4IXCA

Crystal structure of human glucokinase in complex with a small molecule activator.
Total Genus 171

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
447
structure length
443
Chain Sequence
NSQVEQILAEFQLQAADLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHAAASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
50100150200250300350400400300200100
050100150Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Matched triplicate design sets in the optimisation of glucokinase activators maximising medicinal chemistry information content
rcsb
molecule keywords Glucokinase isoform 3
total genus 171
structure length 443
sequence length 447
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ixcA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4ixcA01
2H3GX 1YXQA 3GBTA 1XC3A 4CZEA 3ZX2A 3ZEUA 4BVPA 1NGBA 5AR0A 1GLLO 1YVNA 3A0IX 3ULEB 4FWRA 3HM8A 3WXLA 1HX1A 4A2AA 4BRKA 2D0PA 3I8BA 5AQZA 3A5OC 2Q0RA 4WQ4C 3CI5A 5LJWA 2QWOA 2D4WA 3WUHA 4JAXA 1QZ5A 5AQPA 4YDUC 1CZAN 2QWQA 2QWRA 1X3NA 3GG4A 4BR7A 1ATSA 1T44A 3QB0A 5AZIB 4AM7A 5AQOA 3AARA 2ZGYA 2CH5A 4DCHA 2V7ZA 3D2EA 3VF6A 3JS6A 4BRLA 2PAVA 2V7YA 1XQSC 1YAGA 2P9PA 3CERA 3IFRA 4Z94A 1NGFA 2GEMA 2P9UA 3MN7A 3H1VX 2ASPA 1QQOA 2A41A 3LDLA 2QWPA 1NGIA 4A62A 4BRDA 3UKRB 5KPZA 5F2RA 1KXPA 4EAHD 3EZWA 5B8HA 3LM2A 4FWPA 4MLEA 4L3QA 1HUXA 3RSEA 1X3MA 3FFKB 4M63C 1MA9B 3UE5A 3WXKA 4DHYA 5ADXA 3WQTA 3H1QA 5AFUH 4BRCA 1U2VA 3IDHA 3SK3A 3QMLA 4PKGA 2VYPA 1NGJA 1BU6O 4H5RA 2FSKA 4BC5A 4A61A 2A6AA 4B1YB 3SLCA 3U4LA 3R6MA 4KBOA 5AQJA 2E2OA 2D1KA 1YUWA 2HF3A 4A2BA 2CGLA 3CIPA 5ADXH 4M7YA 2FF6A 5AQTA 5CE3A 5FPDA 3B8AX 3ZX0A 3D2EB 4GNIA 4CZFA 2P9PB 4GY2B 1ZC6A 2P9UB 3A5MC 5AQYA 2F9WA 3IUCA 1E4GT 4XH4A 4ISFA 2J4RA 3MN6A 3VEWA 4IJAA 2WUSA 1RGIA 2IVNA 4O5FA 5JLHA 1BDGA 5F0XA 3AAQA 3EO3A 1HKBA 3A8YA 3HI0A 2YHXA 1GLCG 2A42A 2YHYA 3CJBA 3GL1A 3ATVA 3RSEB 3VETA 3CJ1A 4H5TA 4BR4A 2P9NA 3MMVA 1U2VB 2E2NA 2FSJA 2YHWA 3R9PA 3H45C 3WXIA 2VWBA 3CJAA 1X9JA 1Y64A 4I6MB 2QW9A 4FWNA 4JHDA 2W41A 2YJEA 5AQKA 4EFHA 1NGCA 3L6QA 4MO4A 4CZGA 3UKRA 