4UY8O

Molecular basis for the ribosome functioning as a l-tryptophan sensor - cryo-em structure of a tnac stalled e.coli ribosome
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
DKKSARIRRATRARRKLQELGATRLVVHRTPRHIYAQVIAPNGSEVLVAASTVEKAIAEQLKYTGNKDAAAAVGKAVAERALEKGIKDVSFDRSGFQYHGRVQALADAAREAGLQF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular Basis for the Ribosome Functioning as an L-Tryptophan Sensor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32
molecule tags Ribosome
total genus 33
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4uy8O00
1Q81O 3G71N 3DLLL 1VQ5N 2QA4N 3I55N 1YITN 4U67L 3OW2M 1VQNN 1QVFM 4WFBL 3CCLN 1VQ4N 1YIJN 5GADP 1ILYA 2OTLN 5GAGP 1VQON 1VQ8N 4WF9L 4IO9L 3CCRN 1Q86O 3CMEN 1YI2N 1YHQN 1YJNN 5HL7L 3CCMN 3CC2N 3CC4N 1Q7YO 1NJIO 5JVGL 2QEXN 1QVGM 1S72N 3J7ZO 5MLCQ 4IOAL 4WCEL 1M90O 3CD6N 1VQLN 3CCEN 3CCUN 3CCVN 5H1SQ 2ZJQL 4IOCL 5DM6L 1VQPN 3CXCM 1K8AO 3CF5L 5JVHL 3G6EN 2ZJRL 1KC8O 1KQSM 3G4SN 3CCSN 1K73O 1M1KO 3CPWM 2OTJN 1VQMN 1OVYA 1VQ6N 5GAEP 3CMAN 1VQKN 5DM7L 1KD1O 3PIOL 1YJWN 3PIPL 4WFAL 1N8RO 2ZJPL 1VQ9N 3CCJN 1Q82O 1K9MO 4UY8O 3I56N 3CCQN 1YJ9N 5GAHP 3CC7N 1JJ2M 1W2BM 4WFNL 1VQ7N
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C0MA 3CYMA 3LP1A 4I7FA 3CJAA 4B3TK 4PKHA 4FLYA 3SMPA 2NRVA 2QA4N 3MECA 4YY3K 4CHPA 5F0XA 4IDKA 1TAUA 1DT9A 4YDUC 5AQQA 1YTAA 4HWIA 3JS6A 5BR9A 4CZKA 4KHYA 2QXFA 4EHTA 1ASWA 1HPMA 5AQPA 4C23A 4CJLA 2HBJA 1NGAA 2Y1IA 5A2QO 3S3MA 4JNEA 2ATQA 2HNDA 3QERA 4XEIA 3M8PA 3C0BA 3Q7BA 2P9PA 3DAWA 4C8LA 4JI2K 3EYZA 3ZX2A 1J5EK 2G8IA 1TYQA 2HF3A 3OVNA 4XH5A 1OH7A 3MCAB 3TWHA 2F9TA 4GMJB 3A0IX 3QFUA 3ALYA 5AQFA 3NGIA 3HO1A 4B1WB 3L2QA 1E4FT 4HHTA 2HHTA 5E84A 4K8ZA 3BZCA 3MN9A 4LH4A 3LAMA 4CGFA 4CK1A 4CHZA 3WXIA 4BREA 4FWRA 