4O8KA

Crystal structure of type iii pantothenate kinase from burkholderia thailandensis, apo structure
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
GVCLLIDAGNSRIKWALADTGRHFVTSGAFEHADDTPDWSTLPAPRGAWISNVAGDAAAARIDALIDAHWPALPRTVVRACAAQCGVTNGYAEPARLGSDRWAGLIGAHAAFPGEHLLIATFGTATTLEALRADGRFTGGLIAPGWALMMRSLGMHTAQLPTVSIDAATSLLDELAANDAHAPFAIDTPHALSAGCLQAQAGLIERAWRDLEKAWKAPVRLVLSGGAADAIVRALTVPHTRHDTLVLTGLALIAHSA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Burkholderia thailandensis
publication title Crystal structure of Type III pantothenate kinase from Burkholderia thailandensis, apo structure
rcsb
molecule keywords Type III pantothenate kinase
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-12-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o8kA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o8kA02
4JHDA 3L0QA 4WQ5C 5LJWA 4BROA 1HUXA 2ZF5O 3U4LA 1NGEA 5F2RA 1YXQA 1HJOA 1BG3A 1S22A 3VENA 3GE1A 1U6ZA 2P9KA 3EL2A 3BP8A 3ULEA 2CH6A 4I6MA 5ADXA 3WXLA 2Q31A 4WQ4A 3ZEUA 4FWNA 1C0GA 5AQLA 4A2AA 4MO4A 1ZC6A 2ASOA 4DCHA 3CI5A 4CBWA 4JHDB 3ATVA 4WQ4C 1IG8A 3A5LC 1IJJA 3KVGA 4CBXA 5AQJA 5LY3A 3QBWA 3M1FA 3SMSA 4BRPA 1TYQA 2H3GX 3B8AX 2P9KB 4K42A 1K8KA 3ENHA 3ULEB 2NRHA 2W41A 4I6MB 3SMPA 1T6CA 3U9ZA 4B1ZA 4GY2B 5BPNA 4MLHA 4DHYA 2Q36A 3AAQA 3ZEUB 1NGAA 1NGCA 2PBDA 2Q0RA 4K41A 1Z6RA 4B9QA 5AQQA 5BPMA 4J8FA 2YHWA 1TYQB 3VEZA 2NLXA 3M6GA 4CI6A 4Y0WA 1K8KB 3H45C 5ELZA 1NGFA 3H1VX 1GLAG 3BEXA 1WOQA 2P9IA 1MWKA 3GOIA 1JCEA 4F9OA 1GLEG 3QDKA 1NGDA 3CIPA 5FPMA 3DJCA 3DXKA 1ATRA 5AR0A 4CZMA 3I33A 3FZKA 5EOYA 4B1UB 5AQTA 2ASPA 4XEIA 4BRFA 5KQDA 2WUSA 4QS8A 2QWMA 1BWFO 2QW9A 3WXJA 3R6MA 2W40A 1NGJA 3CQXA 3QB0A 2P9IB 3QMLA 3EKSA 3LM2A 2FF3B 4IO8A 4BR5A 1TUUA 5AQXA 2BUPA 3SK3A 3DXKB 5EX5A 4PKIA 4FWPA 4CD3A 4BC5A 2VCPA 3KZBA 3AAPA 2A3ZA 4JAXA 3FR0A 1V4SA 5AZJA 4JD2B 4IJAA 3GG4A 4HWIA 1XQSC 2VYPA 5CE3A 2A6AA 3RSEA 4FSVA 4H5WA 4BRIA 1HLUA 3GL1A 1MWMA 3MN9A 4H03B 4A62A 3CJ1A 3QFUA 2AA4A 1E4GT 5AQGA 3J8AA 2IIRA 2GELA 1SZ2A 2P9NA 5AZJB 4FWOA 3ZX2A 4QS7A 3H46O 1HKCA 2FSKA 1MDUB 1NWKA 3P4IA 