4ISGA 4EIAA 5BRHA 2CGJA 3MN9A 2CH6A 5KQDA 5AQGA 3L0QA 2ASOA 5EVZA 3UB5A 5JICA 3LM9A 4FOIA 5KQ8A 5ELZA 3M1FA 4E1JA 5KPRA 4IO8A 2HF4A 2V51B 2ZF5O 4RWTA 3DAWA 4H0YB 4FL9A 4BRPA 3HSCA 2Q36A 3DXKA 4CZJA 4F9OA 3SMPA 1D4XA 3EKUA 2EWSA 2UYTA 4CI6A 1QHAA 2F9TA 4DQ8A 4XH1A 4WQ5A 3HBTA 3F9MA 4H03B 2NLXA 1HKGA 2ASMA 2IVPA 2CGKA 2P9NB 4BR9A 3FLCO 3VERA 4XEIA 1BA1A 2HMPA 3VESA 2DPNA 5KPTA 1BUPA 1R59O 1HKCA 3QICA 4JHDB 1NGGA 4QS7A 4FPAA 4Y0WA 1NLVA 2BUPA 3EL2A 2QXLA 4K43A 4B1VA 5AQIA 2A5XA 3SMSA 5BPMA 2GWJA 4LC9B 2ITMA 3CQYA 3AAPA 3EKSA 4K25A 2Q1NA 4IXCA 1SAZA 2V52B 4QS9A 5BR9A 2GUPA 2YCHA 4BC2A 5AQFA 5LY3A 4H0VB 2P9KA 3CJ9A 4JN4A 5EX5A 3DXKB 4CZIA 1V4SA 4I6MA 4CD3A 1Q18A 2ZWHA 4WYBA 3MK6A 4RTFD 2FF3B 1SZ2A 3FZLA 1J6ZA 1GLBG 1HPMA 5F1XA 3I33A 1NM1A 5AQRA 3O08A 5JMVA 3O80A 3QBXA 2W40A 5JLFA 1KAXA 1Z05A 3LDOA 4CZHA 5LJVA 2E1YA 1QQNA 4FPBA 3TU5A 4BRGA 4FWKA 3ZETA 1TUYA 4BREA 1HLUA 1IJJA 4NB4A 3DXMB 1C0GA 2OANA 3L4IA 3H3OB 4K41A 3DJCA 2PBDA 5AQSA 3P4IA 1NGEA 2P9IB 3VGLA 2KHOA 3CJCA 4IZ9A 4BQZA 1ZXOA 1K8KB 3M6GA 4M7XA 4BC3A 1G99A 1H1VA 2ZGZA 3A5NC 4DB3A 4FWOA 4CD1A 3VEVA 3H46O 1GLEG 2D0OA 2FLOA 1KAYA 4RCHA 2YI1A 4WQ4A 5AQQA 5AQUA 2Q2RA 2QM1A 4CZMA 5BRFA 4CZKA 2P9KB 4YDUA 2E2QA 1NGAA 3U8XA 2A40A 3JXUA 3DWLA 4EHUA 1GLFO 4H0OA 2P9LA 3TPQA 3EN9A 3D7EO 3VF2A 3FE1A 4B1UB 3WXJA 1Z6RA 4IWVA 5BN9A 3U9ZA 3VEXA 1BA0A 4IJNA 4H0XB 3VGMA 2FXUA 4C23A 3G25A 3H6EA 3VENA 4FSVA 4BG8A 2I7PA 1MWKA 2AA4A 4MO5A 4XH5A 1LCUA 5TKYA 3ZETB 5BREA 4BRNA 1ATRA 2VCPA 4BG9A 1ESVA 5AZJA 3ID8A 1NGHA 1WOQA 1ATNA 4FOEA 3M3ZA 1HJOA 1KAZA 2AP1A 1BO5O 4J8FA 3SJHA 3VPZA 4BQLA 5EOYA 2P9SA 3H3NO 1DGKN 3C7NB 4H0PA 2IIRA 5AQVA 3CJ7A 4FWQA 4H0TB 4H5NA 4B1WB 2Q0UA 1V4TA 3LDNA 3BF3A 4CBXA 1P8ZA 3AY9A 3GOIA 3CQXA 3FZFA 3VEZA 4BGAA 4CBWA 5EY4A 1JCGA 2IVOA 1EQYA 3UKUA 4BVOA 4B1ZA 3D2FB 2I7NA 5AQWA 3DXMA 1TYQA 4O8KA 4BRHA 4PL7A 2E20A 3O5BA 4BRMA 1NGDA 2P9IA 2P9LB 3WQUA 1XUPO 3HTVA 4K42A 3O1BA 3O1WA 4FWMA 1IG8A 1K8KA 2BTFA 3W3DA 3ENHA 1OKJA 4BC4A 3BEXA 4NO7A 4AM6A 4CJ7A 5AFUA 4PKHA 5AQMA 3MN5A 3WT0A 1DEJA 1T6DA 3VF4A 4CBUA 1GLAG 4B9QA 3KZBA 