4NB4A

Pantothenamide-bound pantothenate kinase from staphylococcus aureus
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
267
structure length
265
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Staphylococcus aureus
publication title Structural characterization of a new N-substituted pantothenamide bound to pantothenate kinases from Klebsiella pneumoniae and Staphylococcus aureus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Type II pantothenate kinase
total genus 91
structure length 265
sequence length 267
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-10-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4nb4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4nb4A01
2E8AA 1C0FA 3CERA 4FWLA 4BRDA 1RDWX 3DJCA 3LDNA 1QQOA 4I6MA 5AZJB 4PL7A 5FPMA 4NB4A 5AQHA 3WEEB 4MO4A 3VEOA 2OANA 4K42A 2EWSA 3F9MA 5AQJA 3HBTA 2FSJA 3GOIA 2ZGYA 3FZKA 1SQKA 1SAZA 2E2PA 3M1FA 1OKJA 3A5NC 1G99A 4FL9A 5AQSA 3SMPA 3CQXA 3JS6A 1BWFO 2P9LA 3VEVA 5ADXA 3LDQA 1NM1A 3ZETB 2P9KA 3LDLA 2IVOA 1MWMA 2Q0UA 1J6ZA 4BRNA 3VEWA 1TYQB 1XQSC 2FSKA 3A5MC 1NGCA 1ATRA 4DB3A 2A6AA 5AQQA 3FZLA 1Z05A 2I7NA 5AQVA 3UKRA 3UB5A 2FLOA 3GL1A 3QFUA 2ZF5O 2E2NA 4H5RA 1Y64A 3P4IA 2E20A 1BO5O 2IIRA 3HTVA 4BRKA 3EKSA 5BRFA 3B8AX 2FSNA 3LDPA 2QW9A 1QHAA 4FWMA 3TPQA 4B1YB 4YDUC 4IJAA 5ADXH 3WQUA 1DGKN 4XH4A 3W0LA 1HKCA 1DKGD 3VERA 5AZJA 2Q97A 3HI0A 3QBWA 2F9WA 4H5NA 1E4GT 1E4FT 3VENA 5AQLA 1YUWA 1LOTB 4C23A 3D2EB 1HLUA 3O4WA 4JNEA 3IMXA 3D2FA 4WQ5C 4XH1A 4B1WB 5KQ8A 2Q1NA 4FOEA 4BR4A 1U2VB 3AAPA 4BR9A 4NO7A 3L4IA 4BRGA 4JAXA 1XUPO 3DWLA 4IWVA 2CGJA 2QWNA 5AQWA 4CJ7A 1S3XA 1HX1A 4I6MB 1ESVA 4E1JA 4L3QA 1TYQA 1GLCG 4Y0WA 1KAZA 2AP1A 4CZLA 3TU5A 3I33A 3JXUA 4O5FA 4K43A 3VESA 3MDQA 3S41A 4ISFA 4CZFA 4BRIA 1JCGA 5CE3A 1BOTO 1XC3A 3IDHA 3HM8A 2P9LB 1JCFA 4JHDA 4QS9A 5JLHA 2P9KB 2YHXA 4IJNA 4CD1A 4BGAA 1V4SA 3CJBA 2ZWHA 4JD2A 5JICA 2P9UB 5EVZA 5LJVA 1NGGA 1DEJA 3O6WA 2FF6A 4M7XA 3UKUA 1X3NA 3UKRB 1NBWA 3CJCA 3FR0A 3QICA 4BRCA 3O1BA 1KXPA 3FFKB 5AQTA 3D2EA 1BDGA 3L0QA 2D0OA 1IJJA 1BU6O 