4MO4A

Crystal structure of anmk bound to amppcp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
362
structure length
345
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGDDDTSRAVLNIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLANLPWLQEHLARHPALPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Pseudomonas aeruginosa
publication title Conformational Itinerary of Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase during Its Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
total genus 118
structure length 345
sequence length 362
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo4A01
1SZ2A 4BC5A 2YHYA 3IDHA 2FSKA 1K8KA 5EXWA 2D0OA 4H0TB 3FZMA 2IVPA 1TYQB 3WXLA 5AQGA 3D7EO 3VEWA 2FF3B 3L0QA 5AQVA 2VWBA 5JICA 2P9PB 4WQ5A 3AAQA 4BRLA 1NLVA 4MO4A 4EHUA 5AQWA 3UE5A 3MCPA 3LL3A 2VYPA 1NGHA 5AQIA 5AZJB 4CZJA 1IJJA 4PL7A 4FWKA 3LM9A 4IJNA 2E2NA 4BRFA 1KAXA 2CGKA 2FF6A 2GTDA 2QWLA 4FWSA 1OKJA 4H0VB 3QICA 1RDWX 4BR7A 3DWLA 4MO5A 3FE1A 1YXQA 5LJWA 4MLHA 2A40A 3MDQA 2ASOA 1JCFA 3U4LA 3MK6A 4JD2B 4YDUC 3HBTA 5AQUA 1K8KB 2CGJA 4JNEA 3DXKB 4FL9A 4XEIA 4B1ZA 1TUUA 1CZAN 3FLCO 4K42A 2W40A 4FOEA 5AQRA 4HWIA 4CZIA 1GLAG 4RWTA 3UB5A 2ZGYA 3VPZA 3H6EA 4BR0A 4MLEA 2QWRA 5BPLA 2P9LA 5JLFA 4BR2A 4DQ8A 4K41A 3SK3A 4CBUA 4WQ4A 5TKYA 4M7XA 4XH1A 5F1XA 5E26A 2QWPA 1QZ6A 5AQKA 1J6ZA 4H03B 3L4IA 4BRKA 5F2RA 4NO7A 3H3NO 1QQOA 1NGJA 3CJ7A 2F9TA 4PL8A 4CZFA 5FPDA 5AQPA 3SJHA 1GLDG 3H3OB 4BRPA 4IO8A 1GLFO 2P9UA 5EY4A 1NGIA 2ASMA 2QWQA 4BRNA 1RFQA 4JHDB 4K25A 1MDUB 2UYTA 4WYBA 2QWMA 3IMXA 2H3GX 3ENHA 1HKGA 1T6DA 4QS7A 3D2FA 4H5TA 3I8BA 5AQOA 2QM1A 3CJ9A 1NBWA 4AM7A 3RSEA 4IWVA 3FFKB 2F9WA 4DCHA 3S41A 1NM1A 2A3ZA 5FPEA 4CBWA 1GLLO 3B8AX 1MA9B 4H0YB 5FPMA 3SMPA 3R8EA 3VEOA 4KBOA 4BRQA 2D4WA 1ZBSA 1XC3A 4FSVA 2Q0RA 4M63C 2Q97A 1LOTB 4FOIA 2IIRA 3QMLA 1X9JA 