4IZ9A

Crystal structure of an acetate kinase from mycobacterium avium bound to an unknown acid-apcpp conjugate and manganese
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
383
structure length
381
Chain Sequence
DGARRVLVINSGSSSLKFQLVDPESGVAASTGIVERIGESPVPDHDAALRRAFDMLAGDGVDLNTAGLVAVGHRVVHGGNTFYRPTVLDDAVIARLHELSELAPLHNPPALLGIEVARRLLPGIAHVAVFDTGFFHDLPPAAATYAIDRELADRWQIRRYGFHGTSHRYVSEQAAAFLDRPLRGLKQIVLHLGNGCSASAIAGTRPLDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPSVVSYLCHTAGMGVDDVESMLNHRSGVVGLSGVRDFRRLRELIESGDGAAQLAYSVFTHRLRKYIGAYLAVLGHTDVISFTAGIGENDAAVRRDAVSGMEELGIVLDERRNLPGAKGARQISADDSPITVLVVPTNEELAIARDCVRVLGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Increasing the structural coverage of tuberculosis drug targets.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium avium
molecule keywords Acetate kinase
total genus 135
structure length 381
sequence length 383
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2013-01-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iz9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4iz9A02
4B9QA 4DQ8A 3VF4A 1NGEA 3OHRA 1S22A 1NMDA 4PKHA 2E2QA 3QBXA 3ZX0A 5AQJA 2CGLA 3QFPA 2QW9A 1GLCG 4JNEA 2V7ZA 2A5XA 2W41A 4FOIA 4BVPA 1BUPA 1BU6O 4K43A 5AQTA 4FSVA 3JS6A 3CJCA 1QQOA 1QZ6A 3H1VX 3TU5A 4PKGA 1P8ZA 3G25A 1JCFA 1SAZA 3A0IX 2ITMA 4M7XA 4JAXA 2PAVA 3O8MA 1BA1A 4FWKA 4PL8A 4JD2B 2VYPA 1QZ5A 2QWNA 3QBWA 3H3NO 5AQWA 3DXMB 3FZKA 2V52B 5BPMA 1ATNA 3AAQA 3B8AX 2IIRA 4H5TA 4B1VA 3MMVA 2E2PA 2FLOA 4ISEA 1KAYA 5AFUA 2YHWA 4FL9A 5AQPA 4H5VA 4FWQA 3F9MA 3J8AA 3IMXA 2Q1NA 1SQKA 4XEIA 4XH1A 1BO5O 2H3GX 2ZWHA 3MCPA 4E1JA 3GDQA 3MN9A 2NZTA 4BG8A 1XQSC 1K8KA 3U9ZA 4F9OA 1R59O 1GLFO 1RGIA 3C7NB 2CGJA 4M7YA 3O80A 3VERA 4BRKA 1T6CA 1IG8A 5CE3A 1DGKN 3ZX3A 4H03B 4C23A 3ID8A 4A2BA 4H0OA 3DJCA 3VEWA 2QWLA 3ULEB 2E88A 4BC5A 2NLXA 3QICA 3LM2A 3VF2A 3FGUA 1HX1A 3SLCA 4B1UB 1MWKA 1ZBSA 3HM8A 3WUHA 3M1FA 1IJJA 1Y64A 4JHDA 4BR7A 1XC3A 4I6MA 3WT0A 2IVPA 4H0PA 2YJEA 5BN9A 2AP1A 3FFKB 4H5WA 5JMVA 2IVNA 3HZ6A 5BRFA 4BR5A 3BEXA 4CBXA 3CJBA 1ZXOA 1J6ZA 4BRFA 2WUSA 3VOVA 1TYQA 1HLUA 3RSEB 5FPMA 5AQQA 4BC4A 