4GW6 | Genus

Total Genus 49

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	49
sequence length	155
structure length	144
Chain Sequence	DCSPGIWQLDCTHLEGKVILVAVHVASGYIEAEVIPAETGQETAYFLLKLAGRWPVKTVHTDNGSNFTSTTVKAACWWAGIKQEFGIPESMNKELKKIIGQVRDQAEHLKTAVQMAVFIHNKKRKGGGYSAGERIVDIIATDIQ

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__4851635654996125__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__4851635654996125__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/4GW6/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__4851635654996125__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"4851635654996125","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/4GW6/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__4851635654996125__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

Viewer cachePut cache://localLOAD_/file/5d00314880cc945713e3fb2a/pdb.gz

Viewer cachePut https://genus.fuw.edu.pl/file/5d00314880cc945713e3fb2a/pdb.gz

FileManager.getAtomSetCollectionFromFile(/file/5d00314880cc945713e3fb2a/pdb.gz)

loadScript /static/js/j2s/core/corezip.z.js

The Resolver thinks Pdb

loadScript /static/js/j2s/core/corebio.z.js

Time for openFile(/file/5d00314880cc945713e3fb2a/pdb.gz): 878 ms

reading 144 atoms

ModelSet: haveSymmetry:false haveUnitcells:false haveFractionalCoord:false

1 model in this collection. Use getProperty "modelInfo" or getProperty "auxiliaryInfo" to inspect them.

Default Van der Waals type for model set to Jmol

144 atoms created

ModelSet: autobonding; use autobond=false to not generate bonds automatically

Time for creating model: 18 ms

Adding embedded #jmolscript: select ({0:143});backbone only;select *;

platformSpeed = 8

cartoonsFancy = true

sheetSmoothing = 1.0

traceAlpha = true

loadScript /static/js/j2s/core/corescriptcmd.z.js

specularPower = 9

ambientPercent = 20

antialiasDisplay = true

Script completed

Jmol script terminated

loadScript /static/js/j2s/J/g3d/HermiteRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/renderbio/BioMeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/render/MeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/shape/Mesh.js

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism	Human immunodeficiency virus type 1 (new york-5 isolate)
publication title	The A128T Resistance Mutation Reveals Aberrant Protein Multimerization as the Primary Mechanism of Action of Allosteric HIV-1 Integrase Inhibitors. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Gag-Pol polyprotein
total genus	49
structure length	144
sequence length	155
ec nomenclature	ec 2.7.7.49: RNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date	2012-08-31

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00665	rve	Integrase core domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.420.10	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H	4gw6A00

