4EHUA

Activator of the 2-hydroxyisocaproyl-coa dehydratase from clostridium difficile with bound adpnp
Total Genus 92

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MYTMGLDIGSTASKGVILKNGEDIVASETISSGTGTTGPSRVLEKLYGKTGLAREDIKKVVVTGYGRMNYSDADKQISELSCHARGVNFIIPETRTIIDIGGQDAKVLKLDNNGRLLNFLMNDKCAAGTGRFLDVMAKIIEVDVSELGSISMNSQNEVSISSTCTVFAESEVISHLSENAKIEDIVAGIHTSVAKRVSSLVKRIGVQRNVVMVGGVARNSGIVRAMAREINTEIIVPDIPQLTGALGAALYAFDEAKESQKEVKNISA

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTIV2 (18-21)AH8 (242-262)S1 (2-8)TI1 (64-67)TIV1 (9-12)TII1 (33-36)S2 (13-19)TI'1 (19-22)AH1 (37-50)3H1 (54-56)S4 (57-63)TVIII1 (73-76)S5 (75-76)3H2 (67-69)AH2 (79-90)S7 (105-110)TIV4 (91-94)S6 (94-100)TI3 (111-114)TIV7 (207-210)3H4 (215-218)TI2 (101-104)AH3 (130-140)AH6 (182-204)S8 (116-122)TIV5 (122-125)TII2 (126-129)3H3 (144-146)AH4 (147-152)AH7 (220-230)TIV6 (154-157)TIV8 (237-240)TI4 (239-242)S3 (23-30)S9 (209-213)S10 (234-235)AH5 (165-178)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Electron transport
source organism Clostridium difficile
publication title On the ATP-Dependent Activation of the Radical Enzyme (R)-2-Hydroxyisocaproyl-CoA Dehydratase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase
total genus 92
structure length 268
sequence length 268
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehuA01
4BRLA 4JD2A 1IG8A 3UE5A 1YUWA 2QWQA 4RTFD 2YI1A 4CD3A 4CZHA 5FPMA 5AFUH 3R9PA 3SJHA 1U2VA 2GELA 1QHAA 2A40A 1KAXA 1JCGA 4H0XB 2QWNA 3DXKA 4CBUA 4DQ8A 3H3OB 4BQLA 2E20A 4B1UB 1NGHA 3LDNA 2P9PA 4M7XA 3IUCA 2YHYA 4H0OA 1NMDA 5AQRA 3H3NO 3G25A 3VESA 4H03B 3HBTA 3VPZA 3CJ7A 5AQFA 2CGKA 1IJJA 5BPMA 3A5NC 4MO4A 3ZEUA 3VENA 2E2NA 4M63C 3SK3A 3LDPA 2ZGYA 4B9QA 3CQYA 3VEZA 4BRDA 