4M7XA

Staphylococcus aureus type ii pantothenate kinase in complex with a pantothenate analog
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEKHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
publication title Discovery of Potent Pantothenamide Inhibitors of Staphylococcus aureus Pantothenate Kinase through a Minimal SAR Study: Inhibition Is Due to Trapping of the Product.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Type II pantothenate kinase
total genus 98
structure length 273
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4m7xA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4m7xA01
3G25A 3IDHA 2Q31A 3BF1A 3KHYA 4H5WA 3LM2A 1Q18A 1QHAA 3WUHA 2E88A 4AM6A 3QB0A 4XEIA 3IUCA 4CZEA 4K43A 4A62A 3VESA 1YUWA 3HM8A 4CBUA 3J8AA 3AAQA 1BA0A 5KPRA 1TYQB 2QXLA 1QQMA 1BU6O 4ISFA 5AZIA 3WXJA 3DAWA 1E4FT 1HPMA 5JMVA 3FFKB 5AQWA 5AQIA 3FZHA 4EFHA 2EWSA 3A0IX 3B8AX 4FL9A 4LC9B 4M7XA 1QQNA 3W0LA 5B8HA 3CJ7A 1OKJA 3FE1A 4RCHA 1YVNA 2ASPA 4BR0A 5AZJB 5ELZA 5F1XA 1GLFO 4QS9A 5BREA 4CD3A 2CGKA 2IVNA 1BO5O 1IG8A 1HKBA 1YXQA 2QWQA 3LDPA 5AQMA 2P9PB 4IJNA 1JCEA 4BRHA 4BRGA 1ZC6A 3ZX0A 3DJCA 2P9UA 1HKGA 4JD2B 4PKHA 2QWPA 4EIAA 1KAYA 2D1KA 4H0VB 3H3NO 4CBXA 3U9ZA 4FWRA 4QS8A 2E20A 2P9SB 2QWOA 2BUPA 2CGLA 4MLHA 3WXKA 2P9IB 4H0XB 4BRPA 4HWIA 3O08A 2V7YA 3GG4A 4NB4A 3ZX3A 4BR7A 3WEEA 4CI6A 3MN5A 4FWNA 3EN9A 4BG8A 4CD1A 2FLOA 3QICA 4CZJA 1NGHA 3CJBA 3IFRA 4FWSA 2GEMA 4B1UB 3FZMA 1Z05A 5JLHA 3P4IA 4WQ4C 3UB5A 3ATUA 4CZFA 5FPNA 3MDQA 2D0OA 4BC5A 1KXPA 3U8XA 5EOYA 4H5VA 1GLLO 3LM9A 3QDKA 4CZMA 2UYTA 5AQZA 3AAPA 4Z94A 3EZWA 1MWKA 2E1ZA 3CERA 4FWOA 5EVZA 2V52B 4H5RA 1S3XA 1HUXA 1NGBA 4E1JA 1HLUA 1QZ5A 3WXIA 2A40A 4ISGA 3WQTA 3ULEB 2P9PA 5AQHA 3VEYA 1D4XA 1ZBSA 4BROA 3BEXA 2CH6A 5AFUH 2A41A 2Q97A 3CJCA 1S22A 3FR0A 1G99A 4XH1A 2I7NA 2OANA 1XC3A 4K25A 3D2EA 2VCPA 3UKUB 2P9SA 5FPDA 4K42A 3EL2A 3VERA 3LDNA 3QBWA 1GLDG 1ATNA 1LCUA 5AQQA 4A2BA 3GOIA 4FWMA 4BC4A 4BRIA 2YJFA 1E4GT 3IMXA 4GNIA 3M3ZA 2E2NA 4YDUA 2WUSA 1RFQA 3BP8A 3CJ1A 1BG3A 