4F9OA

Crystal structure of recombinant human hexokinase type i with 2-deoxy-glucose 6-phosphate
Total Genus 335
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
335
sequence length
899
structure length
899
Chain Sequence
DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Inhibitor Sites of Unequal Affinity Linked by Binding Synergism in Mutant Forms of Recombinant Human Hexokinase Type-I
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Hexokinase-1
total genus 335
structure length 899
sequence length 899
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2012-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4f9oA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4f9oA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4f9oA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4f9oA03
3ZX3A 5E26A 3VEWA 2FF6A 1LCUA 4MO5A 4EIAA 4QS8A 3UKUA 2NZTA 5AQWA 1HJOA 3LL3A 3MN7A 4BR9A 1DGKN 4BVOA 1YUWA 1JCEA 2E2PA 2V7YA 4PKHA 3VEYA 5AQQA 1SQKA 3EZWA 1RDWX 3D2EB 4BRKA 2VCPA 1NLVA 2P9NA 3MN6A 4H5NA 1HKCA 3D2FB 1BA1A 4H0OA 3WT0A 4JD2B 3SK3A 4FL9A 2I7PA 5TKYA 5I9EB 3UKRB 3WUHA 4HWIA 2GELA 3C0BA 1WOQA 3ZEUA 3J8AA 4BR2A 2FSJA 3L0QA 1G99A 3DXKA 1BU6O 4JN4A 3VERA 1TUYA 4I6MB 5AQJA 3VF4A 1KAYA 1NGCA 1ZXOA 3FGUA 2E1YA 4CBUA 5F1XA 1BO5O 2E2NA 5FPDA 2QWOA 4IXCA 1NGAA 4E1JA 4BR5A 4PL7A 3EL2A 3DJCA 4RWTA 3P4IA 3EN9A 4H0PA 3FZMA 5BR9A 2A41A 3FFKB 5AR0A 5FPNA 4BC5A 1ATRA 4ISFA 4H5WA 1Q18A 3L6QA 4YDUA 5EY4A 1X3MA 2HOEA 4B1ZA 2BTFA 3M3ZA 4PKIA 3H3NO 5LJWA 3SMSA 1GLEG 2A6AA 5AQNA 4IJNA 4A2AA 4BG8A 3VENA 2Q0UA 4JAXA 4JHDB 4FWMA 4CJ7A 3CI5A 3WXKA 1HKGA 3IDHA 3CJ9A 3SJHA 4Z94A 1ATSA 3DXMB 3JXUA 2QWMA 4K43A 4H5RA 4JNEA 2PBDA 1BA0A 1MA9B 3KHYA 4H03B 2HF4A 2YCHA 1Z6RA 3FZHA 1TYQB 2P9KB 3QBWA 4WQ5A 4BRPA 4K25A 4O5FA 1C0GA 4WYBA 4FWLA 2W40A 2P9SB 1T6DA 5AQZA 1MDUB 4FOIA 4LC9B 1GLJO 3H1VX 1NMDA 4FWQA 2A3ZA 3QICA 4M63C 3OHRA 3GBTA 1K8KA 1HX1A 1YAGA 1EQYA 1QZ6A 5FPMA 4CI6A 2CH5A 3IUCA 3C7NB 2YHWA 4BGAA 3FZFA 4H0TB 3ULEA 4BR4A 4H0YB 5AQIA 3ZX0A 1IJJA 3QMLA 5AQGA 3WXLA 1U2VA 3MMVA 3UKUB 3VGLA 1NGIA 