4FOEA 3VEVA 1NGIA 2F9WA 1GLAG 3KVGA 2P9SB 4CI6A 3LDOA 3VGLA 3KHYA 4K41A 3MDQA 3A8YA 3EKSA 1NBWA 1H1VA 3ENOA 2YCHA 1YAGA 2E2OA 3CQYA 3UKUB 3LDPA 2QWRA 3CERA 4BRAA 4EAHD 3WXKA 1HJOA 3AARA 5AZJB 1OKJA 4IZ9A 4K42A 1GLBG 1WUAA 3DXKA 5AQRA 3ZETA 3WXIA 3HI0A 3A5NC 3ZEUA 4PL7A 2E20A 1QQNA 5E84A 5AR0A 4CD1A 2GWKA 3L6QA 2ASPA 3U8XA 3VEZA 3QDKA 3EKUA 3ENHA 5JLHA 4FWLA 5EOYA 5BN8A 2BUPA 3AAPA 1KXPA 1RFQA 5BPLA 2A40A 5JLFA 1HUXA 1S3XA 4EIAA 4CBUA 3GE1A 3O6WA 4BG9A 3VGMA 4BRDA 1MA9B 4XH5A 1XUPO 4Y0WA 1DKGD 4M63C 5BREA 5AZIA 4CZEA 3D2FA 4CJ7A 3KZBA 1NLVA 4L3QA 3L0QA 4B1XB 3O5BA 1ZC6A 3QMLA 5ELZA 4GNIA 5KPZA 2D0OA 4BQLA 1E4GT 1HKBA 1V4SA 3EL2A 2P9KA 2I7PA 4IO8A 1TUYA 3EO3A 1KAXA 2D4WA 4BR4A 1NM1A 1LOTB 5AQHA 3H45C 4ISFA 2W40A 5E26A 3R6MA 1WOQA 4XH4A 4QS9A 2E8AA 2P9PA 3IUCA 4A2AA 2A41A 1BG3A 4NB4A 2P9LB 3MK6A 4H5NA 2GUPA 3H6EA 1U2VB 3O08A 4AM7A 4JD2A 1NGDA 3O4WA 5B8HA 2P9NA 4AM6A 5AQSA 4FWRA 4MO4A 3AY9A 5AQVA 2QWQA 3WQUA 5AQOA 5AQXA 1BDGA 5AQNA 4BGAA 4Z94A 2CH5A 3UB5A 3WEEA 4K25A 2J4RA 4BR0A 4BRMA 3WXLA 1MWMA 3I33A 2V7YA 1JCGA 3FZMA 3BF1A 4O8KA 4JHDB 4CD3A 3UKRA 4CZFA 4WQ4C 3A5OC 3CHWA 2EWSA 2ZGYA 3LM9A 4BRQA 2ZGZA 3H46O 3GOIA 5KPRA 3MN7A 2GTDA 3C7NA 1BOTO 1T6DA 2ASOA 1BA0A 3CJ1A 4FWMA 3GL1A 4A62A 3CI5A 2Q0UA 1TYQB 3D2EA 3TPQA 1GLLO 2E1YA 4FWSA 4IWVA 4IXCA 5BPNA 3SMSA 5FPDA 3EZWA 4CZLA 1G99A 1NGCA 4H0XB 4J8FA 3LL3A 3GBTA 4DHYA 3SMPA 1NGBA 3VETA 5EVZA 3HTVA 2QM1A 3HSCA 4IJNA 3QB0A 3WQTA 4BRCA 1SZ2A 2QWOA 2P9IA 4EHUA 3BP8A 4BROA 4FO0A 3CIPA 3O1WA 4B1ZA 1RDWX 2VCPA 3UE5A 2GWJA 4CZMA 2P9SA 4BGBA 5AFUH 4WQ5C 4CBWA 2Q97A 3VPZA 4JN4A 2P9UA 3CETA 3SK3A 5ADXA 3UKUA 1Z05A 2I7NA 5F0XA 4WQ4A 3A5LC 2Q36A 5KQ8A 3LDNA 4CZIA 4MLHA 3VEOA 5AQZA 4FWNA 5AZIB 5AZJA 3D2FB 5TKYA 2A6AA 2YI1A 3L4IA 3DAWA 3FZHA 4CZJA 2A42A 4HTLA 2DPNA 4YDUC 4B1WB 4BRNA 5AQYA 3M6GA 4BRIA 2P9KB 4RWTA 1NGHA 3QFUA 5KPTA 3CQXA 5BR9A 4ISGA 2E2NA 3VF6A 4MO5A 4KBOA 1NGFA 1E4FT 4QS7A 3R9PA 3C0BA 3IDHA 3GG4A 2ASMA 3M3ZA 3IFRA 1HPMA 2P9PB 3U4LA 3BF3A 4FPBA 2QWPA 2UYTA 3CJ9A 1LCUA 3W3DA 3FR0A 2YHYA 1QHAA 4WYBA 4H5RA 1K8KB 1ESVA 5BRHA 2P9NB 3ZX2A 1X3NA 2OANA 4BRGA 3W0LA 3DXMA 5AQGA 4WQ5A 5FPEA 1DEJA 3VEXA 3JXUA 