4HTLA

Lmo2764 protein, a putative n-acetylmannosamine kinase, from listeria monocytogenes
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
MKIAAFDIGGTALKMGVVLPHGEIILTKSAEISGSDGDQILAEMKVFLAENTDVTGIAVSAPGYVNPKTGLITMGGAIRRFDNFNLKEWLEAETGLPVAIENDANCALLAEKWLGKGQDLDDFLCLTIGTGIGGGIFSNGELVRGGRFRAGEFGYMFSERPGAFRPGKYTLNETTTMLVLRRQYAELTGRPLEEITGEEIFANYDAHDAVSERLITEFYTGICTGLYNLIYLFDPTHIFIGGGITSRPTFIAELKHHMESFGLRDTIIETATHKNQAGLLGAVYHFLQEEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Lmo2764 protein, a putative N-acetylmannosamine kinase, from Listeria monocytogenes.
rcsb
molecule keywords Beta-glucoside kinase
molecule tags Transferase
source organism Listeria monocytogenes
total genus 92
structure length 291
sequence length 291
ec nomenclature ec 2.7.1.85: Beta-glucoside kinase.
pdb deposition date 2012-11-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4htlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4htlA01
4JNEA 3F9MA 3O1WA 1LOTB 3DXKA 3MN9A 1Q18A 2A5XA 3QFPA 4BROA 5ELZA 1HKGA 1NGIA 4CZHA 2P9PA 2QWQA 4BRQA 3VEVA 3MN7A 4BR4A 2VCPA 4K42A 3GL1A 2ZGZA 1NGCA 2P9KA 5FPNA 4B1VA 3I33A 4CZMA 5E84A 3VERA 3ENHA 2NZTA 2Q31A 3A8YA 3A5NC 4PKGA 2VWBA 3EL2A 2E1ZA 4FWNA 2P9IB 4H5VA 3WQUA 1HKBA 1GLCG 3VGLA 3CJ7A 3H1QA 3IMXA 4PL7A 2I7PA 2E2OA 3ZEUA 2Q2RA 2QWRA 1Y64A 2CGLA 4PL8A 4BREA 1BWFO 3A5OC 5AQQA 5AQZA 2BTFA 3WT0A 1BO5O 1MWKA 2V51B 3L6QA 3KZBA 3H45C 3M1FA 1D4XA 4GNIA 1HJOA 4A2BA 2QWPA 2E1YA 4BR2A 1BOTO 2IIRA 3A0IX 3H1VX 3QB0A 1GLFO 3BUZB 3D2FB 4BC5A 4FWKA 2P9NA 4IJNA 2P9UA 5AQJA 3WUHA 3CJCA 3R9PA 3QBXA 5AQLA 3I8BA 4PKIA 4BR5A 4B1XB 2A3ZA 2I7NA 3KVGA 1C0GA 5FPDA 4WQ5C 3TPQA 4GY2B 5KQDA 2E2PA 4FWPA 4M63C 1GLJO 2FLOA 3C7NA 5KPRA 1LCUA 1Z05A 5B8HA 1XUPO 3CETA 2IVOA 3IUCA 2CGKA 4WQ4A 5KPTA 2EWSA 4FWQA 3D7EO 1TUYA 5EXWA 4IJAA 4WYBA 1H1VA 2E8AA 3DXKB 3P4IA 1DEJA 5AQFA 5LY3A 2P9PB 3EZWA 4C23A 1R59O 1T6DA 2P9LB 4KBOA 3CJ1A 4QS7A 5AQTA 1HX1A 2J4RA 3SLCA 4IWVA 2FSJA 5KPZA 2PBDA 4BC2A 4FWOA 2FF6A 4HTLA 5AZJA 3IDHA 4I6MA 3H3NO 4H0YB 3ZX3A 5LJVA 4YDUC 5CE3A 4EIAA 3FGUA 5AQNA 3VPZA 2QM1A 4E1JA 1U2VB 1KXPA 3LDOA 3BEXA 