4KTWA

Lactococcus phage 67 ruvc - apo form
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
MKKILAINFSTASKKGEGTGYAFRKDGQVYVGSIKAYNPKKTAWERTFDIVNAIKDIIDEFDLKGYHLAIETPIMGRNRKHSITLANCNGYFIGAIDGLVNGYTFIDNSKWCSYHLISGKREQRKEESLELLKATGLVDSNCKDDNIADAYNILTYCEHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Lactococcus phage bil67
publication title Mutants of phage bIL67 RuvC with enhanced Holliday junction binding selectivity and resolution symmetry.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RuvC endonuclease
total genus 61
structure length 160
sequence length 160
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07066 DUF3882 Lactococcus phage M3 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4ktwA00
2GV9A 3NGYA 3CFPA 4NYFA 4DTOA 4FJGA 3M8QA 4BACA 1N5YA 5HRSA 2OA8A 4DF4A 1RTIA 2FBXA 2YKMA 1BI4A 4FJ7A 1VSLA 3RTVA 2XO7A 2G8VA 3UIQA 4J2BA 1WSFA 4E89A 5FROA 4CECA 2HVHA 3AA4A 4W5OA 3KLEA 3OS2A 1LW0A 1GOAA 4DMNA 1ZBLA 4AH9A 1JLAA 1S6QA 2O4GA 5FRNA 3AA3A 4B9NA 4CEQA 4O0IA 3SQ0A 1C0TA 1JLCA 4K8XA 3ZT1A 3LAKA 2X78A 4XIUA 5D3GA 4MQ3A 3CQ8A 4M3RA 4ZTJA 2YNIA 2Z1JA 3VQCA 4DLGA 3TR8A 4LY7A 3HPGA 3NGZA 1VSMA 3L2WA 4DG1A 4I9QA 4CEFA 3EYZA 1TKDA 4YFUA 3SUQA 2D5RA 1S6PA 3KLFA 4AILC 2Y1JA 1RT4A 3OYEA 3NF8A 3V9WA 2PYLA 4E0DA 4CJWA 1JKHA 2ITGA 2Q3SA 3OVNA 4OKEA 1JL1A 4JS4A 1NK8A 3ZT4A 1BHLA 3KKRA 3NH0A 2HW3A 2KW4A 4M3XA 4CJ3A 1B9DA 1RDCA 5DK5A 4GW6A 2ZQBA 4FLXA 1WAJA 4CEDA 2XY5A 4CIEA 1HPZA 3HM9A 3V1RA 1QQCA 1GOCA 4AHRA 2F8SA 4CE9A 4NYNA 3MXJA 1U48A 4F3TA 3AV9A 3F9KA 2BANA 3OS1A 2B5JA 2W42A 3OYDA 4PWDA 3B6PA 2HHWA 4Y1CA 2VG5A 4O55A 1Z26A 3DLKA 3DLRA 4M3UA 4KTQA 2OYQA 3SQ4A 1Y97A 3OYGA 4PY5A 1D9FA 1RDBA 3OYHA 3ZSWA 4RW9A 3SQ1A 1L3VA 1TKZA 3KJVA 3KTQA 2HHVA 3NF7A 3NH2A 1TL1A 