4HWIA 4GY2B 1Z6RA 1HKCA 1MDUB 4H0TB 1ATRA 3HBTA 3SJHA 4H0VB 3WEEB 2FXUA 2F9TA 2YJFA 2Q0RA 1GLDG 1V4TA 2QWMA 3I8BA 1X9JA 5AQMA 3S41A 3MN6A 2Q2RA 2P9LA 4IJAA 3UKRB 3VESA 3VENA 2QXLA 4YDUA 5KQDA 1C0FA 1U2VA 4H0YB 4I6MB 2A3ZA 2YHXA 3R8EA 3D7EO 4A61A 2IVOA 4NO7A 2GEMA 1GLJO 1NGJA 3H3OB 4LC9B 3D2EB 4DB3A 1EQYA 2D0PA 3BUZB 5AQKA 4B1YB 3ATVA 4BR2A 3LDLA 1KAZA 2AA4A 4RTFD 2PBDA 3O1BA 4EHTA 4FPAA 2KHOA 1CZAN 1YVNA 2E1ZA 5ADXH 4BRHA 2FF6A 1NWKA 3DWLA 2CGKA 3P4IA 1T44A 5EXWA 5EX5A 5I9EB 3ULEA 1D4XA 2HOEA 5F2RA 1TUUA 1Q18A 2Q31A 5F1XA 1NGAA 4FWPA 3MN5A 3VGKA 3CJAA 2HF3A 5LY3A 1X3MA 3WXJA 3FZLA 4BC3A 1YXQA 1ATSA 5AQIA 1YUWA 3DXKB 3ZETB 2P9IB 4EFHA 3ZEUB 5AQFA 2GELA 4QS8A 4BRLA 3RSEA 4O5FA 4BQZA 5BRDA 3FE1A 3ATUA 5AQLA 2HMPA 1HKGA 4BREA 2HF4A 3FLCO 5EY4A 2P9UB 4MLEA 3LDQA 2V51B 4PKIA 1QQMA 4FWOA 4RCHA 2D1KA 5AQUA 2FSKA 3A5MC 5FPNA 3VEYA 1U6ZA 2ZF5O 3FZFA 2FF3B 3U9DA 1JCEA 4CZHA 2CH6A 5LJVA 5LJWA 2NRHA 1GLEG 2FSNA 1NGGA 4CZKA 1BWFO 3H1QA 4DCHA 4BR9A 3EN9A 2FSJA 2VWBA 4BRPA 4BC2A 5JICA 1C0GA 3CJ7A 4CZGA 4BVOA 2BTFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DMNA 4DQ8A 4KHYA 3OHRA 1S22A 5AQJA 1T8EA 3K9KA 3QFPA 4H8KA 1BI4A 1U49A 4DTNA 1BU6O 1FJGK 1KD1O 4JKEA 1J9AA 3AA2A 3CFRA 4CFCA 3A0IX 1C1AA 3O8MA 4FWKA 2VYPA 3RRGA 2PFUA 1LW2A 3DXMB 5AQWA 4FLWA 3J80O 5BPMA 4W5TA 4IEIA 3PX4A 4LFBK 3CCSN 2YHWA 5AQPA 2O8DA 3F9MA 3IMXA 5FRMA 4PQUA 1SQKA 3KKSA 4KREA 3O4QA 3TAPA 3NBPA 3GDQA 4DFKA 1RT1A 4CEDA 3SJJA 4ICLA 3LP0A 1R59O 1K73O 4NYFA 3CFPA 4BRKA 3VERA 3QESA 1T6CA 5FROA 4DV1K 3SV3A 3RMBA 3ID8A 1C0UA 4A2BA 1EWRA 4H0OA 3ZT4A 3KD5E 1L3TA 3ULEB 4Q0BA 2NLXA 3QICA 1J5EK 3K5NA 1ZBSA 4I6MA 4KB0A 1WSJA 3WT0A 1EXQA 3CCMN 2AP1A 4W5RA 5JMVA 3HZ6A 4HCCA 4BR5A 1RTHA 1IKYA 1ZXOA 4CEFA 4ILGB 2JWLA 2A1SA 1U48A 1G15A 4AH9A 4FOEA 4IDHA 4Y1DA 2X6SA 3WNGA 1GLAG 3VGLA 4JI6K 2Q3SA 1NK7A 1NBWA 3A8YA 4DS5A 2E2OA 4EAHD 1N6QA 3G71N 3SBGA 3T1HK 2YX6A 4DSLA 1HJRA 3ZEUA 4Z4EA 2D0CA 1RT5A 1LWFA 1VSIA 2VGMA 5AR0A 4CD1A 4CFDA 3L6QA 5DMRA 2ASPA 2W6LA 3U8XA 3QDKA 4K0KK 3EKUA 4CJSA 2PY5A 5JLHA 3C95A 5FDLA 2UXBK 4DU1A 4B9UA 2A40A 4J2BA 1BI4B 3GE1A 3O6WA 3WNHA 3VGMA 5C25A 1TK8A 1OH5A 1XUPO 5LMNK 4FYDA 