4L3QA

Crystal structure of glucokinase-activator complex
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
447
structure length
447
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Pyrimidone-based series of glucokinase activators with alternative donor-acceptor motif.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase/transferase activator
source organism Homo sapiens
total genus 156
structure length 447
sequence length 447
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4l3qA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4l3qA01
4BRLA 1JCFA 1XUPO 2YI1A 3FFKB 3H3NO 4JD2A 3VGLA 4IWVA 5F1XA 3EKUA 1E4FT 3LM2A 4DHYA 2E1YA 2QWOA 5EOYA 2VWBA 3QICA 1HLUA 3D2FA 1MWMA 3OHRA 4FWPA 4WQ4C 3HM8A 2BUPA 3HZ6A 5AZIB 1JCGA 4E1JA 5FPDA 2P9LA 2P9SB 5LJVA 4BRMA 3IUCA 1X3NA 2E2PA 1X9JA 4BQLA 3VF4A 2PAVA 3L4IA 1MDUB 2QWNA 4BGBA 3MDQA 3CJ7A 3ENOA 1Y64A 4WQ4A 1HUXA 1BA1A 3MN6A 4B1ZA 4YDUA 3BF3A 4B1UB 3DAWA 4BC3A 4BVOA 5BN9A 4H0TB 2HF4A 1NLVA 2FLOA 1QHAA 2V7YA 1RGIA 3VPZA 5AQFA 1QZ5A 3VF6A 2D0PA 3AAQA 5ELZA 3ATVA 1NGDA 5EX5A 1NBWA 2PBDA 3WQUA 1TYQA 3LDNA 4H03B 4AM7A 2CGKA 3A5MC 1YUWA 5F0XA 2F9WA 5KQ8A 2CGJA 4HTLA 2QM1A 2I7NA 2E8AA 4B1WB 1HKCA 3JS6A 3O80A 4EFHA 3VEVA 3I33A 1NMDA 1BDGA 4FWKA 4BG9A 3BF1A 5E26A 2QWRA 2FF3B 1R59O 4H5NA 3VF2A 1SQKA 1GLCG 2QXLA 3VEZA 1CZAN 4H5RA 2NRHA 1ATSA 1TUYA 1SAZA 5AQKA 1E4GT 1U6ZA 2A40A 1GLDG 4A61A 3KZBA 3QDKA 2F9TA 3DXMA 3W3DA 3GDQA 2CH5A 1KAZA 3W0LA 1P8ZA 2IVPA 5AQGA 3GL1A 4FPAA 2IVOA 4K42A 4BC4A 5B8HA 5AZJA 2HOEA 3WXJA 5AQWA 1U2VA 4WQ5C 3ID8A 4PL7A 3CERA 4I6MA 5AQIA 2GUPA 3BEXA 1Z05A 2OANA 5ADXH 3ULEA 4FWOA 1NGIA 2P9NA 3H6EA 5AQJA 3WXLA 2NZTA 4A2BA 3C0BA 4AM6A 3SK3A 4C23A 1Z6RA 1MA9B 3SMPA 4GY2B 3GOIA 3CQYA 3F9MA 3HBTA 3CQXA 3ZX2A 5BN8A 4K43A 4WQ5A 3UB5A 4BRPA 1G99A 4BRKA 2P9KB 4BR9A 4FPBA 2YHWA 3TPQA 3R8EA 3CJ1A 3ZETA 5AQPA 3MK6A 2FSKA 1YXQA 2V51B 4H0XB 1MWKA 2H3GX 3HSCA 2J4RA 1C0FA 3DXKA 4JHDB 1IG8A 3ZX0A 5BRFA 4DB3A 3FZFA 2Q1NA 3R6MA 4B1YB 4CI6A 5AR0A 4CD1A 3FZHA 1TUUA 3P4IA 