1JCEA 2IVPA 1NLVA 1RGIA 3SMSA 2ITMA 5F1XA 4B1ZA 4H0YB 2W40A 2YJFA 1EQYA 1SZ2A 3VF6A 3AARA 4GY2B 5E26A 5F2RA 2PAVA 4FWKA 1GLFO 4M7YA 3FZMA 5EOYA 3VEXA 5AQIA 2Q36A 3KVGA 4RTFD 4WQ4C 4EHUA 1YAGA 1ZXOA 1NGEA 3CJ7A 5B8HA 3WQTA 5I9EB 1YXQA 5AR0A 4A61A 3VGLA 4M63C 3MN5A 4WYBA 4H0TB 5LY3A 3D2FB 2VWBA 2GEMA 1GLAG 1NGJA 2NLXA 4CZKA 5AFUH 1ATNA 4MLEA 1NGIA 5AQKA 1MA9B 3EN9A 3IUCA 4CBXA 3H3NO 4FWQA 4RCHA 2QWPA 2HF4A 2ZGZA 3J8AA 2HMPA 2AA4A 3ZX3A 5AQRA 2P9UA 1QZ5A 3CJ9A 4FOIA 4AM6A 1QQMA 2BTFA 3CETA 4FPBA 2WUSA 1NGHA 4BRPA 2YHYA 5BN9A 3C0BA 2E2QA 2QM1A 3O8MA 3HZ6A 4BQZA 5BN8A 4CZGA 2VYPA 3H3OB 3VETA 4JHDB 4F9OA 3U4LA 4BG9A 4YDUA 2P9NB 4K25A 3ZX0A 4EHTA 4BRQA 3C7NA 4JD2B 4H0OA 5AQYA 3ULEB 3FZHA 3GG4A 4DHYA 1U6ZA 3UKUB 2ASMA 4XEIA 3FZFA 3U9DA 1YVNA 2GELA 2YCHA 4DQ8A 4BREA 5F0XA 1GLLO 2GUPA 2HOEA 3CIPA 4BC4A 2NZTA 4CZHA 4WQ5A 3R9PA 4A2BA 3QB0A 5KPRA 3FLCO 2NRHA 1S22A 3VEZA 2PBDA 2QWLA 2D4WA 2P9SA 4CZMA 2H3GX 1NWKA 3SLCA 4BVPA 2CGKA 4PKGA 4MLHA 1IG8A 3G25A 4PKIA 5BREA 1BUPA 4BVOA 2YJEA 2GTDA 3ENOA 4CD3A 5BR9A 3DAWA 3MCPA 4IXCA 3ZEUA 2BUPA 2Q31A 3LDOA 4BR7A 4K41A 1GLEG 4AM7A 1ZBSA 2E1ZA 3DXKB 3SJHA 4BC5A 5BPNA 3M6GA 1GLDG 4H0XB 3CJAA 2V7ZA 3H46O 2P9NA 1QZ6A 4BROA 3ZX2A 5EY4A 3H6EA 4PKHA 3ULEA 3O08A 4HTLA 3EZWA 4ISGA 1WUAA 5AQGA 4BRLA 2J4RA 2P9IB 4IO8A 3MMVA 4BR5A 4DCHA 1C0GA 1KAYA 3QBXA 3W3DA 1K8KA 3GDQA 2ASPA 2A40A 5AQOA 1D4XA 1LCUA 3BP8A 3DXMA 4EIAA 3C7NB 3ID8A 1QQNA 3WT0A 5FPNA 4WQ4A 2Q0RA 1HKBA 1X9JA 3L6QA 4B1XB 4CBUA 1RFQA 4O8KA 4J8FA 2E88A 5AQPA 5EXWA 4FWSA 5AQUA 5AQFA 4FWOA 5AQMA 3CJ1A 3I8BA 3M3ZA 2ASOA 1Q18A 4CZIA 3DXKA 3EKUA 1R59O 5EX5A 3CI5A 2UYTA 3LM9A 3WUHA 4BR0A 2P9PB 2P9SB 1T44A 1Z6RA 3R6MA 5TKYA 5BRDA 3A0IX 4H0VB 1NMDA 1HUXA 4FSVA 3AY9A 3R8EA 3MN7A 1TUYA 2QWMA 2E1YA 1T6CA 1V4TA 5ELZA 5KPZA 4FPAA 3KZBA 1HJOA 3H1QA 4ISEA 1KAXA 2VCPA 4H5TA 1CZAN 4GNIA 3ZEUB 2P9IA 4FWPA 3VEYA 2CH5A 2FXUA 4JN4A 1NGFA 3GBTA 1ZC6A 2D1KA 4PL8A 2CH6A 4QS7A 5AZIB 5LJWA 3VPZA 2IVNA 1ATSA 4BGBA 3LM2A 3VF4A 4BRHA 4B9QA 4EAHD 4BR2A 3O80A 2V7YA 5FPDA 5KQDA 3VGKA 3OHRA 4BG8A 3H1VX 