1ZBSA 1YXQA 3A5LC 1ZC6A 4XH1A 2NLXA 2A5XA 4BR0A 1KAYA 4GY2B 5BREA 2ASPA 3DXMA 3WEEA 1NGGA 3GL1A 1MWKA 3ZX2A 5AZJB 1SAZA 3M3ZA 5AQJA 5AQHA 5EX5A 4XH5A 1RGIA 1V4TA 4BRMA 4IO8A 3CETA 4FWQA 3OHRA 1Q18A 2V7YA 1GLEG 3TU5A 3H6EA 4K42A 4H0VB 1NGFA 2QWMA 4PL8A 4Z94A 4CZIA 1NBWA 2BUPA 4EFHA 4F9OA 1S22A 5ADXA 1BWFO 4YDUA 3HSCA 3CJ1A 3O80A 4BRCA 2AP1A 2P9LA 3WXKA 1RDWX 1NGBA 3CJ9A 2YCHA 3GOIA 3W3DA 5LY3A 4CBXA 3R8EA 4DHYA 2CGLA 3QICA 4PKIA 3U4LA 1K8KA 3VEOA 1MDUB 4FWPA 1GLFO 4MO5A 3QBWA 4JHDA 3VF2A 2CH6A 3MMVA 2F9TA 3C0BA 2A41A 3ULEA 4IZ9A 2DPNA 3U9DA 4L3QA 2P9UB 5ELZA 1T44A 3HM8A 4H5NA 5AQKA 4O5FA 4BREA 4YDUC 1T6DA 2P9SA 2ZWHA 2P9KA 1TYQB 3CJAA 2QM1A 3L6QA 4IXCA 1XC3A 3CI5A 3WT0A 2CH5A 4CJ7A 1ATSA 5AZIA 4BGAA 4BVOA 4H5TA 1HKGA 3J8AA 4HTLA 3WXJA 4BC2A 4FPBA 5EY4A 3WXIA 5KPZA 3MCPA 3VEXA 4A2AA 1NGIA 2P9IA 3RSEB 4I6MB 2F9WA 3CERA 5AQSA 1NWKA 5AQIA 4JD2B 2IIRA 3AAQA 5F2RA 1U6ZA 2FF6A 4M7YA 1NLVA 4FWRA 4BG8A 2Q0RA 1U2VB 4DB3A 3D2FA 4IWVA 1NGEA 1KAZA 5I9EB 2E88A 3A0IX 2ITMA 2I7PA 1QQNA 5FPNA 3EL2A 3DXKB 4BG9A 5JLHA 3H1QA 4AM7A 3W0LA 5F0XA 2P9PB 3LL3A 3VGKA 1X9JA 2FF3B 4RCHA 2D0OA 1Z6RA 3QBXA 1NM1A 2FSJA 4B1YB 2VYPA 3HZ6A 3WQUA 3ZEUB 3JXUA 5AQNA 5AFUA 1T6CA 1NGCA 4XEIA 5AQPA 4CZMA 4FWSA 4LC9B 3O1WA 3MN7A 4H5WA 1J6ZA 3ZX3A 2VCPA 5AQGA 3DJCA 4ISEA 3DXMB 1LCUA 3WEEB 2QW9A 1XQSC 2NZTA 1E4GT 3GBTA 2Q31A 2ASMA 1EQYA 4AM6A 5JICA 1ESVA 3O6WA 4FO0A 2A6AA 4K43A 1DKGD 3F9MA 3IMXA 1X3NA 3CJBA 4H0PA 4MLHA 4BRQA 1NGDA 1V4SA 1BO5O 1NGAA 5EXWA 4ISFA 1JCFA 3VEYA 1QQMA 3GE1A 3VOVA 1TUYA 3CHWA 4FWLA 4WQ5A 2OANA 3AY9A 4FOIA 2ZF5O 4BR5A 1JCEA 3L4IA 2IVNA 1E4FT 2P9LB 4EHUA 2H3GX 3UKRA 1HKCA 3VF6A 4H5VA 2PBDA 1XUPO 2NRHA 5ADXH 2E2OA 3QMLA 3ZX0A 4BR4A 3LDOA 1HJOA 1K8KB 3O08A 5E84A 2I7NA 3AARA 5AQTA 2WUSA 1ATRA 2YHXA 3FZFA 4JHDB 