5FPNA 4B1XB 5AZJB 1S22A 3FZMA 3LDPA 3HZ6A 3BP8A 2GELA 1C0FA 5FPMA 3VEYA 2P9SB 3MCPA 3FZHA 2HOEA 5I9EB 3ZX3A 3QFPA 4FO0A 4BR0A 5EXWA 1BOTO 1NMDA 1QZ6A 2A3ZA 4MLHA 1BG3A 1SQKA 4BRAA 2QWNA 2FSNA 3UKUB 3ZEUB 4CZLA 2E2PA 3FGUA 3O6WA 4WQ5C 1RFQA 1BWFO 1TYQB 3VEOA 3WEEA 1DKGD 3QDKA 5E84A 5AQNA 3A5LC 2GTDA 3OHRA 3CHWA 1T6CA 3U9DA 5BRDA 3GE1A 4BR2A 3ATUA 1U6ZA 3BUZB 3C7NA 4QS8A 3S41A 2NRHA 3VOVA 5FPEA 4FWLA 1S3XA 3KHYA 4BRQA 1MDUB 2Q31A 4BRFA 2GWKA 3ENOA 2YJFA 4JD2A 4BR5A 1E4FT 4JNEA 1NBWA 4HWIA 4ISEA 1WUAA 3D2FA 3CETA 2E1ZA 3O4WA 4PL8A 1NWKA 2Q97A 3ULEA 1LOTB 5BPLA 2QWMA 4H5WA 3MDQA 4HTLA 4FWSA 3GDQA 1RDWX 3C0BA 3VGKA 2QWLA 3BF1A 5AQXA 3LL3A 5AZIA 3FR0A 5BPNA 4BRIA 1JCFA 3R8EA 1JCEA 1QQMA 1GLJO 3LDQA 4H5VA 3WEEB 3IMXA 3W0LA 4BROA 5E26A 1MWMA 3FZKA 5AQHA 3QFUA 2E8AA 3O8MA 1GLDG 4BGBA 2E88A 3QBWA 1TUUA 5BN8A 2NZTA 3J8AA 4EHTA 3KVGA 5AQLA 4PKIA 1ZBSA 4JD2B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MWPA 3OYDA 1RDCA 1C0UA 3NAEA 4ELTA 3CC2N 5J2NA 5GIOA 3WNGA 4JI2K 1EWQA 5AR0A 3HPHA 2VG5A 4E0DA 1YVNA 3A0IX 4FWRA 3RTVA 1EP4A 3HM8A 1JKHA 4B3SK 4WFBL 3I8BA 5D3GA 4Q5VA 5LJWA 3ISNC 4OVLA 4CJVA 5AQPA 4PY5A 1X3NA 3GG4A 4BR7A 3QB0A 4JI6K 4CJQA 2VQFK 2BGGA 3NGIA 1KVCA 3D2EA 3LP0A 2V7YA 4DSLA 3ENBA 2XO7A 3MN7A 3NH0A 1RCHA 4FM2A 1BISA 1QQOA 1NGIA 2GUIA 2YHAA 1KXPA 3MEDA 4EAHD 3OBWA 4B3OA 3KLGA 1RNHA 2A1RA 1HUXA 3M8PA 1KSPA 2VGNA 3SBGA 1WSIA 4CHZA 4DQQA 3SK3A 4DKWA 4PKGA 1NGJA 4H5RA 2FSKA 4UQGA 1XMQK 1JLQA 1IBLK 3AVKA 4KBOA 2A1SA 4C8NA 3SPYA 4LFAK 3K2PA 2D1KA 4KV8A 5CZ2A 1QSYA 4A2BA 1I3AA 3M8SA 3AVLA 3D2EB 3A2FA 3EE9A 4GNIA 5IWAK 4K8XA 4GY2B 4KKOA 4DTJA 4DLEA 3AVHA 1X9WA 4FJIA 2J4RA 3KWGA 1VSJA 5LMUK 1YVUA 4ILJA 3SJJA 1T03A 5JLHA 1UAXA 1D9DA 3CCSN 5CY4A 3IAYA 2YHYA 4N56A 3GL1A 4CJSA 3CJ1A 2P9NA 4CHOA 4F3TA 1J5OA 5GAGP 1TL3A 1D9FA 2NRXA 4FLTA 4JI8K 1X9JA 4EP4A 1SKWA 4FLYA 3VQPA 4IOAL 5AQKA 4EFHA 3SUOA 1XNRK 3AVIA 3L2RA 1A5XA 4LSNA 3J7ZO 2CGJA 3SUNA 2UU9K 5AQGA 5EU7A 4CJ5A 4EZ9A 3UB5A 3LM9A 3S3MA 3M1FA 4DFPA 2YKMA 2YKNA 2HF4A 4H0YB 3ZT0A 4DR4K 2Q36A 3DXKA 4HUGA 3DYAA 1U04A 2RE2A 3K5NA 