4IZ9A 2QWOA 2A3ZA 3LL3A 3O1WA 1X3MA 3H45C 4XH5A 1MDUB 3BF1A 1HKGA 3BUZB 4A2AA 4BC3A 2DPNA 4BRAA 4Z94A 3VF2A 2YI1A 4FWNA 3RSEB 1T6DA 1BA1A 4BRFA 5JMVA 2FF3B 1K8KB 5E84A 1NGBA 2CGLA 2HF3A 4FO0A 1GLJO 5AQNA 5BPMA 4H5WA 3WXKA 2P9PA 1BG3A 3DXMB 2GWKA 1BA0A 4A62A 3WEEA 1GLBG 5FPEA 2D0PA 4H0PA 5JLFA 3VGMA 4B1UB 3WXLA 2A42A 2E2OA 4H03B 3ATUA 4MO5A 1MWKA 3WXJA 4EFHA 3MK6A 4RWTA 3VOVA 3QFPA 3FE1A 5BRHA 2Q2RA 5AZIA 2GWJA 3U8XA 4BC2A 4CZEA 3ZETA 5AQXA 2F9TA 3IFRA 3CQYA 3EO3A 4QS8A 3ATVA 3ENHA 5BPLA 4FWRA 3O5BA 4CBWA 2W41A 3A5LC 3MN6A 3A8YA 3QMLA 4BRMA 2QWQA 5AQZA 3BEXA 3AAQA 3U9ZA 3WXIA 3KHYA 3HSCA 4CI6A 1WOQA 4BQLA 2A41A 3RSEA 4KBOA 4CZJA 2V52B 3FGUA 3A5OC 1H1VA 3SK3A 2KHOA 3EL2A 3GE1A 4LC9B 1P8ZA 2A5XA 3QDKA 4B1VA 3UE5A 1NGDA 3CHWA 2QXLA 2QWRA 4HWIA 2YHWA 2V51B 5KPTA 5AFUA 1NGAA 1U2VA 1HPMA 3MN9A 4H5VA 2I7PA 1TUUA 3BF3A 3D7EO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KHUA 4BDZA 4BRDA 1RDWX 4IKFA 1RBRA 3WEEB 4M3TA 3VEOA 2OANA 1N6QA 2EWSA 3P38A 4LFBK 2FSJA 2ETJA 4BC2A 4LF4K 1SAZA 2E2PA 4ZHRA 2XY7A 3A5NC 3JS6A 2P9LA 1NM1A 2P9KA 1QVGM 1MWMA 4G9ZA 1QVFM 4FVMA 1DLOA 1J6ZA 1T03A 1NGCA 4CEQA 1VQPN 2RKIA 1ASUA 5E41A 1SUQA 4Z4CA 3FZLA 2DY4A 1S9EA 3QFUA 2E2NA 3SNNA 3KLFA 1BO5O 2IIRA 2HHXA 4JI3K 4BWJA 5BRFA 3THVA 3LDPA 2QW9A 1QHAA 3AV9A 4FWMA 4JK7A 4CFBA 4B1YB 4DSJA 4CF8A 4AHSA 1U47A 4B9SA 5C10A 1GOCA 3C95A 4W5TA 3M8SA 3VERA 2Z1IA 3VENA 1E4GT 4OPAA 1LOTB 3DLLL 2P5GA 4B9UA 3IMXA 1OVYA 2Q1NA 3ASMA 1NK8A 3NFAA 4BR9A 3L4IA 5M1NA 4AH9A 3V9ZA 4B9VA 3NH2A 2QWNA 1TK5A 1B92A 3V1OA 4CJ7A 5J2QA 3HK2A 4YOWA 3L2VA 4FM2A 4CIGA 4F2RA 4E1JA 1CXQA 1TKTA 2UUCK 4OPJA 1KAZA 4M3RA 1Q86O 4JKFA 1VSDA 1XNRK 1Q8IA 4ISFA 3O3HA 3OYMA 3CFRA 4ILGB 2GX9A 4WFNL 3PIPL 3SQ2A 4CJWA 4J2BA 1E3MA 3IDHA 4JHDA 4QS9A 4EZ9A 5JLHA 2KFNA 3O4QA 3CJBA 4JD2A 2P9UB 5LJVA 4N41A 3OS0A 1VQNN 2FF6A 3UKRB 3CJCA 3TAPA 5M1PA 1D9DA 1BDGA 1BU6O 3VMFB 1BHLA 4C1NI 4DV7K 4NCGA 3VQAA 4E1MA 4FLTA 1QTMA 1T05A 3TTCA 1HPZA 4A5BA 1WSFA 2D0AA 3L2UA 4DF4A 4FWKA 1GLFO 4M7YA 5EOYA 3PUFA 4CF0A 3HL8A 2GUIA 1WLJA 4WQ4C 1I39A 1TAQA 5KTQA 