The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
117
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structure length |
117
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Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFRK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
|
| molecule keywords |
16S rRNA
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| publication title |
A structural basis for streptomycin-induced misreading of the genetic code.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
28
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| structure length |
117
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| sequence length |
117
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4LF9 K; 2UUA K; 1N33 K; 4JI4 K; 4NXN K; 4LFB K; 5LMU K; 4JI5 K; 4X62 K; 3OTO K; 4JI1 K; 4DV0 K; 4V19 S; 4DR4 K; 4K0K K; 2E5L K; 5FLX O; 4LFC K; 1HR0 K; 2VQF K; 3T1H K; 4X66 K; 4DR2 K; 3JAM O; 4LF8 K; 2UXD K; 1N32 K; 2UXC K; 4DV7 K; 4GKK K; 5BR8 K; 5AJ3 K; 4JI2 K; 4DV6 K; 1J5E K; 1XMO K; 4LF5 K; 5A2Q O; 4DUY K; 1HNZ K; 2HHH K; 2F4V K; 1N34 K; 1FJG K; 4X64 K; 4JI8 K; 3J81 O; 2VQE K; 4B3M K; 4LF7 K; 4GKJ K; 4B3S K; 4KHP K; 4DR1 K; 4DV1 K; 1XNQ K; 4JYA K; 4YHH K; 1XNR K; 5IT9 O; 4DV3 K; 5LL6 Z; 1N36 K; 3J7A P; 4B3R K; 2UUB K; 1XMQ K; 4DR3 K; 4CW7 B; 4DR5 K; 1IBL K; 1I94 K; 4YY3 K; 4OX9 K; 4JI6 K; 1HNW K; 4DR7 K; 4DUZ K; 4NXM K; 4CVN E; 2ZM6 K; 4DV4 K; 1HNX K; 3T1Y K; 5LMN K; 4AQY K; 4JI3 K; 4DV5 K; 4DR6 K; 4DV2 K; 4X65 K; 2UUC K; 3J7Y P; 4B3T K; 4JI7 K; 1IBK K; 4LF4 K; 2UXB K; 2UU9 K; 4LF6 K; 5IWA K; 4LFA K; 3J80 O; 4JI0 K; 4JV5 K; 1IBM K; #chains in the Genus database with same CATH topology 5BPM A; 3CC7 N; 4A59 A; 3VTH A; 3NGZ A; 5K14 A; 4FK0 A; 4DQR A; 1C0T A; 1BIS A; 4JI4 K; 4GV6 A; 1KAZ A; 3UB5 A; 4KHS A; 4IO9 L; 3EE8 A; 4E7L A; 3RRH A; 3TTD A; 1RBT A; 2YHX A; 1ASW A; 4IBN A; 4CD3 A; 1VQO N; 3C95 A; 5FLX O; 3IKM A; 4CHY A; 3T7Z A; 1WSG A; 3WEE B; 3G10 A; 1VSI A; 2OZS A; 4CHN A; 5FPM A; 2IDO A; 