5HRRA 4J2AA 1RTHA 3WNGA 3NBPA 2HMIA 4ZTJA 1L3UA 3C94A 2XO7A 3TAFA 4CFBA 4DQQA 1BQNA 1FXXA 4B9VA 2VG5A 4DFMA 3E01A 3L2UA 4NCGA 4FJ8A 4N76A 4N5SA 1RT5A 1W0HA 4CEBA 1L3TA 4B9LA 3PV8A 3KLFA 4OKJA 4OLBA 4GVMA 1RBTA 3SQ0A 4CJQA 4AILC 3DRRA 1NOYA 4Z4GA 4H4OA 1KLNA 3LDSA 5E41A 3C6UA 3CFOA 1KTQA 3L2WA 4AHUA 1MU2A 4CFDA 3V81A 1ZBHA 3KK2A 4B9SA 3CYMA 4C8MA 3WNHA 3HP6A 3NAEA 1D8YA 1CZBA 3IS9A 5HRNA 4PQUA 3AVCA 4CEZA 3HT3A 1GOBA 3AO5A 2RF2A 4AHRA 4CFAA 3RMCA 4E19A 2B4JA 2R7YA 4BDZA 1SKRA 2YKNA 3O4QA 1NJWA 2B6AA 1GOCA 1T7PA 4I2QA 2P1JA 4DS4A 4DTPA 1U49A 4KHQA 3HVRA 4FM0A 3KK3A 4CJTA 3OJUA 3K58A 2QXFA 2B5JA 3D0PA 1NK0A 3SPYA 4DSJA 4FZYA 4J2DA 3UIQA 1XHZA 3K5LA 2GV9A 1KLMA 3C6TA 4CIEA 3V9XA 1SKWA 1UA1A 1D9DA 3HPHA 3VQDA 1HMVA 1TAQA 4IDKA 2FBTA 4B9NA 2D5RA 4RW6A 3OS1A 3S3OA 1S1WA 2X6NA 2VWJA 3DLKA 4RG8A 1C0MA 4H4MA 3OYEA 3V4IA 3ZCMA 3VQAA 2Q3SA 4DTMA 3U3YA 1X9WA 4ELTA 4CCHA 4CHQA 1VSHA 4E1MA 1BGXT 3OYLA 4Q0BA 4IFVA 4KTQA 4E3SA 3VQ5A 3B6PA 3AVMA 4LSNA 1NKBA 1CXQA 3L3UA 4CJEA 4TSXA 3QERA 3DI6A 2KZMA 4Y1CA 3OYNA 3NH2A 1IKVA 3ASMA 2P51A 5HP1A 2X78A 3S9HA 2YHAA 1WSHA 3AVIA 1TK5A 1JXBA 4LD0A 3VQ6A 4B08A 5J2MA 3K59A 1C0UA 1B9FA 4F2RA 3P83D 1HRHA 3QLHA 3DLHA 3K57A 4KI4A 4CERA 2QKKA 1EXQA 1VRUA 3HM9A 1JLAA 4HCCA 2G8HA 1JKHA 4J2BA 1QQCA 1NK6A 4ELUA 1YT3A 3OYIA 4FXDA 4OKEA 4FZZA 3OYKA 3RRHA 5JS1A 3QETA 2O4IA 1A5VA 1Q9YA 1UA0A 2WOMA 3LP3A 4FVMA 1JXEA 3NFAA 4CF1A 4ID1A 1G15A 4OJRA 2X74A 2XY5A 3PY8A 2G8FA 3CG7A 4F3TA 4CJ3A 3AVFA 4YNQA 2KTQA 5HRSA 1C1CA 4E89A 3P5JA 4B3OA 3LPUA 5FROA 1RT7A 2VWKA 4C8OA 1LWFA 1ASUA 1QSYA 5CZ2A 5D3GA 4OPKA 2A1SA 4ID5A 1RDAA 3F73A 4DU1A 4OGEA 5T7BA 4CEAA 5I42A 4CGIA 1LV5A 4DTSA 5KRTA 3HP9A 4GMJB 1TV6A 4NYFA 4PUOA 1LAVA 4QCLA 1NK8A 5C42A 1IH7A 1Y97A 4IFYA 2E6MA 1S9EA 3V1QA 3MAQA 4WE1A 3JYTA 3CM5A 5J2QA 1HQEA 4KB1A 4KHNA 1X1PA 4FK4A 2FBVA 3KD1E 3ZT0A 1Z26A 