The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
117
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structure length |
117
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Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFRK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
|
| molecule keywords |
16S rRNA
|
| publication title |
A structural basis for streptomycin-induced misreading of the genetic code.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
28
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| structure length |
117
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| sequence length |
117
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1N34 K; 4GKJ K; 4DR4 K; 2ZM6 K; 4DR3 K; 4LF9 K; 4DV6 K; 4JV5 K; 2HHH K; 4JYA K; 4DR7 K; 4LF8 K; 4B3T K; 4X62 K; 4OX9 K; 4KHP K; 5IT9 O; 1XNQ K; 2UXB K; 4JI6 K; 4CW7 B; 1J5E K; 2UUA K; 4LFB K; 4LF7 K; 5LMU K; 2UXD K; 4DV1 K; 4DR5 K; 4DR2 K; 4JI2 K; 4DV0 K; 4DR1 K; 4X64 K; 4GKK K; 3J81 O; 1HNW K; 4X66 K; 1I94 K; 4V19 S; 1FJG K; 4JI1 K; 5BR8 K; 1XMQ K; 2E5L K; 2UUC K; 4JI5 K; 3JAM O; 4JI4 K; 3T1Y K; 1HNX K; 3J7Y P; 5LL6 Z; 2UXC K; 4LF6 K; 4YY3 K; 1XNR K; 4LF5 K; 4JI8 K; 4B3S K; 5LMN K; 4JI3 K; 1XMO K; 4LF4 K; 4LFA K; 1IBK K; 4AQY K; 1N32 K; 4B3R K; 4DUZ K; 1IBL K; 4YHH K; 4JI7 K; 1IBM K; 4X65 K; 5FLX O; 2VQF K; 3OTO K; 4NXN K; 4DV5 K; 4NXM K; 4DV4 K; 2VQE K; 1N36 K; 5A2Q O; 1N33 K; 4CVN E; 3T1H K; 5IWA K; 4DV2 K; 5AJ3 K; 1HNZ K; 2F4V K; 2UU9 K; 4K0K K; 4B3M K; 4JI0 K; 4DV3 K; 3J80 O; 2UUB K; 1HR0 K; 4DV7 K; 4DR6 K; 4DUY K; 3J7A P; 4LFC K; #chains in the Genus database with same CATH topology 3OYH A; 2KKZ A; 2D0C A; 1TAU A; 3IKM A; 1BO5 O; 4B9N A; 3N4P A; 1EXQ A; 3AO5 A; 4AM6 A; 2P9L B; 1ATR A; 3NGZ A; 4A59 A; 3NGI A; 4OGC A; 2YNF A; 2HHX A; 2V51 B; 1J6Z A; 2Q31 A; 5HOO A; 2E6M A; 1NOZ A; 4E89 A; 2ITM A; 1U4B A; 5H1S Q; 4IEI A; 4IO9 L; 4BR5 A; 2ASO A; 4FK4 A; 4CW7 B; 2G8U A; 1IKV A; 5GAD P; 5E26 A; 4CJQ A; 2AJQ A; 4RW4 A; 3KLF A; 4QS7 A; 