3BF3A 1GLJO 1H1VA 3H45C 2ZGZA 3DJCA 3CIPA 1SAZA 2P9UB 1DKGD 3H1VX 1BU6O 4A61A 2GELA 5EX5A 3BEXA 1NGGA 3TU5A 4PKGA 3F9MA 5AQMA 3BUZB 4RCHA 5F0XA 2VCPA 4H0OA 5E84A 3A0IX 2YHXA 2ITMA 3IUCA 1BO5O 5AQJA 3U8XA 3ULEA 3RSEB 3ZEUB 3QBXA 4CZHA 4A62A 3GBTA 3MMVA 1NGCA 5AQQA 1RGIA 2D1KA 5AQFA 1IG8A 5AQHA 3AARA 4PKHA 5BRDA 3W3DA 2A6AA 3O80A 1NMDA 3IFRA 1C0GA 3VEYA 3GE1A 1QQNA 2V7ZA 5KPRA 1BA0A 4I6MB 3WQTA 3C7NB 5KPZA 1NGEA 2V7YA 3MN6A 3O4WA 2P9IB 2BUPA 3LDQA 3A8YA 3FZFA 3DXMA 3WT0A 2YJFA 3MN5A 1TUYA 2E20A 1XUPO 2P9SB 1HX1A 4RTFD 3A5MC 3U9DA 4BR5A 4FWLA 3FR0A 5EOYA 2P9NA 2YJEA 5BRHA 5BPNA 1BUPA 1ZC6A 1HKBA 5AQXA 3ULEB 4AM6A 1NWKA 5KQ8A 4BG9A 1Z6RA 1V4TA 4FPAA 5ADXA 2CH5A 4A2AA 2HF4A 5ELZA 3CJAA 3LDOA 3LM2A 3UKUA 3SMSA 3VF2A 5FPNA 1SQKA 1DEJA 4ISGA 1MWMA 3FZKA 1P8ZA 2DPNA 4ISEA 3LDNA 3UKRA 1QZ5A 3DXMB 5BN8A 3WEEA 4IZ9A 4FWNA 2E1YA 4CI6A 1Z05A 2I7NA 4EFHA 3GG4A 3U9ZA 2PBDA 3M3ZA 5AZIA 4WQ5C 2E2OA 5JMVA 2FXUA 1NGFA 5BR9A 2CGLA 1ZXOA 3MN7A 4BRCA 1ESVA 2P9NB 3QB0A 4FWPA 4B1VA 2NRHA 1D4XA 4BVOA 5CE3A 4M7YA 1KAYA 3MN9A 3HTVA 3HSCA 3QBWA 1HLUA 4FWOA 1QQMA 2GUPA 3VGMA 4H5WA 4EIAA 4B1UB 3O08A 1R59O 3UKUB 1X3MA 4BR9A 3DAWA 4Z94A 3CJCA 1LCUA 2I7PA 5AQTA 3GL1A 2AP1A 4FWRA 5AQSA 2E2QA 2P9LB 4BC4A 3KZBA 3UKRB 4CZKA 3I33A 1E4GT 2QXLA 2W41A 3R9PA 2HOEA 3ID8A 3CETA 1BDGA 2P9KA 2YHWA 3KVGA 4K43A 2WUSA 3FZHA 2QWOA 2QW9A 3HI0A 3QFPA 3P4IA 2Q31A 3FGUA 1MWKA 4WQ4C 2YI1A 1BA1A 2OANA 4BRIA 3JS6A 3O1WA 3VESA 2HF3A 3D2FB 5AR0A 3VENA 2GWKA 3WXJA 5AFUA 3VEZA 4BC3A 3CI5A 3EL2A 1JCGA 2FSNA 3R6MA 3O5BA 1Y64A 3LDLA 3W0LA 1BWFO 2A42A 4JN4A 1X3NA 4YDUA 1HKCA 1YAGA 4NB4A 2V52B 3HM8A 4FPBA 3ZETA 4A2BA 2YCHA 5AQLA 4BRAA 5BN9A 1ATNA 4PKIA 3HZ6A 4H0XB 4JAXA 3O1BA 4JD2A 2QWNA 4B1XB 4BVPA 1S3XA 1Q18A 3DXKA 4H5NA 1V4SA 3CERA 4F9OA 3EO3A 2FSJA 4CZGA 1G99A 4BREA 1HUXA 1WUAA 3TPQA 2CH6A 4EAHD 3M6GA 4CD3A 4BQLA 