4QS9A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) mutant s177a structure in glucose-bound form
Total Genus 155
50100150200250300350400020406080100120140160
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
461
structure length
450
Chain Sequence
WGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEDFHLPEGRQRELGFTFAFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDQKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSGIGAALLAASHSLYLE
50100150200250300350400400300200100
050100150Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH5 (230-241)TIV1 (34-37)AH1 (37-48)TIV4 (251-254)EMPTYS10 (245-251)AH2 (52-71)TI6 (242-245)S1 (81-82)S4 (121-130)S2 (94-102)TVIII1 (76-79)TVIII2 (85-88)AH4 (207-218)TI2 (103-106)TIV3 (165-168)S3 (106-115)S6 (180-184)TI3 (116-119)TI4 (117-120)3H1 (133-136)S7 (187-190)AH3 (140-156)S13 (434-439)3H2 (160-162)S5 (171-176)TI5 (184-187)AH12 (441-445)TI'1 (194-197)3H3 (200-202)TII1 (202-205)S9 (223-228)S11 (255-262)S12 (278-282)AH10 (372-382)3H4 (263-265)AH6 (297-305)TI7 (266-269)TIV6 (270-273)TI8 (274-277)3H5 (285-287)TI9 (290-293)AH8 (320-338)AH7 (314-318)O2 (293-295)TIV7 (306-309)TIV8 (310-313)AH9 (357-365)TI10 (339-342)TI11 (346-349)TI12 (347-350)TII3 (351-354)TI1 (72-75)AH13 (447-461)O1 (176-178)S8 (205-206)AH11 (389-421)TIV9 (341-344)TVIII3 (353-356)TII4 (368-371)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hexokinase-1
total genus 155
structure length 450
sequence length 461
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs9A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs9A01
1V4TA 3FR0A 1YUWA 1BA0A 3HM8A 3SMPA 3VGLA 2NLXA 5BR9A 3HI0A 5AQRA 3SK3A 5BRHA 4BRNA 4BRIA 2VCPA 3AY9A 3UB5A 2P9SA 2ZGYA 5AQKA 3EKUA 3ATVA 3QBXA 3AAPA 5BPLA 4BC3A 1C0GA 3LDLA 3OHRA 4A62A 2VYPA 4IO8A 1C0FA 3QDKA 3EZWA 5AQZA 1HPMA 3S41A 2QW9A 3O1WA 3L4IA 3B8AX 3EN9A 3ZX0A 4DB3A 4B1ZA 2OANA 3VEVA 3VEYA 2QWOA 1ZXOA 4H5WA 3L0QA 5AQMA 1GLCG 1NGJA 1YAGA 1Z05A 5AQLA 3H1VX 5KPZA 1IG8A 2P9PB 3RSEA 3CQYA 1QZ5A 1QZ6A 3WXKA 4DCHA 4H0OA 5JICA 1ZC6A 3O6WA 5AQGA 4BVOA 2GWJA 4MLHA 5AQPA 1TYQA 3UKRB 2H3GX 4QS8A 4CZIA 2IVOA 4BRHA 1BOTO 5EX5A 1TUUA 1NGDA 3IMXA 1BDGA 1DKGD 3A5NC 1QQNA 3GDQA 4BRKA 3QFUA 2FF6A 4NB4A 1NLVA 3UKUA 4EHTA 3CJ7A 3BUZB 4MLEA 1CZAN 4FWPA 