4MO5A

Crystal structure of anmk bound to amppcp and anhmurnac
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
365
structure length
345
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGDDDTSRAVLNIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLAFNLPWLQEHLARHAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPAGSH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Conformational Itinerary of Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase during Its Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
molecule tags Transferase
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 110
structure length 345
sequence length 365
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo5A01
1ZBSA 3DXKA 1DEJA 4EFHA 3S41A 1EQYA 4IXCA 5ELZA 4PL7A 3I33A 3D2FA 3CERA 5BR9A 3AARA 4MO5A 4QS8A 4BGAA 3CJAA 2HMPA 4DCHA 4H0PA 3MN5A 5JICA 3GL1A 4HWIA 2YHWA 2CH5A 2A40A 3LDPA 5KPTA 2D0OA 4BR2A 4FOIA 4H0VB 3LDNA 5AQYA 4BR0A 1U6ZA 2P9NB 2H3GX 1BDGA 3U4LA 2E2PA 4FOEA 1V4SA 5AQXA 3LM2A 2P9KB 3WXLA 3BF1A 3QDKA 3CJ7A 4BRMA 4CBWA 3FZMA 4WYBA 3VEWA 3GE1A 4JD2A 1YAGA 3L0QA 1TYQB 3D2EA 4GNIA 4QS7A 3JS6A 1MWMA 3QFUA 3A5OC 1SAZA 2YHYA 4BC2A 4BC3A 3UKRB 3H45C 2I7NA 3DWLA 2DPNA 3VETA 4H0OA 2W41A 3ULEB 1XC3A 3QBWA 3HI0A 5JLHA 3M1FA 2CH6A 3BP8A 2Q36A 3KZBA 2ITMA 3I8BA 2P9SB 4O8KA 3FGUA 4B1WB 4ISFA 2PAVA 1XUPO 4CJ7A 4AM6A 2P9NA 4RTFD 2PBDA 4K43A 5FPDA 4K42A 4WQ4A 2GEMA 2NLXA 2P9KA 1BU6O 3JXUA 3U9DA 3H3NO 3HSCA 3P4IA 4BRDA 1H1VA 2A5XA 4CZEA 4B1YB 2GWJA 1BUPA 3WXJA 1RGIA 4FL9A 2D1KA 5AQKA 4BROA 1GLCG 3R6MA 3VEZA 3ULEA 1LOTB 4FWNA 1HKCA 2VWBA 3A5LC 2QWPA 4BRCA 4HTLA 4A2BA 1GLJO 4IJAA 2P9SA 4K41A 1NGDA 1YXQA 3LDOA 5BN9A 4LC9B 2FXUA 4CBXA 2QWNA 3DXKB 3GBTA 3H1VX 1DKGD 5E84A 1V4TA 4H5NA 4BC4A 1NWKA 4BVPA 3ATUA 2YCHA 4BRGA 1K8KB 1MA9B 3GDQA 2I7PA 5KQ8A 3TU5A 4KBOA 4FPBA 1JCEA 5ADXH 1XQSC 3EZWA 3MK6A 3WQUA 3O8MA 1NGCA 2WUSA 4AM7A 3QMLA 2J4RA 3GG4A 4FSVA 1SZ2A 2FLOA 5KPZA 1TUUA 4XH4A 2CGLA 5AQSA 5EVZA 3ENOA 3MN9A 2YJEA 3F9MA 4FWKA 3FE1A 2Q1NA 2V7YA 4J8FA 4XH5A 1TUYA 4ISEA 