4F9OA 1DKGD 2UYTA 3AARA 4BROA 3TU5A 4YDUC 2E2OA 5EY4A 2P9UA 5FPNA 4CZEA 3CJAA 3VOVA 4IJNA 4BRGA 3ENHA 2P9IB 2V7ZA 4J8FA 1IJJA 3D2EA 1HX1A 2D4WA 3C7NA 4A62A 1J6ZA 4CZMA 3UKUB 1S22A 5AQQA 1GLAG 1BA0A 4ISFA 4XH1A 3M3ZA 3O5BA 4BC2A 2NLXA 3ZEUA 3LDOA 5EVZA 5JMVA 1HJOA 1NM1A 3CHWA 3H1QA 4BGAA 4H5VA 2Q2RA 4CZKA 4I6MB 3U8XA 5BRHA 4BRHA 2Q0RA 1RDWX 1K8KB 4L3QA 4B1XB 3GG4A 2WUSA 2YJEA 4EIAA 2P9PA 2ZF5O 4H0OA 4PL8A 4QS8A 1T44A 3DWLA 4BVPA 3RSEA 5AQUA 4FO0A 3WEEA 1BU6O 4BQZA 4BR0A 3HTVA 2CH6A 2HF3A 3WUHA 1KXPA 3VEOA 4ISGA 5AQMA 3FGUA 2Q31A 2FSNA 3MN5A 1Q18A 1YVNA 3O6WA 4O5FA 1ZXOA 3MCPA 4JD2B 5ADXA 1RFQA 3AY9A 4O8KA 4BR7A 3LDPA 3FE1A 4FWLA 4A2AA 4CBXA 3D2FB 4FWQA 3CJ9A 5AFUA 3FR0A 2P9LB 3J8AA 3GE1A 2ASMA 4PKGA 4IXCA 3CI5A 5KQDA 5BPLA 1ESVA 4BG8A 5KPTA 1QQNA 4IZ9A 2A3ZA 2D0OA 4H0YB 1NGFA 1BO5O 1NGGA 3WXKA 4GNIA 2ZWHA 1ATRA 3CJBA 3M1FA 1NGJA 4FWSA 5AQNA 1ZBSA 5AZIA 4FL9A 4BR4A 3ZX3A 2E20A 2E2NA 2P9SA 3QBXA 4B9QA 3EZWA 1QZ6A 3LDQA 5F2RA 4Y0WA 3VESA 4BR2A 1GLFO 4DQ8A 2A6AA 2P9PB 4BREA 4MO4A 3CETA 3JXUA 5BREA 2Q36A 5AFUH 5BR9A 2YJFA 2QW9A 3A0IX 4QS9A 1TYQB 1OKJA 2A42A 4DCHA 3LDLA 3O8MA 4JAXA 3MN7A 4M7YA 5AQXA 3UE5A 4BR5A 5E84A 1KAXA 1T6DA 5JICA 3D7EO 1BG3A 2Q0UA 4EHUA 4Z94A 2E2QA 4QS7A 2QWPA 3EL2A 2ZGZA 3A5LC 2VCPA 1WUAA 2EWSA 4KBOA 4RCHA 5JLFA 4BRQA 3S41A 4EAHD 5AQOA 5AQYA 4BRDA 3VEXA 2AP1A 3O08A 1LCUA 1XQSC 4FWRA 1GLJO 2BTFA 4CZJA 4XEIA 3AAPA 4PKHA 4RWTA 2QWLA 2Q97A 3VENA 3KHYA 2E1ZA 1NWKA 4BRCA 2QWMA 3DXMB 2HMPA 4IO8A 3WXIA 3H46O 4RTFD 3VGMA 2GWJA 3EO3A 4H0VB 3M6GA 3O4WA 3DJCA 5KPRA 5AZJB 3VERA 1C0GA 2CGLA 1GLBG 2A5XA 3L6QA 3VETA 1U2VB 2ZGYA 2YCHA 4CBWA 4BRNA 1BUPA 1XC3A 1LOTB 2VYPA 3MN9A 1DEJA 4CZGA 1V4TA 2I7PA 1HPMA 1V4SA 3LL3A 5AQSA 4M63C 5FPEA 4M7XA 3ULEB 3U9ZA 3SLCA 2P9NB 4K41A 4FOEA 2GTDA 2A41A 3A5OC 2W40A 3GBTA 1BOTO 2YHXA 1SZ2A 3A5NC 1D4XA 5KPZA 4BC5A 1NGCA 4FWNA 5TKYA 4NO7A 3LM9A 1BWFO 3UKRA 1HKGA 5CE3A 3ZETB 5AQTA 3O1BA 3VEYA 4CBUA 4H5TA 3EKSA 5FPMA 3A8YA 4NB4A 3FZMA 4CD3A 5BPMA 5BPNA 3SJHA 3WT0A 3DXKB 3QB0A 4BRAA 1ATNA 