3SJHA 4ISEA 3VGMA 1MA9B 1WUAA 3AARA 3RSEB 4EFHA 1RDWX 2FLOA 3TPQA 3IMXA 2CGJA 3R8EA 3VPZA 3LDNA 2ITMA 3F9MA 4BRMA 2Q97A 5LJVA 4QS9A 3WUHA 4BRCA 3O4WA 5E26A 2D4WA 3VEYA 5AQNA 2A41A 2E1YA 3H6EA 4FWMA 4CJ7A 2P9NB 4BVPA 4ISGA 4PL8A 3BUZB 1KAXA 2FSNA 2ZGYA 3UKUA 3BF1A 1BO5O 2Q2RA 4H0OA 4CZGA 4O5FA 2GWJA 3LDPA 1V4TA 3A8YA 3FLCO 3DAWA 3HBTA 2QWLA 2VWBA 4BGAA 4H0PA 1XUPO 2E2QA 2E20A 4IXCA 5AFUH 3C7NA 4FWSA 1J6ZA 1E4FT 1CZAN 5KPZA 5JLFA 3LL3A 5FPEA 4IZ9A 4EIAA 1NGBA 4DB3A 2CGKA 3UKUB 2CH5A 3UB5A 4MLEA 3HM8A 2V52B 3LDOA 4B1WB 3FGUA 2V7ZA 2YCHA 2IVPA 5BREA 3CJAA 4BRNA 1TUYA 2GWKA 3VETA 3VF6A 1ZBSA 3ID8A 5AQSA 3VGKA 3CJ7A 3C7NB 2ASMA 2V7YA 3O80A 4NB4A 3IDHA 4XH4A 2ZGZA 4BC4A 3VEVA 1GLBG 1Y64A 2YHXA 5FPNA 2QXLA 5EY4A 1ESVA 3FFKB 4HTLA 3WT0A 1QHAA 4BREA 2D1KA 2NZTA 3O1WA 2E2PA 4KBOA 2A42A 1SAZA 4BQLA 5AQKA 4EHUA 2E2OA 4CZLA 1NLVA 1ZXOA 3MN6A 3ZX0A 1HX1A 4M7XA 2AP1A 3ZETA 2F9WA 3C0BA 3EZWA 1NM1A 4BVOA 4JD2A 2P9SA 4H0YB 3CQYA 2IVOA 3QBXA 4FWLA 1JCFA 5AQVA 5F1XA 4BR9A 4K25A 2E8AA 4CZHA 1GLJO 1Z05A 4RTFD 2FSJA 4BRGA 1S3XA 2FXUA 4FWRA 1BA1A 3G25A 5EXWA 1NBWA 4BRKA 5EVZA 4BG9A 1RFQA 3ZETB 5BPLA 1BA0A 3O1BA 5KQ8A 2IVNA 1QQMA 3H3NO 1HKBA 2P9SB 5AQMA 1QQOA 3VESA 4ISFA 3D2FA 5FPDA 5AQPA 2GUPA 4H5NA 2QM1A 2OANA 3WXIA 5AQIA 2D0PA 4AM7A 1LOTB 5AQFA 1BUPA 1EQYA 1DGKN 2EWSA 3SLCA 3VF4A 1NGGA 4BR7A 1G99A 4MO5A 1T44A 1GLFO 3D7EO 4NO7A 3U8XA 4FWQA 1QZ6A 3CETA 4AM6A 3VGLA 3LDQA 3WQTA 3EO3A 1NGHA 1YUWA 1U2VB 4BR0A 3D2FB 2CGLA 4PKGA 2FF6A 1KAYA 4CD1A 4FPAA 1JCGA 4BRQA 2BTFA 3O5BA 3WQUA 3FZMA 3VF2A 2P9PA 3HTVA 3VEWA 2J4RA 2Q0UA 3EN9A 3OHRA 1T6DA 2KHOA 5E84A 4A61A 3QICA 1X3NA 3QFPA 4RCHA 4XH5A 1KAZA 2E1ZA 5TKYA 3ZX3A 3LDLA 3L6QA 3DXMA 1HPMA 5AZIA 1HKGA 2HF4A 4H5VA 5ADXH 2Q1NA 2E2NA 4H0VB 2P9PB 3VEOA 3AY9A 3FZHA 4BR2A 3CHWA 4FOIA 4H5RA 1C0FA 2P9UA 1BU6O 3JS6A 4PKHA 5AFUA 3M3ZA 4FWKA 4BC2A 3A5OC 2QWQA 4IJNA 2HOEA 1Q18A 5BN8A 4CZEA 4H0XB 1SQKA 3A5MC 3O08A 4JNEA 3DXMB 3O8MA 3UKRA 5AZIB 4BRAA 5JLHA 4O8KA 3R9PA 2A5XA 3UE5A 2HF3A 4CZJA 1QQNA 2UYTA 3ENOA 3W0LA 4JN4A 3ATUA 5KPRA 5I9EB 4E1JA 5AQOA 4YDUA 3WEEA 2QWPA 2YJFA 5BN9A 