4LC9B

Structural basis for regulation of human glucokinase by glucokinase regulatory protein
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
450
structure length
422
Chain Sequence
KKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase regulator
source organism Rattus norvegicus
publication title Structural basis for regulation of human glucokinase by glucokinase regulatory protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase regulatory protein
total genus 129
structure length 422
sequence length 450
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
B PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4lc9B02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4lc9B01
3VETA 5AQNA 2Q2RA 3GL1A 1NM1A 2P9PA 4ISFA 2QM1A 4H0YB 3U8XA 3EKSA 3D2FA 4BREA 4KBOA 3JS6A 3VEZA 3O5BA 5FPMA 4BRQA 1YVNA 1RGIA 1HLUA 4K43A 4A2AA 5ADXA 3GE1A 3QB0A 4BC5A 3A5MC 3VEXA 1TUUA 3LM2A 3BEXA 4B9QA 2FF6A 4I6MB 4CZJA 4IZ9A 2E88A 2W41A 3AAPA 3FR0A 4K41A 4WYBA 1CZAN 3DXMA 4BR9A 5E84A 3CERA 3LDOA 5AQKA 2V51B 3QBWA 1BA0A 2P9KA 2YHXA 5LJVA 5KPTA 1JCFA 4B1YB 1GLCG 5AZJA 2E2OA 3D7EO 1RFQA 3CI5A 3ID8A 3BF1A 2I7NA 4Z94A 4FWMA 2NZTA 3VERA 1XUPO 2V52B 5FPEA 2DPNA 1NGHA 5CE3A 4A2BA 4H5NA 1X3NA 2J4RA 4PKGA 2CGKA 5BR9A 4FWNA 3UKUA 4CZFA 5AQWA 3A5OC 5AFUH 3A5NC 3B8AX 3JXUA 4WQ5A 2EWSA 2QWLA 1ATRA 4FSVA 1NGDA 3H45C 1T6CA 1TUYA 2IVPA 5KQ8A 3VOVA 4CZMA 4BVOA 2OANA 2KHOA 3MN5A 3H6EA 3TU5A 3VF2A 5I9EB 1NGGA 3L0QA 2E2QA 5AQQA 4IJNA 3LL3A 1T44A 4XH1A 2Q0UA 4BR7A 1BG3A 4EHUA 4WQ4A 3VGLA 1KAYA 1YXQA 3I8BA 1QZ6A 4I6MA 4XH5A 2F9TA 2FSKA 3H1QA 5AQZA 2AA4A 5LY3A 1MWMA 1C0GA 3EZWA 2YCHA 2V7YA 3I33A 3AY9A 2Q31A 1DKGD 3VF4A 4JD2B 1YUWA 3BF3A 1NMDA 3VEWA 4DB3A 4BRAA 5JICA 2QWOA 5AQLA 1GLJO 4BC2A 1HUXA 1NGEA 1QQNA 2A40A 4K25A 1DGKN 1SZ2A 2CGLA 3M6GA 3FZLA 4CZLA 4RWTA 3UKRB 2ASPA 4CZHA 5F1XA 4M63C 1GLAG 3MN7A 3FLCO 5F0XA 5AQXA 5KPZA 2WUSA 4BRFA 3CHWA 1G99A 1C0FA 3FE1A 2CH6A 4CZIA 4CZEA 1EQYA 1NWKA 4CBWA 4PL7A 1QZ5A 2QWRA 2ZGYA 4BRCA 5EY4A 4BRKA 5BPNA 2IIRA 4FWLA 4XEIA 3O08A 2NLXA 1E4FT 