4QS9A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) mutant s177a structure in glucose-bound form
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
461
structure length
450
Chain Sequence
WGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEDFHLPEGRQRELGFTFAFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDQKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSGIGAALLAASHSLYLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hexokinase-1
molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 155
structure length 450
sequence length 461
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs9A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs9A01
4BRAA 2QWNA 1HKCA 1T6CA 1KAYA 4IXCA 2A6AA 1RFQA 3MN5A 4DHYA 3FGUA 4WYBA 3FLCO 2IVPA 2CH6A 2Q36A 5LJVA 3WQTA 4QS7A 3A0IX 3MCPA 1ATNA 5CE3A 2BTFA 3GOIA 2E1YA 1K8KA 2FXUA 4H03B 2FSKA 2D4WA 3H6EA 1HKGA 2YJEA 3WXLA 4BC3A 3S41A 3WEEB 5AQJA 3LM2A 2FSJA 3AARA 4JN4A 2ZGZA 5AQLA 4ISGA 2HMPA 1EQYA 4JNEA 4FSVA 4BC4A 3I33A 3VF6A 3R6MA 3O4WA 1MDUB 2FSNA 2VYPA 5AQVA 3VETA 4FO0A 3EKUA 2DPNA 1YAGA 5AQYA 4M63C 2W41A 2IIRA 3IUCA 3D2EB 3WXIA 4CZJA 3H1VX 2CGLA 2QWRA 1WOQA 3ATVA 3VERA 4BG9A 1GLFO 1U2VB 1V4TA 2QWPA 4BVOA 3MMVA 5JICA 4Z94A 5BRHA 4BRLA 1GLBG 2QWMA 4BC5A 3CJAA 2E2PA 5AQSA 4BRIA 4DCHA 3EL2A 4EHTA 3VPZA 4AM7A 2P9IB 5BR9A 2D1KA 4H0TB 4BREA 1Z6RA 3QICA 1S3XA 2FF6A 4XEIA 1Y64A 4BRFA 1NGDA 1NWKA 4A62A 1BA1A 3VGMA 4B1YB 1SAZA 3LDNA 3U8XA 3LM9A 1BUPA 3WEEA 4B1VA 3F9MA 2A40A 3O1BA 2HF3A 2A3ZA 4H0YB 4ISEA 2YI1A 1NGBA 4RTFD 1QQOA 5EY4A 4FWNA 5KQDA 3HBTA 5BPNA 3DWLA 4E1JA 3GBTA 4J8FA 3FZLA 4JAXA 2CH5A 4K25A 3GDQA 3D2EA 4BGAA 3AAQA 3HSCA 4H0VB 1K8KB 1NGJA 4RCHA 3FZMA 3QMLA 3W0LA 2P9SB 5E26A 1U2VA 3VENA 3CJBA 1MWMA 4BRHA 4M7YA 4B9QA 1X3MA 3HTVA 1HJOA 3SK3A 3O8MA 3MDQA 4FOIA 1DEJA 5AZIB 3TPQA 3ATUA 5BN9A 3WQUA 1GLLO 4CZHA 3VOVA 4MO4A 5I9EB 2NZTA 2P9PB 3CETA 4XH1A 1XC3A 2E8AA 3CIPA 2V51B 3C7NB 1NGAA 4BRQA 3TU5A 5AQHA 1ESVA 2HOEA 3FZFA 5KPZA 4B1ZA 2PAVA 4FPAA 2GWKA 2EWSA 3CJ1A 4PL8A 3EN9A 5F2RA 2UYTA 