4QS7A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) structure in glucose-bound form
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
460
structure length
455
Chain Sequence
WGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEDFHLPEGRQRELGFTFSFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDEVQKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSNDGSGIGAALLAASHSLYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hexokinase-1
molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 162
structure length 455
sequence length 460
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs7A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs7A01
1NGCA 4H0YB 3WXKA 1HJOA 3LM9A 3QFUA 3EL2A 5ADXA 4EFHA 1OKJA 3VF4A 1ATNA 4K43A 2NZTA 1Q18A 1E4FT 1U2VA 2ITMA 5BPMA 4IWVA 4FWPA 4BRPA 4A61A 3VPZA 2QM1A 4FO0A 5AQNA 2ASOA 3CJAA 3WXJA 1IG8A 3FLCO 3FZLA 1ZBSA 5AQWA 4BRMA 3LDPA 4WYBA 2GEMA 1QHAA 1QZ5A 3LDOA 1DKGD 3FZMA 3M6GA 1KAZA 1IJJA 3WQTA 4H0XB 4FWLA 2NRHA 1TUYA 3ULEB 4B1ZA 4CD3A 2P9IB 3SMPA 3H3NO 1HLUA 5KQDA 4JHDB 1YXQA 5AQJA 1T6CA 3L6QA 4B1YB 2A42A 2CGLA 1WOQA 1X9JA 2I7PA 4BRHA 4WQ4A 2D0PA 2V7YA 1LCUA 3EN9A 2P9LA 3QDKA 2P9KA 2PAVA 2QWLA 1K8KB 4FWKA 4I6MA 2BUPA 3DXKB 3IFRA 4JNEA 5KPZA 3D2FA 3QFPA 3BF3A 3U4LA 1JCFA 5AQYA 4FL9A 4GY2B 3HM8A 3RSEB 3WQUA 1J6ZA 3QICA 4H0VB 2CH6A 3MDQA 4CJ7A 3CERA 4AM6A 2V52B 5KPRA 3R8EA 4BRCA 3CQYA 4FSVA 3VEYA 3L0QA 1RGIA 5AZIB 1C0GA 5E84A 3IUCA 4DHYA 4CZKA 2Q1NA 1YUWA 4BRNA 4K41A 3TPQA 4B1WB 2P9PB 3ZX0A 5ADXH 1BA0A 5FPDA 4BRDA 2GTDA 3ZEUB 1MDUB 5AQXA 5FPMA 5AFUH 3VETA 4BR0A 3GDQA 1E4GT 2D1KA 4BGBA 1X3MA 1V4TA 3FGUA 5BPLA 3LDQA 3DWLA 3BUZB 3EO3A 4BGAA 4GNIA 4B1XB 3CETA 1YAGA 3EKUA 3FZFA 2A41A 3SK3A 4M7YA 3B8AX 4A2BA 3MN5A 4XH4A 5I9EB 2P9UA 1HKCA 1GLBG 4RCHA 5JLFA 1NGFA 1TYQB 5AQTA 1X3NA 4CZHA 5BN8A 4EIAA 3G25A 4FPBA 5JICA 4BRKA 2Q31A 3CJBA 2ZGZA 3MN6A 3W3DA 3VGLA 3WEEB 2FF3B 2VWBA 3CIPA 4Y0WA 4CZLA 3MN9A 3A5NC 3M1FA 1Y64A 5BREA 3J8AA 1QZ6A 2FF6A 1WUAA 4IZ9A 1DGKN 2HF4A 3WT0A 3VEVA 2CGKA 1NGAA 1EQYA 3H46O 