2F96A 4HUFA 3HL8A 4DTUA 4KHUA 1WSGA 4W5NA 3ITHA 3NF6A 3PO5A 4AHVA 1EXQA 1HYVA 1F21A 3SPZA 3QINA 4G1QA 1TKTA 1HQEA 3DOLA 4E19A 1U04A 3SZ2A 3SQ2A 3AO2A 3AVGA 4DQSA 3TANA 2G8FA 4KI4A 4E7IA 1LWCA 4CJUA 4DTSA 4M3WA 4Q0BA 5C24A 2X74A 1XHZA 2D0CA 4F2RA 3HSTB 4DSJA 1NJWA 3M8RA 4CF8A 1DTTA 3QO9A 2XY6A 3OYCA 2Z1GA 3WNGA 5E41A 3IAYA 1ZBFA 1TKXA 4M3YA 4PQUA 1JL2A 4W5QA 3KLIA 4BWMA 3MEEA 5KI6A 1NK7A 1D9DA 4AHSA 3WNFA 2ETJA 3RMBA 3K5LA 1JLBA 3MAQA 2JLEA 4Z4EA 4CGHA 1SL2A 1GOBA 3LPUA 3K58A 1DTQA 4B9MA 4N41A 1JLQA 4L8RB 4OLBA 3NF9A 3HJFA 1IKWA 1DLOA 3V1OA 4CEBA 4CJ4A 1U45A 1L3SA 3NAEA 3B6OA 2FBTA 2XRIA 3QIOA 4CFDA 3TAMA 1WSHA 3NH1A 3OYBA 3O4NA 1A5VA 5FRMA 4K8ZA 3EZ5A 2OZSA 1Z25A 1O1WA 2B6AA 3D45A 3AA5X 1TGOA 1J54A 1VRTA 2ZD1A 4H8KA 5KRTA 5JS2A 3K2PA 4CJKA 3L2VA 4HUGA 4RW6A 3RR8A 3OYJA 5CYMA 3HK2A 1TL3A 3SUOA 3HXMA 3DRSA 3DRRA 4I2PA 1L5UA 4IFYA 3KIOA 4DTRA 1KFDA 3RMAA 1U49A 2Z1IA 1RCHA 3I0SA 4E7KA 1S1XA 1NK9A 1RTHA 2XY7A 4I2QA 1KRPA 2BGGA 2YKNA 4KI6A 2HB5A 4B9UA 1IO2A 1TK0A 4NCGA 1U47A 4N56A 3AVIA 3P83D 4B8AB 2P1JA 3HPOA 1A5XA 3AVMA 4CHZA 3TWHA 1T03A 5KGWA 2LSNA 5J2NA 4FJHA 1QTMA 5HBMA 5C42A 3LANA 4WE1A 4CIGA 3V9UA 4DSFA 4ZHRA 4LH5A 4OKKA 2EX3A 3S3OA 4B9SA 4YNQA 3ZSZA 4M3ZA 4FVMA 1ASUA 2OZMA 3IG1A 4GMJB 1ASVA 3NE6A 1TK8A 3T19A 4AHTA 2P5GA 4LSNA 4CEAA 4NCAA 1R0AA 4DQPA 2YHBA 3MXMA 4FK2A 5SZTA 1NJYA 4FJKA 4CESA 4DU1A 1RBRA 3HYFA 4CEOA 4HVJA 1S1WA 1VSIA 1BGXT 3OYAA 4IG0A 3KKSA 3PUFA 4KV8A 2YV0X 3AVKA 2IS3A 3P5JA 3TAEA 3V6DA 3TAQA 4KAZA 2F8TA 3L8BA 2YNHA 2OPQA 4OPJA 3SV3A 5J2MA 3DOKA 3MECA 2KZZA 1S1TA 1S1UA 3V4IA 3SJJA 1HRHA 4B9VA 3V9ZA 3LAMA 4B9LA 3PY8A 4M3TA 4CIFA 1W0HA 1XC9A 3G10A 4HTUA 1I3AA 1SUQA 3CM5A 1W9HA 4CJTA 3RRHA 2KFZA 3AVCA 3JSMA 2VWJA 1C1CA 3OS0A 3SI6A 4E7JA 1JXBA 3S9HA 3RWUA 