4O8UA

Structure of pf2046
Total Genus 57

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
227
structure length
227
Chain Sequence
SRIVAADTGGAVLDETFEPIGLIATVAVLVEKPYRSAKEVMVKYANPYDYDLTGRQAIRDEVLLAIELARKVKPDVIHLDSTLGGIELRKLDEPTIDALGISDKGKEVWKELSKDLQPLARKFWEETNIEIVAIGKSSVPVRIAEIYAGIYSAKWGIENVEKEGHLIIGLPRYMEVNIKDGKIIGRSLDPREGGLYGSAEVSVPEGVKWEIYPNPVARRFMIFEIFS

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
S1 (10-15)TI1 (22-25)TIV2 (167-170)TVIa1 (39-42)AH1 (64-80)S4 (32-39)EMPTYS6 (51-52)TIV1 (55-58)AH3 (111-134)O1 (87-89)S7 (84-87)TI'1 (91-94)S8 (94-95)3H1 (96-98)S9 (138-141)TIV3 (168-171)TVIII3 (169-172)S12 (190-194)TI2 (143-146)TII'1 (142-145)AH4 (147-166)S14 (216-220)S11 (183-187)S10 (173-177)3H2 (198-200)TIV4 (186-189)S13 (204-208)TIV5 (200-203)TI3 (222-225)S3 (27-30)S2 (19-21)AH2 (101-105)TII1 (212-215)TVIII2 (54-57)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Unknown function
source organism Pyrococcus furiosus
publication title Crystal structure of a novel non-Pfam protein PF2046 solved using low resolution B-factor sharpening and multi-crystal averaging methods
pubmed doi rcsb
molecule keywords Uncharacterized protein PF2046
total genus 57
structure length 227
sequence length 227
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.440 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o8uA00
4YOVA 4YOXA 4O8UA 4YOTA 4YOWA 4YOUA 4YORA 5CHIA 4YOYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CE9A 3DXMA 1NOYA 5C10A 1HYVA 4H5NA 2A42A 4EIAA 1QS4A 3KD1E 3GDQA 3DWLA 2G8VA 4ISGA 3KD5E 4DSKA 3TAPA 4JK9A 1ZYQA 4CBUA 3ZSQA 1S3XA 3C94A 4DSFA 1S5JA 3TSQA 2F8TA 1BISA 4YOVA 3RTVA 2WUSA 2HHVA 4KTWA 1HQEA 3KLFA 4UQGA 1JLQA 3THWA 3WXJA 2P9LB 5AFUA 4KHWA 4LD0A 4CJUA 2D0BA 3IG1A 2IC3A 3WNFA 4A61A 3D6RA 3VEOA 1CZAN 3CCRN 1OVYA 4O8UA 3M8PA 1UOCA 3QERA 1W97L 1P90A 1IH7A 3CPEA 3VMFB 1TKXA 3CQYA 4B9QA 3D0PA 3HBTA 1X9MA 3K58A 3I0SA 2Q3SA 1YI2N 3OYMA 1R59O 1J5EK 2Q0UA 4FJMA 