4H5WA 3VOVA 4IJAA 3BF1A 2GUPA 3IMXA 4O8KA 5BRHA 5AQKA 3UKRA 5FPNA 2IVPA 3ID8A 5F2RA 2P9SA 4H0PA 1D4XA 2CGJA 4QS7A 1RFQA 4M7XA 2OANA 2EWSA 2AA4A 3VEXA 2P9NA 3GE1A 1MWKA 5BR9A 3C7NA 3UKUA 3VENA 5F1XA 4H5VA 3R9PA 1SZ2A 5E26A 3WXLA 2A6AA 1S3XA 2E2QA 1GLLO 4H5RA 4XH1A 1T44A 5AZJA 2D0OA 2DPNA 4LC9B 4JD2B 3U9DA 2D4WA 3HI0A 2BTFA 3JXUA 5LY3A 4BQZA 3H6EA 5ELZA 4YDUA 3GL1A 4B1VA 5AQMA 4K25A 3DXMA 3HZ6A 4M63C 2WUSA 4KBOA 5BRFA 2P9UB 3MK6A 2ASMA 2QWQA 2FXUA 3MN7A 4MO5A 5EXWA 4PL7A 2HF3A 3HSCA 3KZBA 3SLCA 3ATVA 2H3GX 2KHOA 3AAQA 3LL3A 1HKBA 1BU6O 2QW9A 4WQ4C 3CJ7A 3QB0A 3VGKA 3MCPA 1Z6RA 1BWFO 2ASPA 4YDUC 4F9OA 5AQPA 3QBWA 5AQGA 5AQHA 1H1VA 3O80A 1KXPA 3FZHA 3SMSA 4FWQA 3WXIA 1MWMA 4CZGA 2FSJA 4CBUA 4MLHA 5EVZA 3FE1A 2AP1A 1CZAN 3VF6A 3H1VX 5AQFA 3SJHA 3CJ9A 4BRFA 1BA1A 1NGJA 3HBTA 1U2VB 2E2OA 2E1ZA 3VF2A 3W0LA 5AR0A 5AQUA 4BRIA 2YJFA 1XQSC 2GWJA 4JAXA 2Q97A 2QWNA 4ISFA 4PKGA 3VEZA 1ESVA 2CH5A 5BN9A 3CHWA 4NO7A 2YHWA 3IDHA 4CZIA 4CI6A 3ULEA 4BC2A 2P9IA 5EOYA 1NM1A 3VEWA 2FLOA 2YHYA 4CZEA 5EX5A 3A0IX 1T6DA 4WQ5A 4JHDA 1TUUA 3LDLA 1BG3A 4HWIA 3ENHA 3HTVA 3D2EA 4A2AA 3VGMA 1BOTO 2A40A 5LJWA 4RWTA 2QWPA 1BUPA 1BO5O 3I8BA 2NLXA 4QS8A 2E8AA 1K8KA 3O1BA 4BVPA 3BEXA 1ZC6A 5AQZA 2P9LB 3DXKA 1BDGA 1QQNA 4IXCA 2P9KB 3OHRA 4DB3A 4CZMA 3TU5A 3DXMB 4I6MB 3BP8A 3D2FB 4WQ5C 1GLFO 4IJNA 4XEIA 4PL8A 4AM7A 1GLCG 3RSEA 5CE3A 1HX1A 4H5NA 4BR9A 1V4SA 4CBXA 4MO4A 3S41A 1G99A 4MLEA 3CJ1A 3A5OC 4H5TA 1XUPO 5BRDA 2V7ZA 3O8MA 5EY4A 1P8ZA 1JCGA 4Z94A 1GLEG 2PBDA 4J8FA 4BVOA 5AZIA 3EZWA 1HPMA 5AQSA 1QQOA 3GBTA 3FR0A 2P9PA 4BQLA 4K42A 4RTFD 4DQ8A 3ZEUA 5AFUA 3FFKB 4EHTA 4H0TB 4BR5A 1GLJO 3H3OB 4O5FA 1NGBA 4BG9A 2Q36A 2QWRA 3O4WA 1NGIA 4CBWA 3JS6A 1GLAG 2GELA 3O08A 2UYTA 4ISGA 2QXLA 2F9WA 4FWMA 1NBWA 3U8XA 2ZF5O 4CD1A 2FSNA 4XH5A 5TKYA 4BR4A 3AY9A 1LOTB 1C0FA 1TYQA 4BRGA 3QMLA 2Q2RA 1JCEA 1NGHA 2E20A 3CQXA 4BRLA 4PKIA 3ZETA 2I7NA 5LJVA 3UE5A 3WEEA 1NWKA 1NGDA 3QBXA 3D2EB 3O1WA 1NGGA 3O5BA 4H03B 3F9MA 4ISEA 2QWMA 5AQOA 4BC4A 4CZFA 4FWOA 1NLVA 4HTLA 5F0XA 2E2PA 3FZKA 1NGEA 4BROA 4FOIA 