4XH4A

Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase a88v mutant, in complex with amppnp and propionate
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
FPVVLVINCGSSSIKFSVLDVATCDVLMAGIADGMNTENAFLSINGDKPINLAHSNYEDALKAIAFELEKRDLTDSVALIGHRIVHGGELFTQSVIITDEIIDNIRRVSPLAPLHNYANLSGIDAARHLFPAVRQVAVFDTSFHQTLAPEAYLYGLPWEYFSSLGVRRYGFHGTSHRYVSRRAYELLDLDEKDSGLIVAHLGNGASICAVRNGQSVDTSMGMTPLEGLMMGTRSGDVDFGAMAWIAKETGQTLSDLERVVNKESGLLGISGLSSDLRVLEKAWHEGHERARLAIKTFVHRIARHIAGHAASLHRLDGIIFTGGIGENSVLIRQLVIEHLGVLGLTLDVEMNKQPNSHGERIISANPSQVICAVIPTNEEKMIALDAIHLGNVKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Salmonella typhimurium (strain lt2 / sgsc1412 / atcc 700720)
publication title Structures of substrate- and nucleotide-bound propionate kinase from Salmonella typhimurium: substrate specificity and phosphate-transfer mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords Propionate kinase
total genus 140
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 2.7.2.15: Propionate kinase.
pdb deposition date 2015-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh4A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh4A02
3D2EA 2GTDA 2E1YA 3C7NB 4H0XB 3VEYA 4JNEA 4PL8A 1EQYA 4BR2A 1QQNA 4IZ9A 4CZLA 5JICA 3U4LA 1JCFA 3WXIA 4CZJA 1BWFO 3W0LA 3L4IA 4XH4A 2QWLA 2DPNA 2GELA 3M1FA 3QBXA 2F9TA 3QMLA 4BRQA 3U9DA 5KPRA 2YHWA 4MO5A 5AR0A 2IIRA 3R8EA 3ZEUA 4BRCA 2HOEA 2E1ZA 1RDWX 4BRFA 3H46O 5AQMA 3LDPA 4JHDB 4O5FA 4IJNA 2IVPA 3HM8A 3HZ6A 4K43A 1BDGA 2QM1A 1C0GA 4E1JA 3LL3A 2ZGYA 1GLEG 3GBTA 4BC4A 5KQDA 2AA4A 3D2EB 4QS7A 3QDKA 1ZXOA 4FWSA 3CJ1A 3FFKB 5AFUA 1Y64A 3BF1A 1HUXA 4RCHA 4BVPA 4B1WB 4NB4A 1GLLO 2D0PA 1NGFA 3ULEA 3ZETB 2FF3B 4H0TB 1TUYA 4CZGA 3GDQA 3VEOA 3I33A 5F0XA 1BO5O 4K42A 1CZAN 3U8XA 4ISGA 3MN5A 3O80A 5FPMA 5FPNA 3CQYA 3VGKA 2VCPA 2Q97A 2Q0UA 4IWVA 3WQUA 4AM7A 1MDUB 2QXLA 4BRLA 2CH5A 3IDHA 4QS9A 2YJEA 2UYTA 5EVZA 3VF2A 2V51B 2FLOA 4H0VB 1TYQA 1XQSC 4FPBA 4M7YA 1U2VA 5AQPA 2GWKA 2P9KA 5ELZA 2E20A 3RSEB 1GLJO 4J8FA 3EL2A 2HMPA 3VEXA 3ULEB 1MA9B 3O1WA 1JCEA 4RTFD 3AY9A 1WOQA 4BROA 4BR9A 5KPTA 1DGKN 3FZFA 4FWKA 1NGGA 1TUUA 3KZBA 4A2AA 1GLCG 3I8BA 4BC5A 