4IWVA

Crystals structure of human glucokinase in complex with small molecule activator
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
449
structure length
443
Chain Sequence
SSNSQVEQILAEFQLQAADLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHAAASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Optimising pharmacokinetics of glucokinase activators with matched triplicate design sets the discovery of AZD3651 and AZD9485
rcsb
molecule keywords Glucokinase isoform 3
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 168
structure length 443
sequence length 449
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iwvA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4iwvA01
3B8AX 3H3NO 5AQWA 4M7YA 1OKJA 3HBTA 4I6MA 1KAZA 2FSKA 4FWMA 5EOYA 4MLHA 5EXWA 4H5VA 1X9JA 4K41A 1XQSC 3DWLA 2ASOA 4BRLA 2HOEA 5AQRA 4M7XA 1BG3A 4BQZA 4I6MB 4FOEA 1BA0A 3FE1A 1ATNA 4BRIA 2A5XA 2YJEA 4H5TA 3L0QA 3CHWA 1K8KA 1U2VA 3QFUA 3GL1A 1MA9B 1QQOA 1NGEA 1GLBG 2QWMA 3I33A 3BF1A 1BUPA 1XUPO 4FWOA 1RGIA 2HF4A 4A61A 3WQUA 1K8KB 1U2VB 2V52B 4FO0A 4CD1A 3LM2A 2FSNA 3EL2A 4GY2B 1X3NA 3G25A 3EN9A 1H1VA 3RSEA 5AQGA 1HUXA 3GE1A 3IUCA 3QFPA 3H45C 4PKGA 2YHYA 4CBWA 2QWRA 3WXJA 3RSEB 3LM9A 3BUZB 1ZBSA 2D0PA 3UKRA 5AQZA 5JMVA 4O5FA 2V7YA 3U9DA 3VOVA 2Q36A 3VGMA 1HX1A 5JLHA 2FF6A 3UKRB 4BR4A 2E2PA 3TU5A 2P9IA 5AQIA 3U9ZA 2BUPA 3W3DA 1JCEA 4FWNA 3SMPA 1GLEG 2QWQA 3CIPA 5E26A 4BRFA 5BRDA 3WT0A 1WOQA 3D2EA 4IJNA 1SQKA 3UE5A 4Z94A 2E2QA 3J8AA 3A5OC 1QQMA 2P9KA 5BREA 1D4XA 2IVPA 4H0TB 3R8EA 1NBWA 2P9KB 4EIAA 1ESVA 2A42A 1T6CA 4WQ5C 3O5BA 2V7ZA 4H0YB 2H3GX 5AQQA 5ELZA 4DCHA 3CQXA 1JCGA 4K43A 2NRHA 5KPRA 4CZHA 5AZIA 1XC3A 1NGIA 2P9NB 2E2OA 4BRKA 3F9MA 4B1WB 4IO8A 2GELA 3S41A 3A0IX 3ZX3A 5BN8A 4CBXA 5AZIB 3D2FA 3UKUB 2ASMA 2I7NA 5AQKA 3LDLA 1ATSA 4ISEA 1P8ZA 5AQFA 1NGDA 5I9EB 2Q1NA 1GLLO 4IJAA 3D2FB 2QM1A 2E88A 4HTLA 3U8XA 3HZ6A 1TYQA 4PKHA 5AFUA 4PL7A 5LJWA 1EQYA 1MDUB 4NO7A 3VF4A 4BC2A 3CERA 1TYQB 4WQ4C 4BRQA 1BDGA 5AQSA 4CJ7A 3WXKA 3A5MC 1NGCA 1MWKA 3MK6A 1V4SA 1G99A 3DXMA 2QXLA 