4QS9A

Arabidopsis hexokinase 1 (athxk1) mutant s177a structure in glucose-bound form
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
461
structure length
450
Chain Sequence
WGRVLAILKAFEEDCATPISKLRQVADAMTVEMHAGLASDGGSKLKMLISYVDNLPSGDEKGLFYALDLGGTNFRVMRVLLGGKQERVVKQEFEEVSIPPHLMTGGSDELFNFIAEALAKFVATECEDFHLPEGRQRELGFTFAFPVKQTSLSSGSLIKWTKGFSIEEAVGQDVVGALNKALERVGLDMRIAALVNDTVGTLAGGRYYNPDVVAAVILGTGTNAAYVERATAIPKWHGLLPKSGEMVINMEWGNFRSSHLPLTEFDHTLDFESLNPGEQILEKIISGMYLGEILRRVLLKMAEDAAFFGDTVPSKLRIPFIIRTPHMSAMHNDTSPDLKIVGSKIKDILEVPTTSLKMRKVVISLCNIIATRGARLSAAGIYGILKKLGRDQKSVIAMDGGLFEHYTQFSECMESSLKELLGDEASGSVEVTHSGIGAALLAASHSLYLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hexokinase-1
molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 155
structure length 450
sequence length 461
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4qs9A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4qs9A01
2HF4A 3CJ7A 1RDWX 3DXKB 4RWTA 1ZBSA 3AARA 4PL8A 4A61A 2FLOA 1BA0A 3CJAA 1QQMA 3L0QA 4EHUA 1QZ5A 3LDQA 2ASOA 5KPZA 1YUWA 4FWOA 5EX5A 4MO5A 3O80A 4JAXA 4EHTA 5BPLA 3CIPA 2ASPA 2CH6A 3WUHA 1HKCA 3WXIA 3QBWA 1X9JA 4PKHA 3MN5A 4BC5A 2P9KA 3HM8A 1QQOA 3QB0A 3SJHA 4M7YA 3HZ6A 1WUAA 3O8MA 1ATNA 3FFKB 4BG9A 1XUPO 2E2NA 4B9QA 4EAHD 4H5WA 5AQJA 5FPMA 1MWKA 5AR0A 4RCHA 3DJCA 1OKJA 4BRMA 5AQRA 2ASMA 3WQTA 1QQNA 2FF6A 1GLLO 2A5XA 5AFUH 2PBDA 1YXQA 4H03B 3FGUA 4QS8A 1U2VB 3A5LC 3A5MC 4FWMA 2P9UB 4B1ZA 3LDPA 1BA1A 2AP1A 2CGKA 5KQDA 1BWFO 1X3NA 2FSNA 1HKBA 3ULEB 2YJFA 4FOEA 4BR7A 2Q0RA 2NRHA 3VPZA 3DXKA 3FR0A 3ZEUA 4A62A 2Q2RA 2GWKA 4JHDB 4HTLA 3DXMA 1J6ZA 3UKRB 5ADXA 2Q31A 5AZIB 3UKUB 4BR9A 3U9DA 2QWRA 3IUCA 3IDHA 3MDQA 3M6GA 3VEWA 3EKSA 2AA4A 3DWLA 1IJJA 2P9LB 1ESVA 3A5NC 5BN8A 2V7YA 1Z6RA 3ENHA 3ZX3A 4BRAA 3CJ9A 4K43A 4BRDA 4RTFD 4B1YB 1RFQA 3AY9A 1DGKN 5AQZA 2QWMA 3A5OC 4I6MB 3ZETB 4QS9A 1CZAN 4GY2B 5I9EB 3MN7A 4B1UB 4EIAA 2P9SB 2GELA 2E2PA 1R59O 3C7NA 1LOTB 2IIRA 5AQHA 2QWPA 3O1BA 1S3XA 4FPBA 4K41A 3UB5A 2IVNA 3QFPA 3BEXA 2A3ZA 1U2VA 3VESA 1GLFO 2P9UA 3QBXA 2P9KB 4H5VA 5KQ8A 2E88A 4Z94A 1NGHA 3U9ZA 1C0GA 2QWQA 2QW9A 