3AV9A 4CFBA 4DG1A 3CF5L 4BRPA 2E88A 3HSCA 4JKCA 5KPRA 1IH7A 5AZJB 3LDOA 2HVIA 2FBVA 1BI4B 3OYHA 2QWRA 2HBMA 2XRIA 3OYFA 3VQPA 2CGJA 3CPEA 4BC4A 1N5YA 4ICLA 4CBWA 2ZGYA 1TUYA 3HP6A 1LW0A 3NCIA 3LL3A 5DM7L 2HBKA 3QFPA 1RTIA 3OS1A 1ASVA 3EEQA 4H5VA 3P1GA 1C6VA 2IVOA 4CZIA 5C12A 2QK9A 3S3OA 3WNHA 3V9ZA 3M6GA 3ZCMA 3I56N 2EWSA 4AM6A 4BC5A 4W5TA 3NF7A 1BOTO 4G1QA 1GOCA 4IDHA 3K5NA 4H0VB 2UXCK 4E1MA 3DWLA 4BRIA 1MDUB 4KREA 1CZ9A 1LW2A 1TVRA 4OKKA 3SUNA 4FLWA 5GIPA 4ZTJA 1N34K 4JI7K 4CJ7A 4MLEA 1SKSA 2NZTA 1ILYA 3PX4A 1C1BA 3UKUA 3WQTA 4FPBA 1T6CA 1VSMA 4MDBA 4FJJA 3HL8A 3TTFA 3VQ5A 4C8MA 5C24A 4Q5VA 4LD0A 3OYGA 2NUBA 1X1PA 3DLRA 4E7HA 1LWCA 4CZMA 3TAFA 3PO5A 4BE0A 4GNIA 2ASOA 4CERA 3D2EB 4CZEA 1BISA 1HNWK 2B6AA 1Q7YO 4B8CA 3SNNA 3DRRA 2YV0X 4FK4A 3ENHA 4JKGB 1IV0A 3MMVA 1NJWA 1BL3A 4B3RK 3QNOA 4FK0A 2I7NA 5FRNA 3SAHA 4LF7K 3UIQA 2GEMA 2HMPA 3ZT3A 3ENBA 3H6EA 1KSPA 2QW9A 2J4RA 4CJUA 4M3WA 3LDNA 3BZKA 3HTVA 4AM7A 4CJPA 5AZIA 2HNYA 2IGIA 3E9PA 3ZT1A 2VCPA 1WNSA 1K8AO 4H4MA 1JLBA 3D2FA 3AA4A 3MEDA 1NG9A 2GWKA 3G0ZA 4FOIA 4H5TA 2RHKA 1KQSM 1S5JA 1NK5A 2Z1HA 4O4GA 3LM9A 3M8RA 1FKPA 2HB5A 3VN5A 3MCPA 3CHWA 2YHWA 1B9FA 1W7AA 4YNQA 2D1KA 3CMAN 4EIAA 2FSJA 4CF2A 5LJWA 2XY6A 5J1EA 4YOUA 1F21A 3PIPL 3H3NO 1SV5A 2FC0A 3WXMB 3PY8A 2I5JA 4YOYA 3I8DA 5HLFA 3FZFA 3K5MA 2Z1GA 4OLAA 1RT1A 1VQ7N 1BHLA 1LCUA 3HT3A 2NRZA 3PUFA 4LF6K 4BRFA 4U67L 4Z4IA 4U7BA 1VQ4N 3AVNA 1C1CA 5AQRA 5DMRA 3A5NC 4DSKA 3M1FA 1LWEA 2IIRA 3NH0A 3THXA 3HM9A 1TL1A 3CCRN 3QESA 3WEEB 1YHQN 4MLHA 1YJNN 1Z6RA 3DXMB 5HL7L 4DR2K 5EX5A 1HKCA 2E4LA 3DLHA 3O9SA 3F73A 1RDWX 2FBXA 1NKBA 1BUPA 3ITHA 5TKWA 3AO5A 3MXJA 3QMLA 3O3FA 3MDQA 4B9VA 4CGGA 1TKTA 3U9ZA 4H03B 3SMSA 5EXWA 3QO9A 4EZ9A 3NH1A 1VSDA 4WQ5C 1KFSA 5AQZA 4FXDA 3C7NB 1NK0A 3V9WA 1W0HA 2D0BA 