4HTLA

Lmo2764 protein, a putative n-acetylmannosamine kinase, from listeria monocytogenes
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
MKIAAFDIGGTALKMGVVLPHGEIILTKSAEISGSDGDQILAEMKVFLAENTDVTGIAVSAPGYVNPKTGLITMGGAIRRFDNFNLKEWLEAETGLPVAIENDANCALLAEKWLGKGQDLDDFLCLTIGTGIGGGIFSNGELVRGGRFRAGEFGYMFSERPGAFRPGKYTLNETTTMLVLRRQYAELTGRPLEEITGEEIFANYDAHDAVSERLITEFYTGICTGLYNLIYLFDPTHIFIGGGITSRPTFIAELKHHMESFGLRDTIIETATHKNQAGLLGAVYHFLQEEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Listeria monocytogenes
publication title Lmo2764 protein, a putative N-acetylmannosamine kinase, from Listeria monocytogenes.
rcsb
molecule keywords Beta-glucoside kinase
total genus 92
structure length 291
sequence length 291
ec nomenclature ec 2.7.1.85: Beta-glucoside kinase.
pdb deposition date 2012-11-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4htlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4htlA01
3KHYA 5AQWA 4BRAA 3SLCA 2P9KA 1DEJA 3LL3A 1HKBA 3EKSA 4BRNA 4BRPA 1U2VA 4CZGA 4BC3A 5F0XA 3UE5A 2HF4A 5AFUA 1BA0A 1EQYA 5AQGA 3ZEUA 4XH5A 1NMDA 2CH6A 3VPZA 2QW9A 1DGKN 4B1ZA 4NO7A 5AQHA 3S41A 2P9NB 5AQRA 1HKCA 4PKGA 3EN9A 3WXLA 1RDWX 3MN9A 3A0IX 3BF1A 1JCEA 2F9TA 3WUHA 5BPLA 2AA4A 1H1VA 5AQXA 3QICA 1GLBG 4BR9A 1BU6O 3KZBA 1QQOA 1NGDA 3L6QA 4H5VA 1XC3A 3BF3A 4J8FA 1TYQB 2IVPA 3B8AX 1NGIA 4BC4A 2HF3A 4DQ8A 1NGGA 2GTDA 4FPBA 2GWJA 2UYTA 3MN6A 3HSCA 2QWOA 4FWKA 5AZIB 2E2OA 5F1XA 3IMXA 4BREA 3H1VX 2QWPA 3QDKA 1BOTO 3A5LC 3G25A 4LC9B 4Y0WA 1NGHA 4CJ7A 2FSKA 2P9NA 3D7EO 3ATVA 3VGKA 1K8KB 5FPMA 2QXLA 2Q0RA 5AQKA 3RSEB 2HMPA 2P9LA 5AQQA 2A42A 4WQ5C 4YDUC 5AQVA 4O5FA 1QHAA 4WQ5A 4YDUA 1RFQA 3A5MC 4CD3A 4K25A 3A5OC 2VWBA 3WXKA 1GLDG 1TYQA 3GG4A 4ISFA 3FE1A 1HX1A 4CI6A 1Q18A 2I7PA 3R6MA 4BRGA 4XH1A 3CJBA 1IJJA 1KAZA 2D4WA 3ULEB 3VF2A 4B1UB 1X3NA 1D4XA 2GELA 4A61A 2D0PA 4K43A 3GOIA 5AZIA 3SMSA 3BEXA 3CJ7A 4HWIA 1BA1A 4FWLA 3H3NO 4BRLA 3DXMB 5F2RA 5EXWA 5EY4A 1WOQA 5E84A 2KHOA 3CJ9A 5JICA 2P9PB 5AZJB 5KPRA 3M3ZA 1C0GA 4CZLA 2V7YA 3ENOA 1NLVA 4BG8A 2E8AA 2VCPA 1MWKA 4BR5A 3UKUA 3QBXA 2QWLA 3RSEA 3O1WA 4MO5A 1XQSC 5AR0A 