3EO3A 3A8YA 4BROA 3IDHA 3CJBA 2A6AA 1BUPA 2H3GX 3VESA 3R6MA 2IVOA 4F9OA 4MLHA 2BUPA 4YDUC 3M1FA 2P9UB 2D4WA 4H5RA 3BP8A 2P9SB 2ASOA 3H1VX 4NO7A 1GLBG 3W3DA 4JD2A 3VPZA 3FZKA 2Q97A 3HBTA 1S3XA 5EVZA 4WQ5C 4A62A 1ZXOA 3SMSA 5BRHA 3H3OB 4FPAA 1ATNA 4JAXA 1HJOA 3AAQA 5AQUA 2AP1A 1KAZA 3MMVA 1OKJA 3HZ6A 3UKRA 3WQUA 1Y64A 1HKCA 3W0LA 2E8AA 3WXIA 4C23A 2ITMA 2D0OA 3MCPA 4BRIA 3MDQA 4BC4A 3CJ7A 2GTDA 3A5LC 3CJ1A 3KVGA 4WQ4C 5AQPA 4EAHD 3QBXA 2GWKA 3LDQA 3IMXA 4JN4A 3WXJA 5JLHA 3DWLA 4IXCA 3ATUA 3WEEB 1V4TA 1QQMA 1R59O 1S22A 2FF3B 2V7ZA 2P9NB 4M7XA 3CQXA 3VEVA 4H03B 3DJCA 3WQTA 5BREA 3ATVA 5JMVA 3C0BA 5E26A 3MK6A 2GEMA 2I7PA 3WXLA 4H5VA 4FWRA 1XC3A 5LJWA 4PKIA 3WT0A 3HSCA 2P9UA 4H0XB 2YHYA 1IG8A 2P9SA 1TYQB 2A5XA 4BR0A 4FOEA 4MO4A 3IFRA 2E2NA 4BQLA 3F9MA 2FXUA 2GELA 3LDLA 2ZWHA 3ULEB 4J8FA 4EIAA 4Y0WA 1XQSC 4BGBA 1NGFA 1GLDG 3LM9A 3VGKA 4JNEA 3UB5A 1NGIA 1JCGA 5B8HA 4CBXA 1V4SA 3SJHA 1Z05A 2CGJA 4M7YA 3ENOA 5F2RA 5BN8A 1P8ZA 2PAVA 4RTFD 5AQSA 3LDPA 2HMPA 1K8KB 2QXLA 2YHWA 1ZC6A 4AM6A 2IVNA 3U4LA 5BPMA 4BRDA 2FLOA 4BG9A 3WEEA 3MN9A 2GWJA 4AM7A 3UE5A 4BRMA 2P9NA 2FSJA 3LDNA 3VENA 4MO5A 2D0PA 3CETA 1NBWA 3L6QA 3EKUA 3QFUA 4BRHA 4DHYA 4RCHA 1YAGA 3C7NB 2A42A 5ELZA 3FZHA 4ISGA 1NLVA 1JCEA 4H0OA 1HKBA 5BN9A 4K42A 4IO8A 1BA1A 1ZBSA 1J6ZA 1TYQA 1BDGA 4XH4A 2FSNA 2W40A 3D2EB 3DAWA 3VF6A 1LCUA 4H0TB 1NGAA 1NGCA 2VCPA 5EOYA 3ZX2A 2P9IB 3DXKA 3ULEA 5AZIB 3FZMA 1WUAA 2A3ZA 2PBDA 2P9LA 1Z6RA 2QWQA 1HX1A 4E1JA 3EN9A 2CH5A 3A0IX 4B1ZA 3CJ9A 2E20A 4B1VA 2VYPA 4L3QA 3TPQA 5AQFA 4CZGA 2YI1A 4IJAA 4DQ8A 4JHDB 4FOIA 3O4WA 4HTLA 4BRGA 5AQJA 5AQRA 1K8KA 3WXKA 4BRPA 3H46O 2E1ZA 4PL8A 4FWKA 3R8EA 3ZETB 3U9DA 1MDUB 2Q36A 3ZEUB 1U2VB 3O1BA 3ZX3A 4BQZA 5KPRA 2HF4A 3O8MA 1Q18A 3RSEA 5JLFA 2YJEA 5AQOA 3U9ZA 4BR4A 1U6ZA 4FWQA 4CD3A 5EXWA 5FPNA 3O1WA 1X3MA 4BG8A 3EL2A 3FZFA 1KXPA 3C7NA 1D4XA 2YJFA 5KQDA 4BC3A 4CJ7A 4EFHA 5AQYA 4FO0A 1IJJA 5AR0A 3SK3A 3D2EA 4BVPA 1RDWX 4YDUA 3G25A 3ENHA 2P9IA 1GLFO 5AQGA 5AZIA 3VGMA 4A61A 1HPMA 1BOTO 2GUPA 1E4GT 3OHRA 4BR2A 5AQIA 2QWNA 2HOEA 4ISEA 5BRFA 3S41A 