4ISGA

Human glucokinase in complex with novel activator (2s)-3-cyclohexyl-2-[4-(methylsulfonyl)-2-oxopiperazin-1-yl]-n-(1,3-thiazol-2-yl)propanamide
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
457
structure length
418
Chain Sequence
KPMPLTLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESESGRGAALVSAVACKKACMLGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Design, synthesis and SAR of novel glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase/transferase activator
source organism Homo sapiens
total genus 150
structure length 418
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4isgA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4isgA01
3QFUA 1HPMA 2FSNA 4BRLA 2ZGZA 5CE3A 4H0OA 1SZ2A 1ATRA 2DPNA 3O5BA 3ATVA 4BG8A 2V7ZA 2VYPA 1DGKN 1RFQA 3RSEA 5AQLA 2Q36A 1X3MA 4FWNA 4YDUC 1NGFA 2FF6A 3A5MC 4C23A 3H1VX 4Z94A 4BG9A 5B8HA 1K8KA 2PAVA 3QDKA 4CD1A 5JLFA 2A3ZA 2P9LA 2KHOA 4IXCA 4PKHA 4B1XB 5BPMA 4DQ8A 1YUWA 4K43A 4JD2A 2I7NA 4BRNA 4ISEA 4BRQA 5AZJB 3WEEB 1V4SA 4CZEA 1X3NA 3H46O 1GLCG 4H5NA 1NWKA 3DWLA 3UKUB 1V4TA 1T6DA 2GWJA 3EKSA 3I8BA 4BGAA 4BRIA 1D4XA 2A42A 5AQFA 1GLEG 5BRHA 2P9PB 5AZIB 4E1JA 4IO8A 1NGEA 2QXLA 1GLAG 2CGLA 1GLFO 2J4RA 4H5RA 5AZJA 1KAYA 3WEEA 3HSCA 3P4IA 4PKGA 4AM7A 1NMDA 5BPNA 2YCHA 3O1BA 3HI0A 1BWFO 2IVNA 4FL9A 5KQDA 1C0GA 1BUPA 3ENOA 3IMXA 2CGKA 5AQJA 3HZ6A 3VEVA 5AQQA 2ASMA 2QWMA 4K41A 4NO7A 4PKIA 4BQLA 5BRFA 5I9EB 3CQYA 3HM8A 5EY4A 3D2FB 3O8MA 2FSKA 2P9PA 4QS8A 2AP1A 5AZIA 3TPQA 3R9PA 1DKGD 3SMSA 4BC2A 3H6EA 3VENA 4CZHA 3WXKA 3WXLA 4JN4A 3WT0A 2QWLA 3CI5A 5EX5A 5LJWA 1RGIA 1GLLO 2Q31A 5BREA 1NGCA 4MLHA 3QMLA 2YHWA 2D4WA 2GELA 2D0PA 3ID8A 3BF1A 1U2VB 1IJJA 4MO4A 4L3QA 3AY9A 3BP8A 4FPAA 4CBWA 1QZ6A 2A40A 1S22A 4I6MB 3D2FA 3W3DA 4WYBA 1HJOA 3BF3A 3FZFA 1WUAA 2FF3B 5AQZA 3MK6A 3W0LA 5AQGA 4RTFD 1H1VA 3VEWA 1XUPO 4Y0WA 4A62A 1G99A 4H5WA 4WQ5A 1CZAN 1U2VA 5AQPA 4M7YA 4CZMA 4EHUA 3WXIA 1EQYA 1KAZA 5FPMA 4HTLA 3WXJA 2CGJA 3LDLA 2Q0RA 4JAXA 2BTFA 2CH6A 2E2OA 3EZWA 4I6MA 1Z6RA 4HWIA 2HOEA 5AQOA 4B1VA 