4G9ZA

Lassa nucleoprotein with dsrna reveals novel mechanism for immune suppression
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
213
structure length
205
Chain Sequence
AMDHVEFGLTYSQLMTLKDAMLQLDPNAKTWMDIEGRPEDPVEIALYQPSSGCYIHFFREPTDLKQFKQDAKYSHGIDVTDLFATQPGLTSAVIDALPRNMVITCQGSDDIRKLLESQGRKDIKLIDIALSKTDSRKYENAVWDQYKDLCHMHTGVVVEEITPHCALMDCIMFDAAVSGGLNTSVLRAVLPRDMVFRTSTPRVVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structures of Arenaviral Nucleoproteins with Triphosphate dsRNA Reveal a Unique Mechanism of Immune Suppression.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RNA (5'-R(P*GP*CP*CP*C)-3')
molecule tags Viral protein/rna
source organism Lassa virus
total genus 55
structure length 205
sequence length 213
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.410 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4g9zA01
4FVUA 3MWPA 4GV6A 3MWTA 3Q7BA 4G9ZA 3R3LA 3Q7CA 4GV3A 4GVEA 3MX2A 3MX5A 4GV9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KKOA 4H5RA 1NBWA 4FM1A 2O8DB 4FWLA 4E0DA 5FLXO 4KH5A 5ADXA 4N5SA 3H1QA 3OYIA 1Z26A 4OX9K 3WNHA 1A5WA 1RBTA 4CJ5A 3LDPA 1NGIA 3VQAA 2Q97A 5AFUA 2NRVA 2F4VK 2HHSA 4IDHA 4I2QA 1TK8A 3HYFA 5HROA 2VG7A 1VSFA 4B9NA 1I39A 1YIJN 3NGIA 4IOCL 4O0JA 4FXDA 4DQPA 2QWLA 3AV9A 4FJGA 4RG8A 2YHBA 4IBNA 2HHWA 1HX1A 4W5NA 2IVPA 3EY1A 1RDWX 5J2MA 4DSFA 1EWRA 4L3QA 4F4KA 4B9TA 4CGHA 5B8HA 2DFEA 3ZSZA 3CETA 3KKRA 4CZFA 4C8OA 1RBVA 2Y1JA 1MU2A 3I56N 1LW2A 5GIOA 1WBDA 1RT1A 2D0PA 3I55N 1S6QA 5HOOA 2Q3SA 3IAYA 1C1CA 3LWMA 3KZBA 5C24A 5LL6Z 2IOCA 3LP1A 2P5GA 2RHKA 1NKBA 4DFJA 3KK1A 1NU0A 4BE0A 3C7NB 1WSFA 4GMJB 3VERA 2F8TA 2JWKA 4RW9A 5KRTA 2NRTA 4M42A 2FSNA 1S1UA 3G0ZA 1MDUB 5HRSA 4JKFA 4HUFA 3WNGA 3FR0A 3ZT4A 1XNRK 3AVAA 2ITMA 3CJAA 