4JAXA

Crystal structure of dimeric klhxk1 in crystal form x
Total Genus 170
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
170
sequence length
469
structure length
469
Chain Sequence
MADVPANLMEQIHGLETLFTVSSEKMRSIVKHFISELDKGLSKKGGNIPMIPGWVVEYPTGKETGDFLALDLGGTNLRVVLVKLGGNHDFDTTQNKYRLPDHLRTGTSEQLWSFIAKCLKEFVDEWYPDGVSEPLPLGFTFSYPASQKKINSGVLQRWTKGFDIEGVEGHDVVPMLQEQIEKLNIPINVVALINDTTGTLVASLYTDPQTKMGIIIGTGVNGAYYDVVSGIEKLEGLLPEDIGPDSPMAINCEYGSFDNEHLVLPRTKYDVIIDEESPRPGQQAFEKMTSGYYLGEIMRLVLLDLYDSGFIFKDQDISKLKEAYVMDTSYPSKIEDDPFENLEDTDDLFKTNLNIETTVVERKLIRKLAELVGTRAARLTVCGVSAICDKRGYKTAHIAADGSVFNRYPGYKEKAAQALKDIYNWDVEKMEDHPIQLVAAEDGSGVGAAIIACLTQKRLAAGKSVGIKG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title In vivo phosphorylation and in vitro autophosphorylation-inactivation of Kluyveromyces lactis hexokinase KlHxk1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hexokinase
molecule tags Transferase
source organism Kluyveromyces lactis
total genus 170
structure length 469
sequence length 469
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2013-02-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4jaxA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4jaxA03
1GLLO 1GLBG 1GLEG 4FWSA 4BQLA 3H6EA 5JMVA 3A5LC 3UKUB 3CQXA 3SLCA 3EZWA 4CZEA 3FZHA 3CI5A 4I6MB 4DHYA 3WXLA 1HLUA 5BRDA 1ZC6A 4O8KA 4Z94A 2Q0RA 3FLCO 1T44A 2V52B 1LCUA 2YI1A 2IVOA 3H1VX 4CJ7A 3SK3A 4K42A 3QBWA 4FWQA 4B1UB 3FZFA 5FPEA 2A5XA 4ISGA 4H5WA 2ASPA 4CBUA 3RSEA 4CZIA 2CH5A 1XUPO 3CJCA 1BUPA 3DAWA 3B8AX 4BR2A 4E1JA 3KVGA 1BO5O 2P9UA 3FGUA 3VEVA 1GLAG 1P8ZA 1NGAA 3D2FB 1NGEA 5FPDA 4DQ8A 1BA0A 2QWNA 2QWMA 3WXKA 4H03B 2HF4A 2HF3A 1YXQA 2V7ZA 3H3NO 2QWOA 3MN5A 1E4GT 4BR4A 1NGCA 3O80A 