4PL7A 3SMPA 2OANA 3DJCA 5ADXH 4CBWA 3LL3A 1ATRA 3LDPA 4BQLA 3A5NC 4WQ4A 3KVGA 4IZ9A 4K42A 3HZ6A 2A5XA 2YHXA 2IVOA 4CZFA 1GLCG 1OKJA 5AQQA 3EZWA 5AQTA 3GE1A 1QHAA 1H1VA 2P9SA 3AAPA 1HX1A 5AR0A 3WXKA 1J6ZA 2VCPA 4FWRA 5AZIA 1BDGA 3WT0A 4JHDA 4BRMA 1NGCA 3VEOA 2GEMA 5JLHA 2P9PA 3KZBA 2V7YA 1NGIA 3QBXA 4IJAA 4CBUA 5BRDA 3C7NA 3VF2A 3J8AA 2W40A 4QS8A 5FPMA 3VGKA 5F1XA 5BREA 2I7PA 3ID8A 3D2FB 5AQGA 1TUYA 4M7XA 3GG4A 3H3NO 4FWSA 3FZKA 3U9ZA 1TYQB 5AQPA 3OHRA 3A5LC 3LDLA 1S22A 1HUXA 4IJNA 1YUWA 2YJFA 5ADXA 3B8AX 2ASOA 2P9KA 3ENHA 2ASPA 2QWLA 1KAZA 3HI0A 4A2AA 5LY3A 2AP1A 3GL1A 2GUPA 5KQ8A 4AM6A 4Y0WA 5EXWA 2GELA 1GLAG 1HKBA 4HTLA 2QWOA 4EAHD 2J4RA 1JCEA 1QQNA 2QXLA 1XQSC 3CQYA 4DB3A 4MLEA 1C0FA 5TKYA 4FWMA 5ELZA 1XUPO 1LCUA 2ZF5O 2Q0RA 2E20A 3L0QA 4H5NA 4YDUA 5AQZA 3VEVA 1MWKA 3D2FA 3MN9A 3UE5A 4CD1A 4CBXA 3KHYA 3ZETB 3DAWA 4FOEA 2WUSA 3VEZA 3U9DA 1TYQA 1NGFA 4KBOA 5AQXA 3HM8A 3EO3A 4FWQA 3BUZB 4CZKA 2ZWHA 5AZJB 4MLHA 2CGJA 2YCHA 4JHDB 4IO8A 3DXKB 1ZC6A 5BRFA 2GWJA 2ASMA 4WQ5A 5E84A 3MN6A 4BVPA 1BU6O 2ITMA 4CZLA 1Q18A 5B8HA 2P9UB 2AA4A 5BPMA 1DKGD 2F9WA 1QZ6A 1RDWX 1YXQA 1G99A 1T44A 4EHUA 3ZX0A 2HF4A 4H5TA 4A2BA 4K43A 4XH4A 3FZHA 3O80A 3U4LA 5AQOA 5F0XA 4HWIA 4JD2B 2FLOA 3IDHA 1NM1A 3A5OC 3H45C 2NRHA 4FPBA 4QS9A 2BUPA 5LJWA 3A8YA 2P9KB 4CD3A 2KHOA 4I6MB 3L6QA 5EVZA 1C0GA 2QW9A 2P9LB 3ZX3A 5AFUH 4BC2A 3ZETA 2A42A 5BPLA 1JCFA 3FE1A 4PKIA 3UKRA 4H0OA 3SLCA 4B1WB 4BROA 4WQ4C 2Q0UA 3O5BA 5AQNA 2E1ZA 4BR0A 3C0BA 3UB5A 1NMDA 3QFPA 5AZJA 3DXKA 1IJJA 3QBWA 3WUHA 1RGIA 4F9OA 1LOTB 4BR5A 1E4FT 5KPTA 3R8EA 2D0OA 4ISFA 4FWKA 1E4GT 2P9UA 3QB0A 5FPEA 4C23A 4NB4A 1Z05A 3UKUB 2Q2RA 4BRKA 4CZGA 3O6WA 2ZGYA 4H5WA 3ENOA 1KXPA 4XH5A 3M3ZA 4CZEA 1GLJO 1NBWA 4JD2A 3VF4A 5JMVA 4H0XB 4FL9A 3BF1A 3MK6A 1YVNA 4BRCA 1ZXOA 5AQIA 2V7ZA 3M1FA 4CZMA 3P4IA 3H1QA 3IFRA 3ZEUB 2CGKA 4CJ7A 3DXMA 4I6MA 3BP8A 1T6DA 3WXJA 2P9LA 1BO5O 3CJCA 4FWOA 2VWBA 4BG8A 2A41A 3CHWA 2YHWA 4NO7A 5EOYA 4IWVA 4CI6A 5AFUA 2I7NA 3ZX2A 3AY9A 3W3DA 5AQUA 3L4IA 2GTDA 4O8KA 4BGBA 2P9NB 2E88A 4BRDA 2QM1A 1BA0A 3ULEB 