3AAQA 2IVNA 3ZX0A 5F0XA 1S3XA 4JAXA 3H46O 2FSKA 1K8KA 4DB3A 4RWTA 3L6QA 3VGLA 4CZGA 1QHAA 5EXWA 3A5MC 1NBWA 5AQIA 5AZIA 4WQ4C 4Z94A 3QB0A 3VESA 4EHTA 1HLUA 3VEXA 4FWMA 3HBTA 4FO0A 4CI6A 3U9ZA 5AQUA 1BA0A 4IZ9A 4A62A 4B9QA 1MDUB 3BUZB 4XH1A 2YHXA 3C0BA 4FWQA 2GELA 2QWLA 5AFUH 4F9OA 4BVOA 3WEEB 4BRPA 1NGBA 3ZETB 2GTDA 1GLDG 5LY3A 2D4WA 1YVNA 4Y0WA 2E8AA 3AY9A 5AQZA 1YUWA 3UB5A 5AQPA 5ADXA 3VENA 4YDUA 3G25A 4MLEA 2NZTA 1X9JA 1LCUA 3RSEA 4BRIA 4CZHA 3FZFA 4H5WA 1G99A 3FFKB 4A2AA 5KQDA 5BN8A 2A41A 2IVPA 2P9PB 2ZGYA 3O5BA 2IVOA 3DJCA 5AQJA 5AQHA 5AQFA 2ZGZA 2YI1A 3IUCA 3MCPA 3B8AX 1HX1A 3MMVA 3O4WA 4EHUA 2V51B 4PKIA 4BG8A 4BR9A 4FWLA 3CI5A 4WQ5A 5AQVA 3WEEA 3QICA 3ZX3A 2Q2RA 3ZETA 3LM9A 4JNEA 1ATSA 4M7XA 1BA1A 3A8YA 2GUPA 5FPMA 3VF4A 1QZ6A 3M3ZA 4A61A 2P9PA 4JHDB 5EY4A 3FZLA 4FWOA 3MN6A 3VEYA 5AFUA 2FSJA 2ASPA 2Q97A 5AQRA 2ASOA 3ZX2A 5CE3A 2V7ZA 3LDLA 2EWSA 5JLFA 3VEVA 2OANA 1WUAA 2QWQA 1HKGA 3CJ9A 4C23A 1NGHA 2Q0RA 4BGBA 1CZAN 2BTFA 2QWOA 3DAWA 1NM1A 3O08A 3IDHA 3SK3A 1T6DA 3CIPA 4BREA 5AZIB 1BOTO 1E4GT 2F9WA 4CZFA 1OKJA 3VGKA 3LDQA 1NGEA 1MWKA 3WUHA 1DGKN 1D4XA 1ZXOA 3OHRA 4H0XB 2QWRA 3C7NB 2E2QA 4CD1A 1ZC6A 4BRHA 3IFRA 2UYTA 2ZWHA 3CQYA 3D7EO 4JHDA 1R59O 4BR4A 4BR7A 5FPEA 4YDUC 5KPRA 4H03B 1KXPA 4CZMA 4CD3A 2E2OA 3R9PA 4DQ8A 1T6CA 4CZJA 4MLHA 2GWKA 2CGKA 4BRQA 4PKGA 3RSEB 1U2VB 2Q31A 1Q18A 4DHYA 3WXIA 5AR0A 1JCFA 3A5NC 3CETA 1SQKA 3A0IX 4IO8A 4IWVA 4B1VA 1RFQA 3O1BA 5I9EB 3FR0A 5AQLA 3HZ6A 4ISGA 1NGIA 3HM8A 3R8EA 1X3MA 1QQNA 3SLCA 1T44A 3O1WA 4FWRA 2QWMA 5TKYA 4BQZA 1HJOA 2E1ZA 3DXMB 3L4IA 3TPQA 2VYPA 3U8XA 5AQTA 3MN7A 3MDQA 3VF2A 5F2RA 4B1ZA 1HPMA 4IJNA 5FPNA 3C7NA 4WQ5C 1RDWX 1BO5O 1J6ZA 4FWSA 2IIRA 4BRLA 4K25A 3J8AA 1GLLO 1KAZA 4BC5A 4M7YA 5AQGA 5AQWA 4H5TA 3CJCA 5EX5A 4O5FA 3O6WA 2A42A 2W40A 1U2VA 3M6GA 4H0YB 2E20A 1NGGA 1NGJA 3SMPA 1WOQA 3CQXA 2FSNA 2AA4A 2ASMA 3DXMA 3ZEUB 3VPZA 4BRAA 2KHOA 5LJWA 5AZJB 5AQOA 1IG8A 1KAYA 3EN9A 2AP1A 4CZLA 3W3DA 3CJBA 3BF3A 3BEXA 4BG9A 1BG3A 3FZKA 1NMDA 4NB4A 3VF6A 1BWFO 3LL3A 4I6MB 1Z05A 3KVGA 3EKSA 4PKHA 5AQNA 3VERA 