5BREA 1RBVA 4DSIA 4CJ7A 1C6VA 3NGIA 4FM2A 3NVMA 3O5BA 3LANA 3QMLA 5ELZA 4DTXA 1RNHA 3V9SA 2ZJPL 4CGFA 5C2DA 3CQ8A 3CPEA 4BR4A 2PZSA 4FM0A 3O9SA 4C8OA 4ISFA 2OA8A 2KTQA 5HRNA 4XH4A 2E8AA 1HPZA 1W97L 2P9PA 3O9TA 3RTVA 5GAGP 4DF8A 4IG0A 1BG3A 5M1FA 3ZSQA 4FK0A 2F8SA 2P9LB 4H5NA 3DM2A 4AHVA 2KZMA 5A2QO 3CCQN 4CF8A 4F4KA 3CMAN 2E6LA 4AHRA 3TSUA 4KH4A 3RMAA 2VG6A 2QWQA 1X9MA 4E7JA 4DSKA 4BGAA 2CH5A 1NJIO 3OYHA 3PO4A 2QEXN 1ZBFA 4DQPA 3OBWA 4L8RB 3L3UA 3NE6A 4M3YA 2IOCA 3CCRN 1MWMA 3OW2M 3DMJA 3I33A 2V7YA 1Q8IA 2WFBA 3O3GA 1DLOA 3QO9A 2DY4A 3VMFB 3CC2N 2ZGZA 4CJFA 3GOIA 4U7BA 2GTDA 3HP6A 3T19A 3C7NA 3CMEN 3EZ5A 3M8QA 1BA0A 3AA5X 4A62A 3VQ6A 2E1YA 3SCXA 2O8CA 1VQLN 5TKWA 5BPNA 3SMSA 2HBJA 5M1QA 2KQ2A 5C10A 2O8BB 3I55N 1NGCA 4J2EA 4DQRA 1TKZA 4Z4IA 4B9NA 4I2PA 3LL3A 3GBTA 4I7FA 3T3FA 3VETA 1NGBA 3HTVA 1IG9A 5J2QA 4QAGA 3WQTA 2QWOA 4FVMA 3NMUA 3PIOL 2FBVA 3BP8A 3TABA 4IO9L 5C2FA 1JLEA 4AHUA 3SV4A 4CBWA 2HBMA 4JN4A 2P9UA 3CETA 1NK9A 3UKUA 4O0IA 4GKKK 1Z05A 3E66A 4FZXC 3VEOA 4JI4K 3IRXA 4F2RA 2HHQA 1NK4A 3A2FA 4CZJA 4YDUC 4BRNA 2VWKA 4JI8K 4DTOA 2OZMA 3CQXA 1EX4A 1N33K 2E2NA 3OA9A 1IKVA 4MO5A 2ATQA 2XHBA 4KBOA 3G0ZA 3HP9A 3L4QA 1M90O 3LZJA 2ASMA 4GV6A 4YNQA 2P9PB 1KFDA 3AVCA 3BF3A 4FPBA 2QTDA 3H08A 2UYTA 2P5GA 4WYBA 5SZTA 1K8KB 1X1PA 3SNNA 3OS2A 1KVBA 5JS2A 5GIOA 1KVCA 4BRGA 3W0LA 1BHLA 3KK1A 1DEJA 1RDDA 3THXB 2RKIA 3BGRA 4GY2B 1HKCA 5CHIA 4H0TB 1ATRA 3HBTA 2OPRA 5K14A 3ZYYX 3DLHA 1Q9YA 4IOXA 4O8UA 3VQQA 3C6AA 3ISNC 2Q2RA 4KTZA 2FBTA 3CXCM 1XHZA 5HRSA 1VQ7N 4CESA 3PX6A 5KQDA 2Z1HA 3OVNA 4H0YB 1W9HA 4KFBA 5HOOA 3R8EA 4DR2K 3SUQA 3L3VA 2GEMA 4KHUA 1Q86O 4WFAL 3G10A 5M1PA 3OYEA 4LC9B 1J53A 3TTCA 4B1YB 3VQ9A 2O4GA 1J5OA 3LDLA 5KI6A 3HT3A 4JK9A 3EY1A 2PBDA 3O1BA 3OYIA 1U45A 2E1ZA 3MCAB 4BE0A 3DWLA 3P4IA 2B4JA 1EWQA 5EXWA 5I9EB 1VRTA 4GVEA 3AGRA 1TUUA 1Q18A 3OYFA 5F1XA 4CF9A 4FWPA 3V81A 3VGKA 3CJAA 1NMNA 2HF3A 1QVGM 3WXJA 4F8RA 4IKFA 4BC3A 3ZT0A 2E5LK 2ITGA 1ITGA 2QI2A 3ZETB 1ZBIA 3AVIA 2GELA 3L2UA 4CCHA 1HQUA 4JKGA 1HYSA 4BQZA 3ATUA 4CHPA 4DU3A 4CGIA 4M42A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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