4ISEA

Human glucokinase in complex with novel activator (2s)-3-cyclohexyl-2-(6-fluoro-4-oxoquinazolin-3(4h)-yl)-n-(1,3-thiazol-2-yl)propanamide
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
457
structure length
427
Chain Sequence
KPMPLTLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKACMLGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Design, synthesis and SAR of novel glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase/transferase activator
source organism Homo sapiens
total genus 163
structure length 427
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iseA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4iseA01
4XH4A 4BQLA 3H1QA 2GWKA 2QWNA 3D2FA 3DXKB 1K8KA 3A8YA 3AARA 1SQKA 4MLEA 5F1XA 3MK6A 4CBXA 3HZ6A 2E88A 2V7YA 3R9PA 1Z05A 1HJOA 5TKYA 1QHAA 4FWMA 3ZX2A 4PKHA 1NGGA 4NB4A 3U8XA 1SZ2A 5JLHA 5AQKA 4H5VA 1V4SA 5AQNA 3GG4A 5AQGA 5AQWA 3VF2A 4CJ7A 4EHUA 3HTVA 4EIAA 5I9EB 5AQJA 5BPLA 3VENA 3VETA 2NZTA 4B1XB 5AQZA 5AQMA 4FPAA 3HM8A 1IJJA 3FZLA 3O5BA 4A62A 1E4FT 3ZETB 1NGEA 1HLUA 4PL8A 2YJFA 3O1BA 4BG9A 3JXUA 1U2VB 4ISEA 2NRHA 3LDNA 5KPRA 3CJ9A 5AQTA 1NGHA 3GBTA 2A40A 2D0OA 3O8MA 3ID8A 3CQXA 4FOIA 3UKRB 4H5WA 4H0TB 3WQTA 4BC3A 3G25A 1YVNA 1P8ZA 5AQQA 1ATSA 3VF6A 4DQ8A 3VGKA 4JAXA 4JNEA 3FE1A 5AQXA 3A0IX 3H3OB 1Z6RA 3WXJA 3LDLA 2Q36A 5BPMA 1QQMA 5BN8A 3OHRA 2P9LB 3QFPA 4H03B 4H5RA 5BRHA 1HUXA 5AQLA 3TPQA 4BG8A 4AM7A 1BO5O 1HKGA 4B1WB 1NGBA 1NGFA 3L6QA 4M63C 5EX5A 5B8HA 1GLCG 4K42A 3JS6A 3IMXA 1ZC6A 3M3ZA 4MO4A 3D2EA 3VGLA 3D2EB 3ZX0A 1ATRA 4H0VB 2E1ZA 2P9KA 5EVZA 4BGBA 2P9KB 4C23A 5KPTA 2BTFA 3SMPA 3FZFA 5FPEA 2Q0UA 4M7XA 3CERA 3DXMA 4BC2A 3CETA 5AQHA 3EKUA 4CD1A 2D0PA 3KVGA 4GY2B 2D1KA 2P9NA 3VEYA 1Y64A 3MDQA 4BRPA 1KAXA 2P9PA 3D7EO 4CZJA 1NWKA 2A3ZA 1T6DA 3WT0A 4BC5A 3RSEA 1JCGA 3CQYA 3EZWA 1NM1A 4H0YB 2GTDA 2I7PA 5BN9A 3HBTA 3FR0A 3EO3A 1OKJA 3H45C 3DAWA 3CJAA 1RFQA 4FWOA 3O80A 4BR0A 2A5XA 4I6MB 1BA1A 3I8BA 3ATUA 5AQSA 3W3DA 4CZHA 2H3GX 5FPMA 5ADXA 1G99A 1X9JA 5AZIB 3WEEB 4FSVA 1GLFO 3MN7A 1R59O 4FL9A 