3E9OA 5KGWA 4C8NA 1UOCA 4QOZB 2DFHA 2YJEA 3FFIA 2P9IB 4I2QA 3EKUA 3C6AA 3MN6A 2EHGA 1I39A 2ETJA 4BVOA 1RTDA 1Q9YA 4H5NA 4PHTX 1IKXA 1C0UA 3EO3A 1U47A 1S1UA 3V1QA 1SZ2A 3GL1A 3VTIA 3CFOA 5M1FA 4DV3K 4KH4A 4RWTA 1BWFO 4BE1A 4CECA 4C8OA 1VQ6N 3N4QA 3V9SA 2QTDA 2O8BA 1XHXA 4KHPK 3CQYA 2HNZA 2KHOA 4FJNA 4ELUA 1Y97A 4CIFA 4Y0WA 5M1OA 4FCYA 4KAZA 3NVMA 4ISFA 1ZBHA 4OJRA 4IFYA 4JK9A 3CJ7A 4JI1K 1VAZA 2ZF5O 3HXMA 1FKOA 1FK9A 4BRMA 3KLHA 1KLMA 4E1JA 2P9UA 1VSLA 2O8DB 3CFPA 4OO1J 4PUOA 3G71N 5AR0A 3SQ0A 1GLEG 1OVQA 4AHCA 4J2EA 5GADP 3U8XA 1EX4A 3QEIA 4H5WA 2D0AA 1JLQA 4IEEA 3NDKA 3WNGA 1VQON 2E2NA 3M8SA 3O9TA 5LL6Z 2A6AA 1GLBG 4JI8K 1UA1A 5HRPA 3VGKA 1BCMA 2QWNA 3VTHA 4WQ5A 3JXUA 5IT9O 4NCGA 4DF8A 4A59A 5FDLA 3CC4N 1KAZA 4W5RA 1XNQK 4KBOA 2A3ZA 1V4SA 1XUPO 3WNEA 4W5NA 4DTNA 3U6FA 1R59O 4DV7K 1T05A 3HVRA 3AVKA 3NBPA 4F3TA 1S9GA 3I0SA 5SZTA 3MN5A 4X65K 4CFDA 3CCUN 2O8EA 4QS7A 1X9MA 4OPJA 2O8CA 3CI5A 3QNNA 3ZETB 3VEZA 1D4XA 2E6LA 4Y1CA 4KRFA 4CGHA 5J2QA 1LAVA 3O1WA 5AQMA 2VG5A 3VA3A 1E4GT 1EP4A 1JLCA 4CFAA 4O8UA 3VEXA 3IKMA 3VESA 3HYFA 4KTQA 1NK7A 2PZSA 4CF9A 4LF5K 5EY4A 3GBTA 4M7YA 2V52B 4JI0K 3D0PA 4M3TA 2O8FB 1NKCA 1OH5A 2OTJN 1VQMN 4HCCA 3U3YA 1KVBA 3VF2A 3A8YA 4PA1A 4HUEA 3SUPA 2PAVA 1YXQA 1VSIA 2BDPA 4JV5K 2FF3B 1ZXOA 3ISNC 4FK2A 2P9SB 3NAEA 1HYZA 5E41A 1SKRA 3IG1A 1IO2A 1NGCA 3CJ1A 5CHIA 3VEOA 4B1XB 3ZSRA 1X9SA 5C0YA 3UKRB 5HRSA 3CC7N 1RT5A 3IRXA 3C94A 4K8XA 3OYNA 1U2VA 1YVNA 1ZBUA 1T6DA 1ZBFA 4H0YB 4J2DA 3LP2A 4CD1A 4WFBL 1ZBLA 3V6DA 3ID8A 1WAFA 4FWOA 1A5XA 3THVA 2VGNA 4Y1DA 3VMFB 5I3UA 5JS1A 1ITGA 2AP1A 5BRHA 2IC3A 2W6KA 3KK2A 1EWRA 4CHQA 4CJ4A 3OHRA 2LSNA 3L2UA 3HVTA 5I42A 2P9KB 2IS3A 3DM2A 4FJ5A 4BRKA 2W6LA 4BR2A 4DUYK 1NJIO 4DR5K 5JVGL 4B9MA 3K59A 4F2SA 3AVJA 4IOAL 1VRUA 1QQCA 4KHQA 3OBYA 