4M7XA

Staphylococcus aureus type ii pantothenate kinase in complex with a pantothenate analog
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEKHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery of Potent Pantothenamide Inhibitors of Staphylococcus aureus Pantothenate Kinase through a Minimal SAR Study: Inhibition Is Due to Trapping of the Product.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Type II pantothenate kinase
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
total genus 98
structure length 273
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4m7xA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4m7xA01
5E84A 4DB3A 2P9UA 4LC9B 5BRFA 3MK6A 3U9ZA 1NLVA 2ASPA 2V7YA 4CZKA 4HWIA 4A62A 5BREA 2HMPA 4K42A 1RDWX 2YHYA 2GEMA 3ENOA 3VETA 2YCHA 1ATRA 2E2NA 2QXLA 3IMXA 4H0YB 5AQFA 3WEEA 4BR5A 2V51B 5KPTA 5BPMA 3FZKA 2P9SA 4H5TA 1IJJA 2YHXA 3CI5A 1KAXA 1QHAA 2VCPA 2W41A 4FWPA 5EVZA 2IVOA 1P8ZA 3FLCO 4Y0WA 3O1WA 3QFPA 3VF4A 1NGJA 1QZ6A 2P9PA 3AARA 3GE1A 5BRHA 3ULEB 1RFQA 2P9KA 2UYTA 4JN4A 4E1JA 1X3MA 1YAGA 3O80A 1BG3A 3M1FA 4BVPA 1YVNA 3D7EO 1NGAA 1S22A 2QWQA 5KPZA 3U8XA 3TU5A 2Q31A 2Q36A 4B1XB 5AQZA 1KAZA 4H0OA 4CJ7A 3D2EA 4H5RA 3AY9A 3L6QA 4YDUA 1MWMA 3CJAA 4JD2B 4BRDA 4FWOA 2ZWHA 4NO7A 3WXLA 4H5WA 2DPNA 3CJ1A 1RGIA 2E1ZA 3O08A 3FZFA 5FPMA 3KVGA 3H1QA 4DCHA 5EXWA 3C7NA 2E2QA 3VGKA 3WXJA 3QMLA 4FWRA 3VGLA 3ZX2A 1HLUA 4BRIA 2NLXA 5AQXA 3SMPA 5LJVA 1D4XA 3ID8A 2AP1A 2Q1NA 2IIRA 2CGLA 1NGHA 1V4TA 1U6ZA 4F9OA 1HKCA 1G99A 2W40A 4H0PA 4ISFA 4K25A 3ZEUB 4BROA 2H3GX 1BA0A 1TYQA 3L4IA 4FPBA 4MO4A 5FPEA 3A5OC 3A8YA 5AQPA 3FZHA 4H0XB 4QS8A 4EHUA 3IUCA 5AQRA 3HBTA 1BDGA 1YXQA 4PKHA 1JCFA 3CQYA 5AQTA 2P9NB 3KZBA 3BF3A 3H3NO 3HTVA 4Z94A 3LDOA 5F0XA 4PL7A 2HOEA 3O4WA 3QDKA 1TUUA 4GY2B 2P9LB 5AQSA 4BGBA 4BRPA 1NWKA 3WQUA 3VOVA 3WT0A 1E4GT 2IVPA 3VEWA 4B1YB 4B1VA 1JCGA 3EN9A 4BRHA 4H03B 3OHRA 3DXKA 4C23A 3D2FA 3W3DA 3EZWA 2P9IB 3J8AA 3JS6A 3DXMB 3I33A 2I7PA 3M3ZA 2A42A 4XH4A 3LL3A 3I8BA 3O6WA 4WQ4C 2E8AA 2QWMA 5LY3A 1BWFO 1DKGD 