3EY1 A; 3BZK A; 1NGB A; 2W6L A; 4I9L A; 3SMP A; 4IDH A; 4IG3 A; 4M7X A; 1QQC A; 5ADX A; 4BRD A; 4HCC A; 4FM0 A; 2IDO A; 3THY A; 1LAV A; 3SJH A; 4NCA A; 4PKH A; 4WQ5 C; 1HJR A; 3EKU A; 2YV0 X; 4G1Q A; 4CZE A; 3OYE A; 3HXM A; 1YI2 N; 4CEZ A; 1MU2 A; 1JLG A; 3AA4 A; 3CCL N; 4F2S A; 1L3U A; 3WXM B; 4FZZ A; 4EIA A; 2HND A; 3MEE A; 4Y1D A; 3NF9 A; 4YY3 K; 5JS1 A; 3DI6 A; 4GV3 A; 4JI8 K; 5KI6 A; 3ZT2 A; 1S1W A; 4KRF A; 3K5M A; 4JN4 A; 3VA0 A; 3FZL A; 4N76 A; 3MN5 A; 4RW7 A; 3ZT1 A; 4KHN A; 4ZTF A; 3ZX0 A; 1M90 O; 1QQN A; 3SUQ A; 4KFB A; 4K8X A; 2Q0U A; 4H0O A; 2Q36 A; 3U9D A; 4LSN A; 4JAX A; 1C0U A; 2OTL N; 3RMD A; 4ISG A; 5AQQ A; 1RTD A; 3HOT A; 4NXM K; 4DV4 K; 1BQN A; 2GBZ A; 1RDU A; 2J4R A; 4FK2 A; 3ID8 A; 2HHQ A; 5FPD A; 1WN7 A; 1WSG A; 5J2M A; 4OPA A; 3S3N A; 2FF3 B; 3O3F A; 1VHX A; 5KQ8 A; 4M41 A; 3Q7B A; 4DTO A; 3L3U A; 3MEC A; 4KBO A; 4Z4I A; 4IDK A; 5DM7 L; 3DLG A; 1RDC A; 3O4W A; 1BL3 A; 4UY8 O; 1SQK A; 4K42 A; 5TKW A; 3CJB A; 2KZM A; 4C1N K; 3NE6 A; 3PY8 A; 2ZM6 K; 1Y97 A; 3ULE A; 2ZJQ L; 5TKY A; 1NK7 A; 2O8E A; 3P31 A; 3O9R A; 1CZB A; 4X62 K; 4GY2 B; 3VQ7 A; 4NO7 A; 3KWI A; 4BGB A; 1GLC G; 4LFB K; 3HVR A; 1I39 A; 1T6D A; 2FXU A; 5FRM A; 2P9U B; 2YHB A; 3ZT0 A; 4JS5 A; 1SKR A; 1CXU A; 3MWP A; 1M1K O; 1QTM A; 1ZBU A; 3PSI A; 4AH9 A; 1WSF A; 3TAF A; 3G4S N; 3CJ1 A; 3HP9 A; 3AV9 A; 4DS5 A; 4BRQ A; 5GIN A; 4BQZ A; 3CIP A; 3T1Y K; 2O4I A; 1ILY A; 3AAR A; 3HJF A; 3TSQ A; 2B4J A; 3SQ2 A; 3C65 A; 3E9O A; 4R79 A; 2Q0R A; 5J2N A; 1EO1 A; 4W5Q A; 1IKY A; 1RTH A; 4O0J A; 4OGE A; 5AQT A; 3NF7 A; 4AQY K; 3I0S A; 1YVN A; 3ITH A; 4CJS A; 3VN5 A; 4HWI A; 4E1N A; 4FLZ A; 1QE1 A; 3WNG A; 4CK3 A; 3QML A; 4M3Y A; 1WNS A; 4OLB A; 1NJZ A; 1VQL N; 4FLW A; 3L2W A; 2VQF K; 3SAF A; 3OS2 A; 1S1U A; 4BRF A; 3VEZ A; 4CBW A; 1VQN N; 1IG8 A; 4EFH A; 2HNY A; 3DXK B; 1N36 K; 2G8H A; 3ZT3 A; 3K9K A; 2QWN A; 4IFV A; 4ZHR A; 3LDQ A; 4C8K A; 2QEX N; 3PLA A; 3HM9 A; 1QHA A; 2F4V K; 3E9P A; 2ZE2 A; 4MLE A; 3ZEU A; 4BGA A; 4EP4 A; 3PIO L; 3VQ6 A; 2NRW