4H0PA

Crystal structure of acetate kinase from cryptococcus neoformans
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
431
structure length
431
Chain Sequence
AEYLLAINCGSSSIKGKLFAIPSFELLANLAVTNISSSDERVKIKTTWEEGKGKDSEEEADYGDKIRYASLVPILLDHLTNSTHVKKEEIKYVCHRVVHGGMHDKGIRVVKGHEEGLMEMDKLSEFAPLHNHRAVLAVKSCIDALPHHTSLLLFDTIFHRTIAPEVYTYALPPPDTELTMPLRKYGFHGLSYASIVQSLAEHLKKPSDQINVVVAHLGSGSSSCCIKNGKSIDTSMGLTPLEGLLGGTRSGTIDPTAIFHHTEDAASDANVGDFTVSKAEIILNKNSGFKALAGTTNFGHIIQNLDPSKCSEEDHEKAKLTYAVFLDRLLNFVAQYLFKLLSEVPIESIDGLVFSGGIGEKGAELRRDVLKKLAWLGAEVDEEANNSNSGGAVKCITKEGSKLKGWVVETDEEGWMARMAKEEFGFLEHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of acetate kinases from the eukaryotic pathogens Entamoeba histolytica and Cryptococcus neoformans.
pubmed doi rcsb
molecule keywords acetate kinase
molecule tags Transferase
source organism Cryptococcus neoformans
total genus 141
structure length 431
sequence length 431
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2012-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0pA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0pA02
4DCHA 1T6CA 4WQ4A 5FPMA 2YHXA 2QWMA 3M1FA 5BR9A 2QWRA 5AFUA 1CZAN 4CZHA 4MLHA 4QS8A 2NRHA 4BRIA 3VEYA 2ZGYA 3O1BA 5LJWA 3MN5A 3MN9A 1MWMA 3VESA 2CGJA 1V4TA 2FF3B 3C7NB 1G99A 1JCEA 3A8YA 1GLCG 1QZ5A 3J8AA 3LDQA 4FOEA 2D0PA 3D2FA 4MO5A 3BF1A 4A61A 4BQLA 2QWOA 4CD1A 4K25A 1YXQA 4K42A 3GL1A 1DGKN 3UKRA 3VEVA 4CZEA 3QFUA 4Y0WA 4IXCA 2ZWHA 5AQFA 3SLCA 2E88A 5AQNA 4WQ5C 4BRGA 4H0OA 4BQZA 3CIPA 2I7NA 3CJAA 5F2RA 3ULEB 1EQYA 2ZGZA 4FWRA 4WQ4C 4BRLA 5AQTA 3FLCO 1J6ZA 2FSJA 4C23A 2OANA 3HI0A 5F1XA 2KHOA 4L3QA 4FWNA 3UKUA 1GLJO 3EO3A 2IVOA 4FWMA 1H1VA 3ATUA 3LL3A 2F9WA 2P9UA 3U9DA 5ELZA 2E1YA 2Q0RA 1XC3A 1MDUB 1X3MA 1Y64A 2QWPA 4LC9B 3IFRA 2CH6A 2GTDA 2Q97A 3QFPA 3MDQA 3U8XA 4BC3A 2QWQA 4EFHA 3VEXA 1TUYA 1HUXA 4PKHA 1NGEA 5AQVA 3ATVA 4PKIA 5AZIA 3SMPA 3VERA 2UYTA 4BG9A 4RWTA 4NO7A 4CJ7A 2A3ZA 4JD2B 3WT0A 5AQKA 3H45C 1QHAA 4BRNA 5CE3A 1JCGA 2YHWA 3UB5A 3MN6A 4I6MA 4IJNA 3QBWA 3HBTA 5BRHA 4XEIA 4PKGA 4BRMA 4BROA 3VENA 4FSVA 3EN9A 4BR7A 4GY2B 3MN7A 5BN8A 2VWBA 2Q36A 5FPDA 2Q0UA 4PL8A 2A5XA 