4XH4A

Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase a88v mutant, in complex with amppnp and propionate
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
FPVVLVINCGSSSIKFSVLDVATCDVLMAGIADGMNTENAFLSINGDKPINLAHSNYEDALKAIAFELEKRDLTDSVALIGHRIVHGGELFTQSVIITDEIIDNIRRVSPLAPLHNYANLSGIDAARHLFPAVRQVAVFDTSFHQTLAPEAYLYGLPWEYFSSLGVRRYGFHGTSHRYVSRRAYELLDLDEKDSGLIVAHLGNGASICAVRNGQSVDTSMGMTPLEGLMMGTRSGDVDFGAMAWIAKETGQTLSDLERVVNKESGLLGISGLSSDLRVLEKAWHEGHERARLAIKTFVHRIARHIAGHAASLHRLDGIIFTGGIGENSVLIRQLVIEHLGVLGLTLDVEMNKQPNSHGERIISANPSQVICAVIPTNEEKMIALDAIHLGNVKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Salmonella typhimurium (strain lt2 / sgsc1412 / atcc 700720)
publication title Structures of substrate- and nucleotide-bound propionate kinase from Salmonella typhimurium: substrate specificity and phosphate-transfer mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords Propionate kinase
total genus 140
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 2.7.2.15: Propionate kinase.
pdb deposition date 2015-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh4A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh4A02
2P9LA 3RSEB 1S3XA 3HZ6A 3D2EA 3CJAA 1BA1A 4DHYA 1H1VA 1TYQA 2HOEA 4H5TA 3SLCA 3O8MA 3GBTA 2V7ZA 5BR9A 3H6EA 2GEMA 4YDUC 5KPTA 4I6MA 4BR0A 4EHTA 3HI0A 4WYBA 4O5FA 1RGIA 1NGJA 3JXUA 4CBUA 3WUHA 1K8KA 2D4WA 1YXQA 3VGMA 4O8KA 4FPAA 4YDUA 2HF3A 4BGBA 4IXCA 1T6DA 4MLEA 3CETA 4LC9B 5AQMA 4BRHA 3LM9A 3H1QA 4F9OA 3UKUA 3DXKA 2AA4A 3MN6A 3L4IA 2P9IA 4Z94A 1BWFO 4EIAA 2P9SA 3WXJA 4A2BA 4B1YB 3W3DA 2GWJA 4EFHA 4MO4A 1D4XA 2I7NA 3LDQA 1XUPO 3DJCA 4J8FA 3MN9A 3AAQA 3R9PA 5BRDA 1MA9B 2GWKA 2ZF5O 3L0QA 2QWLA 2CH6A 4M7YA 2D0OA 5AQYA 3FZKA 4HTLA 4BRGA 4JD2B 1NGEA 4E1JA 2A3ZA 1GLFO 1DKGD 2E2PA 3LL3A 4JHDB 4H03B 1Q18A 4BRPA 3HTVA 3U8XA 3ZEUB 2P9NB 4ISFA 4A62A 1XC3A 2FLOA 4K25A 2V51B 1GLAG 4QS8A 1NLVA 1NGAA 3ZETA 1Z6RA 4B1UB 4CBWA 3HSCA 3LDOA 3MK6A 3BP8A 5AZJB 4H0YB 3CIPA 3S41A 1HJOA 2ASOA 2IVOA 5BN9A 2YCHA 3ZX0A 2P9KB 4PL7A 5FPNA 1DGKN 1HKCA 1R59O 4H5RA 1KAXA 5AZJA 4H5VA 4K42A 2YHWA 5AQHA 2P9KA 1HPMA 1BO5O 4H0PA 4BGAA 1T44A 4B1VA 4BREA 5CE3A 3BF1A 5AR0A 