2QWRA 3VERA 2QWPA 3L0QA 4ISEA 3IFRA 2Q0UA 4CD1A 5CE3A 2CH5A 2GWKA 3UKRA 1WUAA 2F9TA 4JHDB 3C0BA 4CBXA 2A6AA 3RSEB 4BRMA 1ESVA 4BRLA 1NGEA 3LDQA 3UKUA 5AQWA 5BPLA 1GLAG 3GBTA 3CJ9A 4BC2A 3CERA 3S41A 1C0FA 4BG8A 4PKIA 5BN8A 3SK3A 3AAQA 3QBWA 1Q18A 4FWSA 1NGBA 3GL1A 1HKBA 5JLFA 3CHWA 5AZJA 3F9MA 1NGIA 2AA4A 3WQTA 4I6MA 2Q0RA 4HTLA 2CGKA 4WQ5A 4CBUA 1T6DA 1WOQA 3EKSA 2EWSA 2E88A 1K8KB 3FR0A 4WYBA 1KAYA 4FWNA 3VEVA 1T6CA 1BA1A 4FWQA 2D0OA 1ZC6A 5AZIB 3UB5A 4FOEA 2WUSA 3CETA 5AQGA 2BUPA 5EX5A 2FSJA 2FLOA 1CZAN 1BU6O 1R59O 3MN9A 4DHYA 4AM6A 5F2RA 1DEJA 4XEIA 3VEOA 4EFHA 1U2VA 5I9EB 2HF3A 4BR0A 2A40A 2QM1A 5BPNA 5FPNA 2F9WA 5ADXA 4XH1A 4BC4A 1QQMA 1MDUB 3WXKA 2FF3B 4BR7A 3VPZA 4EAHD 1Y64A 4M7YA 4B1ZA 2GUPA 1GLFO 1YUWA 2YHWA 5AQIA 4CI6A 4CBWA 1C0GA 5AQMA 4RTFD 3CQXA 2P9UB 4H5NA 1JCEA 5AQOA 3RSEA 2FSKA 1ZBSA 3A5NC 5AR0A 2Q2RA 3SMSA 4JAXA 3WUHA 3SJHA 3DJCA 2FXUA 4BRCA 3AAPA 5AQLA 3MDQA 4IWVA 1GLEG 3G25A 4MO5A 4CZIA 4BREA 1SZ2A 3WEEB 1KXPA 3O8MA 2E2OA 1LCUA 2P9SB 4IO8A 2J4RA 1NGFA 1NMDA 3VENA 5KPRA 3CJCA 3MCPA 4BRGA 5TKYA 3MN7A 3ULEA 3VGMA 5E26A 2QWNA 2ZGZA 3H6EA 5AQJA 3O5BA 3FZLA 5ADXH 3DAWA 2P9PB 3BEXA 2P9KB 2A5XA 3SLCA 3ATVA 4PL8A 4RCHA 3LM9A 5AFUA 3UE5A 5AQQA 4BRKA 2FF6A 2OANA 4BRAA 4A2AA 4MLHA 1DGKN 3CJ7A 4JD2A 3KHYA 4FOIA 5AQHA 1TUYA 3A5LC 3D2EB 1Z6RA 3MMVA 4JNEA 3P4IA 3MN6A 2YJFA 3FGUA 4BGAA 3HM8A 2QWLA 4NB4A 2GELA 5ELZA 2NRHA 1S3XA 2GWJA 3VEYA 2BTFA 4BVOA 1HKGA 3C7NB 5AQKA 2IVNA 3GDQA 4AM7A 1NGCA 4FSVA 4FWKA 5KQDA 1XQSC 3U4LA 2A3ZA 3FZMA 4ISGA 3ZEUA 3LDNA 3A0IX 1H1VA 2QW9A 1GLDG 4FWMA 3EO3A 2D1KA 1X3NA 4M7XA 4BC3A 1ATSA 4BR4A 5F1XA 5AFUH 4WQ4A 4K43A 1J6ZA 2D0PA 1TYQB 2VWBA 3GOIA 4YDUC 2P9NA 3HI0A 1ATNA 2KHOA 1SQKA 2ITMA 4CZFA 1BO5O 1ZXOA 4J8FA 2FSNA 3M6GA 2QWOA 2P9LA 4BRQA 5LJWA 3BP8A 1SAZA 5BRDA 5B8HA 4CD3A 4BRFA 3HZ6A 3LDLA 2PBDA 4CZLA 2CH6A 4O5FA 4CZHA 3ZETB 4PKGA 3TPQA 3ZX0A 4BC5A 2A41A 2P9IA 1GLCG 2ASMA 3DXMA 1XUPO 4B9QA 1IG8A 4H5VA 3FE1A 5JMVA 3LDPA 1QQNA 3BUZB 2VYPA 3B8AX 4O8KA 1GLJO 4IJNA 3DXKB 4B1WB 4QS7A 1XC3A 3EL2A 1NGDA 5AQYA 