3DAWA 3H46O 2E1ZA 1HKCA 3FLCO 1DEJA 4H5NA 5JICA 1YAGA 3FZKA 2Q2RA 3DXMB 4RWTA 4F9OA 4BQLA 2Q97A 3U4LA 2FF3B 5AQUA 1E4GT 2PBDA 4FSVA 2IIRA 4BR0A 5BPNA 3VPZA 3R9PA 3LL3A 4BROA 3DXKA 5FPDA 3VF2A 4AM7A 4CZMA 3M6GA 4H0OA 1NGHA 4BRAA 3D7EO 4BGAA 4H03B 3DXKB 2QW9A 1HKBA 3MCPA 3EKUA 3IDHA 3ULEA 3O6WA 3FZHA 2VYPA 3CJBA 1HKGA 1C0GA 2D4WA 5AFUH 5TKYA 4BG8A 1LOTB 2QWNA 3A5NC 3R6MA 3ULEB 3WXLA 1NGAA 3HI0A 4JAXA 3CETA 4AM6A 3ATVA 4J8FA 4KBOA 5AQMA 3H6EA 2Q31A 4GNIA 5B8HA 3CQYA 1JCFA 4QS8A 2J4RA 4FOIA 4IXCA 3O80A 3UB5A 3MN7A 5BPMA 2QWOA 4FPAA 1RFQA 3AY9A 4JNEA 4BVPA 4H5WA 2GWJA 4JHDA 1QHAA 2V51B 5AQXA 3GOIA 3LDPA 1GLFO 2EWSA 3BEXA 1GLJO 2P9IB 3LDNA 2ZGYA 4FWQA 4ISFA 5BPLA 1TUUA 4MLEA 2YI1A 3D2EB 4QS7A 3EKSA 1LCUA 4PKIA 3O8MA 4JN4A 1GLDG 3WUHA 5EY4A 1BWFO 3CJCA 2D0OA 1T6DA 3CJ9A 5BRHA 3MDQA 2P9SA 3AAQA 4CBUA 3VENA 4XH1A 2VCPA 1NLVA 3I8BA 5EVZA 4EHUA 2E1YA 1GLCG 1ZC6A 4L3QA 1Z05A 2A40A 4DHYA 5AQNA 4B1XB 4H0XB 4CD3A 4CI6A 3VEXA 3M3ZA 5AQJA 4BR2A 3GBTA 3QB0A 3HSCA 4FPBA 3ID8A 3FGUA 5LY3A 3A5LC 3QBXA 1GLAG 2DPNA 3FZLA 4BRGA 1J6ZA 4MO5A 1NGBA 4BG9A 3C7NA 1BOTO 1NM1A 1YVNA 3MN9A 4B1VA 2FXUA 4ISGA 4BRPA 1KAYA 3EZWA 5F0XA 2P9PA 4BRDA 2F9WA 1KAXA 3VEYA 1DKGD 3C7NB 5KPTA 4XH4A 3LDQA 1NGJA 3O1WA 3WQTA 4CZGA 2GUPA 5AQLA 2YJFA 4BVOA 1X3MA 2P9PB 2Q0UA 4H0PA 3H1VX 4E1JA 1T44A 2KHOA 4H5RA 3ZETA 4DQ8A 1MWMA 3KZBA 3ZEUA 4Y0WA 2FLOA 4BR9A 4A2BA 2GTDA 4CZFA 1QZ6A 3C0BA 3ZETB 1RDWX 3ZEUB 2CH5A 4EFHA 3KVGA 4HWIA 3VESA 2IVOA 1E4FT 5KPZA 2AA4A 3VEZA 2ZWHA 2D1KA 3SJHA 3H3OB 1S3XA 3VF6A 2PAVA 4A62A 3BP8A 3FZFA 3O4WA 4FWKA 3W0LA 4BRNA 4A2AA 3VEVA 4BR5A 3SLCA 5FPEA 2AP1A 3CJ1A 4XH5A 4FWLA 5AQTA 1NGFA 3BF3A 2WUSA 2IVNA 2OANA 1TUYA 4H0VB 1KXPA 3FFKB 5AQPA 5BR9A 4WQ5A 4CZKA 4BGBA 3GDQA 4FWSA 2NZTA 3ATUA 3FR0A 4B9QA 1S22A 5AQVA 4XEIA 3L4IA 5BN9A 4QS9A 4EHTA 3ENHA 2YCHA 2YHWA 3IFRA 3O08A 3ZX0A 5AQYA 4CZLA 2NLXA 2A41A 4CZEA 3FZMA 1C0FA 3QMLA 1Y64A 4B1UB 1NMDA 1YUWA 5BRFA 3EO3A 3CJAA 3ENOA 4IZ9A 5AR0A 2E20A 2CH6A 2E2NA 3L6QA 3MN6A 3HM8A 1IJJA 3QICA 4BC4A 5E84A 2VWBA 4MO4A 2ITMA 3TPQA 1QQNA 4JHDB 