4QS8A 5AZJA 2F9WA 2ASMA 5EXWA 3VETA 4BRGA 3UKUB 1GLBG 1K8KA 1ZC6A 3A5LC 3S41A 3UKRA 4DHYA 3ATUA 3MMVA 2E2QA 1D4XA 3VGLA 3ENOA 4DB3A 3DJCA 5AQXA 3IUCA 2Q31A 3W3DA 1U2VB 4GY2B 5F2RA 1GLDG 4BR7A 1IJJA 1T6DA 5AQZA 1NGDA 1GLFO 1RGIA 4BC2A 1BG3A 3DXMB 5AQYA 4CBWA 3LDLA 3LM2A 4IJAA 3D7EO 3WXLA 5EX5A 3DXKA 2P9IA 2PBDA 2FSNA 4WYBA 1HKCA 2D4WA 5AFUH 1ATNA 4BQZA 3VGMA 3O6WA 1NLVA 2YHYA 5BRDA 1X9JA 4HWIA 1C0FA 4EFHA 2J4RA 1QQOA 1HPMA 1X3NA 4PKIA 4H5TA 1S22A 3ENHA 2NLXA 1LCUA 1G99A 1ATRA 1NGHA 3DAWA 4KBOA 5AQLA 3MN9A 2QWOA 4I6MA 2ZWHA 2P9LA 4C23A 1NMDA 1QZ5A 2NZTA 3FZMA 4L3QA 4JAXA 3EN9A 4F9OA 3CIPA 3FGUA 4H03B 2NRHA 5AQOA 5BPMA 1V4TA 4NO7A 3BEXA 1MWKA 5BRHA 3L6QA 2HF3A 1RFQA 2A3ZA 3GE1A 1SQKA 4WQ4C 3A5OC 3QICA 1BOTO 2VYPA 3VENA 4FWQA 1NGAA 5BRFA 5LJWA 3HI0A 4BR0A 2GUPA 3BUZB 4BR5A 2P9PA 2H3GX 2FSKA 2A41A 3CJBA 4CZMA 3WT0A 3H45C 3JS6A 1XUPO 3CERA 3GG4A 2IVNA 3M6GA 4CD3A 1NGCA 5ADXH 1X3MA 2HF4A 1KAYA 4H5VA 2OANA 4HTLA 3ZEUB 3EZWA 5BPNA 2V52B 3IMXA 2FSJA 5AQJA 1QQMA 1NGEA 4FPAA 2ZGZA 1QZ6A 2WUSA 3GL1A 3O1BA 3EKSA 3R9PA 4FWLA 1NM1A 4B1VA 2FF6A 1BA1A 1NGBA 4CZHA 1YAGA 3ZX3A 1ESVA 3VEWA 4FWMA 2E2NA 3FLCO 4H5NA 3CJ9A 2P9PB 1HJOA 2V7YA 4H0YB 4RWTA 3B8AX 2Q1NA 1HLUA 4CZIA 2IVOA 1JCGA 3ATVA 3KHYA 3FR0A 4FSVA 2E2PA 5AQQA 5AQGA 4BRNA 4CBUA 3WEEA 4FWNA 4BRMA 3ZX2A 4WQ4A 5AQTA 4H5WA 1HX1A 5I9EB 5JMVA 3AAQA 3WQTA 3VESA 3VEVA 5AQRA 2QWQA 5AQHA 3IFRA 3O08A 3HBTA 4CZKA 4DCHA 4YDUC 5AQFA 2P9NA 1NBWA 5E26A 1TYQB 1E4GT 4BR4A 2P9KB 4K25A 2V7ZA 4FWPA 3GOIA 4B9QA 2I7PA 3BP8A 4XH5A 5AZIA 1Z6RA 3A5NC 2CGKA 5BN8A 3C7NA 3C0BA 3ZX0A 3OHRA 3CI5A 4O8KA 4H0PA 2BTFA 4M7XA 4FWRA 3CHWA 5KQ8A 1XC3A 3CJCA 3O4WA 1Z05A 5AZJB 3MDQA 1YVNA 3MN7A 3MN6A 4FWOA 4BGAA 4CJ7A 5JLFA 1K8KB 1E4FT 3UKRB 3AAPA 4DQ8A 3BF3A 2W40A 2I7NA 4CZEA 5FPEA 1SZ2A 3VEZA 2Q2RA 2CH6A 1T6CA 4JHDA 3CJAA 2P9NB 2FXUA 3EO3A 3R6MA 2BUPA 5F1XA 4A2BA 3M3ZA 4EIAA 2E88A 5FPDA 2CGJA 4IO8A 5AZIB 5EOYA 4CBXA 1R59O 1IG8A 2QWNA 1T44A 5AQVA 1P8ZA 4JN4A 3UE5A 3VF4A 3ZETA 4BRIA 4YDUA 4XH1A 3DXKB 2AP1A 3QBWA 4B1UB 2P9IB 2YJFA 3A8YA 3LM9A 5AQKA 3EKUA 2QWMA 1NWKA 3ID8A 3KVGA 3SMSA 1DKGD 5CE3A 4IXCA 4CI6A 1GLAG 4FOIA 1S3XA 3O8MA 4BC3A 1YXQA 4WQ5C 5AQWA 4CD1A 