4JN4A 2Q36A 4H0VB 3ZX0A 3CQXA 1OKJA 2QWNA 4NB4A 1E4GT 3VESA 1KAYA 4BRIA 3CJ9A 3ATVA 3CQYA 2ITMA 3ZEUB 1JCGA 2E2QA 4M7XA 4BRFA 3VEWA 4FWMA 4Y0WA 3UKUA 2QWLA 1MWMA 3H46O 3SK3A 4BC3A 4CI6A 3ZETA 5ADXH 1EQYA 3LM9A 3ZX2A 1NGAA 5F1XA 1NGBA 3ULEA 4RTFD 3LL3A 1YVNA 4FPAA 2QXLA 1V4SA 3LDQA 4XEIA 5F2RA 3U9DA 4JHDA 2GWKA 2HMPA 2W40A 3CI5A 2ZGYA 3FZHA 4A2AA 1NLVA 4BG8A 4CD3A 5FPMA 4CZKA 2P9SA 4O5FA 1YXQA 2GEMA 4BR7A 2E20A 4H0PA 2ZWHA 4ISGA 1SZ2A 2A41A 3DWLA 3DXMA 1X3NA 1TUUA 1XQSC 3VGKA 2WUSA 2YJEA 1ATNA 3C7NB 3U4LA 1P8ZA 4BGBA 3BP8A 1JCFA 4FWRA 2D0PA 3WEEA 2F9WA 3CIPA 2CGJA 3HI0A 4K41A 2YHWA 1DGKN 5AFUH 1NGHA 1TYQA 3GOIA 1HUXA 3UKRB 1NGDA 1X3MA 5EVZA 4AM7A 5AQOA 1WUAA 3HTVA 2NRHA 3RSEB 1NGEA 2D4WA 3O80A 3O4WA 1YUWA 4QS9A 3VENA 1NWKA 4CZIA 1CZAN 3WXKA 3VOVA 2E2NA 4A61A 3DAWA 3QBWA 4I6MB 1GLDG 3MN5A 4WQ5A 2PAVA 4FSVA 4XH5A 5EY4A 5BN8A 5BPLA 3GDQA 3GG4A 3EKSA 5AQKA 5AQUA 4FOIA 3LDLA 1GLBG 1NM1A 2V52B 3O6WA 3G25A 4DQ8A 1S22A 3DJCA 4H0XB 3B8AX 4H5RA 4BR0A 1ZXOA 3AY9A 4BRLA 1QZ6A 5EOYA 4BRAA 3L0QA 1BG3A 4B1ZA 1HLUA 3C0BA 4CZLA 3D2EB 4CZJA 4BRPA 1C0FA 1MA9B 2ZF5O 3VF2A 5AQRA 4ISEA 4RWTA 5AZIA 1IJJA 3UKUB 3QICA 3WXIA 2YJFA 1NMDA 4XH4A 1S3XA 4H0OA 5AQMA 3VF6A 3ZETB 3W3DA 3SMPA 2HF4A 1HKCA 5BRDA 4CJ7A 3A5LC 3MN6A 1NGJA 4K43A 3ENOA 1RDWX 1NBWA 4JHDB 2P9KB 4NO7A 4EHTA 4YDUA 5AR0A 3HM8A 2ASOA 3UB5A 1KAXA 3AAQA 3M6GA 3FZMA 4BRKA 4B1YB 1QQOA 3ID8A 4CBWA 2FF3B 3VETA 2NLXA 3M3ZA 3VEYA 3FZLA 4BQZA 1K8KA 1ZC6A 5BREA 1BUPA 4FO0A 3SMSA 4ISFA 1ATRA 2ASMA 3DXMB 4BRNA 3D2FA 1MDUB 4BQLA 2Q0RA 4B1UB 5ADXA 2AA4A 4CBXA 3MDQA 3FZFA 5BPNA 5AQYA 5BN9A 3WEEB 4BRDA 2E88A 1QZ5A 3L4IA 5TKYA 4JD2A 4MO5A 4CZFA 2Q1NA 5JLFA 5AQIA 1G99A 3CERA 2IVNA 1BU6O 3HSCA 2GWJA 3CJBA 4RCHA 4H03B 3JXUA 3WXLA 4CZGA 4H0TB 2P9NB 1ZBSA 1BA0A 2P9UB 4H5NA 2W41A 4K25A 4AM6A 4CD1A 2A42A 3EN9A 3A5MC 2A6AA 4PKHA 4IO8A 3IFRA 1ATSA 3H3OB 1T44A 1DKGD 1Z6RA 2YHYA 5AQWA 5BPMA 2P9LA 4BRGA 3JS6A 3O1BA 5JLHA 3QFUA 4CZEA 4A62A 1SAZA 2GUPA 1GLAG 3R6MA 4FOEA 3SJHA 3ATUA 3VEOA 5JMVA 2ASPA 3LDNA 2GELA 3CHWA 2DPNA 4BRCA 5AFUA 2YHXA 3WXJA 3HBTA 1E4FT 1HPMA 3EKUA 1U2VA 3H6EA 4M7YA 5AZIB 4CBUA 