4FPAA

Crystal structure of recombinant human hexokinase type i mutant d413n glucose 6-phosphate
Total Genus 335
100200300400500600700800050100150200250300350
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
335
sequence length
899
structure length
899
Chain Sequence
DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVNGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRTE
100200300400500600700800800600400200
050100150200250300Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title DETERMINATION OF SITE AFFINITY CONSTANTS FOR PRODUCT INHIBITION of WILD-TYPE AND MUTANT FORMS OF RECOMBINANT HUMAN HEXOKINASE TYPE I
rcsb
molecule keywords Hexokinase-1
total genus 335
structure length 899
sequence length 899
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2012-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fpaA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fpaA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4fpaA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4fpaA03
1NGJA 2A5XA 3GBTA 4E1JA 4H5TA 3O8MA 3WXJA 4DCHA 5AQGA 1JCFA 1ZXOA 4HTLA 3MN9A 1XUPO 1ATRA 3FZKA 5I9EB 3M1FA 2YHWA 3FLCO 3KVGA 4FOIA 1CZAN 5AQYA 4H0VB 4BGAA 4CI6A 3GDQA 4BR5A 1SZ2A 1OKJA 5AQOA 3VEYA 3ENHA 5AFUA 1BA1A 3O1WA 3U8XA 4WQ5C 4BC2A 2D0OA 5AQJA 3MN7A 5AQRA 3C0BA 3A0IX 1Q18A 3BP8A 4FPAA 4M63C 1QZ5A 5AR0A 5EXWA 4C23A 1JCEA 4CZIA 5BRFA 2UYTA 4PL8A 2E1ZA 4WQ4C 4H0TB 3U4LA 2FF3B 3QFPA 1RDWX 4GNIA 1NGEA 5AZIB 3P4IA 4H5NA 1QHAA 4XH5A 4ISEA 3DXMB 3FZFA 2I7PA 1U2VA 2GWJA 5AQXA 3QDKA 3FFKB 1WUAA 4BRKA 2HOEA 5KPRA 3C7NA 3IMXA 3L4IA 3GL1A 3ZX3A 1T44A 3ZX2A 4EHTA 4CBXA 4FWOA 3IFRA 5TKYA 4A2AA 2J4RA 3HI0A 3LM2A 2KHOA 5ADXA 1QQMA 3HBTA 4AM6A 3WUHA 2BUPA 3KZBA 1NWKA 4O8KA 2CGKA 1H1VA 2A3ZA 3LDOA 2QWMA 3FR0A 2P9IB 1P8ZA 2V7ZA 3D2EB 2ZGZA 4B1XB 2ZWHA 4M7XA 4MLEA 5BPNA 3SLCA 3L6QA 4IO8A 4B1ZA 3O08A 5AQQA 3VF2A 1BU6O 1MWMA 4CZJA 4BRMA 2IIRA 4BRDA 2FLOA 5FPMA 5AZIA 2ASMA 3DXMA 4YDUA 1DGKN 4RTFD 3H46O 1XQSC 3MMVA 4QS7A 4DQ8A 4LC9B 4BVPA 4ISGA 4BQZA 2GUPA 2Q0RA 1QQOA 2Q2RA 4BR2A 2GELA 3IUCA 3CHWA 2BTFA 3CJBA 1ESVA 1YUWA 1NGDA 4JNEA 4CZHA 2Q97A 