4RTFD 1BO5O 3L0QA 4PKIA 4FWQA 2IIRA 3FFKB 4BRIA 4A62A 4A2AA 2Q1NA 4FWMA 4CBXA 3FZKA 4DHYA 3VF4A 3IFRA 2PBDA 5BRDA 2P9IB 2ITMA 3WQTA 4AM7A 1YXQA 4PKHA 1HPMA 2D0OA 3AAPA 3CHWA 3HM8A 4BRKA 3O08A 4BRCA 4L3QA 2P9UA 3EKUA 4MLHA 2P9SB 3VESA 1X3MA 3ULEA 2NRHA 4FWNA 3I8BA 2ASPA 2ZGZA 1NM1A 4CZHA 4FO0A 4IJAA 3DXMA 2OANA 3MK6A 5AQFA 3CJ1A 3CQYA 1RGIA 2FSJA 3QBWA 3QFPA 4FOIA 4JD2B 5LJVA 2P9PA 3L4IA 5AZJA 2YI1A 4FOEA 2E88A 5AQIA 3JXUA 2GWKA 4QS8A 2VYPA 4EHTA 4H5TA 3O5BA 5BN8A 3ENHA 5AFUH 3EO3A 4BGAA 4IO8A 1HJOA 1BWFO 1WUAA 2A6AA 1NGFA 3QB0A 3D2EB 3GBTA 5FPNA 3EL2A 2F9WA 4BRHA 2P9IA 3WEEB 4BC5A 2BTFA 2YHYA 4H0XB 3VEOA 5BR9A 1T44A 4PL8A 3DJCA 3JS6A 1T6DA 3U9ZA 4CZJA 5AQSA 3C0BA 4ISGA 5AQZA 3SMPA 2Q97A 4JNEA 1ATNA 4H0TB 4FL9A 3WQUA 4WYBA 5AQNA 1JCGA 3H1QA 4IWVA 1X9JA 3VEXA 2WUSA 4H0YB 5BN9A 4JD2A 1R59O 3LDPA 3A5NC 3J8AA 4BRDA 3VEVA 1LOTB 2W41A 1ZXOA 3LM2A 4CZKA 3LM9A 5FPDA 3WXIA 4ISEA 2D1KA 4CZIA 1HKGA 1P8ZA 1QQNA 4M7XA 3LDQA 1GLFO 4MO4A 1NGCA 5AQJA 5EVZA 3CJCA 4BVOA 3WEEA 3GE1A 1XUPO 4EHUA 1NGBA 1ZBSA 4M63C 4NB4A 2QWQA 3UKRB 3F9MA 5JLFA 4RCHA 4H0PA 1S3XA 2Q31A 3FZMA 4MLEA 4GY2B 4BROA 4CBWA 3A8YA 3CIPA 3C7NB 5BRFA 2FSNA 4C23A 1LCUA 2ASOA 2QWNA 1NGJA 1C0FA 1HUXA 3H45C 5ELZA 4CBUA 1K8KA 4QS7A 3AARA 1BG3A 3FR0A 2A40A 5AQOA 5AQTA 1U2VB 2E20A 4IXCA 1KAYA 2A3ZA 1U6ZA 1NWKA 1T6CA 3VEZA 3H46O 3QFUA 2H3GX 5EOYA 4BRFA 2ZF5O 3VF6A 5AQYA 4BVPA 1BDGA 5JMVA 3GDQA 5ADXA 1S22A 1J6ZA 3R9PA 1E4GT 1GLCG 2W40A 1Z05A 5KQDA 4B1VA 3VEYA 3R8EA 3C7NA 4H0VB 1MDUB 3DAWA 3ZETB 2V7ZA 1GLEG 3MCPA 1Z6RA 3VETA 3DXKB 3EZWA 5TKYA 2QWMA 4FWOA 3VOVA 4FWPA 4BQZA 5ADXH 1SZ2A 3M1FA 4BC2A 3LDOA 5JLHA 4DB3A 4H03B 4IJNA 3W3DA 1KAXA 1NGAA 2E2NA 4M7YA 5LY3A 2BUPA 1SQKA 2FLOA 3U8XA 1TUYA 4E1JA 4HTLA 5BRHA 2QWRA 1SAZA 3HZ6A 2E1ZA 3O8MA 4KBOA 1BUPA 1YVNA 2Q0UA 2A41A 4B1WB 5KPZA 1TUUA 5EX5A 3U4LA 3WXJA 2Q36A 1QZ5A 3IDHA 5AQPA 4B9QA 2CH5A 2ZGYA 2I7NA 4IZ9A 2ASMA 5CE3A 5AQUA 5KPTA 3WT0A 4CZEA 5KQ8A 2E2QA 3ATUA 3VERA 2A5XA 5AQLA 4F9OA 2AP1A 2P9SA 3ZX0A 2YHWA 3D2FB 2IVOA 4BRQA 3KVGA 4CD1A 3I33A 2YHXA 2P9LB 3U9DA 3ZETA 4RWTA 4FWRA 4BRMA 2NZTA 2FF3B 1ESVA 3O1BA 4JHDB 