2PZS A; 1RBU A; 3H08 A; 3E01 A; 3AAR A; 5KPT A; 2JGU A; 4FPB A; 5B8H A; 5BR8 K; 2V51 B; 3F9M A; 4K43 A; 3NGI A; 1S1V A; 2P9I B; 1YTA A; 1MDU B; 1VRU A; 3JS6 A; 3PSF A; 5A2Q O; 4MO4 A; 3ENB A; 4FLY A; 3ZSR A; 1NKB A; 4DSK A; 3TSU A; 4FCY A; 4MLE A; 5C10 A; 3CCV N; 5KQD A; 2IVO A; 2H3G X; 3FZM A; 1XC9 A; 4OO1 J; 1RGI A; 3MXI A; 2E6M A; 3DXK B; 1FW6 A; 3NF7 A; 4GY2 B; 1C6V A; 5EX5 A; 3DYA A; 1BUP A; 1C0F A; 2RPI A; 4DV3 K; 3VPZ A; 4B9T A; 3O9U A; 2OTL N; 4JKG B; 3DRP A; 4CHP A; 4MDA A; 1HRH A; 3IS9 A; 1RTH A; 4RW6 A; 4C1N K; 1Y97 A; 3WXI A; 3K9J A; 1NJY A; 3AO4 A; 4KH5 A; 4CCH A; 4Z4I A; 1RDD A; 4NCB A; 1X1P A; 3HOS A; 1CZ9 A; 3HRG A; 3DLR A; 3ITH A; 4DTP A; 1OH8 A; 1CZB A; 4OPH A; 1ZBI A; 4DTR A; 2A5X A; 2GV9 A; 4IOX A; 3CJ9 A; 2FLO A; 4B08 A; 2JLE A; 4CEQ A; 1RT6 A; 3CJ7 A; 5TKY A; 3E9P A; 1LWE A; 1QTM A; 3KTQ A; 5AZJ A; 1KVB A; 3MDQ A; 4ELU A; 5MLC Q; 2VCP A; 4O0I A; 4H0X B; 4LFB K; 4K8Z A; 3ZT3 A; 4CHO A; 4DSE A; 4DMN A; 1BGX T; 3KK3 A; 1OH7 A; 1RBV A; 3FZK A; 3OYE A; 3FZH A; 5AQS A; 4DU4 A; 2AA4 A; 3CFR A; 2VQF K; 1ZBF A; 3GG4 A; 3PUF A; 4H0O A; 4YOT A; 1KFD A; 4NCG A; 4RW4 A; 3K57 A; 4KV8 A; 1KSP A; 1RTI A; 4QS8 A; 4WQ5 C; 1W9H A; 3TAE A; 4OLA A; 3VEW A; 3CQ8 A; 3CJC A; 2OYQ A; 2VGM A; 3B8A X; 1XWL A; 1GLA G; 3THW B; 3LP3 A; 4DUY K; 4JLH A; 3ZT2 A; 3D0P A; 2F4V K; 4CJT A; 3CCJ N; 1GLB G; 1YJW N; 4KO0 A; 5HBM A; 1FXX A; 1NGJ A; 4BE1 A; 3ATV A; 1H1V A; 1YVN A; 4XH4 A; 1YIJ N; 5BR9 A; 1HYS A; 2ZE2 A; 3DI6 A; 3SUO A; 3U8X A; 4XH1 A; 5FRM A; 1TKT A; 1QQM A; 3H46 O; 1XNQ K; 2O8C B; 1HX1 A; 1U2V B; 4DHY A; 1LW0 A; 2O8B A; 4H03 B; 2EHG A; 1DTQ A; 3P1G A; 5KQ8 A; 3ZX3 A; 2QWO A; 3CCQ N; 4YDU C; 1D5A A; 5AQX A; 4CJU A; 1JLG A; 3DRS A; 4FLU A; 3TTC A; 2WUS A; 1J5O A; 2D1K A; 1TKX A; 1W97 L; 4BVP A; 4KTZ A; 2E20 A; 3LM9 A; 1VK0 A; 3GOI A; 1NM1 A; 5J2P A; 3LP0 A; 2FSK A; 3LAK A; 2D4W A; 2NRH A; 3SBT A; 3VEZ A; 4CZH A; 1SL1 A; 3BP8 A; 1LCU A; 1YVU A; 1NGG A; 3DXM B; 1C0M A; 2GBZ A; 3VF6 A; 2I7P A; 4YOW A; 2HW3 A; 1JCG A; 2NNW A; 3C65 A; 