4XH5A 2EWSA 5EY4A 1SQKA 3U8XA 4BRFA 3D2EB 2A3ZA 4FWMA 4CBWA 1S22A 4L3QA 3H3OB 4BQZA 3CETA 4B1VA 3ZETB 2P9LB 4ISEA 3DAWA 1BO5O 3VGKA 3WXLA 3I8BA 2YJEA 1BA1A 5KQ8A 3MDQA 2NZTA 3LDNA 2Q1NA 4RTFD 3U9DA 2V51B 3VF6A 2V52B 2GEMA 1R59O 5EVZA 5AZJB 1LOTB 4AM7A 2E1YA 3FZMA 3LDPA 3HSCA 4BREA 1BG3A 4BC4A 5F0XA 1U2VB 3J8AA 5EXWA 2P9UA 1X3NA 4FL9A 2F9WA 5FPNA 5BRDA 3LDQA 3R6MA 2ZWHA 3KZBA 3W0LA 3W3DA 3FFKB 2IVPA 4CI6A 4H5NA 3D2FB 3QB0A 5KPTA 4NO7A 4EAHD 2YHXA 1G99A 3ZX2A 4IZ9A 1NM1A 4JN4A 4Z94A 3H6EA 3WEEA 2D1KA 3DXKB 3LDOA 4H0TB 4BRPA 3HZ6A 2AP1A 4YDUC 2E8AA 1GLEG 3ULEA 2Q97A 1MDUB 2PAVA 1XC3A 4B1YB 5LY3A 3ID8A 1RGIA 1TUYA 1E4GT 3C7NB 4FOIA 3QMLA 2A5XA 4CZGA 4J8FA 3VEXA 4GNIA 2GWKA 5AQQA 3MK6A 3SLCA 1JCEA 1MA9B 4CZKA 2Q36A 2A6AA 3GL1A 4EHUA 4I6MB 2CGKA 3M3ZA 1NGGA 4QS7A 2ASMA 4H0XB 5AQFA 3G25A 2P9KB 4BRMA 4H03B 4BQLA 1DGKN 1ZBSA 3CHWA 4H5TA 5AQHA 3VERA 3TPQA 4M7XA 4XEIA 3WUHA 1WOQA 5AR0A 3A8YA 5BN9A 5AZIA 2QXLA 2A41A 4BG8A 4XH4A 1NWKA 4BR4A 3EL2A 3VETA 4BG9A 4CD1A 4O8KA 4PL7A 3VEWA 4HWIA 4MO5A 4BROA 4M63C 4CZHA 1ATSA 4IJAA 3ZEUB 3H45C 3WQUA 4BVPA 4FWNA 2A40A 2YCHA 3L6QA 3U4LA 4FWRA 5FPMA 3SJHA 1K8KB 1XUPO 2GTDA 4PL8A 2GELA 3A5LC 1QQMA 3WXJA 3CJ9A 3VF2A 4WQ4C 1X9JA 2CGJA 4JHDB 1GLDG 2E2OA 3WXIA 3WQTA 4CBUA 4EFHA 3BP8A 1KAZA 5AQOA 2Q31A 2GUPA 1GLFO 3CJCA 4M7YA 2P9PA 1DEJA 3R9PA 3MMVA 3A5OC 3ZEUA 1J6ZA 4F9OA 5KQDA 5EOYA 2YI1A 2FSKA 5AQWA 5F2RA 1EQYA 2W40A 5AQTA 4B9QA 1K8KA 1NGBA 3VEOA 3UKRA 1NBWA 2HF4A 5LJWA 1RDWX 1X3MA 5FPDA 3JXUA 4BR9A 4CZLA 4BRQA 3QBWA 4BGAA 2P9NB 1WUAA 2PBDA 3FGUA 1XQSC 4E1JA 3HBTA 4PKGA 1SAZA 4FWOA 3VEZA 2P9IB 5JMVA 4XH1A 1OKJA 1HLUA 3FZFA 4KBOA 3ENHA 3GE1A 3GOIA 2V7ZA 3D2EA 3EKSA 1RFQA 4K43A 3CERA 5AQSA 4BRAA 2QWPA 3O5BA 1U6ZA 2I7NA 3ZETA 2P9LA 3BF3A 2P9NA 4B1WB 4K25A 5JLHA 1BU6O 3QICA 1LCUA 4CZMA 4FPAA 4IXCA 4CBXA 1IJJA 1HUXA 4BRCA 5AZJA 5ELZA 4JNEA 4WQ5C 4A61A 2QWQA 3GBTA 2V7YA 1P8ZA 1GLLO 4CZFA 3H1QA 1U2VA 5KPRA 2VWBA 2HMPA 3KVGA 3FZLA 4FSVA 4JD2B 4H5VA 4JAXA 4BC5A 4CZEA 4PKHA 3D2FA 4AM6A 1Z6RA 3ATUA 3EO3A 3O4WA 3ZX3A 4C23A 5E84A 4CJ7A 2Q0UA 2WUSA 3C0BA 4FOEA 2QWLA 3VGMA 1Y64A 3FZHA 2P9SB 4FWKA 3DXKA 1ATRA 4BR0A 2D4WA 1H1VA 3MN6A 2ITMA 3O08A 1E4FT 3A0IX 3BF1A 2FXUA 3C7NA 3I33A 3FE1A 1V4SA 5TKYA 3LM2A 5I9EB 1JCGA 1KXPA 3H3NO 5ADXA 2YHYA 5AQIA 3M6GA 3MCPA 5F1XA 4CD3A 