4KH5A

Toxoplasma gondii ntpdase1 c258s/c268s in complex with mg and ampnp
Total Genus 178
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
178
sequence length
595
structure length
591
Chain Sequence
DADTEKRINVGKTHLQTLRNLETRCHDSLQALVVIDAGSSSTRTNVFLAKTRSCPNKGRSIDPDSIQLIREGKRFTGLRVVLEEWLDTYAGKDWESRPVDARLLFQYVPQMHEGAKKLMQLLEEDTVAILDSQLNEEQKVQVKALGIPVMLCSTAGVRDFHEWYRDALFVLLRHLINNPSPAHGYKFFTNPFWTRPITGAEEGLFAFITLNHLSRRLGEDPARSMIDEYGVKHSRNDLAGVVEVGGASAQIVFPLQEGTVLPSSVRAVNLQRERLLPERYPSADVVSVSFMQLGMASSAGLFLKELCSNDEFLQGGICSNPCLFKGFQQSCSAGEVEVRPDGSASVNEDVRKNRLKPLATYCSVHNPEISFKVTNEMQCRENSIDPTKPLAERMKIENCSIIEGTGNFDKCVSQVESILVAPKLPLPANIEAASSGFESVDQVFRFASSTAPMFITGREMLASIDTLKDHRLLRSDFSGDVEELAEAAREFCSSEVIIRTDGPVIQLGEQKLNSLNFDLCKTMALTVSLLRHMAAGENQPSFIKWEKSIAGPDGKPLADLGWQVGVILHHVLFTEEWGRTAYEAGYSHNLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Toxoplasma gondii
publication title The ATP/ADP substrate specificity switch between Toxoplasma gondii NTPDase1 and NTPDase3 is caused by an altered mode of binding of the substrate base.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nucleoside-triphosphatase 2
total genus 178
structure length 591
sequence length 595
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.15: Nucleoside-triphosphate phosphatase.
pdb deposition date 2013-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.530 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kh5A01
3.30.420.540 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kh5A02
4KH4A 3AGRA 4A59A 4KH5A 4A5BA 4A5AA 4A57A 4KH6A 4JEPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CF9A 4FWOA 2OANA 3UKUA 3ULDA 4M3YA 4JHDA 1S6PA 3V81A 4FL9A 2E8AA 2KZMA 4KB0A 1SL1A 2E2QA 1G15A 4CGFA 4YOXA 3CCJN 4O55A 2V51B 3QFUA 5GAEP 3OHRA 3IKMA 2P9SB 3QBWA 4O5FA 4IO9L 3OYJA 5JVHL 1YVNA 3IAYA 3DLBA 3ATUA 4CZMA 2Z1IA 2D5RA 5AQZA 1QQOA 2YJEA 3AA5X 4Z4IA 2HB5A 3MCAB 3SMPA 4DQIA 4QS7A 1JLCA 3NH2A 3L2VA 2W41A 3K0SA 1S9GA 5LMNK 3W0LA 4OX9K 3J7ZO 3ENOA 4CD3A 4FLZA 3VPZA 4E19A 3I55N 