4F9OA

Crystal structure of recombinant human hexokinase type i with 2-deoxy-glucose 6-phosphate
Total Genus 335
100200300400500600700800050100150200250300350
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
335
sequence length
899
structure length
899
Chain Sequence
DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRTE
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Inhibitor Sites of Unequal Affinity Linked by Binding Synergism in Mutant Forms of Recombinant Human Hexokinase Type-I
rcsb
molecule keywords Hexokinase-1
total genus 335
structure length 899
sequence length 899
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2012-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4f9oA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4f9oA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4f9oA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4f9oA03
4H5VA 1XC3A 2V7YA 2P9LA 4K43A 3GDQA 3MN6A 4XH5A 1YAGA 1HLUA 3CI5A 1NBWA 1GLBG 1IG8A 1TYQB 3KHYA 1HX1A 3CJBA 3JXUA 2F9TA 5KPTA 1QQNA 3F9MA 2D4WA 4IZ9A 5AQJA 4FWKA 4F9OA 2A3ZA 1GLLO 2FSNA 2YCHA 2CGJA 5JICA 3MDQA 2GWJA 5AQGA 5AQUA 5LJVA 4BC3A 4H0TB 1SZ2A 3ZX2A 4AM6A 4A62A 4AM7A 1GLFO 5F0XA 3VGKA 4DHYA 2Q36A 3EZWA 2ASMA 3DJCA 5AR0A 4H0OA 3HM8A 5FPNA 4BRFA 4EFHA 5AQYA 2IVPA 4CJ7A 4A2BA 4BGBA 1NLVA 2Q0RA 3O1WA 4M63C 4WQ5C 3ZX0A 3BF3A 3WQUA 3VEZA 3C7NB 4BRKA 1JCEA 5LY3A 2P9SB 3WXKA 4CZKA 2ZGYA 1CZAN 3D2EA 3H1QA 4CD1A 4B1UB 4BRIA 3M3ZA 5AZIA 3CJAA 3LL3A 5AQMA 5BN8A 3A5LC 3A5MC 3SMPA 3QFUA 3WEEB 4BRPA 2V52B 1GLAG 1Z05A 3QICA 4BRAA 2A41A 2IIRA 3BEXA 3IUCA 5FPEA 2I7PA 5BPMA 3EKSA 3U9ZA 4BG8A 4QS9A 2GTDA 1WOQA 1E4GT 3ATUA 1WUAA 4K42A 2BUPA 2P9NB 3I33A 3VGLA 4H5RA 3FFKB 4ISEA 2ITMA 2IVOA 3WXJA 4XH4A 2E8AA 3BP8A 4BRNA 2FSKA 4FOEA 5LJWA 1YUWA 4GNIA 4B1ZA 1XUPO 1ZXOA 3ENOA 2HF3A 1HKBA 4M7YA 3UKUA 1BOTO 1BA1A 3DXMA 3HTVA 4IJNA 3KZBA 3VGMA 4FWOA 4B9QA 4C23A 5AQLA 4H03B 4IJAA 2FXUA 1ZC6A 1DGKN 1Z6RA 2E2NA 4NB4A 4PL8A 4BRGA 4BR5A 4FWPA 3O08A 3VOVA 4FWMA 3OHRA 1E4FT 2V51B 4MO5A 5ADXA 4HTLA 2A6AA 4FPBA 5AQKA 1C0FA 1X9JA 2D0PA 5AZJB 1NM1A 4FSVA 