4UY8O

Molecular basis for the ribosome functioning as a l-tryptophan sensor - cryo-em structure of a tnac stalled e.coli ribosome
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
DKKSARIRRATRARRKLQELGATRLVVHRTPRHIYAQVIAPNGSEVLVAASTVEKAIAEQLKYTGNKDAAAAVGKAVAERALEKGIKDVSFDRSGFQYHGRVQALADAAREAGLQF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
publication title Molecular Basis for the Ribosome Functioning as an L-Tryptophan Sensor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32
total genus 33
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4uy8O00
2ZJQL 3CCMN 2OTJN 1VQKN 1S72N 3PIOL 1OVYA 4IOCL 1M1KO 5DM6L 1Q81O 3G71N 5HL7L 1M90O 3J7ZO 3OW2M 1KD1O 1YITN 3CC7N 1YJ9N 3DLLL 3CCSN 3I56N 1YI2N 5DM7L 2ZJPL 3I55N 4WCEL 1Q7YO 3CCLN 3CC4N 4WFBL 3G4SN 5GAEP 4WF9L 2QA4N 3CCJN 1Q86O 1ILYA 1QVGM 1VQ4N 1VQPN 3CCUN 1YIJN 1VQ7N 5JVHL 4UY8O 1K73O 4WFNL 1VQ9N 4IOAL 2ZJRL 1K8AO 3CCEN 3CMAN 1N8RO 3CC2N 1VQON 3PIPL 1K9MO 1YJWN 3CD6N 1KQSM 2QEXN 1NJIO 3CCQN 1JJ2M 1VQNN 5MLCQ 5GAHP 4WFAL 3CPWM 1VQ6N 1YHQN 3CCVN 3CXCM 4IO9L 3CCRN 1KC8O 1QVFM 1VQLN 1YJNN 1W2BM 5JVGL 5H1SQ 2OTLN 5GAGP 1VQMN 3CMEN 4U67L 1VQ8N 5GADP 1Q82O 3CF5L 1VQ5N 3G6EN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FJ5A 4IEIA 1CLQA 2DFFA 3VQ9A 3OYDA 4CESA 4CJ5A 4JN4A 4BC3A 4AHSA 4CBXA 3SUOA 2OCEA 4JV5K 1BU6O 3SJJA 2FSKA 3CQXA 3G71N 4IFEA 4E19A 2KFNA 4DUZK 4IWVA 3K59A 3HJFA 3PSFA 4YOUA 4CW7B 4L3QA 2P1JA 4MFBA 4LF5K 5M1NA 4BRFA 2JWLA 3I0SA 4OO1J 2GELA 3QEXA 2O8EB 2AP1A 1QTMA 1RBUA 4OX9K 3DJCA 3E1YA 4OGEA 3HVTA 2P9PA 4WFBL 2OPRA 3O9SA 1VK0A 1U04A 2RKIA 1BI4A 3LZJA 3L4IA 3TAGA 3U3YA 2F9WA 2V52B 4GV3A 4JI5K 5CR4A 3WXLA 3AVLA 3L3UA 3IMXA 4RW6A 3SQ2A 2G8IA 3I33A 1XMQK 