4JYAK 4FWPA 4DTUA 3T1YK 4JK8A 4CD1A 5JLHA 3L2VA 4FJNA 3K59A 2WC9A 4ELTA 4OPKA 1Q18A 2P51A 3CFOA 3C95A 3SMSA 4MQ3A 4KHNA 3PV8A 1HRHA 2QK9A 3PLAA 2PYLA 4CEDA 4CBXA 2KHOA 1B9FA 1RT6A 4KH6A 3SYZA 4FYDA 5KQ8A 1SUQA 4IXCA 1NGFA 1VQON 2QWNA 1ZBFA 3R3LA 4IJNA 2X74A 3U6FA 4CGFA 2OA8A 3VEZA 4DLEA 1SQKA 4LH5A 4N47A 4DFMA 3VQ9A 4BRHA 4CVNE 4FVMA 4BROA 1BI4B 4IEEA 3EE9A 2OPSA 4JKBA 3NVKA 3K58A 1RT5A 4RCHA 5F2RA 4DR6K 3DLGA 1CXUA 1RTJA 3ATUA 3LM2A 3Q7CA 1KAXA 1MWMA 1ATRA 3WXIA 1RDAA 3CJBA 3MCAB 4CESA 2KZZA 3UIQA 4DQQA 3SUQA 1RTDA 1S22A 2CGKA 5I3UA 3R6MA 1S6PA 2A5XA 3KTQA 1D5AA 4MDBA 4B9QA 3HVRA 2OCEA 1KVAA 2O8CB 2G8VA 1HQEA 3LPUA 3PIPL 4ZHRA 5AQSA 4PUOA 4CBWA 3HPHA 5LMUK 1EP4A 3TAQA 3LALA 2G8IA 4DCHA 3SAFA 3OYGA 4CZLA 3ULDA 5AQIA 1BOTO 3LP2A 1N6QA 3UKUA 3VA0A 1UAXA 1HNZK 3VQPA 4LF5K 3LZIA 4EP4A 3BEXA 1IBLK 3KVGA 1JXBA 5GINA 3WXJA 1U2VA 1FXXA 5GIPA 5IWAK 4AHTA 5HL7L 1TVRA 2E88A 2G8HA 3SQ2A 4XH4A 4BWMA 5HRNA 3AVHA 3BGRA 4DSLA 1X3MA 3C6HA 4Z4IA 3FLCO 2QWQA 3IMXA 1OH7A 3VA3A 2O4IA 2P9SA 1GLBG 3NF6A 4A57A 1EWQA 4ZTFA 4CD3A 4YOWA 3CC2N 1JLEA 4RTFD 3AO1A 3SQ4A 1ZBHA 4Y1CA 4CJEA 4CJSA 2Q2RA 1NNEA 3TWHA 4YORA 4IFEA 4CECA 1SKSA 4C8MA 3U3YA 2RF2A 4M3RA 3ZT0A 4MDAA 4H5WA 1KRPA 4BC4A 4CFDA 1VQ9N 1N33K 3HL8A 4YDUC 2LSNA 2Z1IA 4CZGA 1SKRA 1ESVA 1NLVA 1K9MO 1J9AA 1EX4A 1SS6A 4CIGA 3SAGA 3UE5A 3VQQA 2XY5A 3I0SA 4GVMA 3AA5X 4M3UA 1NMDA 2R7YA 2HNDA 1TKDA 4J2BA 1SAZA 4BGAA 2P9IA 3P39A 3HBTA 5KTQA 4I9LA 3CJCA 3J7AP 5TKYA 5BRFA 2UXCK 3QESA 3TAEA 4FJ9A 4JKEA 3U8XA 1BCMA 3K0SA 3MAQA 2WOMA 1TAUA 4JI7K 4XH1A 1NOYA 3HZ6A 4JKGA 4Z4EA 3CMAN 3D6RA 3TTCA 3RSEA 2G8WA 3ULEA 1RT2A 4H0XB 1C1BA 1TGOA 1NOZA 4CJLA 4R5PA 5ELZA 3IG1A 4AM7A 3R1XA 2BDPA 4BRPA 4H0YB 2NZTA 3E01A 1YJWN 3DLEA 1LV5A 2JWLA 3WNFA 3THWA 4YOXA 3RR8A 2IAJA 3DJCA 1EKEA 