2P9LA 4BGBA 2PAVA 3LM9A 3CERA 4XH1A 5BRHA 4B1YB 4BRHA 2P9UB 1R59O 1X3MA 4YDUC 4M7YA 3FZLA 3A0IX 4IWVA 4CZFA 5AQUA 5KPTA 3L4IA 4B1VA 3JXUA 5B8HA 3UKRB 3KHYA 2A40A 5F0XA 3H1QA 3DWLA 4C23A 2QWOA 4DQ8A 3FZFA 3CJ9A 3WEEB 3HI0A 1YVNA 2P9LB 5AQRA 3TU5A 3WXKA 1ATNA 3D2EA 3HZ6A 1NMDA 1NGIA 3O6WA 3CJCA 4BQZA 2YI1A 2DPNA 1RGIA 3CJBA 4EAHD 3IFRA 4CZIA 4BRDA 3U9DA 4H0TB 4FO0A 3H3OB 5BRDA 1LCUA 3VOVA 3MN5A 4WYBA 4B1XB 1BOTO 3MCPA 4FOEA 3EKUA 2HMPA 3MK6A 1DKGD 5JICA 1D4XA 2ZWHA 3IUCA 4BRLA 4L3QA 1GLDG 1H1VA 3HSCA 2F9TA 2GTDA 1YAGA 5AQZA 4A2BA 1DEJA 3MDQA 1U2VA 3D2EB 3GDQA 4M63C 4FPBA 4BG8A 4K43A 4CBUA 2YJEA 3S41A 2QWNA 1BDGA 2I7PA 3A5NC 2QWRA 4Z94A 1KXPA 2V51B 4GNIA 5BR9A 1OKJA 5AQYA 4FL9A 5JMVA 3MN7A 1GLCG 2YHYA 4EHTA 1ATSA 1X9JA 2I7NA 3GBTA 4LC9B 3W3DA 5AQWA 5AQHA 4BR4A 3VEXA 4BC3A 1GLLO 5BRFA 3MMVA 3VERA 4PL7A 2D0OA 1P8ZA 1QZ5A 4H5TA 4CZKA 3FE1A 4WQ5A 3I8BA 1XC3A 3BF3A 2E88A 4RWTA 2GEMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CG7A 3L0QA 3RVCA 3THVA 1HUXA 4I2PA 3U4LA 4BE0A 5EU7A 2NNWA 1QHTA 1HJOA 3GE1A 2BGGA 2HBLA 3QEIA 2YNGA 4C8LA 3TSQA 2Q31A 4E7LA 3LWLA 5AQLA 4JKFA 4X65K 3CI5A 4CBWA 4JHDB 4RG8A 2HHHK 4CJSA 4QCLA 5AQJA 2ZD1A 1TKDA 5LY3A 3QBWA 4DV7K 3I8DA 1TK0A 2H3GX 3ZSXA 4FM2A 4I6MB 3NF7A 3U9ZA 1W0HA 3WNHA 4YFUA 3ZLJA 2Q36A 4B3RK 3AAQA 4O4GA 3HK2A 2PBDA 4CK3A 5BR8K 4CEEA 4Z0UA 3PX6A 4FLXA 4CK1A 1Z6RA 4B9QA 1Q9XA 5BPMA 2NLXA 3AVNA 4O8UA 1EWRA 1CZBA 1K8KB 4B8AB 1GLAG 1W7AA 3BEXA 3OS0A 1RBRA 4Q0BA 4KKOA 3GOIA 2NRWA 1BQNA 5IWAK 4DWIA 5FPMA 3TTCA 1DTTA 3B6PA 2XY5A 5AR0A 2GV9A 4CZMA 2NUBA 1IBLK 3MWPA 3I33A 3HOTA 2WBNA 2ASPA 4GKKK 5KQDA 4QS8A 3WXJA 2W40A 5GADP 1NGJA 3QNOA 4CIGA 2VQEK 4I9QA 1VSJA 4IDKA 2D0CA 3LM2A 3T1HK 2HBJA 1QSLA 4IO8A 3OYEA 1TUUA 3G6EN 3U3YA 4KHNA 4PKIA 3KZBA 1QSSA 1NOYA 3DLEA 3ITHA 1BCOA 1V4SA 1IKYA 1NG9A 4BE1A 3CCSN 3HL8A 4HWIA 2PZSA 2YX6A 2QKBA 4FJLA 3WNEA 4ILHA 3CPWM 1KVAA 3VQPA 4DTSA 4BRIA 1BI4B 4O55A 1HLUA 3GL1A 1MWMA 4YOXA 2OCEA 1OH8A 2EHGA 4F2RA 1OH7A 3VQEA 1SZ2A 4E89A 4DV2K 3IG1A 3RMDA 2KKZA 2UUBK 1WUAA 3AARA 4BE2A 5GAEP 3AO3A 3K57A 3TPQA 3R8EA 1ASWA 1M90O 