4K25A 4QS7A 5AQIA 3SK3A 3EZWA 3WEEB 3CQXA 3O08A 4BRGA 1NMDA 1K8KB 3QMLA 4BRCA 2YCHA 5AQVA 3U8XA 4JHDA 3KZBA 4XEIA 2QWOA 3UKRA 4CBXA 2E1YA 5AZJB 5AZIA 3UKUA 4FL9A 1HLUA 3W3DA 1RGIA 1NGEA 4B1XB 3H3OB 3EN9A 1GLAG 1NGBA 4WQ4C 4H5RA 2FSKA 4CZFA 2P9LA 3ZEUB 4BROA 3CERA 4PKIA 1U6ZA 3A0IX 3DXMB 2WUSA 2F9TA 3LDOA 3GL1A 3VF6A 3CI5A 1V4SA 4I6MA 3A8YA 1TYQB 3QFUA 3ZETA 3MN9A 2FSJA 2D0PA 1IG8A 2P9SA 4PKGA 4BGBA 4FWRA 1P8ZA 3AAPA 3LDLA 2VYPA 2ZWHA 5BPNA 3CHWA 5BPMA 1T6CA 4BC4A 1T44A 3O1WA 4O8KA 4ISEA 1MA9B 1MDUB 4BRQA 5EVZA 3D7EO 4CD3A 4BRKA 3CJ1A 4KBOA 3P4IA 3I8BA 1JCGA 2NLXA 4LC9B 4BC2A 1DKGD 4MO4A 3H46O 3WEEA 4BG8A 5EY4A 2FXUA 1K8KA 1BU6O 1ZXOA 3H45C 1KAZA 2E2OA 3SMPA 3TU5A 3C7NB 2DPNA 1GLBG 2VWBA 3VEZA 5F1XA 5KPRA 5BR9A 5AQGA 5AZJA 4BGAA 3IFRA 1JCEA 1C0FA 5AQFA 4CI6A 5AFUA 3H3NO 3ID8A 2J4RA 4WQ4A 1KAXA 4DB3A 1TUYA 4WYBA 2Q0UA 5AQPA 3VGLA 3HTVA 1NGDA 4JN4A 1S22A 5FPEA 2CGJA 3D2EB 3H6EA 1ATSA 3S41A 4HWIA 5E84A 2QWLA 1D4XA 3VOVA 1TYQA 3VEVA 4L3QA 2A6AA 5LJVA 1DEJA 1E4FT 3GG4A 5AQYA 5EOYA 1BG3A 4E1JA 3EL2A 4XH1A 4H0TB 4IZ9A 4MLEA 3R8EA 2E20A 3MN6A 2PAVA 2OANA 4BRHA 5F0XA 4JD2B 4ISGA 3L6QA 1KXPA 4A2AA 5BRFA 3JXUA 5B8HA 1TUUA 2IVOA 4DCHA 4H0PA 1NBWA 2P9NA 4FSVA 3VERA 4BR4A 1NGFA 2QXLA 2Q97A 2F9WA 2ZF5O 3LDNA 4H0YB 5KPTA 2D1KA 2ZGYA 3VEYA 3W0LA 2Q1NA 5FPDA 3CETA 3RSEA 5E26A 4CD1A 3L4IA 4B1VA 4MLHA 3CQYA 1NM1A 4BRLA 4CBUA 3EKUA 2CH5A 2HOEA 3FZMA 3G25A 4BRFA 5AQOA 2I7PA 4FWQA 3VGMA 4CZEA 2YHYA 4PL7A 1SZ2A 4BQLA 1Y64A 5AQXA 2A41A 4FWNA 4FWKA 4NO7A 1HX1A 3D2EA 3IMXA 4GNIA 3M3ZA 1JCFA 3UE5A 4H0XB 5CE3A 2E1ZA 4CZKA 3MK6A 3ZX2A 3WT0A 2GEMA 3C0BA 3HI0A 2W41A 2W40A 5F2RA 4CBWA 4FWPA 3VF4A 3R6MA 1HJOA 3WXJA 2QWNA 1NGAA 3LL3A 3I33A 4IWVA 3HSCA 2CGLA 4JD2A 5BREA 4YDUC 1Z05A 3FZHA 3ZX0A 4B1WB 5JLHA 3WQUA 4WQ5A 4F9OA 3GE1A 3ENOA 4IO8A 5LY3A 2P9IB 1BOTO 3EO3A 4BVOA 3FLCO 3GBTA 4CZJA 4CZLA 1EQYA 1GLJO 3B8AX 3VF2A 3O5BA 5BRHA 1SQKA 4FO0A 5JLFA 4BQZA 2ZGZA 2YHXA 2NZTA 1BUPA 3H1VX 3O6WA 4BR5A 1YAGA 4BRIA 3R9PA 2BUPA 4FWSA 1NGCA 2I7NA 2P9NB 1H1VA 4DHYA 2H3GX 1T6DA 3FZFA 2Q36A 2D4WA 2GTDA 3BP8A 2QM1A 3VETA 3KHYA 1ZC6A 4BREA 2D0OA 3RSEB 