A; 3LWM A; 2YKN A; 4FW1 A; 3T69 A; 5T7B A; 4IZ9 A; 4RTF D; 2R7Y A; 2YJF A; 4JD2 B; 1HKB A; 4DTP A; 3K2P A; 3FR0 A; 3C6A A; 4CHY A; 4FJI A; 4DTU A; 1QZ5 A; 4GKJ K; 5BRD A; 2O8C B; 4LF8 K; 4CF0 A; 2PYL A; 2HF4 A; 4IWV A; 4E7H A; 1OH7 A; 2UUA K; 1V4T A; 4FL9 A; 2UXD K; 1GOA A; 4NYF A; 3UIQ A; 3BF3 A; 4DV0 K; 2A1S A; 3T19 A; 4CCH A; 3HK2 A; 3G71 N; 4B1X B; 4ISE A; 4CZJ A; 2XY5 A; 4V19 S; 2YI1 A; 1NK0 A; 5AQI A; 1ZBH A; 4CBU A; 3LPT A; 3IUC A; 1BI4 B; 2OCE A; 4I9Q A; 4Z4G A; 1VK0 A; 3RR8 A; 2P9S A; 2Z1I A; 4BY9 C; 2GWK A; 3VQ5 A; 1FXX A; 3LM9 A; 1RT2 A; 3OYL A; 1RBU A; 4ICL A; 1W7A A; 3DLL L; 1XQS C; 5LMN K; 5AQJ A; 1VQ8 N; 4DTX A; 4FYD A; 3GL1 A; 4JI3 K; 4BR9 A; 2KQ2 A; 3UKR A; 3LWL A; 1F21 A; 3DLH A; 1BU6 O; 3I8D A; 2XRI A; 5EVZ A; 5BPN A; 3UE5 A; 4CZF A; 1K9M O; 1IBL K; 5AR0 A; 1KC8 O; 4BC2 A; 4M7Y A; 3NH0 A; 2I5J A; 4AF1 A; 2JGU A; 3QLH A; 1FKO A; 1C1C A; 1IKX A; 4O4G A; 1N8R O; 3I0R A; 2Q97 A; 4W5R A; 2D5R A; 5HL7 L; 5AQP A; 3RSE A; 4BDP A; 4E7L A; 3QNN A; 2FSK A; 4OKJ A; 3MCA B; 3SAG A; 5FPM A; 1JXB A; 1JLB A; 1KAX A; 2Z1J A; 4XH5 A; 3HZ6 A; 3PV8 A; 4M3T A; 4C8L A; 4KPY A; 4C8N A; 4LFC K; 4H5T A; 2GX9 A; 3A5L C; 3ZSR A; 4ID1 A; 3D2E B; 4A5A A; 4QS9 A; 4DTR A; 3OYK A; 4ILJ A; 2ZGY A; 4CEB A; 4FJM A; 3CJ7 A; 1EX4 A; 4KHQ A; 4CI6 A; 5DK5 A; 4N5S A; 3WQU A; 1QSY A; 4KH4 A; 5FDL A; 3MN9 A; 3TAR A; 5CZ1 A; 3LP0 A; 1BIS A; 1LW0 A; 1YT3 A; 1BA0 A; 1NGE A; 2JWK A; 2DPN A; 1ZBI A; 1NK8 A; 4FWL A; 4FZX C; 4FK0 A; 5DM6 L; 3LP1 A; 4X66 K; 5AFU A; 2A6A A; 1KVB A; 3MDQ A; 3V1R A; 2P9K B; 3HO1 A; 3T7Z A; 3VQQ A; 1WBB A; 1IO2 A; 5AQH A; 4FWN A; 4QCL A; 5AQU A; 4W5O A; 5J2Q A; 2D4W A; 2RF2 A; 3HYF A; 5HRP A; 4BQL A; 5E84 A; 2KHO A; 4BRL A; 3MXM A; 1WSI A; 3THW A; 4JLH A; 3RVC A; 4CFA A; 4KAZ A; 3IG1 A; 2WC9 A; 4E0D A; 5AQO A; 1XMO K; 1VSD A; 1XUP O; 1A5X A; 3RR7 A; 3QFU A; 3QES A; 3AAQ A; 3BUZ B; 3V81 A; 4IOX A; 4CE9 A; 4GNI A; 2QI2 A; 3E9L A; 2AA4 A; 2ASM A; 5KTQ A; 4JRP A; 3Q7C A; 4I2P A; 1X3N A; 4B9Q A; 3OS0 A; 1L3V A; 4E19 A; 2Y1I