5AQHA 4EHTA 1QHAA 3L4IA 3QFPA 4GY2B 2QWPA 3DXKB 4CZKA 3AARA 4H0PA 4HWIA 2ZF5O 1KAXA 1MWKA 2P9LB 2A41A 4JHDA 5TKYA 3SMPA 2F9WA 1LOTB 2VWBA 4H0VB 2Q0RA 3SLCA 3ZX0A 1X9JA 4H5WA 1BO5O 3M3ZA 3ZETA 3J8AA 1ATSA 3ZEUA 1BWFO 2E2PA 1U2VA 5AQTA 3IUCA 3VEOA 3O6WA 1SQKA 4QS7A 4BRLA 5BPLA 1DEJA 4FL9A 2P9PB 1T6DA 2NRHA 5AFUA 4FPBA 3CJCA 3D2FB 5AQMA 3GG4A 4O5FA 4CD1A 3GOIA 2UYTA 4FWOA 4MLEA 4BRNA 5AQVA 4QS9A 1GLLO 1NGJA 3MN6A 2ASMA 4GNIA 3RSEB 2BTFA 1QQOA 4PKHA 1HKGA 1WOQA 1GLEG 4DCHA 3GBTA 1MA9B 3KZBA 4IWVA 3WUHA 4FWPA 4NB4A 3O80A 3DXMB 4CBUA 5EX5A 1BU6O 4H5TA 4O8KA 3CJAA 3QMLA 2P9KB 4QS8A 4BR5A 2ZGZA 4FWSA 4B1XB 5AZJB 1NGBA 1H1VA 2E1YA 3HM8A 3FFKB 2HF3A 4BGAA 2QWMA 3HI0A 3KHYA 2D1KA 3VEYA 3CQYA 2QW9A 5BRDA 4CI6A 3GDQA 3R9PA 2Q1NA 5FPDA 3P4IA 4B1UB 3H3NO 3CIPA 4LC9B 3UKUB 5ADXH 3BUZB 1ESVA 4B1WB 3QICA 1SAZA 3QDKA 3HTVA 3FGUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HVTA 3OBWA 3VETA 3AV9A 3QNNA 2P9PA 5SZTA 2QM1A 2VGNA 3L2WA 3E9OA 3U8XA 2WTUA 3ZYYX 1X9WA 1RBVA 2VQEK 4KFBA 4BREA 3CC2N 3VEZA 1SUQA 3V1OA 3CM6A 4BRQA 4FJHA 2HW3A 1RGIA 4K43A 3E01A 1WBDA 1EWRA 2HHUA 3KKSA 1UWBA 4B08A 3GE1A 1BISA 1WSHA 4IZ9A 3AAPA 4XIUA 4WYBA 1JLQA 1C0MA 2V51B 3QBWA 1BA0A 3CFPA 2D0BA 1NOZA 4CFBA 1GLCG 2E2OA 4GW6A 2P5OA 1RFQA 3CI5A 1Q86O 2FBYA 3ID8A 3QERA 1RT1A 2X74A 3TAEA 4FJGA 4FWMA 4GV3A 2NZTA 4H5NA 4JS5A 1X3NA 4PKGA 2CGKA 3BGRA 3MEDA 1Q8IA 4MFBA 1ASUA 4OKKA 3A5NC 2QWLA 2A1SA 1IO2A 3LWMA 3TSUA 1NGDA 1RT3A 3L3VA 4NLBA 1QQCA 3VOVA 1TGOA 4LY7A 4JKDA 3MN5A 5C12A 3H6EA 3TU5A 2BE2A 5I9EB 2E2QA 2G8WA 3QEPA 1XWLA 2NUBA 4IJNA 5SWMA 3L2QA 1HNWK 2Q0UA 4LSNA 4X66K 1QZ6A 5LY3A 5AQZA 2WONA 3ZT2A 2FBVA 4KHSA 4JKFA 3PO5A 2YCHA 3I33A 2Q31A 4A57A 4R79A 1YUWA 4DB3A 4RW4A 4JI6K 5JICA 5M1NA 4BC2A 1HYVA 1VQON 4CEOA 4K25A 1DGKN 4KHPK 4W5NA 4DR5K 2CGLA 3H08A 4JK8A 3M6GA 2HMIA 4CERA 3MECA 1S1UA 2ASPA 4CZHA 5F1XA 1GLAG 3C95A 2UXCK 5KPZA 2WUSA 2QK9A 4DQIA 2WBNA 1EQYA 4NCBA 4CJLA 4CW7B 3O9TA 1NWKA 4OPJA 3NH0A 1QZ5A 4X64K 4EP5A 4BRCA 2ZGYA 4DQRA 5EY4A 4DKWA 4CEEA 4FW2A 4XEIA 3G71N 3AGKA 2DFHA 1E4FT 2HHSA 