1C1BA 1JLGA 1JXEA 3LZJA 3S3NA 3T3FA 2DFHA 3TARA 4E1MA 1LWEA 2VG6A 4Z0UA 4IDKA 4CF2A 4DTXA 1XHXA 1VK0A 3CYMA 4C8LA 4IKFA 1RTDA 1CZ9A 4ID1A 5EU7A 2HNDA 3HVTA 4CFAA 1KFSA 4BDPA 1Q8IA 2OPSA 3KLHA 1IKVA 3AO4A 4IBNA 4FLUA 2HHSA 4QCLA 4DTMA 2YNGA 3OY9A 1ITGA 2JGUA 4DFMA 5C25A 1BI4B 1BIUA 4FJ8A 3SNNA 3ASMA 1HYZA 2AJQA 3OYFA 2P5OA 1N6QA 4OKJA 4KKOA 4MFBA 1QSYA 2GBZA 2I5JA 1UA0A 2XHBA 1YTAA 4EP4A 1WSIA 5KGXA 4Z4IA 4DWIA 2X6SA 1D5AA 2DFEA 1NK6A 2IOCA 5J2PA 4DFKA 4J2DA 4KHSA 4KO0A 3DYAA 2VG7A 1UWBA 1RT3A 3NFAA 3ZT2A 4CFBA 3U6FA 3LP3A 4DF8A 3TABA 5HP1A 4ELTA 3RRGA 2HHQA 1T8EA 1SKWA 1G15A 1YT3A 4CJRA 3O3HA 4KHYA 4HCCA 1SL0A 1NKEA 3NCIA 4H4MA 4C8KA 4F8RA 3AVJA 2KTQA 3DLBA 2RKIA 3AA2A 1RT1A 1EETA 4KTWA 3I0RA 2XY8A 1UA1A 4QOZB 1MU2A 2BDPA 3AVFA 1IG9A 1RBVA 1C0MA 4CGDA 3PV8A 1S9EA 1LAVA 2NUBA 3TAGA 3RMCA 2RN2A 2B4JA 4DLEA 4Z4FA 3LP2A 4M41A 3AO1A 4CCHA 1VSEA 2QXFA 3NDKA 1C1AA 4KB0A 2HHXA 2DTUA 4OPKA 3SPYA 3VQ9A 4DS5A 2IDOA 1B92A 4EP5A 2YNFA 4FM0A 3VQ4A 2IGIA 1NKBA 1L3TA 3HO1A 2A1SA 3KD1E 4AHCA 4FJLA 3VQAA 4CF9A 2KZMA 3E01A 1ZBIA 1BISA 3KLGA 4FM1A 3VQ7A 3S3MA 1RBSA 1RILA 2FBVA 3IRXA 2YHAA 4F2SA 4FLVA 3TI0A 4RW7A 3QNNA 1WSEA 4CF0A 1QSSA 1ZBHA 2IAJA 4ELUA 2HNYA 2QK9A 4C8MA 4FK0A 1HNIA 1JLEA 3LALA 3SCXA 4B9TA 5HRPA 3SYZA 3V9XA 4BE1A 3L2UA 3QERA 1NKCA 4FLYA 3V9SA 2EHGA 3C95A 3MEDA 1D8YA 3QIPA 3EY1A 2E6MA 3ZSVA 4W5RA 1VSDA 4KPYA 3ZT3A 3VN5A 1KCFA 1CZBA 3ZSRA 3HP6A 4FJJA 4EZ9A 1K6YA 1NJXA 3DLEA 1QHTA 1U4BA 2D0BA 3K59A 4ELVA 4DU3A 4FJ9A 1X9WA 5HLFA 3MEGA 4CHPA 2QKKA 1KVAA 1UAXA 1VSJA 3DMJA 4CJQA 3VQPA 4Z4CA 1YVUA 3OJSA 4BWJA 3LDSA 3H08A 4C8OA 3VQEA 3L3VA 4B8CA 4DSEA 2HHUA 5JS1A 5HROA 1BIZA 1RNHA 3P1GA 4LSLA 3L2QA 3OYNA 1KLMA 4ZTFA 3LPTA 1CXQA 4I9LA 4CGFA 4DQQA 1VRUA 4PA1A 3KK2A 1SKSA 1FK9A 3OYLA 3SUNA 