2YJEA 3I33A 5AQQA 2GWKA 5KQ8A 3H45C 1QQMA 3MMVA 3WUHA 5FPEA 3KHYA 2E2NA 4JN4A 4BR2A 4FPAA 3A8YA 4FWNA 3UKRB 3KVGA 3P4IA 4B1UB 1MA9B 5AQLA 2P9SB 1NMDA 5AQRA 4BRAA 4EAHD 1HKGA 3VESA 1DEJA 3DJCA 3ZX3A 1R59O 2YI1A 2FSKA 3A5MC 1XC3A 4H0OA 3U9ZA 3ZX2A 4CZJA 2P9NB 2Q0RA 2ZGYA 4BC5A 3C7NB 3UKUB 3L4IA 2F9TA 4QS9A 2E88A 4FOEA 1ZXOA 4FWSA 4A62A 2E1YA 4IO8A 1S22A 4BREA 3D7EO 4JD2A 5AZJB 5KPTA 5AQVA 2J4RA 4BR7A 3CI5A 4PKHA 2YHXA 3GOIA 3LDNA 1GLDG 4BG8A 2W40A 5BPNA 2V51B 4NB4A 1ATRA 1KAYA 2HMPA 3A5LC 3UB5A 3O6WA 3EKSA 3DAWA 3H1QA 2VCPA 1YVNA 3M3ZA 2IVNA 4E1JA 3LM2A 1Z05A 2QWOA 4B9QA 4FWRA 3C0BA 4L3QA 1SAZA 2HOEA 2Q0UA 3VEOA 3R6MA 3ZETB 4BRQA 1ATSA 3CJCA 4DCHA 1KAXA 5JMVA 2W41A 4C23A 2ZWHA 5JLHA 2VYPA 2A5XA 3VERA 1RDWX 4BC3A 1HUXA 3AARA 5B8HA 2IVOA 1SQKA 3ATUA 5AQIA 4EHUA 1U6ZA 3AAPA 3ENOA 2YCHA 2A3ZA 2IIRA 3GG4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WXKA 1HJOA 3EL2A 5ADXA 1OH7A 1KSPA 3VTIA 1E4FT 1U2VA 2Z1HA 3ZSWA 4IWVA 4B9SA 3CPEA 2LSNA 3I0RA 4HUEA 2VQEK 1IG8A 5KRTA 2Z1GA 4RG8A 4B9VA 4BRMA 4DV3K 4KAZA 3LDOA 3FZMA 3M6GA 1KAZA 4DR2K 3NBPA 4CERA 3SUPA 1TUYA 4DLGA 2P9IB 3MCAB 5KQDA 4JI4K 4JHDB 1S72N 5HRRA 1T6CA 3EY1A 2A42A 4JRPA 1WOQA 5C2DA 4WQ4A 1LW2A 4BE1A 3E9OA 2YKNA 4CF1A 2O8CA 1K8AO 2PAVA 1K8KB 4GV3A 4I6MA 4I7FA 3IFRA 5KPZA 1VSIA 1Z25A 3D2FA 2HW3A 3BF3A 3U4LA 5E41A 5LMNK 2O8EB 3T3FA 4FK4A 4GY2B 4C8NA 1WNSA 4FW2A 2CH6A 1HYZA 4NCGA 2V52B 3TTCA 1BGXT 2W6KA 4FSVA 3P39A 4W5TA 3QEPA 3VEYA 1KVAA 5AZIB 2B4JA 4X62K 3HOSA 1VSEA 4B1WB 2P9PB 1TK8A 5ADXH 1T8EA 4DFPA 2Z1IA 4BRDA 3CCSN 3ZEUB 3SQ2A 4PUOA 5AFUH 3VETA 4CJUA 1IKVA 4BGBA 1X3MA 3FGUA 2O8DB 3V4IA 3DWLA 1U48A 4ID1A 3CETA 1YAGA 3EKUA 3FZFA 3ZT3A 3N4PA 1U4BA 2E6LA 3O3GA 4DSIA 4YFUA 5AQTA 4B8AB 3RMBA 5C0YA 2Q31A 1O1WA 3CJBA 1BQMA 4DUZK 2ZGZA 3W3DA 4R79A 2W6LA 2ZJQL 2IDOA 3SUQA 2FBTA 3J8AA 3C65A 5EU7A 2FF6A 5FLXO 2RE2A 3K5MA 1A5VA 3V9XA 3VEVA 1HMVA 1W9HA 1NGAA 3LANA 1NKBA 1LWFA 4H5WA 3VOVA 3IMXA 5BRHA 1NG9A 2Q3SA 3ID8A 2PZSA 3PY8A 5F2RA 2P9SA 2KLAA 1M90O 4KHNA 1HR0K 3C6HA 4O44A 3THWA 3U3GA 4M7XA 2OANA 