3D2FB 5EOYA 3A5MC 3VF2A 4RWTA 4CZJA 5KQ8A 3HSCA 2ZGYA 4H0TB 1GLBG 3H46O 4MLEA 1HX1A 3CJBA 4FWLA 1HUXA 4BQLA 4JHDA 4BRNA 3H45C 5AQNA 4BR9A 3QICA 4CZMA 3UKRB 2CGJA 2E1YA 3U9DA 2NZTA 4L3QA 5FPDA 1GLLO 1LOTB 4M63C 4DQ8A 2I7NA 1BOTO 3R6MA 3IDHA 3LM2A 4KBOA 2YI1A 3W0LA 1MWKA 1X9JA 5BN9A 3UKUB 4IXCA 3H1VX 3QBXA 2D4WA 3MN5A 3EKUA 1E4FT 4FO0A 1HPMA 3WXIA 5JICA 3BF1A 4QS9A 2V7ZA 4FL9A 1OKJA 3DWLA 4H0VB 5AZJB 1K8KA 2GTDA 2Q97A 1HJOA 4IZ9A 4I6MB 1NBWA 3QB0A 4EIAA 1MA9B 5BR9A 1V4SA 5AZIA 4K41A 3VEXA 4IJAA 3VF6A 3FFKB 3CIPA 4CZGA 3H3OB 4A2BA 2E2PA 3R8EA 3O1BA 3VESA 2HF4A 5AQVA 4BQZA 3ENHA 1QQOA 1T44A 4CZEA 2V52B 2YJEA 3ZETA 4BG9A 1Z05A 3JXUA 1NM1A 3R9PA 3VEZA 3ZX3A 1EQYA 5EY4A 5JLHA 4XH5A 1NGGA 2E20A 4EHTA 4B1UB 1BUPA 1U2VB 2PAVA 3ATUA 1QZ5A 4GNIA 5AQUA 2ASOA 4A61A 4FPAA 2ZF5O 4BR2A 4WQ5C 3QFUA 3GG4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RMBA 4ID1A 3OS0A 3N4PA 4DTJA 4YFUA 1VSHA 4M45A 3AA5X 4B9SA 4YOXA 1QSSA 1Q86O 3M8QA 1QVFM 5BREA 2HMPA 4K42A 1RDWX 4ILJA 3OYLA 4CFBA 3IMXA 4OPAA 4BR5A 1L3VA 3I8DA 5M1PA 2V51B 5KPTA 3PV8A 3CCRN 1HNIA 4NYFA 2P9SA 4H5TA 5GAGP 2KZMA 2ZE2A 5EVZA 2RN2A 5AJ3K 4KB1A 4GV3A 1N5YA 4BE1A 3NH0A 1E3MA 2KKZA 3DLHA 2HHUA 4E1JA 2FBTA 3O80A 1BG3A 2P5GA 4BVPA 3KWGA 4N56A 3HM9A 1NGAA 3LDSA 3TU5A 3TANA 4B1XB 2E6MA 4M41A 4HCBA 1S9EA 4H0OA 3NDKA 3D2EA 4LSNA 4H5RA 3T3FA 3AY9A 3L2RA 4I2PA 1MWMA 4JD2B 1C1BA 1NKBA 3SUPA 4BRDA 2NRTA 4NO7A 1ASWA 2VGMA 4Q0BA 1X9WA 2DPNA 1VQ6N 3VA3A 1RGIA 2E1ZA 3VQ9A 4JRQA 3CCEN 3RWUA 4KTZA 5EXWA 4CK2A 2E2QA 3AVGA 5CHIA 4OJRA 4KAZA 4DTSA 4FWRA 4OLAA 5AQXA 3AO3A 4EP4A 3HP6A 2Q1NA 4E1MA 2CGLA 1NGHA 1BL3A 1HKCA 3KKRA 1ASUA 5I42A 3IG1A 1Q9XA 2O8EA 1RDDA 5C0YA 3SUOA 3ZSVA 3V1OA 1YTUA 1JCFA 3CQYA 3AO1A 1S1UA 3H3NO 3AVLA 3G10A 4PL7A 4B9NA 3QDKA 4GY2B 4CJVA 4C8MA 3VMFB 4DSLA 4BGBA 2KFZA 4GVMA 4CIEA 3VOVA 2IVPA 4DFJA 3VEWA 1OVYA 2IDOA 3EN9A 4BRHA 1SUQA 2D5RA 2HHXA 1BI4B 4W5RA 4JS4A 3AVMA 3THWB 3QEXA 4WQ4C 5KI6A 4NXNK 2E8AA 4DF8A 3LZJA 1BWFO 1G15A 4CF9A 3K9KA 4DTOA 1Z25A 2OYQA 4WE1A 3IFRA 2Q0UA 4CJTA 2CH5A 3UKRA 