4OKJA

Crystal structure of rnase as from m tuberculosis
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
VRYFYDTEFIEDGHTIELISIGVVAEDGREYYAVSTEFDPERAGSWVRTHVLPKLPPPASQLWRSRQQIRLDLEEFLRIDGTDSIELWAWVGAYDHVALCQLWGPMTALPPTVPRFTRELRQLWEDRGCPRMPPRPRDVHDALVDARDQLRRFRLITSTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure and Function of RNase AS, a Polyadenylate-Specific Exoribonuclease Affecting Mycobacterial Virulence In Vivo
pubmed doi rcsb
molecule keywords 3'-5' exoribonuclease Rv2179c/MT2234.1
molecule tags Hydrolase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 50
structure length 160
sequence length 160
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.13.-:
pdb deposition date 2014-01-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4okjA00
3HJFA 4C8KA 3QO9A 1JLQA 5J2MA 4DTNA 3AO1A 3QETA 1ZYQA 3KLFA 1LW0A 2KFZA 4Y1DA 4O5BA 3RWUA 1YVUA 5CY4A 3NH2A 4FLVA 4FCYA 3OYCA 4NCAA 3E01A 3RMCA 3S3OA 4J2EA 4C8LA 1CXUA 3KLIA 4F8RA 4AHTA 3KTQA 2YNFA 1A5WA 4I7FA 4RG8A 3ASMA 4NYFA 1BCOA 3LP3A 4CEZA 3NAEA 1L3SA 3SI6A 4FJKA 4QOZB 4O4GA 4JS4A 2HNYA 4KB1A 3TR8A 1S9GA 1W0HA 3OYHA 1J9AA 1NJXA 1DTTA 1N5YA 1WNSA 2IS3A 1LWCA 4H4OA 4KO0A 3K5MA 4B8AB 2YNIA 2ATQA 3I8DA 1NJYA 3AVGA 4FJ5A 2XRIA 1KSPA 4DLEA 4HUGA 1KRPA 3ZSYA 1RDDA 3SPYA 4FJ9A 2VG6A 4AHCA 4DFMA 2YKNA 5HRNA 3L2UA 3CFRA 1RBRA 4BDZA 1SKSA 1SL0A 4FK2A 3V9WA 4PA1A 1QSSA 3OYDA 1NK6A 2OZMA 2HHUA 3ZSVA 4OJRA 4ELTA 3CM6A 3OYLA 3PO4A 2PYLA 3B6PA 2HMIA 4DS5A 4CJKA 1RTHA 5I3UA 4KKOA 1WSJA 2YHAA 1QSYA 3DMJA 1A5VA 1L3TA 1IKXA 4RW7A 5KRTA 3CFPA 4B9SA 2O4GA 5C42A 4E7IA 3S3MA 4Q5VA 2B6AA 2VG5A 1VSJA 4B08A 4CF8A 4FJHA 4FJIA 1ITGA 3NF7A 4NYNA 2XY8A 3THVA 4CHNA 3KD5E 1RBVA 3AVLA 2Z1GA 1EP4A 1REVA 4GW6A 1QSLA 2FBYA 2ZQBA 3LZJA 4FLXA 1XHZA 