4O0IA 3A5LC 4XEIA 3HM8A 4BROA 3HTVA 3VN5A 3FGUA 1VSDA 1N34K 4GVEA 4FJJA 1TKDA 4IG0A 1EETA 3HSTB 5JICA 3M8SA 3AV9A 3SBTA 4DTNA 3DOKA 1WBBA 3WUHA 1BDGA 4ELTA 2P9SA 4YOTA 1VQ6N 1HNVA 4Y1DA 1DEJA 2W40A 2WTUA 4BACA 4DTSA 4CF9A 3AO3A 3WEEA 1NGJA 3VGLA 3C7NA 4DV6K 2YHBA 4A61A 4E89A 4HWIA 1J54A 4BRIA 1S1XA 3ZYYX 3U6FA 4U67L 4KAZA 2E2PA 2YNHA 3THYA 1ESVA 3CM5A 3HOSA 4A62A 3F2KA 2A40A 3PV8A 2PYLA 2HSTA 3LP3A 4OKEA 4L8RB 4FJ8A 3HSCA 2QKBA 4NYNA 4BVOA 3CCMN 3HYFA 3D7EO 1KCFA 4A5AA 5BRHA 1U4BA 1HX1A 1N5YA 3MXJA 4KHNA 3OYKA 2BDPA 4X66K 3EZ5A 2IVPA 1SL2A 3C65A 1KVCA 5HL7L 5HRRA 4KFBA 1HQEA 2D0BA 4WQ4A 4O55A 3EN9A 3EZWA 1NU0A 3O6WA 3J80O 4FK0A 4NYFA 1RBSA 3MXMA 4KREA 1S6PA 3EE8A 4DS5A 4OLBA 2YJFA 3CJAA 1VSJA 2QM1A 4F9OA 2ATQA 3NAEA 3O9TA 1BGXT 3O5BA 3G4SN 2GUPA 3QBWA 1GLDG 1GLCG 4PWDA 4NCBA 2E2OA 4FOEA 5FRMA 1QSYA 4RCHA 3DM2A 1QSSA 3BUZB 1UA1A 1ILYA 4UQGA 1DT9A 3AY9A 3EY1A 2HF4A 3SYZA 1KVBA 2WONA 5D3GA 4KHUA 4YHHK 2YHYA 1TKZA 1T03A 1GOBA 1K73O 3CJ1A 3NH1A 1VQ9N 4O4GA 3L2RA 2HBMA 2NRRA 4RW9A 2P9KB 1WSIA 3S3NA 3D0PA 4PL7A 2WOMA 3GDQA 1RBTA 4AHUA 4KH5A 2UUAK 3HP9A 2G8WA 4CJEA 1EKEA 3MMVA 4GKJK 1YHQN 1A5WA 3MK6A 3A5NC 3OYIA 1VQLN 4JK9A 3UKUA 3MAQA 2YHXA 3LAMA 4BRMA 3WNEA 2XHBA 3DLRA 1NG9A 3K9JA 3FZKA 3VETA 2GTDA 4CHYA 5CHIA 1NLVA 5GADP 4ID1A 1BIUA 2HVHA 2VCPA 3ZSOA 4LSLA 2AJQA 3ZETA 5DMRA 4KI6A 4B1VA 4CEOA 2X6SA 3K5OA 1UAXA 4BC5A 2FBTA 4KO0A 4RG8A 1X3MA 3O3GA 3ZSWA 4HTUA 2UUCK 3A2FA 1TUUA 3U8XA 1J5EK 5HRPA 4HCBA 4M7YA 4BR9A 1BCOA 3IFRA 3BZCA 1V4SA 3EE9A 5C15A 1U47A 1NK8A 3V9ZA 4DQSA 4FZYA 2O4IA 3CCSN 4CHPA 4CBUA 1OH8A 3C6AA 1JCFA 4J2AA 3AVCA 4LF4K 1XI1A 2KFZA 1QSLA 2P5GA 4IDHA 2CGLA 3CC4N 1GLLO 1WLJA 1KLNA 3NVMA 1RTHA 2FBVA 4FLTA 1NGHA 4BR0A 3KTQA 