1NGBA 3U9DA 4FPBA 5LY3A 1NGAA 2PBDA 3CQYA 4CZEA 3I33A 3W3DA 2W40A 2P9SB 3QBXA 3VEOA 4PKGA 3VGMA 4BC5A 2IVOA 1GLEG 4FOEA 2P9IA 2P9KB 2YCHA 3D2EA 3MDQA 4BRIA 3KHYA 2ASPA 4BRQA 4F9OA 2F9TA 5FPNA 3UKRB 5BR9A 5BRDA 2E2NA 1C0GA 1YAGA 4BR4A 4BQLA 3HTVA 4BRFA 4IWVA 3D7EO 5AQUA 3AY9A 3CJ1A 4JD2A 3DAWA 3M6GA 1TUYA 4B1VA 3R9PA 3UE5A 2Q31A 4IJAA 2HF4A 1ZC6A 1V4SA 2CGJA 3O4WA 4CD3A 2P9LB 2A6AA 2QM1A 2F9WA 3LDLA 3CI5A 3HSCA 3VGLA 3AARA 4BG9A 4BREA 1T6DA 3AAPA 3R6MA 3ATVA 4K25A 3FGUA 4DHYA 3CJ9A 1EQYA 2V51B 3L0QA 4QS8A 2P9SA 4CBUA 5JMVA 5KPZA 3VF4A 5BREA 4CZKA 3CIPA 2FXUA 1E4GT 2ASOA 2P9KA 4BRAA 1YXQA 4BRPA 1HUXA 5F0XA 3QB0A 5AFUH 2V52B 2E2QA 5AQLA 3TPQA 1BO5O 1HLUA 2EWSA 3UKRA 3VEXA 1GLCG 3DXKA 5AQPA 1C0FA 3ZEUB 4BR9A 4BRGA 5B8HA 1TYQB 4PL7A 4CJ7A 1GLFO 3CJAA 1NGGA 5AQVA 5CE3A 3WEEB 2DPNA 4KBOA 2VYPA 1HKGA 1RGIA 1BWFO 3D2FB 3CERA 2QXLA 2QWPA 3MN6A 3W0LA 2YJEA 3EL2A 1U6ZA 4HWIA 4A2BA 4BRNA 1BOTO 3ENOA 2YJFA 2P9LA 4PKIA 3EKUA 3B8AX 1QQNA 4J8FA 5EY4A 3VEVA 4IZ9A 4EFHA 1ATNA 4CZGA 3WXKA 3VOVA 4A61A 1LCUA 1SQKA 3FZMA 5ADXH 2E2OA 1TUUA 3TU5A 4XH4A 2FSKA 4FWMA 3EN9A 4XH1A 4EHUA 1SAZA 5JLHA 3SMSA 2VCPA 4QS9A 3SJHA 3WXIA 4JD2B 5EOYA 2V7YA 3ZEUA 2ZF5O 1TYQA 1NBWA 3WEEA 3JXUA 4K43A 3VEZA 5F1XA 2NZTA 2HMPA 2D1KA 4BRHA 4BRCA 2YHYA 5BRHA 1NGIA 1J6ZA 3D2FA 4M7YA 2P9PB 4WYBA 1KAZA 3SMPA 3A5NC 4FL9A 1GLAG 3CETA 4WQ5A 1RFQA 3OHRA 3U9ZA 2GWKA 2YHXA 4AM7A 4Z94A 2GEMA 4FWLA 4MO5A 1DEJA 3A5OC 1BG3A 4DB3A 3MCPA 2CH6A 4BROA 1KXPA 2D4WA 5JICA 4WQ4A 4XEIA 4K42A 3G25A 1DKGD 3EO3A 3O5BA 3S41A 3SK3A 3DWLA 3WQTA 1E4FT 3DXKB 1ATSA 1NM1A 3VENA 4H0XB 5AQFA 4H0PA 3LDQA 4FWSA 1HKCA 3LDPA 3WT0A 3ID8A 2E88A 5AZJB 4FWPA 4BGBA 5BN8A 4A62A 3JS6A 5E84A 3CJCA 4BR7A 5KQ8A 4B9QA 1BA0A 4JAXA 3A5LC 4JN4A 4H5RA 3UKUB 3QFUA 4CZMA 4IJNA 4NO7A 4YDUC 1GLJO 2W41A 4K41A 4JHDB 1IJJA 5AQIA 3ULEB 2P9PA 5BPLA 5EX5A 1GLDG 2VWBA 3A8YA 4NB4A 2QWOA 1V4TA 2QW9A 2GTDA 3QMLA 4MO4A 3VEWA 1HJOA 4PKHA 4FWNA 3J8AA 1LOTB 2QWLA 3BF1A 4FO0A 5F2RA 2CH5A 3O1BA 3RSEB 3UB5A 3EKSA 1QZ6A 3ZX0A 4H5VA 2QWNA 1Y64A 4B1YB 1NLVA 4EIAA 1KAYA 1YVNA 5LJWA 2HF3A 3QBWA 2P9NB 2I7NA 3O6WA 2E8AA 1G99A 4FSVA 5AQKA 3H3NO 3BUZB 