2HHXA 1HX1A 4DTMA 4IG0A 4CZMA 1N8RO 1H1VA 3B6PA 4JI1K 2O8CB 4DQQA 4CD3A 3G10A 4CZIA 4E3SA 5AQQA 3RMBA 3K9KA 4B9UA 5AQXA 4DSEA 3OA9A 1NJWA 3V1QA 3MN7A 4CK2A 1ZBUA 4H0PA 3NBPA 3P1GA 3CF5L 3F2KA 5M1KA 3CMEN 3GBTA 2UXDK 3OBWA 2XRIA 1U4BA 1TUYA 4B3OA 4BQLA 4HCBA 2O8DA 3JYTA 3J7AP 1HKCA 3VQQA 3QLHA 4KI6A 1I39A 4Z4HA 5DM7L 4QS9A 3FZLA 3HP9A 3THXB 3TU5A 3ZYYX 4R5PA 1TV6A 4DTJA 3WXIA 3HSTB 1LAVA 2PYJA 1U2VA 2G8UA 2BGGA 3HPGA 4YHHK 1S6PA 2YHBA 3TR8A 3F9MA 4YDUA 5AQGA 4B1YB 5EVZA 3SLCA 3VA3A 3L2UA 3SBTA 3MX2A 4HVJA 4IOAL 1HPMA 1XUPO 5CYQA 3AVNA 5AQWA 4KHQA 3CQ8A 5KQ8A 5AQFA 4W5RA 3N4PA 1ESVA 3CM6A 3VQCA 4B1VA 4GKJK 3B6OA 4LSLA 1NJIO 4BG9A 1QQMA 2QWPA 4B08A 1W2BM 2ZJPL 4KH6A 3VQAA 3OVNA 2YNGA 3SQ1A 4U67L 4JI0K 1D9FA 1ASVA 4BWMA 4JI2K 4A57A 4FOEA 3ENOA 4FK2A 5BRFA 3KKRA 2IOCA 4NCGA 5AQTA 5SWMA 1QQCA 4X66K 4ISEA 4A2BA 3GE1A 3OYHA 4V19S 4K41A 3LM2A 4DFPA 5BPMA 3ZEUA 1C6VA 3OYFA 3VENA 5KGXA 3VETA 3IKMA 1OH6A 2E8AA 2QW9A 2F4VK 3FZKA 3VGMA 5E26A 1OH5A 4FLTA 4DSIA 3SUQA 1XNQK 1WSIA 2Y1JA 1L5UA 3V9WA 4YOUA 2FSJA 4KBOA 3UKUB 4JKEA 2YKMA 5C24A 2P5GA 3ZT3A 4OX9K 1QVFM 4KRFA 3R6MA 4WYBA 1TAQA 2P9UB 3E01A 1TK5A 1RT5A 1ZBSA 4DR7K 3EE9A 4AHVA 1JL2A 3EZWA 1OVQA 3PUFA 2FSNA 4FWOA 4XEIA 3HOSA 1IBKK 4FJXA 3CJ7A 3CM5A 3ULDA 4JKGA 4PKHA 3LP1A 5EX5A 4O55A 3T1AA 3QEVA 4BDPA 2QKKA 2HHSA 2FBTA 3LDPA 4B1XB 3LAKA 2O8BB 4O5FA 2HHTA 3HI0A 4RW6A 2YNHA 4JRPA 3D2EB 1SKRA 2IVNA 4DV5K 4H5WA 3SCXA 1QVGM 3PY8A 3CCEN 3DOLA 1WB9A 4LC9B 2KHOA 4H03B 4G1QA 5JICA 2BE2A 4FWSA 2D0CA 2WFBA 4M45A 1J53A 2BH1A 4FM1A 2V7ZA 4CGJA 3VQBA 3OYLA 2WOMA 3VN5A 2P5OA 2YHYA 5J2MA 1XHXA 2I7NA 4DFJA 4B1ZA 5A2QO 2Z1IA 4JKDA 1NKBA 3RR7A 2W40A 3QBWA 4B3TK 4AHCA 1D9DA 1OH7A 1RDDA 3AVMA 4CEQA 4DB3A 5ELZA 4X64K 3OHRA 3J7ZO 1HR0K 1EO1A 1KVBA 5JMVA 4JYAK 3DLHA 1WBBA 1WAFA 4J2BA 2HVHA 2ZGZA 3QIPA 4K43A 3D45A 2R7YA 5AQVA 3BP8A 4DV3K 4I9QA 1CXUA 1LWFA 3V4IA 1WAJA 3SAGA 1NGIA 1BIZA 1KVAA 4KTQA 1KLMA 1MWMA 3D2FA 3O9SA 2GEMA 3D7EO 3S9HA 4BDZA 2YJEA 1E4FT 4DTSA 3AGKA 