1U04A 3KLGA 2OPQA 4LSLA 3G0ZA 4O55A 3OYHA 4BACA 1RTDA 4K8ZA 5J2PA 3L2VA 3V1OA 1TKDA 2GUIA 4F3OA 1SV5A 4YFUA 4C8KA 4IG3A 1Q9XA 2QK9A 1U47A 3O3FA 5C24A 1WAFA 2BANA 2OPSA 4CJVA 4M3XA 3C95A 4R5PA 4DTUA 5SZTA 3V9ZA 1SL0A 3RR7A 1KVCA 2P5OA 4CGFA 4EP5A 1BCOA 4DU3A 2YKMA 4ZTFA 1TK0A 3K5NA 2OA8A 4CEOA 4I9LA 4AH9A 3LWMA 3OS2A 1TKTA 3M8SA 1B9DA 1HYZA 2IAJA 2Z1GA 3ZSXA 5KRSA 3OYDA 3HXMA 3VA3A 3MECA 3AA5X 4LH4A 4O0IA 2W42A 4KO0A 1WSFA 3BGRA 3G10A 1S1TA 3NF6A 3HSTB 3V9SA 2A1RA 3ZSWA 1VSKA 4CGGA 4CHYA 4FK0A 4I7FA 3WNEA 3NH1A 3KJVA 1ITGA 1R0AA 2XY8A 5KGWA 3SZ2A 2PYLA 4KB0A 3AO4A 3ZSZA 3NGZA 4Z4FA 3HPGA 3DOLA 4FW1A 4CHPA 5FRMA 4HUEA 1KCFA 3LP0A 4DQPA 4O0JA 4PY5A 4FYDA 2G8KA 5CY4A 3VA0A 3LANA 1YTAA 4CEDA 3O3GA 3DMJA 1ASVA 4E7JA 3ZSYA 3I0SA 1KFSA 1WSGA 3BDPA 1QTMA 1VSEA 1JLCA 2IC3A 3AVLA 4LY7A 3O4NA 3KD5E 3M8QA 1BI4A 4KTWA 4NCAA 1BL3A 4HUGA 4CESA 3TWHA 3AA3A 3QEXA 2FBXA 3HYFA 4KAZA 4AHSA 1K6YA 2Z1HA 4ZHRA 3AV9A 1D5AA 1FK9A 4FJMA 1W9HA 4CFCA 1BISA 4KHWA 1L5UA 4N56A 1BCMA 2GBZA 3O3HA 1VRTA 4CJUA 1HJRA 4KFBA 1UAXA 3NGIA 3AVGA 4MQ3A 4CIGA 4E0DA 4F4KA 2IDOA 3K5MA 1JLFA 3V9UA 1QS4A 1S5JA 4FJIA 4AHCA 4E1NA 1JL2A 3VQ4A 1S6QA 3NDKA 1NK5A 3DLRA 4CEFA 3RR8A 3AA2A 3D45A 5FDLA 3PUFA 4FM1A 4ELVA 4FJ7A 3S3NA 3KK1A 1B92A 4B8AB 1QSLA 1UWBA 3OYAA 1J5OA 4CJFA 2G8UA 5I3UA 4DSIA 1DTQA 4OKKA 3F9KA 1SKSA 4DQIA 3RMBA 1T05A 1LWEA 1U45A 4FLUA 2FBYA 3AVKA 3K5OA 3CQ8A 1HNIA 1JLGA 3VQCA 3M8PA 3ITHA 4IBNA 1RDBA 2EHGA 1XHXA 1A5XA 3T3FA 5JS2A 4DSEA 4F2SA 2BGGA 4JLHA 3TAEA 4Q5VA 3IAYA 4FLXA 3TANA 3DRSA 1KVBA 4AHVA 2F96A 1RILA 2XRIA 4DF4A 1J53A 3MEGA 1IG9A 3KLIA 1A5WA 2HNDA 5HBMA 1O1WA 2HNZA 4CJLA 5KGXA 3QEWA 4M3UA 1RBSA 4HVJA 2DTUA 3ZSQA 3TAQA 4W5NA 4DWIA 1XWLA 1Z25A 4FLVA 4BE1A 4FK2A 2RN2A 2HHTA 1YVUA 3DLBA 3DLEA 1VK0A 2Z1IA 2DFHA 4EZ6A 4FJ9A 3QESA 5FRNA 1SUQA 3KKRA 3SUOA 3LPTA 1JLQA 1NJXA 3EZ5A 