4DB3A 2YI1A 1U6ZA 3FLCO 3MK6A 1QHAA 2FXUA 3AARA 4IXCA 2UYTA 4JAXA 4Z94A 4LC9B 4BG9A 3QDKA 4XH1A 5AQVA 4FWSA 3VGMA 1NGFA 5AQXA 2HOEA 3GE1A 1BDGA 3W0LA 2CH6A 3TU5A 5AZJB 3QMLA 3MCPA 2QW9A 4IZ9A 1IG8A 1RFQA 2HF3A 3J8AA 3WQTA 4B1WB 1SQKA 2VYPA 4QS8A 1K8KB 1GLEG 2H3GX 2QWOA 5AQHA 4DHYA 3VEXA 5BRFA 1NGGA 2D1KA 3KHYA 3HZ6A 5FPEA 4FL9A 4H5WA 4BR9A 3CJAA 1YAGA 2FSNA 2OANA 4O8KA 3VEZA 1JCEA 2BUPA 2A40A 4L3QA 5EX5A 3FE1A 2P9IA 4JD2B 4MO4A 4BRMA 3U9ZA 1QQNA 5E26A 4HWIA 2QWMA 5JICA 3ULEB 4FWLA 5AQPA 4BVPA 2D0OA 3AAPA 2CH5A 2YCHA 3LDPA 3GBTA 3FZKA 2Q0UA 2KHOA 4MLEA 4BC4A 1BA1A 2V7ZA 1J6ZA 4MLHA 3VF4A 5AQSA 2AP1A 2V7YA 4WQ4C 4BVOA 2P9SB 4F9OA 2FSKA 4EAHD 5LJWA 1ESVA 2IVPA 3BF3A 3OHRA 3S41A 4H5TA 3UKRA 3MMVA 4BGAA 3U8XA 3RSEA 5BR9A 1RGIA 3O8MA 3R8EA 3EO3A 3O08A 1GLLO 3FR0A 4B9QA 5BRHA 4EHUA 3BF1A 5F0XA 4DCHA 2Q97A 2GTDA 4J8FA 3UE5A 5AQGA 1QQMA 1KAZA 3FFKB 1TYQB 4BRHA 5KQ8A 1T6CA 1XC3A 4FPBA 4EFHA 3LM2A 2F9TA 1V4TA 1WOQA 3O5BA 1X9JA 3D2EA 5I9EB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FK2A 4JNEA 3VQDA 1WBBA 4KV8A 3L2UA 3LZIA 3MN9A 3EE9A 3PV8A 1M1KO 5ELZA 1ILYA 3NVMA 2YKMA 4BRQA 1KVAA 4FJMA 1LW0A 3SAFA 3QIPA 4HCBA 4DSJA 4CEEA 5EU7A 4B1VA 4DU3A 3OS0A 4CZMA 2P5GA 4M41A 4PKGA 3SCXA 3N4PA 1ZBLA 2E1ZA 4JK8A 2HBKA 3AVCA 4X64K 2P9IB 4YOUA 3WQUA 4I2QA 3KJVA 3H1QA 4FLUA 2R7YA 2E2OA 1YTAA 3NBPA 4OPKA 1KFSA 1CLQA 3ZEUA 4OKKA 4DMNA 4PL8A 1BWFO 3LP1A 3A5OC 5AQQA 4AHUA 2UXCK 3VTIA 2AJQA 4CJ3A 3H45C 3M1FA 4OO1J 3L4QA 2QWPA 3L8BA 2FBYA 4CEDA 4JKGA 1KQSM 3D45A 4CJKA 4BC5A 2WOMA 1KVCA 4DR5K 4IG0A 3THWB 3CJCA 4JI1K 3T3FA 3KTQA 1IBMK 3PUFA 4DV6K 4KKOA 4JS5A 4Y1DA 4FWPA 2IDOA 3M8QA 5KPRA 3CFPA 4KHNA 2D0AA 4E7LA 2IVOA 3HPHA 3LP2A 1UA0A 4H4MA 3SPYA 3HSTB 3K59A 3B6OA 4WFNL 5KTQA 3G4SN 3SAGA 3R3LA 1T6DA 4KBOA 2X6NA 3SLCA 3TSUA 3M8RA 3V9WA 1NOYA 4DSFA 4FWOA 4HTLA 4PQUA 3IDHA 1W9HA 4I6MA 4H0YB 4IFVA 3RRHA 5CE3A 5J2MA 1RT5A 1W7AA 4CJEA 4CEZA 3VPZA 4OLBA 1KXPA 1RDCA 3TI0A 4KAZA 3IRXA 2Q36A 4H0VB 3IAYA 3ZX0A 4W5RA 3OYNA 3P83D 3V9XA 1YJWN 4M3ZA 3DYAA 1KAYA 1S6QA 4BRIA 4LH4A 2ITMA 3N4QA 1JCGA 2E2QA 1N33K 4BRFA 3CFOA 2HHXA 3VEWA 3U3YA 4DQSA 3SK3A 