3VERA 1CZAN 3H1QA 2P9LA 5ADXA 2BTFA 4M63C 3QBWA 1HPMA 4B1ZA 4BR7A 3ZX2A 3DJCA 1Z6RA 4CZIA 4WQ4A 2Q0RA 4YDUA 2P9LB 1NWKA 3A8YA 4IWVA 2FSJA 2YHXA 3MMVA 3OHRA 4DB3A 5LJVA 2HF3A 2ASPA 2A6AA 2ZGZA 3M1FA 3VGLA 3WEEA 2QWLA 3KHYA 4PL8A 2P9UA 4K25A 1BO5O 2F9TA 4CZJA 3AAPA 5F1XA 4FWPA 2P9SB 2HMPA 5AQOA 5KQ8A 3JS6A 2E8AA 3WEEB 1BU6O 4LC9B 2P9UB 1R59O 2CGJA 3HTVA 3WXIA 4BC3A 4BRHA 4BRCA 5F2RA 1HLUA 3MN5A 3CJ7A 2P9NA 2ZF5O 1YXQA 1BA1A 1SZ2A 3O1BA 2CGKA 4K42A 2GWKA 1NGGA 3VGKA 4RTFD 2CGLA 3VEOA 3UKUA 5AQHA 4FWRA 3VEWA 1U6ZA 3LDOA 1QZ5A 3VETA 3P4IA 2A3ZA 4B1YB 3JXUA 5ADXH 1Q18A 1DGKN 3IMXA 4WYBA 4RCHA 2W41A 4NB4A 5CE3A 3GG4A 1V4TA 4C23A 5AZJA 4JD2A 2I7PA 4BC5A 5JLFA 1IG8A 3SMSA 2UYTA 1ATRA 4O8KA 3AARA 3CI5A 5AZJB 4JD2B 5EX5A 4BRMA 4YDUC 2W40A 3QDKA 4EAHD 1SAZA 5FPNA 4BREA 3SK3A 1ZXOA 2QWPA 1WUAA 4FL9A 5KQDA 2GEMA 5FPMA 1HJOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3H3NO 2YNHA 5AQWA 4I6MA 4Q0BA 2F8TA 1Q86O 1T05A 4DV1K 4BQZA 2UXDK 2HBJA 4FOEA 4IEEA 4JEPA 1NJYA 1S9EA 1ATNA 1K8KA 1U2VA 3QFUA 4FJHA 3GL1A 1QQOA 1NGEA 4CFBA 3RMCA 1L5UA 1XUPO 5CR4A 2HF4A 3L3UA 3THXA 2G8FA 4JKGB 2OPPA 1Q7YO 2UUAK 4FO0A 2FBYA 4AF1A 1X3NA 2NUBA 4CEAA 3RSEA 4FK0A 5AQGA 3GE1A 1XNQK 1UWBA 1T7PA 3NAEA 2QWRA 3LM9A 3BUZB 1O1WA 2D0PA 3UKRA 3PV8A 4B3MK 2ATQA 3V81A 4FJXA 5CY4A 3HK2A 3EE8A 1TK8A 2FF6A 3SAFA 3Q7BA 3MCAB 3TU5A 3W3DA 4FWNA 3SMPA 1IG9A 1VSEA 1HQEA 3WT0A 1NK4A 3D2EA 4IJNA 1Q8IA 1SQKA 1IKVA 2E2QA 1DTTA 3OYJA 2Z1JA 3T1YK 3NGIA 3I0RA 4H0TB 3KLFA 3VQ7A 3LAKA 3OYIA 4NLCA 1Z25A 4DTSA 3C6TA 4DSFA 2P9KB 4EIAA 2IAJA 1VQ7N 2D0CA 4X66K 1T6CA 1ASVA 3E01A 1IKXA 4DCHA 3CQXA 4K43A 4JKFA 4PQUA 3C65A 3QLHA 4AHSA 2P9NB 1ZBFA 5LMUK 5MLCQ 2GELA 2Z1IA 3ZX3A 4CBXA 1C6VA 2G8VA 4JS4A 5AZIB 5DM6L 2ASMA 3TAEA 4FLVA 3SJJA 4IOAL 1RT1A 3LZIA 3E9PA 1KLNA 3NDKA 5IT9O 3LP3A 4LFBK 3R1XA 4WFBL 2Q1NA 3D2FB 2QM1A 4HTLA 1LAWA 3K57A 3Q7CA 3V6DA 1TYQA 1MDUB 4AHTA 4KHQA 3AO2A 4DV0K 3C6AA 5AQSA 1WSEA 3A5MC 1RT2A 3NGYA 1SKSA 1IBLK 4CEZA 1C1AA 4KHYA 1G99A 3DAWA 4B9TA 1HKCA 1DEJA 4H5NA 5JICA 4ILJA 1YAGA 4AHCA 4O0JA 2UU9K 