4KTZA

Lactococcus phage 67 ruvc
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
MKKILAINFSTASKKGEGTGYAFRKDGQVYVGSIKAYNPKKTAWERTFDIVNAIKDIIDEFDLKGYHLAIETPIMGRNRKHSITLANCNGYFIGAIDGLVNGYTFIDNSKWCSYHLISGKREQRKEESLELLKATGLVDSNCKDDNIADAYNILTYCEHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Lactococcus phage bil67
publication title Mutants of phage bIL67 RuvC with enhanced Holliday junction binding selectivity and resolution symmetry.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RuvC endonuclease
total genus 57
structure length 160
sequence length 160
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07066 DUF3882 Lactococcus phage M3 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4ktzA00
4CF8A 3VQPA 3VQ8A 1HNVA 4BE1A 4FJXA 4H8KA 4E0DA 1HMVA 1S1WA 4J2DA 3AVBA 3HM9A 4FM0A 4DF4A 4HUGA 1T05A 4B3OA 3A2FA 3I0RA 1EP4A 4O5BA 4FJ9A 1RNHA 2X6NA 2RN2A 4O4GA 2RF2A 4CFBA 1D9DA 1JLFA 2JLEA 3NE6A 3OS1A 3EZ5A 3MAQA 1NKBA 1HYVA 3VQBA 1N6QA 1A5VA 3C94A 3HVTA 4CGHA 3OYNA 3T3FA 3NAEA 3V81A 3DLEA 4N41A 1EXQA 4E7KA 1JXBA 4J2EA 1JLBA 2E6LA 1SL0A 1S1VA 3NH2A 3VQ9A 1TAUA 1W0HA 2ZE2A 4Z0UA 4KREA 3CM6A 5HRSA 4O0JA 1RBVA 3L2VA 1JXEA 1X9SA 3SNNA 1YT3A 4BACA 2G8KA 4DTMA 1VSDA 3VA0A 4Z4IA 4LSLA 1BCMA 3ZT2A 3CG7A 1TKDA 1RT2A 4DSJA 5SZTA 2BDPA 4CJVA 2P1JA 5KRSA 3PO5A 1S5JA 3F9KA 4N5SA 2Z1IA 3AA5X 1IKWA 1IH7A 1SV5A 3SV3A 1D9FA 4PA1A 2YKNA 1NKCA 1VSIA 3QO9A 5DK5A 3L2RA 3BGRA 1CXQA 1TV6A 3T1AA 4FJHA 3QEXA 3O4NA 3K5LA 4I9QA 1JKHA 3VQ5A 2VG7A 4FLUA 4F2RA 5HRRA 3AV9A 4DSFA 3U6FA 3LP2A 4KFBA 5I3UA 2B5JA 2ITGA 1IKYA 2FBTA 1S6QA 4DFMA 3KIOA 3RR7A 2QXFA 1ZYQA 1MU2A 4E7IA 2HNYA 4AH9A 3SUOA 3ZSWA 4M3ZA 1QHTA 1YTAA 2Z1HA 5HBMA 1TGOA 4RG8A 2VWJA 1L3SA 3VQ4A 4IFVA 2X78A 1VSFA 4OPKA 3G10A 4M3XA 