3AO2A 4JD2A 4LF4K 3SJJA 2BANA 4CF1A 2F4VK 3L0QA 3WNFA 3MXIA 2IAJA 3EE9A 4K25A 3VGLA 1S1TA 4FJ9A 1VQPN 1IKVA 1JL2A 2UXBK 1BA1A 3D6RA 4E7KA 1NGBA 5C15A 5C10A 1RBSA 3TAEA 1RDBA 1RBUA 1X9JA 4A2AA 3GDQA 3SJHA 1VSEA 3ZSYA 3HOTA 2WBNA 4DTRA 3K5OA 4X66K 3SUQA 3ATUA 3SBGA 1HPZA 3RMAA 1JCFA 2OPQA 4HCBA 4FJ7A 3HPOA 1I3AA 2YX6A 5AQHA 1YF5L 1QQNA 3VQ4A 5FPNA 4DQRA 4BGAA 4PL7A 5JS2A 2ZJPL 3M3ZA 5JLHA 3DXKB 1RGIA 4CJ3A 4KO0A 2HVHA 4DS5A 3TI0A 1YJ9N 1DTQA 3ZX0A 5DK5A 2YHXA 2X6SA 3MK6A 2HHQA 1X9WA 3DLKA 5D3GA 2D0CA 3SI6A 4DSIA 3QIOA 3THYA 1YITN 3OW2M 2OPSA 2D4WA 2G8WA 1J5OA 4NCAA 1MWMA 1L5UA 3WXLA 3AVHA 4DU1A 5EU7A 1FXXA 2XY8A 2HMIA 4CF8A 4DSFA 3VQDA 3BDPA 4IO9L 3OYEA 3EL2A 3CMEN 3WUHA 5JLFA 3RRHA 4NXNK 1C1AA 2E2OA 4CJWA 3R9PA 3SAGA 1Z26A 2G8UA 2ZD1A 3FE1A 2D5RA 1S1WA 4DSEA 3TSQA 3KLGA 3E9LA 1NGEA 3OYDA 4NB4A 4GVMA 5FRMA 4K0KK 4DV0K 4ID1A 4HTUA 4FLZA 3CQ8A 2QKKA 2V7ZA 3OYBA 2KW4A 2CH5A 2QWPA 4FW2A 1ZC6A 4FJIA 3BEXA 4YOWA 1JL1A 3NF8A 4JKAA 4CIGA 4YFUA 2HHUA 2A42A 3K58A 1DKGD 4IKFA 3G6EN 3VEYA 3ZYYX 3H3OB 3ZT4A 2G8HA 3SQ4A 1GLFO 4DS4A 1NOZA 3GOIA 4ILGB 1TKZA 4AH9A 1M1KO 3CPWM 1VK0A 4CHYA 3W0LA 2GUPA 4KHUA 4E7IA 2O4IA 1K8KA 2Q2RA 3FZKA 2OA8A 2YHYA 1K6YA 3AVLA 1NJXA 5LMNK 1S3XA 2JGUA 4JLHA 2ITMA 2BH1A 2RPIA 1K9MO 3R1XA 4KTZA 4FJHA 4NXMK 3RSEB 3THWA 1P90A 4WFNL 4PY5A 3RR7A 3OBWA 3TR8A 1NKEA 4KH5A 3OYMA 3UKUB 4CHOA 3RMCA 3CCLN 1O1WA 5M1QA 2HF4A 3ULEA 3O5BA 4G9ZA 4Z94A 3TABA 4DTOA 4DV1K 5ADXA 1CZBA 3J7YP 4DTPA 3HBTA 1RDCA 3CJ9A 4WF9L 4YDUA 2Q97A 4CJRA 3C6HA 3ZX3A 3CCMN 4FJGA 2CGKA 5BRFA 1BIZA 2JLEA 1QHAA 4MQ3A 4CK2A 3AO3A 1A5WA 1C0TA 3J7ZO 3CJBA 2E8AA 4MDAA 5AQYA 2FBYA 1NOYA 3L3VA 4IO8A 4XIUA 1BI4A 2OPPA 4JEPA 3LZJA 4DU4A 1J9AA 3SV4A 4CZLA 3CCVN 5AZIB 4H0TB 4J2BA 3HI0A 4FLVA 5JICA 3D2FB 4B9LA 3M5RA 3L4IA 3KIOA 1BQNA 