4BG8 A; 4CFA A; 4LFA K; 4FPA A; 3K2P A; 1IG9 A; 1IBM K; 4F3T A; 1KVA A; 2P9P B; 1Q7Y O; 3OVN A; 5JLH A; 2F9W A; 3VF4 A; 3OBW A; 1BCM A; 3KLH A; 3WNG A; 2KQ2 A; 3K5L A; 3THX A; 5AQZ A; 3CXC M; 3NDK A; 1T05 A; 4WQ4 C; 1QSS A; 2QWL A; 1UWB A; 3ZSZ A; 3DJC A; 4H4M A; 4FW2 A; 3IFR A; 3SUP A; 3AVA A; 4FWN A; 4CJR A; 1WSE A; 1TL3 A; 3OJU A; 3EKU A; 2WFB A; 4BE2 A; 3NGY A; 2GWJ A; 1BWF O; 1K6Y A; 2I7N A; 3O8M A; 3CI5 A; 4DTO A; 3AVF A; 3EZW A; 4DQS A; 1VQ9 N; 4FWL A; 4FJH A; 4C8O A; 4DV6 K; 2QA4 N; 2PBD A; 3VQ8 A; 3VGK A; 2WC9 A; 4L8R B; 2OPQ A; 3EL2 A; 5FPD A; 4OGC A; 3ZCM A; 1MWM A; 2WBN A; 4IJN A; 1C0U A; 1VQP N; 4C1N I; 4BRN A; 3N4P A; 2NUB A; 3TSQ A; 3VOV A; 2HB5 A; 3QER A; 4B9N A; 1XQS C; 2CH5 A; 3G4S N; 1NG9 A; 1VSK A; 4F3O A; 1N36 K; 2QI2 A; 2QWN A; 4CFB A; 2GEL A; 2HF4 A; 1R0A A; 5AQK A; 5CZ1 A; 1UA1 A; 3LAN A; 4YOY A; 5HP1 A; 3V1O A; 3EO3 A; 1QQN A; 1BQM A; 1EKE A; 2YNF A; 3CM6 A; 3L0Q A; 4FM1 A; 4WFN L; 4DUZ K; 5C2D A; 3V9X A; 1NKC A; 4BR5 A; 2ZWH A; 3QBW A; 3R1X A; 4I9L A; 1S6Q A; 3BGR A; 4DS5 A; 4BRI A; 4IOC L; 3O9S A; 3AO1 A; 4GVM A; 3WXM B; 2P9S A; 4M3U A; 4WFA L; 4DS4 A; 1YHQ N; 1KC8 O; 5AQN A; 4E7I A; 4FWQ A; 2UXB K; 3KVG A; 3BY5 A; 4UQG A; 3V9Z A; 1EQY A; 4CJQ A; 1U4B A; 5JVH L; 2P51 A; 4F2R A; 2XY5 A; 4GV9 A; 1UA0 A; 3A5O C; 1J6Z A; 4BR7 A; 4FYD A; 3WNF A; 4H4O A; 2YI1 A; 4IG0 A; 2OTJ N; 2E4L A; 3AVI A; 3RR7 A; 4KB0 A; 3F2K A; 2KKZ A; 2E1Y A; 1B9F A; 1RT7 A; 1IKW A; 4CFD A; 3U4L A; 3ZEU B; 4DB3 A; 2HHV A; 4X62 K; 3K5M A; 2FC0 A; 5EU7 A; 3OS1 A; 4JKA A; 1TKZ A; 3RTV A; 2JWK A; 1HR0 K; 4JKB A; 3CER A; 4BRQ A; 4EHU A; 5AZI B; 1HKB A; 1T6D A; 3A5N C; 2Z1I A; 3R6M A; 3TAP A; 4W5R A; 2P9K B; 1Q86 O; 4DV7 K; 4QOZ B; 1OVY A; 2E2O A; 3ZX0 A; 4ID5 A; 2CH6 A; 4BAC A; 3IUC A; 3AVH A; 4CBX A; 2IS3 A; 5AQV A; 4O8K A; 4IFY A; 3RRG A; 1BCO A; 3HJF A; 2BE2 A; 1LAV A; 1YI2 N; 3HO1 A; 3O4W A; 4W5Q A; 2PAV A; 3S3O A; 2ASO A; 4PY5 A; 5JS1 A; 4JS5 A; 3TTF A; 2NRV A; 1XNR K; 2VWK A; 1ZBS A; 4DFK A; 3NAE A; 1Q81 O; 3MN5 A; 4CER A; 3QIO A; 