2PBDA 4L3QA 1GLEG 3VESA 3CI5A 4EIAA 3JXUA 1NGGA 4PKGA 1V4SA 2Q31A 4GNIA 1TUUA 2V52B 3RSEB 4BR9A 3I8BA 3H3OB 1JCGA 2NLXA 1ZBSA 2Q97A 3BF3A 3UKUA 4RWTA 1IG8A 2E2NA 5JLFA 3LDQA 2E2OA 4A61A 3O08A 3FR0A 3EKSA 1MA9B 4PKHA 3M6GA 4DQ8A 1HLUA 1NGHA 1DGKN 2F9TA 3BEXA 4YDUC 1ATSA 5AQMA 3UKRB 2D0PA 5AQWA 3SJHA 4H5VA 3IMXA 4BRNA 3FFKB 2YHYA 1X3NA 5EX5A 4BQZA 3A5MC 3LDOA 3ZEUA 1BWFO 3JS6A 2Q1NA 4B1UB 3H46O 1HPMA 3CJ7A 2QWQA 4FWLA 4K41A 3QFUA 4MO5A 1SQKA 1BG3A 1NGEA 3CERA 2IVNA 3MN7A 1NLVA 3CQXA 1U6ZA 4BR4A 5AQRA 4BR2A 4WQ5C 1QQMA 3QDKA 4BRGA 4H5RA 3VEXA 2P9NA 4BR7A 5KPRA 1D4XA 3ULEA 4FWPA 3R9PA 4B1XB 2FF3B 2P9IA 1WUAA 3VGLA 1QZ5A 4LC9B 3RSEA 4EFHA 1CZAN 1GLDG 1KAXA 1P8ZA 1X9JA 3VEYA 5FPDA 3DXMB 1SZ2A 1R59O 4O5FA 5BN8A 5FPNA 4CZIA 2H3GX 3D7EO 3CJ9A 1BOTO 3G25A 4H0PA 3VEWA 4GY2B 3SMSA 4BRPA 5AQFA 2E2QA 5AQKA 3O1WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IKFA 2F7TA 2O4GA 1T6CA 1KAYA 1KVCA 3V9XA 1QQCA 3PX4A 1LWCA 1U04A 5CY4A 1TGOA 1K73O 4CF9A 3MCPA 5CYQA 3G0ZA 4K0KK 3GOIA 1NMNA 2D4WA 3L2QA 1RDDA 4CEDA 1CZ9A 3OS0A 3NDKA 4DV1K 1ZBLA 4AHSA 4M3RA 1S1TA 3SAFA 3AARA 4JN4A 2ETJA 4DQSA 4Z4EA 1EQYA 4NXNK 4CJKA 3SQ1A 1UOCA 3VQBA 5AQVA 3VETA 4FO0A 1BI4A 2G8KA 2XHBA 3EZ5A 1B92A 1M1KO 2VG5A 4JKHA 4PY5A 1JKHA 3WXIA 2QWRA 3KD1E 2YKNA 3TAMA 1GLFO 1U2VB 3O4QA 1BHLA 3CM6A 2O8EA 4Z94A 5BRHA 4W5TA 4QOZB 5C42A 1R0AA 2E2PA 4DCHA 4GMJB 4F2RA 2P9IB 4Y1DA 4O55A 2D1KA 3C6TA 3I0RA 1JXEA 4FJ8A 1S3XA 4BRFA 1NGDA 3NCIA 4CEAA 4JK7A 4B1YB 4FJHA 2R7YA 4B1VA 3O1BA 1FW6A 2A3ZA 4CJQA 1NK9A 1ILYA 4ISEA 2OTLN 1QQOA 3MCAB 5EY4A 1BGXT 5C12A 1DTTA 3NAEA 3L3VA 1WSGA 4MDAA 4DLGA 4ICLA 1E3MA 4J8FA 5DMRA 3FZLA 4E7IA 2LSNA 1A5VA 2D0CA 4IOCL 3HSCA 4YORA 1VSHA 2PY5A 1K8KB 3FZMA 3QMLA 4RW7A 5E26A 1U2VA 1U45A 1XNRK 2YNGA 1C0TA 4E7JA 3O8MA 2ZJRL 4WCEL 1DEJA 5AZIB 2W6LA 4HUFA 1OH8A 3TPQA 3ATUA 1TKXA 3RMAA 2QKBA 3J7YP 1I39A 3KK2A 3L2WA 3CETA 4U67L 1XC3A 2E8AA 1RDUA 3KWGA 4CERA 1NGAA 3V6DA 3VQ7A 1ESVA 3KLIA 2HOEA 2HNZA 3R3LA 4H4MA 4WE1A 3MEDA 3SPZA 5KPZA 1Q86O 3AVAA 4WF9L 4JKBA 5C2DA 4KHPK 2GWKA 1S6QA 