4IWVA

Crystals structure of human glucokinase in complex with small molecule activator
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
449
structure length
443
Chain Sequence
SSNSQVEQILAEFQLQAADLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHAAASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Optimising pharmacokinetics of glucokinase activators with matched triplicate design sets the discovery of AZD3651 and AZD9485
rcsb
molecule keywords Glucokinase isoform 3
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 168
structure length 443
sequence length 449
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iwvA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4iwvA01
3EZWA 3MN6A 3SJHA 3O08A 1IG8A 2GWKA 4H5WA 4K43A 1YXQA 1S22A 4H0XB 4H0TB 1X3MA 3EL2A 1XQSC 4Y0WA 3JXUA 3WXKA 2I7PA 3O8MA 3ULEA 3VF2A 3QMLA 3U9ZA 4A2AA 3I8BA 4I6MB 3CJAA 2ASMA 2P9LB 3EN9A 3GOIA 5AQPA 4L3QA 5AQGA 4K42A 3ZX0A 3VF6A 5BPLA 4B1ZA 2FSKA 3M1FA 5AQOA 4B9QA 3JS6A 2GEMA 1RFQA 1V4TA 4FO0A 1X9JA 2DPNA 3FZLA 2QWRA 3D2EB 2ZGYA 1T6CA 3FZMA 1HJOA 3VEZA 3D2FA 3WXIA 3A0IX 3ZETA 4O5FA 1ATSA 5AQUA 4BR0A 5AQXA 2P9PB 1OKJA 3WXJA 4CZKA 4BRFA 2P9NA 3QFUA 1BO5O 3ATUA 2E2NA 4FPAA 5EY4A 1ATRA 4DHYA 4MLHA 3LDLA 4FL9A 4BR2A 5BRFA 1X3NA 1NM1A 5BPMA 5AQNA 1Y64A 1KXPA 2E20A 2J4RA 1GLCG 3FZKA 4JAXA 2GUPA 1NGJA 1XUPO 2CGLA 3KHYA 2ZGZA 5AQFA 3FE1A 1C0GA 5AQKA 3LL3A 3VGMA 1Z6RA 4FSVA 3FGUA 5ELZA 3I33A 4I6MA 4BRLA 3QB0A 4BRCA 2P9LA 4CZLA 4NB4A 3CIPA 2CGJA 5EX5A 3WQTA 1HLUA 1KAYA 5AQWA 3ZX2A 3HZ6A 2P9UB 2Q0UA 3OHRA 5EXWA 3D2EA 4IXCA 2QWPA 5FPEA 2P9IB 5F0XA 4BC5A 3W3DA 3A5NC 3EO3A 3BF1A 4BRMA 1MWMA 3CJBA 4DB3A 5LJWA 2P9PA 2QWLA 4FWSA 1HKGA 1MWKA 4H5VA 2YJEA 5TKYA 4GY2B 3WQUA 4JHDB 3IFRA 4RCHA 4PL7A 1HPMA 4CZJA 3VETA 5EVZA 3GG4A 1NGGA 3GL1A 4CZGA 5AQZA 5JLFA 1NMDA 2KHOA 1NGIA 1BUPA 3H3NO 3HTVA 3AAPA 3R8EA 4CJ7A 4EHUA 3ENOA 5AQJA 3HBTA 1YUWA 4FWRA 3O6WA 2FF6A 1H1VA 3O1WA 4XH1A 4YDUA 5AQSA 1TUUA 3WEEA 1KAZA 2VCPA 3LDPA 2QWNA 3VOVA 3DXMB 3FZFA 4FOIA 1DGKN 4WQ5C 4WQ4C 5F1XA 1GLLO 2BUPA 