4IWVA

Crystals structure of human glucokinase in complex with small molecule activator
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
449
structure length
443
Chain Sequence
SSNSQVEQILAEFQLQAADLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHAAASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Optimising pharmacokinetics of glucokinase activators with matched triplicate design sets the discovery of AZD3651 and AZD9485
rcsb
molecule keywords Glucokinase isoform 3
total genus 168
structure length 443
sequence length 449
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iwvA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4iwvA01
4RTFD 2P9SA 3FZMA 4BRHA 2ASMA 3LM9A 5BR9A 3EO3A 1NBWA 1TUUA 4JAXA 5AQLA 4IO8A 5LJWA 3UE5A 4BG9A 4MLEA 4FWMA 4O5FA 2GUPA 3FZHA 1DEJA 1T44A 4BRAA 4BR2A 1Q18A 3FR0A 2QWPA 3H3OB 1BU6O 4CZHA 5BRHA 4YDUC 3ATVA 3EL2A 4BG8A 1MA9B 3FZKA 1GLBG 4FWQA 2VCPA 5JLHA 4RCHA 3VPZA 4B1WB 2ITMA 4A2BA 5ADXH 1NGHA 3LDPA 4KBOA 2YHWA 1ZC6A 2Q36A 3QBWA 1QQMA 2QM1A 4BR5A 2V52B 4NO7A 2ASPA 3BP8A 3R9PA 4CBWA 2OANA 5AQUA 3G25A 4WQ5C 4H5TA 1ATRA 3U4LA 2VWBA 1BUPA 1Y64A 3KZBA 1BA0A 3KVGA 2P9SB 2EWSA 3LDNA 3CETA 1Z05A 2YI1A 2FSJA 1MWKA 3VEOA 3MMVA 2IIRA 3EKSA 4PKGA 4H5VA 4FL9A 4ISEA 3CJ1A 4XEIA 3A5OC 3UKUA 2QWNA 5ELZA 3SMPA 1J6ZA 1D4XA 3FFKB 4XH1A 1HUXA 5EX5A 2E88A 1SAZA 2P9PA 2P9KB 3GG4A 5BPLA 3QFPA 3LDOA 1GLEG 4C23A 5KPRA 3MN7A 1NGEA 3GDQA 1DKGD 5AFUH 4CD1A 4M63C 2P9NA 3H1VX 2F9WA 5EVZA 3VGKA 2V7YA 3QDKA 3EN9A 4H0VB 5AZIA 3CQXA 4ISFA 3W3DA 3ZX3A 4CBXA 5FPNA 1YAGA 4QS9A 1E4FT 1S22A 1HPMA 2GWJA 3FGUA 3VESA 3IMXA 1XQSC 3O80A 5FPMA 4BRFA 3HTVA 3QMLA 1MDUB 5AQRA 3WXJA 4DB3A 3VF2A 3H46O 4K43A 2D0PA 1IG8A 3M3ZA 1V4SA 2GEMA 1SZ2A 2E20A 1T6CA 3I33A 4H0YB 3DXKA 4MO4A 2E2OA 1NGBA 2CH6A 3WXLA 1YVNA 5EXWA 3QICA 5BPNA 3CJAA 2NZTA 3MN5A 4WQ4C 3IUCA 3DJCA 4CZGA 3VERA 1QHAA 1U2VA 4CBUA 1RFQA 2Q2RA 3L6QA 4BR9A 4HTLA 1XC3A 3A5NC 4BRLA 3LL3A 5EY4A 5AQNA 3ATUA 2Q0UA 4NB4A 3I8BA 1U6ZA 2BUPA 3HM8A 2P9NB 2W40A 1KXPA 3HZ6A 2Q0RA 3P4IA 4M7YA 4BRKA 