4HUFA 1G15A 1YAGA 4NYFA 2QKKA 4CHYA 3WNHA 4FW1A 5CZ1A 5I9EB 1YXQA 5AR0A 3MN5A 3K57A 2UXDK 4WYBA 4H0TB 5LY3A 4CECA 4B08A 1GLAG 2WONA 3LP2A 4CZKA 3LANA 3O3GA 3V9SA 5AFUH 1ATNA 1L3VA 3T3FA 4DFKA 1WSGA 4CHPA 4LF6K 3G0ZA 4GKKK 4BE0A 4LH4A 5CHIA 4DR5K 4C8MA 2YNFA 4CGHA 1EETA 2G8IA 3FFIA 3CJ9A 1TKDA 3CETA 4ZTJA 2QI2A 1EKEA 3OYBA 5BN9A 2O8CB 4M42A 5T7BA 1VQ8N 4JYAK 2O8EB 4FXDA 3C6AA 1Y97A 2YHAA 5AJ3K 1W0HA 1O13A 1HYVA 4DTXA 3VETA 4DR7K 3B6OA 3DLEA 4F9OA 3LALA 2P9NB 4K25A 1TL1A 3TAEA 2KFZA 5AQYA 3RMCA 4DHYA 1Q7YO 3U9DA 4GV6A 4CEFA 3AVKA 1GLLO 1LWCA 3SJJA 4CGJA 4NYNA 4A2BA 3QB0A 3LPTA 2XO7A 4DV5K 1NKBA 2HHWA 2NRHA 1S22A 4CZMA 2B4JA 2H3GX 1NWKA 3CC7N 3T1HK 3DLRA 4PKIA 4H4OA 3VA0A 4GV3A 3I56N 3NF7A 1BGXT 3RR7A 5HL7L 2GTDA 1OH7A 4CD3A 1OVQA 3DAWA 4DKWA 1Z25A 3LDOA 4BR7A 3AVNA 1VRTA 1GLEG 5FRNA 3SJHA 1WAFA 4BC5A 4CHNA 5BPNA 1UA1A 1FW6A 5M1FA 4BDYA 1RBSA 4GW6A 2UU9K 1X1PA 4CJRA 5IT9O 3ALYA 1SL2A 4DV4K 4QAGA 1EWRA 1BISA 4IO8A 4IO9L 3J7YP 4E19A 2B5JA 3I0SA 2JWLA 4CCHA 1JJ2M 4KPYA 2Y1JA 4DSFA 1C1AA 1K8KA 1FKOA 2A40A 2NRTA 5AQOA 1D4XA 1LCUA 2F4VK 4OO1J 1QQNA 4EP5A 3L3VA 3VQQA 1TK8A 1U49A 4WQ4A 4CGIA 1X9JA 4ICLA 4O8KA 4DS5A 4CJEA 4ELVA 1O1WA 3OW2M 3WNFA 4FWSA 5AQUA 3LZIA 4FWOA 1ASWA 3DXKA 3EKUA 1YITN 5J2MA 2UYTA 4F2SA 3L4QA 2P9SB 1NOZA 3SAFA 4FM0A 3ID6A 1ILYA 1TK0A 4DU1A 1S6PA 2Z1JA 3AO4A 4V19S 4DR2K 1TUYA 1T6CA 2HBJA 2FXUA 4ILHA 3QNNA 4JI5K 1NGFA 3GBTA 4FM1A 2D1KA 3AA3A 2CH6A 1RNHA 4QS7A 4CEDA 4E3SA 1J5EK 2EX3A 3KD1E 2A1SA 2ZJPL 1WBDA 1Q9XA 3QEWA 4BRHA 4FJLA 4JI4K 4A57A 1JLEA 3V81A 3H1VX 2QWOA 4JKGB 3CFPA 4OLAA 3LZJA 3THYB 3BF1A 4X64K 1HKGA 4Z94A 3K5NA 2RE2A 3VF2A 1IKXA 4FK2A 2NRWA 4BRFA 5J1EA 3KTQA 5E84A 1SS6A 2HF3A 3C6UA 1RT1A 4MQ3A 1RTHA 3WXKA 2P9PA 1N8RO 1JLQA 3R3LA 4GV9A 1GLBG 2D0PA 4H0PA 4B1UB 2VQFK 3WXLA 3RMDA 1WBBA 4J2AA 1XWLA 2A42A 3EE9A 3KK3A 3AO5A 2E2OA 4H03B 3VOVA 2OTLN 4KREA 3FE1A 4W5OA 3CQ8A 2EHGA 3K9KA 1RT7A 1XNQK 3IFRA 3EO3A 1L5UA 3ATVA 2PFUA 3DLGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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