4HTLA 3LM9A 5E84A 4BRPA 2E2NA 4JNEA 1U2VA 3VEZA 4K25A 5LY3A 4K43A 4PKIA 4JHDA 5ADXH 3SJHA 3TPQA 3EKSA 5AZIA 2W41A 3U4LA 2E8AA 3GE1A 3VF2A 4BRMA 1KAZA 1D4XA 1S3XA 2P9NA 5KPRA 1MWKA 2FLOA 2FF3B 3CETA 4FWPA 3ENHA 1NWKA 1X3NA 4BGAA 1KAYA 3VETA 4CZJA 2P9LA 4FOIA 1NGIA 4H5VA 1K8KA 2NRHA 3DXMA 3M3ZA 3TU5A 2VYPA 5BPMA 1ZBSA 3CJAA 4CZFA 3WXJA 3VERA 1C0FA 3G25A 3DWLA 4XH1A 1QQMA 2QW9A 2YCHA 5EVZA 5KPZA 4A2AA 3ZX2A 1NMDA 4CBXA 4B1ZA 3LDQA 4BRQA 3IDHA 3JXUA 5FPMA 2E1ZA 2A42A 2A6AA 5ADXA 3O8MA 5FPNA 3DJCA 4A61A 1SQKA 4YDUA 5AQVA 2P9IA 3WUHA 4B1YB 3M1FA 3HSCA 4BG8A 5AQHA 4IWVA 3A8YA 3F9MA 1BA1A 2D1KA 4EHTA 3DXKB 3VF4A 3D2EA 4XH4A 2ITMA 5E26A 2PAVA 3MN6A 3UB5A 3LDNA 5BRFA 3BUZB 4CI6A 4WYBA 3JS6A 2E2OA 3KZBA 4B1VA 3MN9A 4GNIA 1G99A 3MK6A 4BQZA 3RSEB 1BWFO 4H0XB 3U9ZA 2YHXA 1T6CA 2P9KA 4MO4A 4BC4A 4H5NA 3H46O 4JD2A 4WQ5A 2IVPA 1Y64A 4BRFA 4J8FA 1NGBA 5AQYA 5AQKA 3BF3A 4RWTA 3VEOA 4B1XB 1YUWA 5BPNA 2Q31A 3CJ9A 5AZJA 1BDGA 5KQ8A 3J8AA 3LDOA 4BGBA 4FO0A 3VGLA 3I33A 3O1WA 3ZEUB 2QWPA 4FWKA 1U2VB 4H0YB 3OHRA 3WEEA 4JHDB 2ASOA 3MN7A 3GDQA 1BG3A 3UE5A 2P9NB 2BTFA 1C0GA 3WQTA 5EY4A 3D7EO 3MCPA 2QXLA 5AQSA 1DKGD 1ATSA 2FSJA 2IVNA 4BRCA 4FPBA 4BC3A 3LDPA 3FR0A 2P9LB 2WUSA 3A5OC 4PL8A 4B1WB 2P9PB 4EFHA 5CE3A 4F9OA 1HJOA 2CGJA 2GWKA 3A0IX 3FZKA 4BRAA 4HWIA 5KPTA 2QM1A 3VENA 5AQMA 4XEIA 1TUYA 3VGKA 3FZLA 2E20A 3ULEA 1NLVA 1DGKN 5I9EB 5AQJA 2J4RA 3IMXA 3U8XA 1QQNA 5AR0A 3C0BA 1BU6O 3GL1A 2QWLA 1IG8A 3AY9A 4NO7A 5AFUH 3CERA 3VEWA 3A5NC 2A41A 4I6MA 4Y0WA 1DEJA 1MDUB 2A3ZA 2VCPA 2BUPA 2UYTA 3QB0A 1S22A 3R9PA 4FWNA 3GOIA 5EX5A 2ZGZA 4O5FA 5AQIA 1HX1A 2ZGYA 3VPZA 3CHWA 2DPNA 4MLEA 3ZX0A 4FPAA 3WXIA 1HKCA 1ATRA 2E2PA 3W3DA 2A40A 3ENOA 3QMLA 1X3MA 3W0LA 4BR9A 1SAZA 3FE1A 5EXWA 3VF6A 2P9SB 5F0XA 