4HTLA

Lmo2764 protein, a putative n-acetylmannosamine kinase, from listeria monocytogenes
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
MKIAAFDIGGTALKMGVVLPHGEIILTKSAEISGSDGDQILAEMKVFLAENTDVTGIAVSAPGYVNPKTGLITMGGAIRRFDNFNLKEWLEAETGLPVAIENDANCALLAEKWLGKGQDLDDFLCLTIGTGIGGGIFSNGELVRGGRFRAGEFGYMFSERPGAFRPGKYTLNETTTMLVLRRQYAELTGRPLEEITGEEIFANYDAHDAVSERLITEFYTGICTGLYNLIYLFDPTHIFIGGGITSRPTFIAELKHHMESFGLRDTIIETATHKNQAGLLGAVYHFLQEEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Lmo2764 protein, a putative N-acetylmannosamine kinase, from Listeria monocytogenes.
rcsb
molecule keywords Beta-glucoside kinase
molecule tags Transferase
source organism Listeria monocytogenes
total genus 92
structure length 291
sequence length 291
ec nomenclature ec 2.7.1.85: Beta-glucoside kinase.
pdb deposition date 2012-11-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4htlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4htlA01
3C7NA 4DCHA 1ZC6A 3HZ6A 3A5OC 3CJAA 2VWBA 5AQJA 3CJ1A 3U8XA 4FWPA 3DWLA 1J6ZA 1HUXA 5LJVA 4CD1A 3U9ZA 2FLOA 3UKRA 1BA1A 3O08A 2GUPA 2FF3B 2V7ZA 2FSJA 3O1BA 3WUHA 1NGHA 3VENA 3CETA 1QQMA 1WOQA 4BRLA 3DXKA 5BREA 3HSCA 2QWOA 3LDNA 4I6MA 3KZBA 4JAXA 5AFUH 1OKJA 3RSEA 1E4FT 2HMPA 4CZLA 5KQDA 5F2RA 3SMPA 5AQYA 4FO0A 2E1YA 3VEYA 4BRMA 4EFHA 5BRHA 4M63C 1YUWA 2Q97A 5AZJA 4O5FA 3VGKA 2W40A 4EHUA 3MN9A 1HLUA 4O8KA 1Q18A 3W3DA 4FWRA 1IG8A 4BR9A 3MMVA 3VEOA 4BR0A 2ZGZA 4HWIA 2YHXA 1DGKN 5AQVA 3ZX2A 1QQOA 3AARA 3CIPA 2ASOA 3O4WA 3IFRA 4H0YB 2HF4A 3TPQA 4BG8A 3WEEB 1BG3A 2ZWHA 3HM8A 2Q1NA 1LOTB 2E2OA 1KAXA 2P9SB 2QWQA 1ZBSA 4H5WA 4BGBA 1MDUB 3A0IX 4FSVA 5AQQA 1NGFA 2PAVA 4ISFA 2QWNA 1XC3A 2F9WA 1C0FA 3BF3A 4JN4A 4XH5A 1D4XA 4FL9A 2W41A 5E26A 5FPMA 3ULEA 4MLEA 5BRDA 4BRKA 5AQOA 4H0TB 4ISEA 4L3QA 2A41A 1JCEA 4BC5A 5F1XA 2E20A 5ADXA 5BN9A 4H0PA 1MA9B 3MDQA 3R6MA 4H5RA 4B9QA 4NB4A 4BRDA 3LDLA 3ATUA 4CD3A 5EXWA 3CHWA 4JD2B 1C0GA 5JICA 5AQIA 2Q36A 2UYTA 3B8AX 5AQXA 4BC2A 1K8KA 2DPNA 1NM1A 2NZTA 2VYPA 1U2VA 4WQ4C 3O6WA 5EX5A 4BRIA 3QB0A 4BC3A 2FXUA 2P9UA 3BEXA 1S3XA 4BRQA 1X3NA 4CZMA 4BC4A 3VOVA 4GY2B 4B1XB 