2UYTA 4MFBA 3TSQA 2A1RA 3T1YK 1VHXA 3LL3A 4CGDA 4CHZA 4OKEA 2HW3A 4DSIA 4DMNA 4CGGA 1GLCG 1QHAA 3ZT1A 4GV6A 4DQRA 3AVNA 1VSJA 3WXKA 4LF8K 3CCRN 3DM2A 3SQ2A 5AZIA 1UWBA 4W5RA 4JK9A 5LMUK 2NRTA 1WBBA 4NYNA 3SV4A 1IKXA 5JLHA 5KI6A 2V7YA 1NGIA 5FROA 3OYKA 2HNYA 2UUBK 3J8AA 3V1OA 4QS8A 4RW8A 5FPMA 5BREA 3D2FB 1S9EA 3OS2A 1NG9A 3GG4A 3U9ZA 3A5LC 3LDLA 4DWIA 4BE0A 3QNNA 4BWJA 3AO2A 4JKDA 1T7PA 3B8AX 3SJJA 1W9HA 1L3SA 3VQPA 3SQ0A 2O8FB 5KQ8A 1J5EK 1HKBA 4DQIA 4X65K 1VQ5N 3EE9A 2JGUA 4DB3A 4B9MA 3E9PA 1ZYQA 3NVKA 4B8AB 2Q0RA 4M42A 3DRRA 1K9MO 3HP9A 3RMCA 5AQZA 4JI6K 5HRSA 3D2FA 1J9AA 3DMJA 1FXXA 4CBXA 3HRGA 1JL2A 3P31A 3ZETB 3NH0A 1RDCA 5KRTA 1RT2A 1VQ9N 4KBOA 3AA4A 3HM8A 4IOAL 1LW2A 4CGHA 4WFBL 3P38A 3DXKB 1ZC6A 2WFBA 4OJRA 4E1MA 1S72N 4DR6K 2O8FA 2RE2A 2QTDA 4BVPA 4CESA 1X9SA 1SL0A 3VTIA 3KKSA 1VQNN 1HR0K 4CVNE 2X6NA 3TTDA 1LAVA 5B8HA 2AA4A 4F4KA 1CZBA 5BPMA 4DTSA 1XMOK 3DRSA 4ID1A 1T44A 4OO1J 4I2QA 2GUIA 3L8BA 3O4NA 5F0XA 3QETA 2FLOA 3IDHA 3J81O 3H45C 5EU7A 4CHNA 2ZM6K 4KV8A 5HP1A 1RT1A 2P9KB 2QI2A 4CD3A 2O8DA 3OYBA 2QW9A 3VN5A 1NKBA 1KTQA 3T1HK 4BC2A 3ZETA 4CJPA 1JCFA 4B1WB 4BROA 3HVRA 4JRPA 1JLGA 4KH5A 3OS1A 2IDOA 1JJ2M 2XRIA 4JK8A 4BR0A 3CCVN 4CJTA 3KK1A 1O1WA 3DXKA 3THVA 1T3VA 3HYFA 3QBWA 4KFBA 3F2KA 4BR5A 1E4FT 4CF8A 3HPGA 3MXJA 3VQ8A 5DM6L 4CF1A 1E4GT 2HBJA 1QSYA 4KB0A 5HROA 2XO7A 1Z05A 4WFAL 3UKUB 2XY8A 4JEPA 4BRKA 1KLMA 4FM0A 2B6AA 3PX6A 3HPOA 4FL9A 3BF1A 2IOCA 1ZXOA 3CFOA 5AQIA 3H1QA 3TAFA 1RTIA 2HHVA 1T6DA 4F2SA 1RDBA 2XY7A 4CEBA 5AFUA 2IC3A 1WAFA 4A59A 5AQUA 5J2NA 1RTHA 1KFSA 3THWB 3DLGA 4AHRA 2QA4N 3K9KA 1IBKK 4YOVA 4EIAA 2JLEA 3JXUA 1NGGA 1YTAA 3MWTA 1WAJA 2NLXA 4BDZA 3BF3A 2RF2A 3UKUA 1KFDA 2IGIA 1NK7A 4B9SA 4G1QA 1HLUA 1DGKN 1UA1A 3C95A 2VQEK 1IBLK 4I7FA 3J7AP 3FFKB 2YHYA 4FJXA 3AA3A 1KRPA 5EX5A 4AF1A 4JI0K 4GW6A 4CFAA 3JS6A 4B1UB 4JLHA 2QWQA 4N5SA 1SQKA 4CFCA 4HHTA 2BANA 1U6ZA 4BR4A 4BR2A 1K6YA 2NRWA 1HYVA 3THWA 4BR7A 3KTQA 2KZMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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