4H0YB 1MWKA 3DXMB 3VESA 2HF3A 4YDUA 2D0OA 3JS6A 4FO0A 4QS9A 1MWMA 1ESVA 3RSEB 2FF3B 5BN8A 4H0VB 4ISFA 2J4RA 4I6MA 4DQ8A 2HOEA 5E26A 1JCFA 1GLJO 4K42A 2P9KA 4CZJA 3VENA 3MN9A 1TYQB 3IUCA 2ZF5O 1HJOA 1T6DA 5BPMA 3D7EO 2I7PA 3VOVA 4BR5A 3VF4A 2W41A 3FLCO 1T44A 3CJAA 2QWMA 3AARA 4DHYA 5LJVA 5AQJA 2FSNA 3DWLA 3DXMA 3M1FA 1NGCA 2NRHA 1S3XA 1YVNA 5AFUA 4BGBA 4FWLA 3UKUB 4B1UB 3TU5A 1NGEA 4BRLA 2BTFA 2ASOA 2KHOA 4FWSA 1HKGA 3IDHA 3O8MA 2E2PA 2Q2RA 5AQUA 2E2QA 4LC9B 2BUPA 1QQOA 2AA4A 4GY2B 4A2AA 3U9ZA 2QWNA 2D0PA 3AAQA 5ADXH 2UYTA 1QHAA 4O5FA 4JHDA 1NGFA 2ASPA 4BR2A 3QFPA 1NGHA 1NGAA 1SZ2A 4Y0WA 4IWVA 3O1BA 5FPEA 3LM9A 2CH5A 4B1XB 3IFRA 4WQ4A 2P9UB 4A2BA 3ENOA 5AQXA 2YJFA 1KAYA 2CH6A 2FLOA 1NGIA 5AQNA 4BRDA 5B8HA 4BRGA 5AFUH 3CJBA 1HKBA 1BUPA 5CE3A 4EIAA 1BWFO 3WEEB 3CQXA 3KHYA 5BPNA 3MN7A 4FPBA 1KAXA 2IIRA 2P9IA 2E20A 3P4IA 3CIPA 2F9TA 3ULEB 4BC2A 1HX1A 3FZKA 3CJ1A 1ATNA 2CGLA 1HKCA 3LL3A 4K41A 4WYBA 2QWRA 1D4XA 2DPNA 3O80A 5JLFA 3MN5A 1YXQA 1GLBG 1GLAG 4RWTA 3UE5A 4ISGA 3H46O 3F9MA 2ZGZA 4H0PA 2FSJA 4RCHA 2QM1A 4IJNA 5BREA 4H5RA 2YHWA 4HTLA 5AQVA 5AQYA 4PKIA 5BRFA 2E1ZA 2E2NA 3WT0A 2IVNA 1Q18A 2E88A 3GG4A 3HTVA 3SMSA 1T6CA 3BEXA 4MO4A 3VPZA 3A5MC 2A42A 2Q0RA 3R8EA 5AZIB 3DJCA 4JD2A 3CI5A 1NMDA 4BR7A 4FWQA 4WQ5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NLBA 3PX0A 1LWEA 3SMPA 3BZKA 5AQRA 3SK3A 4BRNA 3O4QA 3UB5A 2ZGYA 5AQKA 3QBXA 3OYNA 4DFKA 3F5TA 4CCHA 4CEDA 3THVA 3LALA 3OYCA 3S41A 4OJRA 2QW9A 3CMEN 4DQIA 4J2EA 5KGXA 5KPZA 2P9PB 1QZ6A 3SQ2A 1EWQA 5FRMA 5JICA 3O6WA 2OCEA 2GWJA 1I3AA 1OVYA 1K9MO 4JK9A 1IBKK 3I0SA 2O8EA 4DQQA 4IDKA 3AVKA 5EX5A 3OYHA 4KRFA 4OLBA 1QQNA 3GDQA 3QFUA 4J2DA 2FF6A 4DF4A 1NLVA 5J2MA 4CEFA 4MLEA 1TKZA 4JKDA 4DTXA 3U8XA 2HNZA 4IFEA 2A3ZA 3NVMA 1S22A 4GMJB 3P83D 4JKGA 3KLFA 2HBJA 5SZTA 2RF2A 5FLXO 4JYAK 3VMFB 3DAWA 3KLEA 5KQ8A 3LDNA 1SUQA 3RMDA 4L8RB 2HHSA 3AO4A 3ZSOA 1SKRA 1LAVA 5GADP 4BREA 1BG3A 4B3SK 3DLRA 3K5NA 1U2VB 4CE9A 2P9UA 4FL9A 3SAHA 2F9WA 4CK3A 1MU2A 3LDQA 3KZBA 1CZBA 3W3DA 3FFKB 4CI6A 4I9QA 1RDCA 4KHWA 4H5NA 5BR8K 3QB0A 5KPTA 4EAHD 3V9SA 4JN4A 4AH9A 3CCQN 3LZJA 3KK2A 2D1KA 1NK8A 3HZ6A 4YDUC 4LSLA 3PSFA 1NNEA 2PAVA 4DS4A 2UU9K 3ID8A 2YNFA 4DFJA 3WNGA 3BZCA 4Z4GA 4EP4A 2HHVA 3E9OA 3DLGA 2XY8A 2A5XA 4JI1K 4CZGA 3NH2A 3P5JA 2JWLA 5AQQA 2NRVA 1VQ8N 