1Y64A 2WUSA 4A2BA 3VESA 4B3TK 2PY5A 2HHQA 4DTMA 4HVJA 5J2NA 3NE6A 1RILA 4K8XA 3FZFA 4M7YA 4JI3K 1YXQA 4OKKA 5JVGL 1IKXA 3QB0A 1W97L 1FKOA 1WSEA 1WAJA 4KH4A 3G10A 1UA1A 2YNFA 1C1AA 2NLXA 4IG3A 4HUGA 1S9EA 3VF4A 4JI6K 5KQDA 1GLDG 4DU4A 2IVNA 4PY5A 1HYZA 3Q7BA 3TAMA 3CCJN 5JS1A 1UA0A 3AVLA 1S1TA 2DFHA 3WQTA 3NHGA 1GLEG 3UKUB 3AARA 2ZQBA 2E1YA 1YTUA 4WQ5C 4YDUA 2Z1JA 2FF3B 4KTZA 1GLJO 2I7PA 1W9HA 3DWLA 4FLVA 1U2VB 4WQ4C 4CEEA 2KQ2A 4I7FA 3KLGA 1NG9A 2W6LA 3ITHA 4BRKA 1NK9A 3OYDA 2VQEK 1SV5A 3U9DA 5AR0A 3ZX2A 2D1KA 4DTNA 3VQ6A 4FW1A 3LDOA 3AVJA 3BP8A 3WXLA 4KB0A 3DRSA 2E2NA 4EAHD 1WOQA 4BC5A 4ID1A 4CGJA 3CF5L 3T3FA 4DF8A 4Z4CA 1IO2A 4CHZA 2B4JA 2E8AA 4V19S 3M8RA 4LF7K 1VQ8N 1FKPA 1O13A 2YNIA 3F2KA 2O8DA 1QVGM 4AILC 1IV0A 2I5JA 2Q31A 4DV2K 4JRQA 2B6AA 4DTJA 1OVYA 3NF8A 2ZJRL 1JJ2M 4ISFA 2P5OA 1JLBA 2CGJA 2Q36A 3DRRA 3HRGA 4AM6A 3NF9A 5HBMA 3IS9A 1GOBA 3QBXA 2FC0A 1NWKA 5C42A 4DSIA 3A5MC 3SJJA 5CZ1A 3GL1A 4NYNA 3THYB 2VWBA 3ZSOA 3ZCMA 1UOCA 3ZEUA 5JLFA 3UB5A 1XMOK 1U4BA 3SUNA 4O0IA 4GW6A 4DR3K 4RW4A 4DQ8A 1T8EA 4BRGA 4R79A 3MK6A 1DT9A 1T6DA 2Z1HA 5AQTA 2PFUA 4U7BA 2P9IB 1LAWA 2YNGA 3M1FA 4FLWA 4FM2A 1MA9B 1YVUA 3NH0A 5C25A 2DFFA 3VGMA 3B8AX 3OYMA 1TKTA 3OYKA 2EHGA 3AGKA 3SV4A 2KW4A 2D0OA 2WONA 3WUHA 2HMPA 2VG5A 4WE1A 2HSTA 4OKEA 3ZSXA 3RVCA 3ID8A 1KD1O 2F9TA 1VQ7N 4DMNA 1KQSM 3D7EO 4E1JA 3C7NA 1QZ6A 4WQ5A 1IJJA 3J7ZO 3CJ9A 3RSEB 3ULEB 1N36K 1M90O 3VF6A 3M3ZA 3C94A 4WQ4A 2UXBK 1WUAA 2X78A 4AHCA 4CGIA 1W0HA 2NNWA 5EY4A 3DYAA 2ETJA 3V6DA 4K8ZA 3PSFA 4NLCA 4WYBA 1C0GA 3MXIA 3S9HA 1QSLA 4J2AA 4GKJK 4DQSA 4XEIA 5I42A 3PO4A 4KHQA 2IS3A 4HTLA 4PKIA 3SPYA 3NH2A 1M1KO 4K42A 2Y1IA 2UUBK 3BY5A 4CF2A 5AZJA 1HLUA 5EX5A 4CHNA 4B9LA 3MWPA 5CR4A 3AO5A 2ITGA 2W41A 4XH5A 4M3ZA 2FLOA 3N4PA 4IOXA 1L3UA 1HR0K 4W5OA 