4I2PA 3JYTA 1Z26A 3D0PA 3QEVA 2OZMA 1TL3A 1LAVA 1NK4A 2VG6A 1VSLA 1ZBFA 2NUBA 4LH5A 4CJQA 1R0AA 3NDKA 4M41A 1B9FA 5KRTA 3OYLA 3PV8A 1KRPA 3HT3A 4Z4HA 1I3AA 4EP4A 1QTMA 4B9SA 4AHCA 2HMIA 2KQ2A 4FW2A 5EU7A 3OYEA 2E4LA 2DFFA 1WSJA 4CJPA 3SQ0A 4F2SA 4OPJA 2BANA 2IDOA 1S1XA 4F4KA 3PX6A 3P83D 1VSHA 4CJ5A 1Q9YA 3LDSA 1XHXA 1C0TA 3D45A 3DLKA 4DLEA 3KKSA 4B9MA 2BGGA 4M3WA 3AA2A 1Y97A 1CLQA 4CERA 1NK7A 5FRMA 1J53A 1VSEA 3S3MA 4TSXA 4E7HA 1LWFA 3OYJA 2OPRA 1QS4A 1DTTA 3M8RA 2FBVA 3DLHA 3BDPA 5D3GA 4FJ5A 1FKPA 1BCOA 4DU3A 2G8FA 3SUQA 4IG0A 4W5OA 1RBUA 4FXDA 2KFNA 1VSMA 4CK1A 4FJMA 1WAJA 3PX4A 4FLTA 1C0MA 3NF7A 1NKEA 1QQCA 2OPSA 3AVLA 1K6YA 2YNHA 1RILA 5T7BA 4N56A 3F73A 3QEIA 2Y1JA 1QSLA 2F96A 3VQ7A 3AVCA 4FM2A 4DF8A 2KZMA 1LAWA 4CESA 3L3UA 4ELVA 1KCFA 1RCHA 4DTJA 4B9LA 3QEWA 3NGZA 1IKXA 2FBXA 4C8MA 2KW4A 1KSPA 1RTIA 1D8YA 3OYAA 3RR8A 4KPYA 3AO5A 3DOLA 4HHTA 1IG9A 4Z4GA 1C0UA 3OS0A 3C6TA 1ZBUA 4OJRA 2X74A 3HJFA 2VWKA 4E3SA 1G15A 3V9XA 3RMCA 4C8LA 3PUFA 3DRSA 4O0IA 3QIOA 5HP1A 4QCLA 3HPHA 3RMDA 2D0AA 4ID5A 4DTSA 5C25A 1ZBIA 3LP3A 4MQ3A 4M45A 4CHQA 4Q0BA 4CJFA 4DU4A 4CEFA 1JLEA 4FW1A 4B8CA 3LWMA 1KTQA 4ID1A 4BE0A 4DFPA 3TI0A 4ELUA 1L5UA 4FM1A 4KKOA 4LY7A 2DFHA 4OKJA 3OYGA 2XY8A 5J2PA 1KLNA 4Z4EA 5JS1A 3CFPA 4XIUA 3ZT0A 5KGXA 3O3FA 4KHWA 3SQ4A 2D0BA 3CYMA 2QKBA 1ASUA 3AO1A 1GOCA 5KTQA 1QSSA 2IAJA 4OGEA 4OLAA 4OKKA 3V9UA 2RPIA 3EYZA 4M3YA 4JLHA 4O55A 4CGFA 2HHTA 4CCHA 5JS2A 4B08A 4W5TA 4CHZA 2B4JA 3ZSYA 4MFBA 1FXXA 3C6UA 4FLYA 1TKXA 5HRPA 4ICLA 1SKWA 3K5OA 5HROA 1NK9A 4N76A 1WSEA 1Q8IA 4DG1A 3KJVA 3LWLA 4HUFA 2ATQA 4CJWA 3QESA 3CFOA 2IOCA 2HNDA 3NHGA 4DSIA 2IC3A 3TAQA 4WE1A 3V9WA 4FJLA 3KLHA 3HL8A 4GVMA 4FLZA 1RT5A 3MXJA 1O1WA 3AO4A 1J54A 4KO0A 1YVUA 4RW9A 3TANA 3V4IA 4HCCA 3WNGA 1HNIA 