2EWSA 3DAWA 3L6QA 3IDHA 1E4GT 3CJ9A 4MO5A 4EHTA 3KZBA 2UYTA 2IIRA 2W40A 3VPZA 5AR0A 2IVOA 2P9UA 3H3OB 3H1VX 3QDKA 4CBWA 3R6MA 2A40A 1RDWX 2F9WA 3CERA 2P9IA 3BF3A 3MK6A 3P4IA 2E1ZA 1BOTO 1HUXA 5KPZA 4FWQA 4BRQA 4BR5A 2A41A 2Q1NA 3ZEUB 2P9KB 4FPBA 2YCHA 4BC3A 4BC2A 1E4FT 3BUZB 3ZX3A 3LDOA 4BRHA 2D1KA 4JHDA 4BR4A 2IVNA 4FWLA 4PKGA 3A8YA 1HKCA 4RWTA 5AQVA 1T6DA 4FOEA 4EIAA 4BG8A 1YAGA 1XC3A 4CZFA 1QZ6A 3L0QA 2YHXA 3U9DA 2F9TA 3EKUA 5JMVA 5JICA 5KPTA 1BDGA 3A5LC 2QWQA 2A42A 3CI5A 3VENA 3WT0A 2AA4A 4BR7A 1BU6O 5AZJB 4BGBA 3DXMA 1BA0A 5AQMA 3UKRB 3DJCA 5BRHA 3BP8A 3SLCA 3LDNA 1JCFA 3MMVA 4C23A 2ASPA 2E8AA 4IJNA 4O8KA 3VEWA 1NGDA 4H5TA 4FWPA 1BG3A 3CETA 1NGAA 5ADXH 3F9MA 4PL8A 2A3ZA 4CD3A 3SMSA 1ZBSA 3QBWA 4BRIA 2NZTA 5AQLA 1J6ZA 1TYQB 3ZEUA 2P9KA 5AQHA 2YJFA 2NLXA 3GDQA 4CZMA 2QW9A 1HX1A 3TU5A 4DCHA 4ISGA 2D4WA 3TPQA 5B8HA 4IO8A 2A6AA 3R9PA 5KQ8A 2PBDA 4CI6A 4DQ8A 3MN9A 3VEXA 3AAQA 3O5BA 3AY9A 4BRKA 5ADXA 4QS8A 3UKUB 3DWLA 1RGIA 4B1XB 3L4IA 5AFUH 1G99A 4PKIA 3J8AA 5FPMA 1U2VB 2QWOA 4CZHA 4QS7A 3B8AX 3QICA 5AQIA 1KAXA 4JNEA 1JCGA 4KBOA 5AZJA 2W41A 4J8FA 5E84A 1ESVA 2VYPA 1NLVA 3UKRA 1MDUB 3H6EA 3U8XA 3ULEB 4IWVA 4Z94A 3W0LA 2V7ZA 4HTLA 4BRPA 4B1YB 4BVOA 1K8KB 5BR9A 1CZAN 2YHWA 4H0YB 1GLEG 3A5OC 5AQRA 4BVPA 5AQTA 3LDQA 5AFUA 4LC9B 1JCEA 4XH5A 2GWJA 3SMPA 3VEOA 2QM1A 4BRGA 3HM8A 3H46O 1BA1A 1TYQA 2ZWHA 4XEIA 4YDUC 2E1YA 3FFKB 3LM2A 3H45C 1HKBA 2E2OA 2A5XA 5EOYA 4BG9A 5AQYA 1D4XA 5AZIB 3IMXA 4MLEA 3ATVA 2P9NB 2E2QA 2I7NA 3C0BA 2YHYA 3VGLA 3ENHA 4ISEA 2CH6A 3GBTA 3UKUA 2HOEA 3LM9A 3M6GA 4B1WB 2P9SB 2ITMA 3CQXA 2Q0RA 4BRDA 2V52B 4FWOA 1U2VA 3QBXA 1QHAA 1NGFA 4EFHA 4IJAA 3FZHA 1P8ZA 1ZXOA 3VF4A 3CQYA 5FPNA 2HMPA 2QXLA 5JLHA 1QQNA 1DKGD 1R59O 4QS9A 3WUHA 1ATNA 4K25A 2VWBA 5BREA 4BQZA 3IUCA 1ZC6A 1K8KA 3HI0A 3VEVA 4BQLA 4H0VB 4JN4A 3RSEB 3G25A 2H3GX 2CGKA 2ASOA 5AQQA 2D0PA 2ZF5O 4WYBA 3UB5A 3MCPA 5CE3A 5LY3A 4AM7A 4IZ9A 2HF4A 1NGHA 4BROA 3GE1A 2NRHA 4M63C 1NWKA 1YVNA 2IVPA 4EAHD 4F9OA 3CJ1A 2Q97A 2QWMA 3O80A 3EKSA 1SAZA 2WUSA 3WXLA 3M3ZA 5AZIA 1V4SA 4BRNA 3D7EO 1BWFO 