4QAGA 2GWJA 2AP1A 1JCGA 4NCGA 2CH6A 5CE3A 3A8YA 2VQFK 1S1WA 2V7ZA 1MWKA 1WLJA 4BE1A 3CJ7A 4Z4HA 5E84A 3CC4N 3WXMB 3SNNA 1Q7YO 3HP6A 4DV4K 2OANA 2P9PB 4RW8A 4I6MB 2ZJQL 4OLAA 3L8BA 3WNEA 3NF7A 2YHWA 4B1UB 1RCHA 3PX4A 2OZSA 3T1HK 4DFKA 5CHIA 1OKJA 2QXLA 3P38A 1KXPA 4PL7A 4BE2A 2HVIA 5BPNA 1RDUA 1V4SA 1JLAA 1G99A 4H5TA 3KWIA 1YITN 1XC3A 3KJVA 5DK5A 3OTOK 1Q81O 5KRSA 3S3NA 3V9XA 1OVQA 2E2OA 2QA4N 1Q9XA 5FPNA 5LJWA 3QICA 4ELVA 3LM9A 3BDPA 3WXKA 5CZ2A 5FPDA 4YOTA 3THVA 2QTDA 1N5YA 4FO0A 1HJRA 1NJYA 4I9QA 1R59O 3A5NC 3C6TA 4CFAA 3M6GA 1XHXA 3P5JA 3MX5A 4IO8A 4BR4A 3ZETA 4M3TA 3O1WA 4AQYK 5AQWA 1KFSA 3WT0A 4CFCA 4CJQA 3OJSA 1RGIA 3DRPA 1E3MA 3HO1A 4DU1A 5EOYA 5CYMA 4IFVA 2F8SA 4GKKK 4FWNA 3ZEUB 4KI6A 4B1WB 4DR2K 1QSSA 4LFAK 5FPMA 2DPNA 4WFNL 1KAYA 1BUPA 2HHTA 1QSYA 1VQ4N 1FJGK 1NGAA 3LDSA 1L3VA 1RBUA 4W5RA 4LC9B 4A2AA 3NAEA 4DFPA 1XWLA 1V4TA 4JI4K 3VQCA 1VQMN 5KI6A 4I2PA 3J8AA 1S5JA 4MFBA 4KV8A 3TSQA 5LY3A 3NCIA 1EQYA 5J2QA 3M5RA 2IGIA 4YY3K 4UQGA 5FRNA 3JSMA 1T03A 3MXMA 3EN9A 3PX0A 1ZBUA 5HRPA 3CFRA 4NCBA 1LWCA 2GBZA 3BZKA 3DOKA 4NO7A 4XIUA 2HOEA 2I7NA 5AQRA 4QOZB 3OYHA 3OYNA 4HHTA 5AQJA 4IO9L 4M7XA 2X6SA 3O1BA 4FWSA 1KVCA 3CJ1A 4BDYA 4FWOA 1NMNA 4LF4K 2A6AA 1NK0A 3K9JA 4F3OA 3I0RA 3L6QA 4CF9A 2QWRA 1YJ9N 3KKSA 1VSMA 4H0VB 1CZBA 5I9EB 4CHYA 1KLNA 3RMBA 3TSPA 2NRXA 2Q1NA 3V1QA 1RBSA 3ZT2A 2HBJA 3HM9A 4DV7K 3LPTA 3KIOA 4C23A 4J8FA 1CLQA 1QHAA 5AZJB 4HCBA 1TL3A 4QCLA 2UYTA 1VQKN 4FVUA 2ZE2A 3DXMB 4LSNA 1BCOA 3CCSN 3IUCA 4PHTX 1NGBA 4M41A 3CI5A 3FZHA 3EEQA 3VQDA 3V4IA 4N76A 3AY9A 5AQVA 3CD6N 3O80A 3RMCA 4H0PA 4WF9L 4PQUA 2D0CA 4B1VA 1BL3A 3U4LA 3G4SN 4K41A 1DLOA 4FK0A 3GDQA 3MWTA 3HSCA 5AJ3K 3QMLA 4K43A 2F96A 3MDQA 1LOTB 3A5LC 5F1XA 4CIFA 2RN2A 4FJIA 3MEGA 3A5OC 3CQ8A 4CEAA 3KD5E 1BU6O 1NK4A 1JL2A 