4IWVA

Crystals structure of human glucokinase in complex with small molecule activator
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
449
structure length
443
Chain Sequence
SSNSQVEQILAEFQLQAADLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHAAASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Optimising pharmacokinetics of glucokinase activators with matched triplicate design sets the discovery of AZD3651 and AZD9485
rcsb
molecule keywords Glucokinase isoform 3
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 168
structure length 443
sequence length 449
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iwvA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4iwvA01
5AZIA 2E2QA 3LM9A 2E2NA 3ZX3A 4CZFA 1QQMA 1BUPA 2ASOA 4FWOA 2P9PB 1JCFA 2A40A 4BG9A 2VCPA 4FSVA 4BGAA 3UKRB 3VEWA 1P8ZA 2P9LA 3J8AA 4B9QA 3MN5A 4CZJA 4I6MA 3VEVA 3WQTA 4O5FA 1BA0A 2QWPA 2D0PA 1TYQA 3D2EB 3LDNA 1V4SA 4L3QA 5AQFA 2H3GX 1QQOA 3QMLA 4H5TA 2FSKA 3BUZB 1LOTB 5ELZA 5F0XA 4B1YB 5BR9A 4IWVA 2FSNA 3LM2A 3O1BA 4NB4A 1U2VB 3W0LA 2YHYA 4MO4A 3HBTA 3I8BA 3DXMA 2YJEA 1YXQA 4BR5A 3CERA 2ZF5O 1SQKA 2Q0RA 4CZHA 3HM8A 3QBXA 3VPZA 2QW9A 1NLVA 4CJ7A 1MWKA 3AARA 4QS9A 3MCPA 1U6ZA 3H3OB 5TKYA 3ZEUB 2YJFA 3QB0A 4H0OA 3VGMA 2YI1A 3KHYA 4FWLA 1ATRA 5EX5A 3QFPA 1C0GA 3BF1A 5AQYA 3VOVA 4B1VA 2YCHA 4CBUA 4CI6A 2NRHA 4BRIA 3CJ1A 3WEEB 4BR0A 4K41A 4CZIA 4CZGA 1GLCG 4RTFD 4BRCA 2ZGZA 3CJCA 3CJ7A 3HI0A 1C0FA 3A5MC 5AQXA 1X3NA 1KAYA 1IJJA 4A61A 4BRQA 3SJHA 4FOIA 5F1XA 1GLLO 5JICA 3LDQA 4FWRA 4JD2B 2ITMA 5I9EB 5AQMA 2FF3B 2QXLA 5AQGA 3VESA 3FGUA 4WYBA 5AQHA 1HKGA 2BTFA 3WQUA 4BR9A 4PKGA 3VF6A 3WXKA 1KXPA 4BRPA 3G25A 5JMVA 2V7YA 3VETA 1DEJA 3ID8A 5AZIB 3U8XA 3ULEA 4O8KA 5EOYA 1HJOA 4H5RA 2FF6A 5AR0A 3GL1A 1NWKA 2GUPA 2P9UA 5AQSA 4FL9A 4CD1A 2GWJA 1ATNA 4BRKA 4IJAA 3ZETB 3M1FA 3QFUA 1BG3A 4YDUA 4H0YB 3CJAA 3HZ6A 2P9NB 4FPBA 1K8KA 3C7NB 4FOEA 2QWOA 1SZ2A 2CGLA 1JCGA 5KQ8A 3O8MA 4CZLA 1GLEG 2A42A 3WUHA 2AA4A 2FXUA 4BC3A 2PBDA 3DXKB 1GLDG 3WXIA 1DGKN 3UKUA 3WXLA 3VEXA 4M63C 4A2AA 