A; 1KAZ A; 4BDY A; 1TK8 A; 2XHB A; 4GV9 A; 2HVI A; 3O4Q A; 5KPR A; 2FBY A; 4KHW A; 3EE9 A; 3LP2 A; 1HYV A; 2F9W A; 2QA4 N; 1HYZ A; 1EKE A; 4H0Y B; 2NLX A; 3RRG A; 4Q0B A; 4QS8 A; 3VEO A; 1EQY A; 3LDS A; 3TWH A; 1VQ5 N; 3I56 N; 1OVY A; 3RMC A; 2RPI A; 4IO8 A; 3KLH A; 2OPS A; 4J2E A; 4M63 C; 2FLO A; 2GUI A; 2DFF A; 1ZBL A; 2UUB K; 3T1A A; 4HHT A; 2P9N A; 4DQR A; 4FZY A; 4M3U A; 1XC9 A; 4MDA A; 3QO9 A; 3CXC M; 1NG9 A; 4H0T B; 1O1W A; 3L4Q A; 1VSE A; 4DV6 K; 3PO5 A; 2G8F A; 4DU4 A; 4FLU A; 3SUO A; 1CXQ A; 1TYQ B; 4A2B A; 4IJA A; 2ZF5 O; 3AGR A; 1XNQ K; 3AO1 A; 1RDD A; 5KQD A; 4FLT A; 3O08 A; 2OPP A; 5ADX H; 1BUP A; 3E1Y A; 3VQ4 A; 4FJN A; 3IDH A; 1V4S A; 3GE1 A; 4H5N A; 2GEL A; 1NGH A; 3VTH A; 3OJU A; 5EX5 A; 5C25 A; 4KHY A; 2RE2 A; 1RT5 A; 3JAM O; 3P5J A; 3V6D A; 3SAH A; 5AZI A; 1S9G A; 1LWC A; 2NRV A; 3O9U A; 4BR7 A; 2FF6 A; 5KPZ A; 4B8C A; 2BDP A; 4O0I A; 2HF3 A; 4DLG A; 3VQE A; 5GAG P; 1RBS A; 2A5X A; 3R8E A; 3O1W A; 4WYB A; 4LFA K; 1YUW A; 2IGI A; 3BDP A; 4JKC A; 4JKA A; 2VYP A; 5F2R A; 4B3R K; 3HBT A; 4BWM A; 5JS2 A; 2P5O A; 2HVH A; 1DGK N; 4MO5 A; 4O5F A; 2WFB A; 3WXJ A; 4CHZ A; 4JKB A; 4JI7 K; 1NBW A; 1IV0 A; 4IOA L; 3DRS A; 1YJW N; 1IKW A; 3KVG A; 4L3Q A; 4MFB A; 3OTO K; 3OYM A; 4NXN K; 3LL3 A; 3AVL A; 4OJR A; 4CEA A; 3HP6 A; 4FJ7 A; 4IKF A; 4WFA L; 2A1R A; 1Q7Y O; 1YJ9 N; 4PKI A; 4DSI A; 4CVN E; 2LSN A; 2QWR A; 3MK6 A; 4MLH A; 5AJ3 K; 1JCF A; 3IMX A; 4JS4 A; 4KTQ A; 2I7P A; 1RTI A; 3AVB A; 4ID5 A; 4FM2 A; 3CYM A; 5J2P A; 3L8B A; 3VGL A; 1REV A; 1NMN A; 3F73 A; 3J7A P; 3M3Z A; 5AQY A; 2IIR A; 4GVM A; 2NRR A; 4A61 A; 2W42 A; 4NYN A; 3ZSV A; 3M6G A; 4CBX A; 1HX1 A; 1S9E A; 4CER A; 2NRX A; 4JYA K; 1HQE A; 4XIU A; 5EXW A; 5AZJ B; 1HYS A; 2O8D B; 3SCX A; 4CJE A; 2HBJ A; 1SKS A; 1HNV A; 1TKD A; 3L2Q A; 1WAF A; 2IVP A; 1KVA A; 2P9U A; 4IG0 A; 5AQW A; 2V52 B; 4CJT A; 3VEY A; 3WNH A; 1RDA A; 4BRK A; 5BPL A; 5AQK A; 3D2F A; 4BG8 A; 3GOI A; 1Q82 O; 2A42 A; 3QER A; 1X1P A; 4B8A B; 3CCQ N; 1KLN A; 2E5L K; 3AO2 A; 3WXK A; 2HB5 