4DR3K 4A5BA 4CZFA 4I6MB 3OS2A 3S3NA 4LF9K 4LF4K 4EZ9A 3KLEA 1SUQA 4DMNA 1JCEA 1BWFO 1KCFA 3GOIA 2EX3A 3EO3A 1QSYA 3Q7BA 4PL8A 4E0DA 5C15A 5F2RA 1N33K 3IAYA 3I33A 4IDHA 1BI4B 3W0LA 1TUUA 2LSNA 5GADP 1YITN 1D8YA 2G8WA 5MLCQ 4BE1A 4DCHA 1IG8A 1TYQB 3SAFA 2F96A 4CEAA 1NGHA 2ZQBA 4DF8A 4IBNA 4FJ5A 4FVUA 4DS4A 3SQ4A 1BUPA 4MDBA 3JXUA 1NBWA 2BANA 3WXKA 1T44A 5JLFA 1HNIA 3R3LA 1YHQN 4FK4A 3HJFA 1A5WA 1NLVA 1Q8IA 3AO1A 2OPRA 1RBRA 1Q86O 2OZMA 2BUPA 4BC4A 4CJTA 4FOIA 1ASUA 3DAWA 2XY8A 2KZZA 1ATRA 4M3RA 4RCHA 2HBJA 1NGCA 3O4NA 1SKSA 3O3GA 3C95A 5CY4A 2P1JA 4BC2A 4LH5A 2NRTA 3WNEA 2E5LK 3ZSWA 2V51B 4WFAL 4IJAA 4KB0A 1TGOA 2W6KA 2EWSA 2BTFA 2ATQA 4FLUA 3U3YA 4DSLA 3ZSZA 1NJZA 4FYDA 3G4SN 3QFPA 3VQ9A 4E7IA 3T3FA 4CGFA 3R1XA 3VEVA 5BN9A 4E7KA 4XH5A 5GIPA 2QWLA 1KTQA 4IO8A 3TABA 1VQKN 4BRIA 4BRAA 3EZ5A 3DXKA 3I0RA 3HM9A 3SUNA 3QEXA 3SBGA 2QWMA 5M1NA 1IJJA 4F9OA 5CE3A 1TKTA 1EXQA 3PIOL 4WQ5C 2QK9A 3WXLA 4AHUA 4WFBL 3G25A 4BRNA 3QETA 5AQKA 2RKIA 1ZC6A 3SI6A 2Z1GA 3AVJA 3TAQA 5AQLA 2HHUA 2W6LA 3CJBA 4FJGA 3CG7A 1Q7YO 4HTLA 4H4OA 4IJNA 4CIFA 4N5SA 3RSEB 2P9NA 2RHKA 1X9SA 3SAHA 2JLEA 3CCJN 3AA2A 1KRPA 4BACA 5F0XA 4IEEA 2X78A 2F7TA 4PQUA 1YAGA 5EY4A 4BR4A 3LWLA 1LWCA 3OYGA 5AJ3K 4YFUA 4DV4K 1ZBLA 3LDOA 5F1XA 1ZXOA 4CZJA 1GOCA 5EOYA 1FW6A 4JD2A 4JKBA 2HOEA 3DRSA 4FVMA 4HUFA 3M8RA 1U45A 2VWBA 1RT7A 2G8HA 5EU7A 4W5NA 1KFSA 1BA0A 4DTRA 4H4MA 4FLVA 4CJ4A 3HVTA 3VGKA 3VQEA 3SMPA 1MA9B 5LJVA 1SQKA 1VSHA 1GLCG 3RMDA 2VG6A 4DV6K 4O0JA 2UUCK 3T7ZA 4CGHA 4N76A 5AQRA 3NF6A 3KVGA 1LWEA 2NRVA 3N4QA 3OTOK 1DKGD 4YOYA 3DXMB 3H08A 1YTUA 4BRFA 2OPSA 1SZ2A 1VRUA 1HYZA 3CPWM 3NH0A 3FR0A 5KQDA 1ASWA 2GBZA 4KO0A 3ZETB 1HPZA 2YV0X 1Q9YA 4B1UB 4B9MA 1BL3A 2E6MA 4DHYA 3QBXA 3IS9A 3ENHA 3E9OA 4AH9A 3FFIA 4KH5A 3NF8A 4A5AA 1J5OA 1EP4A 2HSTA 2D4WA 1Z26A 4QAGA 3MWPA 5C42A 3VQPA 4MO5A 4DTOA 3O08A 2UUBK 2HBMA 4CHQA 5AQNA 5AQPA 4Z94A 2YI1A 2XHBA 2CGJA 3MCPA 4B9VA 4JHDA 5HROA 1NNEA 4U7BA 1GOAA 1HJRA 3PX4A 2O8FA 4FLWA 1XMOK 5HBMA 2HNYA 