4E3SA 2GUIA 4DTPA 4O0JA 4BE2A 4F4KA 4PUOA 4CJEA 3THVA 2WOMA 1VSFA 4CFCA 4H4OA 1BQNA 2G8WA 3O3GA 2E6LA 2Z1HA 4O5BA 1I39A 4DS4A 3RMDA 3G0ZA 4JRPA 5SWMA 1FKPA 4DFPA 1S9GA 3DM2A 3VA0A 1ZYQA 1NOZA 3DLHA 1YTUA 5FDLA 3KK3A 3PO4A 4C8NA 4DTNA 4FK4A 1BCMA 4R5PA 4CK3A 4FLZA 1QSLA 3O4QA 4AHUA 4FZXC 1KVBA 5HRNA 2G8KA 2P51A 3NHGA 4BDYA 4M42A 4F3OA 4ID5A 1KTQA 3HP9A 3AVHA 4JRQA 4FLWA 4CGGA 1RT7A 3QEWA 2O4IA 3I8DA 4O44A 4B3OA 4M45A 3LWLA 3OYMA 4OLAA 3K57A 4E1NA 4OGCA 2A1RA 4LD0A 2KQ2A 4TSXA 3T1AA 3VQDA 4N5SA 3DRPA 1BCOA 2ZE2A 1NJZA 5I3UA 3AVLA 3LP0A 3K5MA 4BE0A 2RPIA 3K5NA 3AVNA 2Y1IA 1L3UA 5J2QA 1LV5A 1ASWA 1TVRA 4HCBA 1LAWA 3AVAA 3F73A 3U3GA 2E4LA 3TAPA 4FZYA 4FJMA 1ZBUA 3L3UA 3ZCMA 2FC0A 4JS5A 1S1VA 3A2FA 4KTZA 1S5JA 1IH7A 5J1EA 1Q9YA 3C94A 3RR7A 4FCYA 3VA3A 1VSHA 4FZZA 1FKOA 1LW2A 1TV6A 3BGRA 5HRRA 4FLTA 5I42A 1TAUA 4CF1A 1NOYA 1RBUA 2HMIA 3M8PA 1SL1A 2HHTA 4HHTA 3LP1A 4E7LA 1HNVA 3SV4A 2HVIA 2D0AA 1J5OA 4Q5VA 3HPHA 4CERA 1HYSA 4FM2A 4IFVA 5CYQA 3WNEA 3V81A 3CFOA 1JLFA 2VWKA 3VQ8A 1UOCA 3QETA 5T7BA 1C6VA 3NBPA 3LZIA 2X6NA 3BDPA 1RDAA 4N47A 4HUEA 4KHWA 1REVA 4KRFA 2KFNA 4CJ5A 4FW2A 1SV5A 3ZT0A 2PYJA 3TAFA 4W5TA 1WNSA 3PX4A 4QAGA 3CM6A 4DSIA 1FXXA 4CJSA 5KTQA 3OYIA 1QS4A 3D0PA 1NK0A 1EP4A 1B9FA 2ATQA 4DU4A 3ULDA 4N76A 3QESA 3MXIA 3K5OA 1VSKA 4Z4HA 3ISNC 4CJPA 3OYKA 1WN7A 4CJFA 3NGIA 1X9SA 4FXDA 3DLGA 3QEPA 4CHOA 4LH4A 4Z4GA 4UQGA 3HT3A 1HJRA 4OGEA 3CFRA 3KD5E 5CZ1A 3ZSXA 1RDDA 4CHYA 1X9MA 3CG7A 2G8UA 1NK4A 3QLHA 1RT2A 1Q9XA 1J53A 1WAFA 4Y1DA 3QNOA 1EKEA 2G8IA 4I7FA 2DFFA 1RT5A 3ALYA 3QEVA 1TK5A 1XI1A 4OVLA 1SKRA 4BDZA 2WONA 4CK1A 5KRSA 3QEIA 1IKYA 3VQQA 4KREA 2IC3A 1TAQA 4E7HA 4DQRA 3QEXA 2RF2A 4FJXA 4FJ5A 1BQMA 3AVBA 2HNZA 3U3YA 5DMRA 1T05A 5CY4A 5K14A 2OPRA 3LWMA 4RW8A 2DY4A 1C0UA 