2BTFA 3ATUA 3EKUA 3VF4A 5LY3A 2E1ZA 3VETA 4BRHA 1GLBG 1KAZA 5ADXH 2FLOA 3OHRA 4FO0A 4DHYA 1KXPA 1GLEG 4H5VA 1YUWA 4O8KA 1DGKN 1NGDA 3CQYA 3A5OC 1JCEA 4BRMA 4BR4A 2HMPA 3EZWA 3ZETB 2E2PA 5KQDA 4FWMA 4B1YB 1T44A 2IVNA 2KHOA 4O5FA 3J8AA 1T6CA 4CZMA 5LJVA 1C0FA 3EKSA 3AY9A 3EN9A 4JHDA 4CBXA 4QS9A 2V51B 3QDKA 3CJ1A 3AAPA 3VGKA 1ATSA 4XH4A 3VOVA 4BG8A 4C23A 4BRDA 3ZX0A 1ATRA 1U6ZA 3D2EA 4EHTA 1S22A 2ZF5O 4B1WB 2NZTA 4HTLA 1HJOA 3WXIA 4J8FA 3L6QA 3CQXA 2Q1NA 4E1JA 3O6WA 1HPMA 2IVOA 3ZX2A 3KHYA 4LC9B 3VGLA 1EQYA 3BF1A 3LDPA 3H1QA 1BOTO 5I9EB 4BRGA 1U2VA 2Q36A 4BC2A 1QHAA 4BROA 4Y0WA 4BGAA 3M1FA 4QS8A 3ENOA 1E4FT 5AQZA 4FWQA 3WQUA 5AQYA 4BGBA 4BQZA 2D0PA 3WEEB 4L3QA 4GY2B 4ISFA 3A5NC 5AZIB 1XQSC 2A41A 2A5XA 3D2EB 3H46O 3SLCA 4CD1A 3ZEUA 4CJ7A 3WXKA 3BP8A 1YVNA 3GOIA 2E88A 1WOQA 4IJAA 5BPMA 1TYQA 5JLHA 3C0BA 1NGAA 5AFUH 2ZWHA 1NGBA 2P9PA 4H0PA 5KPTA 3JXUA 4I6MA 1U2VB 5EVZA 3VERA 3C7NA 3FZLA 2P9IA 3WUHA 3VEVA 4DB3A 3VF6A 2NLXA 2Q0UA 2J4RA 3ATVA 3QFUA 5AZJA 4CZEA 4XH5A 4IXCA 5B8HA 2P9SA 4CZLA 5BRFA 1GLCG 3CJBA 3GDQA 3VEXA 1BG3A 2Q2RA 3CHWA 2GEMA 2ASPA 3A5LC 4GNIA 2E8AA 5AQNA 2P9KB 2PAVA 2GWJA 4B9QA 2AA4A 3G25A 5BREA 3ZX3A 3O8MA 2EWSA 4H5RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1O1WA 2YHYA 4CGFA 1KC8O 3RR7A 3FZMA 3WXLA 4IOXA 2BH1A 1VSJA 1NK0A 4JK8A 2FF3B 3L0QA 5AQVA 2HVHA 2P9PB 3CCJN 3N4PA 2O8DB 4MO4A 4CIGA 3J7AP 4EHUA 1JLBA 5C24A 2HHWA 2VYPA 4WF9L 5AQIA 5AZJB 4CZJA 4YOWA 3DLGA 3LM9A 4DTRA 4CF0A 3OYIA 1NJYA 1KAXA 4O0JA 1LAVA 1KD1O 3DRRA 4E19A 4LH5A 3NE6A 1OKJA 3QICA 1RDWX 1KLMA 4CGHA 2FBVA 2JLEA 4CJWA 2VQEK 3U4LA 1JCFA 4WCEL 3I55N 5AQUA 3VQ5A 4CEEA 1K8KB 3HYFA 4AHUA 1Z26A 1K9MO 1DTQA 5AQRA 3AV9A 2OTJN 3SAFA 3H6EA 4BR0A 2QWRA 2P9LA 4BR2A 3AO3A 4Z4CA 4CBUA 4M7XA 1YF5L 4K8XA 3KKSA 1QZ6A 5AQKA 4H03B 1JLGA 1TL1A 2PYJA 4W5RA 1GOCA 3KLFA 1HYSA 3M5RA 3CC7N 