4ISEA

Human glucokinase in complex with novel activator (2s)-3-cyclohexyl-2-(6-fluoro-4-oxoquinazolin-3(4h)-yl)-n-(1,3-thiazol-2-yl)propanamide
Total Genus 163
50100150200250300350400020406080100120140160
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
457
structure length
427
Chain Sequence
KPMPLTLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKACMLGQ
50100150200250300350400400300200100
050100150Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH1 (14-22)S8 (230-237)AH7 (272-280)EMPTYAH2 (27-45)TIV3 (226-229)S7 (220-226)TI1 (46-49)TI6 (217-220)3H1 (50-52)TVIII1 (53-56)AH6 (205-216)AH14 (419-430)S1 (58-63)S3 (83-92)TI4 (80-83)TIV1 (66-69)S2 (73-79)AH13 (411-415)TI3 (68-71)TVIII2 (69-72)S10 (402-409)TIV2 (93-99)AH3 (112-116)3H3 (257-259)AH5 (181-192)TII1 (259-262)S6 (197-199)AH12 (361-397)TI7 (241-244)3H2 (238-240)TVIII3 (242-245)S9 (250-254)TIV7 (294-297)TI8 (261-264)AH8 (288-292)3H4 (267-269)TI9 (264-267)TII3 (326-329)TII2 (283-286)TIV6 (285-288)3H5 (316-318)AH9 (297-312)TI5 (139-142)S4 (100-109)AH4 (119-137)TIV5 (281-284)AH10 (332-340)TVIII4 (328-331)AH11 (346-355)3H6 (323-325)TII4 (416-419)S5 (144-150)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transferase/transferase activator
source organism Homo sapiens
publication title Design, synthesis and SAR of novel glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 163
structure length 427
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iseA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4iseA01
1BOTO 4EHUA 3JS6A 2Q0UA 4JN4A 1BDGA 3ULEB 5AQVA 3ENOA 4WQ5A 4CD1A 3KZBA 1BWFO 3FFKB 3MN6A 5AQZA 5AQHA 1R59O 2QWRA 3LM2A 3O08A 4J8FA 3GDQA 4B1YB 2Q31A 5KQ8A 3FZLA 4DQ8A 4QS7A 4BRMA 5EXWA 4MLEA 4IZ9A 4BR9A 2Q36A 3D2EA 5AQIA 5ADXA 3O1BA 4BGAA 3D2EB 4AM7A 5AQUA 1GLLO 1QQOA 2PAVA 4M7XA 5AQWA 4ISFA 1GLCG 2QWQA 1HKCA 2D0PA 5LJVA 1JCEA 4B9QA 3ZX2A 5AQPA 1QZ6A 4YDUA 2P9IB 3AY9A 5TKYA 2V52B 5FPMA 3VF2A 4WQ4C 5E84A 2V7YA 4Z94A 2E20A 1ATRA 1RFQA 3F9MA 4FWPA 3RSEA 4FOIA 4FOEA 2E8AA 3BEXA 3AAPA 3G25A 4PL8A 3RSEB 1KXPA 4BRNA 3WT0A 5AFUA 2CGKA 3IMXA 4BVPA 3W0LA 1BO5O 3LL3A 3R9PA 4NB4A 2IIRA 4M63C 1DGKN 3HI0A 4B1VA 4BR4A 5AQXA 4PKHA 2GELA 1ESVA 1GLEG 3BF1A 2P9NA 4EHTA 3DJCA 3AAQA 2OANA 5ADXH 1MWMA 4RWTA 