3RMCA 4YDUC 1OH6A 4CVNE 1BCMA 1B9DA 5GIPA 1IBLK 4BY9C 4B3SK 3SAHA 3NF8A 4M45A 4CJ4A 1JL2A 4H0PA 5AQFA 1XMOK 3BZKA 3AVKA 2O8BA 3ZX2A 1GLFO 2IGIA 1NK7A 3U4LA 4FK4A 2HBLA 1HKBA 4BREA 2D5RA 4H0OA 2QEXN 5KI6A 4B3TK 3CCQN 2O8FB 4QS8A 4IJAA 1D4XA 3MN7A 1WB9A 3NF9A 3V9WA 4DTPA 1NK5A 3EKUA 2R7YA 3NE6A 1OH5A 4FJ7A 2P9NB 1QQOA 5ADXA 4M3TA 4BE0A 4BC2A 2GUIA 3ATUA 3LWMA 4DQ8A 1HRHA 3NMUA 3LDSA 3T3FA 5KQDA 1L3TA 1W97L 5FROA 4JKGB 3RR7A 5AQWA 3LZIA 4C8MA 5LMUK 4F2RA 4Z0UA 2XY6A 3SBGA 2HF3A 3DYAA 4PKIA 3MWTA 3KLEA 3QO9A 1JLCA 2IOCA 2FBYA 3O1BA 5HROA 4BDPA 1TK0A 5AQHA 4DQPA 3F73A 4PKHA 3MEGA 2OANA 4JD2A 3QEPA 4O8UA 4W5OA 3PX6A 1KTQA 3LDQA 4DFMA 3DRSA 4FJ9A 3LANA 5AQJA 1RTDA 4FLZA 4AHCA 4FWMA 3QFPA 3AGKA 1SQKA 2Q97A 4J2DA 4E1MA 3ALYA 4YOVA 1DTTA 2W42A 3P38A 1H1VA 3UKRB 4QS9A 3T69A 3OJUA 4B9SA 1Z05A 5LJVA 4KHQA 3NDKA 3CERA 4MLHA 3CCUN 5F0XA 4KHWA 3KK7A 1P8ZA 4PY5A 2UXCK 4H5TA 1TYQB 4BWJA 4O8KA 1GOAA 4CGIA 3VQ7A 3SUPA 4BRNA 1CZAN 4FJHA 3M1FA 4DR3K 3D2FA 3MXIA 2HHXA 1K8KB 1KXPA 3JXUA 5M1FA 1R59O 5AQYA 1S6QA 1BISA 3E66A 3ZX0A 4DWIA 4FWOA 3TARA 2DY4A 3QEIA 4DV0K 4XIUA 3OYCA 1EWRA 1XHZA 3LP0A 3VEZA 3THVA 1SZ2A 1YJNN 2P9IB 4EFHA 5BPNA 2PY5A 4B1UB 4H4MA 3ZEUA 1X1PA 5AQMA 3VQCA 3KWGA 3H08A 1S1TA 1WNSA 4YORA 4M3RA 2ZM6K 4DFPA 4MDAA 4DQIA 4GMJB 2A1SA 4DS4A 4KTZA 2HNDA 3V1RA 1Z26A 5AFUA 2O8FA 3G6EN 3CFPA 4A2BA 5KQ8A 1F21A 5AZIB 1R0AA 3V1OA 3M8RA 1S1WA 2B5JA 3OJSA 1IKVA 1G15A 4CE9A 2V7YA 2O8CA 3BY5A 4DR6K 3BGRA 4OVLA 1JCGA 5KTQA 4FOIA 3L2WA 1EP4A 1GLEG 3QEVA 4KH6A 4DTXA 3OS2A 3O4NA 2V7ZA 3DLLL 4F8RA 4JI4K 3LAKA 1YI2N 5DM7L 1X9MA 4JKGA 1XQSC 3LP2A 2QXFA 3MCPA 3AO1A 3O3HA 2UYTA 4CF8A 3TANA 1U48A 2PFUA 3KD5E 2QWLA 4K43A 4GV9A 1E4FT 3D2EB 4AHRA 4J8FA 4BR2A 2DFHA 