2FF6A 4H5RA 3VF2A 4A62A 2A40A 1ATNA 1RGIA 5LY3A 4CZIA 2NLXA 3EKSA 5KQ8A 2QW9A 4MLEA 3OHRA 5BREA 4AM6A 1SZ2A 1SQKA 5AR0A 3H3OB 3C7NA 2E2NA 1Q18A 1DKGD 3SMSA 1K8KB 5KPZA 1KAZA 5AQYA 2PBDA 1MWKA 1U6ZA 1X3NA 5E84A 1V4SA 5KPTA 3WXKA 1XQSC 3VGKA 4BRKA 2I7PA 3R9PA 4B9QA 2YI1A 3LDNA 1BO5O 2E1ZA 3D7EO 4WYBA 3LM9A 4HTLA 3ULEA 2E20A 1ZXOA 2P9IB 4A2BA 2W41A 1NGHA 2QXLA 2P9LB 1NGDA 2FSKA 3L4IA 2NZTA 4M63C 5AQOA 3GDQA 1GLLO 1JCFA 3ENHA 1KAYA 2VYPA 1D4XA 3CJ7A 4ISFA 3LDLA 4BGAA 4CZJA 3O80A 3ZX2A 2W40A 3C0BA 5LJVA 5AQIA 4B1ZA 3U4LA 5I9EB 4BRHA 3GE1A 4FWLA 4BR5A 4YDUC 3DXMB 2BUPA 1NMDA 1RFQA 2WUSA 2QM1A 3QICA 3JXUA 5FPEA 4BRCA 1NGCA 1QQOA 4O5FA 3SK3A 4JD2A 3WXLA 4PL7A 3AAPA 4K41A 4IO8A 4FWSA 5AQPA 4EIAA 5JICA 2FXUA 3ZX0A 3JS6A 1BWFO 1NM1A 5AQWA 4B1WB 3ENOA 1YUWA 4H0YB 5AZJB 4AM7A 2GEMA 1NGJA 1NGBA 5JLHA 3IMXA 4H0PA 3MK6A 1WOQA 4H5TA 5B8HA 4FWQA 3CJ1A 3VGLA 4FO0A 2D0OA 5AQLA 4H5VA 5AQUA 4BGBA 4BR9A 4ISGA 3FZHA 1TUUA 1NWKA 3W3DA 3R6MA 1LCUA 1ATSA 1K8KA 3I33A 3WEEB 4GNIA 1QQNA 5EX5A 1P8ZA 4IZ9A 1BU6O 1GLDG 2Q1NA 4CD3A 2GWKA 3HM8A 4ISEA 3A5OC 4M7XA 4BR4A 4H5WA 1NBWA 2V51B 3WUHA 4IJAA 4FPAA 2E2PA 4CZGA 4DHYA 2ITMA 1DEJA 1GLEG 4EHUA 2ASOA 2P9IA 3EZWA 5AQRA 3EL2A 3WQUA 5ADXH 2VCPA 2YCHA 2P9LA 3ZEUB 3VEZA 5EVZA 2YHYA 1MA9B 2H3GX 1C0FA 4QS9A 1BA1A 3SJHA 2P9PB 4JN4A 1LOTB 3AARA 4IWVA 4A2AA 4BR2A 4B1VA 4B1YB 1Z6RA 3DXKB 3I8BA 3GG4A 3QBXA 3BUZB 3FZLA 3DXMA 3MMVA 4RCHA 4FWKA 4BC2A 4FOIA 3CJBA 2HF4A 4XH4A 3FZFA 5BPMA 3ZX3A 2Q31A 4BVPA 2IVNA 4BRFA 4CI6A 2ASPA 4BC4A 3CQXA 4YDUA 1NGIA 4CZFA 3LM2A 5BRFA 1KXPA 4JHDB 4J8FA 3O08A 5AZJA 3KZBA 5AQGA 3O6WA 1HLUA 3GOIA 3HZ6A 5E26A 1U2VB 1WUAA 2P9NB 4B1UB 2V52B 1NGGA 4O8KA 3GBTA 3BF3A 3EKUA 2HF3A 4H03B 5TKYA 4JNEA 5BPLA 3H46O 4H5NA 3L0QA 4KBOA 2EWSA 2AP1A 5AQHA 4K43A 3CHWA 2FSNA 3AY9A 4NB4A 1QQMA 1S22A 3H6EA 3IUCA 5EXWA 1NGFA 3WEEA 3HSCA 3RSEB 2YJFA 5KQDA 4B1XB 2V7ZA 3KHYA 3G25A 4H0VB 2CGKA 3W0LA 4DB3A 2ASMA 2A6AA 3D2EB 4BREA 2D1KA 2IIRA 2F9TA 4DQ8A 5F0XA 1SAZA 3H1QA 3ZETB 1XUPO 1TYQB 3CI5A 3WXJA 3O1WA 2QWNA 2P9KB 3F9MA 4CZKA 1X9JA 3H1VX 2FLOA 2P9SB 3LDPA 2V7YA 3ZEUA 2D4WA 3QB0A 2CGLA 2J4RA 4BRQA 4BVOA 4FL9A 4JAXA 5AFUH 1QZ6A 4XH5A 