5BPMA 5BRHA 1NGFA 3FLCO 3CHWA 5BPLA 1HKBA 4EIAA 1ATRA 3EL2A 1X3NA 4E1JA 3UKUB 2BUPA 2Q0UA 2QM1A 5BRFA 4M63C 2HOEA 1IJJA 1HUXA 1TYQA 3SMSA 2D0PA 3H1QA 3ENHA 4BR5A 2F9TA 5AQMA 3UKRA 1E4FT 4PL8A 1GLAG 3ZEUA 4H5VA 2A3ZA 2P9IB 5AZJA 1GLBG 2P9LB 3ID8A 2NRHA 3QBXA 4EAHD 2VCPA 4MO4A 3O80A 5AQQA 4H5RA 4L3QA 2QXLA 1ESVA 4BRFA 1QZ5A 3AAPA 2P9UB 4CZKA 2YJFA 4BQLA 4B1XB 4CBUA 1GLEG 4I6MA 2CGJA 1QQMA 4H0TB 1ATNA 3EO3A 3UE5A 3H6EA 3WT0A 2V52B 2QW9A 4BRNA 1QQOA 3IMXA 3UKUA 4JN4A 3D2FB 2FF3B 5LJVA 1NGAA 3WQTA 1C0FA 3EKUA 3GOIA 3WXKA 5BRDA 5B8HA 1P8ZA 4NO7A 2FF6A 1S22A 1KAXA 3SJHA 1Z6RA 4QS9A 2E88A 3HTVA 3VEOA 3W0LA 5F1XA 5JMVA 4XEIA 5BPNA 2HF3A 1JCGA 2P9IA 1NLVA 3QFPA 2P9LA 3FZHA 5BREA 5E26A 4CZIA 3VOVA 4B1UB 2ZF5O 4FWPA 2P9UA 3CJ1A 3H3OB 1Y64A 2E2NA 4JD2B 4GY2B 4RCHA 2E1YA 2A6AA 4BRKA 3ATVA 5EOYA 3KHYA 1GLFO 3D2EB 1C0GA 3VGMA 2HF4A 4FPAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VQQA 3SUPA 4EFHA 3DXKA 1DEJA 2F96A 3LZJA 4FJ5A 1RBTA 3S41A 4IXCA 5ELZA 2WFBA 4C1NK 2A1RA 4U67L 2OPPA 5LMNK 5C2FA 2UUBK 4LFBK 4KB1A 2CH5A 2Z1HA 3LDPA 4DV5K 2D0OA 1N32K 4BR2A 3LDNA 3BZCA 4KPYA 2H3GX 4OX9K 3U4LA 4EP5A 4FOEA 3P1GA 4WCEL 1SS6A 4X62K 1HNZK 2P9KB 3QDKA 4CBWA 4CEDA 4JS5A 1VRUA 2D0BA 3WNFA 5IT9O 3MWPA 3HT3A 5JVHL 1MWMA 4BC3A 3IKMA 2OTJN 4I2QA 2DPNA 3VETA 3VQ5A 4DWIA 4NXNK 3LP0A 3RR8A 4FYDA 4FW2A 5JLHA 4LF4K 2CH6A 3BP8A 3V9ZA 4CK2A 3VQ4A 3CC7N 2P9SB 1J54A 4ISFA 3ZT4A 4RTFD 2D0CA 4O0JA 2HHTA 4G9ZA 2O4GA 4CHYA 3PV8A 1BU6O 1TV6A 4FK2A 1KFSA 3HM9A 5I42A 3H3NO 4K8XA 1B92A 3SQ1A 3VQEA 4JEPA 3E1YA 3WXJA 1RGIA 3CC4N 4U7BA 3BDPA 1XC9A 3AO5A 3VEZA 1NJXA 3NF7A 4ZTJA 3C6HA 4DU3A 1KC8O 4RW8A 2VWBA 3A5LC 4JI5K 5FRNA 4A2BA 3OY9A 1UWBA 5J2QA 5BN9A 3MCAB 1NG9A 4DQSA 3DXKB 3ZSZA 4M3RA 3K0SA 1DKGD 2HBMA 1V4TA 4H5NA 4C8KA 2Y1IA 3ATUA 2FBTA 3GDQA 1QTMA 1IO2A 4DQPA 3LP2A 4KBOA 4ZTFA 3NF8A 3OYLA 1XQSC 4CK1A 3VTHA 2DFHA 2JWLA 2WUSA 3OYFA 4YHHK 4LF5K 1QE1A 4EZ6A 5KPZA 1TUUA 4FCYA 4GW6A 2OPRA 2CGLA 5AQSA 5EVZA 3ENOA 1RNHA 3L2WA 2O8DB 2BDPA 4CFCA 3NGZA 2KFNA 4BACA 5M1KA 5KRSA 3AVNA 4J8FA 4KI6A 4XH5A 3ZSYA 