2G8FA 3DLKA 3VEXA 2P9NA 1L5UA 4YOTA 3NF8A 5E26A 1SUQA 2A6AA 3KIOA 4J2DA 5AZJA 1VRUA 1GOCA 3CCQN 4GVMA 1KQSM 4H8KA 4B9NA 1HQEA 4RW9A 2NRRA 4O55A 4BQZA 3P38A 2I5JA 5AQMA 2QTDA 2HBMA 3PIPL 1EWRA 4K25A 3DXMA 3HO1A 1JLBA 4M63C 4HVJA 3D0PA 4DR5K 2HVIA 4ILJA 5BRFA 1TK0A 4X66K 2ASMA 5EXWA 4Z4CA 1VQ4N 3WNEA 2Y1JA 4PL7A 1ZBIA 3HSCA 1DTTA 4OKEA 1NJYA 4UY8O 4YY3K 3O9QA 3DOLA 1BIZA 3VGKA 1Z6RA 4KO0A 4E19A 1VQON 3SBTA 4FK2A 3QBWA 3DLHA 5AQHA 4DTOA 3E66A 3QO9A 2OTLN 4NCBA 1MWMA 4LSLA 4E7JA 1TVRA 4N47A 1WSHA 4MDAA 5CR4A 1WLJA 3BZKA 3H1VX 4DSJA 2IS3A 1QS4A 4DSFA 2E1ZA 3VQPA 3MEGA 4DR1K 1VQ8N 4NXMK 1J5OA 1TK5A 4M41A 4B3SK 3RMDA 4Z4IA 5C25A 2QWNA 5GIPA 4PKGA 4AHVA 4N56A 3THYA 3TAEA 3CHWA 1YF5L 2YHWA 4CJKA 1X9MA 4CZIA 4NLCA 1Q82O 4BC2A 2P9IA 1C0MA 1NM1A 3OY9A 4OKKA 1QVFM 2YHYA 4WF9L 4CK2A 2QEXN 4DR4K 3OYMA 4JHDA 3I56N 4AF1A 4A2AA 3AA4A 3VGMA 4ZTFA 3U6FA 2Y1IA 2NNWA 3KK3A 4AQYK 4KHQA 4FLZA 1BO5O 3I8BA 3MWTA 2QK9A 3PV8A 1YI2N 3KLGA 4G9ZA 4QS8A 1QE1A 4FZYA 1GOBA 1K8KA 2P9LB 4IG3A 4WCEL 3EYZA 1Q7YO 4K8XA 3TU5A 3SQ1A 1IKXA 3CMAN 3OS0A 3BP8A 4OX9K 3LP0A 4WQ5C 3C6AA 4XIUA 3AVCA 1Y97A 1IKYA 5CE3A 4H5NA 3A2FA 4MO4A 3S41A 4CJLA 3IAYA 3U3YA 1G99A 4CCHA 4QCLA 1XUPO 4KHPK 3O8MA 4Z94A 4J8FA 2VG5A 4CFBA 2X6SA 5AZIA 3TAGA 4KV8A 3MX2A 3QEIA 1SL0A 3AA5X 4MDBA 3AA2A 1CZBA 3DMJA 3GBTA 1WAJA 2P9PA 3B6PA 3RVCA 3ZEUA 4H0TB 4BR5A 3MAQA 1HYSA 3NAEA 4W5NA 3NE6A 4CESA 3H3OB 1NGBA 4AILC 2O8DA 3JS6A 1GLAG 4JEPA 4A5BA 3O08A 4JYAK 1TV6A 2F9WA 4M3WA 4BR4A 3AY9A 2F8TA 4BE2A 2E20A 2Z1JA 3AO5A 4PKIA 4X64K 3D2EB 1FW6A 3F9MA 4E0DA 2P51A 4FWOA 3FZKA 4JK9A 1NGEA 1CXUA 1ZBFA 4PHTX 4JKDA 1D9FA 4C1NI 4QAGA 4FWNA 4CECA 1SKRA 3KVGA 3V9WA 4DV7K 1ZBHA 4IFYA 3TAMA 4Z4EA 5AQRA 3DLLL 1K73O 4EAHD 2QXFA 5CHIA 5GAGP 3VMFB 1DEJA 3O9TA 1C1AA 2YI1A 1NK8A 2FSKA 4KTWA 3HVTA 4OGEA 3U9ZA 1B92A 4BC5A 3UKUB 1RT7A 3L4IA 4FK0A 4FOEA 3R3LA 1T03A 1XC9A 3RWUA 3PUFA 3D7EO 4KI4A 2W40A 2V51B 4NB4A 2HMPA 3T1YK 3DAWA 3P1GA 2VCPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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