4GVMA 5M1PA 3U9DA 3SAFA 3NF7A 1WOQA 1RT4A 2P9LB 1D8YA 2F4VK 5AQXA 1LW2A 3AGRA 1IG8A 5DK5A 4UY8O 1RTIA 3N4QA 4Z4EA 1N32K 1XC3A 3NGIA 2RHKA 2A41A 5FRNA 1IKXA 3CCEN 4E0DA 3TABA 1BOTO 3SUNA 3PIPL 4B08A 3TTCA 4CGGA 4DSEA 1YJWN 4CEQA 1HNZK 1FJGK 1NK6A 2AA4A 4B9TA 4AF1A 2HHUA 2LSNA 3CETA 5HLFA 2NRHA 2XRIA 3DXKB 4JKAA 4G1QA 1W9HA 3WXKA 1NK4A 4Z4IA 3HOTA 2OTLN 4OLAA 3AVFA 4E7HA 4Z4FA 4EP5A 3MEEA 1VQMN 2GV9A 3KHYA 5BR9A 5KRSA 3H3OB 1T6DA 4ICLA 3CMEN 2P51A 4FL9A 1QHAA 1IG9A 3QESA 3CG7A 2HVIA 1BHLA 3C6HA 3QIPA 3ATVA 4FVUA 3L3VA 1WUAA 1WSHA 4DTRA 4IZ9A 3E9OA 4ZTJA 4C8OA 4I9QA 1VSMA 3AAQA 1VQKN 1X9SA 2P9IA 4CFBA 5LMNK 2B4JA 1HNXK 3VQ5A 4GKKK 2Z1GA 4H0VB 3UE5A 1TL1A 4B3MK 4I6MA 4FJLA 3T1HK 4FPBA 1HR0K 5AFUH 4B1YB 1N6QA 3B6PA 4A59A 3O4QA 4CZLA 4DR7K 1WN7A 1OKJA 4B9NA 3THXB 1J6ZA 3EEQA 3MX2A 5GAEP 1UOCA 3GE1A 2BUPA 4KB0A 4G9ZA 1RILA 4RW4A 3OTOK 4RWTA 4LFAK 1IV0A 3QERA 4DB3A 5AQKA 1NWKA 2HMPA 5LL6Z 1ASVA 4OKJA 1T44A 3KJVA 4CJRA 2VGNA 3SLCA 3WQTA 4E7LA 1J53A 3OY9A 5CZ2A 1HMVA 3DRRA 2OZMA 3HBTA 4DSFA 3F5TA 1TK5A 2DTUA 2UUBK 1YVNA 1NJXA 3VENA 2RPIA 1S5JA 3QLHA 3L2QA 4J2BA 1J9AA 2WUSA 4CK1A 4CJUA 3O80A 3TR8A 3D2EA 5J1EA 2KKZA 2UXDK 1VQNN 2E6LA 4CD1A 1Z25A 5BREA 4M7XA 3PO4A 2QWRA 1KC8O 4CEDA 4KHSA 5JVGL 3H45C 4E7JA 4GY2B 4CJVA 4K8ZA 4FW2A 4OPAA 3P31A 4XH1A 2HHQA 1T8EA 2WFBA 3NGZA 4C1NI 3VPZA 2HMIA 1TKTA 1ATNA 2XY5A 1L5UA 4NLBA 3AO2A 3SZ2A 3RSEB 2IDOA 4JEPA 4QCLA 3DXKA 1S22A 3DXMA 1JKHA 1NKEA 2QWOA 1U49A 1W0HA 3HPOA 4FZXC 2CGKA 3ENBA 3QB0A 4DU1A 4IOCL 1YT3A 5C2DA 4H5VA 3BDPA 3CQ8A 5BN8A 1XNRK 4IG3A 3QIOA 3KLGA 3AVNA 1ZBIA 2HOEA 3AA5X 3VF6A 2Q31A 3DLBA 2ZJPL 3GBTA 4IXCA 2FC0A 4M42A 3DAWA 5I42A 4H0TB 5C25A 5AQGA 4BG9A 4FW1A 1NMNA 4AILC 4JI6K 2YHWA 1LAWA 