2Q36A 4AILC 3NE6A 4O0JA 3V1OA 4I6MB 3NF8A 2CGKA 1VRTA 4AHTA 4H0XB 2BDPA 3G25A 2P9KB 3VA3A 1ZBSA 2ZJQL 4J2BA 4GVEA 3TPQA 1QE1A 4XEIA 4YOWA 1JXBA 3V1RA 5AR0A 5BN9A 3CC2N 5AZIA 3Q7CA 2QXLA 3KLIA 2GUIA 4BG8A 4BR4A 3V4IA 3EL2A 1KC8O 4OPJA 3HL8A 4CEAA 4O8KA 2QEXN 4M63C 1ATSA 4IJAA 4FJMA 4DG1A 2F7TA 3LWMA 4F2RA 3WQUA 2ZD1A 4B3MK 4F8RA 1QVGM 1WAJA 5FPMA 4WF9L 3VQ4A 2VG5A 1D9DA 1XUPO 1LAWA 2HBLA 1TK0A 3A5LC 1QQMA 4DR2K 2FBTA 3LPUA 2CGJA 4Q5VA 1LV5A 4CJFA 5C42A 1GLDG 2KZMA 4E89A 4I7FA 3EYZA 1SKWA 4NLCA 1B9FA 3MECA 3CJCA 4M7YA 1VSFA 3TANA 1DEJA 5KGWA 1Q8IA 4YFUA 2LSNA 1RBVA 3HVTA 1SL2A 1HR0K 4YOXA 4MQ3A 1C6VA 3QNOA 2W40A 3LP3A 1HNVA 1ZBIA 2HHHK 4N5SA 4M3UA 3DLKA 1FJGK 4OKJA 4BR9A 3OJUA 4CJ4A 1KVBA 2G8WA 1XQSC 1X9WA 1SAZA 3G4SN 1UA0A 3MEGA 4IKFA 5JMVA 4KKOA 2OPPA 1ZBHA 1G15A 3WXMB 3CERA 4BRAA 2QWPA 3KWGA 2P9LA 3D0PA 1UOCA 4FZXC 3BDPA 1YTAA 3NAEA 3THWB 1BU6O 3QICA 1LCUA 4KAZA 4IXCA 2D0AA 3CQ8A 2IS3A 4CGJA 4CBXA 3ZT3A 2Y1JA 3MX5A 4BRCA 5AZJA 2D0CA 5ELZA 2V7YA 5LMNK 1XMOK 2O4GA 1S1TA 4CZFA 1C1BA 3M8SA 1T7PA 3ZSQA 3PX4A 1EWRA 4FSVA 5HRNA 4KPYA 4H5VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4NLB A;  3PX0 A;  1LWE A;  3SMP A;  3BZK A;  5AQR A;  3SK3 A;  4BRN A;  3O4Q A;  3UB5 A;  2ZGY A;  5AQK A;  3QBX A;  3OYN A;  4DFK A;  3F5T A;  4CCH A;  4CED A;  3THV A;  3LAL A;  3OYC A;  3S41 A;  4OJR A;  2QW9 A;  3CME N;  4DQI A;  4J2E A;  5KGX A;  5KPZ A;  2P9P B;  1QZ6 A;  3SQ2 A;  1EWQ A;  5FRM A;  5JIC A;  3O6W A;  2OCE A;  2GWJ A;  1I3A A;  1OVY A;  1K9M O;  4JK9 A;  1IBK K;  3I0S A;  2O8E A;  4DQQ A;  4IDK A;  3AVK A;  5EX5 A;  3OYH A;  4KRF A;  4OLB A;  1QQN A;  3GDQ A;  3QFU A;  4J2D A;  2FF6 A;  4DF4 A;  1NLV A;  5J2M A;  4CEF A;  4MLE A;  1TKZ A;  4JKD A;  4DTX A;  3U8X A;  2HNZ A;  4IFE A;  2A3Z A;  3NVM A;  1S22 A;  4GMJ B;  3P83 D;  4JKG A;  3KLF A;  2HBJ A;  5SZT A;  2RF2 A;  5FLX O;  4JYA K;  3VMF B;  3DAW A;  3KLE A;  5KQ8 A;  3LDN A;  1SUQ A;  3RMD A;  4L8R B;  2HHS A;  3AO4 A;  3ZSO A;  1SKR A;  1LAV A;  5GAD P;  4BRE A;  1BG3 A;  4B3S K;  3DLR A;  3K5N A;  1U2V B;  4CE9 A;  2P9U A;  4FL9 A;  3SAH A;  2F9W A;  4CK3 A;  1MU2 A;  3LDQ A;  3KZB A;  1CZB A;  3W3D A;  3FFK B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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