4UY8O 3WNHA 1ZBHA 4CGGA 3OYBA 4DLGA 3C0BA 4CBXA 3L2VA 4DS4A 2A6AA 3KK3A 1VQ4N 4OGEA 4BRLA 4JYAK 2EHGA 4K8XA 4BC2A 4FYDA 5BN8A 2YNIA 1RT6A 1HKBA 4IDHA 4M3XA 2VG7A 5AZJA 1SKWA 3F9MA 1NGIA 3WQTA 1HQEA 4U7BA 4HTLA 2X78A 3EKSA 1TL3A 4KREA 1YF5L 5J2MA 1YITN 1EETA 5EU7A 4LFAK 2VQEK 4FWNA 5GIOA 4FWQA 1RILA 4CJFA 2QA4N 1ZC6A 4DV4K 3LP2A 1A5VA 5AZIB 4FVUA 1VHXA 4Z4CA 4H4MA 5AQGA 5JS1A 2A1RA 3SV4A 2FSJA 1CZAN 4I2QA 1BU6O 5HL7L 4KHUA 2HF3A 4B3MK 3SUNA 1TKZA 3V9ZA 2A40A 5FPNA 3NMUA 2F9WA 4Z4EA 2HW3A 3K9JA 4W5NA 2FF3B 4KI6A 4RW4A 1U48A 2QKBA 1M90O 4CBWA 4AHCA 4C8LA 3AVFA 1C0GA 5HRNA 3CQXA 1ASVA 3RSEA 2FSKA 3SI6A 3A5NC 5AR0A 4C8KA 3SMSA 4JAXA 3HO1A 2FXUA 3I0SA 1W9HA 4BDZA 3DYAA 2ITGA 1HNWK 2HNYA 4YY3K 4HVJA 2ZM6K 3LWMA 1SZ2A 4CJUA 4KV8A 3WEEB 3SQ2A 3BDPA 3EE9A 3L2QA 1NOYA 1LCUA 3JAMO 4IO8A 4O5BA 1NGFA 3VENA 5C12A 5HOOA 4BRGA 3CC4N 3LP3A 3VGMA 5E26A 2QWNA 2ZGZA 1RTJA 3H6EA 4FJGA 5IWAK 3NAEA 2O8FB 2YNFA 1Q9YA 3BEXA 3ATVA 4OPKA 4DV0K 3I56N 3UE5A 5AQQA 4DR6K 3KD5E 4BRAA 2UUCK 2B4JA 2JGUA 4KHSA 4MLHA 4JD2A 4CJLA 1TAUA 3KHYA 3O9UA 4PA1A 1JLBA 3L3UA 4DWIA 2YJFA 2YNGA 1RDBA 3PUFA 3FGUA 3HYFA 5C10A 2G8WA 4PQUA 4DUYK 3TAQA 1S3XA 3VEYA 3D6RA 4BVOA 1Q82O 3F9KA 4EZ9A 4NYNA 1NGCA 4FSVA 2WONA 4KKOA 2VWKA 3QO9A 4WFBL 3EEQA 3HP9A 1S1VA 3LDNA 4JI1K 4KHPK 2QK9A 5LMUK 2D1KA 4BC3A 1ATSA 5AFUH 1HMVA 4K43A 3GOIA 4JKAA 1JL2A 2KHOA 1SQKA 2ITMA 1VAZA 4IDKA 3C65A 1VSDA 1NJZA 3BP8A 2OTJN 1SAZA 1S1WA 3DOKA 3O3FA 1WN7A 2A1SA 3SAHA 4V19S 3PLAA 4MDBA 3SBTA 1D9DA 4B9MA 4PKGA 3TPQA 3ZX0A 4PY5A 1BI4A 3D45A 3THWA 1RTDA 4B9QA 1JXBA 2OPQA 3LDPA 1QQNA 2VYPA 3G6EN 3DXKB 5AQYA 4FM0A 1IKVA 4RWTA 1T3VA 5KQ8A 3DLRA 5JS2A 3HSCA 3ZT4A 3K5OA 3OJUA 1HUXA 1S9GA 2E1YA 2IS3A 3UIQA 4M63C 1IG9A 3CC7N 3CYMA 2I7NA 1BOTO 5JVHL 4RW9A 2Z1IA 4IKFA 3SAFA 1TKTA 3CCQN 4CEZA 3EKUA 1BHLA 3B6PA 5JICA 3BF1A 1VQ9N 3F73A 1WSFA 4FL9A 1EP4A 4H0VB 3O9SA 4O8UA 4CF8A 4DTPA 3V9SA 4IZ9A 2D0BA 3OBYA 3QB0A 1MA9B 2ATQA 5AZIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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