3ZETB 4H0TB 3LM2A 3L6QA 3UKRA 2FF6A 3R8EA 3WT0A 2CH6A 4A2BA 5LJWA 3HI0A 5BREA 5AQRA 1JCGA 3LDLA 3EN9A 1CZAN 3D2FA 3MMVA 2IIRA 3EKUA 4A62A 2P9KB 4JN4A 5B8HA 5AQLA 4BRNA 3ID8A 2D4WA 4M7YA 2YJFA 4MO5A 4FL9A 1X9JA 1LOTB 3ATUA 3I8BA 3CIPA 4BC5A 1OKJA 3SMPA 5ELZA 1NGJA 5AQWA 1WOQA 5AZJB 1BOTO 5BRHA 2Q0UA 1GLCG 2HMPA 3A5MC 3H45C 1V4SA 3O5BA 5AQUA 3EL2A 3ZX3A 3H3OB 3C7NA 4CZGA 1XC3A 2VWBA 3IFRA 2F9TA 3CJ1A 5AQQA 3WEEB 3FZMA 4BC2A 4BG9A 1XQSC 1EQYA 2I7PA 1E4FT 4AM6A 2H3GX 2HOEA 3M6GA 1TYQA 5BN9A 4BRDA 3QBXA 4C23A 2P9UB 4BREA 4RCHA 2W40A 4ISEA 2GELA 5AQFA 5BN8A 3QDKA 4H5TA 2I7NA 4PKHA 3WQUA 4ISFA 5AQPA 2QWQA 3SMSA 5F2RA 4QS8A 2OANA 2YJEA 3H1QA 4IO8A 3EO3A 5KQDA 2ASMA 1JCEA 3VESA 5BR9A 5LJVA 2CGKA 3QFPA 1GLFO 4IJAA 4FOEA 5AZIB 2FSNA 4L3QA 3KHYA 3VEYA 4PKGA 3DXKA 2F9WA 2E1YA 1Z05A 4AM7A 2YHYA 1KAXA 4CD1A 2CGLA 2D0OA 3BEXA 2FSKA 4BR5A 4CZMA 4NB4A 3QFUA 1J6ZA 1K8KB 1RGIA 3DXMB 1HUXA 2Q36A 4WQ4C 3O6WA 5AQOA 3R6MA 4WQ4A 4CZLA 4K41A 4PL7A 1KXPA 1MA9B 2Q1NA 1IJJA 2EWSA 4H5RA 1Z6RA 4DCHA 3BP8A 3HZ6A 3ZEUA 1QZ6A 2V51B 3UKRB 4CBWA 1JCFA 4BR0A 1H1VA 1HKGA 3UKUA 2E88A 4BRKA 2E2QA 4KBOA 1T6DA 4BVPA 5TKYA 1RFQA 2ZF5O 5AQGA 5EOYA 5JICA 1R59O 1V4TA 1NGHA 4BROA 1ESVA 4H0VB 4FWOA 3ATVA 4BR7A 2P9IB 4IXCA 1NGDA 1ATNA 2Q97A 4QS7A 3AAPA 1NGFA 3BF1A 2Q2RA 3AARA 3D2EB 4BRGA 3HTVA 4B9QA 3FFKB 4M63C 4EAHD 3VEXA 4EHUA 3C7NB 2GTDA 4XH5A 1YVNA 4H0OA 4CZHA 3S41A 1YAGA 4FWLA 4M7XA 4LC9B 2P9PA 4BRHA 5AFUA 3O4WA 2GWJA 2YHWA 1NBWA 4JAXA 2GUPA 1TYQB 5AQXA 4JD2B 2V7YA 3L0QA 3CJ7A 3AAQA 2ZWHA 5JLHA 1HKBA 4IJNA 1HPMA 2PBDA 3VGMA 2GEMA 1WUAA 4BVOA 4H0PA 4RTFD 1SZ2A 1U6ZA 2AP1A 1QZ5A 4EIAA 4YDUC 1TUUA 2D0PA 4FWRA 4IZ9A 1RDWX 4QS9A 3O1BA 4GY2B 3HM8A 1ZXOA 4FSVA 1MWMA 1Q18A 3CQYA 3GG4A 3U9DA 4DB3A 5JLFA 