4IZ9A

Crystal structure of an acetate kinase from mycobacterium avium bound to an unknown acid-apcpp conjugate and manganese
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
383
structure length
381
Chain Sequence
DGARRVLVINSGSSSLKFQLVDPESGVAASTGIVERIGESPVPDHDAALRRAFDMLAGDGVDLNTAGLVAVGHRVVHGGNTFYRPTVLDDAVIARLHELSELAPLHNPPALLGIEVARRLLPGIAHVAVFDTGFFHDLPPAAATYAIDRELADRWQIRRYGFHGTSHRYVSEQAAAFLDRPLRGLKQIVLHLGNGCSASAIAGTRPLDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPSVVSYLCHTAGMGVDDVESMLNHRSGVVGLSGVRDFRRLRELIESGDGAAQLAYSVFTHRLRKYIGAYLAVLGHTDVISFTAGIGENDAAVRRDAVSGMEELGIVLDERRNLPGAKGARQISADDSPITVLVVPTNEELAIARDCVRVLGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium avium
publication title Increasing the structural coverage of tuberculosis drug targets.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acetate kinase
total genus 135
structure length 381
sequence length 383
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2013-01-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iz9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iz9A02
3GBTA 1HKCA 5AQTA 3ULEB 3H3OB 2QWMA 3SMSA 3H3NO 3FZHA 4QS7A 1NGIA 4BR0A 3DWLA 5AQKA 5LJVA 3I33A 1IG8A 5JLFA 3MK6A 4CD3A 4BRCA 2CGJA 2VCPA 4BR9A 4FL9A 3DXMB 5LY3A 1CZAN 4Z94A 1ESVA 4K25A 4BVPA 4B1WB 4CZIA 1T44A 2V7YA 4YDUC 2GWKA 4EHUA 4H5RA 4EHTA 4YDUA 3EZWA 3ATUA 1ATSA 1P8ZA 4PL8A 5BN8A 3FE1A 4BRLA 3VF4A 2IVOA 3O5BA 2QW9A 5AQVA 3UKUB 2P9NB 3L4IA 3O8MA 4IXCA 1V4TA 3ZX3A 4MLEA 3CJBA 1V4SA 2QWQA 2A3ZA 4MLHA 3D2FB 4BREA 4BR5A 4O5FA 1KAYA 3O1BA 4XEIA 4EIAA 4I6MB 1GLFO 2QWOA 4FWPA 4E1JA 4JHDB 1WOQA 3VGMA 5AZJB 4AM7A 2FF6A 4PKHA 2CH6A 1TUUA 1BA1A 4DCHA 3FGUA 1U2VB 3MN5A 3QMLA 1YAGA 5KPRA 1JCFA 5AQQA 1MWKA 2FF3B 3HM8A 2BUPA 5AQLA 3DJCA 4M7YA 3CI5A 3C0BA 3HZ6A 3ID8A 5JLHA 2E2OA 4QS8A 1MDUB 4BRIA 4CBXA 4FSVA 1KAXA 2E2PA 3WXJA 3D2EA 4K42A 1Y64A 3UKRB 3VPZA 2I7NA 2Q0UA 1NGHA 3TPQA 4CBWA 1BA0A 1BU6O 3BEXA 2DPNA 5EOYA 3EL2A 2UYTA 4BR4A 2E88A 4CD1A 2Q36A 4BRPA 2YHYA 4RTFD 5JICA 3DAWA 3FR0A 2YHXA 3IUCA 3FZFA 1TYQB 3BF3A 4JN4A 4JNEA 5AQSA 1T6CA 5TKYA 5AQPA 5FPNA 5AQHA 1S3XA 2AA4A 3OHRA 3EN9A 3LDPA 