2ZWHA 5KQ8A 4EAHD 3DXKA 1GLBG 4CI6A 2E2NA 3QDKA 4O5FA 2E2PA 4QS9A 5BR9A 4IWVA 4FWPA 2HMPA 4B1UB 3QMLA 4Z94A 1MA9B 2E2OA 3CHWA 3QB0A 5EY4A 3VOVA 4CZIA 4JHDB 1WUAA 4RTFD 4WYBA 3BUZB 2CGKA 2FLOA 3ZEUB 4PKIA 2CH5A 4BRHA 4RWTA 3WUHA 2ITMA 5F2RA 4K43A 5KPZA 2FSKA 2FSJA 2IVOA 5AFUA 4B1ZA 5ADXH 4BRQA 2P9IB 3H1VX 3EL2A 1GLAG 1HKBA 5FPDA 4J8FA 1GLDG 3BP8A 3IFRA 2ASOA 3GDQA 3A5NC 1HKCA 1TUYA 3A5OC 2YJEA 3F9MA 3ZETA 5CE3A 3VEOA 3GOIA 1NGDA 1U2VA 2BUPA 4WQ4C 4PL7A 2V7ZA 1CZAN 3BF3A 3WXLA 4NO7A 3VPZA 3EKSA 3ENHA 3VF4A 4HTLA 5AQRA 4DHYA 2ZGYA 1ATNA 1QQOA 4DB3A 4B1VA 3UKRA 3QBWA 2IVNA 1RGIA 3W0LA 3FZMA 5ELZA 3VEWA 4BRGA 4WQ5C 1J6ZA 3UKUA 1JCEA 3VGMA 3UKUB 1U6ZA 1BDGA 1GLEG 1NGJA 4IJAA 3VESA 5AFUH 3CJ1A 2F9TA 4RCHA 2FF6A 1DKGD 4K41A 2QWOA 2QW9A 2VCPA 2HF4A 1LOTB 3BF1A 2P9LA 4WQ4A 4E1JA 1YXQA 2AP1A 4FO0A 2P9UB 3CJCA 1D4XA 5LY3A 1NGCA 1BOTO 2QM1A 3QBXA 4JN4A 3GE1A 5AZJB 4Y0WA 5AQOA 1S22A 2KHOA 5EOYA 5BRDA 4YDUC 4WQ5A 1Q18A 3VEVA 3AY9A 4FWSA 1ZBSA 4A2AA 1C0FA 3P4IA 3U9DA 1QZ5A 2CGJA 1NMDA 2FF3B 4FWRA 1H1VA 2FSNA 4FPBA 5BRFA 1NGIA 4QS8A 4FWNA 3EN9A 2DPNA 5E26A 2GWJA 4F9OA 2YI1A 3SK3A 1RDWX 1EQYA 1GLJO 3DJCA 3H6EA 5LJVA 3J8AA 4MO5A 3B8AX 1WOQA 3UE5A 5AQPA 4L3QA 4BRLA 3MMVA 3ULEA 3LDOA 1ZXOA 4BREA 3ULEB 2EWSA 2IIRA 4BRKA 3U9ZA 5JICA 3L4IA 4YDUA 4BGAA 5AQFA 2GELA 3O1WA 3TU5A 1C0GA 3A5MC 1HX1A 4I6MA 3R8EA 1DEJA 2GUPA 3WXIA 4BVOA 5AZIA 3WEEA 4XH5A 4FWLA 3ENOA 3AAQA 2YHYA 4BRNA 4AM6A 2PAVA 4EHTA 4LC9B 1QZ6A 1X3MA 4CZFA 3LM9A 1TYQB 5JLFA 3I33A 2Q0RA 2FXUA 3KHYA 3MCPA 3HSCA 5F0XA 4A61A 4BR7A 4K25A 2ZGZA 4JHDA 4QS7A 4CZEA 3ZEUA 3LDQA 4BRAA 4CZMA 4BRCA 1DGKN 1IG8A 3C7NB 2YHXA 2P9IA 3H3NO 3D2FB 2HOEA 1K8KB 3IDHA 1MDUB 5LJWA 4BR4A 4DCHA 1E4GT 2Q2RA 2A41A 1NLVA 2ASPA 1MWMA 2F9WA 2V51B 2QWRA 2QWPA 3O6WA 2QWMA 1NBWA 2Q1NA 2UYTA 2J4RA 1LCUA 4ISFA 4BQZA 3C0BA 1BWFO 4H0XB 4IJNA 2CGLA 2VWBA 5JMVA 4O8KA 4H5NA 5AQUA 4BR9A 3SJHA 2QXLA 3FZKA 4BROA 3M6GA 3MN6A 2CH6A 3U4LA 4KBOA 3FZHA 4BRIA 3MN9A 1TUUA 4M7YA 3ZX3A 3FGUA 4CD3A 2D4WA 4CZLA 1XQSC 3L0QA 2WUSA 1YAGA 2P9UA 1KAZA 2OANA 1XC3A 