1GOCA 3VOVA 1R59O 3MX2A 3UE5A 4KREA 4KO0A 1S1XA 1VQ6N 2O8FB 5AFUA 5KGXA 4ISFA 1L3UA 2D0AA 3WXJA 4DFJA 1DTTA 2QWMA 3SUQA 2VGMA 3HZ6A 3A5MC 3VQQA 5K14A 3V1OA 4BR5A 3SI6A 1WNSA 4F3TA 1CLQA 1NJYA 4CJFA 5AZJB 4I2QA 4BRMA 2V7YA 2VWBA 1X3MA 3QMLA 4CFAA 3O3HA 4KHWA 4YORA 2P9IB 3MEGA 4YOYA 3RRGA 4JI6K 4FK2A 2O8EA 1HNZK 3OYAA 4BC4A 1RDWX 1XWLA 4N56A 4DB3A 1WLJA 3HVTA 1W0HA 2ZGZA 5CR4A 5EXWA 3VGLA 3HPGA 3RTVA 5AQMA 4A59A 4DR5K 3LAKA 4DTJA 5FLXO 4WQ4A 4MO4A 4YOWA 3SUPA 4BRAA 5AQNA 4FJJA 4RW6A 3JSMA 2UXDK 3CCEN 2E1YA 1ASWA 4DR7K 5F2RA 4LFCK 4CEFA 3BP8A 3KWIA 3C94A 3M8QA 1SKRA 3AAQA 1A5XA 1EQYA 4CJ5A 4RW4A 3QEIA 2FXUA 4JD2A 4HUGA 2HMIA 1ZBFA 3OYCA 4XH4A 4KBOA 3U3YA 1N33K 3I0SA 3THWB 2JGUA 1MU2A 1QSYA 4WQ5C 3D2FB 3H45C 4AM7A 1NJXA 3ULEA 1WOQA 4HUFA 2ZD1A 1S3XA 1KQSM 3E01A 3E9OA 4CGJA 1BWFO 2QI2A 4K8XA 4FJHA 4B3TK 4EIAA 3CJ9A 3J8AA 3EKSA 2RE2A 4CIFA 4FVMA 3QESA 1TVRA 3KHYA 4I6MB 4IG3A 1RTJA 1B9FA 4LSNA 3AO3A 4EZ6A 1KAYA 2JWLA 2NLXA 4LH5A 5BPNA 4QS8A 3IFRA 1C1CA 4JNEA 2RKIA 4H0PA 1SV5A 1BOTO 4CHYA 3LDSA 1BGXT 4FJXA 1BI4B 4O8KA 1YI2N 4BWJA 3IMXA 1KVCA 2FBXA 4BG8A 1WSFA 3V9ZA 2CH6A 4C1NK 1YVUA 5I42A 4FJ8A 4Q5VA 3JYTA 1UA1A 4PWDA 3R3LA 4MLEA 4FLYA 3A5NC 3O9RA 4OGCA 2P5OA 4FJ9A 4FJNA 3S3OA 4YOVA 2DY4A 4BE2A 4BC3A 4FXDA 2X78A 3CC2N 4JI3K 5C0YA 4B3SK 4KAZA 3MWTA 3NE6A 2E2OA 2FBTA 2ITMA 3CCUN 1TK8A 5FRMA 4OJRA 4GVMA 2PY5A 3I0RA 3CCRN 3B6PA 3VQAA 2AP1A 5M1PA 1FKOA 4FWQA 4JI0K 1RDCA 4IZ9A 1NG9A 1VSIA 3LZJA 3SQ2A 4F2SA 4DSIA 3VQ5A 1J5EK 3A2FA 3NGIA 3LDOA 4M3WA 3DLHA 3KK1A 5C12A 4DTXA 2UUCK 3U8XA 4KPYA 3LDQA 3SPZA 1HR0K 4IEIA 5TKYA 4OPJA 1LWEA 5BREA 1TKXA 5H1SQ 3H1VX 2Q2RA 1BA0A 1JLBA 4A62A 1S22A 1HMVA 1REVA 2ETJA 2HHUA 3CCSN 1GLBG 2KLAA 3I56N 4CZEA 5JVGL 1NWKA 4Y0WA 5C10A 4FCYA 3J7YP 1L5UA 1VSLA 2E88A 2YHAA 3DLEA 4PHTX 2VG6A 2JLEA 1VK0A 3BDPA 3D2EB 4CJ4A 2HHTA 2VCPA 4CD1A 4W5TA 3EE9A 4BROA 1NK5A 3VESA 4FWMA 1HUXA 4RCHA 1NBWA 1JKHA 5FPEA 3TAQA 3ENHA 2YHWA 1FK9A 1IV0A 4YOUA 3LWLA 4EP4A 3P31A 1KFDA 3SV3A 3TAFA 3WUHA 3L2UA 3CM5A 2F7TA 4JRQA 4MLHA 2HNYA 3BZKA 3SZ2A 