2W40A 3QICA 3A5NC 3D2FB 3FFKB 5AZIA 5AQUA 3TU5A 5F1XA 1QQMA 2ZGZA 3U9ZA 4AM6A 1YAGA 3IUCA 2QWOA 2VCPA 4BROA 3EN9A 3EZWA 3M6GA 1NBWA 4L3QA 3DAWA 1QQNA 5AQZA 4PKHA 4H0VB 3EKSA 2FXUA 4CZJA 4BC3A 5JLFA 4FWRA 3HM8A 1TUYA 1U2VA 3DXMA 3QBWA 4BQLA 1NGIA 3ENHA 4FWQA 4CZEA 2E1YA 3C7NA 4FWMA 3I33A 2A6AA 4K41A 4CZLA 4H5WA 1OKJA 5BRHA 5AQQA 2OANA 5EVZA 3VEXA 2KHOA 1IG8A 3A0IX 3QBXA 5AQPA 5ADXA 4K43A 4XH5A 4EAHD 2GELA 1Z05A 1GLEG 3CHWA 3RSEA 5EY4A 1BA0A 4BR7A 3CJ1A 1ATSA 4MLHA 5AFUH 5TKYA 5EOYA 3QB0A 3WEEB 2NLXA 3ENOA 5KQ8A 5EXWA 5LJWA 5AQSA 3UKRB 3LM2A 3P4IA 2Q0UA 4FWOA 4NO7A 1GLJO 4FWLA 5AQTA 4NB4A 4PL8A 5AQXA 1JCGA 1NGFA 5F2RA 3FR0A 2GUPA 3O4WA 3SMSA 2P9UB 5E26A 5AQJA 4FPBA 1YUWA 4BRIA 3MDQA 4H0XB 2CGKA 2Q1NA 1QZ6A 4EHUA 3F9MA 5AQWA 3ULEB 3AY9A 1C0GA 1NGGA 2HMPA 2Q36A 3OHRA 1BG3A 2P9UA 3A5MC 3M1FA 3BEXA 1V4TA 5AQFA 1G99A 5KQDA 3UB5A 2VYPA 2P9PB 1ZBSA 4M7XA 3SJHA 4CZHA 1P8ZA 3VENA 4CZFA 3O5BA 1J6ZA 2V7YA 3R6MA 5BPNA 5AQRA 2ASPA 4BG8A 1KXPA 1MWMA 3WXKA 4M63C 1E4GT 4PKIA 4WQ5C 2YHYA 2ZWHA 4JD2A 4H0OA 1XQSC 1HUXA 3QFPA 1KAZA 2VWBA 4JHDA 4BR5A 2NRHA 3CERA 1NMDA 2Q0RA 3ZEUA 2J4RA 4BRLA 1LOTB 2P9NA 4QS9A 2QM1A 4JN4A 3BF3A 3QMLA 2F9TA 4FWPA 3VPZA 3GG4A 2FF3B 1HLUA 4KBOA 2A41A 4CZIA 5FPEA 3BUZB 2IVPA 2A40A 4BVPA 5BPLA 3KHYA 1E4FT 3A5LC 2UYTA 2PAVA 3O08A 3CI5A 2DPNA 1X3MA 3H3OB 2F9WA 3IMXA 4ISEA 4IWVA 4RTFD 4B1WB 3UE5A 3GOIA 3U9DA 4FOIA 4XH4A 3LDNA 4A2AA 2YI1A 4CZKA 3MN5A 3FGUA 5JMVA 4H0TB 3D7EO 2HF4A 3SMPA 4H5NA 5AQOA 3A5OC 2FSNA 3D2FA 3H45C 5AQVA 5LY3A 2E20A 2GTDA 2QWPA 4BG9A 3VEOA 4BR4A 3QDKA 2E88A 3L6QA 2E2NA 4FOEA 1BU6O 4CJ7A 2P9LB 1EQYA 1SQKA 3GDQA 2I7PA 3VEWA 3D2EB 3TPQA 2E2OA 4Y0WA 4CI6A 5KPRA 4PKGA 4DB3A 4A61A 3H3NO 3CJBA 2Q2RA 3EL2A 3WXIA 2Q97A 1GLBG 4GY2B 5JICA 1GLCG 3ATUA 4BRNA 2YJEA 4I6MB 1C0FA 4IO8A 1TUUA 2FF6A 3FZHA 4B1ZA 3O1BA 1BOTO 2QWNA 4BRMA 2ITMA 2WUSA 5F0XA 1MDUB 1NWKA 3GE1A 3SK3A 3FE1A 2D0PA 1QQOA 1K8KB 4DCHA 4WQ4C 1LCUA 3J8AA 5AQGA 5AFUA 1X9JA 3C0BA 4BRAA 1HX1A 2FSKA 3WEEA 4B1XB 3IFRA 2CGJA 4QS7A 1ATNA 2E1ZA 1ZC6A 2AP1A 3UKRA 1KAYA 1NGHA 2E2QA 1WUAA 3CJ9A 3B8AX 3A8YA 3WQUA 1DEJA 4FWNA 4JAXA 4FO0A 4HWIA 3UKUB 3DXKB 4MO5A 3ATVA 2ZGYA 2PBDA 5EX5A 4BR9A 4WQ4A 