2NLXA 1QQOA 2P9SA 3VOVA 3QICA 3IUCA 3ZETA 3LL3A 4CD3A 5AQZA 3L4IA 4FWMA 1NM1A 5AQNA 5BPLA 2FXUA 3O08A 5AQTA 1GLDG 2KHOA 3HBTA 5F1XA 4BRIA 3CJBA 1GLJO 2NZTA 4MLHA 3ULEB 3P4IA 4WQ5C 2QWRA 4CZKA 1QHAA 3MDQA 1NGGA 4BRLA 3GBTA 2AA4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HCBA 1GLEG 3UKUB 3T7ZA 4DR2K 3LANA 1BGXT 3DRRA 3WXLA 2UXDK 2O8DB 1HLUA 4OJRA 5BRDA 1MU2A 4Z94A 2ETJA 4HHTA 4Q5VA 1M1KO 1T44A 1LCUA 2YI1A 3VQ5A 5KGXA 3MWTA 3RMAA 3HSTB 4B9UA 4B1UB 3AVBA 3OJUA 3ULDA 2ASPA 4DTNA 2O8CB 4CZIA 1L3UA 3THYB 1XUPO 3CJCA 3DAWA 3B8AX 2KZMA 3VQCA 3ZSRA 4BR2A 3HXMA 1O1WA 2P9UA 2XY6A 4B3SK 3M8PA 2OA8A 1NGAA 2QTDA 4DR4K 2QXFA 4JEPA 1NJZA 3WXKA 3K57A 1Z25A 2X6NA 4OPHA 2VG6A 4K43A 4PKIA 3TAPA 4CK3A 3EKSA 3EE8A 2E8AA 4BRMA 4AHCA 3D6RA 1MWKA 3V6DA 1WBDA 4F3TA 5LMUK 4L8RB 1CXUA 2FF3B 4E19A 3C6TA 1KAYA 2P9LA 4FOIA 1NGIA 2O4GA 4X66K 1ZBUA 3TAMA 2VYPA 3CXCM 1ZBSA 4CZFA 3WXJA 4W5RA 4FZXC 4FLYA 1NG9A 3VERA 3K0SA 2HVIA 3AO4A 1WSFA 3OYDA 4JK7A 1VQKN 4CJ5A 3MXJA 4DV2K 4XIUA 2YCHA 1FJGK 1VSDA 3H08A 4B1ZA 3LDQA 4BRQA 5FPMA 3LP2A 3CCJN 2A42A 2A6AA 5JVGL 1XHXA 3NH1A 2B4JA 3T69A 1SQKA 4A61A 1QVFM 4JI4K 1JLFA 1S1XA 1EP4A 1SL1A 4O0JA 2YV0X 3KWGA 1N33K 3MX5A 3WUHA 3M1FA 4B1YB 3SQ4A 3HSCA 4IWVA 1VSKA 1BA1A 2D1KA 1YITN 1Q9XA 3DXKB 3VF4A 3D2EA 4XH4A 3VTHA 4H4MA 4BDYA 3MN6A 3P38A 5BRFA 3D45A 2GX9A 1BI4A 4C8MA 3J80O 5J2PA 1WAJA 3DLLL 4MDAA 3J7AP 1HYZA 1OH6A 2P9KA 5CYMA 1KC8O 2IVPA 5AQYA 1OH7A 4RWTA 3OY9A 3VEOA 3HVTA 5BPNA 4PHTX 5KQ8A 3J8AA 3LDOA 2KFNA 4BGBA 1TAUA 3I33A 2Y1JA 1K9MO 3O1WA 4JKCA 1K73O 4FZZA 4KHPK 4FWKA 1N32K 4CGFA 1LW0A 2P5OA 4Z4GA 4RG8A 3GDQA 4HUGA 1HNWK 1C0GA 1BQMA 5EY4A 3VN5A 3PIPL 2FSJA 4BRCA 4M41A 3BZCA 3K9JA 4IKFA 2P9LB 3MAQA 3U6FA 1X1PA 4FJIA 4BRAA 1SL2A 3VENA 2GV9A 1VHXA 