4BVPA 4IJNA 3BUZB 2FF3B 2P9PB 2HMPA 4CZHA 3JS6A 1HUXA 3HBTA 5TKYA 4BRPA 3AAQA 3J8AA 3H1QA 2KHOA 4CJ7A 5AQNA 3LM9A 3MCPA 4YDUA 3BF3A 2GWJA 4AM7A 1ATRA 4CZMA 1GLEG 4DQ8A 4XH4A 1MWMA 4H5NA 4XH5A 4EFHA 2EWSA 2P9IA 2YHWA 1SAZA 5JICA 1YVNA 3D2FA 1QZ6A 4C23A 1QHAA 3VENA 2BTFA 5ADXH 3DAWA 5EXWA 5BRDA 3VEOA 1NLVA 1WOQA 2GUPA 3TPQA 1X3MA 1E4GT 1NWKA 4H5TA 4J8FA 4WQ5C 4IXCA 5BN9A 3QICA 5LJWA 3GDQA 3ATVA 3FZLA 3CJCA 3LM2A 1GLCG 4O5FA 4NB4A 3M1FA 1LCUA 3VGKA 4H0VB 5AQWA 5AQUA 1NGIA 1V4TA 4K42A 2V51B 3FZKA 5ELZA 1Q18A 2P9PA 5AQQA 2V52B 1GLDG 4JNEA 2E2QA 4FOIA 1XQSC 5FPNA 5AQMA 1XC3A 2IVPA 1G99A 3QDKA 2ITMA 2A40A 4AM6A 2V7ZA 4BR0A 4M63C 1KAYA 5JMVA 1NGGA 4CZIA 4M7XA 3U4LA 3WXKA 4BC3A 4CZGA 4FPAA 3GOIA 1NGJA 3MMVA 2E8AA 3FE1A 3ULEA 4A2BA 5AQSA 5AQKA 2YJEA 4ISFA 3BF1A 4FWLA 2UYTA 5AQTA 3SLCA 1BDGA 3VEXA 4Y0WA 2A42A 2YI1A 3F9MA 3CJBA 3SMSA 1HKGA 3KVGA 3WXLA 5AQLA 2HF3A 3OHRA 4BR2A 4BRNA 1HPMA 4IJAA 3ATUA 4H0OA 3D2FB 3O4WA 1BO5O 2VCPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HF4A 1B92A 1RDWX 3MXJA 2OCEA 4OVLA 2UXDK 4PL8A 4A61A 1U48A 4DTUA 3L0QA 4N56A 2PZSA 3KK7A 1YI2N 4KHYA 2UU9K 1SKRA 4U67L 5EX5A 1W7AA 1ZBFA 3CIPA 2ASPA 3WUHA 1SKWA 3WXIA 1RBUA 3QBWA 4BC5A 4O0JA 3HM8A 3THXA 2UXCK 2YX6A 2KZZA 4M7YA 4I2PA 4N5SA 1J9AA 3DOKA 5FPMA 2NRVA 5AR0A 3ZSXA 4AHUA 4CECA 1WBDA 1VSLA 2FF6A 1NNEA 4N76A 2P5OA 4DU4A 2PBDA 2HSTA 4C8MA 3NH1A 3VQ9A 3HVTA 3KK2A 1BA1A 4CF0A 5FROA 4KHSA 1X3NA 3HO1A 4CF2A 2UXBK 4AH9A 2Q0RA 1VSJA 3FR0A 5M1NA 3T3FA 1J6ZA 1RBRA 4I9LA 3I8DA 2G8VA 3UKUB 4BR9A 2QWRA 3WNFA 1KSPA 2A1RA 1QSLA 3EKSA 3E1YA 3DMJA 1TK8A 2KFZA 1ESVA 4WFAL 2V7YA 3ENHA 3ZT1A 3ZX3A 3CJ9A 1HMVA 4FLTA 2JWLA 3E01A 4W5NA 1C0TA 3L2UA 3RMDA 3CFRA 2HVIA 4GY2B 3ULDA 4DS5A 1O13A 2NRXA 1C6VA 1R0AA 4M3TA 5C0YA 3C7NA 4HUGA 1LOTB 3VQPA 4F2RA 4F4KA 3AVBA 2QWPA 4K41A 3OBYA 3D45A 1T05A 1VQMN 3BEXA 3KKRA 5SWMA 2A3ZA 3M8PA 4CHNA 1GLFO 2P9UA 5KQ8A 2P9KB 4H5VA 2BH1A 4CFDA 4Z94A 4CK2A 3QIPA 3CQXA 3AVJA 3QMLA 1LW0A 4FW1A 1RBSA 4QCLA 4FJ5A 3KZBA 4XEIA 3CCUN 3KJVA 3UKRA 4CBXA 5GAEP 2P1JA 1K6YA 3OA9A 4E7LA 4YOXA 4CJRA 4FL9A 3O9SA 4BE1A 4GVEA 3EY1A 1NGEA 3LAKA 