4M7XA

Staphylococcus aureus type ii pantothenate kinase in complex with a pantothenate analog
Total Genus 98

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEKHHHHHH

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH2 (53-60)S1 (2-7)S2 (11-17)TIV1 (8-11)TIV3 (97-100)TIV2 (18-21)AH3 (70-85)S3 (22-28)EMPTYS5 (65-67)S8 (111-117)TII3 (251-254)3H3 (225-227)S6 (92-97)S7 (101-106)TIV5 (106-109)TIV6 (107-110)AH4 (121-132)AH7 (189-215)AH5 (137-145)AH8 (231-244)TI1 (149-152)TIV7 (150-153)TII1 (174-177)AH6 (156-160)S9 (154-155)TI2 (168-171)TVIII1 (165-168)S10 (172-174)TVIII2 (172-175)3H2 (179-181)TI3 (176-179)TI4 (182-185)S12 (247-250)S11 (219-223)3H1 (29-31)AH1 (32-41)AH9 (257-269)S4 (47-50)TII2 (227-230)3H4 (254-256)TII'1 (160-163)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
publication title Discovery of Potent Pantothenamide Inhibitors of Staphylococcus aureus Pantothenate Kinase through a Minimal SAR Study: Inhibition Is Due to Trapping of the Product.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Type II pantothenate kinase
total genus 98
structure length 273
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4m7xA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4m7xA01
4J8FA 5BPNA 2FF3B 5F2RA 4CZMA 3LDNA 3FLCO 4XH4A 3ZX2A 5JMVA 2Q0UA 2Q31A 3LL3A 4FWKA 1WOQA 2QWOA 3QFUA 3ZEUB 2GWJA 4BRLA 2GEMA 3A8YA 4B1ZA 4CZIA 3VF2A 5AQOA 1NGFA 4K43A 1QQMA 5AFUH 1RGIA 1SZ2A 4BVOA 5BRFA 3WXKA 3U9ZA 2IIRA 3A5OC 4JAXA 3CERA 5EOYA 3CETA 3QBWA 4K25A 3FFKB 4LC9B 4FOIA 3SK3A 3SJHA 2HOEA 2QWRA 3H1QA 3ENOA 4MLHA 4IO8A 5AQQA 1XUPO 2FF6A 1NWKA 4CZJA 4B1XB 2NZTA 3CJAA 2QWPA 3W3DA 1BA0A 2QWLA 3ZETA 4BROA 4JNEA 2V51B 2YCHA 5AQYA 4AM6A 4NO7A 2A5XA 2PBDA 5ADXA 5FPDA 3O6WA 3A5LC 3D2EB 3FR0A 3VGKA 3AARA 3KHYA 3FZLA 4H0TB 3WEEA 3VEXA 2A40A 3L0QA 3VERA 3M3ZA 2P9PB 4FOEA 4FWOA 3F9MA 3MN6A 3DXMB 5E26A 2YHYA 5AQKA 3WXLA 4BR0A 3M6GA 4EIAA 3VEOA 4WQ5A 3U8XA 3LM2A 1BG3A 2VWBA 2I7PA 5AQFA 3VENA 4I6MB 4BRIA 4IJAA 5BRDA 1TUUA 3C0BA 3VETA 5F0XA 4A61A 2P9UA 4JD2B 3UKRB 1GLEG 3O4WA 5ADXH 3QB0A 4BGAA 2V7ZA 1ZBSA 4BRDA 3P4IA 1U2VA 2QWNA 1V4SA 2V7YA 5E84A 1MWMA 4BG9A 1GLFO 3ZX0A 5TKYA 2AA4A 4CI6A 