4A2AA 1KAYA 5LJWA 1G99A 4Y0WA 3WQTA 2Q0RA 4QS7A 1NLVA 5EOYA 2ASPA 3VF4A 4WQ5C 3ZETB 4F9OA 3ENOA 4WYBA 3MCPA 3A5NC 2CH6A 2P9NA 4YDUC 2P9NB 5AQPA 3QMLA 2E8AA 4H0VB 3LM2A 1ESVA 5JLHA 1CZAN 2HF3A 2P9LB 3O80A 5B8HA 3H1QA 1NGGA 3DXMA 3SJHA 4Z94A 2P9IA 5BRFA 3H46O 2NLXA 3DXMB 4A61A 3KVGA 1KXPA 2Q31A 3W0LA 2D0OA 4BQZA 3I8BA 3C7NB 4RCHA 2BUPA 5FPDA 4BRHA 1QZ6A 4AM6A 1GLLO 1NGJA 3WXKA 3R8EA 3LM9A 2P9KA 3BUZB 3EKSA 4FPBA 2P9KB 3FFKB 3UKRB 2AP1A 2IVPA 4CZGA 3DAWA 1U6ZA 3HI0A 1Y64A 2D4WA 4B1YB 1BUPA 3IDHA 2CGKA 3SLCA 4EHTA 5AQMA 3M3ZA 4FWMA 1TUYA 5JLFA 3DXKB 4CBUA 4HTLA 4I6MB 5AQUA 3RSEB 1DKGD 3FZMA 5AQHA 4JNEA 2D1KA 4K42A 3TU5A 4XEIA 5BPMA 1YAGA 5AQZA 1ATSA 5AZJB 4EAHD 3D7EO 2QWMA 5TKYA 2QW9A 2FF6A 4JHDA 4BR5A 4DQ8A 4E1JA 2GTDA 5AQSA 3A5MC 3EN9A 3QFPA 5EY4A 3GOIA 2PBDA 1RDWX 3MN6A 1WUAA 4FWSA 5AQLA 2GWKA 2P9PA 4H5NA 4IJAA 4CZIA 1HPMA 2WUSA 1R59O 4BGAA 1JCFA 4BREA 5FPNA 3D2EA 1X3MA 3A8YA 3UKUA 5ELZA 3VF6A 2E88A 4B1ZA 5AQTA 2A6AA 3UKUB 5AQWA 1GLBG 3D2FA 4M7YA 3GG4A 2YHWA 3CI5A 2YCHA 3D2FB 1SAZA 3QFUA 1ATNA 2J4RA 1QZ5A 1NBWA 3ULEB 4FOEA 3U9DA 3F9MA 4BRGA 4XH4A 1GLEG 1V4SA 1T6DA 5AFUA 3GDQA 3R9PA 4ISGA 4BRCA 1GLJO 4FWKA 3VEZA 1HJOA 4A2BA 3VETA 1Z6RA 1Z05A 1NGEA 3H3OB 1K8KB 3OHRA 4CZFA 3WXJA 3CERA 4MO5A 3O8MA 2E1ZA 1U2VB 1DEJA 3VEWA 3ATVA 4RTFD 4FWNA 1BDGA 2ZF5O 3JXUA 5KPZA 2P9UB 5AR0A 4MO4A 3I33A 5KQ8A 1MWKA 3G25A 1GLCG 1T44A 1X9JA 5AQFA 4H03B 4BVPA 2F9TA 3ZEUA 2GEMA 3M1FA 4AM7A 4J8FA 3M6GA 4EIAA 2H3GX 2ZGYA 3EO3A 3MN5A 1NGBA 4CBWA 1V4TA 1BO5O 3VEVA 3FZKA 3LDPA 1H1VA 2QM1A 2I7PA 3FZLA 2P9IB 2QWLA 3ENHA 5AZIA 1MWMA 2ASMA 2E2PA 5AQNA 1BU6O 4BR4A 3SMSA 3O1WA 3FZHA 1EQYA 4CZKA 4FWQA 4CJ7A 5KPRA 4PKGA 3LDOA 4H0OA 4QS8A 5LY3A 5I9EB 1T6CA 3VEXA 3CJ7A 3A5LC 1NGIA 1ZXOA 3MN7A 3QBWA 1XUPO 2HOEA 3H45C 4PL8A 2EWSA 4K25A 5EVZA 2V7YA 3IMXA 3AAPA 4CZJA 2OANA 3L0QA 4DB3A 3QDKA 2YI1A 4CZHA 3SK3A 2QWPA 3FE1A 3FGUA 3BF1A 2E2NA 1SQKA 4IZ9A 3L4IA 3GL1A 3HBTA 3L6QA 5BR9A 2FSNA 1TYQA 3ID8A 1NGCA 1QHAA 3IUCA 1TYQB 3WXLA 2FSKA 3EKUA 1LCUA 3EL2A 1NMDA 4FOIA 4H5TA 4IJNA 5ADXH 3H1VX 3AAQA 3J8AA 1GLDG 2YJEA 1YVNA 4PKIA 4JHDB 3ZX3A 2A5XA 3EZWA 5JMVA 