3EKUA 4B9QA 3VEYA 1HKBA 2P9NA 5BPLA 1ZC6A 3LDPA 5EVZA 3I33A 1QQMA 4BQZA 2NRHA 3FZHA 3OHRA 4BR0A 1QZ5A 2ZGYA 2QM1A 3AAPA 2E88A 5F2RA 3MMVA 2AA4A 5JMVA 2E2NA 3DXKB 2P9UA 1BDGA 2NLXA 3FLCO 1Q18A 1ZXOA 2Q0UA 1KAXA 4K25A 3VEOA 3UB5A 5KQ8A 3CJ1A 5AQKA 1TUUA 5AQTA 3GE1A 4O8KA 4BR7A 1BG3A 2BUPA 1NLVA 2D1KA 3LDNA 2W41A 3ZX2A 3FFKB 3CJBA 3JS6A 5BN8A 1E4GT 3FZKA 2V52B 4XEIA 3LM2A 3A5OC 4BR9A 2GUPA 4K42A 1JCEA 4A2AA 3GDQA 3U9ZA 5F1XA 3S41A 5E26A 5LY3A 2QWRA 4BRPA 3B8AX 1Y64A 3DXKA 3EL2A 5AQHA 5AFUA 1ATNA 2YI1A 3IUCA 3A5LC 1R59O 5AQNA 5KPZA 5FPEA 2E20A 2IIRA 3A5NC 1GLJO 2ZF5O 4WQ5C 3VGKA 3L4IA 3O08A 3CIPA 3EN9A 2YHXA 4BRMA 4B1YB 4XH4A 4JHDB 5AQSA 3BEXA 1T44A 3VETA 4GY2B 2ASPA 3WQTA 3VF2A 3QBXA 3VGMA 4XH5A 2P9KB 1HKGA 5BN9A 2FSJA 2V51B 2HMPA 5AQXA 2NZTA 3DJCA 1JCGA 3FR0A 5BR9A 3UE5A 2Q1NA 3QBWA 3FZMA 3QB0A 1YXQA 2Q97A 3FE1A 3MN9A 4IZ9A 1SAZA 1ESVA 4FO0A 4EIAA 4BR5A 1QHAA 4QS9A 1NM1A 3GBTA 3FZLA 2QWOA 3U4LA 4BVOA 4CZKA 4H0VB 4B1ZA 3VGLA 2GTDA 4J8FA 4A2BA 3O4WA 3SJHA 2A41A 4JHDA 3CJAA 2F9TA 3CETA 1MA9B 3J8AA 5AQIA 4H0YB 4CJ7A 4BC4A 2PBDA 4BC3A 1OKJA 2P9KA 3LM9A 2ASOA 4RCHA 3VERA 4BR4A 4BRHA 2FLOA 4BRGA 3AARA 3ZEUB 5KPRA 1BO5O 4H0XB 3KZBA 2E1YA 3HBTA 2I7PA 5ADXA 2E8AA 1ATSA 2P9NB 1JCFA 1X9JA 1C0FA 4M7XA 2YJEA 2A6AA 3UKRA 4B1UB 2QWNA 4BRKA 1XQSC 4PL7A 4IJNA 2E1ZA 5AQWA 3LDOA 4ISGA 2P9SB 3H1QA 3DAWA 3KHYA 3ZX3A 4FWOA 2P9UB 5AQRA 4DCHA 4FWKA 2GEMA 1ZBSA 2HF4A 5F0XA 1SQKA 2ZWHA 2E2PA 5ELZA 3ZEUA 4CZJA 1HKCA 3DXMB 4BRFA 3MCPA 3F9MA 4FWLA 4FWSA 5FPDA 1YVNA 3VF6A 4BVPA 4BROA 3L0QA 3GG4A 2GWKA 3AAQA 2P9SA 4FOEA 1HUXA 4XH1A 1E4FT 4EFHA 1Z05A 4FWPA 4H0PA 4CZFA 1IG8A 3IFRA 1S3XA 3DXMA 4CBUA 3FGUA 1LCUA 3CQXA 4DB3A 3O6WA 2CH5A 4BRCA 4ISFA 2YJFA 1NGDA 2P9IB 4WQ4A 3VPZA 4B1WB 1TYQA 3L6QA 3O80A 2QWQA 2FXUA 3ZX0A 3EO3A 4FWQA 5TKYA 3U9DA 4BR2A 4EHTA 1BA1A 1NBWA 2UYTA 2Q2RA 4KBOA 3WQUA 4A61A 2E2QA 4BRDA 3R6MA 2V7YA 3CHWA 3ATUA 3ULEB 3SMPA 2H3GX 3LDQA 3MN6A 2HF3A 4JNEA 1QQOA 5EXWA 3U8XA 3C7NB 4FSVA 4FOIA 3VESA 4EAHD 4H03B 2YHYA 3VOVA 4BRAA 1J6ZA 5AQUA 2P9IA 1MDUB 4LC9B 3O1WA 5EOYA 