1U47A 1KVBA 3F9MA 4BRMA 2Q97A 4UQGA 3NGZA 2ZJPL 1L3UA 4WCEL 2A41A 4DSLA 3BUZB 1KAXA 3K0SA 1YHQN 3THXA 3C6HA 4CZGA 3SUPA 3A8YA 4CW7B 2G8FA 4FLZA 1JLEA 4A57A 1B9DA 4IXCA 3TAPA 2QK9A 3F5TA 1WN7A 2JWLA 2EX3A 1CXQA 5KPZA 3LL3A 1QTMA 4EIAA 1RBSA 2CGKA 5M1NA 4FLWA 2CH5A 3NVKA 4B1WB 3E01A 3FGUA 5HP1A 4EZ9A 5BREA 2IVPA 3DOKA 1TUYA 4FJ8A 5AQSA 3VGKA 4TSXA 2YNFA 3C7NB 3OBWA 4CE9A 3D45A 5AJ3K 1RBVA 4Z4IA 1GLBG 1Y97A 2YHXA 4FVMA 3V1OA 3CC7N 3FFKB 4NXMK 1NKEA 4JI2K 3WT0A 1ASUA 2NZTA 4KPYA 1ZBUA 2E2PA 4J2DA 4KHYA 1SAZA 3OYMA 5SZTA 3ZYYX 1T3VA 1NKBA 4BQLA 2E2OA 3CYMA 1ZXOA 3ZX0A 2VQFK 3T69A 4M7XA 4CHZA 3C0BA 4DV5K 1KVCA 4PHTX 5GAGP 2P9SA 4H0YB 3CQYA 3O3HA 1WSIA 1JCFA 1VQ6N 3O9QA 4RTFD 3NHGA 4FJNA 1NK9A 3B6OA 1LWCA 4BRKA 1RCHA 2VWJA 1RFQA 3TSPA 2KLAA 3OYCA 1LW0A 2WC9A 4JI6K 4C8MA 3C6TA 2KFNA 4DQRA 4F4KA 4ISFA 5AQPA 4H5NA 3I0RA 3ZT4A 1KQSM 4FZXC 5CR4A 4PWDA 3ULDA 3AV9A 1BIUA 1DGKN 1MU2A 4YOWA 2YHBA 3ZSOA 1G99A 4MO5A 4N76A 3K58A 4AM6A 4IFEA 1YUWA 3DLLL 3AVKA 3HPGA 2FF6A 1KAYA 4MQ3A 4FPAA 1ASVA 4BRQA 2P5GA 1S6PA 1VQ9N 3VF2A 2P9PA 3G4SN 1RT2A 3RR8A 4FK0A 1NJYA 1SUQA 2Q0UA 5E84A 1GOBA 1TAQA 1X3NA 1KAZA 3O9UA 4PY5A 1NMNA 1FK9A 1OVQA 1WSGA 1LV5A 4FJJA 3N4QA 1HKGA 4DR6K 2Q1NA 5CHIA 3SAHA 3G0ZA 3I56N 3BGRA 3Q7BA 3PSFA 4PKHA 3JS6A 1BU6O 1WNSA 4IG0A 4FWKA 3TAEA 3A5OC 4DF8A 4LF5K 2P5OA 2RKIA 3P83D 1UA1A 4ELTA 2HBMA 4CEOA 4FYDA 3A5MC 3JSMA 5AZIB 1X9WA 4DSKA 3QEVA 2A5XA 4KB1A 2KTQA 4JN4A 1TKTA 3ATUA 2KQ2A 4E1MA 3SUOA 3WEEA 4YDUA 2P9LA 2PAVA 3CERA 2PYLA 3TSUA 4B1YB 4C8NA 4Q5VA 1SL2A 1VSLA 4M7YA 5E41A 2HHUA 3L4IA 3RTVA 3JXUA 3AVBA 4R5PA 3KHYA 1YJWN 3DWLA 3KWGA 4G1QA 1N32K 4DUZK 1NU0A 5FDLA 1VQNN 1OVYA 2YHAA 3TI0A 1SS6A 5AQRA 4DG1A 3WXKA 3U6FA 3HZ6A 4BDYA 1NGIA 3O6WA 3CJCA 1SKSA 1HNZK 3JAMO 4H0TB 3AVAA 5TKWA 1IH7A 4CF2A 4KH6A 2XRIA 3AA3A 4JK7A 3VOVA 4B1XB 3MCPA 4DKWA 3HYFA 2HMPA 2HHSA 3PSIA 4CK2A 3CCRN 4BRLA 3K5LA 1H1VA 1VQ5N 5AQZA 3OA9A 4QAGA 1DEJA 3GDQA 4ICLA 4FPBA 3P1GA 4K43A 1IO2A 1K6YA 1QQCA 3ISNC 3AA4A 1ILYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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