4BACA 3TARA 3L3UA 3OYJA 3HVTA 1NK7A 1KFDA 3VQ4A 1D5AA 4DTRA 1S1TA 4CK3A 3RRGA 3DYAA 4ELUA 1JKHA 4IBNA 4FJNA 4N41A 4CHQA 2XHBA 3HM9A 2KZMA 3QIPA 3TAPA 4OKKA 1L3VA 4DQSA 1RT4A 4GMJB 4Z4FA 3AVJA 1UA1A 3AO4A 3SV3A 4E1NA 2IAJA 3TAEA 3O3GA 4I2QA 3V9XA 1TKTA 3DLGA 4DU3A 3U6FA 4CFAA 2RN2A 4FW1A 4KV8A 4O0JA 4DQRA 1HJRA 1B9FA 1KVAA 4LSLA 3T19A 3RMBA 3HP9A 1D9DA 1JLCA 3HPGA 4B8CA 5SZTA 3L2RA 1QQCA 3NHGA 2YV0X 3AV9A 3M8PA 1LW2A 3QEWA 3SQ1A 3DRSA 4OGCA 2G8FA 2F96A 2YHBA 2Q3SA 4AHSA 1ZBLA 1X9MA 5J2NA 1KVBA 4W5OA 1IO2A 4B9VA 4AHUA 1RT3A 2NUBA 4FZZA 2WOMA 2D0AA 1SKRA 1KFSA 2HHTA 4MFBA 1FXXA 4PUOA 3C94A 4FK4A 3HPHA 1Z25A 3PX0A 3PY8A 4KHYA 1RT6A 3EYZA 3K5NA 1WLJA 4MQ3A 4BE0A 1Q8IA 4AILC 3HT3A 1Q9YA 1RDCA 5CZ2A 2X6SA 4CEQA 3RR8A 3L3VA 3G0ZA 4KREA 1SV5A 1D8YA 4AHVA 4ICLA 3EZ5A 5DMRA 3V1OA 1MU2A 5CYMA 3JYTA 4FM2A 1WN7A 3DLBA 1Y97A 1NOYA 2HHWA 3AVFA 1RTIA 5KI6A 2KFNA 4M3YA 4CFDA 3VQ7A 4CJ3A 1ASVA 4NCBA 1SKWA 1VSHA 3LWMA 4CF9A 2G8HA 4Q0BA 1U48A 1RBSA 1RDAA 3T1AA 4F4KA 3VQBA 3VQ8A 4Z4HA 4Z4IA 4Z0UA 2YNGA 1S9EA 3LWLA 1SL1A 1RT1A 4CJFA 3TAGA 2PY5A 2FBXA 5KGXA 3OS1A 1CLQA 4O55A 2RF2A 1BQNA 1LWFA 4CGIA 2VWKA 2BANA 3ZCMA 2D0BA 3AVKA 3VQ5A 4CEEA 1C1BA 4CJ5A 2DFFA 4CJQA 3AVBA 1RTDA 4CFCA 4M3UA 1WAFA 1NK0A 4RW9A 1TGOA 3OYEA 1VSMA 3TANA 1J54A 1CZBA 1VSEA 2WONA 3ZSWA 2JLEA 1RCHA 3NBPA 3L8BA 4DSEA 1ZBHA 4Z4EA 2OPPA 3VA0A 3O3FA 1J5OA 4KHQA 3NF8A 4CJ4A 3K5LA 4CCHA 2QK9A 3I0SA 4CERA 3SQ0A 3AO5A 1TK8A 1TAUA 2W42A 1BIZA 2FBTA 3NF9A 1KCFA 1W9HA 4AHRA 5KGWA 4IDKA 1KLMA 1S6PA 4CFBA 1WSEA 4XIUA 4DFJA 4DLGA 3PX4A 1T03A 1HYSA 4LSNA 3HVRA 2X6NA 4E1MA 4JS5A 5JS2A 2BGGA 3OS0A 2RKIA 3AO2A 2RPIA 3D45A 3ZSXA 5J1EA 3KJVA 4ZTJA 4KI6A 4KI4A 3LALA 4KHWA 1RT2A 3VN5A 3RR7A 1GOCA 1TL3A 2FBVA 2KZZA 1J53A 3IAYA 3SUNA 1GOBA 3LANA 1HQUA 4IFYA 