3FZLA 3ULEA 1NLVA 1FW6A 3SNNA 5I9EB 3TSQA 4FJGA 1QQNA 3LWMA 2KTQA 3GL1A 2IDOA 2NNWA 1IG8A 4NO7A 3VA3A 3T1YK 1N36K 3OYGA 5EU7A 3CCMN 2OYQA 2IGIA 4Y0WA 4I6MA 1MDUB 4DS5A 4K0KK 4BACA 1S22A 4ELUA 3HPGA 2XY7A 4O5FA 4DTOA 4CJSA 1HX1A 4M45A 5BR8K 2DPNA 4FJ7A 3V9ZA 4DU4A 2E2PA 2ZJRL 3I8DA 3W0LA 3O9UA 5HP1A 2G8VA 1YJNN 4H0TB 1D9FA 5BREA 2P51A 1VQON 3DOLA 4O4GA 4IEEA 1C6VA 4CHPA 3V81A 2HMIA 1LWEA 3EKUA 3L2VA 4CF8A 1KFDA 2P9KB 4OKJA 4CGDA 3KLIA 2YJFA 1TKDA 1X9JA 1LOTB 3ATUA 4B9VA 1REVA 3SMPA 4CGIA 5GAGP 5ELZA 4B3MK 1NGJA 5AQWA 3ZT3A 1BOTO 4OGEA 1GLCG 5AQUA 2ATQA 3AVJA 1XWLA 4K8ZA 4FLVA 3PX0A 3CJ1A 1RDBA 5AQQA 4B9TA 3Q7BA 1EQYA 2I7PA 1E4FT 4HTUA 3S3NA 3PX6A 2E5LK 3IAYA 4AM6A 4BRDA 4RCHA 3ASMA 2GELA 5AQFA 2VWJA 4PKHA 3SV3A 2OANA 2VQEK 5I42A 4F8RA 2ASMA 1JLGA 4ELTA 1UA1A 3QFPA 1T3VA 1GLFO 4FOEA 3HJFA 3ZSZA 3MWPA 2HHUA 3KHYA 3KIOA 4CERA 1KVBA 1ILYA 3VEYA 4PKGA 1NK7A 4IEIA 4LH5A 2E1YA 1XNRK 3L2QA 1F21A 5KRSA 3CD6N 2YHYA 2D0OA 4FM1A 2EX3A 3QFUA 1J6ZA 4CEZA 3DXMB 1HUXA 1YVUA 4KHYA 3M8RA 3L2UA 4CZLA 4K41A 2OZSA 4CECA 4PL7A 1KXPA 1IJJA 4H5RA 1Z6RA 4DCHA 2O8FA 1EETA 1JCFA 1G15A 4BR0A 2OPSA 1H1VA 2R7YA 3NCIA 4NYNA 4KHNA 5AQGA 5EOYA 1DTQA 1R59O 2B6AA 2ZQBA 1V4TA 4FM2A 4DQPA 2LSNA 1VQNN 1YIJN 5KI6A 4FLWA 2RE2A 1HNZK 3THVA 1NGDA 2D0AA 4RW7A 1ATNA 2KLAA 4DV3K 2HBMA 3R1XA 4JS5A 1FXXA 2IS3A 4Z4FA 3CFOA 4FJLA 3ALYA 4R79A 3OYIA 3CCRN 4MDBA 1YVNA 1WLJA 2B5JA 3S41A 1U4BA 3LP3A 2RKIA 3O3HA 4X65K 2P9PA 3I0RA 4BRHA 5C0YA 4OPKA 1KVAA 3HOTA 2GWJA 4OKEA 1NBWA 3SBGA 2F8TA 1RDDA 2GUPA 1KLMA 1SKWA 3CJ7A 4RW9A 4OPJA 4W5OA 2PBDA 3G6EN 2GEMA 1XMQK 1Q82O 4Y1DA 4I9LA 1SZ2A 3C6AA 1YI2N 4KREA 1C0TA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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