2EWSA 2GEMA 1ZXOA 1WOQA 1BDGA 4WYBA 4HWIA 3ULEB 3ZETA 2QXLA 5TKYA 3VETA 3TPQA 3ENOA 4H5RA 3SMSA 3MN5A 2HMPA 2QWPA 1HPMA 3KHYA 5KPTA 2P9SB 3EKSA 2P9KB 4CD1A 1H1VA 3D2EA 4EIAA 3U8XA 3O8MA 3C7NA 3BP8A 5AQZA 3MN9A 4KBOA 4MLEA 1HUXA 5AQQA 4RWTA 5B8HA 1MA9B 5AZIB 2CGJA 5BRDA 2E2QA 3I8BA 4EHTA 2A3ZA 3FZMA 2P9NA 5FPDA 1GLLO 3FZKA 2P9IB 2D0PA 4JNEA 5EOYA 4BGBA 4WQ4C 4CZGA 4BRHA 2GWJA 4FSVA 3BF3A 3I33A 4BC5A 5KQDA 3GDQA 3H46O 2FSKA 3D2FB 2FLOA 2AA4A 1X3MA 2E1YA 3CIPA 2ZGZA 1BU6O 2D1KA 5AQYA 4BR2A 1CZAN 5AQLA 3UKUA 3R6MA 2D4WA 3QFPA 3DWLA 3VEWA 2GTDA 4FPAA 4CZJA 4CI6A 5JMVA 2FSNA 3EO3A 4PL7A 1RFQA 3VERA 4BRPA 4BRGA 3HI0A 1HKBA 3LM9A 3VGMA 2QWLA 1G99A 1QZ6A 1QQOA 1R59O 3MN6A 1P8ZA 4FOEA 4BVPA 2HF4A 4NO7A 3QFUA 1GLJO 4FL9A 1BG3A 2GWKA 3WXLA 2HOEA 3BEXA 1BA1A 4E1JA 5F1XA 2Q97A 1ATNA 4QS7A 2W41A 2QWRA 3VF4A 2J4RA 3BUZB 3VGLA 3BF1A 4DCHA 2IVPA 2BTFA 2HF3A 3ID8A 2A42A 4H0YB 5BR9A 4CZFA 3IDHA 3L0QA 1HX1A 3ATVA 4GNIA 2YHWA 4PKGA 2GUPA 3O5BA 3GG4A 4BRKA 4FWKA 4BC3A 5BPNA 1NGJA 3H1VX 4FWOA 3DAWA 4O8KA 3WQTA 4BROA 5CE3A 5EVZA 1KXPA 4PKHA 5AQWA 5BN8A 1GLBG 4K25A 1SZ2A 2Q2RA 3A8YA 2Q36A 2PAVA 4BC4A 1DEJA 3LDQA 4BQZA 1GLCG 1D4XA 4C23A 3UKRB 5BN9A 3EKUA 3A5MC 4XH4A 3ATUA 3SMPA 5AR0A 1SQKA 4K41A 2Q1NA 2YJEA 2V52B 4Y0WA 1BOTO 1BA0A 4A2BA 3FE1A 4J8FA 5BPLA 4H0TB 3CJCA 4B1ZA 3H45C 5KPRA 2ASOA 2E2PA 5E26A 1C0FA 3FZLA 5AZJA 5AQXA 4BRNA 3FFKB 4JAXA 4BR7A 3ZETB 4CBWA 4QS9A 3P4IA 1YAGA 3O4WA 1LOTB 2IVOA 1WUAA 1DGKN 3D7EO 4BR9A 1MWMA 4B1VA 4WQ5C 3EN9A 3FR0A 2FXUA 3D2EB 4IJAA 3ENHA 3MK6A 3C7NB 3VEVA 3FLCO 2KHOA 5AQUA 3LDLA 3LM2A 5BRFA 3QDKA 4BRIA 4B1WB 4CZKA 5FPEA 5JLFA 3MDQA 1QZ5A 2P9NB 1OKJA 4CZLA 3KVGA 2E8AA 3KZBA 1GLDG 4IJNA 1GLAG 3U9ZA 4QS8A 3EZWA 2QWOA 2V7ZA 3A5OC 3HTVA 4WQ4A 1C0GA 4ISGA 3QB0A 5BRHA 5LJVA 2P9UA 1TUUA 