1J9AA 2PY5A 3C6UA 1KLNA 1WLJA 1T7PA 1BL3A 4CK2A 1KSPA 1HQUA 4ICLA 3VQ5A 4CGIA 4RG8A 1RTJA 4CEZA 3OJUA 3JYTA 4CEEA 2OPPA 4KHQA 3V1QA 1A5WA 4J2AA 1CLQA 4DFJA 3ZSYA 3SUPA 4B08A 1IKXA 3HVRA 1X1PA 4DSLA 4OJRA 1HMVA 4KFBA 3C6TA 1LWFA 5CZ2A 4CJVA 4KHNA 1KVCA 1NK5A 3ZSQA 4EZ6A 4NCBA 4CHQA 4IG3A 2BE2A 3FFIA 4CHNA 2PZSA 3KK1A 1CXUA 3PX6A 3VQ6A 4O4GA 3DI6A 4JLHA 4FJNA 3O3FA 1RBTA 2R7YA 4J2EA 4RW4A 1WSJA 4FW1A 3AO3A 4KB1A 2FBYA 2G8HA 1XWLA 4FYDA 3AO5A 4FJIA 3WNHA 1EX4A 3L2RA 3VQBA 4CJLA 3ZSOA 4CGJA 3IS9A 4DTJA 4DSKA 4GVMA 3PX0A 1QE1A 3M8SA 4DQIA 1RT6A 2QKBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CHWA 3M8QA 3VENA 2YKMA 1VSLA 3RTVA 4J2BA 4CECA 4JKBA 4W5OA 3OS2A 1GOAA 1ZBLA 3WXMB 3AA3A 4B9NA 4O0IA 4K8XA 2I7PA 3T69A 3A5LC 1C0GA 3CQ8A 3WT0A 4YDUA 2YNIA 4IWVA 4BR4A 2YHXA 2CGLA 1T6CA 3NGZA 4LY7A 3L2WA 1Q81O 3PIOL 4CEFA 1TKDA 1S3XA 5AZIA 4FWSA 4RTFD 4E0DA 4CJWA 3CQXA 3O1WA 1BHLA 3KKRA 2HW3A 1B9DA 1RDCA 2UUBK 1FJGK 3HM9A 4MDBA 2VGMA 3AV9A 5AFUH 3SMSA 2W42A 3OYDA 3B6PA 1OVYA 3G4SN 1Z26A 3DLKA 4H5RA 3SQ4A 1Y97A 3OYGA 2VWBA 3VEOA 3ZSWA 1L3VA 1TKZA 1VQ7N 3HL8A 1HKCA 4W5NA 5JVGL 4AHVA 3CCLN 4IFEA 2QWRA 3SQ2A 4DUZK 2G8FA 4GKJK 4ILHA 5AQTA 1LWCA 1SQKA 3VF6A 4M3WA 4Q0BA 2V52B 4JI0K 2X74A 4WF9L 4CF8A 1YJWN 3QO9A 3OYCA 2Z1GA 1ZBFA 4BWMA 1D9DA 4NB4A 1QVGM 3WNFA 3RMBA 1JLBA 1VAZA 2FLOA 1SL2A 3FZFA 3K58A 1DTQA 4N41A 3MWPA 1IKWA 4CEBA 2XRIA 3DXKB 1WSHA 3ENBA 5HOOA 4K8ZA 1NGBA 1O1WA 2B6AA 1VRTA 2ZD1A 5JS2A 3K2PA 4I2PA 3KIOA 1YIJN 1NK9A 1RTHA 1KRPA 2YKNA 3CCRN 4B9UA 1IO2A 4B8AB 3P83D 3J7ZO 3H1VX 3QBXA 5AQGA 3KWGA 4U7BA 5LL6Z 4DR2K 1QTMA 5C42A 2QEXN 4BQZA 3BP8A 4CIGA 4DSFA 4ZHRA 2O8DA 4YNQA 2OZMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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