3SNNA 1TKXA 4CI6A 3C95A 2O8CA 3LM9A 4Q5VA 3MAQA 1SUQA 5F1XA 3L2RA 1UA1A 3ULEA 3QEIA 1YVNA 1V4SA 4O5BA 3C6TA 4JHDA 5K14A 2W40A 1TK8A 1I94K 3E66A 4X66K 4N56A 4CD3A 5FPMA 3HRGA 2P9SA 3ID6A 1YXQA 2VG6A 2ZWHA 3LP3A 5DMRA 4CEAA 2A41A 4LY7A 3DXMA 1JL2A 2KLAA 3KLFA 3T1HK 4M3WA 1XQSC 2B5JA 2VQFK 4DLGA 1ATNA 4KRFA 3B6PA 4A59A 4CGHA 4DQIA 5SWMA 4CEBA 4CJ5A 3PSFA 4FWRA 4HUFA 3V1RA 4FM1A 3O3GA 2XRIA 4FJNA 4DSLA 2F9WA 3CIPA 3PLAA 3HI0A 3KD5E 1DGKN 1KLMA 3AVIA 1HUXA 4DFMA 4OGEA 1YI2N 1BHLA 1WUAA 3HTVA 4IDKA 4CHNA 2NRHA 3RSEB 3DMJA 4XIUA 4CVNE 4A61A 2F7TA 2I5JA 1DT9A 3TTFA 1S5JA 5AQUA 1GLBG 3OYGA 3DOKA 1S22A 4YOVA 1NK7A 4G9ZA 4FZYA 4JK7A 3KLIA 5EOYA 3L0QA 1BG3A 4CK3A 1T05A 1HLUA 4BRPA 1C0FA 2ZF5O 4HUEA 4DQQA 1X9MA 4RWTA 5AZIA 3OYJA 2Y1JA 3WXIA 4YORA 3VF6A 4MQ3A 5BRDA 3KK3A 4CJ7A 1D5AA 2QK9A 1NGJA 4K43A 1VRTA 4EP4A 1NBWA 3AAQA 4OVLA 1HNIA 4HTUA 4BY9C 1QQOA 3ID8A 2W6KA 2FF3B 3EY1A 2YNFA 1XMQK 4H4OA 4FLXA 1TAQA 1VQ8N 1ZC6A 4J2EA 1BUPA 4FO0A 4FJJA 3NVKA 1J54A 1FKPA 4NYFA 4JKCA 3SV4A 1WSGA 2AA4A 3ZSOA 4CBXA 3MDQA 4CF0A 5BN9A 3K5LA 4B9TA 4B3RK 3L4IA 1JL1A 3LWMA 1G99A 4F8RA 3CERA 3DLBA 5CHIA 1C0MA 3HSCA 3TSQA 1S1TA 2E6MA 2JWKA 3K57A 3CPWM 1XNQK 2ZJRL 4JV5K 3JXUA 4CZGA 2F4VK 1C0UA 3CG7A 4H0TB 1ZBSA 4FW2A 1VQMN 3EN9A 3A5MC 1KVBA 3IFRA 1ATSA 4F2SA 4ELVA 1YF5L 5AQWA 3UIQA 3EEQA 1NG9A 4A62A 4L8RB 2GUPA 4YHHK 4RW7A 3R6MA 4FOEA 3VEOA 3ATUA 5JMVA 3LDNA 1VQ9N 4ELUA 2DPNA 3HBTA 3LPTA 4AHTA 3S3MA 1L5UA 5TKWA 4ICLA 1NKEA 4LF7K 4M7YA 4ZHRA 1U49A 2IGIA 3DRSA 1HQEA 3MK6A 1QHAA 4JI3K 2UYTA 4I9QA 2O8FB 2HVIA 3BZKA 3ZSZA 4XH1A 5AQVA 3DRPA 2CH6A 4KB0A 3MEDA 3OYCA 3QMLA 4CJUA 1ZYQA 4EZ6A 1A5WA 4FJ5A 2ZE2A 1SQKA 2VYPA 3ZT1A 4QS8A 1BIUA 3C6AA 4KREA 2H3GX 2QWOA 4DHYA 2YNGA 2X6SA 3HZ6A 5FPEA 4DTXA 4E89A 3V9ZA 4Z4IA 1IKXA 5FROA 3CJAA 1YAGA 1WLJA 2G8UA 1L3SA 4O8KA 3M5RA 1JCEA 2BUPA 5M1NA 3NCIA 2P9IA 2PY5A 3E01A 2O8CB 3OJSA 2X78A 2QWMA 3ULEB 4O0IA 1ZBIA 3AAPA 2O8EA 1HQUA 2Q0UA 1BA1A 2YNHA 3PSIA 1NK9A 2P9SB 3O9RA 1NJZA 1KRPA 2HNZA 3MMVA 3D0PA 4H8KA 4K8XA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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