3O08A 1MWKA 4H5TA 4JD2A 1BG3A 2QWLA 4JD2B 2A42A 4BRMA 1BUPA 1V4TA 5AZJA 3SLCA 1ESVA 5BREA 4PKGA 3S41A 1T44A 4IXCA 3CJBA 4XEIA 3O4WA 5E84A 4IZ9A 3VERA 3UB5A 4BR5A 2GEMA 1X3NA 2ASMA 2A6AA 3LL3A 4B9QA 3LDPA 2Q31A 5EXWA 3GL1A 5BPNA 2VYPA 3VEZA 3CIPA 4GNIA 4HWIA 3A5LC 4BRDA 3ATVA 3CI5A 4XH1A 4EFHA 1HPMA 3BEXA 1GLLO 3VEXA 3SMSA 2ZF5O 3KZBA 4MLHA 5KQDA 2E8AA 5FPNA 2W41A 3DWLA 5AQYA 1BU6O 2PBDA 4ISGA 4BVPA 1KXPA 5AQIA 4H0PA 3QICA 1YUWA 3H46O 2NLXA 4FWQA 3DXMB 2AA4A 4BR2A 4FWKA 1XUPO 2E20A 2P9SA 4BRFA 2P9NB 1KAYA 4FOEA 2P9SB 3FLCO 2E2QA 4BC4A 3QFUA 2P9PB 4CZKA 2QWQA 2YHWA 3R6MA 3M1FA 4CBWA 1T6CA 1TYQA 4A2BA 3RSEB 1JCFA 5AQVA 2Q97A 4B1YB 3HI0A 1SAZA 2IVPA 1BA0A 2HF3A 3AAPA 3LM2A 4H0OA 2YCHA 1NGAA 3WQUA 4IO8A 5AR0A 3IUCA 3CJ7A 3MN5A 4CZGA 1QQNA 3FFKB 4CBUA 2E1YA 1S3XA 2I7NA 2V52B 3WXKA 3C7NA 2W40A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K59A 2UUCK 3V9ZA 5J1EA 3QEXA 2A1SA 4C1NK 3E1YA 1ASUA 1WLJA 3SUPA 3AARA 1BQNA 2O8CB 4MLEA 2O4GA 3HZ6A 5FLXO 3VQ9A 4IDHA 4FJ9A 1Z05A 2UXBK 4PKHA 4GVEA 3U8XA 5C0YA 4DTUA 5AQGA 3HTVA 3AVGA 3VENA 5M1NA 5AQZA 1Q9XA 4FPAA 3TAQA 3HM8A 1IJJA 3FZLA 3ZETB 1HQEA 1NGEA 1HLUA 3O1BA 3SJJA 4ISEA 3OS0A 2OZSA 3LDNA 5KPRA 1S1UA 3CJ9A 1NGHA 2NRRA 1UA0A 2A40A 2D0OA 2D0CA 4N47A 2E5LK 3O4QA 2E6LA 3ID8A 3OYMA 1HYVA 4Q0BA 4CK2A 4ZTJA 1S1TA 1P8ZA 1VRUA 3EZ5A 2BANA 5CYMA 4JAXA 3FE1A 5AQXA 4F4KA 3CYMA 3H3OB 1Z6RA 4IDKA 2ZJQL 4KI4A 5BPMA 3NGZA 3VQDA 1UOCA 4N76A 1TKTA 1U47A 3AGKA 1VQ8N 4KB1A 3KLFA 3SBGA 4H03B 1HUXA 5BR8K 1HKGA 3QINA 1NG9A 4LSLA 1IKXA 3L6QA 2RN2A 5EX5A 3VQBA 5B8HA 3JS6A 2XY7A 4CEFA 1IKVA 4YNQA 1NJWA 3VGLA 1QS4A 3L4QA 4CECA 3ENBA 4KPYA 2HNYA 4H0VB 2OPRA 3IAYA 1KFSA 5KPTA 2BTFA 4DF4A 3P83D 1VRTA 3QEWA 5DK5A 3FZFA 4DU1A 4JI1K 4M3RA 3CERA 4M42A 5CHIA 4PHTX 3CETA 5AQHA 3EKUA 1N8RO 2P9NA 3VEYA 4IEEA 2HBLA 5J2PA 4M3WA 3RMCA 2KFNA 4CZJA 3SI6A 1NWKA 3IG1A 3WT0A 1T7PA 2DY4A 1NM1A 4FK2A 1J5OA 4H0YB 4Q5VA 1KVAA 1U45A 1OKJA 3CJAA 4DF8A 1RFQA 2ZQBA 4BR0A 2IDOA 1BA1A 3AVFA 3ATUA 3AO4A 5AZIB 3HSTB 1X1PA 1YTUA 3J7AP 3NF8A 3VQCA 2X78A 