4FLYA 4M3XA 2CH5A 3PUFA 4C23A 2IC3A 4BDYA 4PL8A 1IKYA 4DSJA 1IKWA 3CFRA 1KRPA 1GLJO 1VQ7N 2VGMA 2KZZA 4CJWA 3HZ6A 4CJLA 2A42A 3FZFA 3NFAA 4M63C 4BQLA 4FJIA 2OPPA 3ZT1A 5EX5A 2ZJRL 5I9EB 4DV3K 4DU3A 1BWFO 1YAGA 1REVA 1RCHA 4B8CA 4F2SA 4LH4A 3CJ7A 4IEEA 4W5QA 4C8LA 3O4WA 3VQEA 3TU5A 4FJGA 3WQUA 4JHDB 1NJWA 3P1GA 5GAHP 2HHVA 1ZC6A 2P9UB 4NB4A 4CJFA 1CZBA 3RWUA 1FKPA 3OYBA 3WT0A 3JAMO 1VSKA 1JCEA 3TWHA 2VG7A 4FLUA 2O8EA 2YX6A 3W3DA 2E5LK 1NBWA 4HVJA 5KPTA 1SAZA 2YV0X 1ZXOA 3R8EA 1NK0A 3K57A 5HBMA 4BVPA 1VQ8N 5EY4A 4AHTA 4CZHA 3KK3A 4JS5A 4HTLA 4DSLA 4AQYK 4NO7A 3DLKA 2ZJQL 1LAVA 4JK8A 5SZTA 5KRTA 4BR4A 1HNWK 5LY3A 4TSXA 2QWPA 4RTFD 3F9KA 1QQMA 3LPTA 2ETJA 5CE3A 2ZGZA 1JXEA 3J8AA 3M8PA 4JI7K 1JLEA 3O9QA 1ZBSA 1SUQA 3UB5A 4CHNA 3OW2M 1KD1O 1C1AA 3H1QA 2RF2A 4CK2A 1RDCA 4YOXA 3L4QA 2NNWA 3I55N 3TPQA 2ZF5O 2FSJA 5KPRA 3HL8A 3VOVA 2W6KA 3KWIA 4M3YA 2QA4N 5EVZA 3MWPA 2OPSA 5M1OA 3HO1A 1RDWX 4Q0BA 5J2QA 4GNIA 1X9JA 2YKMA 3T7ZA 2D4WA 3OBWA 4DU4A 5EU7A 4K8XA 3KKSA 3HRGA 3OYLA 4DV2K 3RTVA 3DLHA 4JLHA 4FM1A 2NRZA 1I39A 2QWMA 3OS0A 4CF1A 5EOYA 3RR8A 4DKWA 3SNNA 3CJCA 2OA8A 1RBRA 3CYMA 4EHUA 3HXMA 2A3ZA 4DQRA 3VQ4A 4CEFA 4BQZA 4BE2A 2EWSA 2ZGYA 3H6EA 4DF4A 3ASMA 5AQIA 3VTIA 1X9WA 3FZLA 5GAGP 3NH0A 2BE2A 3C0BA 3C95A 5M1QA 5BR8K 1BG3A 3JS6A 1QZ5A 3W0LA 3OYGA 4PKGA 5KGXA 4E3SA 4JHDA 3ULEB 2D0AA 2IAJA 3RRHA 2P9UA 3H3NO 2QW9A 3NCIA 3LDPA 1KFDA 3E9LA 3O9RA 1XC9A 4CJPA 3QINA 3V9UA 2P9KA 3DOLA 4YFUA 1BA0A 3D6RA 1EWQA 1RBVA 3HM9A 3PSIA 3O8MA 1ZYQA 4FSVA 4K25A 1I94K 4ISGA 5HRSA 4C8NA 3PY8A 1KAYA 1QZ6A 4DG1A 4AH9A 2G8KA 1NGBA 4XH5A 3M6GA 1Q7YO 3CCLN 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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