4H0TB 2PAVA 1DEJA 1DGKN 2F9WA 3HI0A 4F9OA 3U8XA 1LOTB 2BTFA 1BDGA 3A8YA 5EY4A 5ADXA 1K8KA 2P9KB 5AQFA 4FWOA 3O6WA 4CBUA 3EO3A 3KHYA 3ZX2A 3H46O 4CI6A 4A62A 4NO7A 2ASMA 4FOIA 2IIRA 2F9TA 3MCPA 1QQNA 4H5WA 1D4XA 2HMPA 3BUZB 1GLAG 3GG4A 4KBOA 2A42A 4CZKA 3LL3A 3GOIA 2ZGYA 5AR0A 2A41A 4BR2A 4J8FA 2W40A 3H45C 4CZEA 4WQ4A 5AQIA 3HBTA 1TUYA 1BG3A 4ISFA 1HKGA 3EKUA 3TU5A 3R9PA 4H5NA 3WXIA 1IJJA 4B9QA 2YJFA 3QFPA 3QFUA 2QWPA 2IVNA 3S41A 4L3QA 2V51B 3VGLA 2A5XA 5AQGA 3H1VX 3H6EA 3ZEUA 4Y0WA 1SZ2A 5FPEA 1GLBG 2E20A 3MN6A 3VESA 1HPMA 3UE5A 5E84A 1RDWX 3CHWA 4DHYA 2P9PA 4FO0A 4DQ8A 4XH1A 3U9DA 1KXPA 4BRGA 2V7ZA 3B8AX 3QB0A 3VETA 3VOVA 5KPTA 2ITMA 4B1YB 4HTLA 4LC9B 4H03B 3SMPA 3CJ7A 4WYBA 3R6MA 3D7EO 5AQOA 3FZMA 3D2EB 3W0LA 4BVOA 3SJHA 1HLUA 1C0FA 3LDNA 1NWKA 1RFQA 4H5VA 1NM1A 4FPAA 5BRFA 3ENHA 3IMXA 3CQXA 2D1KA 3DXKA 3A5OC 5AZIA 1BO5O 4H5TA 5BN9A 2ZWHA 2GELA 4B1XB 3A5LC 5AQMA 5LJWA 4BR7A 3AAQA 4ISEA 3VEWA 1C0GA 4ISGA 4CZHA 4IZ9A 2CH5A 5F1XA 5FPDA 1K8KB 2D0OA 4BGAA 3G25A 3R8EA 3SK3A 4MO5A 1NLVA 3O08A 3VGKA 1X3NA 4H0XB 5CE3A 3WT0A 4RCHA 5AQUA 3M1FA 4EFHA 2HF4A 1QZ5A 2QWRA 4BG8A 1J6ZA 4H0OA 3J8AA 3WXLA 1ATRA 3I8BA 1X9JA 2OANA 2ASPA 3VENA 5JMVA 2QXLA 3ATVA 4XH5A 1XC3A 3VEZA 4IO8A 3AY9A 3H1QA 4BRKA 1QZ6A 4B1ZA 2E1YA 2P9UA 3JXUA 2Q0RA 5F2RA 4M63C 2P9IA 1G99A 3JS6A 2CGLA 2FXUA 3VF6A 2ZF5O 4MO4A 2NRHA 1MA9B 2QWNA 2ASOA 3QBWA 1SAZA 3U4LA 3AARA 1X3MA 3EKSA 1HJOA 1KAZA 3MN7A 3KZBA 4BC5A 4CZFA 2WUSA 5ELZA 1XUPO 1GLJO 1ZXOA 3FZLA 3ZEUB 2A40A 2YI1A 2P9SA 3W3DA 1NMDA 4BG9A 2GUPA 1E4FT 1QQOA 2P9PB 3LDLA 1NGFA 1YUWA 3L0QA 4O8KA 2PBDA 3SLCA 3QBXA 2A6AA 4FWRA 4A2BA 4PKIA 5AQYA 4BC2A 5AFUH 3QICA 2QM1A 4IWVA 3FFKB 2GTDA 3ZETA 1JCEA 3MN9A 5BPLA 3VEVA 5AQRA 5I9EB 1E4GT 3WEEA 4QS9A 3HSCA 1GLCG 2W41A 4FWKA 2GEMA 5AQJA 3ZX0A 4DB3A 2AP1A 1WUAA 3BP8A 5E26A 3DXKB 3VEXA 5AZIB 1JCGA 3GDQA 2FSNA 5EXWA 2EWSA 1LCUA 4BC3A 3M6GA 2QWLA 1Q18A 3C7NA 3WXKA 1YVNA 2D0PA 1HKBA 3UB5A 5BPMA 3QDKA 2I7PA 3LM9A 4H0VB 3LDOA 5EVZA 1QHAA 3CJCA 4BRFA 1H1VA 1BOTO 1R59O 2D4WA 5KQDA 2ZGZA 1GLEG 4CZGA 4GY2B 1SQKA 3F9MA 3ENOA 3IDHA 1DKGD 2P9LA 3O4WA 2FSJA 2V52B 4JD2A 4H0PA 3RSEA 4EAHD 2H3GX 1Z05A 4BQLA 4B1VA 4CZMA 