3IFRA 4CJFA 4E19A 3ZT3A 3SMPA 4C8LA 5KGWA 1U49A 5LMNK 4Q0BA 4FZZA 3CCLN 4CHQA 3RMAA 1VQLN 4CZEA 2PBDA 3V9UA 4CJRA 4ZTJA 5CYQA 3C65A 4RWTA 4CJ4A 5J1EA 5FRMA 3J7YP 2HNZA 1B92A 1LCUA 3UKRA 4CHOA 3QEVA 3AAQA 4A5AA 5AQQA 3H3NO 3O9RA 4AF1A 4DUYK 3ZETB 2QKKA 3VEVA 1XQSC 2XY7A 3L4IA 4FM0A 4C1NK 4K0KK 1DEJA 2YJEA 3ZX3A 1WBBA 1RT3A 4FWKA 2HHXA 4FCYA 3V9SA 5C2FA 5EVZA 4BR5A 5BPLA 3O4WA 3RMDA 3C0BA 3OVNA 1ZBLA 1HYVA 1VSEA 5HRRA 2KFNA 5T7BA 1VRUA 2P9LB 3O9QA 4OPJA 4A62A 3K2PA 2PZSA 4PWDA 3AGRA 2PYJA 4CEZA 4FLZA 3NGYA 1VQPN 2F7TA 1BA0A 3CG7A 3O5BA 3ZSQA 3K5MA 4M3XA 1IBKK 4BY9C 4JV5K 4O8KA 2NRHA 1I3AA 4JNEA 1QQOA 4DB3A 2ZWHA 4JS5A 3AVKA 4E7HA 3KHYA 3ZSVA 3FZLA 3QERA 1CZAN 2OPRA 4JAXA 2E2QA 4YHHK 5C15A 4FZXC 3D45A 3L4QA 1T3VA 3THYA 3LDNA 1NJWA 2AJQA 1YVNA 2VGNA 2O8BB 1IG8A 1ZC6A 2CGLA 3C6AA 3B6PA 1VAZA 1Z05A 4IFYA 4FLXA 3PY8A 1QHTA 3SQ0A 4KHPK 3J81O 3VQBA 1J5OA 3I33A 1LWFA 2E2PA 1X9JA 2ZJPL 1XMQK 1NKEA 4DV5K 1E4GT 1S3XA 1RT4A 3HTVA 2GUPA 4K25A 2J4RA 1KLMA 4JK9A 3OYAA 3TTDA 3O4QA 4FJ8A 3GOIA 4BRCA 2ZM6K 4MO4A 3CERA 5AQKA 3O6WA 4KTWA 1J5EK 1Z25A 4B8AB 1ZYQA 3ID6A 2E6LA 2ZD1A 4FLYA 4CK3A 4FOIA 1BWFO 1EXQA 5DMRA 3L2QA 3HPGA 5GAGP 4CI6A 3OY9A 3VEYA 2V51B 3ENHA 1GOCA 4LFBK 4IZ9A 3TTFA 1T7PA 3RR7A 1W7AA 1SL0A 3QETA 1K8KA 1YTAA 1RDBA 3AVIA 1U47A 5MLCQ 2FBXA 3O9UA 4M3WA 3NBPA 4G9ZA 1ZXOA 4Z94A 5C0YA 4CK2A 4YFUA 3F5TA 2A1RA 4CZKA 4E7JA 4DV0K 2O8FA 1QTMA 4CF8A 3CCQN 2BTFA 2A1SA 3J80O 1S1VA 3QFPA 1NK7A 1ZBSA 1N8RO 2RPIA 4EFHA 2VWJA 2YI1A 3R8EA 3PIOL 4YOUA 1WSHA 1WAFA 1RDDA 3E9LA 1T44A 2BANA 3UKRB 4DTRA 3SAHA 4MLEA 4OGEA 4OVLA 3QEPA 4B08A 1HKCA 2NRZA 4LH4A 1TAQA 3SBGA 3O9SA 1CXQA 1C6VA 1NKCA 4E1NA 3DI6A 1IG9A 5AQFA 1IBMK 1WN7A 3LDQA 5M1OA 3V1RA 3KK2A 2P9PA 4I6MA 1NJIO 4U67L 2HF4A 3S3MA 4MO5A 3O08A 5C10A 3JXUA 4Z4GA 