3FLCO 4H03B 1NGCA 5F2RA 5LJVA 5BRDA 1NGBA 2V51B 3H1QA 4K41A 4FWMA 1NBWA 1LCUA 1T44A 1GLBG 1C0FA 4BGAA 4M7YA 2P9SA 4A61A 4CZEA 4CZIA 5KPRA 3CJ7A 4BREA 1EQYA 2Q2RA 4GNIA 3O1BA 3CHWA 4BR9A 5BPNA 2FF3B 4H5NA 1LOTB 1WOQA 4RTFD 3AARA 4FWNA 1S3XA 3UE5A 3WEEB 2PAVA 1U6ZA 4H0OA 4A2BA 3MDQA 4BRAA 4HWIA 4PKHA 3QFPA 3C7NB 5KQDA 2GELA 4JD2B 2FSJA 3DXKB 4FWKA 4CBUA 2CH5A 1DEJA 3ID8A 4H0PA 3VGKA 3RSEA 2E2PA 2V7YA 1QZ5A 1TUYA 4MO4A 5BN8A 3VEYA 2Q36A 1MA9B 4E1JA 3S41A 4M7XA 4B1UB 5I9EB 5BN9A 2HF3A 3VERA 2D0OA 2FXUA 4ISFA 1QQMA 2E88A 4AM6A 4H5RA 1Q18A 3U4LA 3CJCA 3O4WA 3A5MC 1QQOA 4A62A 1SZ2A 4XH4A 2GTDA 1IJJA 3HSCA 1GLAG 1SQKA 1WUAA 3MN5A 1NGEA 1Z05A 3SK3A 5FPDA 3KVGA 4CD1A 2FLOA 2FSNA 3BEXA 3D2FB 3ZETB 1GLJO 2AP1A 4NO7A 2YI1A 4WQ5A 2Q31A 4WQ4A 4B1VA 2OANA 2BTFA 4BC4A 3VESA 1GLFO 4CBXA 5E26A 3FR0A 3C7NA 1GLDG 4JD2A 3MN7A 3DXKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EO1A 4PQUA 2O8DA 3F5TA 3AA4A 1JLAA 3KK3A 3DOKA 4Y0WA 5JVHL 1FJGK 3SUOA 3ULEA 4O5BA 1SKWA 3RRGA 3L2RA 1UWBA 1CXQA 5AQPA 4ID1A 3VF6A 3LDSA 5AQOA 1V4TA 3PIOL 4FJKA 1X9JA 2YHAA 4FJ7A 3ZT3A 3MECA 1XMQK 3K57A 3CC2N 1NMNA 1KVAA 2YNIA 3AV9A 1N36K 3D2FA 3DI6A 3WXIA 5C10A 1WLJA 1LAWA 1KRPA 1ATSA 3ASMA 1OKJA 4DR3K 2P9NA 3V1OA 2HMIA 1L3VA 1IKYA 4RW4A 1BO5O 4JI2K 2E2NA 2ZM6K 3O3FA 5EY4A 1ATRA 4DHYA 4GVMA 4ELTA 4DTXA 3P38A 2OTLN 3T1YK 4IEIA 5BPMA 4N5SA 1YITN 4M3UA 4IFVA 3VQQA 1U4BA 4BWJA 2J4RA 1RBSA 1T3VA 3AO5A 4JV5K 3KHYA 1BQNA 2FBXA 2ZGZA 4LFAK 4NYFA 2PY5A 3QLHA 1C0MA 4WFNL 1DTQA 1Z6RA 1BL3A 3N4PA 3V9UA 4I6MA 1ITGA 4QCLA 1VQ5N 1A5VA 4CZLA 4RG8A 1RDDA 5EX5A 2Q3SA 2VWJA 1GOBA 3C94A 1ASWA 1WN7A 3DM2A 5AQWA 4CEBA 3AVMA 3DLEA 3OHRA 3L2QA 4BDZA 4GV3A 1W97L 2HBLA 5HROA 1L3SA 4FJHA 5M1KA 4FWSA 3CCSN 4FLZA 2YJEA 3NVKA 2JWKA 2A1RA 2Y1IA 4FW2A 1ZBHA 3H3NO 1HNXK 3T3FA 1JLCA 3AAPA 4EHUA 2F96A 1SL0A 3ENOA 3HBTA 3K5NA 3L2VA 3O6WA 2FF6A 3F9KA 4IKFA 3O1WA 1EWRA 1KAZA 2QA4N 2QWNA 1QHTA 1TGOA 1LW0A 4CFCA 3FZFA 1QSYA 3SBTA 4DU3A 3KJVA 3KLGA 5C25A 3DAWA 4KHPK 4EHTA 4JK9A 4B9NA 2W40A 5IWAK 1W0HA 3C6AA 3MEDA 2HBMA 4AHUA 1RDWX 