4CJQA 1VQ4N 3THXA 1QZ6A 4AH9A 1MWKA 3VF4A 1JXBA 1U2VB 4BR0A 1NGFA 3VQCA 1IBLK 1RBTA 4L8RB 3ZETB 3ZSVA 3THYB 4N76A 4DG1A 3LANA 4C8KA 3ZT4A 1T6CA 3ZSZA 3RSEB 4H5VA 4H5TA 4DCHA 2X74A 4FWSA 2RHKA 3NBPA 3NMUA 3H3NO 5HRPA 3U4LA 1QSSA 3DOKA 2D0OA 1QTMA 4FPBA 1X9JA 3TARA 1OVQA 3HJFA 4CZKA 2P9KB 3KLHA 4OVLA 1TK0A 1XMQK 4GNIA 3VQEA 4O8UA 5LL6Z 2GEMA 3WNFA 2OCEA 2DFFA 5AQWA 4CIGA 4FM1A 3NF7A 4M3ZA 3G71N 2P51A 4DTPA 3H08A 4W5NA 2W40A 3LM9A 3D45A 3VERA 3B8AX 2DFHA 2OPPA 1OKJA 4JLHA 2VG5A 3SK3A 1VSEA 4CF8A 4DF8A 3OYLA 2V7ZA 2G8WA 3VEZA 5DM6L 4E7HA 1Q9XA 1N8RO 2QKKA 3HL8A 4M3RA 4DV1K 1NK9A 4DQ8A 1N6QA 3QEPA 2F8TA 4OKKA 2UUAK 3VTHA 1ILYA 2FBVA 4BRCA 1NGGA 3IUCA 3OS0A 3PLAA 4QS9A 4CHPA 1VSDA 2HOEA 2E6MA 4B9UA 4HTLA 4CE9A 4NCBA 2AA4A 4H0XB 3VF6A 1NKCA 2F9WA 3NFAA 5HL7L 2WC9A 3CIPA 3VTIA 1TAQA 2KHOA 4ID5A 4EAHD 4DR4K 2ZQBA 3QFPA 1C1AA 3NGYA 4LFBK 4JYAK 3UB5A 4FWLA 4E1NA 1C0GA 1RFQA 3AO5A 5HRRA 4CBXA 4DV0K 3KWGA 3O5BA 3AVBA 3CQ8A 4RW9A 2IDOA 1NJZA 3TABA 1RTDA 4FLVA 1CZAN 3DJCA 4WE1A 2EX3A 3DM2A 2W6LA 2QKBA 1C0UA 1ZBLA 4JV5K 4FLXA 1IG9A 1HNWK 4A57A 5BPMA 3OJSA 5DK5A 1K8AO 1J9AA 1TKTA 3QERA 3A8YA 2FSKA 4M7XA 2RPIA 3CMAN 4Z4CA 1IBMK 1C0MA 1VRUA 2NRVA 4E89A 4LH4A 5CE3A 5FRNA 4I7FA 2YHYA 3MWPA 1KLMA 4PKHA 4J8FA 5JS1A 2Z1GA 2HNDA 3K5MA 3SJJA 4WFAL 4ELVA 5KPZA 5LJVA 1NNEA 3HXMA 1HNXK 2VG7A 5C2DA 4NCAA 1ESVA 4R5PA 3AO1A 4JHDB 3TWHA 4BRGA 3GOIA 3CC4N 3MN5A 3OYKA 3HVRA 2YV0X 2BE2A 2G8UA 3EE8A 2UU9K 2KTQA 3CFRA 2QWQA 4R79A 3CPEA 2I5JA 4ISEA 1VHXA 1YF5L 1HYSA 5EOYA 1M1KO 4DU4A 4UY8O 2FBYA 4H03B 3DLRA 1IG8A 2CH5A 1L3TA 5HOOA 4H4OA 4FJGA 3NDKA 4CJVA 3OYGA 1BA1A 2Q97A 4MDAA 1VAZA 5KRSA 3OYEA 5AQRA 3R6MA 3DI6A 3WXLA 3DLKA 3G4SN 3SJHA 3LPUA 3DRSA 4PL8A 4NB4A 4DS5A 2OZMA 4C1NI 3Q7BA 1Q7YO 2ZJQL 1S9EA 3VQ9A 2RN2A 4JK8A 3CJCA 3HYFA 1YTAA 3M3ZA 3SYZA 3K5OA 4ELUA 1QZ5A 2B6AA 2UXCK 3K2PA 3VEWA 1W97L 1WSJA 1NGDA 3DWLA 3T7ZA 3BUZB 4LSLA 4X65K 5IT9O 4DTSA 3SQ0A 3P39A 3S41A 1JL2A 1NKBA 3GL1A 4JKAA 2HF4A 3O9SA 1G99A 4OPHA 2GELA 3KLFA 2O8EB 1RCHA 1SAZA 3E66A 4KHNA 1K8KA 2D0PA 1E4GT 