3FZLA 5AZJA 4GY2B 4H0OA 3R8EA 5AQZA 3ZETB 1X9JA 3AAQA 1D4XA 3VESA 1S22A 1XC3A 3WXLA 3VF6A 4CD1A 2Q0UA 5EVZA 1MWKA 4CZFA 5LJVA 2AP1A 5E26A 1NMDA 3HZ6A 3UKUA 4BC3A 3F9MA 2E20A 4JHDA 4BVOA 3MN5A 3ULEA 1T6CA 2Q36A 1KAXA 1S3XA 4EAHD 4FWRA 2WUSA 1WOQA 2IVPA 4BC4A 4L3QA 3RSEA 1BUPA 5KQDA 4B1UB 3FZHA 4FWKA 4FWQA 2Q1NA 5BPMA 5JLFA 5AQHA 1GLBG 3O80A 1X3MA 3CJ7A 2IVNA 2FF6A 2P9UB 3IDHA 2P9NA 2OANA 4BG8A 4I6MB 3WQUA 5AQTA 3BF3A 4IXCA 4H0YB 3ATUA 2D0PA 3ZETA 5AQMA 4MLHA 2NLXA 3CQXA 2PAVA 3H1QA 1K8KB 4CBWA 4BRLA 3M3ZA 1Z6RA 5AQNA 2A42A 5AQSA 1NGFA 2NRHA 1IG8A 4ISFA 1MDUB 5FPEA 3MK6A 4CZLA 3VERA 5AQWA 3A5MC 3EZWA 5BN9A 3H1VX 3VETA 3QICA 1NGHA 3H45C 5FPDA 4H03B 3I8BA 1HKBA 2FSJA 3VGKA 4RCHA 3GG4A 4O5FA 2FSNA 3H6EA 3HM8A 4RWTA 2E2PA 2A41A 4H5WA 1MA9B 2E1YA 1HPMA 1X3NA 1HX1A 3GE1A 1JCGA 3VPZA 3LM9A 5ELZA 4B1WB 2QWQA 2H3GX 2A40A 3LDNA 3BEXA 2P9UA 4I6MA 1U2VB 2QWRA 1ZBSA 2AA4A 4BR0A 2CGLA 4Y0WA 3FE1A 1BDGA 1NGCA 3GOIA 3H3OB 3C7NB 2YI1A 1R59O 1GLLO 1Z05A 5KPTA 3DJCA 2ITMA 2ZGYA 1K8KA 3LL3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XY5A 3GBTA 4E1JA 4JKHA 1JCFA 1HNVA 3LALA 1VSLA 3THVA 5I9EB 1ATRA 1D9DA 1SL1A 4KHUA 1CZ9A 4BGAA 1CZAN 4CJUA 4H0VB 4CI6A 3EEQA 4R79A 3KKRA 3U8XA 1SS6A 3L3VA 1T05A 1C0UA 5AQJA 3BP8A 3DRPA 5EXWA 1JCEA 2B4JA 4M3UA 4E1NA 5BRFA 2UYTA 2E1ZA 3SV3A 3QFPA 4DKWA 4GNIA 1LV5A 5AZIB 2DY4A 4H5NA 1QHAA 2UUCK 4W5RA 1J54A 5C2FA 3OYMA 3SUQA 2E5LK 1WUAA 1LWEA 1VSKA 3ZX2A 3O4NA 4EHTA 4CBXA 4YORA 3VQCA 3RMDA 3TANA 4A2AA 4O5BA 3OYKA 1QQMA 3HM9A 4AHCA 5C10A 3HBTA 3PV8A 2P51A 3NH1A 2BUPA 2G8HA 4YHHK 5CR4A 1NWKA 5E41A 3HOTA 4IFYA 5CZ2A 3SAGA 1P8ZA 3D2EB 3SLCA 3TAEA 1RILA 4LD0A 3O08A 4CZJA 4BRMA 2IIRA 2FBYA 1VQKN 3NH2A 3KJVA 4RTFD 3EE8A 1RDAA 3SQ4A 3MMVA 4QS7A 1BCOA 2X78A 4FK4A 1NG9A 2E6MA 3N4QA 4H8KA 2GUPA 4BR2A 1LW0A 4CECA 3RR7A 3CHWA 2BTFA 3I55N 1ESVA 2YV0X 4FJNA 3OYGA 4YOUA 1RT6A 4ID1A 1T8EA 3L3UA 1VSHA 2JGUA 5LY3A 4YOVA 2P9SB 4U67L 3VEOA 4DTOA 1KD1O 3VGMA 4BC5A 3VQPA 1GLEG 2A1SA 4OGCA 3O3HA 1NK0A 4DSLA 3HL8A 3MDQA 4PUOA 1GOAA 4BRIA 2O8DA 3SQ0A 1M90O 1OVYA 1NKCA 4YOYA 4XIUA 2F9TA 3QESA 1ZBUA 3DOLA 5BRDA 3ZSOA 4M3TA 3D0PA 2KFZA 1IKWA 3SQ2A 