4JD2A 2P9NB 3H46O 5AQQA 4BC4A 4CZMA 4H0TB 3WXJA 2WUSA 5EX5A 4EIAA 1NWKA 3W3DA 4BREA 1H1VA 4CZGA 4JD2B 5BPNA 3KVGA 2ZWHA 1BA1A 2YCHA 3UKUA 4BRPA 4CI6A 1YAGA 3H3NO 3EKSA 2QWOA 4FL9A 3BP8A 3UKUB 5ELZA 1NGHA 4CBUA 1MWKA 4I6MB 5BRHA 1RGIA 3ZX0A 2GUPA 4PL7A 1QQNA 5KPTA 3VENA 4WYBA 3WEEA 3O1WA 4K42A 4BRFA 1Y64A 4IO8A 1NGEA 3QFPA 1T6DA 3WEEB 1NM1A 4NO7A 4XH1A 3MMVA 4JNEA 1U6ZA 2I7NA 3VPZA 1MA9B 4CZFA 3IFRA 3LDQA 3VF6A 3VEXA 1T44A 2P9UA 4CZHA 4IWVA 2IVNA 5I9EB 1WUAA 3GOIA 4EFHA 1NGCA 4H0YB 5AZIA 2NZTA 1T6CA 2D1KA 2P9UB 3SMSA 1S22A 1BU6O 4K41A 1LCUA 4XH4A 4FWSA 2QXLA 2FSNA 3CQYA 3ENHA 1LOTB 3L0QA 1JCFA 1E4FT 5F0XA 1X3MA 1BG3A 3O80A 4B1WB 3VGKA 3CQXA 2BTFA 3CJAA 4WQ5C 5AQMA 5JMVA 4BGBA 2Q97A 2W41A 4FO0A 3ID8A 5AQYA 2FXUA 4CZIA 5BN8A 1HX1A 2ASPA 3P4IA 3QB0A 4CZKA 1JCGA 1HKBA 4JHDA 2CH5A 3CJ9A 1NGBA 4GY2B 2W40A 1NGIA 1ZXOA 4FWRA 4JHDB 3A5NC 3U9ZA 4DB3A 4RCHA 4BG9A 5FPNA 2D0OA 1XC3A 4BRDA 1HPMA 3FR0A 5KPRA 4MO4A 5AQJA 3U9DA 5BN9A 3FZFA 1RDWX 3FE1A 2Q1NA 4IJNA 4BRIA 3H3OB 2YHYA 3FZMA 3VEVA 3B8AX 3WXKA 4YDUC 2PBDA 4H0OA 3D2FA 3L4IA 3FLCO 2QWNA 4L3QA 3UKRA 1S3XA 2AP1A 3MN5A 3SK3A 1BUPA 3LDNA 1NGJA 3CERA 3CHWA 5AQTA 3CJBA 5FPDA 4FWMA 1XQSC 1YXQA 2E2OA 3UKRB 4H0XB 4BC5A 1SQKA 5BPMA 4B1UB 4H5WA 2P9KA 3A8YA 2P9PA 4MO5A 5F1XA 4BRQA 2FF6A 3ATVA 3H45C 3WXIA 2P9KB 4BR2A 3VGLA 4BC2A 3VEZA 2E2QA 3MN9A 3VEOA 4BRCA 1KAZA 4O5FA 5JICA 3L6QA 1OKJA 5BRFA 2QW9A 3DAWA 5AR0A 2QWPA 4H5NA 2CH6A 3ZX3A 2HF3A 1GLBG 3TPQA 1WOQA 4H5VA 3SMPA 1BA0A 2HOEA 4FWLA 3S41A 1QQMA 3UB5A 1V4TA 1NGDA 3KHYA 3GL1A 4JAXA 4EAHD 3QBWA 3WUHA 1YUWA 4M7YA 1ZC6A 4BR7A 1U2VA 1V4SA 4PKIA 3MK6A 3EO3A 3I8BA 1G99A 4BRGA 1U2VB 3UE5A 3TU5A 1GLAG 4BQZA 3A0IX 1J6ZA 1NGGA 5AFUH 2V51B 4CZLA 2D4WA 3MCPA 2A6AA 4BQLA 2YJEA 3AARA 3CJ1A 1Q18A 3VETA 1TUYA 3DXKA 2QWMA 4A62A 3H1QA 1GLFO 2HMPA 2UYTA 3VGMA 1CZAN 1XUPO 3I33A 4KBOA 3U4LA 2YI1A 2A42A 4HWIA 2GTDA 3FZHA 2GWJA 4BRLA 4FWNA 2CGLA 2FSKA 3FZKA 1C0GA 1TYQA 1SAZA 1HUXA 5AZIB 2EWSA 4O8KA 5KPZA 5EOYA 2H3GX 3HSCA 1KAXA 3D7EO 5JLHA 3FGUA 4CBWA 3H6EA 2Q0RA 4F9OA 2V7ZA 1KAYA 4C23A 3HBTA 5KQDA 4FWQA 3O5BA 3R6MA 3A5LC 3CJCA 1DKGD 1NBWA 2BUPA 2F9WA 2A5XA 3O8MA 2YHXA 2NLXA 4BRKA 4FWKA 5F2RA 3JXUA 4IJAA 1HJOA 3OHRA 4H03B 4DHYA 4CJ7A 5FPEA 2P9SA 3CJ7A 4FSVA 5EY4A 2ZGZA 3U8XA 1NGFA 3QFUA 3ULEA 2P9SB 