4BVOA 5ADXA 1S3XA 1NGGA 4FPBA 4QS8A 4F9OA 5AZIB 3TU5A 5CE3A 2E1ZA 2ZWHA 4I6MA 1HKBA 3ID8A 2A41A 1X3NA 2A42A 2P9LB 4H5RA 4DHYA 4H03B 2P9KA 2NRHA 1K8KA 3VEVA 4CZIA 3CIPA 3AAQA 5BPMA 1OKJA 5KQDA 3VGLA 2QWRA 3DWLA 3DXKB 4IJNA 4YDUA 5AQGA 1NLVA 4CJ7A 2GTDA 5AQYA 4Z94A 5JLFA 3AARA 3CERA 1BA1A 1H1VA 4CZFA 3VETA 3VENA 1LOTB 1MWMA 3UKRA 1U2VB 4BQLA 3QBXA 1WOQA 3D2EB 4B1VA 3ZETA 3VEYA 1NM1A 4BVPA 3FZLA 4AM6A 3VOVA 3DAWA 1YXQA 3SK3A 3S41A 4BRDA 3R8EA 2P9IB 4FWSA 3ENOA 1QQOA 1BOTO 4CZMA 3HI0A 2Q97A 5AFUA 2A40A 4WQ5A 3MCPA 3WT0A 1GLAG 4XH5A 3U9DA 3FZFA 2ZGZA 1NGCA 3GOIA 1JCEA 4BREA 1HKGA 3O1BA 5AR0A 4E1JA 3MN9A 4I6MB 1LCUA 1JCFA 3A5MC 5BN9A 4FWNA 2FXUA 4A2AA 2A6AA 2D1KA 2E8AA 3HBTA 4B1ZA 4GY2B 1DGKN 2V51B 1P8ZA 3O4WA 3VEXA 1K8KB 3QFUA 4LC9B 1BWFO 4H0PA 2FF3B 2A3ZA 3O6WA 4BQZA 1X3MA 2YJEA 3M1FA 2FSNA 3FLCO 5AQJA 1HLUA 3CJCA 4CD3A 1NGIA 4PL8A 2CGKA 3U8XA 3UKRB 5BREA 3WXIA 2E2NA 3KHYA 2HMPA 5BRFA 3ZETB 5E84A 1WUAA 1CZAN 1C0FA 4XH4A 2ZGYA 3O5BA 1GLFO 2YHYA 2ZF5O 5KQ8A 3CJ9A 2D0OA 2P9LA 3ENHA 4GNIA 3H45C 4H0XB 4JNEA 5AQQA 3WUHA 1XUPO 1BG3A 4BGAA 3IDHA 4K42A 3WQTA 3ZX0A 4DQ8A 5BRDA 5AQMA 5BN8A 4FOIA 1NGJA 3VGMA 5F0XA 4DCHA 4BC2A 3L4IA 2Q31A 1SQKA 2WUSA 1KAYA 2IVNA 1RGIA 5E26A 5KPTA 4BGBA 3D2EA 3O1WA 3O08A 2FSKA 2Q1NA 1GLJO 3BF3A 3AAPA 3A8YA 5AQIA 1NGFA 5LJVA 1BDGA 2PBDA 4CI6A 4JHDA 5B8HA 4PKIA 3EZWA 5AZJA 2QWOA 2P9IA 4H0TB 4EHTA 1HX1A 1QZ5A 2CH5A 3B8AX 3CQYA 3H6EA 2IVOA 2A5XA 3WEEB 4FSVA 2H3GX 4A61A 4BRGA 2QW9A 3BF1A 3MK6A 2W41A 4J8FA 3ZEUA 3R6MA 4AM7A 4B1YB 5KPZA 4MO5A 1ESVA 2QWMA 3BUZB 3F9MA 2GELA 5AQHA 4CZEA 1NGAA 1T6DA 2GWKA 3CI5A 1GLLO 4QS7A 2I7NA 5FPEA 4B1XB 3ZX2A 4RWTA 4BRPA 3ULEA 4FWRA 3JXUA 3C7NB 2QWQA 3GBTA 5EOYA 4BC3A 3VEWA 1QQNA 4IWVA 5AQZA 2UYTA 4BC4A 1KAXA 2P9UB 1EQYA 2IVPA 3MN6A 3L0QA 5JICA 2FLOA 3FE1A 1R59O 3RSEA 4FPAA 4H0OA 4CZKA 4CZLA 3UB5A 4IJAA 4JHDB 1ZXOA 2QXLA 1C0GA 4ISGA 5TKYA 5FPDA 2YJFA 1GLCG 5AZJB 2BTFA 1IJJA 3QB0A 1HJOA 1QZ6A 4K41A 3J8AA 2QWLA 4FWPA 3D2FB 1TYQB 4PL7A 4WYBA 4FWKA 4PKHA 2E1YA 4EIAA 3GE1A 3A5LC 3U9ZA 4H5NA 2V7ZA 