4CJPA 5C25A 5AQXA 4BACA 4RW7A 4JI2K 3CYMA 4CJKA 2G8VA 1X3NA 4GKJK 3ZEUB 4JKHA 4C23A 3TSQA 5C42A 3MN6A 1KFSA 2F4VK 5GIPA 2A6AA 1D8YA 1T7PA 2Y1IA 2B4JA 2EWSA 5AQVA 4B1YB 4CBWA 1KLNA 2GUIA 2YHBA 3V9WA 3G10A 4CZGA 3QB0A 3PSIA 1CZ9A 5AQYA 3H46O 4JD2B 4JK7A 5BR9A 3K5NA 4DSFA 1IKYA 3EY1A 2XY8A 2P9NB 4J2DA 5E84A 1C0TA 2KQ2A 3VMFB 3HPOA 4BC5A 3C7NA 4AHTA 3LP0A 4CK2A 3C65A 3OYFA 4IOXA 5F1XA 2VQFK 3F5TA 4GV6A 4BQZA 1M90O 4A2AA 5FPDA 3JAMO 5GADP 3FR0A 3NF9A 1FXXA 3T69A 1HQEA 4CGGA 1JLEA 3O4NA 2QW9A 2OZSA 3L0QA 4FO0A 3BY5A 4B3MK 2D4WA 2NRWA 1ZXOA 4ISGA 3KIOA 3TSPA 2PBDA 3AVAA 4WQ4C 4DQQA 1QSLA 2HHQA 1BG3A 1W2BM 2BGGA 1RT5A 2QEXN 3SMSA 5AQTA 3QICA 4J2EA 3EL2A 1RT4A 1ZBHA 1EKEA 4CF2A 4YHHK 4W5QA 1JL1A 3D6RA 3WXKA 4I2PA 4IOCL 1HLUA 1IO2A 3O3GA 3QINA 5LY3A 1TYQB 3DXMA 4OLBA 1UOCA 3FZKA 5AFUH 3QNOA 5TKWA 4BRKA 4BR2A 4AF1A 1LAVA 3V9SA 3K9JA 3LP2A 2GWJA 4H5WA 1JCGA 3V1RA 3A5LC 3QETA 2DFEA 3T1AA 4KHYA 3MXMA 4CEZA 3R1XA 2JWKA 4PUOA 1H1VA 5JICA 2ZF5O 1B92A 2GX9A 3OYIA 2WBNA 3ZSWA 4DWIA 1RT1A 2P9UA 3MN9A 1K9MO 4JI5K 1GOBA 1ITGA 1FKPA 3M8RA 1GLFO 4BG9A 1YAGA 3V4IA 4A2BA 4EHTA 4BGBA 4CFDA 1U48A 3P83D 3AVFA 3VEVA 4DV4K 1Q18A 4DV2K 3E1YA 4B9SA 3WNEA 3QEXA 1WAFA 2LSNA 3MECA 4XIUA 1XHXA 3SBTA 4M42A 2QK9A 2H3GX 3U9ZA 2O8FA 1GLEG 1WN7A 5I9EB 2NRZA 4LY7A 5AQLA 3VQBA 1ZYQA 3DXKB 4C8LA 1RT2A 2GV9A 4FYDA 3KLEA 4BRNA 5GINA 4CBUA 1TGOA 4Z4FA 1XQSC 2E2PA 1QVGM 4DUZK 1V4TA 3K58A 4F9OA 2FC0A 1TK5A 5BN8A 1X9SA 3EYZA 4WQ5A 3RVCA 2ZJPL 1LWFA 4CJ7A 3HBTA 4AILC 3AA3A 3PO5A 4EHUA 1NOYA 1J53A 1NK4A 1KVAA 3AVLA 3O3FA 1TUYA 4KHQA 1KSPA 3ID8A 3MN7A 3VQ7A 1SUQA 1TAUA 1TUUA 3I8BA 3RMCA 2Q3SA 2F96A 3TI0A 1IJJA 4JN4A 1T44A 3LM2A 3TR8A 4A5AA 1HQUA 1ZBIA 4DLEA 1U47A 3N4QA 3AY9A 4LF8K 1U45A 4QOZB 3RWUA 2KFNA 1HX1A 1W9HA 3HP9A 4FJLA 2P9LB 3GG4A 2W42A 2XY6A 2A3ZA 3O4QA 4N41A 1W7AA 1Z6RA 3HOTA 2WFBA 3OYMA 3KKSA 3FFIA 1RDAA 3SUOA 1T8EA 3AVMA 3THXB 4CECA 2A41A 3THWA 1XC9A 3UIQA 1FW6A 2I7NA 1K6YA 4ILJA 3OYDA 2IC3A 3NVKA 4N47A 1VSKA 3J80O 3VQPA 1YJNN 1KC8O 4DQPA 3D2FA 3ZYYX 2X6SA 1QE1A 3K59A 4AQYK 4DR1K 