5LY3A 3DXMA 5CE3A 2QWLA 3EZWA 3VOVA 2HF4A 4XEIA 3DXMB 1HKGA 3EL2A 3O6WA 1IJJA 5BPLA 3QICA 2ZGYA 3VEWA 3WXLA 1E4GT 1Z05A 3QDKA 3D2FB 1K8KA 2FLOA 1TUUA 4GNIA 5LJWA 5AQLA 4H0PA 2ASMA 2E1YA 1K8KB 3M1FA 3O4WA 1EQYA 4B1XB 4CD3A 1MDUB 5AQOA 4PKGA 2P9IA 3CI5A 4RTFD 4CBXA 2P9PB 2E1ZA 4Y0WA 5B8HA 5AQGA 2VYPA 4XH5A 3ZEUA 2A40A 4K43A 2ZF5O 5AQFA 3SJHA 3ZEUB 4K25A 4MLHA 3A5MC 4WQ4A 5BR9A 1YVNA 3EKUA 5JLFA 3LM9A 3R8EA 5AQRA 3LDOA 2ASOA 2F9TA 5AQKA 3QBXA 4BVOA 1DEJA 4BG8A 4A61A 4A2AA 1D4XA 4CZJA 2FF3B 1GLJO 2YHWA 3QMLA 3MDQA 3C0BA 1QZ5A 1NMDA 2A3ZA 1NGAA 3HM8A 4IXCA 3M6GA 4E1JA 5AQSA 1QHAA 3LDLA 3IUCA 3SLCA 3DWLA 3VF4A 2QM1A 3WQTA 5BREA 1SZ2A 3WQUA 1Z6RA 3BF3A 1ATNA 5BRDA 2P9LA 3H1VX 4A2BA 4I6MA 1IG8A 3ZETA 3ATUA 2I7PA 1X9JA 2P9LB 3GG4A 4ISEA 4QS8A 4B1ZA 4BR0A 3ZETB 4FPAA 4LC9B 4H5TA 2VWBA 3IDHA 3GBTA 3EN9A 2A41A 3DXKB 4DCHA 2KHOA 3CIPA 2NRHA 3J8AA 1ZBSA 5EVZA 4FWOA 3MN7A 4AM6A 5AZJA 4CZEA 2VCPA 1C0FA 4FPBA 5AQNA 1NLVA 2FSJA 2GWKA 1TYQB 5AZJB 2J4RA 4QS9A 3VESA 2CGJA 4BRHA 2E2NA 3VEYA 2DPNA 3CETA 4ISGA 4BRAA 4HTLA 5E26A 2YJFA 3HTVA 4BROA 1ATSA 1HLUA 3VERA 2IVOA 1X3NA 2E2PA 3HZ6A 4BR5A 4H5RA 3LDPA 3C7NA 2IVPA 2ITMA 1GLDG 1P8ZA 3BUZB 2AA4A 3M3ZA 3GE1A 2GEMA 3C7NB 4BC3A 2E88A 3A5OC 4H0VB 2Q2RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4EHUA 3KK2A 4DU1A 4FJHA 1TGOA 4JN4A 1BDGA 2NRRA 3ENOA 3VQ8A 3S3NA 4FK0A 3KZBA 1BWFO 3EY1A 3FFKB 3HM9A 3VQBA 1W9HA 3LP2A 4E1NA 1NJYA 4B1YB 3GDQA 5KQ8A 3TTFA 2BDPA 3AGKA 3CM5A 4IZ9A 4DSIA 3D2EA 1YITN 5ADXA 3NH0A 2KTQA 4O5BA 2OYQA 1NU0A 3M5RA 1U45A 1RDCA 4BDZA 3KTQA 4DF4A 4O44A 5AQWA 1WSJA 1IKYA 2P1JA 1HKCA 2D0PA 1FXXA 4DR5K 1JCEA 3O3FA 3ZX2A 4DTPA 4CHOA 3CCJN 1QZ6A 5TKYA 2V52B 5FPMA 3VF2A 5CYMA 2P5OA 4CIFA 5LMUK 2RN2A 4HUFA 1RFQA 3R3LA 1BI4A 4OJRA 3AAPA 3RRHA 3TI0A 4E1MA 3AVBA 3SJJA 4KTQA 3E1YA 3KLFA 4GW6A 4BWJA 3IMXA 4BVPA 4BR4A 2VQFK 4FM1A 4PKHA 2NRWA 4AILC 2HHSA 4OKEA 5DMRA 3ZSZA 1GLEG 4YOUA 4DSFA 3TAFA 3DJCA 5E41A 1MWMA 1KFDA 4RWTA 4JD2A 4CZMA 2HHVA 1N8RO 5T7BA 5KRSA 3THXB 3WXJA 1Z26A 4BREA 4CIEA 4CZGA 3MCAB 3QETA 1BA1A 2YCHA 5DM6L 4AF1A 3EKSA 3QEIA 2WBNA 3BP8A 5ELZA 4M3ZA 3C6UA 3V9SA 4I6MB 4CGJA 4Q0BA 3OYKA 4PL7A 1QQNA 5J2QA 3AO2A 4ID1A 3VENA 4LF4K 2KKZA 3G10A 4CEBA 4BDYA 3WEEA 3O1WA 4BRFA 2D0CA 1T6DA 1F21A 3MMVA 3E9PA 3NMUA 3VPZA 4XIUA 