2ZGYA 3W3DA 5BRDA 4BRCA 2E20A 3FLCO 4A62A 3GOIA 3AAPA 1MWKA 4FPBA 3LDLA 3ZETB 1GLFO 3WEEA 4WQ4A 4BC3A 4XH5A 3R6MA 2ASMA 2P9LA 5AQPA 4DHYA 3VEOA 3LM9A 4IJAA 4XEIA 1HPMA 2KHOA 3IFRA 3VESA 4CD1A 1RGIA 2FLOA 3HZ6A 2D0PA 3WQUA 3R8EA 2D4WA 3HI0A 3VEVA 4YDUC 3ZEUB 5AQVA 3DXKB 3F9MA 1WUAA 2PAVA 5LJVA 3H46O 4GY2B 1XUPO 3O8MA 2GWKA 3LDQA 1S3XA 4Y0WA 4J8FA 4B1YB 1TUUA 3ENOA 4KBOA 5F0XA 2V51B 4B1VA 4B1UB 5JLHA 3D7EO 2FSKA 1ZC6A 2P9UB 3QFUA 3RSEB 3U9ZA 3A5MC 3FR0A 3QDKA 4B1WB 3A0IX 4WQ5C 1GLBG 5KQ8A 4EAHD 5KPRA 2UYTA 4F9OA 2E8AA 2A5XA 2J4RA 3TPQA 1XC3A 2BUPA 3QB0A 4BRMA 1Y64A 3AY9A 3BP8A 5AQHA 1NGEA 5AQXA 2P9IB 5BREA 4QS9A 3VGMA 4CZEA 1QQMA 3CJ7A 4BRHA 4GNIA 3LM2A 4FWOA 1ZBSA 3M6GA 1NGGA 4A61A 3QFPA 1BUPA 2H3GX 3U8XA 2I7NA 3L4IA 4CBXA 4BRGA 1NBWA 4O8KA 2GWJA 5BPLA 4FWNA 4CZJA 1NWKA 3MCPA 1GLAG 2F9TA 3FZKA 1SZ2A 4BGBA 1RFQA 4H5VA 1J6ZA 3O1WA 4FWSA 4BRDA 1LOTB 1E4GT 5BRFA 3D2FA 3B8AX 1R59O 5KPTA 4JD2A 4WQ4C 5AFUH 1ATNA 4FSVA 2IVNA 4H0XB 3O4WA 1K8KB 4ISGA 5AZJB 3WXJA 2F9WA 1BWFO 2Q31A 2NRHA 5JLFA 1KXPA 2V7ZA 4IWVA 5AQLA 2YHXA 3ULEB 4CZHA 4CD3A 5EX5A 1U2VB 3H1QA 3O1BA 3CHWA 3CJ1A 3KVGA 5BN8A 4DQ8A 2GEMA 3GG4A 2AP1A 4BQLA 4DB3A 3VF2A 3CETA 3I8BA 3WEEB 4BRFA 5JMVA 2P9LB 1GLCG 4FO0A 2GUPA 3BEXA 2V52B 5AQOA 5BRHA 3H45C 3WQTA 4CZGA 2P9PB 5AFUA 2Q2RA 3QBXA 2QM1A 1NGDA 3SMPA 3ATVA 1P8ZA 1D4XA 4BC4A 4C23A 5AQFA 4FWKA 4JHDA 3EKUA 1HKBA 2HMPA 3HSCA 3CJAA 2CGLA 2QWQA 2ZF5O 3VPZA 3KZBA 2IIRA 5ELZA 1XQSC 2E1ZA 1X9JA 4CZMA 1QHAA 2P9NB 4BR7A 5KQDA 2D1KA 3CIPA 4EHTA 4BRNA 2P9KA 4BRLA 5ADXH 3BUZB 3MN9A 1BDGA 3MK6A 5BN9A 2FF3B 4RCHA 2FSNA 3MN5A 3EKSA 1SAZA 4CZKA 3A5LC 2IVPA 1OKJA 4A2BA 2EWSA 3DAWA 3R9PA 4L3QA 2YI1A 5BPMA 1NGFA 3C7NA 3H6EA 3A5NC 2YJFA 3CJCA 4BRAA 4B9QA 4EFHA 5AZIA 4BG9A 1NM1A 1ESVA 2ASPA 2A40A 3VEZA 4NO7A 4MLHA 5FPEA 2QW9A 3LDNA 4MO4A 3U9DA 3GE1A 4BREA 5ADXA 3W0LA 5B8HA 1JCGA 2D0OA 4XH1A 5BPNA 3ZETA 4B1XB 4BVPA 1H1VA 3M1FA 2GTDA 2Q0RA 1NGBA 1QZ5A 2E2OA 3SLCA 4BQZA 2E2QA 5AQKA 4BRIA 2ASOA 3O6WA 3LDPA 1S22A 3VF6A 1T6CA 3UB5A 4FWPA 1U6ZA 1E4FT 2VYPA 4H5TA 3JS6A 4PKGA 4K42A 3HBTA 4RTFD 1QQOA 3G25A 