3MDQA 3MMVA 2ZGZA 2FSKA 5AQLA 1BUPA 4Y0WA 2YI1A 1BO5O 3IMXA 4EFHA 1YXQA 1Q18A 3DXKB 4H5TA 3SMPA 4CD1A 1KAZA 2QXLA 1NGEA 3L6QA 2Q36A 2YHXA 5BPMA 1G99A 2E2PA 2QWQA 3KVGA 3IFRA 3CQXA 3CIPA 2E2QA 3LDQA 2QWMA 4MLEA 1ATSA 4ISEA 1LOTB 3CI5A 3A5MC 3UKUA 4B9QA 5AFUA 4FWSA 3MCPA 2QW9A 1QZ5A 4BRMA 5AQNA 1BDGA 3H3NO 2CH5A 1KAXA 1NLVA 4F9OA 2F9TA 3AAQA 3VEWA 2Q2RA 3R6MA 1S22A 3GDQA 2E2NA 4BR2A 1H1VA 3O5BA 5AQJA 2IVOA 4PL7A 3WXJA 1XQSC 4RWTA 3HTVA 1YUWA 3UKUB 2FLOA 3BEXA 4BC3A 4BRQA 2P9IA 4BC2A 3I8BA 3AAPA 2V52B 4PL8A 1X3MA 4RCHA 1D4XA 1DKGD 1NGGA 2P9KA 2EWSA 2OANA 2DPNA 4IZ9A 1ATRA 4BQLA 5AZJA 3ATVA 3G25A 1V4TA 4H0OA 4AM7A 3BUZB 5AZIA 4B1VA 1BU6O 1GLAG 1Z05A 2HMPA 4FO0A 3H1VX 4M63C 3D2FA 4BR7A 5EY4A 3FZKA 3H3OB 3ATUA 4YDUA 1KXPA 1C0FA 2Q0RA 3A0IX 4IXCA 4IWVA 4CBUA 2P9SA 4EAHD 4WQ5C 3BP8A 1HPMA 2HF3A 4B1UB 3HBTA 2FSJA 1S3XA 5AZIB 3VEZA 3HM8A 4M7YA 5FPMA 1J6ZA 2ASPA 1ZXOA 5AQMA 2WUSA 3C7NA 2I7NA 2Q1NA 2NLXA 3FE1A 4BRFA 4CD3A 3VF4A 4BRAA 1LCUA 1SAZA 2P9SB 3CJ9A 2YJEA 3IUCA 4BRNA 3GL1A 1RDWX 3ZETB 4H0PA 2PAVA 1HJOA 1T6CA 2D1KA 3W0LA 3LM9A 2E1YA 3KZBA 4JN4A 4BQZA 2ASOA 5AQUA 3C7NB 4JHDA 3IDHA 2A3ZA 5AQZA 1QQNA 4PKHA 4BVPA 3WEEB 4CZEA 4EHUA 2P9NA 3JXUA 3RSEA 2GUPA 3AY9A 2D4WA 4K42A 3WQTA 2E1ZA 4DHYA 4FSVA 1CZAN 3J8AA 4ISFA 3ENHA 2P9UB 4ISGA 5BRHA 2A42A 4B1WB 4CBWA 2W41A 4A62A 3DWLA 4BRPA 1RFQA 1U2VB 1NGAA 1NGHA 1IJJA 1SQKA 1IG8A 3QBXA 2GELA 1MWKA 1HX1A 3O80A 4KBOA 4Z94A 1ZC6A 5AQPA 4CBXA 3TPQA 1OKJA 2AP1A 3ID8A 4CZGA 3S41A 3WXIA 4A2BA 4FWMA 3QMLA 2J4RA 4BR4A 3O08A 4PKGA 2E20A 4BC4A 2IVPA 3A5NC 1C0GA 3L4IA 5B8HA 2KHOA 3LDPA 4FPBA 4XEIA 3R8EA 3VEVA 4BGBA 5JICA 4QS7A 4BRHA 4C23A 4RTFD 4GNIA 1P8ZA 4FWPA 1NBWA 3LDOA 4CZLA 1HLUA 4FWNA 3EL2A 1BOTO 4H0YB 4A2AA 3HI0A 4YDUC 4MO5A 4QS8A 3SLCA 3MN7A 3BF1A 2P9LA 2F9WA 3B8AX 3WUHA 1GLJO 4H03B 3DAWA 3QICA 4WYBA 1E4FT 4BC5A 3SMSA 1JCFA 4PKIA 3VF6A 2BTFA 1QZ6A 2GTDA 4BG8A 1NMDA 1BA1A 2BUPA 3R9PA 4WQ4A 3VOVA 4B1YB 1HKGA 3EO3A 3O1WA 3MN5A 1MA9B 3HSCA 5AQIA 3ZX3A 5CE3A 5I9EB 1E4GT 3GOIA 3LDLA 2P9IB 5KQDA 2P9LB 4NB4A 4BR9A 1QHAA 3O1BA 1Y64A 1NM1A 2E88A 4BRKA 2P9KB 4CZKA 1T6DA 1Z6RA 3UE5A 5AZJB 1TUYA 4CJ7A 5F1XA 4H0XB 3VESA 3QDKA 3FZHA 4H0VB 2ITMA 2GWKA 4H5NA 5BPLA 