4KHSA 1RBVA 2WONA 1JL1A 3PO4A 1J9AA 2YV0X 3QEVA 3THVA 3VQ9A 4KPYA 2HVHA 3ZSRA 3RMDA 1HYVA 3AVJA 1RTIA 1TL1A 3I8DA 3RWUA 3ZSVA 1CLQA 5KI6A 1IKYA 5CZ1A 2BDPA 3ISNC 3SYZA 4B9TA 3NF9A 4I2PA 3AO3A 5SWMA 5EU7A 3CFPA 3L3VA 3TI0A 4FJHA 4JS4A 1RNHA 1VSDA 1XI1A 1QSSA 2VG6A 4F8RA 2QKBA 4M45A 2KQ2A 1WSIA 4OPJA 3SQ4A 1X9MA 1WAJA 2D0CA 4O4GA 1TKXA 4GW6A 3NE6A 3QNOA 1UOCA 4IG0A 3SUQA 1C0TA 2XY6A 4HCBA 3VQPA 4HTUA 3SV4A 5CYMA 2PY5A 4NYNA 3LAKA 3SJJA 4CJ4A 1L3SA 1C1BA 4CECA 1KSPA 4CK1A 1VSMA 3NF8A 4Z4IA 4BWMA 4CE9A 4ICLA 3NH0A 1JLEA 1EKEA 4FJ5A 2HHSA 1NJYA 4XIUA 1WN7A 2Z1JA 2E4LA 4FLYA 3KIOA 1RT4A 4UQGA 3VQEA 4W5OA 3SPZA 3MXMA 3AO1A 3M8RA 3SUPA 3RRGA 4W5RA 2D0AA 4EZ9A 2JGUA 1U4BA 3TABA 2E6LA 4OGCA 5J1EA 4JRPA 3QEPA 4CHZA 2DFEA 3VQ7A 3MXIA 1LWCA 1EETA 4CEEA 2G8VA 1HYSA 4CHNA 4M3ZA 4O5BA 4W5QA 3LALA 4DG1A 3HL8A 2YNHA 4FLTA 2HW3A 3PX4A 1RT1A 1S6PA 2PZSA 4RW9A 4CGJA 1RDDA 3SNNA 1ASWA 4B9MA 4M3YA 3DOKA 3AVAA 1REVA 2IS3A 3QO9A 4FW2A 4DFJA 3TAPA 4LH5A 1NK4A 1NKEA 4KRFA 2KFNA 4FZXC 2EX3A 4FLZA 1CZ9A 4DFPA 4BE0A 4FJJA 2HHVA 1X9SA 4DSLA 4AHTA 3MXJA 1I3AA 4Z4CA 1RTJA 4CEQA 1HPZA 3KLEA 3AO2A 2AJQA 4DS5A 1RT6A 1SL2A 4QAGA 3KTQA 3LZIA 3DLGA 4M3RA 3SQ1A 3MEDA 4PWDA 3ZT2A 4DLGA 4E7IA 3OYJA 3JSMA 3NHGA 4E7LA 4DTRA 1S1UA 1SL1A 5DK5A 3ZSOA 2X6SA 3CM6A 4DLEA 3QNNA 2PYJA 3V9WA 2KZZA 2DFFA 3V6DA 3TAGA 3LP1A 1TGOA 4RW7A 2ZD1A 3HK2A 2ATQA 1NOZA 1N5YA 4C8LA 3PO5A 5J2NA 2OZMA 2F8SA 4CJKA 1GOAA 1T8EA 4J2EA 2LSNA 1TAUA 1S1XA 4BWJA 3ZT1A 3DM2A 4JRQA 2Y1JA 2D0BA 3SV3A 3U6FA 3P1GA 3QIOA 1S1VA 3AVBA 3ZT4A 3TARA 3IG1A 3VQBA 3EY1A 3ULDA 3SUNA 3KLHA 1TKZA 3V1RA 4H8KA 5HLFA 2JLEA 3KKSA 1ZBFA 2BE2A 1QE1A 4CIFA 1N6QA 1NKCA 1LW2A 4O44A 4BDYA 1IKXA 1RBRA 3LP2A 3L2QA 1RT3A 3U3GA 1NK7A 1DLOA 2G8WA 4M3WA 2HHWA 4DTJA 1RDCA 4KTZA 4CF9A 2ETJA 2OYQA 1BI4B 1I39A 3LAMA 2YNIA 1CXUA 4DSKA 2F8TA 1KFDA 2IOCA 1RCHA 4NCBA 