5AQMA 2NLXA 3BP8A 1GLJO 1NGEA 3DXKA 3FGUA 2FXUA 2YCHA 1JCFA 4XEIA 4DCHA 3W0LA 1DKGD 3VGLA 1KXPA 3O4WA 4BR2A 1MA9B 2YJEA 4BR4A 3O80A 1ATRA 1GLAG 4GNIA 3FZLA 4FWSA 3BUZB 4BGBA 2QM1A 2E1YA 1HLUA 3FLCO 3CQXA 3D2EA 3VGMA 1V4TA 4I6MB 3IUCA 1CZAN 3OHRA 3AY9A 3SJHA 1QZ6A 1YUWA 3M6GA 1G99A 2YJFA 1IG8A 2ZWHA 3HTVA 4FPAA 5FPEA 5I9EB 2GEMA 2Q2RA 5BREA 3D2FA 3UKUB 3HBTA 4H5RA 3UB5A 1QQMA 1ATSA 2FF6A 2J4RA 4B1YB 4A2BA 3MN5A 3QMLA 3MDQA 3ID8A 3FZFA 4BQLA 3CI5A 2V51B 2CGKA 3AAQA 2DPNA 4JHDA 3SK3A 3MMVA 1GLLO 2GUPA 3TPQA 2CGJA 3CETA 3P4IA 3LDNA 4CZFA 1YAGA 4JAXA 1MWMA 2P9UB 4BG9A 4XH4A 2IVNA 2P9KB 3ZX2A 4JN4A 4EIAA 2HOEA 4AM6A 4CZMA 3ZEUB 3TU5A 4K42A 4EAHD 3DWLA 4I6MA 3VENA 5E26A 5BPNA 2PAVA 5LJWA 3FZHA 4H5NA 1Y64A 4K41A 1ZC6A 3CJAA 3UKRA 3HI0A 3GL1A 1V4SA 2EWSA 5BPMA 3VEWA 1E4FT 2E2PA 4QS9A 2V52B 3O6WA 3H3OB 4B1XB 1OKJA 4BR7A 4Z94A 4H0OA 3LDLA 1NBWA 4FSVA 4BR0A 2CGLA 4PL7A 3CERA 3H6EA 5B8HA 3MN7A 4WQ4C 4O8KA 3ZX3A 4EFHA 4H5WA 4WQ4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IKXA 1NMNA 3KHYA 5AQWA 4W5TA 4DU4A 4BRPA 1DEJA 3VQDA 1HKBA 4BRNA 2ZJQL 1U2VA 1T03A 1YJNN 4ILHA 5AFUA 1EQYA 1BI4B 2RHKA 3ZEUA 4Y1DA 1NMDA 3CMAN 2G8FA 3VPZA 2PYJA 1SL0A 1K73O 4KRFA 2P9NB 3EN9A 5JS2A 3DLBA 3WXLA 3HSTB 4JI1K 4CJPA 3WUHA 4FK0A 1NK9A 3BZCA 4B9VA 2IC3A 3DLLL 5KGXA 3ZSOA 3OA9A 4CFDA 3AVJA 1RBRA 1TK8A 2YHBA 3L6QA 4H5VA 4F2SA 5FLXO 3BF3A 1IBLK 3PIOL 2G8KA 1TV6A 2X78A 2PY5A 3K58A 4WFNL 1HNVA 3AO5A 1TK0A 2O8EB 1NKBA 4PHTX 4YOYA 4FPBA 3OS1A 3Q7BA 3ZT0A 1BI4A 2E2OA 1X9WA 3IMXA 4B9LA 1D5AA 3PO4A 5HLFA 4LC9B 4Y0WA 3O4QA 3T19A 3NVKA 3QEPA 1RILA 2P9NA 3IRXA 3QESA 3E01A 3ATVA 3KK1A 5FPMA 1C1BA 2QXLA 3PX0A 5AQKA 2B4JA 2F4VK 3RSEB 2HMPA 2HNYA 4I7FA 2A42A 4YDUC 3ZSZA 4C1NK 1NOYA 3KLIA 2HB5A 3EEQA 1ZBFA 4WQ5A 4CK1A 3A5MC 3KK2A 2VWBA 3K5LA 3CCJN 4ISFA 4DSJA 2IGIA 1HX1A 4PA1A 1IBKK 4BRGA 2YX6A 1WSHA 3CJBA 3IG1A 3WNHA 4AHUA 3TAGA 3T69A 5TKWA 2Y1JA 1D4XA 3QIPA 2VQFK 4IFEA 4A61A 1X1PA 4E19A 3CJ7A 1EWRA 3TSUA 1XMQK 3DXMB 2IDOA 5C2DA 2OPQA 5GADP 5EY4A 4F4KA 5I3UA 4DTSA 5AZJB 4JK8A 4V19S 5KPRA 3ALYA 3ENOA 4B9MA 1NLVA 4BG8A 2BANA 2XY7A 3UKUA 2HHHK 2P51A 