1TKZA 3THVA 1QSYA 2HW3A 4DQQA 1KVBA 3QERA 3VQDA 4CJEA 4FJKA 4FK4A 1U47A 4OKEA 1S1UA 3RMBA 1I39A 4BDZA 3K58A 3U3GA 3KLEA 5CZ1A 4KB1A 2KFZA 4DQSA 1GOBA 3ZT4A 4FJJA 3TAEA 3NCIA 3B6OA 2HVIA 3V1RA 3OYKA 4M3RA 3O3HA 4Y1CA 1UA0A 3AVFA 4CGJA 4PY5A 4H4MA 1BIUA 4E1MA 3HSTB 2A1SA 4QAGA 4DTXA 1U45A 1DTQA 3OYFA 1HPZA 3ISNC 4CGIA 4JS5A 3DMJA 4CEEA 4DSLA 4AHSA 1WAFA 4DTPA 4DLGA 4NCBA 5CYMA 1TVRA 3P5JA 4CGDA 4B9VA 1JLAA 4RW4A 2R7YA 1L3UA 4B9TA 4F3OA 4NYNA 3OYCA 1RTHA 2HB5A 1JLGA 4CEQA 5CYQA 3KLIA 4CJRA 3S9HA 2HHUA 3KTQA 2D0CA 3WNEA 1S6PA 3ZSZA 2F8SA 4M3TA 1BQNA 3DM2A 2HHQA 2DY4A 4N47A 3TR8A 5J2QA 3HP9A 3L3VA 4K8ZA 1SKRA 3JSMA 2PZSA 1UWBA 2QKKA 3V9SA 4FJIA 1CZ9A 4FYDA 4KI4A 1NK8A 1Q9XA 2GV9A 4NCGA 3V1OA 3OJUA 3SUPA 3RRGA 4M42A 2AJQA 2D5RA 1J9AA 4FK0A 3CFRA 3VQAA 3CM5A 4LSNA 1IO2A 1WLJA 4CIGA 3VA3A 3UIQA 3AVJA 3PX0A 1F21A 2O4GA 3TABA 3V1QA 3ULDA 2EHGA 5I42A 4DTRA 3MXIA 5C24A 3QIPA 1LW2A 3AVNA 4PQUA 1YTUA 1XWLA 3KD5E 4KTQA 2PY5A 1W9HA 3QETA 5K14A 3AA3A 4KB0A 3QEPA 4FLWA 3K2PA 3I0SA 4I9LA 4CJ3A 5SWMA 2PYJA 4L8RB 1RT6A 3ASMA 2BE2A 3AVMA 1ZBHA 1KFDA 4FLVA 4J2BA 1RT7A 4BWJA 3PY8A 4J2AA 4KRFA 3S3NA 4CHYA 1BL3A 3OS2A 2WONA 3P1GA 4AHVA 3NH1A 1IKVA 4RW7A 1WSFA 3MEDA 3NF6A 4CECA 4DSKA 4ZTJA 4DTUA 1RT3A 1BGXT 3HPOA 3FFIA 1RBRA 5CY4A 4I2QA 1RDBA 3NF8A 4IKFA 4EZ9A 4HVJA 1KVAA 1RTDA 4CFCA 1VK0A 1NJXA 2QK9A 3SUNA 3HXMA 3LANA 3H08A 4GW6A 4FZXC 3KK2A 4CF1A 4BDYA 2GBZA 3LPUA 4AHUA 3SQ2A 1SKSA 2LSNA 3PO4A 4FJ7A 4DMNA 4JRPA 5J2MA 2GUIA 3MECA 2A1RA 3DLRA 3NH0A 3M8SA 1ASWA 4CEOA 3C95A 4E89A 3RMAA 1ASVA 1C6VA 1ZBLA 3NGIA 3RWUA 5FDLA 3AA4A 2HHSA 2ZQBA 4KTZA 1SUQA 1REVA 1B92A 1RT4A 3AO3A 2RKIA 1U49A 4KAZA 3QNNA 3IAYA 2IS3A 5J2NA 2G8UA 2OA8A 3MEEA 4HCBA 2E6MA 2XO7A 1S1TA 5HRNA 5DMRA 3TAMA 1N5YA 4EP5A 2XHBA 3AO2A 