4LC9B

Structural basis for regulation of human glucokinase by glucokinase regulatory protein
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
450
structure length
422
Chain Sequence
KKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for regulation of human glucokinase by glucokinase regulatory protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase regulatory protein
molecule tags Transferase/transferase regulator
source organism Rattus norvegicus
total genus 129
structure length 422
sequence length 450
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
B PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4lc9B02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4lc9B01
3VGLA 3IFRA 3VETA 5AQYA 3EKUA 1U6ZA 2FF6A 4BRMA 5KPRA 4M63C 1TUYA 3W0LA 3WUHA 2IVNA 3MDQA 3ZEUA 3CHWA 3QFUA 5AZIB 5AQSA 3SLCA 5CE3A 5F1XA 1NM1A 3H3NO 3UKUA 1HX1A 2Q97A 1T6DA 2Q1NA 1KAZA 4BG9A 1S3XA 1GLEG 3MK6A 3QDKA 3QMLA 4CZIA 3D2FA 2PBDA 3A8YA 4J8FA 3C0BA 4QS7A 1ZBSA 5BN8A 1S22A 4I6MB 3G25A 4CZLA 5BRHA 2Q36A 1YVNA 3OHRA 2PAVA 2GELA 1HKBA 3MN5A 2EWSA 3B8AX 4M7YA 4WQ5A 1Z6RA 1NGEA 2ZGZA 3VEOA 4BRHA 5BRDA 2HMPA 4JD2A 3ENOA 2IVOA 4CZEA 5AQMA 1GLCG 3C7NB 4DHYA 1LOTB 3KVGA 1V4SA 4FWRA 3BUZB 4YDUA 2V7ZA 1X9JA 4BREA 1GLFO 1RFQA 1D4XA 4AM7A 2V51B 2A5XA 3QB0A 3WXKA 1NGIA 2CGJA 2CGLA 4BRLA 5KPZA 4WQ4A 4CJ7A 4BVPA 3IMXA 4HWIA 4H0PA 3ZX3A 1J6ZA 2NRHA 4B9QA 4DQ8A 4MO5A 4FWPA 1MA9B 3HM8A 4B1UB 4BGAA 4FSVA 5LY3A 3R9PA 1C0FA 2ITMA 3I33A 2H3GX 5AQLA 3I8BA 3M6GA 1Y64A 3FZKA 3JXUA 1NWKA 2YHXA 3IDHA 3FR0A 3WQUA 3J8AA 5LJWA 3ATUA 3MCPA 3D2EB 5JLHA 1ATSA 4AM6A 3DWLA 2QWPA 4JAXA 5ADXA 3AY9A 4IO8A 3ULEB 3A5NC 5BPMA 1BA0A 3HBTA 1X3MA 4A62A 3WEEA 4K25A 4FWOA 2E2PA 1NMDA 4FWQA 3RSEA 4BRPA 3DJCA 3M1FA 4PL7A 2BUPA 2P9PA 2FSKA 4B1XB 2FSJA 1HLUA 3O08A 2D4WA 3VF6A 2D0OA 2VYPA 5AQOA 1HUXA 3WXIA 4Y0WA 1QQOA 2YJFA 3FZLA 2Q0UA 1K8KA 2NZTA 5AQRA 1KAYA 2D1KA 4BG8A 4BR2A 3SJHA 3QFPA 3L4IA 1JCGA 3DXMB 1BG3A 3ZX2A 2ASOA 3JS6A 3L6QA 4GNIA 1JCEA 1KXPA 4H0OA 3ZETB 3KHYA 2KHOA 1Q18A 3DXKA 2E20A 2P9SB 