4PKHA 4H0XB 5FPEA 3HTVA 4QS9A 1P8ZA 5AQRA 1HKGA 2YJFA 4BRPA 4BRAA 4BRNA 3VPZA 4BG9A 2IVOA 3FZFA 3U4LA 1NGAA 1HKCA 2P9PB 4KBOA 4BQLA 3D2EB 3ZX0A 3LL3A 1GLAG 4BRFA 1KAZA 2ITMA 3P4IA 4FWOA 4PL7A 1NWKA 2BTFA 2A40A 1BA0A 3FR0A 3WEEA 2A42A 3GE1A 2P9SA 3O5BA 4NO7A 3CJCA 2QWRA 4K41A 3BP8A 3WQUA 3KHYA 4WQ4A 1IJJA 3VESA 4MLHA 4RWTA 1BOTO 2GWJA 4GNIA 4IO8A 3QBXA 3H3NO 5BN8A 1QQNA 2CH5A 4BR2A 1HX1A 3GBTA 3WT0A 5AQGA 4CI6A 3FLCO 1YXQA 5E84A 1JCGA 3CQXA 1E4GT 3C0BA 4WQ5A 4DHYA 5CE3A 1XQSC 4K43A 5BPNA 2AA4A 4CZEA 4B1WB 2GELA 2QXLA 1ATRA 4JD2A 4B1UB 1SZ2A 2IVNA 3VGMA 1S22A 4YDUA 1NGDA 1GLFO 3MK6A 1TUUA 3QICA 3UE5A 3ZEUB 4C23A 2CGJA 1BWFO 2V52B 3AY9A 3CQYA 5F0XA 3WXIA 4A62A 3JS6A 1RFQA 4XH1A 1HKBA 2Q0UA 4M7XA 4LC9B 4BROA 4BVOA 2E2QA 3VGLA 3ZETA 3DJCA 3VERA 2CGLA 5AZIB 3CJBA 2VCPA 4IWVA 4B1VA 4CBXA 4FPAA 2A3ZA 5BPLA 2I7NA 4FWLA 5AQKA 5KPTA 2KHOA 2Q2RA 2NRHA 2P9LA 4BR7A 2V51B 2YHYA 3S41A 4H5VA 3UB5A 2D0PA 3H6EA 1RGIA 4IXCA 3VF2A 3CJ9A 3LDQA 2IIRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TAFA 3C7NA 3NGYA 1QS4A 3PO4A 1BI4B 3HZ6A 4LFBK 1JXBA 2HHQA 3CJ1A 3KWIA 3L4QA 4J2DA 1Q9YA 4DUZK 2FLOA 2UU9K 2KLAA 4FVMA 4W5QA 3I55N 3CG7A 3O1BA 3WUHA 3VENA 3NGZA 4IG0A 4O4GA 1WOQA 2O8CA 1J9AA 4I6MA 1TAQA 5AFUH 1E4FT 2FBVA 3WXMB 3NE6A 5AQYA 4DV1K 3KWGA 2OPPA 4FO0A 4B9LA 4M63C 4CHOA 1YUWA 3C6AA 5AZJA 3VGKA 3O4QA 4FK2A 5JVGL 2IOCA 2W40A 4OX9K 1JLBA 4B8AB 4Y1DA 1WAJA 3LPTA 3MN9A 4O8KA 3CCMN 4U67L 2Z1JA 1U49A 3AGRA 3N4QA 4F3TA 4BR0A 4FLWA 2ZGZA 3OA9A 1QTMA 3OYGA 4E19A 5HLFA 3KLFA 3L3VA 3CM6A 4EZ6A 1BG3A 4GMJB 2HW3A 1KAXA 3R1XA 4E89A 2QWQA 4DF4A 4BGBA 1K6YA 2D0AA 1WN7A 2GV9A 4FJMA 1TAUA 3TTFA 4XH5A 1D4XA 4KAZA 5FPMA 1SKWA 4FJ9A 3CCVN 3AVFA 1EWRA 4BC5A 1BHLA 5F1XA 4R79A 5ADXA 4YY3K 2WOMA 1BIZA 4CD3A 2E4LA 4PWDA 2HVIA 3ZT4A 3DLHA 2DPNA 1NM1A 4CFCA 5EX5A 4WFBL 4B3RK 1L3SA 4BC3A 4CGJA 2FXUA 2VQEK 4BRQA 1S3XA 3BEXA 3OYBA 5HP1A 1NK8A 5I42A 4M3YA 1ZBLA 1RT5A 4B1XB 4LF9K 4BE2A 3QINA 3OY9A 1G99A 1HQUA 4OPKA 3THVA 3J7YP 4RW8A 3ZETB 4F9OA 4DTNA 3V81A 4WYBA 4JI5K 4LSNA 1VQNN 2G8WA 3QMLA 4DG1A 5JLHA 3O80A 1BL3A 3SV4A 2P9IA 1HNXK 3DXMB 1KXPA 3IG1A 4RW6A 