5AQXA 2PBDA 5AQOA 4CZGA 3ULEA 3AARA 4BC4A 4BQLA 3U9DA 2F9WA 4RTFD 1T6DA 4JNEA 1V4TA 3BUZB 3LDQA 2NRHA 4CZLA 4WQ4C 2J4RA 4K25A 5BN9A 5KQDA 4BRDA 1MWKA 2P9KB 5JLFA 1QQOA 4B1VA 1NGHA 3LM9A 4BREA 1TUUA 3EKUA 4K41A 3DAWA 4FWSA 3SK3A 3UB5A 2DPNA 2CH5A 3CQYA 2Q31A 3RSEB 3CETA 4JHDA 1OKJA 2P9UB 3O6WA 2QW9A 2QWNA 1BWFO 3IFRA 3VEOA 4QS8A 2YJFA 4ISGA 5I9EB 3D2FA 5BRFA 5AQIA 1HPMA 1RDWX 4MO4A 4FOIA 1BG3A 4WQ5A 2ZGZA 1MWMA 4H0VB 4CD3A 5BPNA 3VEWA 5EX5A 2Q0UA 4Z94A 4PKGA 2A42A 4A61A 5KPRA 1U6ZA 3MK6A 3HSCA 5BPLA 1TYQA 3VPZA 3H3NO 1S22A 2GUPA 2E2OA 3UE5A 3MN5A 5AQRA 1EQYA 3O4WA 5BRDA 4DQ8A 1DEJA 2E1YA 3GL1A 1GLJO 2AP1A 1NMDA 4H5NA 3U4LA 3MMVA 4DB3A 3WXLA 3FZLA 3QBWA 3GOIA 3ID8A 1NGJA 2QWMA 4KBOA 3O8MA 3ZETB 4EHUA 2YJEA 5F1XA 1U2VB 2QWRA 3GE1A 4BROA 4CZMA 3FZMA 4YDUC 4BVPA 1GLDG 3FE1A 4B1WB 1P8ZA 1HUXA 4BR2A 3CJCA 4JD2B 2FLOA 4L3QA 3VERA 5AQTA 2V7ZA 3HBTA 3VESA 3ATVA 3B8AX 4M7XA 4FL9A 1NGIA 5AQPA 3FZKA 1NGAA 3FZFA 4RWTA 2UYTA 4IXCA 4I6MB 1KAXA 4XEIA 1S3XA 2A40A 3VEYA 1KAZA 4JN4A 3SJHA 4BC5A 2W40A 3C7NA 3A5OC 5AQWA 4PKIA 3HZ6A 3HI0A 2P9SA 3DXKB 4GY2B 2P9PB 2E88A 2FSJA 3VF6A 2VWBA 1GLEG 3FLCO 3ZX3A 1K8KB 4IO8A 4FWQA 3ZEUB 4BGAA 2HF4A 3VEXA 1Q18A 4H0PA 3H6EA 4E1JA 1HJOA 4CZHA 5EY4A 3WEEA 3UKRB 5CE3A 1NGFA 3MN7A 1BA0A 4WQ4A 3VETA 5JMVA 3R9PA 1Y64A 3AAPA 2VYPA 3S41A 2E1ZA 1MA9B 1YXQA 1LOTB 1TUYA 1RGIA 3W0LA 4CZEA 3R8EA 2EWSA 3H46O 2P9NA 3H3OB 2OANA 3WQTA 5AQZA 2BTFA 3SMSA 4B1XB 3MCPA 4O5FA 3FR0A 3LDNA 2CGKA 3VF2A 1JCGA 4MLEA 3AY9A 1BUPA 2P9LB 2NLXA 2KHOA 4XH1A 2NZTA 4FWLA 5FPDA 3U8XA 1V4SA 1LCUA 3CHWA 4O8KA 4FPAA 2H3GX 5AQQA 2VCPA 1T6CA 4WYBA 2D0OA 3L0QA 2QM1A 4NO7A 1R59O 2E2PA 5AZJA 1HKGA 1QZ6A 3H1VX 3GG4A 2IVNA 4CI6A 4CBWA 5EVZA 5ADXH 3QB0A 3CJ7A 3DWLA 5FPMA 2I7NA 2QWLA 3QFPA 3VF4A 3TU5A 4CZFA 5E26A 2P9IA 3VEVA 3SLCA 2P9KA 4BR9A 4BRHA 2YHWA 1IJJA 1YVNA 2Q97A 4YDUA 5KQ8A 3A5NC 3L6QA 5EXWA 2A5XA 3EN9A 4BRQA 2QXLA 1KAYA 5B8HA 3CJ1A 3RSEA 4A2AA 2P9UA 3CERA 3D2EB 1ESVA 3CQXA 4QS7A 2AA4A 5AZIB 1NGCA 4BQZA 3J8AA 3WXIA 3H45C 2WUSA 2GELA 1RFQA 5AFUA 4RCHA 1D4XA 2GWKA 2E2QA 1SQKA 5JLHA 3BF1A 3M6GA 1NWKA 3ENHA 4BC2A 2CGLA 