3CERA 1EP4A 4CHOA 2RN2A 4JKEA 1TKTA 1NK6A 3I0SA 4BRQA 2KLAA 2P9KB 4LD0A 4KI4A 1IKXA 4BC2A 3CXCM 3LDOA 2QK9A 2WBNA 4BR4A 2IVNA 4FWLA 5M1QA 5C12A 2RF2A 4BE0A 3AVGA 4OO1J 4OVLA 2YHXA 3PLAA 4JKGB 5JICA 4M3TA 4FM0A 2EX3A 4DG1A 2E6LA 3K9JA 3MEEA 3WT0A 1Q81O 1BU6O 3OBYA 1JLQA 4MFBA 4DTUA 3DXMA 4JKCA 5HRSA 4B9LA 3E9LA 2KFNA 4DTNA 3SLCA 4HCBA 1HRHA 3LDNA 3HYFA 3ALYA 4JEPA 4C23A 2X6NA 1RT1A 4YY3K 4J2DA 4H5TA 3TAEA 3M8SA 3CETA 1RBRA 1IBKK 3F9MA 2IAJA 4YOVA 4CD3A 1C1CA 3VA3A 1ZBSA 4Z0UA 3KLIA 1J5OA 5FROA 3ZYYX 4CIFA 1W2BM 2NZTA 2UU9K 3NGIA 2KZZA 3M8RA 2HHWA 4F4KA 1LAVA 4W5NA 3SPZA 1HX1A 3TAFA 1ASVA 4JKFA 3MWPA 3ZT2A 4DCHA 3C6TA 1G15A 3TPQA 2XY6A 1YI2N 5LMNK 5KQ8A 2PBDA 2EHGA 1J9AA 4DQ8A 1Y97A 3OW2M 4NXNK 4QS8A 4CJLA 3DWLA 1NJIO 2ZD1A 4RW6A 4YOUA 4PKIA 1GOCA 3DRSA 4GVEA 3QESA 5FLXO 1RBUA 2NRRA 4GKJK 3K59A 1KAXA 4KTQA 1FXXA 4CJTA 2P51A 4CK2A 4DQRA 4LF4K 3PY8A 1MDUB 5D3GA 1QQCA 3NCIA 2WOMA 1D5AA 4KTWA 3V9WA 1JJ2M 4MQ3A 4B1YB 5E41A 4X64K 3KK1A 3QNNA 1CZAN 4JYAK 2YHWA 4LY7A 2G8HA 4H0YB 4O0IA 3DYAA 3A5OC 3SAGA 3OJSA 4BVPA 4XH5A 4CJEA 3PUFA 3CPEA 3TTCA 4BRGA 3HM8A 3OYEA 1BA1A 2ZWHA 1IO2A 2IOCA 4CK1A 3FFKB 4YNQA 3HO1A 4KI6A 3ID6A 1JL2A 4FLXA 4H8KA 2W6LA 1YF5L 4B3SK 3K2PA 3LP2A 1BIUA 5CHIA 3OVNA 3V1QA 4K8ZA 5AQYA 1RDCA 3ATVA 2I7NA 5J2QA 4AF1A 1JL1A 3L3VA 4DMNA 4DLEA 4ISEA 3THWB 3VTHA 3S9HA 4DSLA 2HOEA 3NHGA 4M3XA 3M6GA 3V9SA 2P5GA 2F8TA 1BIZA 1XWLA 4BE1A 2XY5A 3NF6A 3HRGA 3FZHA 4WFAL 3VF4A 2YKNA 2HMPA 3OY9A 2G8IA 3HSTB 1N5YA 1QQNA 3I8DA 3WUHA 1T05A 1NOYA 4ELUA 4BQZA 4CEZA 4FK0A 4CIGA 4F2SA 2OPSA 3RSEB 1BQMA 1WAFA 3EE8A 1O1WA 4H0VB 3JSMA 5JVGL 3NF8A 2ASOA 4CESA 1NKEA 2D0PA 2E6MA 4WYBA 3UB5A 4E7KA 3V9XA 4C8OA 4AM7A 5CR4A 1WSFA 3CM5A 3O9TA 4DF4A 2YHBA 4IOAL 4EAHD 4F9OA 3CJ1A 3BDPA 3KWGA 2ZJQL 2Q97A 3O80A 4F2RA 5M1NA 3SQ4A 4BRNA 5AZIA 1XI1A 3SI6A 1BWFO 3FLCO 4KHYA 3P5JA 1NGBA 3MAQA 3ZSQA 4FWMA 1LCUA 1WSJA 3SAHA 3G6EN 2P9SA 1TKZA 5CYQA 1P90A 3NVMA 2RKIA 2O8BA 4GNIA 2OTJN 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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