3B8AX 4E1JA 4XH5A 2A41A 2Q97A 3CQYA 4CBXA 2QM1A 2V7ZA 3O6WA 3U9ZA 3EKSA 4H0XB 3IUCA 2GELA 5AQVA 4QS7A 2Q1NA 2KHOA 2D0OA 4BR2A 2E1ZA 1WOQA 5B8HA 3I33A 5AQZA 5AQPA 1YAGA 4BREA 4HTLA 2QWQA 4H5WA 4WQ4C 1QZ5A 1X3MA 2CGKA 4H0VB 4J8FA 1MDUB 5BPMA 4PL8A 1XUPO 2W40A 3DAWA 2IVNA 5FPNA 4FWSA 5AZJA 4CZKA 5BN9A 2HMPA 2A5XA 2F9WA 3VERA 3ENOA 4FWQA 2Q0UA 3VEYA 2W41A 4BVOA 2P9KB 5LJWA 3ENHA 2P9IA 3CQXA 3FZLA 3KZBA 4MO5A 5AQTA 1D4XA 3RSEB 4BVPA 4FPAA 1BO5O 3QICA 4CD3A 1KAXA 2FLOA 3SLCA 1RFQA 1XQSC 1T44A 4JHDA 1RDWX 4CZMA 1H1VA 1WUAA 4BR7A 4M7XA 2IVPA 1V4TA 4BQLA 1CZAN 1HPMA 4QS8A 2ASPA 3D7EO 2PAVA 1E4FT 3KVGA 5FPMA 4JAXA 3A5OC 1YVNA 4Y0WA 3TU5A 3O08A 1J6ZA 2P9UB 5AQQA 5EVZA 3GOIA 4EIAA 3VEZA 3F9MA 4BGBA 4MLHA 4WQ5A 4BG8A 3HTVA 3ATVA 3C0BA 5BRHA 2P9PA 3BF3A 1G99A 2E2OA 3WT0A 4BRFA 3D2FB 4PKHA 3UKRA 3AY9A 4BRGA 1NGAA 2UYTA 2P9SB 4K43A 1GLFO 2HF4A 3OHRA 4BRAA 3D2EA 4DB3A 1NGHA 1QZ6A 1GLBG 1HUXA 4BROA 3VF4A 4B1WB 4BQZA 3H6EA 1ZC6A 5AQJA 2GWKA 4BRDA 1U2VA 2D1KA 3O1WA 2HF3A 1Z05A 1ATSA 5AQIA 3FR0A 3CJ9A 3EL2A 1BDGA 3W3DA 1EQYA 2I7NA 4BRMA 1MWMA 3SMPA 2CGJA 3A5LC 5CE3A 5JLHA 3EZWA 3FFKB 2E2PA 3R8EA 2P9LB 3UB5A 3A0IX 4EHUA 1NMDA 3GE1A 3ATUA 3MDQA 4I6MB 4ISEA 3BP8A 1NGFA 5JLFA 2CH5A 5AQNA 3ZEUA 1R59O 3GDQA 3LL3A 1TYQB 4BC4A 4RCHA 5BN8A 3CIPA 4H0TB 3L6QA 5LY3A 3AAQA 3ZX2A 4CZEA 3S41A 5AQRA 3DWLA 3WEEA 4BR4A 2AP1A 4B1ZA 4F9OA 2J4RA 3IDHA 1NGGA 2GEMA 3DXMB 3U9DA 4KBOA 2E8AA 3GG4A 1BA1A 1T6CA 3H45C 4JD2A 1HKCA 1NM1A 3MN6A 3A5NC 3MN9A 2QWRA 5BPLA 3JXUA 5E26A 4DHYA 3U4LA 3WXJA 4B1UB 1NGIA 2F9TA 4IJNA 4FWMA 4DQ8A 2NZTA 4JNEA 4XH4A 2E88A 1GLJO 1RGIA 4MLEA 5AQLA 3SMSA 2IIRA 1TUUA 1Y64A 3L0QA 3VENA 3FLCO 4XH1A 2ZWHA 1XC3A 4H03B 4ISGA 3FZFA 1NGCA 1S3XA 4IZ9A 2E1YA 1QQNA 4YDUC 3ZETA 3EN9A 3O80A 4EHTA 2A3ZA 3H1VX 1NGDA 1NGEA 2DPNA 3P4IA 3ZX0A 5BRFA 3CETA 1DKGD 5AQUA 4AM6A 2P9NA 1MA9B 3L4IA 3C7NA 5BRDA 4K25A 2Q36A 3FE1A 3VGLA 3UE5A 4H0PA 4XEIA 1NGBA 3FZMA 3IFRA 4BRNA 3DJCA 3O4WA 5KPZA 3DXKA 5KPTA 1Z6RA 4JN4A 4BC5A 1HX1A 1YUWA 3QDKA 1E4GT 3M6GA 2YHXA 1KAZA 1S22A 3ULEB 3EO3A 3M3ZA 4CBWA 3CI5A 