4CHZA 1HQEA 1C0TA 1A5XA 1WAJA 2DFHA 3VQ6A 4DU4A 3V6DA 1WSFA 1XWLA 4DF8A 4CJWA 4DU1A 1GOAA 3ZSZA 4DTSA 1UA0A 4J2DA 3BDPA 4GVMA 1IKYA 4FJJA 1RNHA 4CGHA 4KHSA 4OLAA 4FM0A 4CHOA 3MECA 1VSKA 3VQCA 4CIFA 4W5TA 1T8EA 4BWJA 4PWDA 1HMVA 4ID1A 4OKJA 3LAKA 2Y1IA 3CG7A 3TWHA 4CGGA 2ETJA 3DLHA 2HHXA 3SQ2A 1U47A 1IG9A 3SPZA 1CXQA 3M8RA 3SYZA 4RW6A 2Z1HA 3AA2A 3NCIA 1NK5A 1XI1A 1EETA 1LWEA 5CZ1A 1S1UA 3HYFA 3VA3A 4B9LA 4BE2A 4LY7A 2DTUA 1RDBA 4CE9A 4DTJA 3K2PA 3NH0A 4F3TA 3ZT2A 2OPSA 3SCXA 2EHGA 4E7HA 4FLTA 2KQ2A 4DQPA 1S1XA 3NF6A 4QCLA 1LAVA 4KB0A 2KTQA 1C0UA 3DRRA 4KPYA 4FJMA 4C8MA 3M8SA 4UQGA 1NJZA 1L5UA 2QKKA 2P1JA 2EX3A 1I39A 3NGYA 3RMAA 1S6QA 3HPOA 1NK8A 4O44A 2D0CA 4E7LA 4E0DA 4EZ9A 3OYFA 3OJSA 4M41A 3DI6A 1WSHA 3DRPA 1HYZA 4CF2A 3UIQA 1JLAA 2HB5A 3LAMA 1QS4A 3C6TA 4AH9A 4HVJA 4N56A 3OYKA 5FDLA 4JRQA 4FM1A 1X9SA 1TKDA 4I2PA 2BE2A 2QKBA 3QLHA 5C24A 1FKPA 4NCGA 1X9WA 2F8TA 5HRSA 1ZBIA 1NKEA 1S5JA 4N47A 2YNHA 2ZE2A 5E41A 3OYBA 3ZT1A 2HVHA 3WNGA 4CK1A 2HNDA 3QINA 4CF0A 3O3HA 1BGXT 4LD0A 3OS2A 3TI0A 3VQQA 3VQEA 3KLGA 2X74A 4CJVA 3HXMA 2B4JA 1JL2A 4CJLA 4FLWA 1B92A 1RT7A 5HROA 5HP1A 1U49A 4HCBA 4E89A 4KHUA 2Z1IA 1DTQA 1UAXA 4E19A 4C8NA 4ZTFA 3ZT4A 5D3GA 3KIOA 2P5GA 1SL2A 4F2SA 3H08A 4CGJA 3L2QA 2XY6A 4H8KA 1U45A 4PY5A 3B6OA 1JLEA 1KTQA 2GUIA 4JRPA 3ZT3A 1FK9A 3KK1A 4B9TA 1R0AA 1BCMA 3O4NA 2VWJA 2E4LA 3VQAA 1IH7A 3C6UA 4DTOA 1HNVA 1JXBA 2G8IA 4HTUA 4FW2A 3OYNA 3C95A 4HCCA 3SUPA 2IGIA 3AA5X 2F8SA 3OVNA 3CM5A 2OA8A 2JGUA 1JLBA 4FJ8A 3IG1A 4OVLA 4EP5A 4CJTA 1K6YA 2IOCA 4CEDA 3QEIA 1UWBA 4BE1A 3NDKA 4OKEA 4Z4CA 1YT3A 5CYQA 3D0PA 2Y1JA 3AVMA 4OLBA 4LH5A 3MEDA 2G8UA 4KRFA 3QIOA 4KTWA 1S1VA 1VK0A 1WSGA 3I0RA 4FJGA 3V9SA 1KLNA 5EU7A 1KVCA 4FZYA 5HBMA 4DF4A 3AA4A 3V4IA 2LSNA 1BHLA 3LDSA 3QERA 1IKVA 3O4QA 3EY1A 