4JN4A 3ZEUB 3EKUA 5AQTA 1GLDG 2PAVA 2HOEA 2HF3A 1ATNA 3VEZA 4H5WA 1NWKA 2AP1A 1YUWA 3A0IX 4B9QA 2HF4A 4JD2A 4BROA 1JCGA 5LY3A 3ULEB 1NMDA 2FF6A 3JS6A 3CJBA 4EFHA 3M6GA 2VYPA 2ASOA 3LDQA 1RDWX 4O8KA 3WQUA 4BRQA 4BR7A 4IXCA 3WEEA 3DXMA 5F1XA 1TUYA 2J4RA 3GL1A 3RSEB 4CZJA 1E4GT 1ATSA 1HKCA 5AQSA 2E2PA 4FWOA 2CGJA 3C0BA 1Z6RA 3VF4A 2CGLA 3LM2A 5AQPA 3CHWA 4Y0WA 3OHRA 2D4WA 3VF6A 1V4TA 5JMVA 5AQFA 1BO5O 4L3QA 3H1QA 3CJ7A 4IZ9A 3MDQA 3C7NA 3O8MA 3HSCA 2DPNA 1KAZA 2AA4A 2NLXA 2P9UA 5AQKA 5AQXA 4BRIA 2E2QA 3BEXA 4BRNA 4FO0A 4A62A 4BRMA 1G99A 4WQ4A 3D7EO 3IFRA 4K25A 4BC5A 3SJHA 4JD2B 4M7XA 2YHXA 4HWIA 1ZBSA 4MLHA 4B1UB 2I7PA 5AQOA 2YCHA 3WXKA 3W0LA 3SLCA 3UKUB 3D2FA 1NGDA 1TYQA 1X9JA 3SMSA 5I9EB 5AQVA 4BR4A 5AQWA 3LDLA 4BRCA 3DXMB 2KHOA 4FWLA 3AY9A 4BR0A 4EAHD 3TPQA 2P9PB 5F2RA 4FOEA 4EHUA 3H3NO 2F9TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KWIA 4DQPA 3NHGA 1ITGA 3DLEA 3P83D 1SL2A 1NKBA 3LZJA 3PY8A 4RG8A 4CF9A 2VWJA 4DF8A 4Z4CA 4DR3K 1Q18A 2VGNA 1BU6O 1UOCA 4BG8A 4KTZA 3K5NA 4V19S 3HJFA 2KW4A 3FZKA 3IAYA 1OH6A 5TKWA 3VPZA 4B1WB 4GW6A 1Y97A 4AH9A 4OVLA 2ZJPL 2YHWA 1ZC6A 4J2EA 4WFBL 4WF9L 4FLUA 4PY5A 5HRSA 1NK6A 2OANA 3DI6A 3U6FA 1VSKA 1Y64A 2P9SB 2FSJA 3VEOA 3O9RA 1VQ9N 4JI2K 3EKSA 4H5VA 3AA3A 1TVRA 4XEIA 3C6UA 4CIGA 3G4SN 4N47A 4CGHA 4DTUA 2QKBA 2ZJRL 4CF2A 4DTJA 1WLJA 4WFAL 2ZQBA 4BDYA 4DQSA 4FJKA 4NXMK 1J54A 1NOYA 1HUXA 2HBKA 1A5WA 1BL3A 2UUAK 1M1KO 1QSSA 3GG4A 4B3OA 4IKFA 1TK0A 3HT3A 4DWIA 1REVA 3ISNC 3MN7A 5AFUH 4M63C 2P9NA 3H1VX 5EVZA 4JV5K 4JI7K 4H8KA 5AZIA 1JKHA 3CQXA 4ISFA 3W3DA 3V9WA 1Q7YO 2QK9A 1YAGA 4QS9A 1KVAA 4PA1A 1IG9A 2E6MA 1K6YA 3SUOA 2UXDK 4BRFA 1MDUB 1Z26A 3WXJA 4YHHK 4KHYA 4DB3A 1ZBIA 2O4GA 3LAKA 1IG8A 1TKZA 1YIJN 1V4SA 4J2DA 2E20A 1C1AA 1NGBA 2CH6A 5CZ1A 4NCAA 5EU7A 2KKZA 1WSJA 4IFYA 3AGRA 1ASUA 3CJAA 3KLIA 3MN5A 3K9JA 2IGIA 1ASVA 1QHAA 2Q2RA 3L6QA 3M8PA 4BR9A 3V9ZA 4KHWA 2GX9A 3A5NC 3TTCA 1N6QA 5J1EA 5AQNA 1NJIO 1TK5A 1CXQA 4FVMA 4FJJA 1GOAA 3SAGA 2BUPA 4IO9L 3T69A 3HZ6A 2Q0RA 4BVOA 4RW4A 5ADXA 4W5NA 4CEQA 4ID1A 4E0DA 