2YHWA 4ISFA 4BRLA 4PKIA 4A2BA 1BU6O 2I7PA 3LDPA 3MK6A 3MN7A 4B1XB 5KQDA 3A8YA 1X9JA 3GBTA 1K8KB 2Q31A 4Z94A 4DCHA 5BREA 4IXCA 2VWBA 4FO0A 1NGJA 4NO7A 4AM7A 4FWNA 1NBWA 3CHWA 3H3NO 5LJVA 4FWKA 1QHAA 3JS6A 2E20A 3IMXA 3VGKA 3VF2A 3UKUB 3R6MA 2D4WA 5E84A 3R9PA 5F2RA 3O5BA 2ZGYA 2P9KA 1SAZA 2CH6A 4FWPA 5FPDA 2NLXA 3RSEA 1JCEA 5AQOA 4RWTA 4GNIA 2HOEA 4GY2B 4HWIA 5AFUH 3LDOA 2ASMA 3VEOA 5AFUA 2BUPA 4A62A 5ADXH 2V51B 5ADXA 2EWSA 3CJBA 2GTDA 4EAHD 2Q2RA 3H46O 5AQWA 1LCUA 1Q18A 2IVOA 1TUYA 4WQ4A 1BOTO 4WQ5C 5EXWA 4PL7A 5AQKA 5AZJB 1BWFO 3MMVA 4K42A 1IG8A 1HKBA 3TPQA 3AAPA 3EKUA 2V52B 2VYPA 5FPEA 5BPNA 1T6DA 1OKJA 2P9IB 3SK3A 3D2FA 2A6AA 1GLAG 1ZXOA 2QWLA 1ZBSA 2WUSA 3FZHA 5EY4A 3H1QA 4C23A 2FSJA 2P9SA 3HSCA 3LDLA 1ESVA 4H5VA 5KPRA 4H5NA 4M7YA 4JHDB 4BRHA 4IO8A 4LC9B 2OANA 4EFHA 3QBWA 3FZKA 2QWNA 1HLUA 4BC2A 3BEXA 2QWMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2PFUA 4CFCA 2O8FA 3I0SA 3NH0A 5CYMA 3ZX3A 1RCHA 4DFJA 4DR5K 1BUPA 2ASOA 3A2FA 4FWOA 3PIPL 3U3GA 3RR7A 4LF9K 3JSMA 3UKRB 2O8EA 1A5WA 4LFAK 3J7ZO 4B9QA 3J8AA 3NFAA 2HHQA 4O5FA 4JI5K 4CFDA 1BA0A 1U48A 3TAGA 2D0PA 3D2EB 1C1AA 2H3GX 3C6TA 4LH4A 1LOTB 4DFMA 3VQ4A 4IWVA 2FSNA 4DTXA 3OYJA 4OPAA 1U2VB 4CJWA 3KWGA 3SAGA 3I8BA 3PX0A 2ZF5O 1RBSA 2QXFA 3TTCA 2UUCK 3QBXA 4C8OA 4RW6A 1NLVA 1MWKA 1YITN 4W5QA 4C1NI 1QHTA 4H0OA 2NRTA 3VQAA 5SWMA 3KHYA 1ATRA 1OVQA 2NUBA 1WSJA 5EX5A 4CCHA 4B1VA 1HQUA 4BR0A 4FLZA 4FZZA 4ZTJA 5FLXO 2ITGA 1C0FA 5AQXA 4CEBA 1YIJN 2YHBA 3MXMA 4HUEA 5F1XA 5JICA 3OYIA 3V4IA 3JAMO 2RHKA 2FF3B 5AQGA 3KD1E 1NJZA 4FJ8A 4GW6A 3WQUA 4BDYA 4Z4CA 1Q8IA 4IEEA 3EE8A 3O9UA 5AZIB 1WSGA 4O8KA 5EOYA 5AR0A 1NWKA 2GUPA 4YFUA 1WSHA 3C65A 4FL9A 3ZETB 1KFDA 1L3UA 2G8KA 3HM9A 4YDUA 4NCGA 4HCCA 3CJAA 4FPBA 1CLQA 4KO0A 4CF1A 4FOEA 4BE1A 2O8BB 3D45A 3O8MA 4OKKA 3S9HA 4DTSA 1GLEG 4JV5K 4LSNA 3IKMA 3G10A 1TV6A 3DXKB 1TK8A 1GLDG 5J2NA 2F7TA 4A2AA 4E19A 3B8AX 2WTUA 4E1JA 2Q97A 2DY4A 3NGZA 3MXIA 4CGGA 3VQ5A 4FLWA 2QM1A 3O6WA 3EKSA 3IUCA 5AQVA 3AVJA 4QS7A 3PV8A 4B9MA 3BZKA 3QIOA 2UXBK 4DTPA 3DLHA 3AA4A 3TSQA 1NK8A 