2W41A 2V52B 4PKIA 3IMXA 4B1VA 5JLHA 1JCEA 1GLEG 2P9KA 2ITMA 3QFPA 3CIPA 3H1VX 3O1WA 5I9EB 1NGEA 5AQRA 4BRIA 4IJAA 2GEMA 2P9UB 3IFRA 2FF6A 3U4LA 3BUZB 5EXWA 1NGAA 3QBWA 2ASOA 4CZIA 4CZLA 4CZHA 3D2EB 1EQYA 1YAGA 3C7NB 1NGBA 1DGKN 4JHDA 3QMLA 2AA4A 3B8AX 3ZEUB 2GWKA 1KAYA 5AQZA 4JN4A 3R9PA 4FWMA 2IVNA 1NGHA 4XH4A 4MLEA 2GELA 4FOIA 5BRDA 3U9DA 2IIRA 4CJ7A 2D1KA 4HWIA 3CJCA 5LJWA 4JNEA 4MLHA 2FSJA 4EHTA 1GLLO 2ASPA 3WQTA 2P9IA 4H5WA 1T6CA 2QWQA 3BP8A 2FXUA 3UKUA 3KVGA 3EN9A 1ZC6A 2DPNA 3RSEB 1S3XA 3L0QA 4WYBA 3SMSA 5LY3A 4H0PA 3WEEB 4ISEA 5AQLA 4BRFA 1WOQA 3MMVA 1HKBA 4LC9B 3UKRB 4K25A 3FZKA 3VEWA 2KHOA 3H45C 1H1VA 1K8KA 5AQHA 3G25A 3VGKA 2YHYA 3ATUA 3H3OB 3FLCO 3I8BA 1QQMA 5AQVA 3IDHA 1X3MA 2E88A 3QFUA 4FSVA 3FZLA 4XH5A 4CZFA 1QQOA 4MO5A 3HI0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HRPA 3V9WA 1NG9A 3ZSYA 4BRLA 1JCFA 1XUPO 3O9QA 4DR1K 3FFKB 3VGLA 5F1XA 3OYHA 5EOYA 4CF9A 4KRFA 4J2AA 1HLUA 3QIPA 3C6TA 4DTJA 1VSEA 3HZ6A 1JCGA 4FJJA 1J5OA 3OYJA 3OYGA 2P1JA 2RPIA 3IUCA 4CF8A 1X3NA 4OLBA 2QWNA 3ISNC 3QO9A 3CJ7A 2P51A 3ENOA 2QKKA 4AHUA 3V81A 2W6LA 1D9FA 4O0JA 1MU2A 3HT3A 4RW6A 1RILA 3MEDA 3BF3A 1C0UA 4YNQA 2FLOA 1Z26A 3SV3A 1RGIA 4DV4K 4FJIA 3AAQA 3VQEA 2FC0A 3AVFA 4CJTA 1NGDA 4NXMK 3F73A 2PZSA 5EX5A 4J2BA 5CZ2A 4IDHA 5F0XA 1RBTA 2F9WA 5DM7L 3LANA 4JI5K 2I7NA 3M8RA 4M3TA 1VQ5N 4G1QA 3VEVA 4EFHA 4PHTX 5CY4A 1A5WA 4PQUA 4FWKA 3QEWA 1M90O 3CM5A 3O4QA 4DSFA 1T7PA 4DUYK 1SQKA 4CEDA 2BE2A 4C8NA 1ATSA 3MECA 5AQKA 4NLBA 3L2QA 3E9LA 1SUQA 2VG6A 4OGEA 1GLDG 4KHWA 2VWJA 3QDKA 3TWHA 3GDQA 1JLGA 1KAZA 4M3XA 4CK2A 3NBPA 4KB0A 3GL1A 5HL7L 3QEIA 1VQPN 4BC4A 5AZJA 4C8LA 4C1NI 2DTUA 4FLYA 3HM9A 1U2VA 4DFJA 3ZSRA 5C25A 1FKOA 3BEXA 4WF9L 1HYZA 3HO1A 1RT4A 5CYMA 4EP5A 3VQCA 3ULEA 2P9NA 4DV6K 5AQJA 5CZ1A 4LF9K 4CHQA 4LH4A 4X66K 4HCBA 4DR2K 1B9FA 3GOIA 3ZX2A 3SUNA 3UB5A 2O8EA 3UIQA 2JWKA 5KRTA 3THVA 1K6YA 2BDPA 3TPQA 3SZ2A 4Q5VA 3R8EA 4KHYA 3ZETA 1BGXT 4FZZA 2FSKA 4JI8K 1YXQA 2HHQA 2V51B 2XY7A 2ZJQL 4DG1A 2H3GX 2JLEA 1NK4A 1QSYA 3B6PA 