A; 4CJU A; 2VWJ A; 4KRE A; 1WBD A; 3VMF B; 4BG9 A; 2CH6 A; 1JCE A; 4FJH A; 5EOY A; 1TGO A; 3MXJ A; 4AHC A; 5AQX A; 4XH4 A; 3QBX A; 3ZT4 A; 1KVC A; 3KK7 A; 3AVG A; 4KHS A; 3S9H A; 5C0Y A; 2YHW A; 5JLH A; 5BRH A; 3V9Z A; 3RWU A; 1OKJ A; 5I42 A; 2ZJP L; 2VGM A; 3S3O A; 4DFM A; 1Q8I A; 2YHA A; 4DUZ K; 4JKE A; 1LCU A; 1O13 A; 4FSV A; 3SPZ A; 1HLU A; 3NAE A; 1WAJ A; 5AQF A; 5AQR A; 4FJL A; 3DLE A; 4O8U A; 4WFB L; 4FXD A; 1XWL A; 2ZJR L; 2O8B B; 3AVK A; 3HM8 A; 4ILH A; 1TKZ A; 3SQ0 A; 3NF8 A; 3F9K A; 2E88 A; 2UYT A; 2E2P A; 2HBK A; 3FFI A; 3T1H K; 1BWF O; 4W5T A; 1YHQ N; 3D45 A; 1GLL O; 4XEI A; 4E7J A; 4BC5 A; 1UOC A; 3C6T A; 3LPU A; 1JL2 A; 3IFR A; 3DMJ A; 3C95 A; 1CZ9 A; 3FLC O; 3O3G A; 2ZWH A; 1D9F A; 4DF8 A; 4B9L A; 3KD5 E; 4HUG A; 3UKU A; 3DOL A; 3F5T A; 1N34 K; 2QWL A; 4CJK A; 1HUX A; 4KV8 A; 3MED A; 3QEP A; 3A5O C; 4EP5 A; 2YNI A; 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2YNH A; 3GG4 A; 3VF2 A; 2XY6 A; 2CGL A; 3KD1 E; 2G8I A; 4CZL A; 2CGK A; 4DTM A; 3LAN A; 4DG1 A; 4E1J A; 2O8F A; 4JHD A; 3NDK A; 4BRI A; 4BVO A; 4CHQ A; 3FGU A; 3P4I A; 2X6S A; 2BH1 A; 2Z1H A; 3MXI A; 3AVA A; 4CGI A; 4CFD A; 3UB5 A; 2HMP A; 1EP4 A; 2OA8 A; 2YHX A; 3A2F A; 4B9U A; 2PYJ A; 4CJ5 A; 2V7Z A; 4B9S A; 3J7Z O; 3ULD A; 1FJG K; 5MLC Q; 2KZZ A; 4H4O A; 3QIC A; 3DLB A; 1EWR A; 1VQK N; 2FSJ A; 2HBL A; 1BQM A; 4JKH A; 3ENH A; 3AA5 X; 3KWG A; 1KD1 O; 5LL6 Z; 1U2V A; 3AVC A; 3CHW A; 4LF5 K; 2GEM A; 2KW4 A; 3AY9 A; 3U8X A; 1JXE A; 5FRN A; 4O55 A; 4OPJ A; 5KRT A; 3E01 A; 3VET A; 4I7F A; 3DM2 A; 3ZSY A; 3AVH A; 4AHR A; 4B9M A; 3CD6 N; 1Q18 A; 1QS4 A; 3NHG A; 3S3M A; 1GLE G; 5AQZ A; 1FKP A; 1YVU A; 3WT0 A; 2HST A; 3ULE B; 3EKS A; 5I9E B; 3U3G A; 1J5O A; 3KLG A; 2O8E B; 5IWA K; 1VQ7 N; 4DV2 K; 1Q81 O; 3A0I X; 5EY4 A; 1LAW A; 1HJO A; 2E20 A; 4DSL A; 4BRM A; 3P1G A; 4CEE A; 4H5W A; 4DV3 K; 5HP1 A; 3MMV A; 3K58 A; 3K0S A; 4Q5V A; 3SBT A; 1T03 A; 1MDU B; 3F9M A; 4FWK A; 4AIL C; 1K8K A; 3OYD A; 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