4KHUA 3NCIA 4CHZA 2G8IA 4FJXA 4AF1A 3R6MA 2BUPA 3ZSQA 4YDUC 2Z1GA 3RMDA 3WNFA 2P9SB 3TTFA 1GLBG 1J9AA 4LD0A 2PYJA 3FZKA 4M45A 3VQ4A 4FK4A 2HNZA 5CZ2A 4EZ6A 3B6PA 4CFCA 3KLGA 1M1KO 2DFFA 1ATNA 1BGXT 2E8AA 3WXIA 4C23A 1WSFA 3VN5A 3MCPA 2G8KA 4G1QA 4EAHD 2WOMA 4HVJA 3QBXA 3F9KA 4FJ7A 2HBJA 2FF3B 2QKBA 2P9NB 2G8UA 4CHNA 3E66A 4A59A 4H03B 4PHTX 1VSKA 5C25A 1Q81O 5BREA 3C0BA 3TR8A 3MK6A 4X65K 1XHZA 2GEMA 2I7PA 4H5VA 4E1NA 3RR8A 3WT0A 3ZT4A 4H0XB 4DTOA 4KAZA 2GV9A 1VQ6N 1TKZA 1NG9A 2WC9A 4DSLA 1LWCA 1TYQB 4AHTA 1S5JA 3LAKA 4RW8A 3KD1E 3C94A 3F9MA 1IKWA 3HSTB 2VG5A 3QEIA 3OYGA 1NKBA 4IOAL 4HCCA 1KVAA 4CEDA 1GLDG 3LM9A 1SL1A 4B3MK 1JKHA 3UB5A 3AVMA 3KLFA 3HPGA 1LWFA 4U67L 1JCGA 4CBXA 1V4SA 3MWTA 3SJHA 1XHXA 1Z05A 3ENOA 2JGUA 1I94K 1IKYA 4U7BA 5BN8A 1P8ZA 5AQSA 3O3HA 2OYQA 2HHXA 5CYMA 1DTTA 2HMPA 2QXLA 2YHWA 1RDUA 1J53A 5BPMA 4YY3K 3K5LA 4BG9A 2KZZA 2HHVA 4BRMA 3LPUA 4DSIA 2OPRA 2FSJA 2F8SA 3LDNA 3VENA 3NBPA 5J2QA 3LZJA 3SI6A 1IKXA 3L6QA 1R0AA 3AA3A 4E89A 1CLQA 3BZKA 1NK5A 1BI4A 4RCHA 3NVKA 3SQ4A 5ELZA 3C7NB 2R7YA 1JLGA 3DLEA 3ZT3A 1NLVA 1QS4A 4C8NA 4CHOA 3ZSRA 2X6SA 1ZBSA 1J6ZA 4OVLA 1D9DA 4LFBK 1BDGA 3AO1A 4XH4A 4IFVA 2W40A 3K9JA 3VF6A 1LCUA 3ZT0A 1NGCA 5EOYA 3ZX2A 5AZIB 3FZMA 5J2NA 2PBDA 4YHHK 4O4GA 3EN9A 3DRRA 2IS3A 1VQ8N 4B9LA 4B1VA 2VYPA 3TPQA 3O3GA 3J7YP 1RTDA 4GKKK 4B9UA 4CFAA 4BE1A 4JHDB 3O4WA 4BRGA 2XHBA 5AQJA 1K8KA 3RVCA 4PL8A 2AJQA 3CF5L 4DV6K 1HYZA 3U9DA 2QI2A 2Q36A 5DM7L 3ZSYA 3ZX3A 4CJEA 4DFJA 3OYIA 4KTZA 1KVBA 4OPKA 2PFUA 4EZ9A 4ELTA 1NJYA 4BWJA 4K8ZA 5FPNA 1TVRA 1X3MA 3UIQA 4FJ5A 3AA2A 1A5VA 4CJ4A 2YJFA 3SCXA 3SJJA 4BC3A 4FJNA 2P1JA 2DTUA 2Z1JA 3LPTA 3WXMB 4ID5A 3D2EA 3I55N 3ASMA 1RDWX 3L3UA 3AVLA 4DSKA 3G25A 1IBKK 3P38A 3ZSXA 2P9IA 1GLFO 2KZMA 3OW2M 3VGMA 1IKVA 1HPMA 1LW0A 1A5XA 1M90O 4B9NA 3DOLA 1TKDA 5AQHA 4FLTA 3F2KA 1CZBA 4KO0A 4NYFA 3QFPA 4GY2B 4ICLA 1RTIA 3DXKB 2Y1JA 1D9FA 2D5RA 2P9LB 4Z4FA 5TKYA 2Q3SA 2QA4N 4YOUA 3EZ5A 4WFAL 4FK2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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