3L2QA 1NGHA 1LOTB 2A42A 3AVIA 1S1WA 4KHUA 4DTRA 4I6MA 1TL1A 3CERA 4BE1A 4IWVA 1OH7A 1NMNA 3MAQA 2O8BB 1HNVA 2HHXA 3FZLA 1JCEA 1SKWA 1RBSA 2GWKA 1DLOA 4X62K 3F2KA 5AR0A 3A5OC 3SQ4A 3MCPA 4OKEA 1BI4A 1WSGA 1NK0A 2NRHA 5JLFA 4KKOA 1T03A 4E3SA 1RNHA 5GAGP 3IDHA 4OGEA 4EFHA 3KK2A 3CETA 4CIEA 1CXQA 2UXBK 1HYVA 5AQHA 2QWLA 4CZIA 3K57A 3NAEA 1VQPN 4CW7B 1D9DA 2A40A 4U67L 4JS4A 2HF3A 3RMBA 3WNGA 1EP4A 5JLHA 3VEYA 2O8DB 4CJLA 3IRXA 1O1WA 4K8ZA 4BR9A 4DSLA 3C6AA 4YOTA 3CCLN 4FZZA 1NGEA 4O0IA 5JS2A 3ID6A 4FSVA 1P90A 3CJ1A 2ASOA 4AHUA 5AZIB 4CJRA 3KLGA 3BF3A 1LWCA 1VQLN 3AA2A 3ALYA 4AM6A 1T05A 2J4RA 2HBKA 4BDPA 2NNWA 4AHCA 5EY4A 1JCFA 3AVJA 1XNQK 3NH1A 2PAVA 4IBNA 5AQQA 3TPQA 1KTQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4KH4 A;  3AGR A;  4A59 A;  4KH5 A;  4A5B A;  4A5A A;  4A57 A;  4KH6 A;  4JEP A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4CF9 A;  4FWO A;  2OAN A;  3UKU A;  3ULD A;  4M3Y A;  4JHD A;  1S6P A;  3V81 A;  4FL9 A;  2E8A A;  2KZM A;  4KB0 A;  1SL1 A;  2E2Q A;  1G15 A;  4CGF A;  4YOX A;  3CCJ N;  4O55 A;  2V51 B;  3QFU A;  5GAE P;  3OHR A;  3IKM A;  2P9S B;  3QBW A;  4O5F A;  4IO9 L;  3OYJ A;  5JVH L;  1YVN A;  3IAY A;  3DLB A;  3ATU A;  4CZM A;  2Z1I A;  2D5R A;  5AQZ A;  1QQO A;  2YJE A;  3AA5 X;  4Z4I A;  2HB5 A;  3MCA B;  3SMP A;  4DQI A;  4QS7 A;  1JLC A;  3NH2 A;  3L2V A;  2W41 A;  3K0S A;  1S9G A;  5LMN K;  3W0L A;  4OX9 K;  3J7Z O;  3ENO A;  4CD3 A;  4FLZ A;  3VPZ A;  4E19 A;  3I55 N;  1GOC A;  3VOV A;  1R59 O;  3MX2 A;  3UE5 A;  4KRE A;  4KO0 A;  1S1X A;  1VQ6 N;  2O8F B;  5AFU A;  5KGX A;  4ISF A;  1L3U A;  2D0A A;  3WXJ A;  4DFJ A;  1DTT A;  2QWM A;  3SUQ A;  2VGM A;  3HZ6 A;  3A5M C;  3VQQ A;  5K14 A;  3V1O A;  4BR5 A;  3SI6 A;  1WNS A;  4F3T A;  1CLQ A;  1NJY A;  4CJF A;  5AZJ B;  4I2Q A;  4BRM A;  2V7Y A;  2VWB A;  1X3M A;  3QML A;  4CFA A;  3O3H A;  4KHW A;  4YOR A;  2P9I B;  3MEG A;  4YOY A;  3RRG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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