1RGIA 5AFUH 3EKSA 3HSCA 3QBWA 5JLFA 3LDOA 4A2BA 3H46O 5AR0A 2W41A 1BO5O 4H0VB 4MLHA 3ATVA 4BRDA 3R8EA 2P9IA 4B1WB 1NGCA 1BA1A 3GBTA 2QW9A 3HI0A 2YJEA 3AAQA 3D2FB 3D7EO 3FE1A 3FZHA 2QM1A 3FGUA 5FPNA 3LM2A 2A6AA 3IUCA 4H03B 5KQDA 1KAXA 1TYQA 1QZ6A 3EN9A 2ASPA 3H45C 3BP8A 2IIRA 3SMSA 1U2VA 4NO7A 3SMPA 4K42A 3CJ7A 5AZJA 3UE5A 1E4GT 5BPLA 3VENA 4CZFA 3GDQA 2ZWHA 4H5RA 2P9LA 3LDQA 1DGKN 4FOIA 2GWKA 2F9WA 2J4RA 3H1VX 3U8XA 3WXLA 4IJAA 4BC3A 3TU5A 5AQNA 3A0IX 1ZXOA 3CQYA 3CQXA 3AARA 5FPEA 2QWOA 4PKIA 2VWBA 2E2QA 4BC2A 4EAHD 3VEWA 4DB3A 4CZJA 2A3ZA 2CH6A 4BRCA 5LJVA 3H3OB 5AZIA 4CBUA 2E1ZA 3QBXA 3TPQA 2UYTA 3CJCA 2HF3A 1R59O 3VEZA 4CBXA 2E88A 2GWJA 4XEIA 4BRGA 4WQ5C 4BGBA 3VPZA 2DPNA 1GLDG 5BREA 3A5MC 2Q2RA 4RCHA 2FSNA 1V4TA 1GLAG 2W40A 2P9KB 1MDUB 4YDUC 4O5FA 4BR9A 3M3ZA 5AQTA 2A40A 4BRIA 1NGDA 4I6MA 3AAPA 1NGFA 3UKRB 1BU6O 1ATRA 4PKGA 4B1YB 2E8AA 3U4LA 4FL9A 4BR7A 2AP1A 1P8ZA 4FWKA 2P9UB 5FPMA 3L0QA 4BR5A 2V7YA 4WQ4C 3WT0A 3C7NA 2Q0RA 3CJ1A 3LDPA 3O1WA 5FPDA 2CGKA 3MN7A 4EHTA 1IJJA 5ELZA 1QHAA 2Q31A 3LL3A 4JHDB 3O5BA 4BRAA 1WOQA 5F0XA 4PKHA 3GL1A 4NB4A 5AQKA 1WUAA 4CD3A 4B1VA 2A41A 1BOTO 2P9NB 3FZMA 4BRKA 1C0GA 1DEJA 1SQKA 5JMVA 2HF4A 1JCFA 3CIPA 3EL2A 4XH5A 5BR9A 4C23A 5AQQA 1YXQA 4QS9A 3VOVA 2FLOA 2BTFA 4KBOA 1OKJA 3F9MA 1BWFO 1QQNA 4L3QA 4K41A 4XH4A 2YHWA 2QWRA 3CERA 3HZ6A 5JICA 3ZEUB 3ULEA 5BN9A 5BPNA 3UKUB 2V52B 4CI6A 1CZAN 4B1ZA 1XUPO 3VEYA 3LM9A 1NGBA 4FWSA 4BRNA 1EQYA 3H1QA 3ENHA 2ASMA 1U2VB 5F2RA 4A61A 4MLEA 2ZF5O 4CD1A 4CZKA 4FWNA 1ATNA 1NGJA 3H6EA 4IWVA 4E1JA 1H1VA 2I7NA 5EVZA 3GG4A 2P9LB 4ISEA 2YI1A 4EHUA 1HJOA 2AA4A 1HKCA 5KQ8A 2WUSA 4RTFD 3DXMA 4JD2B 4BR0A 1GLLO 3VEXA 4H5WA 3VESA 3ZETA 1XQSC 4H5TA 3LDLA 2P9SA 3MN9A 3VEVA 4FOEA 5BRFA 2QWQA 5E26A 2D0PA 2QXLA 3VERA 4IZ9A 4ISFA 4BR4A 4CBWA 2IVPA 5AQUA 4IJNA 4MO4A 5ADXH 3CETA 2FF3B 1RDWX 4QS8A 5EXWA 1X3NA 2E2OA 1TUUA 4CZMA 3VGKA 4HTLA 3CJAA 3VF2A 3VF4A 2QWLA 3A5OC 4H5VA 5TKYA 1T44A 3BF3A 5AQZA 5I9EB 5AQIA 3KZBA 2A42A 3BEXA 4BRFA 3HTVA 5AFUA 3GE1A 4DCHA 5B8HA 4FPBA 1SZ2A 4F9OA 5E84A 1ESVA 2QWMA 3O4WA 