3QBXA 3K2PA 4FK4A 3RSEA 4B3RK 4MO5A 3CFPA 4DUZK 3TAFA 1ILYA 2IIRA 3HK2A 1VQON 2ZJRL 3O4NA 1E3MA 3VF4A 2HW3A 5HOOA 1RTIA 4AM7A 4J2AA 1YXQA 4PKHA 1HPMA 2DFFA 2G8WA 4PQUA 4BRKA 3LP3A 4BRCA 1JLBA 2P9UA 3EKUA 5CR4A 3VESA 3EYZA 2WOMA 4OGCA 1SKSA 2VG7A 4IJAA 3DXMA 3VTHA 3C95A 1SL1A 3SQ2A 3CPWM 3AVNA 1RGIA 4A5BA 5AZJA 3P83D 4DTPA 1HNZK 1Q86O 1J54A 3O9SA 2RKIA 4O44A 4PWDA 4EHTA 4OPHA 5BN8A 4O8UA 5AFUH 3THXB 4JKFA 1WUAA 3HP6A 3T1YK 1NGFA 1RT6A 4EP4A 3CYMA 1NOZA 3THWB 3SAHA 3D2EB 1OH7A 4KKOA 3AA5X 3AVGA 1XMOK 3VQ8A 1RT4A 1N36K 1OH5A 1T44A 4PL8A 2R7YA 3JS6A 1T6DA 4CZJA 1KSPA 4ISGA 1YIJN 3SMPA 1S9GA 2HHTA 1ATNA 2VWKA 1TKDA 3PSFA 4H0TB 2FBTA 4FL9A 2BDPA 1U47A 3I0SA 5HRNA 3H1QA 1VQLN 5GINA 4RW7A 2WUSA 1X9SA 4FJNA 4IFYA 1R59O 3J8AA 1LOTB 4OO1J 1ZXOA 3NF7A 2NNWA 4DSLA 1W97L 3K57A 3NF9A 5HRPA 3THXA 3OJSA 4O55A 1QQNA 4BACA 3HRGA 3KTQA 3LP2A 3THWA 1NGCA 3CMEN 4JI4K 4BVOA 4HTUA 3GE1A 4BY9C 4E7HA 1HNWK 3THYA 5JLFA 4RCHA 4IOCL 1RDAA 2Q3SA 3HPOA 4GY2B 4FJHA 3CIPA 4DQRA 4FLYA 4H4MA 2Z1HA 4N5SA 1NJIO 3J7YP 5BRFA 4PUOA 3ITHA 2FSNA 4C23A 2EHGA 1JL1A 1G15A 1VQ8N 1NGJA 3SYZA 4CJ4A 1YITN 4ILGB 5ELZA 4CBUA 4KV8A 2HHVA 4FLVA 4KI4A 1OH6A 4I9QA 1NWKA 2B6AA 2HBKA 3K9KA 4CHNA 3CM6A 1M90O 4LF5K 5AQYA 3OYNA 1RBSA 5JMVA 3GDQA 4FXDA 3P39A 5HP1A 4K8XA 3OYIA 3AO2A 4H0VB 4AH9A 3ZETB 4JKHA 1GLEG 1BIZA 3DXKB 3VOVA 4FWOA 4XIUA 3D45A 4A57A 3OYGA 1P90A 3RR7A 3M1FA 1NKEA 3E1YA 4B9TA 4IJNA 5KTQA 4M45A 4RG8A 4QAGA 4JI6K 1NGAA 4M7YA 2FLOA 3U8XA 4IOXA 4E1JA 1W0HA 5BRHA 3NHGA 2QWRA 1SAZA 4YFUA 3O9RA 5KRTA 3T3FA 1CXUA 1ZBIA 2A41A 4DTRA 1TUUA 1HQUA 3WXJA 3QERA 1J9AA 2KZZA 3NE6A 3EE9A 3WT0A 3DRPA 4W5RA 3L2WA 3THVA 3ZX0A 1RBUA 2WONA 2OTJN 2UUCK 1QSSA 1M1KO 2P9LB 3TAMA 4LF9K 3ZETA 5CY4A 4FWRA 4RWTA 1I39A 2D5RA 4JHDB 3G71N 1NGEA 3DXKA 3PSIA 3W0LA 1VK0A 3O4WA 4WF9L 2XY8A 3R1XA 4JI8K 3O80A 3WNGA 2OPRA 3FZLA 4AILC 2HSTA 5FDLA 1RBVA 3SAFA 4NXNK 3RMDA 5GAGP 3SPYA 4CJ3A 2E1YA 3G10A 1WN7A 3VGMA 3LDSA 1V4TA 2FBXA 4Z4HA 1CZAN 3M8QA 3OHRA 3SJHA 1IG8A 2ZWHA 4JEPA 1KD1O 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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