2YI1A 1HKBA 5AQNA 5AQUA 3F9MA 4BG9A 1BA0A 3G25A 1J6ZA 2A40A 3HTVA 4FL9A 3O5BA 1SAZA 2D1KA 4I6MB 2P9LB 2P9SA 1KXPA 2A6AA 3SMPA 4ISFA 4EHTA 5KPZA 3LDOA 1NGJA 1Q18A 2E8AA 4PL7A 3SLCA 2ASPA 1OKJA 3UB5A 3D2FA 3RSEA 4B1ZA 3H1QA 4LC9B 3L0QA 5TKYA 3AARA 3CQXA 3CETA 4BQLA 5E84A 5EY4A 1QHAA 2QWPA 2PAVA 5JLHA 3H6EA 3VF6A 2VWBA 3VPZA 3SJHA 1H1VA 4Y0WA 3H3NO 5AQSA 2ZF5O 5LJVA 3FE1A 4MO4A 2E2OA 4XEIA 3UKUA 4B1XB 2Q36A 3SK3A 3QFUA 3TU5A 3U9ZA 4PKGA 1ZBSA 2YHXA 1LOTB 2YCHA 5LY3A 2P9SB 1YUWA 2KHOA 3JXUA 2A42A 4B1YB 2QW9A 4BGBA 4BG8A 3CJ7A 4FO0A 3DWLA 3D2FB 3WUHA 4JD2A 3FZLA 4MLEA 1MWMA 4WQ5A 4BRHA 4BVOA 1U6ZA 2P9UA 1V4SA 3MK6A 3DXMA 4A61A 3FZHA 4Z94A 5ADXA 3HSCA 1ATSA 2Q0RA 2ITMA 1KAXA 3A0IX 3TPQA 3VOVA 3WXKA 4MLHA 2EWSA 3J8AA 5B8HA 2W41A 4EAHD 2CGLA 4BRAA 2ASOA 1NGIA 3WEEB 3WXJA 3QB0A 5BPLA 1KAZA 4BREA 3H3OB 4ISEA 3VERA 2A5XA 5AQIA 3QFPA 1WUAA 3P4IA 4FOEA 4BRDA 3MCPA 4BRPA 4BRKA 4CZFA 4JD2B 5BR9A 2D0OA 3A5MC 5BREA 1BUPA 2QWRA 4H0OA 1HKGA 4PKHA 2P9UB 3FZKA 3LDNA 1BU6O 2GEMA 2GWJA 4GNIA 4K41A 3H1VX 5BN9A 4EHUA 4AM6A 4A62A 4H5RA 1DEJA 4M63C 3LDQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3D2EA 5HOOA 4UQGA 3P1GA 2E1YA 3U3GA 3MX5A 4KREA 1ASUA 4H0XB 1N36K 4JNEA 4OVLA 3TSQA 1QQNA 1Q7YO 3KK1A 4BDPA 3P38A 1NOYA 2DTUA 4JK7A 2W6LA 4RW8A 1WN7A 4U67L 4HUFA 5KPRA 4CJRA 4FK0A 1YJ9N 4BRFA 3AVKA 5AQMA 4ILGB 3F73A 4IJNA 5CY4A 4V19S 1ZBIA 1HNWK 4AHTA 5JS2A 4JS4A 3LAKA 3V1OA 4CGIA 4CFDA 2UXBK 1RDAA 3ZSYA 2OYQA 4B3SK 3CJ1A 4DTJA 2XY6A 3FFKB 5J1EA 4F4KA 1VAZA 1Y64A 1FW6A 3KLGA 3CC4N 4FJ5A 4HUEA 4KAZA 1TUYA 3SI6A 5T7BA 1LWCA 3QEXA 4N41A 1U48A 2WTUA 1XNRK 2WC9A 5F0XA 4CFBA 1BO5O 1CZAN 2QK9A 1D5AA 2W6KA 4E0DA 3O4NA 4CIGA 4KHQA 3O80A 4WFAL 3QETA 3NFAA 1B9DA 2VCPA 4AM7A 4EP5A 1ZBFA 2B5JA 3K0SA 5I3UA 5EVZA 3EY1A 2F8TA 1QHTA 4H0VB 2FLOA 4Z4HA 1VQ5N 4BE1A 3SQ4A 4ELUA 3LZJA 2DFHA 4QCLA 1ITGA 3O3GA 1S1VA 3ULEB 1DT9A 3ZYYX 3O1WA 4A5AA 3TTCA 4FVUA 2VGNA 3VA3A 4FWKA 3DLRA 3KZBA 5BR8K 1EX4A 1GLCG 5AZJA 2ASMA 2YKNA 2OPQA 3CCRN 1GLBG 1K8KA 2OCEA 4CJ5A 4ZTFA 4EZ6A 2RN2A 4CFCA 4WFNL 3IUCA 1U2VB 3RR7A 4BR7A 2O8EB 4FM2A 3DLBA 4GVEA 3VQ9A 4BC2A 1Q9YA 3DXMB 2WOMA 1YITN 5AQYA 1D8YA 3LM2A 3D7EO 5EX5A 3Q7CA 