2HVIA 3A2FA 3OJSA 4CJ5A 1JLBA 4Z0UA 1ZYQA 2YNFA 3DRPA 3I0RA 1VSLA 3L8BA 2RKIA 2ITGA 1TK8A 5C25A 4G1QA 1HNVA 4HHTA 3PX0A 4RW4A 4Y1DA 2I5JA 4N47A 4W5TA 3S3MA 3OY9A 4KREA 1ZBUA 3OS0A 4KV8A 2KFZA 3VN5A 4CJPA 3OYBA 2HB5A 4OLAA 2FC0A 3DYAA 4Z4HA 2XHBA 3HO1A 1FKPA 3SQ2A 2OZSA 1C1AA 4DQSA 3QEIA 4CF2A 3H08A 1HQUA 4CGDA 3VQQA 4DTXA 4KI6A 1BIZA 2OPPA 1IO2A 3TAMA 4Z4EA 4I9QA 5CYQA 1ZBIA 1KRPA 4CJSA 1TVRA 1U48A 2VG7A 3HVTA 1LAWA 1D9FA 4M42A 3WNFA 4JS5A 2NUBA 4FCYA 3QINA 1LW0A 1F21A 3ALYA 3LZJA 4FJNA 1IKWA 4FJXA 1TL3A 3VQ8A 1RT2A 4E7KA 4L8RB 1BHLA 1EP4A 3LWLA 2HNYA 1ZBLA 4FJGA 4DSFA 4N41A 4DFKA 4PA1A 4CF0A 3OVNA 4CK2A 1VSIA 1DTTA 4DF8A 4KHUA 1J54A 2HHUA 1YTUA 4DMNA 2ZQBA 1WLJA 4DTNA 3RTVA 4DQRA 3SCXA 4KKOA 2Y1IA 4QOZB 1NJZA 4EP4A 4KHYA 1FKOA 3L2RA 3QIPA 2G8IA 4B8CA 3ZT3A 3FFIA 4FJLA 4RW8A 4BDPA 1RBUA 2YNGA 2O4GA 3PX6A 3B6OA 2HHXA 3AVNA 4DTOA 1T03A 1WSJA 3TR8A 4MFBA 3OYFA 4E7HA 1C6VA 3SI6A 2KW4A 4IKFA 4K8XA 5K14A 4C8NA 3NGYA 3OYMA 1XC9A 1BQMA 1VSFA 5HROA 4CJRA 4CK3A 3AVHA 4HUFA 3HJFA 3AA4A 3NF7A 1VSJA 2IGIA 2YHBA 1WSEA 5DMRA 4CJWA 3CFRA 4FJKA 2HHQA 3OYGA 4M3TA 5KTQA 3OYCA 3MEEA 4FM2A 2XY7A 3RMAA 1QHTA 2ZE2A 2DY4A 4B9UA 3IRXA 4DU4A 1BIUA 3HPOA 3NCIA 1EX4A 3K2PA 4BE2A 4M41A 3T19A 1WNSA 2RPIA 2OPRA 2P5GA 4OVLA 3T1AA 4FLWA 3EYZA 4CF8A 1NK9A 1L3VA 1Q8IA 5HRPA 1KVAA 1S9GA 4CHOA 4CGHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1NGAA 5EVZA 3WNGA 2HMIA 4ZTJA 1L3UA 5I9EB 2GUPA 2OTLN 1FXXA 4B9VA 2VG5A 3ID8A 2IVOA 1RT5A 3PV8A 2QA4N 4CJQA 4AILC 3DRRA 1NOYA 4YOUA 2GELA 2JWLA 3F5TA 1EWQA 3THXB 4BGBA 2I7PA 1D8YA 3IS9A 4YOWA 3AVCA 1V4TA 4CD1A 1Q81O 4BQLA 1NJWA 5CE3A 2B6AA 1T7PA 2P1JA 4DS4A 3HVRA 3WXKA 4GV3A 2BTFA 4FZYA 3SPYA 1O13A 3EL2A 3E1YA 1U2VB 2GV9A 3G4SN 2GEMA 2UXBK 1UA1A 2IIRA 2QW9A 3OBYA 1HMVA 4B9NA 4BVPA 3QB0A 4FWRA 3S3OA 2X6NA 1BDGA 5C12A 5AQOA 4BR9A 1SQKA 4IOAL 