1Y64A 4WYBA 4CZGA 1ATSA 4H0PA 3MCPA 4BREA 5AQRA 4WQ5C 3C7NA 5AQTA 3CQYA 4J8FA 5BN8A 1SZ2A 1QQOA 1NGIA 1NBWA 5BRDA 3DWLA 3W3DA 1NGGA 2F9WA 1V4SA 4BRKA 4BRFA 1U2VB 4A61A 2ZGZA 2QWRA 1V4TA 4JHDB 5E26A 4H03B 1GLJO 1NGJA 1YAGA 1NGCA 4IO8A 1NGEA 4KBOA 3S41A 1T6CA 3R9PA 2V51B 3KZBA 4BRLA 3GDQA 4H5TA 5LY3A 3I33A 3ATVA 3M6GA 1HJOA 1BOTO 2NLXA 4H0YB 4B1YB 3HSCA 1BA1A 1K8KB 2VWBA 1CZAN 4FWLA 4BC3A 1ZXOA 2Q36A 3L6QA 4I6MB 5EXWA 3VGKA 3UKUA 5KPTA 1NGFA 2P9KB 5AQLA 4BQLA 3U4LA 4AM7A 4FOEA 4BC2A 4BGBA 1Z6RA 3M1FA 3FGUA 3EKSA 3MK6A 3VGLA 4O8KA 4CZHA 2D0PA 1XUPO 2IIRA 4FWQA 5AQJA 5FPEA 2YI1A 3UE5A 2AA4A 3CQXA 5KQDA 3DXKB 3ENHA 2E1YA 1T6DA 5FPMA 3TPQA 2P9NB 3CETA 3VEOA 1NMDA 1GLBG 1NLVA 1DEJA 2QWNA 2FSJA 2YJEA 4BRQA 5JLFA 2BTFA 3CJAA 3O1BA 2NZTA 2I7PA 3QMLA 2QWMA 1SAZA 4M63C 2GWJA 3RSEB 3A5MC 1TYQA 3GL1A 3LDLA 3A5LC 5F0XA 2W40A 4DCHA 3VEVA 3H45C 3GE1A 4EAHD 4BRCA 3VETA 4BVOA 4WQ4A 5AQVA 1NWKA 3EO3A 3MN6A 1TUYA 4MO4A 5AQFA 2P9LB 4BRDA 3VEXA 5AZJA 3EKUA 3VEZA 3CIPA 2J4RA 3H1VX 4DB3A 1KAZA 2A3ZA 3TU5A 5AFUA 3U9DA 4K41A 3MN9A 2A42A 4BR5A 5BPLA 4JD2A 1K8KA 3VF2A 3VGMA 2CGJA 4BGAA 4EHUA 1X3NA 4I6MA 3ZX2A 3O80A 2HOEA 2P9KA 1NM1A 1ESVA 3R6MA 1GLCG 2P9IA 2F9TA 1JCFA 3O6WA 2E2PA 3L4IA 4FWPA 4FPBA 3WQUA 1HX1A 1HKCA 3ZEUB 3O8MA 2YHYA 1U6ZA 3VOVA 1XQSC 1MDUB 4F9OA 5BPMA 2E2QA 1NGAA 3DXKA 4JAXA 2HF3A 5BRHA 4B9QA 5JICA 2P9NA 3O4WA 1KAXA 5AQNA 4BG9A 2ZGYA 3H1QA 3HZ6A 2FSNA 4MO5A 4XH5A 1DKGD 4NO7A 5AQGA 3MN7A 4GY2B 3VPZA 3QFUA 4RWTA 3H46O 3RSEA 2HMPA 3JS6A 2HF4A 1SQKA 3VF4A 4M7YA 2YCHA 5AQXA 3LDQA 4BRMA 2YHWA 2P9LA 4ISEA 4DQ8A 3JXUA 3SMSA 4PKGA 4BVPA 3ID8A 2GELA 4PL8A 5AQKA 3FZLA 4BQZA 1RDWX 4C23A 3ULEA 4HTLA 2QM1A 4PL7A 3DXMB 1C0FA 2W41A 4BR2A 1GLEG 4CZLA 3HI0A 1X9JA 5BR9A 5KQ8A 4FWKA 3H3OB 2E8AA 4CZKA 1WOQA 3L0QA 2GUPA 4O5FA 3WT0A 4IWVA 5E84A 3ZETB 5LJVA 3D2FB 3BUZB 4BR4A 4B1WB 2Q0RA 2IVPA 3ZEUA 2FSKA 3FZFA 2ASOA 5AQYA 1BDGA 2GWKA 1X3MA 1JCGA 1MA9B 3FZKA 4H0TB 3A5OC 1J6ZA 3I8BA 1WUAA 3MMVA 3D2EB 3LDOA 3VENA 4L3QA 5AQOA 3D7EO 5EX5A 1H1VA 2AP1A 4RTFD 1T44A 3VF6A 