3KLEA 4KHSA 3ZX0A 3LP3A 4YOUA 4DB3A 3R6MA 5AR0A 3FZHA 2G8FA 4F9OA 1VSDA 2Z1IA 5BR8K 4BROA 3TU5A 2XRIA 4B3MK 2B5JA 2E2OA 3RMDA 1RCHA 4JKHA 1IJJA 3J7AP 1J6ZA 4CZMA 3UKUB 5M1PA 1GLAG 1M1KO 5FROA 1YVUA 4JLHA 2NLXA 3MX2A 1HJOA 3CCEN 1QS4A 3CHWA 3H1QA 3PX6A 4CF2A 3VQQA 2Q2RA 3K0SA 1Q82O 4KFBA 4OKEA 4BRHA 2Q0RA 3I0SA 1K8KB 4L3QA 3AVCA 2YNGA 4ELUA 2VWKA 4AHCA 2WUSA 4B9TA 2P9PA 3RR8A 1YITN 5CR4A 2ZF5O 4H0OA 3U6FA 1K8AO 3WNEA 1T44A 2A1RA 4BVPA 4KHNA 5AQUA 1JXEA 3HOTA 1L3TA 1BU6O 4CJKA 3KK3A 3WNFA 3HTVA 5T7BA 2HF3A 3AV9A 1QSSA 5AQMA 4YOTA 4PUOA 2FSNA 1YVNA 3R1XA 3MCPA 4RW7A 3O9UA 4FWQA 4I9LA 4JK7A 3RRHA 3SUQA 4OPKA 1LW2A 4BY9C 4E19A 4ZTFA 1CZBA 5FLXO 4IXCA 4DQRA 1Z25A 5KQDA 1ESVA 3TTDA 4H0YB 1BO5O 3WXKA 4GNIA 3F9KA 3WXMB 1ATRA 1U4BA 1HNVA 4OGCA 1ZBSA 4DTSA 3AVJA 3IAYA 4FL9A 4BR4A 2E20A 2P9SA 4CJWA 4M3RA 4B9QA 4IKFA 3D45A 3LDQA 5D3GA 4CCHA 4DQ8A 2A6AA 2HW3A 2P9PB 4MO4A 1ZBUA 3JXUA 3VQ4A 4B3RK 4QS9A 2A42A 4CJRA 3O8MA 3AVIA 5J2NA 4JAXA 3FFIA 3UE5A 2O4IA 2O8FA 1NJYA 1YJWN 1DTQA 2Y1IA 4BWMA 4B3OA 4KPYA 4QS7A 2HNDA 2QWPA 1RTJA 4OJRA 5HBMA 3THXA 4W5RA 3S41A 5AQOA 5AQYA 4BRDA 5CYQA 2AP1A 2NRTA 1JLBA 1GLJO 3D6RA 5C2FA 4FLWA 4LF5K 4PKHA 3HVRA 3VENA 4DR3K 2UXDK 2YHBA 1WSIA 4LSLA 4BRCA 1JL2A 3M6GA 1R0AA 3QERA 4YOXA 3OY9A 1DT9A 3E9PA 2CGLA 1HRHA 4BWJA 2A5XA 3L6QA 3VETA 4X65K 3CCUN 4E7LA 4ZTJA 4BRNA 2HNYA 4CZGA 4GV3A 1V4TA 4IG3A 4CHYA 1HPMA 1V4SA 4IFVA 5FPEA 2ETJA 1LAVA 2GTDA 3T3FA 3K5NA 3A5NC 1D4XA 3T19A 2DFFA 1VQKN 1VSKA 3SI6A 3VA0A 4EP4A 5JS2A 1KCFA 3UKRA 1HKGA 5CHIA 3J7YP 3O1BA 3TAPA 1SS6A 3SYZA 2BANA 4NB4A 1VQ9N 1XHZA 1OH7A 3DXKB 4UY8O 4FYDA 4EZ6A 4JI2K 3RVCA 3EY1A 4O8UA 2E5LK 4BDPA 3G71N 2P9KA 3THYA 3IRXA 5I9EB 1TL3A 3ENBA 1HQUA 3CFRA 2FF6A 3U4LA 2O8DA 1K73O 4DU4A 4IO9L 4CZIA 3C7NB 5DM6L 4C8OA 3V9XA 3QESA 4KHUA 4MFBA 4U7BA 1TAQA 2AA4A 4J2EA 5AQZA 1KAYA 2NNWA 4JN4A 3R9PA 3D0PA 2F7TA 1YTAA 3L3UA 2VG5A 1LWCA 2QTDA 4KKOA 3SBTA 4MLHA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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