4IEIA 4LD0A 3AGKA 5LL6Z 1WLJA 4R79A 1T7PA 5AQPA 3G10A 2ZJPL 4JI6K 2BE2A 5EY4A 3DLKA 4BRNA 1RFQA 4K25A 4R5PA 4C8OA 1KVAA 1HKGA 2OPSA 4QS7A 4BDYA 4H5TA 3SPZA 3MXJA 4QCLA 5GAGP 2QM1A 5D3GA 4FZXC 4DLEA 3L4QA 1NJZA 2RPIA 4O0IA 3B8AX 3R8EA 2WC9A 3F73A 4LF7K 4JI2K 3IG1A 1LWFA 3O4QA 2D0CA 2RKIA 3VQ6A 2OYQA 5DK5A 4CJVA 5HRPA 1FJGK 1GLJO 3OS0A 4JRPA 1H1VA 4DTOA 2ZGZA 3DJCA 2DTUA 3Q7CA 4WE1A 2GELA 4HUFA 3CCVN 4PKGA 3SI6A 1L3VA 5FROA 4H0OA 1SKSA 2E6MA 2HHTA 4BE2A 3V81A 4BACA 5SWMA 1OVYA 3RSEB 3ZEUB 3QBXA 4FJ7A 1TV6A 1YITN 4PKHA 3W3DA 3THXB 4BDZA 4NCGA 3AVIA 4CJ5A 4CGDA 4DR4K 1HQUA 3L8BA 2OTLN 2V7YA 3O4WA 1RDUA 2P9IB 4KHYA 1U4BA 2YX6A 3FZFA 3IAYA 3DXMA 3WT0A 1TUYA 1HNXK 4CJPA 4NLBA 3A5MC 1HNVA 1S6PA 4FWLA 4LFBK 2YJEA 1OVQA 3F2KA 4Q5VA 3V1RA 1HKBA 3K5LA 3AVJA 4JS5A 2X78A 1W2BM 4FLWA 1Z6RA 3CC2N 4DFMA 1C0TA 3VQ4A 2CH5A 5ADXA 2OPRA 4HTUA 2HF4A 5ELZA 3A2FA 3CJAA 3SQ2A 3LDOA 3UKUA 3SMSA 4O44A 2GX9A 1SQKA 4YOUA 4FM2A 4FLVA 3WEEA 3RR8A 5GIOA 1FXXA 3ULDA 4GKJK 1K6YA 4CFDA 4WQ5C 2NRRA 2CGLA 2D5RA 4BRCA 4JRQA 1ESVA 2P9NB 2NRHA 1NKCA 1KAYA 1C0UA 3QBWA 4CEZA 3L2RA 3LP0A 1WN7A 4PUOA 2RHKA 3VQ8A 4NCBA 2X74A 3O08A 5TKWA 3NH2A 4DTUA 4BR9A 2FBTA 4DTJA 2AP1A 5AQSA 3TTDA 1HR0K 5J2PA 3LAMA 1C1BA 1SL0A 4BC4A 1D9DA 4DTSA 1ASUA 3I33A 3IS9A 1FKPA 3TI0A 4RW8A 2Z1HA 2G8KA 3ID8A 4FJKA 3BZCA 1TKZA 4DR5K 1DT9A 4FZYA 3AVKA 2WUSA 4YOVA 2QWOA 3DRSA 3TTFA 3HOSA 3OBWA 3QFPA 2X6NA 3FGUA 4WQ4C 2YI1A 2BDPA 3O1WA 4M3TA 3OYKA 5M1KA 4CHPA 3D2FB 3VEZA 1XNQK 4I9QA 4M3UA 1VQ4N 3R6MA 3LP3A 3G0ZA 4J2DA 1BWFO 3QEIA 3TARA 5DM7L 4NB4A 3VMFB 2V52B 4DFPA 4F3TA 4CFCA 2OCEA 1TKTA 3NF9A 4FJ9A 4OPAA 4AH9A 2OZSA 4PHTX 4LF8K 1BQNA 3C6TA 3I0SA 3VN5A 4BVPA 1JXEA 4KHSA 4B9UA 4YNQA 4CZGA 4BREA 2IOCA 1REVA 3DLHA 4EAHD 1N34K 5FDLA 4BQLA 3HP6A 1D8YA 3EKUA 4OGEA 5IT9O 3VF4A 2E1ZA 3VETA 3SZ2A 4KHPK 3MEEA 3MWPA 1BGXT 1DLOA 3OHRA 