2O8CA 4CZFA 1HPZA 3IFRA 1CZBA 3VEXA 1KVAA 4YHHK 2P9UA 3O9RA 1C1AA 4IWVA 2IVNA 1S9GA 1RBUA 3NH2A 5AZIA 2KW4A 2D1KA 1S22A 3MWTA 1JLEA 1WN7A 4CEQA 3OJUA 2FSNA 4JKGB 5M1PA 3L0QA 5F0XA 3RR7A 1BG3A 2KFNA 3ZSVA 3VGKA 4IFVA 3CQXA 3CJAA 3CPWM 4AHRA 5JMVA 5HRRA 1CLQA 5IT9O 4M3RA 2Q97A 4FO0A 4CZIA 3VA0A 1HX1A 3P4IA 3QB0A 4OX9K 3P38A 4CZKA 1JCGA 4FJNA 2HSTA 2W40A 1SV5A 1EETA 3SPYA 1ZXOA 4FWRA 3U9ZA 2FBTA 3SPZA 3FR0A 3L2RA 2NRXA 3QINA 3FZFA 1RDWX 1JJ2M 4KO0A 3VQ4A 3H3OB 2VGMA 4JI0K 3DLGA 3D2FA 3HP6A 2KFZA 2G8VA 3E66A 2QWNA 1ZBFA 3CHWA 2XY7A 3RWUA 5FRMA 4BC5A 2B6AA 3ENBA 3ID6A 1VAZA 2P9KA 1WLJA 2P9PA 1WAFA 2XY6A 4BRQA 2WONA 3HPOA 2FF6A 1IKXA 3VEZA 4DV2K 3MN9A 3NBPA 4FM0A 1TK8A 4O5FA 1C0TA 3DAWA 1IBMK 2CH6A 3ZX3A 3MXIA 1X1PA 4PA1A 1NMNA 1WOQA 1VQ7N 1XHXA 3G71N 1LWCA 5DM7L 1XNRK 3DRRA 4B9SA 1ZC6A 4BR7A 4KHUA 1JLCA 4CGHA 4W5NA 3TU5A 3KWIA 3BGRA 3PO5A 4EP5A 4FCYA 1UOCA 4RG8A 1D9FA 1OH7A 1Q18A 4CEAA 4B9NA 3DXKA 3OYMA 1L3UA 4A62A 1GLFO 2OPRA 2O8CB 3JYTA 2GV9A 1JL1A 1FJGK 3I0SA 3VGMA 1BHLA 3IKMA 4CF8A 2HHQA 2A42A 2GTDA 2O8DA 3FZKA 1ASUA 4I2PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4EHU A;  3KK2 A;  4DU1 A;  4FJH A;  1TGO A;  4JN4 A;  1BDG A;  2NRR A;  3ENO A;  3VQ8 A;  3S3N A;  4FK0 A;  3KZB A;  1BWF O;  3EY1 A;  3FFK B;  3HM9 A;  3VQB A;  1W9H A;  3LP2 A;  4E1N A;  1NJY A;  4B1Y B;  3GDQ A;  5KQ8 A;  3TTF A;  2BDP A;  3AGK A;  3CM5 A;  4IZ9 A;  4DSI A;  3D2E A;  1YIT N;  5ADX A;  3NH0 A;  2KTQ A;  4O5B A;  2OYQ A;  1NU0 A;  3M5R A;  1U45 A;  1RDC A;  4BDZ A;  3KTQ A;  4DF4 A;  4O44 A;  5AQW A;  1WSJ A;  1IKY A;  2P1J A;  1HKC A;  2D0P A;  1FXX A;  4DR5 K;  1JCE A;  3O3F A;  3ZX2 A;  4DTP A;  4CHO A;  3CCJ N;  1QZ6 A;  5TKY A;  2V52 B;  5FPM A;  3VF2 A;  5CYM A;  2P5O A;  4CIF A;  5LMU K;  2RN2 A;  4HUF A;  1RFQ A;  3R3L A;  1BI4 A;  4OJR A;  3AAP A;  3RRH A;  3TI0 A;  4E1M A;  3AVB A;  3SJJ A;  4KTQ A;  3E1Y A;  3KLF A;  4GW6 A;  4BWJ A;  3IMX A;  4BVP A;  4BR4 A;  2VQF K;  4FM1 A;  4PKH A;  2NRW A;  4AIL C;  2HHS A;  4OKE A;  5DMR A;  3ZSZ A;  1GLE G;  4YOU A;  4DSF A;  3TAF A;  3DJC A;  5E41 A;  1MWM A;  1KFD A;  4RWT A;  4JD2 A;  4CZM A;  2HHV A;  1N8R O;  5T7B A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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