4IFVA 4E3SA 4CGDA 5SWMA 2FC0A 3RTVA 1JXEA 4RW4A 4YNQA 4E7JA 3P83D 3L2VA 2XY7A 3AVCA 2GBZA 1BQMA 1G15A 4FLYA 4LH4A 5KTQA 3PO5A 4B3OA 4OPJA 3RMDA 3RRHA 1ASUA 3OYMA 2OZSA 3MXMA 1HPZA 4M3ZA 3KK3A 1JL1A 3SQ4A 3P1GA 1NKBA 4FZXC 1VRUA 3HL8A 2HHVA 4DSJA 1YTAA 5HRRA 4FLZA 4Z4GA 3NE6A 3G10A 3QNNA 1TVRA 3KKSA 4I9LA 5FRMA 4RW8A 3F73A 3AO3A 4CEBA 4CIGA 1C0MA 3OYGA 3AVHA 4CECA 1U04A 4H4MA 4DWIA 2P51A 3MAQA 4IG3A 1VSLA 4E7KA 2E6MA 4M3RA 4BDPA 2DY4A 1NK9A 3NGIA 3CQ8A 3QEVA 1C1CA 3DLEA 3HK2A 4CGFA 4DSFA 3SJJA 2GV9A 4FYDA 5C25A 3JSMA 4F2RA 2A1SA 1X1PA 2IC3A 2ITGA 2I5JA 4OPKA 3MXIA 4F3OA 4EZ6A 4DQIA 3K59A 2VG7A 4HUEA 1BL3A 4BWMA 4EP4A 1HRHA 3OY9A 4DTXA 4B9UA 3PV8A 3MXJA 4B9MA 4HUFA 4G1QA 4ID5A 1ZBUA 2R7YA 1FKOA 3TAQA 3KLHA 1TKXA 4QAGA 3DOKA 3LZIA 1RTJA 4W5QA 3SZ2A 2XY5A 4CJEA 4ELVA 1ASWA 3K5OA 3M8QA 4CEAA 4CF1A 3QEXA 3SV4A 2IDOA 3IRXA 5T7BA 3ULDA 1QTMA 5FRNA 1N6QA 4BDYA 1VSIA 1C6VA 3OYIA 1VSFA 4N5SA 3BGRA 3V9UA 4DSKA 3LPTA 1F21A 4M3XA 2DFEA 4FVMA 3PUFA 4DS4A 3NGZA 1L3UA 3V1QA 4PQUA 2HVIA 1VRTA 4C8OA 1TL1A 1LAWA 3DLKA 1LV5A 4KAZA 4M3WA 4I9QA 5JS1A 1C1AA 1B9DA 1NKCA 4FJXA 3FFIA 2B5JA 4DMNA 3KK2A 1TKZA 3CFOA 1NK4A 4YFUA 1HYVA 1T05A 3WNHA 3LP1A 4DTUA 1T7PA 4M45A 3TAMA 1WSIA 4CJSA 4DTPA 1BI4B 3HP6A 3ITHA 3TAFA 3K58A 2AJQA 3VQPA 3DM2A 2ZD1A 2XO7A 2OYQA 1CZ9A 3QNOA 3ALYA 4FJ7A 4DG1A 3NFAA 1NJWA 1RILA 3NH1A 1ZBFA 3SUOA 4ZHRA 3V1RA 1Z26A 4CEFA 3QEPA 4B9NA 4FK0A 1Q9XA 1UOCA 3S3NA 2G8KA 3OYAA 3OJUA 4OGEA 1RBTA 4DQQA 5HRPA 5I42A 1QHTA 4CJUA 4M3TA 2HW3A 2YKMA 2O4IA 2BDPA 1S1WA 1XC9A 1JLFA 5DK5A 5J2PA 4N76A 4K8XA 5J2QA 1XHXA 3VQ9A 4FLUA 4CJPA 3ISNC 2PYJA 3HO1A 3WNEA 3SUQA 3IS9A 4CJRA 1I3AA 2P5OA 4FJLA 3K57A 2G8WA 4J2BA 1JLGA 2E6LA 3QESA 3U3GA 2OPQA 3LP0A 4FXDA 4M42A 3CYMA 3LP2A 4WE1A 3T3FA 1BIUA 2OPRA 3ZSRA 4HHTA 