2NRRA 3CCVN 1HJOA 1JCFA 1DGKN 4DR4K 4CGIA 4BVPA 1TKDA 3L2VA 4KH4A 4GNIA 3LDNA 2FF3B 3VQ4A 3GG4A 3A5MC 4CHZA 4M63C 3PX6A 3TTFA 1NGBA 4Z4CA 1VSFA 3OYKA 3AA4A 5DMRA 1WOQA 1XWLA 4FJ7A 3VESA 2E2OA 3HPOA 1T6DA 1VQPN 3CCMN 1DT9A 2IVOA 3A8YA 2KFZA 3KLHA 4ZHRA 2FBVA 1JLBA 2VGNA 4B8CA 4YDUC 3R9PA 4IEIA 2P9IA 2PAVA 2YNIA 2O8DB 3PV8A 2YHXA 4LFAK 2KFNA 1T8EA 1NOZA 2HBKA 1WBDA 1U2VB 3ZT4A 3CFPA 2OPQA 3OYBA 3BGRA 2O8EA 2RE2A 3OYEA 3C7NA 3NGYA 5AZJA 4LFBK 1E4GT 5AQJA 3KKSA 2YX6A 3CC4N 4KHNA 4OKJA 5HRSA 3GL1A 5HL7L 3AAQA 3FZHA 4AM6A 4AF1A 4M3XA 1NK5A 1IO2A 1VQ6N 4QOZB 2PZSA 5B8HA 2KKZA 4CJLA 3CCQN 3PO5A 4OPKA 3AGRA 1L3TA 4BE0A 3ID6A 1I94K 2HBLA 2Q0RA 4X62K 3O6WA 4ILHA 5EXWA 3UKRA 4Y1DA 5JLHA 4GV9A 2Q31A 3V1RA 3FZFA 1JLCA 3NVMA 4GW6A 2Q2RA 4Y0WA 1HUXA 5GAGP 3AA3A 3U3GA 2RN2A 1WSHA 1LW2A 3T1HK 1V4SA 4ID5A 3MDQA 1VQLN 1GLLO 1LV5A 3SJHA 4GV6A 3C0BA 1L3VA 3NCIA 4BDYA 4RW7A 2HB5A 3G0ZA 1K8AO 4ELTA 1HMVA 2GV9A 1F21A 3ZT2A 1XI1A 4NB4A 4FLYA 4F3TA 2NRHA 3AY9A 1NMNA 2G8IA 5BPNA 2O4GA 2YKNA 4EZ6A 1HNWK 3H45C 4EHUA 1BA1A 2P9LA 3EY1A 1S6QA 4BY9C 5M1QA 2DFEA 1C0TA 4GY2B 2QA4N 4DTXA 3P38A 3AVGA 2QWRA 4CF1A 1DTTA 1QHTA 5HLFA 2QWOA 2IS3A 3M8QA 2A1RA 4EAHD 4BE2A 3TTCA 4DTPA 3EKUA 4CGDA 4W5TA 5C2FA 1T6CA 1J6ZA 4FJIA 3AVIA 1SL1A 3U8XA 4JKGB 1QSSA 4Z4IA 4MO4A 1DTQA 1NKCA 3AAPA 4GV3A 4DUZK 4DR5K 3RMCA 1YJNN 2UXBK 4M42A 4FPBA 5GAEP 4XH4A 1VSEA 1BIUA 1TK0A 3L0QA 3AO4A 1T03A 3K57A 4E19A 1QHAA 4KAZA 2E2PA 1TK8A 3K59A 4JAXA 4HCCA 3ALYA 3LANA 3ZT0A 2RF2A 3WEEB 3SNNA 2B4JA 4BG8A 3VGLA 2FXUA 3F9KA 1RGIA 2HMIA 4H5RA 3V9ZA 3CIPA 3BUZB 2DY4A 2YJFA 3K5OA 4CHOA 2G8FA 1TL1A 2HW3A 5FRNA 4M7XA 3PSIA 1NK9A 3H3OB 3QO9A 4LY7A 3TAMA 3C65A 4JEPA 4YNQA 3WNGA 5TKYA 4CFDA 3E9LA 1VRTA 4DTNA 2W42A 3HXMA 2WTUA 2I7PA 3NVKA 2E20A 1VSLA 3DLLL 5JS2A 5KPZA 1QE1A 2ASOA 2VQFK 1UA1A 1S1WA 4CHYA 2D5RA 1TKZA 2OTJN 3BF3A 2VQEK 1RT2A 3O9TA 3DYAA 2YHWA 2KLAA 3C6UA 3QEWA 5DM6L 2GTDA 1JL1A 2XY6A 3ZT1A 2D1KA 3THVA 4KHSA 5FLXO 3LP0A 3JSMA 3D2FB 4O4GA 4DU3A 4X65K 