1CLQA 2ZJRL 3A5OC 3MEEA 4RW8A 3NE6A 4CF0A 1UAXA 4FJLA 3MWTA 1CZAN 3IMXA 3AVAA 3CCSN 2GTDA 3J8AA 4PL8A 2VQFK 3NGYA 1T8EA 4BWJA 2UU9K 2HW3A 2QWLA 3VERA 3IDHA 3SQ1A 4QCLA 5K14A 2G8KA 5GINA 3O4WA 4JKHA 1L3UA 4EZ6A 1J6ZA 3O9RA 3IS9A 2QKBA 1GLLO 4KH6A 4MO4A 4CEEA 3CETA 1VRTA 3NH2A 4FJ8A 1NWKA 1RBRA 3B8AX 1I94K 3KLEA 4OKJA 3P4IA 1Q81O 5HRNA 3CIPA 2VQEK 3CJCA 3AAQA 4JS5A 4LY7A 3SK3A 5KGXA 2HSTA 2A1RA 3ENOA 4DHYA 3VQAA 3ZEUB 4FJXA 4FM0A 3THXB 3JSMA 5BPMA 4B9SA 1L3TA 3AVIA 3O6WA 1TK5A 1NK9A 2BGGA 2WOMA 3CQXA 1WOQA 1SL1A 1TUUA 1SKWA 1RFQA 3DYAA 2HHHK 1YI2N 4BR7A 3V81A 3QBXA 2WONA 2F9WA 4CGDA 4N5SA 1N6QA 4CJFA 1QS4A 3KWGA 5KTQA 2P9LA 4B9NA 4DB3A 1QSYA 3BGRA 4NLCA 5AQKA 2ZM6K 3SUOA 1ATRA 3T1YK 5AQTA 2PYLA 1IG8A 1RDDA 3AA2A 1WSJA 3SAFA 3OYCA 3V4IA 3PSIA 4ILHA 4JKFA 1V4TA 1HQUA 5M1NA 2F8TA 4LC9B 3OYKA 4BDYA 4Z4CA 4CJKA 4CW7B 3QEVA 4IOCL 5LJVA 3RWUA 1IG9A 3EY1A 4CEDA 3VF4A 5AQLA 5GIOA 4DQSA 4QS9A 4BRGA 1FW6A 2VG6A 3SPYA 4A61A 5AQIA 4E89A 2WC9A 5BN9A 4LF9K 1E3MA 3V9XA 3O9UA 2E20A 3PX6A 2O8BB 4FWMA 3KK1A 3H45C 2NRTA 1Z25A 4IJAA 4EFHA 5GAEP 2IOCA 4BR5A 4CEZA 3OJUA 4C1NK 4JK7A 3ULDA 4O44A 5CZ2A 3VEWA 3LPUA 4M3XA 4KTWA 1HKGA 2VYPA 2JWKA 1CXQA 4CJSA 2P9UB 3IFRA 3FLCO 1TK0A 3K57A 2QXLA 4JHDA 3HJFA 4DQQA 3KTQA 1VQ5N 4J2AA 2CGLA 4DV4K 4OPAA 4CBUA 4QAGA 4AHRA 3ZSXA 2OTLN 3D45A 1NJYA 1NGHA 2PBDA 1FJGK 4DFJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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 1Q81 O;  3G71 N;  3DLL L;  1VQ5 N;  2QA4 N;  3I55 N;  1YIT N;  4U67 L;  3OW2 M;  1VQN N;  1QVF M;  4WFB L;  3CCL N;  1VQ4 N;  1YIJ N;  5GAD P;  1ILY A;  2OTL N;  5GAG P;  1VQO N;  1VQ8 N;  4WF9 L;  4IO9 L;  3CCR N;  1Q86 O;  3CME N;  1YI2 N;  1YHQ N;  1YJN N;  5HL7 L;  3CCM N;  3CC2 N;  3CC4 N;  1Q7Y O;  