4DCHA 1DEJA 5AQRA 5EVZA 2CGJA 4GY2B 3D2FB 3EKUA 1XC3A 2VYPA 3D2EA 3CJ7A 2CH6A 4L3QA 3FGUA 1GLBG 3CHWA 4FWRA 3BF3A 5FPNA 3VEYA 1EQYA 5JLHA 2VCPA 3O8MA 2P9PA 3TU5A 3U9DA 2HF4A 1R59O 3DXMA 2CGKA 3H6EA 3HZ6A 3I33A 3UB5A 3M1FA 1GLDG 1JCEA 4K41A 5KPZA 5LJVA 4I6MA 1X3NA 4M7XA 1NGCA 5LY3A 1YAGA 5AR0A 3MK6A 4JD2A 4XH5A 3UKRA 1ATNA 1U6ZA 3GE1A 2FSNA 5JLFA 3CJBA 1NGIA 2QM1A 4QS9A 1K8KA 1DGKN 3GG4A 2E8AA 1WUAA 1QQOA 1ESVA 4DQ8A 2YJFA 5BN8A 4HTLA 2W40A 5EX5A 3VPZA 3CQYA 1HKBA 3DXKA 4FWLA 1JCGA 1NGDA 4H5RA 5AQGA 1GLCG 4E1JA 2D0PA 4H5VA 4BRGA 1NGJA 1X9JA 4FL9A 4JHDB 2H3GX 3WT0A 2NRHA 5ELZA 1HUXA 4FPAA 3EKSA 4FWQA 3H46O 4BRCA 5AQWA 5LJWA 1K8KB 2D0OA 4BR5A 3ULEA 3D7EO 1T44A 5BR9A 2P9NB 3RSEB 2ASMA 2A41A 1BWFO 5AQTA 5BN9A 1TYQA 3WQUA 4CZHA 3U4LA 5KPRA 3MN9A 3EZWA 1YVNA 4EHTA 3EN9A 3JS6A 3CJ1A 4IJNA 5KPTA 5AQXA 2CGLA 5AQVA 3CJCA 4HWIA 3FZFA 3OHRA 2ZGYA 4WQ4C 5AQSA 4BREA 1NGBA 4DB3A 5KQ8A 2A6AA 4O5FA 2ZWHA 3ULEB 5AQHA 4O8KA 4CZFA 1MDUB 3GBTA 5FPEA 3FZMA 2Q97A 1GLLO 2UYTA 2ZF5O 4XH1A 3VGLA 2FXUA 2IVNA 3QFPA 1TYQB 3DJCA 3ZEUA 3VGMA 3H45C 1HKCA 2E2OA 1KAYA 5BREA 2YHWA 4H5WA 4MO4A 5EXWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RT7A 4YFUA 3CCJN 2FF3B 3KLEA 4B3RK 3SBGA 4KREA 3DYAA 4KH5A 2QWOA 3IS9A 3QFUA 4H4OA 1L3SA 3CFOA 4BRLA 4KFBA 4DU4A 4DV4K 3EE9A 4M41A 1Z26A 3CM6A 3A8YA 3AVIA 5EU7A 4DSKA 3VF2A 5AQOA 4DR3K 3LAKA 1RGIA 4IO9L 1VQKN 4BVOA 4DWIA 2Z1GA 5GAHP 2IIRA 4DTNA 4B9SA 4MDBA 5EOYA 4K25A 1ZBHA 3C6HA 4AHSA 4FOIA 3SK3A 3OYAA 3OYKA 1JLBA 3VTIA 2EHGA 5JS1A 2ZJQL 3SPYA 4W5NA 3LP0A 4IO8A 1NWKA 1JXBA 1Q7YO 3CJAA 2QWPA 2HNDA 1OH6A 4BROA 4DMNA 3BZCA 4DR7K 3DI6A 2YX6A 1EP4A 2A5XA 2KLAA 5FPDA 3ZT2A 3JSMA 1NKEA 3QEXA 2HHTA 1VQLN 4GV9A 3NH0A 3FR0A 3AARA 2HBJA 2QEXN 3J7AP 4H0TB 1XC9A 3THYB 4E7LA 3VEXA 4DFMA 4CJEA 4CHQA 1QSLA 3F9MA 5AQKA 4BR0A 3M6GA 2VWBA 2G8IA 4I6MB 4BRIA 3VETA 1KTQA 1HNVA 1RT4A 3J81O 2V7ZA 3HOTA 1Q81O 2QWNA 2V7YA 1MWMA 4BG9A 1L5UA 1VQNN 3ZX0A 5KTQA 3NMUA 3MDQA 1IKVA 1K8AO 1BUPA 3TSUA 2YI1A 1YXQA 3SMPA 4HUFA 1HYZA 3AO3A 2QWQA 1XMOK 3IFRA 3TARA 1T05A 3HVRA 2E2QA 1NG9A 1IV0A 1TAQA 4MLEA 4ISEA 4R79A 2IOCA 4B9QA 3LWMA 5AFUA 4K8XA 1ITGA 3PIOL 3PSIA 4BRMA 5AQNA 3THWA 2CH5A 2FBXA 1YTAA 