1EX4A 3KLEA 2X78A 1U4BA 3MEEA 2G8VA 1TAQA 5FROA 1BI4A 1HNIA 3AVAA 1EXQA 1YTUA 4KTZA 4KTQA 4CIEA 5KRSA 2Z1JA 3V81A 4J2AA 4CHYA 1NOZA 4DFKA 3LPUA 3WNFA 5K14A 4K8ZA 1TV6A 3HSTB 4R5PA 1EKEA 3DLRA 3SNNA 1O1WA 3ZT0A 1BISA 4CK2A 4W5RA 1SUQA 4DFPA 4IKFA 3KKRA 1IKWA 4L8RB 3F9KA 1RBUA 1QE1A 1VSDA 4CESA 3DOLA 3AVIA 3ZSQA 2KW4A 1RT5A 4JLHA 3VQDA 4CHPA 3AVNA 2QXFA 2D5RA 3PX6A 1DLOA 2HHQA 2HHSA 4CEOA 4KFBA 4DSIA 4DTMA 1D9FA 3MEGA 2PZSA 3ZSOA 3V9ZA 3AA3A 3L2WA 3S9HA 1TK5A 3P5JA 1TK0A 2A1RA 4DSLA 3A2FA 4KHNA 4Y1CA 5HLFA 3U3YA 3TABA 3KD1E 4O0IA 4IG0A 4W5NA 2HNZA 4TSXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WXMB 3CIPA 4DTNA 3AO1A 3ZETA 5JVGL 3THXA 1LW0A 4AM6A 2OTLN 3NH2A 4NCAA 1XQSC 4KHPK 4JKDA 3H46O 3RMCA 4LFAK 4F8RA 1CXUA 2E88A 3J7AP 4AHTA 3KTQA 2YNFA 5KQDA 3CPWM 4I7FA 4RG8A 2I7NA 1YIJN 4BRPA 1HLUA 4CEZA 3U4LA 3SI6A 2D4WA 2HNYA 4K0KK 3TR8A 1W0HA 3QMLA 3J7YP 1W97L 2AP1A 2V7YA 4H4OA 3K5MA 2UXCK 1KRPA 1TUYA 4ILJA 2ZWHA 1QSSA 4PA1A 3LL3A 2A6AA 5DM6L 4IOXA 3PO4A 2HMIA 1YITN 1RTHA 3ZEUB 1VQMN 2YHAA 4BGAA 3KWGA 1IKXA 4BR7A 5KRTA 3CFPA 1Y64A 5C42A 5F1XA 2D1KA 3CC7N 1H1VA 2VG5A 4FJIA 1ITGA 1OH6A 4DV2K 1Q81O 5DM7L 3AVLA 5BN9A 3LZJA 3HOTA 2E1YA 4CZKA 3OYJA 4BRCA 1KFDA 2HBMA 1IG8A 4IEEA 3RRGA 4FJNA 1OVQA 3DYAA 4IBNA 2E2PA 4H5RA 2IVPA 3TAPA 4DQSA 3AAPA 1VQ4N 2UU9K 3ULEB 4FL9A 4E1NA 3O9SA 4A5BA 3O3GA 1YHQN 3DLGA 4E1JA 3CJCA 5EY4A 1B9FA 3T19A 3RMBA 3GE1A 5SZTA 3LDNA 1EWRA 2YV0X 3T1HK 3AV9A 4KH5A 4AHSA 4K25A 3WEEB 1OKJA 4FZZA 1KAYA 5AQYA 2D0OA 3C94A 3E66A 4IXCA 5ADXA 4KHYA 4BE0A 2O8DB 5ELZA 3IDHA 4BR5A 3O9QA 5LJWA 3VEYA 2BH1A 4DR4K 4ILHA 1XC3A 3AVFA 1RTIA 2KFNA 4CFDA 4NCBA 2ZGYA 1U48A 5M1OA 4F4KA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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