1NK9A 3RTVA 3U4LA 2FF3B 5EU7A 4FSVA 3TTCA 4BR0A 3SQ0A 3LL3A 1U45A 4BROA 4JK7A 3ZSXA 4CE9A 1S5JA 3ITHA 3CFRA 4GVMA 3N4QA 4M42A 3AA5X 4NXNK 4XIUA 4PY5A 4ID1A 2VYPA 2RKIA 3CJBA 1Q9XA 3WNGA 3ZCMA 3A5NC 3ULEB 4JKDA 3LP0A 3I8DA 3K0SA 2IS3A 1NKBA 2WBNA 3H6EA 3WXMB 2Q31A 3TAGA 4NLBA 2NNWA 5K14A 4JI8K 1RDUA 4KTWA 3F73A 1IV0A 4FOIA 3KLGA 4GV6A 1EKEA 3UB5A 1J5OA 1RFQA 3CYMA 3ZSYA 4YOVA 2GWJA 1QHAA 1JXBA 2PY5A 1VQ9N 4ELUA 3NF6A 4DSEA 3AGRA 1U48A 5FRNA 5BPLA 4CFAA 1TUUA 4MLEA 2YI1A 1XMOK 4DTPA 4CEEA 3D2EB 4PKIA 3O9TA 2GBZA 1N5YA 3OYDA 3HOSA 4DR6K 3PX4A 4JI3K 3WUHA 4OO1J 5EY4A 1WSGA 3SCXA 2D0OA 1WBDA 2I5JA 3CJ9A 3VENA 4XH1A 4ZHRA 1GLCG 4QAGA 1Z05A 2HBLA 3OS1A 4JKCA 2A40A 3TAQA 4DLGA 4CI6A 3ZT3A 4DTJA 4DR3K 4ELVA 3DI6A 1TK0A 4MQ3A 1NJIO 4BR2A 5A2QO 1HNWK 5LY3A 2QI2A 3QBXA 3QEWA 3FZLA 4JKEA 4HTUA 1N8RO 1JLCA 3TAFA 4C1NK 3C7NA 3OBWA 4N5SA 5C2DA 4ISGA 3VQ8A 1CXQA 3EZWA 3SNNA 2F9WA 1KAXA 4C8OA 2GUIA 4CW7B 3NH0A 4CZGA 1JLFA 2YJFA 1X3MA 4RW6A 2Q0UA 2OTJN 1S9GA 3MEDA 1UA0A 3ZSZA 2O8CA 4CK1A 2G8KA 4KI4A 1W2BM 2KHOA 3ZEUA 1X9SA 3DLLL 3MECA 1RDAA 1JJ2M 4CJVA 1VQ5N 4CZFA 3I0SA 3SQ4A 3ZETB 3HYFA 4FK2A 4E1NA 2CH5A 4CJ5A 4HCCA 2IVOA 3AVNA 3O9RA 5KPZA 2O8FA 1C0TA 1WAFA 3VEZA 2ZWHA 1YJWN 4WFAL 2PAVA 4A62A 3CFOA 3FZFA 3W0LA 4FWKA 4BRNA 3SAGA 3VEVA 4O55A 1VQ6N 5FPEA 4G9ZA 4AH9A 3O9UA 3BF3A 2WUSA 4H0VB 1TUYA 1QSSA 1KXPA 5AQPA 3GDQA 2P1JA 4BACA 1RTDA 3DLHA 4XEIA 3L4IA 3LAMA 1ASUA 2WTUA 2VQFK 1G15A 4B9NA 2NLXA 3VA3A 1JLQA 4B1UB 1Y64A 5GIOA 1YUWA 4AHRA 4W5OA 2G8UA 3ENOA 4IZ9A 5AR0A 3L6QA 3HM8A 3QICA 2X6SA 4MO4A 3LPUA 3AVKA 3PO4A 4FJLA 1JLAA 5LL6Z 3CCRN 4JKBA 4WCEL 4KKOA 3MXMA 5ADXA 4BR7A 4NYNA 3ZT4A 1WNSA 3MWPA 1TGOA 3OYAA 1RCHA 1BHLA 4A59A 1KVAA 3V9SA 4YDUA 1KVBA 4DG1A 3TSQA 1HNVA 3CFPA 2KFNA 2ASPA 3M1FA 3CG7A 4RW8A 2P9UA 4K25A 3ZSVA 4ILGB 4YFUA 3T1HK 5J2NA 4LC9B 3AO4A 3KLIA 4GV9A 4W5NA 1CZ9A 4BC3A 4BRHA 5F2RA 3CC2N 3CXCM 1VK0A 3VMFB 1S72N 1C0MA 1SUQA 1FKPA 2F4VK 1IKYA 3L2RA 4RTFD 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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