2IVPA 3ULEA 2YJEA 3AAPA 2YHWA 1RGIA 4HWIA 2FSKA 4NB4A 3DXMA 3P4IA 2P9UB 4XH4A 1NGDA 3GE1A 4JAXA 3L6QA 2P9IB 4FPBA 2YCHA 1XQSC 4K43A 5BRHA 3CJ1A 3M3ZA 2HOEA 1NGGA 4RWTA 2J4RA 3O1WA 3VEOA 5AQXA 5BR9A 1GLDG 1ZC6A 1HX1A 3UKUA 2P9NA 2P9SB 1GLLO 3A5MC 3CETA 4B1UB 4GNIA 2KHOA 3VF2A 4FWQA 3IFRA 4CJ7A 1BWFO 1NBWA 1Z6RA 2FLOA 3D2FA 4IJAA 5AQZA 4CZLA 4FWLA 4A2AA 4I6MA 4PL7A 4FWSA 1NGBA 3U9ZA 4BROA 4JHDA 1ATNA 5KQ8A 3CERA 1T6DA 3BF1A 1S22A 3A0IX 3WUHA 5AZJA 5BREA 3ZETB 2Q31A 4BRMA 4BRQA 2VWBA 1U2VA 1NGEA 4BRDA 3CJ9A 3VERA 3HTVA 4PKGA 3FZKA 1EQYA 3WEEB 4BRNA 5BPNA 3CQYA 3O80A 5ADXH 5KPZA 2HF3A 4K41A 3MDQA 2GWJA 2CGKA 4FOEA 4A61A 3LDQA 2E1ZA 3LM2A 1NGAA 3CJAA 4BRAA 3UKRA 5EX5A 3C7NB 4M7XA 2E2QA 1HUXA 4BQZA 1U6ZA 5F0XA 5FPMA 4BC4A 2VYPA 1OKJA 1BUPA 2E8AA 4BRHA 3FLCO 4CZJA 3KVGA 4H0YB 5BRDA 1QQMA 1ZBSA 4BGBA 5AFUA 5B8HA 1TYQA 5AQWA 4C23A 2E2NA 2Q97A 2Q2RA 1MWMA 2Q1NA 4FWMA 2NLXA 3GL1A 1NGJA 2NZTA 4FWNA 4WQ4C 1NGCA 1YXQA 3CIPA 4IJNA 3VEYA 4WQ5C 3WQUA 3A5NC 5AQNA 3WQTA 3MMVA 2P9LB 2P9KA 4WQ5A 4AM6A 4JD2B 3RSEB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4L8RB 1REVA 3H3OB 1LW0A 1RNHA 3FZHA 4QS7A 1BHLA 3DWLA 5AQKA 4HCBA 2VCPA 3OS1A 4FL9A 2D0BA 5M1FA 3DOLA 5C24A 4K25A 1HQEA 1RT4A 1NKCA 4CZIA 3AA2A 4YDUC 2NRTA 3MX2A 3VQ7A 4EHTA 4DQRA 4PL8A 3HM9A 3C6AA 2IVOA 3O5BA 3O8MA 1NJXA 4MLEA 3MECA 1WBBA 3JSMA 1BIUA 1V4SA 2QWQA 1HPZA 2A3ZA 3D2FB 5I42A 3TR8A 1KAYA 4EIAA 4E1JA 1HMVA 1WOQA 4JKEA 3S9HA 2VGNA 4R5PA 4AM7A 1Q8IA 5M1PA 1NMNA 3FGUA 3RMDA 3RR7A 4CEZA 4GVEA 1YAGA 2QTDA 1JCFA 3SQ1A 4FJ7A 1MWKA 1TAUA 4M7YA 4NCAA 3HZ6A 4F2RA 2DFHA 5JLHA 4OPJA 3OYGA 4QS8A 5J1EA 1MDUB 4FSVA 1KAXA 2E2PA 3NVMA 3SUOA 3WXJA 1WSEA 1Y64A 4K42A 3VPZA 4DQIA 1NGHA 1BA0A 1BU6O 5HP1A 3BEXA 4BDYA 3KKSA 5EOYA 1BI4A 2E88A 3OYJA 5KI6A 5JICA 4CGDA 3FR0A 3V1OA 4JN4A 4BWMA 3HPHA 3J7YP 3CCRN 3CMAN 2W42A 1HJRA 3EN9A 1VSEA 4Y1DA 1DEJA 4FVMA 2BTFA 1BDGA 3A8YA 1RTJA 5ADXA 1CZ9A 3LANA 1K73O 4B3SK 2P9KB 4B9NA 5AQFA 1JLEA 4CBUA 4ZTJA 3KHYA 3ZX2A 3H46O 4A62A 4NO7A 2ASMA 4FOIA 1J9AA 2QKKA 4DFMA 3AA5X 3BUZB 3DLLL 4FZZA 5SZTA 2G8VA 4B9LA 4ELVA 1UA1A 3SUNA 2OZMA 2A41A 4OKEA 4LF5K 1NK0A 2B5JA 4J8FA 3SQ4A 1SUQA 