1S3XA 2YJFA 3CQXA 3UKUB 4CZEA 5AQMA 3IFRA 1HLUA 2E1ZA 4B1XB 4A62A 2W40A 1TYQA 3FGUA 1BUPA 4JN4A 4A61A 3FZHA 4NB4A 1YVNA 4BRAA 3M6GA 3O1BA 3WUHA 5KQ8A 2UYTA 1Z05A 3B8AX 4BRFA 3SLCA 3M1FA 4FWMA 3UB5A 4EAHD 4FWNA 5LJWA 3S41A 2V51B 2VWBA 1Y64A 5AQVA 3RSEA 4I6MA 3JS6A 3AAPA 2Q0UA 5AQOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ICLA 5CR4A 2PYJA 3ISNC 2VWJA 1HYZA 4MDBA 4B9MA 2QWQA 5J2PA 3ZT2A 5FPMA 3R9PA 1S72N 3SJHA 4YORA 4JK7A 2A40A 4KTQA 4C8MA 4AF1A 1XWLA 3N4PA 4DQ8A 5J2MA 2F7TA 3EY1A 4KKOA 3H3OB 2XY7A 4B1UB 1NGHA 4CK1A 1VQON 4IFYA 3VPZA 1IJJA 4CGFA 3OBYA 3LP2A 3KJVA 4B8CA 2E2NA 3K0SA 4CECA 4M63C 1WBBA 3VEZA 4B3TK 5KGXA 1ZBSA 4E1MA 1M1KO 5HP1A 1C1BA 4LD0A 2RE2A 3AVKA 3WNGA 4OPAA 1HNZK 1BCOA 1EETA 4XH1A 2XRIA 1NK8A 1OH5A 3AO5A 4RW9A 2HHWA 3ZT3A 3ZYYX 5AZJB 4JKDA 1SAZA 4Y1DA 1VRTA 2YHBA 1JLAA 5AQHA 4CJVA 4B3RK 3CCSN 4DSJA 3KIOA 3OHRA 3SBGA 1WB9A 5BR8K 1EWQA 1OVQA 4R5PA 4C8KA 3TANA 2D0BA 4EFHA 4CF2A 4TSXA 1S22A 5ADXA 4YDUA 1VQ6N 4DR2K 2AP1A 4AHCA 2DFHA 5IT9O 5C15A 1SKRA 3VA3A 4ILGB 3BY5A 4C8OA 1J9AA 3K5NA 3R8EA 1NJIO 3QICA 4PKIA 1WAJA 4FXDA 5C10A 3VEOA 4CEZA 1CLQA 4DTJA 4MO5A 2CH6A 1VSMA 3C0BA 4EP5A 4M3TA 3OS1A 2ZE2A 2Y1JA 3U9DA 4L3QA 1RT2A 5ELZA 1BI4A 3KLEA 4E7IA 4BY9C 2WC9A 1BQNA 1T6DA 1B92A 1C0TA 2RN2A 4CJQA 2P9KA 4DQPA 1TYQB 2QM1A 1T7PA 4JK9A 1NJWA 3K9KA 4DTRA 2CH5A 4CJ7A 5AZIA 4KV8A 4O4GA 3T69A 3HT3A 3WXIA 1L3SA 3VEXA 1TGOA 4YOYA 3RSEB 4OLAA 2NRZA 4JD2B 2IIRA 3SYZA 1IBLK 5DM6L 3QEWA 4M7YA 1NLVA 4FWRA 4BG8A 3SQ0A 1U2VB 4DB3A 3J80O 5DK5A 1HPZA 3OYLA 1U48A 1NGEA 4DQRA 5J2NA 1RBRA 5T7BA 2KW4A 4CFCA 3MX2A 2YNHA 4AM7A 4CF0A 5F0XA 3PO4A 2XY5A 3NVKA 3CCRN 2UXCK 4FK4A 1JKHA 1X9JA 2FF3B 4CJTA 1K8AO 3AGRA 1S1XA 3OYJA 1EXQA 3HZ6A 3ZEUB 2VG5A 4IOAL 5I42A 1EP4A 3F2KA 4LC9B 3HK2A 5E41A 1I39A 