4CJKA 3RTVA 4G1QA 1WSIA 2HHWA 2P51A 1A5XA 5KI6A 4DQPA 3V6DA 4EZ6A 3AVHA 1RT1A 2HNZA 3L2WA 4CJUA 1XHZA 3ZSVA 4KHSA 1BHLA 3HO1A 1U04A 5C42A 1WSHA 3S3OA 3HP6A 4FLXA 4ELTA 2P5OA 4CEDA 1JL1A 3SPZA 3ZSOA 3L2QA 1X9MA 1DLOA 2B6AA 3AVAA 1JL2A 3HPGA 4HUEA 1WN7A 2X6SA 3SZ2A 2W42A 3AVGA 1LWCA 3IRXA 2KTQA 3B6PA 3KK3A 1Z25A 4PUOA 3LP1A 2ETJA 4IG3A 1TL1A 1LWEA 3AVIA 4C8NA 1LV5A 4FK2A 4CF0A 4FCYA 5HLFA 1HYSA 3RRHA 4KHUA 3QNOA 2F8TA 2JGUA 4CHOA 1S9GA 4CK2A 4O44A 3DRRA 3ZSRA 4CE9A 4KHQA 3K5MA 3OY9A 3LALA 1HJRA 4IBNA 5E41A 2XY7A 3HYFA 2P5GA 4Z4FA 3OYBA 1X9WA 1KLMA 3E01A 3LPTA 1SL2A 3MEGA 2DTUA 3DYAA 1A5WA 1HQEA 1SL1A 1TAQA 3VQEA 4CK3A 3O4QA 1NOYA 4BDPA 4H4OA 4DTNA 3OJSA 4DS5A 1BIZA 1NJWA 4FJGA 2YNFA 2HVHA 1T03A 3LZJA 3MXMA 2ZD1A 4DFJA 2XY5A 3SQ1A 1JLQA 3CQ8A 3ALYA 2OYQA 4KHNA 4F3TA 3U3YA 1RBSA 3K59A 5J1EA 3SJJA 4KI6A 4CHPA 4IFYA 4NYFA 4FVMA 3K5NA 3SV4A 3SI6A 1UAXA 4B8AB 4C8OA 2Q3SA 3HK2A 2HHXA 1D5AA 3QLHA 1U48A 4ZTFA 3L2UA 4CIEA 1J5OA 2XRIA 4DQRA 3KD1E 4Z4CA 3ZCMA 1C1AA 4R5PA 4DQIA 1TK8A 1VRTA 4CEZA 3LAMA 5CZ2A 3VQ6A 1UA1A 1NJZA 4YNQA 4E19A 3TAGA 4Q5VA 4DU1A 1WSGA 2KZZA 1LW0A 3EY1A 3KKRA 2G8HA 1UOCA 2OZSA 3M8PA 4FZZA 3ZSXA 4CJ4A 5KGWA 4K8XA 3TAPA 4B9UA 2G8VA 2XY6A 2VG5A 1BISA 4W5QA 4KV8A 1EX4A 1VSKA 4ZHRA 2FBYA 4YFUA 3KK1A 4RW8A 1EKEA 4UQGA 3LAKA 1BI4B 4KTWA 4E7JA 3HVRA 1L3VA 3OYMA 3VN5A 1NJYA 2YV0X 3DLGA 3O3GA 4DS4A 4AILC 3DOKA 1GOAA 3M8QA 3ZSQA 4BWMA 4CEAA 1CZBA 1QE1A 4BE2A 1TK0A 2OPQA 4E7LA 1NK6A 3QINA 1KFSA 2FC0A 4RW6A 3IG1A 2YHBA 4CFDA 4CGGA 1CXUA 5FROA 3VQQA 1ITGA 1HQUA 2Y1IA 1TK5A 2G8WA 4CF9A 1FK9A 1NK5A 4JS4A 3SCXA 4PWDA 3NF9A 4OGCA 3SPYA 4FJ8A 3OYDA 1WNSA 1NK0A 3KLGA 1VRUA 3ZT3A 3TARA 1EETA 1KVCA 4CFAA 4DSEA 3I8DA 4FZYA 3V9ZA 4CJLA 2YNGA 1BQMA 4LH4A 1C1CA 1BI4A 1JLCA 1NOZA 1VSJA 2DFEA 