2P9IB 2P9SB 3VOVA 1NGCA 4B9QA 3O6WA 1T6CA 3MCPA 5JLHA 1ATRA 1X3NA 3G25A 5I9EB 3WT0A 2QW9A 5ELZA 5E84A 2IVNA 3VF2A 2A5XA 3ULEA 1BDGA 1Y64A 3H1VX 5AQNA 1QZ5A 3WXLA 3IDHA 3LDLA 3CQXA 3ZX3A 1QHAA 2FSJA 5AQIA 3ID8A 4BVOA 4CBXA 1U6ZA 4BRKA 2P9PA 1HKBA 5AQLA 1HKGA 1IJJA 2CH5A 1RFQA 2A42A 3ZX2A 4CZGA 4XEIA 1GLDG 4DQ8A 3FLCO 3EKUA 3GL1A 4ISGA 3ZETB 1YVNA 1ZXOA 4FL9A 4WQ5A 5B8HA 2V52B 3VESA 2YJFA 1WOQA 3DWLA 3O1WA 4GNIA 3FZMA 3O80A 2EWSA 4IZ9A 3QFUA 1GLLO 3KVGA 1ESVA 3EO3A 3MMVA 3FZLA 3H46O 1NGBA 4IJNA 3U4LA 4BRCA 3CJCA 3VGLA 3LDPA 4BRDA 3I8BA 2D1KA 2QWQA 4JNEA 3VGKA 4CD3A 3CQYA 4IJAA 1JCEA 4CD1A 2Q31A 1V4SA 2BUPA 1BUPA 5FPMA 5BPMA 4BR2A 5BRFA 2IIRA 3R8EA 3KZBA 5AZIB 3W0LA 2QWRA 3VEZA 4CZMA 1S22A 3HBTA 4FWSA 1JCFA 3M3ZA 3CJ7A 3WQTA 1RDWX 5BREA 2QXLA 4FWKA 4C23A 2NZTA 3MN7A 5FPDA 2W41A 3FZFA 3VF6A 2QWMA 1CZAN 2BTFA 4FSVA 4BC4A 1U2VB 3VEYA 4RWTA 4RCHA 3DXMB 2CGLA 2YHXA 3VEVA 1NM1A 5BN8A 3JS6A 4XH1A 4BRQA 3C7NB 5AQKA 3AAPA 3AARA 2ASMA 4AM7A 1NGDA 5LJVA 3VETA 1SZ2A 4BC2A 1TYQB 5ADXH 2E8AA 3VERA 4BRFA 1MWKA 3VF4A 4BQZA 4BC5A 2H3GX 1SAZA 5KPZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1S3XA 3KTQA 1Q82O 3D2EA 1D9FA 1BA1A 2W42A 1TYQA 2QXFA 4DV1K 4EP5A 3ITHA 5JS2A 4CF9A 4YDUC 4OKKA 4PHTX 2YNFA 4BR0A 3PX4A 3HI0A 4CJUA 2BDPA 1B92A 4O5FA 1UAXA 1NMNA 2PZSA 3TAPA 3KWGA 1NGJA 4I7FA 3ZSZA 4CBUA 1WAJA 3WUHA 4YOXA 3TTCA 3RR8A 4RW4A 3J7AP 1YXQA 3AVIA 2OTLN 4FPAA 1YITN 2B6AA 1T6DA 3VQQA 3OYBA 1LWEA 4IG3A 3AVMA 1C0TA 4CHQA 2KQ2A 3LM9A 3H1QA 3L3VA 1VQPN 3UKUA 1ZBHA 2HNDA 4DU3A 2XY5A 1I94K 3DRSA 3L4IA 1EKEA 4LY7A 4EIAA 2FBXA 2ZJQL 3WXJA 2DFEA 1SL2A 2QA4N 3AVNA 4B1YB 4EFHA 4MO4A 1D4XA 4C8KA 1SUQA 3VQDA 2RF2A 2ZE2A 2HHWA 4M7YA 1S1VA 2D0OA 5AQYA 3CCRN 4Z4HA 2RN2A 1DKGD 4H03B 4NXMK 4JI4K 2HNYA 4BRPA 3OW2M 4EZ9A 3HTVA 3O3FA 4ZTJA 4JI3K 4GW6A 3K5LA 3OYGA 1YTAA 4TSXA 2V51B 1C1CA 3EEQA 2UUCK 3ZETA 4B1UB 2OPQA 1HNIA 5AZJB 4FLUA 4H0YB 2ITGA 3CIPA 4WFNL 3SPZA 2YCHA 3SAFA 4OPKA 4U67L 1IKXA 4FW1A 2DFHA 4N76A 4DU1A 1R59O 1P90A 4H5RA 5AZJA 1TK8A 3OYCA 4FLXA 4CJSA 3UIQA 3CC4N 5FROA 2YHWA 5AQHA 1K6YA 3AV9A 2DFFA 2ZM6K 3BF1A 5AR0A 2W40A 3E9OA 5C25A 5AZIA 2ZGZA 1EETA 1YAGA 3IUCA 2QWOA 2VCPA 3M6GA 