5AFUH 3H45C 1P8ZA 3SLCA 3VEZA 3LL3A 5AQVA 2ITMA 1NGGA 3R8EA 3D7EO 1TUYA 4H5VA 3G25A 3ULEA 4AM6A 4BGBA 5AR0A 3ZETB 4BC5A 5E84A 4CI6A 5FPNA 4CZGA 3CERA 3MN5A 3UKRB 3C7NA 3UKUA 4BREA 3M1FA 2IVOA 5AQMA 3CJCA 3QICA 1KXPA 4CZLA 4PL8A 3SK3A 1NGHA 3MN7A 2EWSA 2F9WA 3H3NO 1GLBG 1WOQA 2IVPA 3VF4A 1NGJA 1QQNA 4FPBA 2VWBA 2W40A 4WQ4C 4CZIA 1RDWX 4YDUA 4NB4A 1HX1A 1NGIA 3HTVA 1NGAA 3VEXA 3MDQA 1DEJA 4IWVA 3ZETA 3BUZB 1LOTB 3D2EB 1HLUA 1GLDG 1NGBA 1MWMA 1BA0A 5KPTA 4FWRA 1XC3A 1YAGA 3GL1A 1T6CA 3A8YA 4M63C 3TU5A 3M6GA 5BRDA 4H5TA 3H3OB 5AQYA 3JXUA 3WUHA 3CJ9A 5LJVA 3M3ZA 4CD3A 4O5FA 5JICA 4GNIA 1BOTO 4QS7A 4CBXA 2WUSA 4RWTA 5ADXH 4MLEA 4H0TB 3CJ7A 2QW9A 2D0OA 1U6ZA 2QWPA 2A5XA 3RSEB 5JLHA 1MWKA 3KVGA 3GOIA 4FWMA 3QFPA 4IJAA 3D2EA 1BU6O 3C0BA 2OANA 1K8KB 1TYQB 2VCPA 3IDHA 2P9LB 3A0IX 4DHYA 3ENHA 4MO5A 4JD2B 4F9OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QFUA 2FSNA 3O3GA 4DV5K 4B9MA 4B9NA 1CXUA 1ZBUA 3ZT4A 4WE1A 3RSEA 5I3UA 4H4OA 4DU4A 4FWNA 4YDUC 4C23A 3VTHA 4OVLA 4BG9A 5B8HA 1K8KA 2PAVA 3TTCA 3ASMA 2A3ZA 4IXCA 2KFZA 4KHSA 2VG6A 4F4KA 4HUFA 4JD2A 1HNZK 2I7NA 4IBNA 1NK6A 3IAYA 1JLGA 4OGCA 2WTUA 3K9KA 3T1HK 3H46O 3G4SN 4H5NA 1VQ5N 1NWKA 4CJQA 3CFRA 3K5LA 3BZCA 4KHQA 3EKSA 4BGAA 3O3HA 4KI4A 1N6QA 4BRIA 1HYVA 3SQ0A 1T8EA 5AQFA 1EXQA 1RDAA 5BRHA 2RHKA 3AO5A 5AZIB 4CFAA 4IO8A 5GAGP 4O0IA 1GLAG 2CGLA 4H5RA 4CHZA 1IBKK 4NLCA 1M1KO 1NMDA 4DTRA 4IFEA 4W5OA 3J7AP 3HZ6A 3O9QA 2ASMA 5I9EB 4K41A 4NO7A 3QERA 3QO9A 4CF1A 3NGYA 3HM8A 1IKXA 2OPPA 3O8MA 4KH6A 4DF8A 4OKJA 3WXLA 3OS0A 2O8EB 3CI5A 1VHXA 4IG3A 4Z4HA 1IO2A 1F21A 1JJ2M 4MLHA 3VQ9A 4CJVA 2YHWA 2GELA 2D0PA 2HSTA 1U2VB 1IJJA 1IKWA 1WB9A 3NVKA 3AY9A 5C15A 1OVYA 1EP4A 4FPAA 1KVBA 3IG1A 4WYBA 1VSJA 3SAHA 3IKMA 2ZE2A 2OPQA 3KK1A 4M3RA 3NF7A 3J7ZO 4RTFD 1H1VA 4ID5A 4FJIA 3VEWA 3L2WA 4CFCA 4Y0WA 1YITN 1G99A 2OPSA 3C6AA 4H5WA 4KB1A 2KFNA 5AQPA 2UUBK 3SPYA 3RR8A 4RG8A 5FPMA 2ZJPL 4FZYA 2G8IA 3LDLA 2Q0RA 4BE0A 4CVNE 1NK8A 4B1VA 1Z6RA 1NK4A 3MECA 4KH5A 3EKUA 3ISNC 2A1SA 2DFHA 2P9NA 3DLBA 4ILJA 5BPLA 1RT6A 4CF2A 2PYJA 