2QWNA 4K41A 1NGJA 1GLDG 1V4SA 2WUSA 3GL1A 3UE5A 2CGJA 1MWMA 2QWRA 3A5OC 3VEXA 4EHUA 3D2EA 4CZIA 1JCFA 3CQYA 4AM6A 2QWPA 3CERA 3BF3A 2CH6A 3H3OB 5AQSA 2AA4A 3UKRA 2ITMA 1KAXA 2P9UA 1HLUA 3I33A 3RSEA 4DCHA 1C0FA 1QQNA 1NGHA 3LDOA 1BOTO 3TU5A 5AQTA 1X3NA 3FZLA 1KAZA 1Z05A 2FXUA 3DWLA 1HUXA 4I6MA 5E84A 3O5BA 4CZFA 4IO8A 2YJEA 3HTVA 3GDQA 4BRQA 4M7XA 2NLXA 2VWBA 1BG3A 4BROA 2IVOA 1CZAN 2P9IA 5EXWA 1DKGD 3EO3A 1T44A 2ZGZA 3HM8A 4NB4A 2OANA 2CGKA 2Q97A 4AM7A 5EVZA 3AARA 3CQXA 5JICA 4HTLA 1IG8A 2YHYA 3WXIA 4IZ9A 3VGKA 5LY3A 1YVNA 3U4LA 4MLEA 3ID8A 4M7YA 2DPNA 2Q1NA 4XH4A 3VETA 4BC2A 3O80A 4BR0A 3S41A 3BF1A 4FWRA 3DXMA 2Q36A 5AZJA 4CZLA 4H0VB 5AQMA 3A8YA 5EOYA 4FOEA 4CBWA 3VOVA 2QXLA 1GLLO 3CJBA 5AZIB 1TYQA 3ZX2A 3MDQA 2QWLA 2W41A 5AQUA 5CE3A 4FPAA 2P9SA 3ATUA 3O08A 3IMXA 2E88A 2HF3A 2ZWHA 4PL8A 2A42A 3FE1A 5AQRA 3ENHA 4ISEA 5AQYA 5F2RA 4QS7A 1V4TA 1YXQA 3AAQA 2P9PA 5KPZA 1DEJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5E26A 3RVCA 2RE2A 4DMNA 4LF5K 4F3TA 4MO5A 3U3YA 1WAJA 3TSUA 2Z1GA 3UKUA 5AQWA 4KI4A 3OBWA 1TAUA 1N36K 2HW3A 3OYIA 4BVOA 5D3GA 2GV9A 4I2PA 1YUWA 4JKCA 1JCEA 2V7YA 4E89A 3QEXA 3QNOA 3VEYA 3MEDA 1SQKA 3EZWA 4BRKA 4JI1K 4M3RA 2P9NA 4Q5VA 4H0OA 1U45A 2XY6A 4CK1A 4FL9A 1HJRA 5TKYA 4E7JA 3AO4A 4ZTJA 5FROA 3C0BA 2UXDK 3QLHA 3SBGA 4I9LA 4DV0K 1BU6O 3VERA 1TUYA 4O4GA 1BCMA 1RT2A 4CFCA 3MAQA 3DMJA 5F1XA 1LV5A 5FPDA 4DR5K 1YT3A 3TAQA 4B9VA 3QIPA 3RMCA 4B9NA 4PWDA 2XRIA 4KPYA 5BR9A 3DRRA 5M1KA 4YDUA 3SQ1A 1RDDA 2HOEA 1GOAA 3M3ZA 3K2PA 4JRPA 3K5MA 2P1JA 3BZCA 4BG8A 1RNHA 3ASMA 3NGZA 4FWMA 4J2DA 3SUQA 4W5RA 3IDHA 2ATQA 2QWMA 4YNQA 3K58A 4DTMA 5I3UA 2PBDA 5TKWA 4H03B 3TAEA 3FZHA 4BRPA 1RTJA 4DF8A 3M8PA 4BY9C 3DOKA 1U04A 3AVKA 4DU3A 3VQAA 1CZ9A 1NMDA 3T3FA 4M63C 2G8KA 1EKEA 3HVTA 3QEVA 4W5QA 4EP4A 4CGFA 1K8KA 4FJ9A 3LZIA 4YOUA 3A2FA 3L3VA 4CI6A 1K6YA 4BGAA 3NE6A 4DQRA 4IG3A 4H0TB 4H0YB 2O8EA 4FLZA 3ZX0A 1IJJA 5AQGA 3WXLA 1VQ4N 1RBVA 3G10A 1NGIA 3SUPA 1CLQA 5BRDA 4A62A 3HPGA 1TKDA 3TABA 3LP2A 2HHVA 4KHWA 2O8CB 1GLFO 4DHYA 2Z1JA 4DUZK 5KI6A 1ZBIA 3O9TA 2KHOA 4E3SA 4N41A 3V81A 1S1VA 