5HRNA 3W0LA 3E01A 3I8BA 4RCHA 4DQPA 3SJJA 4N76A 1GLLO 1NGJA 3R8EA 3LM9A 2P9KA 1VSFA 3VN5A 4B9VA 1R0AA 4Z4CA 3UKRB 1YHQN 2UUBK 4I7FA 4NCBA 4J2BA 2NRVA 4CJPA 2D4WA 4B1YB 5BR8K 3IDHA 2CGKA 2OPRA 5AQMA 3M3ZA 1TUYA 4CEBA 3SAFA 5JLFA 1SKSA 3S3MA 3PLAA 3RSEB 4CFDA 3TSPA 4DV6K 3SUQA 4OGEA 3P38A 3P5JA 1RBTA 5BPMA 1IV0A 1ATSA 4EAHD 1YI2N 1K9MO 2R7YA 4BR5A 1C1AA 4Z4FA 2DFHA 4CE9A 1ZBFA 4FW1A 2YX6A 3QFPA 2EX3A 4ID1A 1RDWX 3MN6A 4OLBA 4FWSA 5AQLA 3MWTA 3U3YA 2GWKA 1SS6A 1S9EA 3KKRA 4CZIA 2ETJA 2WUSA 1R59O 3T1HK 3EZ5A 3THXA 4CF9A 4FYDA 1X1PA 4EP5A 1X3MA 3A8YA 3UKUA 5ELZA 3L8BA 2E88A 1NOYA 5AQWA 4Y1CA 3D2FA 2UXCK 3D45A 1QZ5A 4NCGA 3HO1A 3ULEB 4FOEA 4CJLA 5C10A 3VMFB 4NLCA 4BRGA 3V9UA 4Z4HA 4CJFA 1VAZA 2W42A 1X9WA 5AFUA 1WBDA 1FW6A 2QK9A 3AA3A 4LY7A 1Q86O 1GLJO 3TABA 1HJOA 4A2BA 4KHPK 3M8RA 1KLNA 3BGRA 1JXEA 1K8KB 4DR3K 3WXJA 4MO5A 1U2VB 3VEWA 2HHSA 4KTWA 2ZF5O 3JXUA 3CXCM 4E0DA 2WONA 1GLCG 1I39A 1T44A 1EWQA 3F5TA 1X9JA 3O9QA 3ZLJA 4O0IA 4O55A 3MN5A 4ELTA 3QETA 2PYJA 3OYCA 1BO5O 4LF6K 3LDPA 1H1VA 1HYVA 3K5LA 3ENHA 2AJQA 5AQNA 1BU6O 3HXMA 3SMSA 4ILHA 4FWQA 3PX0A 2E6MA 1U48A 4PKGA 3QNOA 4BY9C 4H0OA 3M8PA 1RBRA 1T6CA 2LSNA 1ZXOA 3I8DA 4E7IA 3MN7A 4LF7K 3HPOA 3K58A 4BACA 3AVIA 3LANA 4PL8A 1RDDA 1BI4A 4CIFA 5EVZA 4IFEA 4IOCL 2O4IA 4K0KK 2OANA 1NKBA 1JLCA 3QDKA 3BF1A 5CYQA 2E2NA 3I0SA 3AVHA 3GL1A 3DRSA 2DFFA 1QHAA 4CVNE 3WXLA 3HK2A 1JL2A 4FOIA 3I0RA 4KH4A 2HHHK 3J7ZO 2YJEA 4DSFA 3S3NA 4JHDB 1WAFA 1D9FA 3B6PA 4PKHA 1ZBIA 4I2PA 4FLTA 1P8ZA 1IG9A 4BRPA 4CHZA 3VPZA 4RW4A 2P9PB 3CCUN 4AHCA 3TARA 3VQ6A 4M45A 3ZYYX 2XY6A 1TVRA 4JLHA 4FWOA 1NWKA 2BTFA 1KQSM 4YFUA 4IDHA 4NYFA 3THYB 1RTDA 1IKXA 3RR8A 4DF8A 3CJCA 3HOTA 4YOUA 2ITGA 4WQ4A 4ELVA 1BOTO 3S3OA 2GWJA 1IH7A 1REVA 4IO8A 1SV5A 4LSLA 3K5MA 4DTSA 4DR4K 4BR2A 3GBTA 1E3MA 5AQGA 3SAHA 5HOOA 1LW2A 1YJWN 4DV3K 1TK8A 3C0BA 5GAEP 2KZZA 1XNRK 4DHYA 5CE3A 4K43A 4B1WB 3LWMA 2GELA 4CK2A 3K5OA 2QXFA 1L3TA 4YDUA 4IKFA 3MK6A 3P31A 1KLMA 3QICA 3TAPA 4HCCA 3DOKA 4C23A 3N4PA 2V52B 3CQYA 1N33K 2VWJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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