3QICA 4Q0BA 1Q82O 4KTQA 1QZ5A 3VQ5A 4E3SA 3AVMA 4LSNA 1NKBA 3OHRA 4NLBA 2KZMA 4HWIA 2V7ZA 1H1VA 2YHAA 4C1NK 1WSHA 4F9OA 1C0UA 1B9FA 5AQFA 3P83D 3JS6A 3KVGA 3MMVA 1EXQA 2CGKA 4HCCA 4WFNL 2A41A 1NK6A 1GLCG 4OKEA 4V19S 2P9SA 5JS1A 4QS7A 4ISEA 3TSPA 4FVMA 3LP3A 4L3QA 4ID1A 1G15A 3CG7A 5AQRA 4F3TA 4CJ3A 2O8CB 4FPBA 3ZYYX 1YVNA 3P5JA 3LPUA 3O9QA 1D4XA 1RDAA 3AGRA 4CEAA 1NM1A 1TV6A 3FZHA 4NYFA 1IH7A 3BEXA 3QFPA 1Y97A 1BU6O 4Z94A 3NMUA 3RSEA 3V1QA 1HQEA 4KHNA 4JKCA 3OA9A 1Z26A 3VEXA 4O55A 3OYHA 4BRDA 2GUIA 1IJJA 4B3RK 1WAFA 1VQ8N 3V9ZA 3IMXA 1KVCA 1NGHA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1NGA A;  5EVZ A;  3WNG A;  2HMI A;  4ZTJ A;  1L3U A;  5I9E B;  2GUP A;  2OTL N;  1FXX A;  4B9V A;  2VG5 A;  3ID8 A;  2IVO A;  1RT5 A;  3PV8 A;  2QA4 N;  4CJQ A;  4AIL C;  3DRR A;  1NOY A;  4YOU A;  2GEL A;  2JWL A;  3F5T A;  1EWQ A;  3THX B;  4BGB A;  2I7P A;  1D8Y A;  3IS9 A;  4YOW A;  3AVC A;  1V4T A;  4CD1 A;  1Q81 O;  4BQL A;  1NJW A;  5CE3 A;  2B6A A;  1T7P A;  2P1J A;  4DS4 A;  3HVR A;  3WXK A;  4GV3 A;  2BTF A;  4FZY A;  3SPY A;  1O13 A;  3EL2 A;  3E1Y A;  1U2V B;  2GV9 A;  3G4S N;  2GEM A;  2UXB K;  1UA1 A;  2IIR A;  2QW9 A;  3OBY A;  1HMV A;  4B9N A;  4BVP A;  3QB0 A;  4FWR A;  3S3O A;  2X6N A;  1BDG A;  5C12 A;  5AQO A;  4BR9 A;  1SQK A;  4IOA L;  3QIC A;  4Q0B A;  1Q82 O;  4KTQ A;  1QZ5 A;  3VQ5 A;  4E3S A;  3AVM A;  4LSN A;  1NKB A;  3OHR A;  4NLB A;  2KZM A;  4HWI A;  2V7Z A;  1H1V A;  2YHA A;  4C1N K;  1WSH A;  4F9O A;  1C0U A;  1B9F A;  5AQF A;  3P83 D;  3JS6 A;  3KVG A;  3MMV A;  1EXQ A;  2CGK A;  4HCC A;  4WFN L;  2A41 A;  1NK6 A;  1GLC G;  4OKE A;  4V19 S;  2P9S A;  5JS1 A; 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4GW6A

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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