1MWKA 4XH1A 5KPTA 4RWTA 3CJBA 4BC5A 5AQFA 1IG8A 4EIAA 3ID8A 1LCUA 3WEEB 4CZHA 4BROA 3SK3A 1DKGD 2E2NA 4FWLA 4BQZA 3DAWA 4ISGA 4Z94A 4M7XA 3RSEB 1XC3A 1BDGA 4H0XB 3WXJA 5AQJA 2P9PB 3GOIA 4CZGA 2OANA 3MMVA 1T6CA 3A5LC 1QQMA 4BVOA 5AQVA 4FWMA 1SAZA 2YHYA 3EO3A 1QZ5A 1HPMA 4H0YB 3U9ZA 1MWMA 5AQWA 1K8KB 3VGMA 4IXCA 2GTDA 5EOYA 2F9TA 2FXUA 1YAGA 1NGGA 4BQLA 5AQPA 3S41A 3CI5A 5AQGA 5AQXA 2E1YA 2P9KA 3O8MA 1NLVA 4PL8A 2ZGYA 2QWNA 3DXKB 3U9DA 1NBWA 1YUWA 3UKRA 3FLCO 5AQHA 3O1BA 4BRQA 5EY4A 3W3DA 3FFKB 4JN4A 1BUPA 3O6WA 2P9UA 2NLXA 3QICA 4FPAA 4FO0A 3D2EA 4LC9B 4EFHA 2I7PA 2P9IB 1Z05A 1NGHA 4GY2B 1ZC6A 3LDNA 1NGAA 3P4IA 4JHDA 1GLBG 1E4FT 4O8KA 1G99A 3UB5A 3BF1A 4BC4A 2GEMA 1TYQB 4WYBA 2VCPA 2P9NA 3O80A 3CJ9A 2YCHA 3ZX0A 2CH5A 4H0TB 3WQTA 1GLJO 3MN6A 2HOEA 4H5NA 5AZJB 3R6MA 1HKGA 4A2AA 3EZWA 3FZFA 4JNEA 5EX5A 4K43A 2GUPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZT4A 4LH4A 1YITN 3TR8A 3OA9A 1XC9A 1TK8A 4JKGB 4W5OA 3OYKA 5KPRA 4M63C 3WUHA 2G8WA 1DT9A 5AZIB 3SLCA 4LFAK 5F1XA 2QKKA 1JKHA 1HX1A 1YHQN 2ZJRL 4DU1A 4F4KA 3T7ZA 1T6DA 3MK6A 1CLQA 1W2BM 1RDAA 2PBDA 4IEEA 4LF7K 5GAEP 3LDSA 3L3UA 2B5JA 5BN8A 1J54A 2F96A 4CJ3A 2NNWA 1YVUA 4NCGA 3TAPA 2X78A 1HKBA 2VG5A 3L2WA 1NGEA 2ZGZA 1XNRK 3O3FA 3ENOA 4B9TA 2IVOA 4CZEA 5AQMA 1GLCG 4DHYA 5C25A 2NRVA 1V4SA 1OH8A 4YDUA 4DR7K 2V7ZA 1VK0A 3OS1A 2OZSA 1GLFO 2B6AA 4E7JA 3OYNA 4BWMA 1FXXA 1RDUA 4NCAA 3CCVN 1S72N 1NGIA 3ULDA 4DTSA 4IG0A 1JLEA 4CJ7A 2F8TA 2WONA 4KHNA 3ZX3A 3NDKA 3DOKA 2YHAA 4DV1K 2HBKA 4FWPA 3DLKA 4B1UB 1B9FA 3QESA 1OVYA 3ZT3A 3SPYA 3O9TA 5BR8K 2G8IA 1A5WA 3J8AA 2NRRA 3KK3A 3DWLA 4JAXA 3K57A 1K6YA 2HMIA 4X66K 3ULEB 5C2FA 1BA0A 4FW2A 4KV8A 4EZ6A 4A62A 2RKIA 4CEZA 1TKDA 3PX6A 4PL7A 4BRPA 2YHBA 4CEAA 4U7BA 5C0YA 3NE6A 2FSJA 3VQ8A 3C6TA 2D4WA 3VF6A 4C1NI 1SL0A 4YOVA 2YJFA 3P39A 4IBNA 3KJVA 3FZLA 2Q0UA 4B3MK 3AGRA 3QO9A 3I0SA 4PY5A 5AQRA 3QIOA 2D1KA 4BG8A 3THWB 3O4NA 3L4IA 1BG3A 1IG9A 3KTQA 3L6QA 1C1BA 3TAMA 1RT5A 3ZETB 4KO0A 3WNFA 2P9SB 1RBSA 2P5GA 3NCIA 3EKSA 1IH7A 4KHYA 4CFDA 5DK5A 4JI6K 4ICLA 1UAXA 1BO5O 