2FF6A 3KVGA 4H0YB 3LDOA 4FWNA 1NGBA 1BO5O 1QHAA 2QWPA 4CZJA 1NGGA 3TPQA 4LC9B 5KPZA 1X3NA 5AQNA 1ATNA 5AQHA 1BDGA 3LM2A 3LDLA 3CIPA 1BU6O 3C0BA 3ZETA 2W41A 3IMXA 3L4IA 3O5BA 3DXMB 3UKUB 5TKYA 1U2VA 2Q1NA 1JCFA 3G25A 4EIAA 2YHYA 3W3DA 3WT0A 2ZF5O 4B1YB 2ZWHA 4HWIA 4BRLA 4ISFA 5BR9A 3QDKA 5BRHA 4JD2A 2QWOA 1ZBSA 4BG9A 4BR7A 1GLCG 1HKCA 2HMPA 3AAQA 1X3MA 1ATRA 3IDHA 3MN9A 4EHTA 3QMLA 5AFUH 3A8YA 5F2RA 1SAZA 3JS6A 3LDPA 3O1BA 4Y0WA 4IWVA 5E84A 2QWQA 3FZHA 3WUHA 3EO3A 5AQFA 3ULEB 4BRMA 3EL2A 2Q2RA 4I6MA 2CH6A 5ELZA 4FWRA 2ASPA 4H5TA 4JAXA 5EOYA 2E20A 4BRCA 4BR4A 4J8FA 3D7EO 2ASOA 1H1VA 3I8BA 1NGEA 1MDUB 3DXKA 2P9PA 2FF3B 4BVOA 3R6MA 3GBTA 1XQSC 3VENA 1DKGD 1K8KA 4PKHA 1KXPA 2YHXA 3ZEUA 4FO0A 1NGDA 1J6ZA 4CBUA 1QQMA 1T44A 2D1KA 1QZ5A 2PAVA 3FGUA 3UKRA 1G99A 3M1FA 4JHDB 4CBXA 2GEMA 3P4IA 4PL7A 2HOEA 3CJ9A 4CZIA 4EAHD 3D2FB 3O80A 4MLHA 1C0GA 5AQVA 3A0IX 4DCHA 4BR0A 4H0XB 5BREA 4H5WA 5AQSA 3QBXA 1ATSA 2P9IB 2YI1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L5UA 5M1NA 1Q7YO 4XH5A 1YAGA 3V9XA 3CI5A 3G0ZA 1GLBG 1HX1A 4I9LA 2Y1IA 1S5JA 4FWKA 2QK9A 4W5TA 4NLBA 3VA0A 3HP6A 4O4GA 2FSNA 1ASVA 4DSLA 1OVQA 2GWJA 3V1RA 3SAHA 3I8DA 4EP4A 3MXJA 1VQ6N 4H0TB 4AM6A 1Q81O 4M45A 4A62A 4AM7A 4CF1A 4CEAA 2OPSA 2Q36A 2P51A 5AR0A 4M3XA 3AVHA 4H0OA 3MEEA 4EFHA 5CR4A 4C8MA 3TANA 4BGBA 1NLVA 3O1WA 4CJWA 4FW2A 3CFOA 4QOZB 1W9HA 4WQ5C 1QHTA 4H8KA 3ZCMA 3C7NB 1D5AA 4DU1A 1RT4A 3WXKA 4Q0BA 2NRZA 1C0MA 1CZAN 3LPUA 4NCAA 5J2NA 4CJ4A 4HVJA 4Z4IA 1VSLA 3O9QA 3AO3A 1XNQK 4FLUA 4E19A 3G6EN 1GLAG 1Z05A 2Z1HA 3QICA 4CJRA 2HHVA 1RDAA 3VQDA 3BEXA 5HRSA 3EKSA 1NOYA 5M1FA 3DRRA 3ENBA 2BH1A 1VSMA 4K42A 4GV6A 2BUPA 3I33A 4DTSA 3EEQA 3LZJA 2WBNA 3IG1A 4BRNA 1YI2N 1XHXA 3K9JA 3NH2A 1BOTO 1BA1A 2F4VK 4B3TK 5AQLA 1VSIA 4KFBA 3CCJN 2FXUA 1TK0A 1DGKN 2W6KA 4AHUA 4YOWA 2ITGA 2QI2A 3VOVA 4N56A 4AHCA 2QTDA 1BI4B 1S9GA 2X74A 4FSVA 5AQXA 4JRPA 1TKDA 3TAMA 3ULEA 4E89A 4DUZK 3DLEA 1YJWN 4PUOA 4AHSA 1TAUA 4JEPA 1T6DA 3M8SA 2EHGA 2DFHA 3SUPA 4U7BA 3OJUA 3LDQA 5H1SQ 1UWBA 5BN9A 5KQDA 4JI3K 4BRDA 4LF9K 4B9MA 1MWKA 1QSLA 2P9KB 5JLFA 1QQOA 2O4IA 4O44A 1ZBIA 