3FFI A; 2UUB K; 1HUX A; 3MXM A; 3TAQ A; 3C7N A; 3AGK A; 2FSN A; 5M1O A; 3IDH A; 3D6R A; 4OX9 K; 1NGF A; 1EXQ A; 1A5X A; 2ASP A; 4I2Q A; 3CHW A; 3MN6 A; 3VQ5 A; 3ZSV A; 2RHK A; 3THY A; 1T8E A; 3D2E A; 1VQL N; 2DFF A; 1SL0 A; 1BI4 A; 4ICL A; 4B1W B; 2Q97 A; 2HVI A; 4Z94 A; 3GE1 A; 3KK2 A; 2P5G A; 2O8D A; 1KLN A; 4JI7 K; 2FSJ A; 5TKW A; 1IBK K; 3L4Q A; 3ZT1 A; 2Q1N A; 3HM8 A; 2F8T A; 1CXU A; 2DFE A; 5HLF A; 3O3F A; 4M3X A; 3OYC A; 2V52 B; 4BRG A; 1N33 K; 4JKD A; 1TUY A; 1EX4 A; 2FBX A; 2FBY A; 3O4N A; 3KWG A; 4PKI A; 3I33 A; 3OTO K; 3LDS A; 4A57 A; 1HMV A; 3ATU A; 3O1B A; 4H0V B; 4PUO A; 4LFC K; 1QVF M; 1HJR A; 2E2N A; 3A2F A; 4DR2 K; 3P31 A; 2BGG A; 4NLB A; 3SK3 A; 3LWM A; 1N32 K; 3QBX A; 3BUZ B; 3QNO A; 4H0P A; 3I55 N; 3V1R A; 4WE1 A; 2VG6 A; 3CD6 N; 1NK7 A; 4KRF A; 3DRR A; 3LPT A; 1N6Q A; 1BIZ A; 3SUQ A; 1O1W A; 1N34 K; 2OZM A; 4FVU A; 2QW9 A; 5CY4 A; 1U49 A; 3HPH A; 3WNE A; 1CZA N; 1SKR A; 3NFA A; 3M1F A; 1SQK A; 4FWP A; 4MQ3 A; 4DSL A; 2FBV A; 3A5L C; 3VQQ A; 1Q8I A; 3GBT A; 3ZSQ A; 4B1X B; 3J8A A; 4BC5 A; 4H5T A; 5FRO A; 3KLG A; 1Z25 A; 1QQO A; 3SQ1 A; 2KFN A; 1MA9 B; 1VRT A; 2D0A A; 2A3Z A; 4QCL A; 2FBT A; 3CYM A; 4DCH A; 1T7P A; 3DMJ A; 3S41 A; 5GAG P; 4CJP A; 4LH4 A; 3CMA N; 1UOC A; 1RNH A; 3UKU A; 2IVP A; 2YHB A; 1HNX K; 2BDP A; 2QWM A; 3EZ5 A; 4AQY K; 4JI3 K; 4I6M B; 2DTU A; 3TSP A; 5AQJ A; 3L4I A; 3CJB A; 2BUP A; 5H1S Q; 4H5N A; 5C12 A; 4LF9 K; 2HNY A; 3HVR A; 4U7B A; 5AQF A; 3OYN A; 1NK8 A; 1LOT B; 2ZGY A; 2A1R A; 1BL3 A; 3QEP A; 3AO3 A; 4V19 S; 4JK9 A; 3QFP A; 3KD1 E; 1NJZ A; 1RTJ A; 4JN4 A; 1TAQ A; 4CF1 A; 3ISN C; 4DFM A; 3ID8 A; 3CCE N; 4FWS A; 4CE9 A; 2A6A A; 1WOQ A; 2QTD A; 4X66 K; 3F73 A; 4Q0B A; 3QLH A; 4M3Y A; 2ETJ A; 3HM9 A; 1SV5 A; 4MDB A; 2NRT A; 1QVG M; 4N5S A; 4IWV A; 4DSF A; 3HST B; 1KFS A; 2ZGZ A; 1TVR A; 2HOE A; 5ADX A; 3TAM A; 3C6T A; 4AF1 A; 4RW9 A; 3O08 A; 5F1X A; 3DOL A; 1K8K B; 5AQG A; 3LDN A; 3D7E O; 4B3M K; 3PV8 A; 2GEM A; 4HWI A; 4B3S K; 3E66 A; 5AQM A; 2A40 A; 2Q36 A; 3D45 A; 1HKC A; 5EVZ A; 