3HTVA 1KCFA 4AHUA 4Z4GA 2G8IA 1NJXA 2JLEA 1NU0A 5CY4A 1J5OA 4RW8A 4JV5K 2NRVA 2HSTA 4N5SA 1HJRA 3M6GA 3QERA 1TUYA 4B1VA 3IRXA 2KFNA 4AHSA 2CGJA 3O4WA 2A6AA 1WBBA 2QM1A 3C94A 4I7FA 3VGLA 1NJZA 4BG9A 2HVHA 4OPHA 4BREA 1T6DA 3ATVA 3FGUA 3OYBA 2KLAA 4LFAK 1EQYA 2F96A 3V1QA 4DU3A 1NK7A 4WFAL 3KK3A 1BI4B 3E9OA 5BREA 4C8LA 4EZ6A 3K5NA 3VQBA 2ASOA 1HNXK 1RT5A 3KD5E 4F2RA 3ALYA 4DQRA 2V52B 1YT3A 3V4IA 1Q7YO 5AQLA 3DXKA 3ZEUB 4JI0K 1TYQB 4CGGA 4CJ7A 3WEEB 1WNSA 4FLTA 3L2UA 3CQ8A 1BWFO 2JWLA 4JS4A 4G1QA 3CERA 4BDPA 3ASMA 4DSKA 2YJEA 4HWIA 4A2BA 4BRNA 3ENOA 2HHVA 3AGKA 3CC2N 4BE1A 1RNHA 4PKIA 3VTIA 3EKUA 1ZBLA 2QKBA 1KVCA 4J8FA 2WONA 3SQ1A 5EY4A 3VEVA 2IC3A 4WFBL 3RVCA 4KB1A 3M8QA 4A61A 1LCUA 3MCAB 2XY8A 3FZMA 3TU5A 5FLXO 4XH4A 4CJRA 4LH5A 5M1QA 3EN9A 5DMRA 4EHUA 4W5TA 3PIOL 4JKEA 2OZMA 5CZ1A 1BGXT 1SL2A 4DTSA 5EOYA 3G6EN 4YOTA 1TK8A 1NBWA 4LF8K 3JXUA 4DS4A 3EYZA 2NZTA 2D1KA 1NOYA 4BRHA 1NGIA 2DFFA 4M7YA 4KI4A 1KAZA 4F3OA 4I9QA 3A5NC 3PX6A 4FJIA 3EZ5A 4M42A 3NVMA 3CETA 1D9FA 4WQ5A 3U9ZA 4AM7A 4K8ZA 1VQ8N 3MAQA 3T7ZA 1DEJA 4FLWA 2B5JA 1WSIA 4BROA 2D4WA 2OPPA 4WQ4A 3QEVA 5HL7L 4QCLA 3NBPA 3OYEA 4A57A 4ILJA 3WNGA 3ZSRA 3HVRA 4DF8A 4N76A 3SK3A 3DWLA 3LDSA 1UAXA 4CEZA 4FLXA 4DMNA 2E88A 4W5NA 3TSUA 4J2DA 1HQUA 1TKDA 2O8CA 2E4LA 4A62A 4FLVA 1JLFA 4X65K 5HOOA 3K57A 3OYDA 3AVKA 1JLQA 2IS3A 5AJ3K 4CZMA 1TL3A 3V9XA 3L2VA 4K41A 3CCMN 1IJJA 1RT4A 5JVGL 2ZM6K 3Q7CA 5EX5A 2VWBA 3CYMA 4NB4A 1V4TA 3SCXA 3OS1A 3K58A 4Z4FA 3F73A 4GKJK 4KHQA 4FWNA 5LMNK 2ITGA 2HNYA 4B3OA 4BACA 1QZ6A 1TKZA 3ID6A 4B1YB 4EIAA 1KAYA 1HYZA 1MU2A 5CYMA 3T1YK 2P9NB 3EY1A 4CIGA 3DYAA 1J53A 1B9DA 3BUZB 1RBVA 4GY2B 1I94K 4H0OA 5AQZA 4H4OA 1C0MA 1Z25A 4CFAA 2VG7A 3WXLA 1W7AA 4C8KA 1VSDA 3O9TA 1VQ5N 1RT7A 2W6LA 1MWKA 2UUAK 5IT9O 5HRSA 4CZFA 5E26A 5HRNA 4AH9A 3F9MA 4JHDA 4B9MA 3TTFA 1NJWA 2G8UA 3VQ7A 3ULEA 3K5OA 2VG5A 3QIOA 1S3XA 4FWRA 1EX4A 1TV6A 3OBWA 3R1XA 2O8BB 4DR3K 2WUSA 2IVPA 1XNQK 3RSEA 1BUPA 4F8RA 5KQDA 4ILGB 4B1UB 1TK5A 1CXQA 3FZHA 3K5MA 3O80A 3CJ7A 4FLUA 2P9UB 3O9QA 4AF1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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