4HTLA 3QEIA 2NRRA 4XIUA 1T8EA 4J8FA 3VQ6A 2UXCK 1RT6A 1VQMN 3VTHA 2YKNA 3LWLA 5BPMA 4DR4K 4IOCL 3E9PA 3THYA 2W40A 3DAWA 5FPNA 2OPQA 4FWSA 1SV5A 4WFBL 3VQ9A 2KZMA 2F9WA 5M1NA 3VEYA 3MWTA 3QNOA 3Q7CA 1J9AA 3ENHA 3RSEB 3CQXA 3FZLA 5AQTA 1D4XA 3EEQA 2JGUA 3THWB 1KAXA 3SLCA 4J2EA 3N4PA 1BQNA 3E9LA 3CMAN 4KH4A 5SZTA 4CZMA 4BR7A 4M7XA 2IVPA 1HPMA 3L2VA 3RMBA 3D7EO 1E4FT 3L3VA 1TKDA 4IG3A 4OKJA 4DSIA 3NH1A 3LAMA 2IAJA 3RMDA 5CYQA 3RMCA 1Z26A 3GOIA 1VSHA 4BGBA 4BG8A 1G99A 3G71N 3WT0A 4BRFA 3D2FB 3V1QA 4K43A 2GBZA 3OHRA 5FRNA 4LY7A 1HNWK 5GINA 4I9QA 1SKWA 4KI4A 4MDBA 1R0AA 1HUXA 4BROA 4B1WB 4BQZA 1ZC6A 4CHZA 2GWKA 4FVUA 3MEEA 2D1KA 3LP3A 2BGGA 2YKMA 3AVKA 1RTJA 1HNIA 2O8FB 1X9SA 3DI6A 4RG8A 3W3DA 1EQYA 3F9KA 4BRMA 2QTDA 2GX9A 4M45A 4H4MA 3M8PA 2O8EB 1SUQA 5GIOA 2WC9A 1ZBIA 4EHUA 1KVCA 3GE1A 3MDQA 3BP8A 3ULDA 5M1PA 3B6OA 3GDQA 1J5OA 4JI2K 1TKXA 4KAZA 4CECA 4H0TB 3ZX2A 1VSIA 4C8KA 1HYSA 4BR4A 1JL2A 5IT9O 2AP1A 1KCFA 3LAKA 3IDHA 3QEXA 4FJNA 4LF8K 1U45A 4HTUA 3ISNC 1JLEA 2HVHA 1BA1A 1T6CA 1RILA 1SS6A 3H45C 2OPPA 4JD2A 3MN9A 4DHYA 1L3SA 3WXJA 4M3WA 1NGIA 4HUGA 4YNQA 4DQ8A 1LAVA 1GLJO 3SMSA 1VSMA 1W97L 1TUUA 1Y64A 3L0QA 3VENA 3L2RA 3HXMA 2YNGA 4LSLA 4IOAL 3FZFA 3QNNA 4FK4A 3NF8A 3O9RA 1QQNA 5KGXA 3V9XA 2KQ2A 3DOLA 4DTOA 3O80A 4EHTA 3E01A 2A3ZA 2VG5A 4F3OA 1JLAA 3P4IA 3OYFA 3CETA 4DFKA 2P9NA 3OYEA 3SQ2A 2OA8A 1MA9B 3WNEA 4YOXA 3MX5A 3TABA 3ZSVA 3T3FA 4FJLA 4JLHA 2ZE2A 4HCBA 4H0PA 2DFEA 1NKCA 3IFRA 1XWLA 3VQ7A 3O4WA 4CJQA 1KRPA 4X66K 2HHWA 3AO1A 4BC5A 1NOZA 2HB5A 3Q7BA 3AVAA 2YHXA 3OYLA 3KTQA 1DLOA 1TKZA 3VMFB 1C0TA 3OJSA 3SV4A 1T05A 1WNSA 1BU6O 4DV0K 3MN7A 4CF9A 3CCRN 3BGRA 4OX9K 3VQ8A 3IRXA 3SNNA 4DCHA 5C10A 4X62K 3TI0A 3AVHA 4IFVA 4NO7A 4FWNA 1NBWA 3CHWA 5LJVA 3JS6A 3DRPA 3VF2A 3BDPA 3IAYA 3BY5A 3CM6A 3CFPA 2VWJA 4O55A 2ZGYA 1NJYA 3RRGA 5FPDA 2A1SA 3RWUA 1SL1A 4JI6K 5AQOA 3T69A 2HOEA 3HYFA 2HNYA 1RT7A 4AHRA 3OTOK 3P39A 5JS1A 4DU4A 1NG9A 1LWCA 3TSUA 1JLGA 5ADXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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