4CEDA 4DHYA 3O3FA 3SQ0A 1N32K 3NH0A 2YNFA 4DF4A 1NGDA 3A5OC 3MX2A 2QKKA 3ZETB 2E2PA 4KTWA 1X9WA 1VQNN 4B3SK 2IVNA 4KTQA 5FLXO 2YNGA 3NMUA 4OVLA 3QESA 4WFBL 3ZT0A 3U3GA 2V51B 3VGKA 4KHNA 4BG8A 3G6EN 1QVFM 3ZX0A 4CF9A 4DU1A 1RDCA 3AO2A 3NF7A 2NZTA 3AO4A 5CHIA 1HJOA 3WXIA 4DSFA 3NGYA 1NG9A 3L6QA 4CJQA 1VQ8N 3O6WA 2E6LA 2E4LA 4DSIA 3KHYA 4LC9B 4LSNA 3BF1A 3QEWA 5M1OA 3O9QA 2QK9A 1U2VA 3C94A 3VQ7A 4E89A 5EU7A 4Y0WA 4QS8A 4CJEA 4DV3K 1RBVA 3VQDA 4B9TA 1WBBA 5AQYA 4BGBA 4BQZA 4FK2A 3ITHA 1G15A 4DFJA 1ZBUA 4KO0A 4CJ4A 2HB5A 3D2EB 2EX3A 3ZSRA 1T8EA 4Q0BA 3P31A 2IDOA 3ZSZA 2KZMA 4PWDA 1OH7A 2O8CB 2WONA 3BP8A 4CE9A 1TKDA 1YVNA 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4K0KK 4GV9A 3C95A 4JKDA 4H0YB 2HBKA 5FPMA 2BGGA 3SMPA 5MLCQ 2BANA 3K2PA 4KBOA 3WNHA 4AILC 4H4OA 5T7BA 2Q0RA 4M63C 1RBSA 2Q97A 1VQ5N 3DM2A 3KLIA 4DTPA 3QMLA 1X9JA 3CPEA 4HHTA 3BF3A 2O8FB 4O8UA 2WFBA 3PSFA 3VA0A 3HJFA 1NK5A 5KRTA 4A61A 5EX5A 4MDBA 3KLHA 4RW4A 3BEXA 4F2RA 1BIUA 3F9MA 5F0XA 3A0IX 3SNNA 4CJSA 3IUCA 5M1FA 5AQJA 3U8XA 3SUPA 4CZHA 4YFUA 4BWMA 3MMVA 5AQQA 1NGCA 1IG8A 5AQHA 1YIJN 3VQBA 4FJNA 3DLLL 4DG1A 2A6AA 3IFRA 1C0GA 3VEYA 4M42A 1QQNA 4FVUA 2ATQA 5KI6A 1BA0A 2EHGA 4I6MB 4CK1A 5FRNA 5KPZA 1NGEA 3CCUN 1QSLA 4DSKA 1WBDA 5C2FA 3LDQA 3BDPA 4B3TK 3QINA 4CW7B 2KQ2A 2P9SB 3OYJA 4FXDA 1JLQA 4N56A 3U9DA 2KLAA 2QA4N 1YTAA 1Q7YO 3ZT4A 5AQXA 1KRPA 1NWKA 3CCLN 1Y97A 1IH7A 1UA0A 3L3VA 1V4TA 4OX9K 2JGUA 4CGIA 4FJJA 3H08A 4RW6A 3G4SN 1BCOA 1NK7A 1MWMA 2VGMA 1P8ZA 1BHLA 4IEEA 1RTJA 3HPGA 4LY7A 4EP5A 3LDNA 3UKRA 4Z4GA 1JL2A 3DXMB 4CI6A 2I7NA 4DS5A 3ISNC 3MXIA 1J9AA 5AZIA 2E2OA 4B8AB 2FXUA 3WNEA 5M1NA 3MAQA 4JI5K 4IBNA 3QO9A 2LSNA 3RTVA 4A57A 1LW0A 3HSCA 4GVEA 3M8SA 2GUPA 1L5UA 1JL1A 1ZBIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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