5M1KA 3ZT3A 5KGXA 2RE2A 2FBVA 3CPEA 4DS5A 5JLFA 4FWRA 3HM8A 4GVEA 1JXEA 1U2VA 4YOWA 3KLIA 4BQLA 3KLHA 2X74A 4OKJA 4FWMA 4LF4K 3F2KA 1OKJA 4KO0A 2G8WA 3TABA 3D45A 5AQQA 5EVZA 3HM9A 4DTUA 3A0IX 4DR5K 4XH5A 3IS9A 2UU9K 4EAHD 2GELA 1GLEG 3CHWA 5D3GA 3K0SA 3RSEA 2WBNA 3HRGA 5EY4A 1BA0A 3RRHA 2E6MA 5AFUH 5EOYA 3NH2A 1FJGK 4CHZA 3K5MA 3WEEB 3ENOA 1IV0A 5KQ8A 5EXWA 3R1XA 2NRRA 1WSJA 3ENBA 3ALYA 1L3UA 4F3OA 3L3UA 4CIGA 3ULDA 1QVGM 1JCGA 4WE1A 5F2RA 3O4WA 2PY5A 1KD1O 4C8OA 3VQ4A 4H4OA 5E26A 4BRIA 2QEXN 5AQWA 1C0GA 1T8EA 4LF7K 2HMPA 3M1FA 4C1NK 5AQFA 3MEGA 5KQDA 2HSTA 3M8RA 4CZHA 1P8ZA 4KHWA 4M3ZA 1I3AA 3CC7N 4K0KK 4JKGB 3KK3A 1MWMA 1VSIA 2BH1A 4CJ5A 4J2EA 1RBTA 2ZWHA 4KKOA 2W6LA 3QFPA 1HUXA 1WSFA 4JHDA 1YVUA 1N32K 2Q0RA 3ZEUA 4W5TA 2P9NA 2QM1A 4N41A 4M3UA 4CHNA 1CLQA 3RVCA 3BF3A 1S72N 4E89A 3O9RA 4IBNA 3P38A 4ILHA 4IOXA 5BPLA 3I0SA 2JLEA 4IDKA 4K8ZA 3KHYA 4IO9L 4GMJB 1VK0A 1R0AA 2VGNA 3O08A 1HNWK 2ATQA 3IMXA 2F9WA 4RTFD 1U49A 2R7YA 3TI0A 3U9DA 3OYMA 3ZLJA 4BWMA 1O1WA 1NJXA 1N36K 2YI1A 5AJ3K 2Y1IA 3MN5A 4H0TB 3D7EO 2HF4A 4WFBL 3LPUA 1U47A 1SL1A 5JVHL 4KH5A 3SNNA 3LAKA 3C6AA 5AQVA 2E20A 4I2QA 3IKMA 1VQKN 3OYAA 4LD0A 1KRPA 5KRTA 2G8HA 3T1YK 3WNHA 4PA1A 4CJFA 1BCMA 2E2NA 4B9TA 4DR4K 4FOEA 4X64K 4FCYA 1YTUA 1BU6O 2P9LB 1SQKA 1XWLA 4YOYA 4IOAL 3ZSOA 1GLBG 1X9SA 1HNVA 1C0FA 1KCFA 1QQCA 5K14A 4JK8A 4NYNA 1KTQA 2BANA 1IH7A 2FF6A 4J2AA 2WUSA 2G8KA 4FJHA 5E41A 4LSNA 3OBWA 2D0PA 4DCHA 4KH4A 5AFUA 3HVTA 4B1XB 2CGJA 2BE2A 1VQ4N 3LP1A 1W9HA 2E2QA 3CJ9A 1BCOA 1DEJA 4DV3K 4FLVA 2ZGYA 4BR9A 1S1UA 3IG1A 2P9SB 3D0PA 3EYZA 4A5BA 4FJ5A 2QKBA 1VAZA 4Z4GA 3G25A 1LV5A 1QSYA 4EZ6A 3WT0A 4J2BA 5ELZA 2A5XA 4Z0UA 1QZ5A 2HBMA 1HMVA 3CQXA 3QLHA 2FSJA 4F8RA 4CBXA 4YY3K 1QSSA 3OJUA 3CM6A 2P9PA 4BRKA 2GUIA 1TK0A 1HKBA 3ZSXA 5GAGP 3LPTA 2RHKA 1RFQA 3ZX2A 1X9MA 1C6VA 3B6PA 2P5GA 4OLAA 2FC0A 3FLCO 3GL1A 1KFSA 3K57A 1ZXOA 3HJFA 4KAZA 1VSFA 3NF9A 3VESA 2NRZA 4M41A 1Y97A 2YV0X 3DWLA 3FZMA 3O80A 4CGHA 1KQSM 4JS4A 4BE0A 4KHSA 3EO3A 3MMVA 3HVRA 3H46O 4HCCA 2F8TA 4OPHA 3S3MA 1O13A 1NJWA 4JYAK 2OA8A 4BRDA 3I8BA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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