4H0VB 3CCSN 3J7AP 4B1WB 1BA1A 3GBTA 2DY4A 3D2FB 2HBLA 3FFIA 2A6AA 1TYQA 3T69A 1W9HA 1QZ6A 3CCMN 2XHBA 5I42A 2IIRA 4NO7A 2XY5A 1RT1A 3DLLL 2UXDK 4DR5K 4ELUA 3KD1E 3MAQA 4CZFA 2P9LA 2QKBA 4FOIA 2GWKA 4BDPA 3H1VX 3WXLA 1HQUA 3NGYA 3I0RA 3IG1A 3P1GA 1DLOA 2VWBA 4CEFA 3TABA 4DR6K 3K5OA 4IDHA 4M3XA 3CD6N 4CZJA 2FBXA 2CH6A 4HUGA 1KSPA 5AZIA 1LV5A 3QBXA 4OKEA 3VEZA 4DR3K 3NF7A 1LAWA 3OYCA 3K59A 1Z26A 3CCQN 4BGBA 5BREA 1LAVA 4KH6A 4BRIA 1QE1A 3AAPA 5JVHL 1NGFA 2OPPA 4PKGA 4CCHA 1ASWA 2AP1A 4BR5A 3DLBA 4WQ4C 3UIQA 4X64K 4CGGA 1NJIO 2CGKA 3T3FA 3LP3A 1WSJA 4JKAA 1IJJA 5HL7L 4B8CA 4GV6A 4PKHA 3GL1A 4NB4A 3EE8A 4B1VA 1BOTO 4HHTA 4KFBA 1VHXA 1WSGA 4J2AA 4RW8A 4Z4IA 4GVEA 4OGCA 3SV4A 4C23A 4QS9A 1K8AO 1D5AA 1J5EK 3KK2A 3T1HK 2FLOA 2BTFA 2R7YA 1NK4A 4FYDA 1TVRA 3F9MA 3CC2N 4L3QA 3V9UA 4RG8A 4XH4A 3CERA 1CXQA 3ULEA 3V1RA 3NF8A 1ZBLA 3THXB 3UKUB 2V52B 3J7ZO 1CZAN 4C8KA 4CVNE 2NRZA 3LM9A 4BRNA 3H1QA 3ENHA 4CIEA 2O4IA 3OYAA 4DQIA 1SL1A 5CZ2A 4A61A 1NJWA 4CZKA 3G6EN 1NGJA 3H6EA 3V1OA 4IWVA 4E1JA 1H1VA 1YTAA 4DMNA 2YI1A 4KKOA 3OJUA 3G0ZA 4RTFD 4JD2B 4AHVA 3TAEA 4BR0A 4CHYA 3AVKA 5IWAK 3ZETA 4H5TA 5BRFA 2P9SA 3THYA 4FOEA 2OPRA 2D0PA 3KK1A 4CBWA 2IVPA 4DFPA 4IJNA 4MO4A 1RDWX 3V81A 4QS8A 3CPWM 4EZ9A 3DOLA 2QA4N 4DKWA 3DLGA 4DV4K 3CJAA 3F9KA 3QNNA 4NXMK 2E6LA 3QIPA 3AVIA 3AA5X 2IC3A 3SPZA 4BWJA 4FLXA 4BRFA 1Q81O 1YJWN 1KFSA 5AFUA 3P5JA 4I9LA 4FPBA 1WBBA 1RTHA 1ESVA 2UUCK 1MWKA 3OYHA 3KLFA 3KKSA 4AHCA 2F8SA 4EIAA 3AA3A 4F8RA 1LCUA 4FJMA 1NJYA 4BROA 3SK3A 2E2NA 3IRXA 3R1XA 4ISGA 1KLMA 2HHUA 1RDDA 1XC3A 4CEDA 4KH5A 4ZTFA 3WXJA 1SS6A 3NF9A 1T6CA 2ZQBA 2ZE2A 5HRSA 1X9MA 4FWMA 4DFMA 4FJKA 3ID6A 4B9VA 3L2VA 3U9ZA 2YX6A 1EX4A 1K8KB 3VGMA 4IXCA 2GTDA 5EOYA 4M3RA 1NGGA 4IFEA 3T1YK 3S41A 3CI5A 5KGWA 3ZSVA 5AQGA 4DU4A 4LD0A 5AQXA 3AGKA 3TI0A 1NLVA 3DXKB 1YUWA 3HM9A 3TAGA 2RN2A 3RMAA 4ILHA 2JLEA 3O4QA 4KHPK 1BUPA 2VWJA 3O6WA 4FO0A 2OA8A 1S1VA 2JWLA 4B9UA 3AVJA 4DU3A 3OBWA 1QVFM 1WSIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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