG7A 1MA9B 3CD6N 1WUAA 2OA8A 2HSTA 1RBUA 5TKYA 3WEEB 2NRRA 1KD1O 4EIAA 2JWLA 3HPGA 4IOXA 2NRXA 1ZBUA 5F0XA 5DM6L 4AHCA 4YDUA 2CGKA 1IKWA 1ATNA 2VGMA 4F3OA 4JHDB 3WXMB 3LALA 3LDSA 1TL1A 4DU4A 1FK9A 5AQMA 3TAGA 2W42A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2IVP A;  2FBV A;  3CJC A;  3DLR A;  4U67 L;  4AHR A;  3ZET A;  3EN9 A;  4Y0W A;  4Z4E A;  4CEB A;  5AFU H;  4FWL A;  3WXI A;  3CCV N;  3HT3 A;  3V81 A;  1NJI O;  4BR0 A;  4FLW A;  2HBJ A;  2P1J A;  4H5T A;  4CE9 A;  1ATR A;  4ELU A;  4Q0B A;  4JK7 A;  5C0Y A;  4V19 S;  4FW2 A;  1TUY A;  4PHT X;  4E89 A;  5LMU K;  4BAC A;  4KI6 A;  4BRO A;  5C12 A;  2UUC K;  2KTQ A;  2V52 B;  2NRH A;  2OZS A;  4YNQ A;  1LAV A;  3MXM A;  4IJA A;  1M90 O;  1KVB A;  3P38 A;  4ICL A;  3HJF A;  3VES A;  1G99 A;  4IDH A;  5BR8 K;  3AO5 A;  2YV0 X;  5EU7 A;  3OA9 A;  2ASP A;  1JLB A;  4M3U A;  1OVQ A;  3QEI A;  3S3O A;  4BE1 A;  2NRV A;  1V4S A;  5KPZ A;  2FXU A;  4WQ5 A;  1BOT O;  2Q1N A;  1YJN N;  3LM2 A;  1RT6 A;  3AVF A;  1EQY A;  1S1V A;  4JKG B;  5DMR A;  3WXK A;  4I9L A;  4AF1 A;  3EKU A;  4CES A;  1QS4 A;  2NRT A;  4B9U A;  3O9U A;  1YVN A;  4CHO A;  3V9W A;  5SZT A;  3P4I A;  4HHT A;  2G8F A;  4JI7 K;  4M3Y A;  2ATQ A;  4JHD A;  4CJV A;  2P9N B;  1NJZ A;  1WBB A;  1CZA N;  5DK5 A;  1WSJ A;  3NGY A;  4PWD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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