1NJI O;  5JVG L;  2QEX N;  1QVG M;  1S72 N;  3J7Z O;  5MLC Q;  4IOA L;  4WCE L;  1M90 O;  3CD6 N;  1VQL N;  3CCE N;  3CCU N;  3CCV N;  5H1S Q;  2ZJQ L;  4IOC L;  5DM6 L;  1VQP N;  3CXC M;  1K8A O;  3CF5 L;  5JVH L;  3G6E N;  2ZJR L;  1KC8 O;  1KQS M;  3G4S N;  3CCS N;  1K73 O;  1M1K O;  3CPW M;  2OTJ N;  1VQM N;  1OVY A;  1VQ6 N;  5GAE P;  3CMA N;  1VQK N;  5DM7 L;  1KD1 O;  3PIO L;  1YJW N;  3PIP L;  4WFA L;  1N8R O;  2ZJP L;  1VQ9 N;  3CCJ N;  1Q82 O;  1K9M O;  4UY8 O;  3I56 N;  3CCQ N;  1YJ9 N;  5GAH P;  3CC7 N;  1JJ2 M;  1W2B M;  4WFN L;  1VQ7 N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1C0M A;  3CYM A;  3LP1 A;  4I7F A;  3CJA A;  4B3T K;  4PKH A;  4FLY A;  3SMP A;  2NRV A;  2QA4 N;  3MEC A;  4YY3 K;  4CHP A;  5F0X A;  4IDK A;  1TAU A;  1DT9 A;  4YDU C;  5AQQ A;  1YTA A;  4HWI A;  3JS6 A;  5BR9 A;  4CZK A;  4KHY A;  2QXF A;  4EHT A;  1ASW A;  1HPM A;  5AQP A;  4C23 A;  4CJL A;  2HBJ A;  1NGA A;  2Y1I A;  5A2Q O;  3S3M A;  4JNE A;  2ATQ A;  2HND A;  3QER A;  4XEI A;  3M8P A;  3C0B A;  3Q7B A;  2P9P A;  3DAW A;  4C8L A;  4JI2 K;  3EYZ A;  3ZX2 A;  1J5E K;  2G8I A;  1TYQ A;  2HF3 A;  3OVN A;  4XH5 A;  1OH7 A;  3MCA B;  3TWH A;  2F9T A;  4GMJ B;  3A0I X;  3QFU A;  3ALY A;  5AQF A;  3NGI A;  3HO1 A;  4B1W B;  3L2Q A;  1E4F T;  4HHT A;  2HHT A;  5E84 A;  4K8Z A;  3BZC A;  3MN9 A;  4LH4 A;  3LAM A;  4CGF A;  4CK1 A;  4CHZ A;  3WXI A;  4BRE A;  4FWR A;  3AV9 A;  4CFB A;  4DG1 A;  3CF5 L;  4BRP A;  2E88 A;  3HSC A;  4JKC A;  5KPR A;  1IH7 A;  5AZJ B;  3LDO A;  2HVI A;  2FBV A;  1BI4 B;  3OYH A;  2QWR A;  2HBM A;  2XRI A;  3OYF A;  3VQP A;  2CGJ A;  3CPE A;  4BC4 A;  1N5Y A;  4ICL A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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