3J7Z O; 5IT9 O; 5FRN A; 3ENH A; 3EKS A; 4B3R K; 3H3O B; 1ZXO A; 4K41 A; 3MXJ A; 4NYF A; 3C6U A; 1HNV A; 3MEE A; 4LSL A; 4OKJ A; 1XMQ K; 3AO2 A; 1BHL A; 2XY8 A; 3LDQ A; 5HRN A; 1TK8 A; 4M3Z A; 1S72 N; 4FLV A; 3ENO A; 1KVC A; 3QIP A; 4DLG A; 1RBR A; 3LDL A; 4KTQ A; 1KAX A; 3OYM A; 2E2P A; 1BA1 A; 4DG1 A; 4GMJ B; 3ZT4 A; 1HLU A; 3O9Q A; 4KBO A; 4FJ8 A; 4IO8 A; 4Z0U A; 2KLA A; 4JAX A; 4CZL A; 4KI4 A; 3QML A; 2YNI A; 5E26 A; 4B3T K; 4FJM A; 1ATN A; 4JKE A; 4IOA L; 1SS6 A; 1OH6 A; 2YCH A; 5C25 A; 2B5J A; 3DWL A; 4MO5 A; 4NB4 A; 5D3G A; 1GLC G; 5C0Y A; 3DXK A; 4FK2 A; 2YNG A; 3UKR A; 3VQE A; 1U04 A; 4BG9 A; 4MFB A; 3LM2 A; 2ZD1 A; 4AH9 A; 1NOY A; 3L3V A; 3S3M A; 4DV0 K; 2HVH A; 3V4I A; 3MWP A; 4IKF A; 1S6P A; 4JKG A; 4DF8 A; 3M3Z A; 3HVT A; 2IGI A; 1NLV A; 3L8B A; 3EN9 A; 5AZJ B; 3VER A; 1WBB A; 1NNE A; 1DKG D; 2XY6 A; 1JCF A; 1BO5 O; 2D0O A; 4I2P A; 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3W3D A; 3D2F A; 4CF0 A; 4JHD B; 1B9D A; 1T44 A; 4BRC A; 5KRS A; 4KKO A; 2QK9 A; 3PX4 A; 2NRX A; 3NCI A; 4DSI A; 4WQ5 A; 3MX2 A; 2HHQ A; 3RSE A; 5EXW A; 3V81 A; 3F9K A; 5ELZ A; 3DXM A; 4DU1 A; 4M3T A; 2QKB A; 4CJV A; 3QNN A; 3VQ7 A; 4FWM A; 3OYA A; 4B9M A; 3SMP A; 4CEF A; 1TK0 A; 1X3N A; 3SLC A; 4WYB A; 1WAF A; 4X64 K; 1LW2 A; 3PO4 A; 4JD2 B; 3TAR A; 3WQT A; 1KXP A; 3QET A; 2P9P A; 5JLF A; 4LC9 B; 1QSL A; 4KI6 A; 1D4X A; 4FL9 A; 5FDL A; 3ULE B; 1KTQ A; 2A42 A; 4E0D A; 4ILG B; 5AQL A; 4B9Q A; 2F9T A; 4C8L A; 4WFB L; 1HKG A; 4IG3 A; 4EAH D; 3CCU N; 3VA0 A; 3H45 C; 2E88 A; 3DLK A; 4CHQ A; 1HNW K; 5GIP A; 3VTI A; 4JS4 A; 2W6L A; 4JKF A; 3TAG A; 2ZM6 K; 5HRS A; 4J2A A; 1JCE A; 5C2F A; 3AVN A; 2QXL A; 3DM2 A; 5CE3 A; 5JVG L; 1JLC A; 4CJ4 A; 4E1M A; 1VSM A; 1O13 A; 1NK5 A; 5ADX H; 1RTD A; 2X78 A; 4KH6 A; 2HHX A; 2NZT A; 1J9A A; 3FE1 A; 1CLQ A; 4IFE A; 4OJR A; 3A0I X; 4KHN A; 2QXF A; 4C23 A; 4LD0 A; 5CYQ A; 1R59 O; 3O9T A; 4BDY A; 3PSI A; 2NRR A; 3F5T A; 3HSC A; 5J1E A; 4CZG A; 1VQM N; 4WQ4 A; 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