1S3XA 3CERA 2P9PA 1T44A 3DAWA 1BG3A 4CBWA 5AQMA 2HMPA 4Z94A 3A5NC 3DXKA 5AQSA 3UE5A 1IJJA 5AQJA 1HX1A 3O5BA 3FFKB 2E2OA 3LDOA 3O8MA 2IVPA 3CQYA 3QDKA 3A0IX 3P4IA 1HKBA 1E4GT 3IDHA 3VF4A 3FE1A 3O4WA 1HKCA 1NLVA 2GELA 2E8AA 1C0GA 1OKJA 1YVNA 4MO4A 1ESVA 5ADXA 4JHDA 1ZC6A 3FR0A 2ZF5O 5AQQA 4BG8A 4E1JA 1HJOA 3BEXA 3CETA 3VEOA 5BN9A 2E2QA 2PAVA 2A42A 3VOVA 2GWJA 5AQZA 1U2VA 2P9NA 4EHTA 2HOEA 5JMVA 3A5LC 4BC5A 2AA4A 3CJ9A 3D2FB 3HTVA 3M6GA 4HWIA 4FWPA 1BOTO 4F9OA 1KAXA 5EOYA 3WQTA 4BRDA 1GLFO 3BP8A 3UKRB 1GLBG 2DPNA 2GUPA 3VGMA 1ATRA 3VETA 1YAGA 5JLFA 3AAQA 3A5MC 3RSEA 3M3ZA 1E4FT 1Z05A 1BUPA 3VEWA 3D2EA 4FPBA 1GLAG 1HPMA 2YJEA 4CBXA 5AQXA 5EY4A 2QWLA 1RDWX 3ZETA 3CJCA 3VPZA 1TYQA 3KVGA 5FPNA 3U9ZA 3UKUB 1BA0A 3S41A 2P9KA 2BTFA 3MCPA 1BDGA 2P9SA 2P9UB 3TPQA 5KPRA 4FWOA 4QS7A 4M7YA 5BRDA 3WXIA 3H3NO 3QMLA 3FGUA 1HKGA 5AZIB 3R8EA 5BPNA 4BR0A 2A41A 4RTFD 1ZBSA 1NGAA 4CZMA 4I6MB 4BRPA 4H0TB 3ID8A 4CZLA 1T6DA 3B8AX 3DWLA 3TU5A 2CH5A 3VF6A 4CBUA 1R59O 4BRAA 4WQ5A 4EAHD 2Q2RA 1IG8A 3FZKA 4H0XB 3FZMA 4XH1A 3DJCA 3L6QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JI8K 4WQ4A 5FPMA 4JKHA 2QWRA 3KIOA 1CZAN 3QESA 4FJLA 3O3FA 4BRIA 3O1BA 2WONA 3MN5A 3U6FA 1RBTA 1V4TA 1G99A 1JCEA 3AA5X 2D0PA 3D2FA 3BF1A 4CD1A 5E41A 4J2AA 3GL1A 3UKRA 3VEVA 2E4LA 3QFUA 5I3UA 3ZCMA 3AVGA 3LWMA 1WBDA 3SLCA 2D0BA 4E7LA 4BRGA 4H0OA 2HHHK 3CIPA 2I7NA 3OYBA 3L2QA 3CFPA 2WBNA 2ZGZA 1VQ6N 1Z25A 2JWKA 4FWRA 1NMNA 3AO1A 4C23A 3V81A 5F1XA 1WLJA 4L3QA 1JKHA 4B3RK 3PIPL 4LH5A 4JKDA 2E1YA 5A2QO 1XC3A 4E89A 4QAGA 1KC8O 4LC9B 2Q97A 4I9QA 4EFHA 3MXIA 3CM5A 2G8IA 4PKHA 4PKIA 1JLFA 4BG9A 2UYTA 2RKIA 4NO7A 4CJ7A 4JD2B 3ZSYA 3V1RA 4KHYA 2KW4A 1YTUA 1JCGA 4I2PA 2YHWA 3MN6A 4I6MA 3QBWA 3HXMA 3C6AA 3HBTA 4XEIA 2G8VA 3VENA 4DG1A 4FSVA 3RMCA 2VWKA 3EN9A 5KGWA 5BN8A 1UOCA 2A5XA 3NVMA 3N4QA 4KH4A 1E3MA 4KREA 2F7TA 1B9FA 3ZT4A 4YOUA 3VQEA 4O4GA 3WNEA 4KTWA 4MLEA 3OHRA 2F96A 4AM6A 3TARA 1QSSA 2E2NA 1Q18A 1NK0A 3E9OA 1DKGD 3SV3A 1RDCA 3HL8A 4DV3K 3TTCA 5M1FA 4CJPA 5KPTA 1V4SA 1RT5A 3R9PA 5DM6L 1TL3A 4KB1A 3LDNA 1Q81O 1BO5O 1W0HA 4WYBA 3P38A 4HTLA 2HHWA 4RG8A 2P9IB 4A2BA 2HVHA 3AGKA 3U3GA 3ISNC 1NGHA 4NCGA 4N56A 