1YI2N 1RGIA 2FLOA 3HI0A 5HRRA 4YDUC 2DTUA 3F9MA 1WUAA 5HL7L 4A57A 4GY2B 4FZZA 4Z4FA 4ELVA 1S3XA 4Z4HA 5LL6Z 1HNXK 4ICLA 2V51B 4CHQA 3D7EO 2YX6A 4CW7B 3RSEB 3A5MC 4JK9A 3N4PA 4CEZA 1GLBG 3L8BA 4DV7K 3DLHA 5C2DA 1VSEA 2A5XA 2J4RA 3C94A 3TPQA 3LDSA 1T03A 2R7YA 1IKVA 4Z4EA 4LFAK 1GOBA 1VQLN 2OA8A 3U3GA 3CJ7A 4BRHA 1VQKN 3NF7A 4GV6A 4KKOA 3SQ2A 3QFPA 1GOCA 1BUPA 3MXIA 1JL1A 1I3AA 4CBXA 1FJGK 1C0TA 1C1BA 4JKBA 4LSNA 4DV3K 3FZKA 2RHKA 1SZ2A 4BGBA 3L2QA 2XY5A 3QERA 2HHXA 3NGYA 4OKJA 3L2RA 5AFUH 1ATNA 4FSVA 4CIEA 4GKJK 4KV8A 1VQ8N 3SCXA 1BWFO 1HR0K 2Q31A 2V7ZA 3O9QA 5GADP 3ULEB 4Z4IA 4CD3A 4JYAK 3ISNC 4K0KK 3V6DA 1U2VB 3HPHA 4DU4A 2GEMA 4BQLA 4CJKA 4G9ZA 4NLBA 3CETA 3I8BA 3LP1A 1NKEA 1T7PA 1JLAA 2P9LB 4YOWA 2GUPA 5BRHA 1JKHA 3H45C 3VQ9A 3WQTA 3ZSYA 2P9PB 1J5OA 2Y1JA 2OCEA 1WAFA 1RBSA 1FW6A 1UOCA 3HO1A 1SL1A 3HYFA 3ATVA 1P8ZA 1D4XA 3IKMA 4DWIA 3EKUA 3HSCA 2CGLA 2QWQA 3KZBA 3T7ZA 4CK2A 1XQSC 2E1ZA 1DT9A 5DM7L 2F8SA 4HUEA 3CC7N 2D1KA 3CIPA 1RCHA 5E41A 4BRLA 5T7BA 3LWMA 3P38A 3SV4A 3MK6A 1JLGA 5BN9A 1OH7A 1NK6A 1ILYA 3OVNA 1KD1O 4PY5A 4RCHA 1VSLA 3MN5A 4CZKA 1SAZA 3A5LC 2IVPA 4A2BA 4NXMK 2YHAA 1HPZA 3H6EA 3VA3A 1RDCA 1SUQA 4GV3A 4FLUA 2ITGA 4EFHA 3NGIA 3CMAN 2XY7A 2YNIA 4U67L 3SNNA 4NO7A 1RT3A 3GE1A 5ADXA 4IOCL 3KLIA 4IDKA 2ETJA 2D0OA 3ZSXA 5BPNA 4BVPA 3WXMB 1Z25A 3M1FA 2HHUA 2JLEA 3WNEA 3M8SA 1G15A 1JL2A 1N33K 4NCAA 3LDPA 3E9PA 3VF6A 1U6ZA 3E9OA 1E4FT 4CEEA 4PKGA 1ZBHA 4MFBA 2QWNA 4DQQA 1GLDG 3AO3A 2CGJA 3CPEA 1O13A 5FLXO 3FFIA 2QWRA 3VEXA 3D2EA 5CYMA 4CZIA 4WE1A 1JCFA 1W2BM 3QEIA 3BF3A 1C1CA 2ITMA 3RSEA 4OKEA 4FJ5A 4DS4A 3FZLA 3AVNA 1KAZA 1NK7A 1D8YA 4DV5K 4BE1A 3JYTA 4HTUA 1C0MA 4CZFA 1S1XA 2YJEA 1TVRA 3PUFA 4MQ3A 2NLXA 2VWBA 1BG3A 4F4KA 5EXWA 1ASWA 2O4GA 4DG1A 3VQPA 1RTIA 2OANA 4CHPA 2X6NA 4A5BA 4FJJA 4OPJA 3AARA 4YORA 4AHTA 4ZHRA 3G0ZA 3T69A 3O4QA 2EX3A 2YHYA 3WXIA 1SKSA 3I56N 5LY3A 1R0AA 4G1QA 4EZ9A 3VQBA 3HP9A 3AVIA 2Q1NA 4B3SK 1WSEA 3O80A 3VQQA 5GINA 3BF1A 3TTFA 3AVCA 5AQMA 1BCOA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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