3MN7A 3QETA 2EX3A 3B6OA 3ZLJA 3HL8A 3SAGA 5AQGA 1O1WA 4CJRA 3PIPL 3DXMB 2O8FA 1LCUA 4NYNA 3K58A 4JI6K 4IEEA 1U04A 4A5BA 3V4IA 1ESVA 4DR5K 3Q7CA 4JKBA 2A6AA 5C24A 1DKGD 3F9MA 3D0PA 3THXB 3SUQA 3BZCA 3CJBA 4BRQA 1JCFA 1QQMA 3VOVA 1C6VA 3C6UA 1JLBA 3AY9A 2NRXA 1HYSA 4BR5A 1JCEA 1VQ7N 2IVNA 3KLGA 3HPGA 4JKGB 3VF6A 3V1RA 3SAFA 2PBDA 4M45A 1P90A 3BDPA 5ADXH 4DTSA 3LP3A 3CPWM 3DMJA 4KHSA 4EZ6A 1SV5A 2HBKA 1HJOA 4MQ3A 3O08A 5E84A 3CC4N 4N76A 2I7NA 1G15A 4Z4EA 3L2RA 3FZFA 2WONA 1KSPA 3AO3A 3AVIA 4M3WA 2HSTA 1B9FA 4I9LA 1KVBA 4DS5A 4O5BA 3T1AA 5M1KA 3ENOA 1RCHA 2Z1HA 5KPTA 3KHYA 1HPMA 4CD1A 3MXJA 4EIAA 3MN9A 4IDKA 3LP1A 4KBOA 4MLEA 4DR6K 4WFNL 2HHHK 1SL2A 2OPSA 4G9ZA 3ZSZA 2CGJA 4IDHA 4KH6A 2Q3SA 5M1NA 3FZMA 3ID6A 4CF9A 5FPDA 4FM2A 1Q81O 2P9IB 3DOKA 1KLMA 3PSFA 4IFVA 3TTCA 4CZGA 3K59A 4CE9A 4FSVA 3E9LA 5HLFA 5KQDA 3GDQA 3D2FB 2FLOA 2ZGZA 4RW4A 5AQYA 3V9UA 5AQLA 4CHYA 3R6MA 4OLBA 2F8SA 2D4WA 3THVA 2GTDA 4FPAA 4CI6A 5JMVA 2KZMA 4PL7A 3N4QA 3VERA 2JLEA 2NNWA 4HUFA 1HKBA 3CCQN 4DV2K 4F3TA 1QZ6A 4E0DA 4PUOA 2X78A 3O9RA 1S9EA 3OYCA 1EX4A 4I7FA 4BWMA 2HHQA 4IKFA 3QFUA 3OS2A 4FL9A 3CCLN 3WXLA 2HOEA 3BEXA 4W5OA 5F1XA 3V81A 1ATNA 3QESA 5M1OA 4E7KA 4FYDA 2O8BB 5CYQA 4DV7K 3EE8A 4DV6K 3K2PA 2QWRA 5CZ1A 4CEFA 1HNXK 3BF1A 3ENBA 4LF9K 4DCHA 3KK7A 2A42A 2FC0A 3IDHA 3D6RA 2ZM6K 4M41A 5GIPA 5JS1A 2OZMA 1FK9A 4LY7A 4JI8K 4BRKA 4OKEA 4KI4A 1WSHA 4B3OA 3DAWA 4O8KA 2EHGA 4J2AA 4M3YA 1NU0A 1TVRA 3TSPA 4FZYA 3O9QA 4FJ5A 2PAVA 3D45A 4CEOA 3LDQA 2ZJRL 4FJ9A 3RVCA 3M5RA 3JSMA 4CHZA 3SMPA 1SQKA 4K41A 2YJEA 2V52B 2WTUA 1JLFA 4A2BA 3DYAA 3FE1A 3ZCMA 3G71N 1ZBLA 1HNIA 1LWEA 3NF9A 2ASOA 5KPRA 5E26A 2F4VK 1C0FA 1M90O 5AZJA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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