1QZ5A 3KWIA 3MX5A 4M3TA 4NCAA 5M1QA 3SAFA 1WSJA 4RW4A 2WBNA 1C6VA 1L5UA 4DR1K 4LF4K 3T19A 3DMJA 3CXCM 3FLCO 4HCBA 4QAGA 3U6FA 1J9AA 3KLFA 2R7YA 2PZSA 5AQKA 1BHLA 1TUUA 1Q8IA 2HBKA 1BG3A 3SUPA 3RRHA 3ZX2A 1M90O 3UIQA 3JS6A 5BN8A 1E4GT 3WXMB 3CMEN 2UU9K 1KFDA 3FZKA 3SUQA 3ZSZA 3SPZA 1J5OA 3CFOA 3MCAB 3GDQA 3S41A 2JGUA 2VWKA 3B8AX 3HOTA 4M3ZA 4E1MA 3P38A 4FJNA 2YI1A 3A5LC 1R59O 5AQNA 5FPEA 4X66K 3A5NC 1GLJO 4WQ5C 4JI1K 4OO1J 4MQ3A 2BGGA 3V1RA 1A5XA 2YHXA 1NNEA 4BRMA 4FZXC 4B1YB 5BR8K 2WONA 3AVMA 3CCUN 5AQSA 4CGJA 1QVFM 4CJ4A 3V1QA 2B6AA 2WFBA 4B9TA 4XH5A 2IOCA 4BE2A 4JKAA 3BY5A 4LF9K 2HHTA 2E6MA 1NG9A 1VSIA 3HVTA 2OZMA 4A5AA 2NRWA 2Q97A 1Z25A 1I94K 4CZKA 2X6SA 4FLVA 2GTDA 3O4WA 3ZSXA 4FM1A 1MA9B 2YKNA 4H0YB 2KLAA 2ASOA 4BRGA 2FLOA 1K6YA 3ZEUB 3JAMO 2E1YA 3EY1A 4QCLA 2I7PA 5ADXA 1RTDA 4DTUA 1X9JA 1C0FA 1QVGM 4M7XA 3SUNA 4RW9A 4FLXA 3M8QA 4DR4K 1XQSC 4E7KA 3MWPA 2P9SB 1HR0K 2UUCK 3KHYA 3NBPA 2ETJA 3U3YA 3KIOA 1NMNA 4FWKA 2GEMA 1K8AO 2HF4A 1EKEA 1TAUA 5F0XA 5ELZA 1HKCA 2RPIA 2BDPA 3F9MA 3KWGA 1ZBFA 2JWKA 5HBMA 3KKRA 4NYNA 5FPDA 3VF6A 1Q81O 4BVPA 4GMJB 3AVCA 4DG1A 4OPAA 1G15A 4E0DA 5J2MA 4XH1A 5GADP 3RMDA 1S72N 2KTQA 3S9HA 2OPRA 3CQXA 4WFNL 2CH5A 2YJFA 1NGDA 4WQ4A 4B1WB 3AVBA 3L6QA 4FXDA 3AGRA 2QWQA 4I7FA 2FXUA 3QEXA 2RKIA 1VQ4N 1VSLA 3EO3A 4M3UA 4BR2A 4BDPA 4EHTA 3SUOA 1LAVA 2VG5A 4DSJA 1NBWA 3WQUA 4ZTJA 4BRDA 3R6MA 2V7YA 1SV5A 1YJWN 3J81O 2H3GX 3KLIA 4CJPA 1C0MA 4JKBA 4W5NA 5EXWA 4DV1K 1BQMA 4UY8O 3VESA 3VQCA 3THXA 2G8WA 3VA0A 4CJSA 1U47A 3THYB 3MXIA 3VMFB 2GBZA 2P9IA 1WSGA 3O9RA 2G8VA 1U4BA 3DLHA 4HHTA 5TKWA 4AHUA 4UQGA 3VEZA 4JI5K 3D7EO 5LL6Z 1WNSA 5E41A 4BGBA 4NCBA 4BC5A 4N56A 4CI6A 3C6TA 5SZTA 4OLBA 3UKRB 1YTUA 3O9SA 3M1FA 4DR6K 1IBLK 1XI1A 3SK3A 1NGHA 3MN7A 3RMCA 3QLHA 1CZ9A 3BGRA 3H3NO 2IVPA 3VF4A 4CHNA 4OKEA 4DS4A 2VWBA 3PIOL 4GVEA 1X9MA 1NGIA 1K9MO 2HHSA 1CZBA 3NGZA 1NGAA 3MDQA 1DEJA 4KHUA 3MXMA 2UXBK 2O8FA 3BUZB 1HLUA 4AHTA 2QKBA 5C42A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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