2ZWHA 3R3LA 1GLBG 4CF9A 1RT6A 3SV3A 1JLEA 4O5FA 2E2PA 5D3GA 4CHYA 3OYAA 3QNOA 5BR9A 4Z4FA 1W9HA 4FWPA 2HMPA 4JKAA 4Z94A 1MA9B 3OJSA 1KLMA 3BUZB 1U04A 3ZEUB 3HP9A 4AH9A 5DM6L 4BRHA 4O4GA 2ITMA 4JI2K 4LH5A 3T1YK 1NK0A 3VQ8A 2IVOA 2QKBA 3H1VX 3EL2A 4RW6A 4J8FA 3ZT0A 4KO0A 3JYTA 2YJEA 5CE3A 4JKGB 1LW2A 1NGDA 1U2VA 4WQ4C 1C1BA 3VQ5A 4B9MA 4CEQA 4LF6K 3WXLA 3SUNA 3VPZA 4HTLA 3DLGA 4KFBA 4DHYA 4DUYK 2WOMA 4F2RA 1ILYA 1VQKN 3EEQA 1HNWK 3V9WA 1XMOK 3S3OA 2KQ2A 3KLHA 4JI3K 3ULDA 1GLEG 2D5RA 3SAHA 4K41A 3NGYA 1WSGA 1S1XA 4FCYA 2F8TA 4PQUA 4E1JA 3OS1A 2P9UB 1D9FA 1XWLA 1J54A 3GE1A 2VQEK 5AZJB 4NLCA 5AQOA 3SNNA 4B9UA 4H4MA 5C2DA 3BZKA 4WQ5A 4YFUA 3AY9A 2OA8A 4FWSA 1C0FA 4AHRA 2DFEA 2FF3B 4FWRA 4R5PA 4FWNA 4B9TA 3EN9A 4JLHA 2DPNA 5KGXA 4DV2K 1D9DA 2YI1A 4LFAK 1Q7YO 4KH5A 3AO3A 2G8FA 1GLJO 4M3UA 3H6EA 4B3MK 3DI6A 1WAFA 3ULEA 4BREA 3ULEB 5I3UA 4OGCA 1X9MA 1W97L 4B8CA 2EWSA 3DLRA 2IIRA 4BRKA 3U9ZA 4FLYA 3NF9A 3V1OA 3L2QA 1Q82O 3O1WA 4BDZA 1HX1A 2F96A 2BDPA 2YV0X 4CVNE 4O0JA 4BVOA 4CEOA 3AAQA 4M41A 4OKKA 1EXQA 5LMUK 4HHTA 1BI4A 3VQ6A 4DMNA 4J2DA 4YOWA 1BI4B 4B8AB 1FK9A 4HCBA 3OW2M 3MXMA 5JLFA 2Q0RA 3KHYA 3MCPA 1C1AA 1RNHA 3BZCA 3L3VA 4A61A 2Z1JA 4BR7A 1SKSA 1OH7A 1M1KO 3AVLA 4A5AA 1JL1A 2XY8A 3OYDA 3ZSXA 2A1RA 5JVHL 2HHHK 2P9IA 1FKPA 3D2FB 4I9QA 3IDHA 2UUBK 3ZSZA 4BR4A 1IKYA 3V1QA 3HM9A 2F9WA 2GUIA 2DFFA 2V51B 3O6WA 4CGGA 1RBRA 2HSTA 2OPSA 2BE2A 2Q1NA 3F5TA 2J4RA 4JK9A 1BWFO 4H0XB 3PSIA 3NAEA 1Z26A 3TAPA 2WC9A 5M1QA 1OH8A 5JMVA 4E0DA 4BR9A 3O3GA 1G15A 3ZSRA 3SJHA 4DKWA 3FZKA 3M6GA 5GADP 2D0AA 3ZSVA 4RW9A 4U67L 4DV4K 3PO4A 3LP0A 1O13A 4J2BA 4DFKA 4ELUA 1GOCA 1KAZA 1GOAA 4CF8A 3PX0A 2G8UA 2PYJA 4CHNA 1BUPA 4DR3K 4EZ6A 2B4JA 4DS4A 1TK5A 5FRMA 1SV5A 3C95A 3O9RA 4PKGA 3S41A 1LWCA 1T44A 4CERA 3HPGA 2YKMA 3O4WA 2O8BA 5KTQA 4IZ9A 2GEMA 2WFBA 2ASMA 2A6AA 3ZSQA 2X6SA 3LL3A 3B6OA 3MEGA 3O3HA 1NJZA 3LDPA 1IKWA 4FJGA 3EYZA 2VYPA 5GINA 3CM6A 4HWIA 3OS2A 4E7HA 1HQUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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