2PY5A 4JK9A 1U4BA 4LH5A 4QCLA 3KD1E 2A42A 3DRSA 4H5RA 3K59A 1XI1A 3D45A 3VEVA 4CZIA 3C6HA 3CIPA 4RW8A 3SUQA 3RMCA 3TTDA 3DMJA 4M45A 5M1OA 2QWRA 5KRTA 3DXKB 3CCJN 3CCRN 2GTDA 5AQYA 4Z94A 3TTFA 3DRPA 4AHRA 2F96A 1YTUA 1U2VB 2YKNA 1WOQA 4JI4K 4KB1A 4G9ZA 3P38A 4O55A 4F3OA 4CHOA 3ZT2A 3VQBA 4I2QA 4HUEA 1VQ7N 3DAWA 1YXQA 3T7ZA 4FM0A 4BRDA 1HNZK 3KK7A 4FWSA 2JWKA 4CZMA 3MX5A 4KHPK 2Q97A 1TKTA 4WQ5A 3SBGA 1VRUA 3O1BA 2KFNA 3CPEA 1JL2A 4IOXA 4CFAA 3THXA 3A5MC 4FWNA 2QA4N 4A2AA 3HBTA 4OKKA 4B1ZA 5AJ3K 1N36K 1P8ZA 5SZTA 4LC9B 4JI1K 4PUOA 4H0PA 2A3ZA 4JI8K 2FSNA 4FLYA 3FLCO 1LWEA 1TKDA 3KK1A 1OH7A 3CC4N 1QTMA 3JSMA 3SAHA 3NBPA 3KHYA 2HMPA 5DK5A 5BRFA 5E84A 4RW7A 1WUAA 1CZAN 1XHZA 2Z1GA 2HHQA 4M42A 4YOVA 4C1NI 2AJQA 2QEXN 2D0OA 3ENHA 4GNIA 5AQQA 4CJKA 3QERA 4RW6A 1RTJA 2B6AA 3OYMA 3CM5A 3V81A 4JKGB 1SKSA 1RT1A 5AQMA 1VSIA 1IKXA 3L3UA 4FOIA 3VGMA 3NGYA 4DCHA 3L4IA 1SQKA 1KAYA 1L5UA 1T05A 1S72N 5KGWA 1IBMK 1GLJO 3AAPA 2PFUA 1VSHA 4IOCL 2HNDA 4IBNA 2JWLA 4ILGB 3EZWA 3SUNA 4PHTX 1DTTA 4H0TB 4C8OA 4JRPA 1QZ5A 4JK7A 3EE8A 4EP5A 4R79A 2A5XA 2G8VA 3CG7A 2QW9A 4Y1DA 4AM7A 4B1YB 1S5JA 5IWAK 4MO5A 3QEVA 3VQAA 1JXEA 2D5RA 2GELA 2O8DB 2P5OA 1C6VA 4JS5A 1T6DA 4HHTA 3AVGA 3QEPA 3CI5A 1IBKK 1NK8A 3SQ4A 2XRIA 4F3TA 4CGDA 4BRPA 3JXUA 4BC3A 1QQNA 3CFPA 5AQZA 4OPKA 2R7YA 3SJJA 5JICA 3FE1A 4EP4A 4FZYA 1P90A 3SI6A 4JHDB 3QETA 4OPJA 1ZXOA 5FPDA 4DV6K 5AZJB 3QB0A 4CJRA 3OYIA 1HRHA 4PL7A 3RRGA 4WYBA 3K5MA 4JKGA 3PIOL 3GE1A 3PO4A 3CC7N 4HTUA 1ATNA 2O8BA 1TKXA 4MFBA 1NNEA 3VEZA 4M3YA 4FLWA 3TSUA 1RBUA 4H5WA 2OPPA 1EXQA 4LSNA 5C10A 3VQEA 3A0IX 2W6LA 4JD2A 1J53A 1NJZA 4FM1A 3E9OA 4WCEL 1VHXA 3EEQA 4DV2K 1NKEA 2NRTA 3M6GA 1JXBA 1S1WA 4J2AA 3DLGA 1RDWX 4BRQA 4CJSA 4F2RA 5F1XA 1TUYA 3OW2M 2J4RA 3RSEB 1VSLA 3TARA 3RR7A 5AQSA 1G15A 4DU4A 1ZBLA 3CMAN 3CFOA 5AQFA 1HQEA 4L3QA 3CJ7A 3MDQA 1L3UA 4FLZA 4FLXA 2DFFA 1ZBUA 4W5QA 3MECA 3J81O 4M3RA 1S9GA 3OYJA 2E2QA 3BEXA 4BRNA 4DLEA 4OX9K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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