4B1XB 1XNRK 1J53A 1UAXA 3AVGA 4H5RA 3A2FA 2B5JA 1KFSA 1ZBLA 3KLHA 1IBKK 2F8TA 3DXMB 2WUSA 2F9TA 4UQGA 1V4SA 3DRRA 4I6MA 1RTIA 5HROA 3E9LA 4BGBA 1VK0A 4FWRA 1NKCA 3LDLA 3OVNA 4FVUA 3RWUA 1T44A 5HP1A 3O1WA 4CD3A 5EVZA 2O8EB 4DTXA 3P4IA 2HMIA 4LC9B 3BGRA 4KH4A 3F2KA 3PX6A 2FXUA 3H45C 2NRTA 2E2OA 1IKXA 5F1XA 2UUBK 3KLIA 2I5JA 4DSEA 5AZJA 3IFRA 3CMAN 5AQFA 1RT4A 3H3NO 3ID8A 4JI2K 4HCBA 1TUYA 4LD0A 3LPTA 2VG7A 2Q0UA 5AQPA 1VSHA 3VGLA 3PIPL 3M8QA 1W0HA 3HTVA 4E0DA 3QINA 1N6QA 2CGJA 3D2EB 3TAPA 4HWIA 1D4XA 1T3VA 1TYQA 2OPRA 3VEVA 2HHSA 3THYA 1NKEA 2OYQA 3NMUA 4F3OA 3HYFA 4FJ8A 4QAGA 3Q7CA 4JI6K 4MLEA 3R8EA 2BANA 2PAVA 5F0XA 4JRQA 4JD2B 3LALA 4JI5K 1W97L 1VQ6N 2ATQA 4FSVA 3L4QA 4WFBL 4DMNA 4DQRA 3LDNA 4E3SA 5I42A 2D1KA 5FPDA 4CD1A 4B1VA 3ZT0A 2CH5A 4BRFA 3SQ1A 1J5EK 1HNWK 3HK2A 4DR2K 4FWQA 2YHYA 4PL7A 1SZ2A 5AQXA 3NFAA 4GNIA 3M3ZA 2G8WA 1JCFA 3RRGA 3ZT4A 4IFEA 1JXBA 4LF4K 3HJFA 4EP5A 2GEMA 3SV3A 2GV9A 2W40A 3HI0A 4KO0A 1U45A 3QEWA 1WN7A 2QWNA 4RW9A 3LL3A 1NOZA 4IWVA 3HSCA 1Z05A 3ZX0A 4M42A 4DG1A 4B1WB 4IBNA 3CYMA 3CCSN 1VRUA 4OGCA 3O3HA 1BIUA 1S72N 4CFBA 3ALYA 4N47A 4CZJA 3SUOA 4FZYA 2O8DA 4O5BA 1GLJO 4CJFA 5BRHA 3OYKA 4LFAK 4MDAA 2YHXA 2NZTA 1BUPA 3O6WA 3MWPA 4PA1A 4BR5A 2G8KA 4BRIA 1YTUA 2BUPA 4DKWA 4FLZA 2I7NA 3F5TA 1L3TA 1Q7YO 4GMJB 4CJTA 2Q36A 3AA3A 3O4NA 4FM2A 1IBLK 2QM1A 3TTCA 4E7KA 5HL7L 5HRPA 1ZYQA 3TWHA 4CZHA 1EXQA 1NU0A 3JS6A 4BRPA 4Z4CA 4V19S 5SZTA 3J8AA 3H1QA 4CJ7A 3C6HA 2HBJA 2KLAA 4AM7A 4I7FA 1ATRA 4C1NI 3MWTA 1LAWA 1MWMA 3RTVA 4H5NA 3NGYA 4XH5A 1DLOA 2P9IA 2YHWA 4DV3K 4MQ3A 5JICA 3QO9A 3D2FA 3SI6A 3CC7N 3DAWA 5EXWA 4BWJA 1WOQA 4CF9A 3OJUA 1IO2A 3JSMA 1J5OA 1C0MA 4JI1K 3O9QA 4JV5K 2X6NA 2PY5A 2O8BA 3ATVA 4Z4FA 1VQ8N 1VQ4N 1GLCG 2RN2A 3BZKA 3CM5A 1BCMA 2RHKA 4CEZA 1DTQA 4ILGB 1T8EA 4CEFA 3FZKA 3SAGA 1RBTA 4W5QA 4DQQA 1C1AA 3CFOA 3EE9A 5AQQA 1CXUA 2V52B 2BDPA 4JNEA 3AA2A 4YNQA 4RW8A 3HT3A 5C24A 1G99A 3BY5A 2ZD1A 4CESA 4QOZB 4M63C 3F73A 1OH6A 4CZIA 4JS4A 4M7XA 1VAZA 4PUOA 4FPAA 3MMVA 1BIZA 3VQCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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