3OBYA 3AAQA 3VEWA 2Q2RA 4OLBA 1TKTA 2BE2A 1TK0A 4E89A 3OS1A 4LD0A 3L2WA 1H1VA 4JK8A 1RTDA 5AQJA 2IVOA 1QSYA 3UKUB 1RCHA 4IOXA 4XIUA 1RT6A 1GOAA 3SUOA 5J2MA 4Z4GA 2O8BA 2GBZA 5HRRA 1EO1A 4FXDA 1FXXA 1TGOA 1YHQN 2P9KA 1I39A 2EWSA 2NNWA 2OANA 3CCUN 4Z4HA 4FJ9A 4B9LA 3MX2A 2D0BA 4DG1A 1Z05A 3PX4A 1XMQK 3FZKA 2PFUA 5C10A 4IWVA 3OY9A 4WQ5C 2KZMA 3QIOA 1HYVA 4C8LA 3KK1A 1ZBUA 5CY4A 4JKBA 4CF2A 5FPMA 4JKAA 1BIUA 3VQAA 2WUSA 1HNWK 4BRFA 3VF4A 2P9SB 4OPAA 4CJKA 2HB5A 1WSEA 4WE1A 4BRNA 5C0YA 3GL1A 4CEZA 3OYJA 1N33K 3TANA 4DSIA 1HJOA 2D1KA 4CHNA 1C1BA 2FBTA 2ASOA 5MLCQ 3OYLA 4LF4K 1L3TA 4JHDA 1XHXA 3IDHA 3CMAN 4FM1A 2A3ZA 2D0CA 1QQNA 3AO2A 1RDAA 4FJ5A 4CZEA 4EHUA 2P9NA 4I2QA 3S3MA 3DLLL 1NOZA 3VQ9A 1FK9A 1ASUA 5FRMA 1WBBA 3MAQA 4IOAL 4IFVA 3VQ6A 2AJQA 3AVCA 4M3TA 1RDDA 3J8AA 4CEAA 5BRHA 4O0IA 4ZHRA 4GMJB 4PHTX 4RW7A 1KQSM 4Z4IA 3TSQA 1RFQA 3PO5A 3SYZA 4CF1A 2G8VA 1N34K 4OJRA 4AHCA 1IG8A 3OW2M 4B3OA 1HX1A 3O80A 4KBOA 4A59A 4Z94A 4CBXA 1IBMK 4QOZB 3CQ8A 2YHAA 3E66A 4B9TA 4FWMA 4OLAA 2J4RA 2HSTA 4PKGA 4DTPA 3V81A 5M1NA 4JKCA 1S5JA 4KTWA 3L4IA 4XEIA 4N41A 4JKDA 1W7AA 4GNIA 4FWPA 1WBDA 4KTQA 1WSHA 4DTMA 1HLUA 4PUOA 4A2AA 4MO5A 3SLCA 4FJMA 2OCEA 4CF9A 2P9LA 3WUHA 1ASVA 1GLJO 4H03B 3QICA 3THWB 2HHSA 4BC5A 3SMSA 3WNFA 1ILYA 2X6SA 1NMDA 3SV4A 3VOVA 2VGNA 4X64K 1Y97A 2XY8A 1VSLA 2O8DA 3R3LA 3MN5A 1KFDA 5M1QA 3CF5L 2XO7A 5CE3A 5I9EB 2RE2A 4DTRA 3LDLA 3CFPA 1JLQA 2RF2A 3G6EN 3V1QA 1OH8A 2P51A 3P83D 2O8BB 3O1BA 4FK2A 1NM1A 2P9KB 4CZKA 1CZ9A 1NOYA 2KQ2A 3QDKA 4H0VB 4Q0BA 4H5NA 5BPLA 4FVMA 4ICLA 4DFKA 4FJNA 2CH6A 4L3QA 4B8CA 1GLBG 1J5EK 4FWRA 2G8UA 1LW0A 3VEYA 1K73O 3P38A 3HPHA 2OTLN 1JLAA 2O8CA 3MX5A 5LL6Z 4CE9A 3SQ2A 3HZ6A 4YOUA 4DTOA 1GLDG 4K41A 1TAUA 3NH2A 4M7XA 1YAGA 2HHXA 5AR0A 3MK6A 3OYHA 1ATNA 2FSNA 5HRNA 3CJBA 5JLFA 4YOWA 2QM1A 1K8KA 1RILA 4CVNE 2OYQA 1OH5A 4X65K 2W40A 5DM7L 1ZBFA 3TABA 3FFIA 4PA1A 1HJRA 5LMNK 4EZ9A 4FWLA 1VSJA 3N4QA 1SL0A 4H5VA 4JHDB 5ELZA 4FJHA 2OPSA 4G9ZA 5AQWA 1WAJA 5LJWA 1LAWA 5C12A 2P9NB 3THXA 1VQ4N 2A41A 3OYCA 5JVGL 5BN9A 3N4PA 2NRTA 5CYQA 4EHTA 1NJIO 3JS6A 4IJNA 2CGLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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