5GADP 3DAWA 1U04A 4NYFA 2DPNA 2CH5A 3AGKA 3CQYA 2Q31A 5CZ2A 5C2FA 2HHWA 3CCVN 1OKJA 3VTIA 4TSXA 1ASUA 3O9TA 3PIOL 1BWFO 1SKRA 1VQPN 1LV5A 5I9EB 3QETA 2O8BA 1BG3A 4CD3A 1SKSA 2Q0UA 4CGJA 4DR7K 2ZJRL 4E7LA 4A61A 2NNWA 4E7KA 5BPLA 1TYQA 4FJLA 3VPZA 1L3UA 4JI8K 1EETA 3PLAA 2HVIA 1WLJA 3KK2A 1VSHA 3LWMA 1LWFA 1EQYA 4DV3K 4DQ8A 4KAZA 3GL1A 1GLJO 4H5NA 3J80O 4DB3A 1IBLK 4N47A 1VQ5N 3F2KA 3D45A 1OH5A 3ID8A 2KLAA 1T8EA 4EHUA 2YJEA 3O4QA 5F1XA 3CMEN 3TTCA 2DFFA 1U2VB 2QWRA 4MFBA 3OYCA 4E0DA 3P31A 3HVTA 4YDUC 1D9FA 1GLDG 3QEVA 3R1XA 4BR2A 4CHOA 3M8PA 2UUCK 3K5NA 3TAFA 4L3QA 1WSIA 4LD0A 3D0PA 3ATVA 2DFEA 2DTUA 3TR8A 3FZKA 4F4KA 1NGAA 1YT3A 4RWTA 1KTQA 2E6MA 1QVGM 1CLQA 4ILGB 3VEYA 4YOYA 3A5OC 5AQWA 3QEWA 1BCMA 4LSLA 3HI0A 3T19A 3DXKB 2AJQA 2P9PB 4B3RK 1K8KB 4FWQA 3LP2A 3HP9A 4F8RA 3EYZA 1Q18A 3SAGA 3H6EA 1EXQA 3PO5A 4KTQA 3JSMA 5CE3A 1NGFA 3T1HK 2YNHA 3C95A 4OPAA 3H08A 5JMVA 1Y64A 3AAPA 3T3FA 2VG7A 4EP5A 1EWQA 2VYPA 4OKJA 1MA9B 3WXMB 1U49A 5FRNA 4FVUA 3G4SN 4CVNE 2O8EA 3WQTA 5AQZA 4V19S 3DLKA 4O5FA 4DQRA 3VF2A 2P9LB 2VG5A 2NLXA 2JWKA 2KHOA 1J5EK 4YORA 4FWLA 1YJ9N 3CMAN 1IKWA 2VCPA 2QEXN 1JLQA 2D0OA 4BDPA 4ZTJA 4F3TA 4RW9A 2QM1A 5JS1A 4GKKK 4IO9L 4HCBA 1R59O 3OS0A 5AZJA 4LSNA 4CGHA 3KWGA 3TAPA 3O3FA 3GG4A 5CY4A 4AILC 4MDBA 2OCEA 4JS5A 4KHWA 1F21A 5ADXH 1R0AA 2NRRA 1QQCA 3J7YP 4AH9A 1DLOA 3VF4A 4KH4A 3TU5A 3V1QA 1LAVA 1OVYA 4BR9A 2YHWA 4IFEA 2Q97A 1N36K 4FLVA 3A5NC 3NF8A 5J2QA 4CEZA 3M5RA 4KKOA 3OW2M 4FJ5A 1T03A 1QE1A 1TGOA 3EN9A 4JKFA 1U48A 4NXMK 5B8HA 1WSEA 3CERA 3QIOA 3SQ4A 2YKNA 5AZIB 2A1RA 4FJ8A 3HK2A 5HROA 3TAQA 4CECA 3AVGA 2WUSA 3THYA 4FJNA 1RFQA 1D4XA 4FLXA 4DQSA 1WSFA 3ENHA 5FRMA 4BC2A 3WNFA 3AA5X 4CF8A 4IEEA 4DR1K 3LDOA 1S9EA 1QHAA 4B3OA 1Z25A 3TPQA 4JRQA 1X3NA 2ZM6K 3PSIA 4J2BA 4WFNL 2WFBA 1O13A 4DF4A 3C0BA 3ZSVA 3RVCA 3E9OA 3UKUB 3L4IA 3KIOA 3G25A 2HW3A 2W42A 4EIAA 3W3DA 4JKGA 3U6FA 3CCEN 3IS9A 2ZWHA 4BDYA 1VSJA 4DS5A 3ZT0A 3AVAA 4CK3A 4PA1A 3OYJA 3V9ZA 1ZBSA 1GLCG 3AAQA 4EHTA 1X3MA 1ATRA 5LMNK 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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