1KVBA 1VSHA 4ZTJA 3G0ZA 1K9MO 3NAEA 1GLLO 1JCFA 3ENHA 1TAUA 3NH0A 2VYPA 2F8TA 5CR4A 1XMOK 3LDLA 5SWMA 4CZJA 1D9DA 3ZX2A 5AQIA 1KCFA 2PFUA 4DQSA 5I9EB 3GE1A 4JYAK 3HO1A 1S1TA 4FWLA 1WNSA 3SBTA 3K58A 4YDUC 4DTNA 1S1VA 2BUPA 3THYB 4DWIA 1RFQA 4AHCA 1RT4A 2QM1A 1N34K 1K73O 1QSYA 3WNFA 3SK3A 4JD2A 2E6LA 4DV2K 5J2NA 3AAPA 4K41A 1O13A 5AQPA 4OO1J 4RW7A 3ZX0A 5C42A 4IOAL 1QHTA 1UAXA 4H4MA 1VQPN 4KRFA 1BQNA 1JXEA 1S9EA 3ENOA 1YUWA 4FZZA 4RW4A 3HSTB 2ZJPL 5FRMA 1NGJA 1NGBA 3T1YK 4H0PA 1TVRA 1BIZA 3TWHA 4H5TA 3VGLA 4FO0A 4DTMA 3M8RA 3F9KA 1L5UA 1VK0A 5AQUA 4CIGA 1T8EA 2YHBA 2WC9A 3QEPA 4ISGA 2GUIA 3QO9A 3W3DA 1BISA 4DV7K 3R6MA 4GV6A 4WCEL 1ATSA 4E3SA 1S6PA 4KH5A 3G10A 4IZ9A 5KTQA 1GLDG 3O9QA 2QA4N 1GOCA 4M7XA 1RTIA 4H5WA 1NBWA 3WUHA 1L3VA 4IJAA 4DHYA 2ITMA 4Z4GA 1GLEG 2ASOA 2P9IA 3EZWA 4DTRA 5JS2A 4CHQA 1FXXA 3VEZA 2YHYA 4YFUA 4EP5A 4KTQA 3SJHA 3QERA 3RR8A 4DF8A 1LOTB 2OPRA 3AARA 3CMAN 3S3MA 4F3TA 2AJQA 2NRTA 4BR2A 3CCQN 4FLVA 3GG4A 4CEDA 3BUZB 3MMVA 4GVEA 5HROA 3THYA 1IV0A 1LW2A 1QE1A 3TI0A 1VQMN 4OKKA 4B9VA 1T05A 2HF4A 5IWAK 3ZX3A 4IEIA 3V1OA 2NRVA 4BRFA 4CI6A 3ID6A 3T1AA 4JI5K 2OTJN 5FLXO 1M1KO 3U3YA 4I2QA 1EP4A 3TANA 4KHUA 3IAYA 3ENBA 4O8UA 4B1UB 3PO4A 4O8KA 1Z26A 3KD1E 5BPLA 3H46O 2VGNA 3DOLA 4KBOA 2EWSA 4KHWA 2AP1A 1Q9XA 4GKKK 4K43A 4NB4A 1J5OA 1T7PA 3E66A 4C8NA 5KQDA 4TSXA 3PO5A 4DSJA 2NRZA 3J7AP 4DQPA 4OPKA 3VQ6A 3WXMB 2KFZA 3O9TA 2D1KA 2IIRA 2F9TA 4B3TK 5F0XA 1SAZA 1VAZA 4O0IA 3CI5A 3WXJA 4BDZA 2QWNA 4C8KA 1IO2A 2OPSA 3H1VX 2O8BB 4BRQA 1X9WA 2OPPA 2G8KA 3DAWA 4KHPK 4DF4A 4JKGB 4FJIA 1X1PA 2FBTA 5AQMA 4Z4FA 1W97L 4DLGA 1HYVA 3A5NC 3OBWA 3RRGA 1LAVA 4HTUA 5H1SQ 1IJJA 5AQJA 1RDDA 1HPZA 1HX1A 3BY5A 4FJMA 3TSQA 1K6YA 1HR0K 4FK4A 1W2BM 5HRNA 4C8LA 3IDHA 4CJWA 1YTAA 2VG7A 4BDYA 1KFSA 1OKJA 1ESVA 2DFHA 4AHUA 3CYMA 3AO3A 4BG8A 4DLEA 4DV0K 4E1JA 2PYLA 4JV5K 2D0CA 2OCEA 3ZSVA 4WFAL 1VQ7N 3BEXA 5KRSA 3AVJA 3HJFA 1S1WA 3HP6A 2RF2A 3VOVA 2GBZA 5BR8K 5J2PA 3CCEN 3HOSA 1BGXT 4HWIA 4F9OA 1C1BA 4FWPA 5EOYA 4KKOA 3P1GA 3BP8A 3VQ4A 3AA3A 3OYMA 3NH2A 3MEEA 3AAQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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