4KHQA 3EKUA 4KH4A 2EWSA 1LAVA 3OYKA 3KLHA 3NH1A 1Z26A 4RW6A 3CQ8A 4CGIA 3G0ZA 4WQ5A 3F9MA 4HUFA 1HKGA 4FLWA 2VGMA 2P9NB 3FLCO 2D5RA 4XEIA 3RVCA 3VA3A 3EZ5A 4IFVA 1TVRA 2RKIA 1HKCA 3N4PA 3QICA 1NGGA 4Y0WA 2BUPA 2QXLA 3VQ4A 4CEZA 2A5XA 1FKOA 1VSMA 2ITMA 1C1AA 3V9SA 4M3WA 4YY3K 1VRUA 2E4LA 2OCEA 3EKSA 4CEOA 3L2VA 1TK0A 3J7AP 4B9SA 4KRFA 2YCHA 2YNHA 3V6DA 4AHUA 5LY3A 4H0VB 2P9KA 1VSHA 1HNXK 2F7TA 1NOYA 1G15A 5EX5A 3DXKB 4CZIA 1V4SA 3THYA 4GW6A 4I6MA 3O3HA 2ZWHA 2E5LK 4LSLA 2P5GA 2E6MA 4FLVA 3E1YA 2RHKA 3FZLA 1N5YA 1BIUA 1HPMA 2HHSA 3I33A 1JXBA 4MQ3A 1NM1A 5AQRA 4DF4A 1A5WA 3O08A 3U6FA 4NLCA 1KAXA 5JLFA 3OYFA 3RWUA 4CZHA 3AO3A 3D6RA 4ILGB 4DR1K 4HHTA 4E7KA 3TU5A 4FWKA 4NCBA 3ZETA 3TI0A 4E7JA 4LF7K 2OANA 2HHWA 4B9TA 2GV9A 2PBDA 3CCQN 1NGEA 4OKJA 5JS2A 2VQEK 3M6GA 4M7XA 3F2KA 2ZGZA 5J2MA 4CESA 5HRPA 2OA8A 4TSXA 4CD1A 1Q7YO 2D0OA 3SNNA 3ZT4A 4CJPA 1N33K 5AQQA 4CZMA 5BRFA 2P51A 4DTPA 2P9KB 4YDUA 3M8QA 1IKYA 3THYB 2QKBA 3U8XA 2G8UA 4M3UA 1LWFA 4FLUA 4EHUA 4H0OA 3TPQA 4CIEA 3VF2A 3D7EO 2IGIA 1TK5A 4JK9A 4B1UB 3WXJA 1YF5L 1RTIA 1Z6RA 4O55A 4LF6K 5HL7L 1BA0A 4OPKA 1YI2N 3OBYA 4DS5A 2BANA 4BG8A 2I7PA 4DG1A 2AA4A 4MO5A 5C24A 4YOUA 3KKSA 3ZETB 3MWTA 3NGYA 3SZ2A 4BRNA 1ATRA 2VCPA 5AZJA 2UXDK 1ATNA 3M3ZA 2YV0X 2P9SA 3ZSOA 1DGKN 2G8IA 3E9OA 4B9UA 3ZLJA 5I42A 3MX2A 4B1WB 1NJYA 3NH2A 3HOTA 1V4TA 3LDNA 2NRZA 3MEEA 4C1NK 3GOIA 1NG9A 3CQXA 4G1QA 3VEZA 4B8CA 4AHCA 5HLFA 3E9LA 2Z1IA 3DXMA 1TYQA 2ITGA 4CF8A 1IH7A 4O8KA 2PFUA 3LAMA 3NMUA 3WQUA 2HNZA 4CHPA 1XUPO 4FWMA 1IG8A 3ZSYA 4IOCL 2O8DA 1HYVA 3OYLA 3LWMA 3CCRN 4B3MK 4Z4CA 1KC8O 1T6DA 3OW2M 4CBUA 1GLAG 4Y1DA 3KZBA 2PY5A 5AZJB 1YJ9N 1ZYQA 1J9AA 2OZSA 3O9TA 5H1SQ 4ELUA 2P9SB 3OYJA 3HVTA 1QSLA 1XWLA 4BR0A 3P1GA 1BG3A 4BRAA 1BCOA 2QWNA 2FSNA 3OA9A 3HO1A 3ZEUB 4WF9L 4IFEA 1FK9A 3FGUA 1TYQB 3QESA 3VTIA 1S1WA 3QDKA 5E84A 5AQNA 4HCCA 2O4GA 1T6CA 3GE1A 3KJVA 1SV5A 3C7NA 4QS8A 3S41A 4CFDA 1ZBHA 3PX4A 2NRHA 1KRPA 5FPEA 4DWIA 3P5JA 4BRQA 4M3XA 2O8DB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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