3ZX0A 4H4OA 5F0XA 1S3XA 3LDSA 4JYAK 3HVTA 4IFVA 3TAQA 3V6DA 2RF2A 1CLQA 1NBWA 3K5NA 4DR6K 4DFMA 1EO1A 3ZT2A 3VEXA 4NCBA 4CI6A 2UXDK 4FLZA 5AQUA 4A62A 3NF6A 4W5TA 4B9QA 1J9AA 4YOWA 4TSXA 4FJKA 1KLMA 3T1YK 1WSIA 1EETA 5AFUH 3SQ2A 4F9OA 4BVOA 3WEEB 1X9SA 2GTDA 2D4WA 3LP1A 3AY9A 1U4BA 1LCUA 3RSEA 2IVPA 2P9PB 3MEGA 4JI8K 1YHQN 2HNYA 2XY6A 3OYEA 4DSJA 4CGHA 2F8TA 4F4KA 2YI1A 1EWQA 5TKWA 3MMVA 3O4WA 2V51B 3QEVA 1JLQA 4CJTA 5AQVA 2ZQBA 1D5AA 2Q2RA 4JKAA 2UXCK 4CJ3A 4GV9A 3K5OA 1LWFA 4JI1K 3PX6A 3ZT3A 1A5VA 4OJRA 2VG6A 3VQ7A 4JKGA 3V4IA 1WB9A 4AF1A 5EY4A 5AFUA 2Q97A 5AQRA 1ZBIA 3ZX2A 3QEPA 4KHYA 4N76A 2EWSA 1ASVA 3MECA 3J80O 1REVA 3QEWA 4LY7A 2QI2A 4KB0A 1HQEA 4CIEA 1RT7A 3HOSA 3HYFA 4CERA 1BOTO 3THYA 2QK9A 1OKJA 3LDQA 1NGEA 1MWKA 3WUHA 2OYQA 3NHGA 1IKYA 4CJSA 3KWGA 3OHRA 3KLEA 3CYMA 2QWRA 1A5XA 1ZC6A 3IFRA 4JHDA 2UYTA 3D7EO 1C6VA 2FBXA 4YOTA 1N36K 4FJMA 2NRTA 4BR7A 5FPEA 4JI6K 3PLAA 3ZSRA 4H03B 5HOOA 4MLHA 2GWKA 3TTCA 5SWMA 2OCEA 4BRQA 3RSEB 2Q31A 1YVUA 4DHYA 3AO2A 3DLGA 1KFDA 5AR0A 3U3GA 1HPZA 1SQKA 3AVBA 3VA3A 3OYAA 4DV3K 5I9EB 4E89A 3LWLA 3D6RA 4O4GA 4B9TA 1QQNA 3PX4A 3OBYA 4Q5VA 3SAFA 4G1QA 2E1ZA 1RT3A 4AHUA 3CCSN 2BANA 5FDLA 3VF2A 3DRSA 4B9LA 2O8EB 5FPNA 5GAHP 1VQON 4NXMK 1J6ZA 1DLOA 4N41A 4W5OA 4IFYA 2HHUA 4FWSA 4BRLA 1C0TA 1S1UA 3AV9A 1YJ9N 4H5TA 4LH4A 4O5FA 3O6WA 2A42A 2RE2A 2VWKA 4DG1A 3S9HA 3AVLA 3OJUA 5GIPA 2FSNA 2BH1A 2JGUA 3DXMA 4LFAK 4CEZA 3DM2A 4F8RA 5KI6A 4B3RK 3SV4A 1KAYA 3DRRA 1C0MA 3EN9A 1IBLK 3RMCA 4C8LA 1NU0A 3CJBA 4IBNA 3SI6A 4BG9A 1BG3A 3FZKA 3VQCA 4DSFA 4I6MB 1LV5A 1Z05A 3EKSA 3J7YP 5BPMA 4CF8A 4KHSA 3FLCO 4GV3A 3CHWA 3CCJN 4DR2K 4E1JA 4FJHA 3OS2A 2HMIA 4FLVA 4LF8K 2QM1A 2GV9A 3SPZA 5HRNA 4DTRA 1VSMA 3EE8A 3ENHA 4OGEA 5AQMA 4PL8A 5M1QA 3TANA 4IG3A 1GLBG 3QBXA 1RT5A 3O80A 2QXLA 1HQUA 1NJZA 4DU1A 4CZKA 2HBLA 4BQLA 1U47A 4CBUA 1S5JA 2UU9K 4FJLA 1WSGA 4WFNL 1KRPA 5GAEP 4DV0K 3WT0A 1FJGK 2OPQA 1IBKK 2Z1IA 2D0AA 4JN4A 4ZHRA 3TAEA 3IS9A 1W7AA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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