2PBDA 4PHTX 2D4WA 2D0CA 4PUOA 3HYFA 3HRGA 4ZHRA 3TTFA 1K8AO 1IKXA 5BRDA 2XY5A 1RILA 1LW2A 3KJVA 1NMNA 1X3NA 4LSLA 3V4IA 4B9VA 1DTQA 1SKSA 3HPGA 1G99A 1N33K 1FXXA 3AVHA 1OVYA 3KKSA 4HHTA 5AQLA 2ZWHA 4FW1A 1QSYA 1NMDA 3OYBA 3FZMA 4L3QA 4JAXA 4HCBA 1EXQA 3J80O 1NJXA 2OPSA 1RT5A 1V4TA 3CCEN 1EO1A 2Y1JA 2HF3A 4Y1CA 3CC7N 1NGAA 4DSJA 3KWIA 5BRFA 1RT6A 3O9QA 3NH1A 2P5GA 1VK0A 1JLAA 4CEQA 2YHBA 2P9PA 4YFUA 3OYKA 1XHZA 3JS6A 3CXCM 4CD3A 1VSIA 2OTJN 3HOTA 1KSPA 2PZSA 4Y1DA 4H5VA 1XHXA 3G6EN 2D5RA 2OANA 4CGGA 3DRPA 4FJLA 3EZWA 1OH6A 2V52B 2FSJA 3CFPA 4JKCA 4DTSA 4R5PA 1QZ6A 3GL1A 4DSIA 2RKIA 4JRQA 4FJJA 1LV5A 1IO2A 1LWEA 3EYZA 1GOCA 3ZX3A 4A59A 1QSLA 1VQ8N 3EE9A 2E2NA 3FLCO 4H5NA 4DQSA 3CJ9A 4CGJA 4H0YB 1VQLN 4GVMA 4OKKA 1JCGA 3ATVA 3FR0A 4OO1J 4E19A 3RR8A 4FWNA 3NF9A 2O8DA 2FC0A 4X65K 1TAQA 3SPZA 4UY8O 4C8MA 4LF7K 3AAQA 1YF5L 3WQTA 1TK0A 3OYNA 3MEEA 4DLGA 4CFAA 3QO9A 4IDKA 3E01A 4Z4EA 3O08A 3HBTA 4CZKA 1RDDA 4MQ3A 4YDUC 4FVMA 2W42A 3MCAB 2DFFA 3AVLA 1TYQB 3NVKA 4BR4A 2P9KB 5FRNA 1RDUA 3GOIA 3KWGA 3BP8A 4KRFA 3NAEA 3G71N 5HBMA 5BN8A 3G0ZA 3NBPA 4IOAL 2BTFA 1RT4A 4IG3A 4M7XA 3U3YA 4B9MA 3O4WA 4HTUA 4LF5K 1Z05A 2FBYA 3WNEA 4KHWA 3G4SN 3AVMA 3ZSWA 1VQ6N 1YVNA 4OGCA 4OPJA 4E7LA 3OVNA 1BQNA 1WSFA 4KH5A 1VQKN 2OTLN 2D0AA 4IDHA 1KVCA 2W40A 4CZEA 1SL2A 1U04A 3VEZA 3CJAA 2NRXA 4Z4GA 2BUPA 3SCXA 3DRSA 4FJ7A 1YI2N 4KH6A 3ZT0A 2DFEA 1J54A 3AGKA 2ZQBA 4H4MA 4IO8A 4NYFA 1N34K 5EOYA 3HO1A 5HP1A 3E9PA 4CERA 4CHNA 1KVBA 4FYDA 1FK9A 2HHVA 3KTQA 4YDUA 3QEIA 2AP1A 4B1UB 2P9IB 4F2RA 4OX9K 4JV5K 2JGUA 3BGRA 3EKUA 1NWKA 4KFBA 2X78A 1S1XA 5J2PA 3L8BA 5CE3A 2RPIA 1S3XA 4KTQA 3CG7A 5M1NA 4DSLA 1YXQA 5AQWA 3SUOA 3K5NA 1KRPA 2YI1A 5M1KA 2F4VK 3HTVA 2HBKA 3VTHA 2G8HA 1Q86O 4I6MB 2P9LB 4ISFA 3VTIA 2ITGA 3QNOA 2VGMA 3AGRA 1RTHA 4FK2A 2FBVA 4RW7A 3VQEA 4LY7A 3AARA 1VQMN 4WFBL 2UXCK 3I0RA 5E84A 3F2KA 2PAVA 3VF6A 4CIEA 3VPZA 3KK7A 3PLAA 5LJVA 5JVHL 2PYJA 2F8SA 4MO4A 4XEIA 3SK3A 3F9KA 3QFUA 2GX9A 3D6RA 2HVHA 4JI6K 3BY5A 4LF8K 1L3SA 3U9ZA 1ZBSA 3G10A 3NMUA 1Q82O 1KVAA 3EEQA 4F2SA 3C65A 3JXUA 1J9AA 4BG8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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