3SJHA 2ITMA 2PAVA 2E2OA 3UKRB 1BWFO 5I9EB 3SMPA 5CE3A 4IJAA 4A2AA 2ASMA 1U2VA 3QFPA 1RGIA 4FO0A 5TKYA 4IXCA 5KPZA 4JHDA 3CI5A 1IJJA 1LOTB 2CH5A 3SK3A 1MWMA 4B1XB 4EHTA 1DGKN 4FOIA 4FPAA 4IZ9A 3CHWA 5BN9A 1NGDA 2QW9A 3VEWA 3C7NB 3O1WA 4B1VA 3BF3A 1C0GA 3QBXA 3LL3A 2D4WA 4DHYA 4H0OA 5BPNA 2Q1NA 3DXMA 2A5XA 2YHXA 5AZIB 2A6AA 1P8ZA 5AQUA 2V7ZA 2IVOA 2ZWHA 3HBTA 3O5BA 3AY9A 5AQPA 4CJ7A 5BRFA 5ADXA 3CJ9A 4PKIA 2KHOA 4Y0WA 4CZIA 3SLCA 5ADXH 4MLEA 3KVGA 3OHRA 5AQSA 3ZETA 2Q0UA 4XH4A 3WXLA 3A5NC 2PBDA 3D2FA 2GTDA 1BUPA 2ZF5O 4CBWA 2VYPA 4JNEA 3HTVA 2Q2RA 3F9MA 4H5NA 5AR0A 2P9UB 4BRNA 2FXUA 4BRAA 3AARA 2NRHA 4JN4A 1ATRA 1QZ6A 1R59O 2FF3B 4YDUC 3ENOA 4QS7A 3A8YA 3FLCO 3GBTA 5LJWA 3C0BA 4BR9A 4FSVA 5F2RA 3H6EA 1GLAG 3UKRA 3WEEB 2DPNA 5EY4A 2H3GX 4B1ZA 3R8EA 2FF6A 1EQYA 1TUUA 4WQ5A 2QWLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3BF1A 1K9MO 3F5TA 3TAQA 4CZEA 3NE6A 2JGUA 3M5RA 3OS2A 4K43A 2X6NA 3QINA 3VESA 4OX9K 3HM8A 1HYSA 1U45A 3HK2A 3CMAN 3BDPA 4ISFA 4LSNA 3RVCA 1HPMA 2XY5A 1J5OA 4JS5A 2VWJA 4TSXA 1EWRA 1YT3A 5M1OA 4B9TA 5CY4A 1RT2A 1QQNA 2E4LA 1HNWK 1OKJA 1XHZA 3FE1A 4PUOA 1GLFO 4YOTA 2CGKA 3V6DA 1BO5O 2HHSA 3J7AP 3LDPA 3L2WA 2P9PB 1JXEA 4E7IA 3ZX0A 3DJCA 3S3MA 3ZSZA 1KLNA 2YNHA 3O9QA 4H0VB 4CJRA 4KPYA 3TAGA 4FWRA 4CJQA 2CGLA 4A5AA 5C2DA 1KSPA 4OJRA 4K8XA 3O08A 4O5BA 4BR7A 4CI6A 4B3MK 4FWNA 3P1GA 4DU4A 3VQEA 2WC9A 1ZBFA 3JYTA 4FWSA 3SQ2A 3DLRA 1YJ9N 4F4KA 1Q8IA 1QHTA 4B1UB 3TTFA 1ZYQA 4MDBA 3AVHA 5JLHA 2IAJA 4B3OA 2PZSA 4WQ4C 4LF5K 5FPNA 3SAGA 5EOYA 3LM9A 4DTXA 4IDHA 3KK3A 3H08A 5AQZA 4BACA 4O8UA 1GOBA 4FWOA 4DTJA 4CE9A 2R7YA 3SYZA 1S3XA 3EEQA 4LH4A 4E89A 3KK2A 4LF4K 1NGBA 4AH9A 1QZ5A 4ISGA 2P9PA 1VQLN 1ZBSA 2NUBA 3BEXA 3L2QA 2CH6A 5AFUH 2W6LA 2Q97A 3TSQA 2GBZA 4MDAA 2I7NA 1XC3A 4K25A 4OGCA 4CFCA 2X74A 2P5OA 4K42A 2ZJQL 3QBWA 1GLDG 3GOIA 1M1KO 2E6MA 1EWQA 4X66K 2DY4A 4GNIA 3CPWM 1QVFM 1L3VA 3IG1A 1FKPA 1HYVA 1T3VA 1BG3A 1A5WA 3MAQA 1NJIO 4LF9K 4ILHA 3MCPA 4Z4CA 4WQ5C 3RR7A 1B9FA 5BN8A 2HVHA 5BRDA 3DWLA 5FROA 4DSLA 4F3OA 1V4SA 4O0JA 