3DI6A 3ZT1A 4QOZB 4GMJB 1S9EA 3TAFA 4CIFA 1XI1A 2OPPA 3OYIA 3SYZA 3DLBA 2YKMA 4KHYA 1X1PA 3OVNA 1C1BA 4IDKA 4NCAA 4CJTA 1RDCA 3TWHA 3T19A 2HHVA 1FKOA 3OYHA 1RTJA 4CJSA 1U4BA 2G8IA 2YHAA 3NGYA 4AHRA 2PYLA 4C8KA 3NFAA 2EX3A 1RDAA 4OVLA 3DRPA 1T7PA 4FJNA 4JRQA 4CEBA 1T8EA 2IGIA 2YNIA 1HYZA 1RBTA 4W5RA 4OLBA 3WNHA 3WNFA 1B9DA 3KLFA 3LZIA 3G0ZA 1TKTA 2WOMA 4HTUA 4CHNA 2I5JA 3NBPA 4DFKA 1XC9A 3AVKA 5FRNA 2Z1GA 2Z1JA 4AHTA 4B9NA 3K57A 4I7FA 3VQCA 4DWIA 2O4IA 4W5NA 4LD0A 4CF2A 1L3TA 3LP0A 4F8RA 4M3UA 3L8BA 1HRHA 4DTOA 1RDDA 4Y1DA 3IS9A 4E1NA 3ITHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VQ8A 4BE1A 3KZBA 4FWPA 2IVOA 3QFUA 4E0DA 1S1WA 3AVBA 5BR8K 3JS6A 1T05A 1QHAA 3T1YK 2RHKA 2X6NA 4O4GA 3NE6A 3OS1A 5CR4A 5C12A 3MAQA 3BZKA 3VQBA 1A5VA 3VEWA 4CGHA 1XUPO 3T3FA 3WXLA 3NAEA 1EXQA 3D2EB 2P9IB 4J2EA 1TAUA 2YHWA 1S1VA 2GEMA 5KPZA 1FW6A 4KREA 1DKGD 2P9SA 4BR5A 3SNNA 1YT3A 4DTMA 4LSLA 1BCMA 2BDPA 3P39A 3C7NA 3IFRA 2Z1IA 1IKWA 1IH7A 3SV3A 4PA1A 4CZLA 4BC5A 3L2RA 5BRDA 2P9PA 4L3QA 4H0OA 3O4NA 3CHWA 4BRLA 5KPRA 3O9QA 4FLUA 4F2RA 3EO3A 4DSFA 4KFBA 4NB4A 4JD2A 4DUZK 2QXFA 1ZYQA 4E7IA 2HNYA 4DR6K 3VETA 1QHTA 1TGOA 3CC2N 4JKGA 4OPKA 4M3XA 4KH6A 4XH4A 1Z26A 5E26A 1TL3A 4PL7A 3VGMA 5M1FA 1NK4A 1VSLA 4LH5A 3QMLA 5KRTA 4GV9A 3PV8A 1KRPA 4Z4HA 1I3AA 4EP4A 4AHCA 2KQ2A 4FW2A 2ZJPL 5EU7A 3SQ0A 2DFFA 2IDOA 1S1XA 4JI2K 2P9UB 1Q9YA 4GKJK 3AA2A 4CERA 3ZX0A 3VERA 4E7HA 1DTTA 2E2OA 3AAQA 1CZAN 3BDPA 3LDLA 5D3GA 4CZIA 3NVKA 3DJCA 3SUQA 3GBTA 4W5OA 4JI4K 4B3SK 2Q0UA 2FF6A 1VQMN 3L6QA 3NF7A 3AVLA 4A2BA 2Y1JA 1WBBA 2F96A 4H5NA 1BWFO 4H5VA 1LAWA 4CESA 4B1VA 1W2BM 1RCHA 4B9LA 2NRZA 3KK7A 4C8MA 2KW4A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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