3WEEA 4H0OA 4FJMA 4LF9K 4BRFA 3VGKA 2QWPA 5TKWA 5J2PA 3ZLJA 4FJHA 5FROA 3D2EA 2P9KA 4DKWA 4KHUA 3V9ZA 2Q0RA 3KD1E 4DR1K 1TKZA 3MEEA 4O55A 1NGJA 1NK5A 3AAPA 1G15A 3CYMA 4YNQA 3D2FB 2HBKA 3ENOA 1TKXA 5M1KA 4DG1A 2UUCK 3E9PA 2OPPA 2GELA 3CM5A 3SUPA 1ITGA 2HBLA 4F8RA 2ASMA 5LJVA 3ZSRA 3CCRN 1W2BM 2G8FA 2A41A 3P83D 3CFPA 2FBVA 2P9NB 2ZGYA 1K73O 1VHXA 2CH5A 1Q86O 3VTIA 4KPYA 3NDKA 3OYCA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4FVU A;  3MWP A;  4GV6 A;  3MWT A;  3Q7B A;  4G9Z A;  3R3L A;  3Q7C A;  4GV3 A;  4GVE A;  3MX2 A;  3MX5 A;  4GV9 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4KKO A;  4H5R A;  1NBW A;  4FM1 A;  2O8D B;  4FWL A;  4E0D A;  5FLX O;  4KH5 A;  5ADX A;  4N5S A;  3H1Q A;  3OYI A;  1Z26 A;  4OX9 K;  3WNH A;  1A5W A;  1RBT A;  4CJ5 A;  3LDP A;  1NGI A;  3VQA A;  2Q97 A;  5AFU A;  2NRV A;  2F4V K;  2HHS A;  4IDH A;  4I2Q A;  1TK8 A;  3HYF A;  5HRO A;  2VG7 A;  1VSF A;  4B9N A;  1I39 A;  1YIJ N;  3NGI A;  4IOC L;  4O0J A;  4FXD A;  4DQP A;  2QWL A;  3AV9 A;  4FJG A;  4RG8 A;  2YHB A;  4IBN A;  2HHW A;  1HX1 A;  4W5N A;  2IVP A;  3EY1 A;  1RDW X;  5J2M A;  4DSF A;  1EWR A;  4L3Q A;  4F4K A;  4B9T A;  4CGH A;  5B8H A;  2DFE A;  3ZSZ A;  3CET A;  3KKR A;  4CZF A;  4C8O A;  1RBV A;  2Y1J A;  1MU2 A;  3I56 N;  1LW2 A;  5GIO A;  1WBD A;  1RT1 A;  2D0P A;  3I55 N;  1S6Q A;  5HOO A;  2Q3S A;  3IAY A;  1C1C A;  3LWM A;  3KZB A;  5C24 A;  5LL6 Z;  2IOC A;  3LP1 A;  2P5G A;  2RHK A;  1NKB A;  4DFJ A;  3KK1 A;  1NU0 A;  4BE0 A;  3C7N B;  1WSF A;  4GMJ B;  3VER A;  2F8T A;  2JWK A;  4RW9 A;  5KRT A;  2NRT A;  4M42 A;  2FSN A;  1S1U A;  3G0Z A;  1MDU B;  5HRS A;  4JKF A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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