4FW2A 1BDGA 4I2PA 4KTZA 1N36K 3CC7N 4K8XA 3K5LA 3UB5A 4M41A 1DEJA 3SV4A 4FWPA 1OH8A 4O44A 3SV3A 4FPAA 3SQ2A 1JJ2M 1D5AA 1C1BA 1GLDG 1N34K 3KK1A 4KB1A 4CHPA 4CFBA 5AQHA 4ICLA 3KWIA 3RVCA 4YOWA 3CJCA 1Q9XA 4J2AA 4BR2A 1S22A 4FWMA 1EQYA 1RTHA 3AO2A 4DQ8A 1JLFA 3DRPA 1IBMK 1TVRA 3LDSA 4MQ3A 3VERA 4DV7K 4CJRA 3H46O 5KGWA 3ZSXA 3QIOA 4BRQA 1IKYA 2W41A 2ITGA 3CCUN 2A1SA 3MN9A 5FDLA 4IFEA 1IV0A 4DQSA 4FSVA 2V7YA 1NK0A 1RDCA 1M1KO 3KTQA 1HQUA 2RPIA 4AHTA 1ZBFA 4DSJA 1S1UA 3M5RA 4CJSA 2QWQA 2XY7A 3NDKA 1YT3A 3NH1A 1A5XA 1K8KA 3BEXA 4CIGA 2IIRA 2E1ZA 4DS5A 1N5YA 5AQZA 3ENBA 3LP3A 4CF9A 3ZSRA 3PX0A 3I56N 3THYB 3S3MA 4CD1A 4J2DA 4FJKA 4OLAA 1KFDA 4OPAA 4UY8O 4CJWA 1JLAA 2Q36A 1RCHA 1Z25A 4CEDA 3IRXA 4PHTX 1BQMA 4LF7K 2GWJA 4A2AA 1S72N 2Y1IA 2QM1A 4YOTA 3CXCM 3ZX2A 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4WFNL 1VK0A 4C23A 5GINA 3T19A 3TTDA 4CGGA 2HNDA 4CEEA 4OLBA 1QZ6A 2P9SB 1W0HA 1WNSA 1JXEA 1X9JA 4CBWA 1N6QA 1NK4A 3OJUA 1WSEA 1Y64A 3O8MA 5ADXH 4Q5VA 1ATNA 4C8OA 4KI4A 3PLAA 1X1PA 5K14A 1BGXT 2IAJA 1EWRA 3KIOA 1LW0A 1Q18A 4WE1A 3EN9A 3A5OC 1HRHA 1XHZA 1KSPA 4NO7A 4NYFA 5AZIA 4CF2A 4JHDB 3OYIA 3ATUA 3RR8A 4BRMA 1VSIA 2O8FB 4DR2K 2XO7A 2WBNA 4AILC 2A40A 4EHTA 3KHYA 4IOXA 1RTJA 3E9PA 3LWMA 4C8NA 1W7AA 3R8EA 3C6AA 4IOCL 4CZHA 3CERA 2PFUA 3NFAA 5T7BA 2HVIA 2ZWHA 4OKEA 2X6NA 4M3UA 2NRZA 4H0OA 3WT0A 1TL3A 1HLUA 4Z4EA 3MX5A 3SUPA 2P9IB 3QICA 3HO1A 1BQNA 2ZGYA 4OO1J 4FWNA 3WQTA 4LFCK 3THWB 1QQOA 4M3YA 4QCLA 4B3MK 4DFKA 4CI6A 3OYCA 5LMUK 1VHXA 4DV0K 4CERA 4BRDA 3A5NC 4FM0A 4HTUA 3C7NB 5AZJB 3RRHA 2HMPA 3ITHA 2ASMA 3PIPL 1V4TA 3O1BA 2ZF5O 1HNVA 2F8SA 4CJQA 3AVAA 1T7PA 2WC9A 2OANA 3BF1A 1Z6RA 2QKBA 3Q7CA 1NK8A 2AJQA 4M3TA 3MCAB 1SL2A 3CFOA 3EYZA 3AVKA 3H6EA 2ITMA 1GLJO 3LDQA 4FK0A 4DKWA 5HRNA 3UKRB 4CIEA 3O1WA 3LDLA 1RBSA 3O4QA 1KC8O 4WQ4C 4OGEA 2ZJRL 3AV9A 3BY5A 5DK5A 4MLEA 4DQRA 4ELUA 2AP1A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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