1HNZK 3V9SA 3THYB 2VG6A 1C1AA 2RF2A 4JHDB 5KGXA 4ILGB 4CK2A 1NGJA 3CCMN 3NFAA 3AGKA 3DOLA 4IO8A 3NDKA 3R9PA 3KZBA 4BRLA 3D6RA 1TGOA 3QIPA 1QS4A 3CG7A 1KRPA 3ATVA 4JKFA 4DR3K 1LW2A 2NLXA 1VSKA 5GADP 4JKGB 1X9SA 3HVRA 4O55A 2VWBA 4K0KK 4CFDA 3AVFA 3OYFA 4I6MB 5EXWA 3VGKA 2KQ2A 4CFAA 3LALA 3ZSXA 4DQPA 3MK6A 3VGLA 4CZHA 3HP9A 3M8PA 3BZKA 2IIRA 4M42A 4DU1A 3K9KA 2HHWA 4YOVA 3OYCA 4F2SA 5KQDA 3QO9A 5J2QA 1LV5A 3ENHA 3IS9A 4B9SA 3CFRA 3TPQA 4FJKA 3I0SA 4BRQA 3D0PA 2HBMA 3CFPA 3O1BA 1D5AA 3L2UA 3FFIA 4CERA 4DSIA 3A5MC 3KJVA 2FBXA 3LWMA 3A5LC 3LPTA 3C6HA 4CHOA 1WBDA 3THYA 4ID1A 3GE1A 3V9ZA 4PQUA 2QI2A 3VETA 4CHQA 1NWKA 3MN6A 1VRUA 3EO3A 3IRXA 2P9LB 4KKOA 3CMEN 4YORA 3VEZA 2YHAA 3CIPA 4DV6K 3MWTA 2PFUA 2A42A 4H4MA 2IC3A 4KRFA 5HROA 3KKRA 2F8TA 4ZTFA 4I6MA 1FXXA 1R0AA 1CZBA 4DKWA 4DR5K 2HOEA 2YNGA 1QSSA 2OA8A 2VG5A 1JCFA 3L4IA 4FPBA 4UY8O 1S6QA 3O8MA 3V81A 1WNSA 4E1MA 1OH6A 1N32K 2RHKA 1KD1O 4F9OA 5BPMA 2E2QA 1QSLA 2XRIA 4B9QA 1NG9A 4BDYA 2ZGYA 1NK4A 3OYDA 2UXCK 5DM7L 1S1WA 1EP4A 2OPSA 1IKVA 4M3TA 3MN7A 3V4IA 1VQ8N 1EKEA 3LZIA 3HYFA 3VQ6A 1ASVA 3NH1A 1VSIA 3TAMA 4B3SK 4KHNA 1WAJA 2XY8A 2UUCK 4G1QA 3CCEN 5AQXA 4FLUA 2P9LA 2Q3SA 3SMSA 4BVPA 3QEWA 1KFDA 4CJSA 4PL8A 3VQ4A 3FZLA 4GKKK 4F3TA 4JI3K 1VAZA 5C25A 3AVJA 4G9ZA 4BR2A 1E3MA 4CGFA 3P5JA 4KB0A 3C6AA 3DLKA 4FWKA 4FVUA 1WOQA 4IWVA 5E84A 3F2KA 4W5TA 5HP1A 2FSKA 1FK9A 4M41A 3HL8A 2ASOA 4OVLA 1Q86O 1G15A 4HTUA 1MA9B 3V1OA 4OPKA 4CGHA 3I8BA 3L3UA 3K59A 3OYMA 4DUYK 4HCBA 3OVNA 2BDPA 2HHVA 3SJHA 2PAVA 5K14A 1YF5L 3UKRB 4A2AA 3S3OA 1U2VA 2KFNA 4FO0A 4DF4A 5KPZA 1LOTB 3VTIA 3SK3A 4EHTA 4HUEA 4FJ7A 5CR4A 1Q7YO 4IZ9A 3CHWA 2QW9A 2OCEA 3C7NB 3O1WA 3ZLJA 4DV7K 1C0GA 3TSUA 3TAPA 4UQGA 3N4QA 4CGDA 3U6FA 5AZIB 2YKNA 2A6AA 3NVMA 5AQUA 3THWB 3HBTA 3PSFA 1C1CA 5C15A 2QK9A 1XI1A 3CJ9A 4PKIA 2KHOA 4IOCL 4CHZA 4E7JA 5AQSA 2BGGA 2KZMA 1NJXA 2Z1IA 1BUPA 2ZF5O 4CBWA 4BE0A 1ZBIA 3DLHA 3HTVA 4M3UA 3F9MA 2P9UB 5CYMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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