1ITGA 4ILHA 4CFBA 4CK1A 3M8RA 1IJJA 4JKFA 5GAHP 3QFUA 1C0TA 4DTXA 2OA8A 4LF7K 4FVUA 3THXB 3L2RA 2YHBA 4FJKA 3T1AA 3M8QA 4Z0UA 4DV6K 3P1GA 4GKJK 4JRPA 3PY8A 4M3YA 3AVKA 3MN6A 3L2VA 1HPMA 4CF8A 1SV5A 4FO0A 4YHHK 4DQ8A 1IBMK 1C0UA 4CGIA 1S1TA 3VETA 3L3VA 4F3TA 2ITMA 4DU3A 4W5NA 3OYHA 4IEIA 5CY4A 3WNEA 2D0AA 1NNEA 2UXCK 3SMPA 3CJ7A 4JYAK 4DR4K 3OVNA 5AQOA 4FM1A 2O8FA 2O8DA 1HLUA 1K8AO 5AJ3K 3OYBA 3THYA 3PSFA 4FPAA 3OTOK 3IMXA 4CVNE 1W2BM 3A5OC 5AZIA 3HOTA 2ZWHA 2GELA 4M3RA 3NE6A 3OYEA 3A5LC 5AQMA 5C2DA 5LJWA 4BR7A 3AAQA 1SKSA 4ISGA 4YFUA 5CZ2A 3OYLA 1N33K 5F1XA 1OVYA 1K8KB 4O5BA 3G25A 3PUFA 1NJZA 1VQKN 4MO5A 4RW6A 4H0XB 1HYSA 4N41A 4RCHA 4C1NI 1J5OA 4A59A 4OKJA 3Q7BA 4O4GA 3MX5A 3WXLA 1RBRA 3I8BA 1X9JA 4ZHRA 5DM6L 4M3TA 3MWTA 3VA0A 1XC3A 4IO8A 3ALYA 1J54A 4DS5A 4FJLA 1EWQA 2E1YA 4IO9L 2Q0RA 4KTWA 1RTIA 4M63C 3ZSVA 3F5TA 1A5VA 1G99A 4OVLA 4YOTA 2CGLA 3V9ZA 1LWEA 4DSLA 1S1VA 3QBWA 4CCHA 2XHBA 3C6HA 4DU1A 4FLWA 1HJOA 3MN7A 4BC5A 5HOOA 1XUPO 1ZXOA 3V9XA 1D9DA 3N4QA 4OPKA 4DR2K 2GUPA 3TI0A 3NGZA 1WNSA 3TAGA 1JXEA 1NGFA 1YUWA 3SLCA 2A6AA 4B9SA 4KHSA 4LF6K 4I2PA 4B08A 4FW1A 4CFCA 4CJ5A 2DFFA 4JKGB 4M3UA 5I9EB 3AGRA 4CK2A 3RRHA 4FWKA 2P51A 3AV9A 2JGUA 4Y1CA 2GEMA 1U04A 4H4OA 4E7HA 1BCOA 3G0ZA 3EYZA 4BWJA 2EWSA 4YORA 1S72N 2PYJA 1KRPA 4GW6A 4E1MA 1Q18A 3C7NA 3CG7A 4G1QA 2D0PA 4JS5A 3AVBA 5CZ1A 4FJ5A 1FKPA 2I7PA 2E6LA 4DR7K 4FLYA 1QHAA 4DV3K 1MU2A 4LSLA 5JS1A 1R59O 1TKDA 4JI7K 3TARA 1GLEG 2W6KA 3DMJA 2O8EB 4LD0A 3LZJA 2WFBA 3DLBA 1NU0A 4M3XA 1T05A 4JD2A 3LALA 4H0PA 1Z05A 4IBNA 1VQMN 2O4GA 3CFPA 1RT7A 1QTMA 1VHXA 3HK2A 4JK9A 3NVKA 1R0AA 1BISA 2Z1GA 4XH4A 1Z25A 1XMQK 3C65A 1U48A 1BQNA 3KD5E 4FPBA 4ID5A 4DTOA 3M3ZA 4DV4K 5C15A 4M3WA 1VQ7N 2J4RA 3O1WA 2B6AA 3TSPA 3VQDA 3UKUA 2P9NA 3OJSA 4B1UB 1WAFA 4HTUA 1TL3A 3TANA 2VWKA 3AVHA 3IFRA 4N76A 1NBWA 5AQZA 2FLOA 3OYMA 5C0YA 1C1BA 4I6MA 3TTFA 1WAJA 3PO4A 1KLNA 3A0IX 5AZJA 2Q31A 1ZBUA 4Q0BA 4EZ9A 1NGEA 1HQUA 2XY5A 4PKGA 2I5JA 2NRVA 3VQ8A 4CHNA 3CCQN 4FM0A 2OTLN 3CQYA 4JI8K 4DU4A 2HF3A 4K41A 1N8RO 3HYFA 1G15A 3LDQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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