The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
214
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structure length |
207
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Chain Sequence |
GAMDHVEFGLTYSQLMTLKDAMLQLDPNAKTWMDIEGRPEDPVEIALYQPSSGCYIHFFREPTDLKQFKQDAKYSHGIDVTDLFATQPGLTSAVIDALPRNMVITCQGSDDIRKLLESQGRKDIKLIDIALSKTDSRKYENAVWDQYKDLCHMHTGVVVEKEEITPHCALMDCIMFDAAVSGGLNTSVLRAVLPRDMVFRTSPRVVL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Rna binding protein/rna
|
| molecule keywords |
RNA (5'-R(*(GTP)P*GP*GP*C)-3')
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| publication title |
Structures of Arenaviral Nucleoproteins with Triphosphate dsRNA Reveal a Unique Mechanism of Immune Suppression.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Lassa virus
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| total genus |
58
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| structure length |
207
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| sequence length |
214
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-08-30 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3MWP A; 4GV6 A; 3MWT A; 4GVE A; 4FVU A; 4GV3 A; 3R3L A; 4G9Z A; 3Q7B A; 3MX5 A; 3MX2 A; 4GV9 A; 3Q7C A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3DLG A; 3SQ1 A; 4OKK A; 3VA3 A; 4DF4 A; 4O0J A; 5FRO A; 3M8P A; 4BVO A; 4E7I A; 1X9M A; 1VSI A; 2BAN A; 3D6R A; 3RTV A; 2VWJ A; 4DV6 K; 3PO4 A; 1BIS A; 1N33 K; 4B1V A; 3SUO A; 4CFC A; 1WLJ A; 3ZYY X; 4EFH A; 3OBW A; 1ZBH A; 5LMU K; 1BUP A; 4ELT A; 3H08 A; 4DR3 K; 4Y0W A; 4M3U A; 3UE5 A; 3M8R A; 3CCL N; 1C0T A; 3CC7 N; 3K5N A; 4CD1 A; 3DXM B; 1IKV A; 3A8Y A; 3OBY A; 1Y64 A; 4BC5 A; 4IOA L; 4BRN A; 3WNF A; 4JK7 A; 4CJ3 A; 3VQ9 A; 4BAC A; 3V9W A; 4OLB A; 1NG9 A; 1OH8 A; 4PKI A; 3VEN A; 2NNW A; 4HUF A; 2EX3 A; 2OTJ N; 1BWF O; 2UXD K; 1NKC A; 1QVG M; 1TAQ A; 3T1A A; 4NXN K; 3THX B; 4AHC A; 4DMN A; 2YI1 A; 1HYS A; 4M3W A; 1DKG D; 1FJG K; 4CGD A; 1JXB A; 3VQ7 A; 2PAV A; 5JS1 A; 1TKT A; 4BRI A; 4H5V A; 4LC9 B; 4Z4I A; 2O8E A; 3CCE N; 4CZH A; 5J2M A; 2YNH A; 5M1Q A; 3VQE A; 4C8O A; 1WSE A; 1GLA G; 3JSM A; 1A5W A; 4KHY A; 4JYA K; 3AO1 A; 5BRH A; 5IWA K; 2FF6 A; 5AQF A; 3C6H A; 5SZT A; 2X6S A; 4PWD A; 4H5W A; 3S9H A; 4ZTJ A; 1XUP O; 4B3S K; 4LF5 K; 1RDU A; 4JD2 B; 2X6N A; 2KKZ A; 3D45 A; 5EXW A; 1NMN A; 3L3U A; 4DR7 K; 3G10 A; 4FO0 A; 3AA4 A; 3SPZ A; 3LM9 A; 3SAH A; 3G4S N; 3O9S A; 3QEW A; 2XO7 A; 1XNR K; 2R7Y A; 4KRF A; 4BQL A; 3K9K A; 3CME N; 3NMU A; 4WF9 L; 4HHT A; 5K14 A; 3BUZ B; 3V4I A; 4LF7 K; 5HRS A; 5HOO A; 3OW2 M; 2D5R A; 4RW4 A; 3LAN A; 4NYF A; 3WNH A; 1BQN A; 1GOA A; 1OH5 A; 2QK9 A; 2QM1 A; 4DG1 A; 3JAM O; 2Z1J A; 4FM2 A; 3ZX2 A; 3H6E A; 3QLH A; 4H8K A; 1HX1 A; 3HPG A; 1SKS A; 2DTU A; 5AQJ A; 2WUS A; 3HOS A; 4DQ8 A; 2UXC K; 5E84 A; 1JLE A; 4CGH A; 3TTD A; 2P9K B; 1D9F A; 3EKU A; 5AQP A; 4FWK A; 4CJV A; 3TSU A; 4LD0 A; 4DQI A; 1NWK A; 1DT9 A; 1BU6 O; 4A5B A; 1HYZ A; 4FWL A; 4CJL A; 1LOT B; 3KK1 A; 2O8D A; 4DQS A; 5C25 A; 3CJ9 A; 1K8K A; 3J8A A; 3KLH A; 2QA4 N; 3THV A; 4CJR A; 4GNI A; 3DLH A; 5GIO A; 1HPM A; 1VSF A; 3ZSZ A; 1C1A A; 1SKW A; 3KD1 E; 3VN5 A; 4CF8 A; 1OKJ A; 5C12 A; 1ASU A; 3U6F A; 1JCG A; 2P9U B; 3VER A; 4H4O A; 3RSE B; 3PX6 A; 3RVC A; 2G8I A; 5AQS A; 2HHQ A; 4BDZ A; 4DTN A; 3CFP A; 3GDQ A; 3QDK A; 1Q7Y O; 4AHU A; 1ZBL A; 5EU7 A; 1O13 A; 4BR0 A; 4YHH K; 3QET A; 3UKU A; 2FBV A; 4F3T A; 4I9Q A; 3KJV A; 3P4I A; 3RMA A; 4DUY K; 1HLU A; 3CCS N; 4K41 A; 3QIP A; 4E7J A; 3SUN A; 5CYM A; 4BRG A; 5BR8 K; 4KTZ A; 3NVK A; 4BR4 A; 2D1K A; 1BHL A; 4N56 A; 1RT5 A; 5ELZ A; 3KKR A; 4YOU A; 5AZJ A; 3SAG A; 3ENO A; 3OTO K; 3LAL A; 1HKG A; 5C10 A; 1Z6R A; 3PIP L; 1RFQ A; 1TKZ A; 1ATN A; 4Z0U A; 4F3O A; 3O6W A; 3C0B A; 2A6A A; 2IS3 A; 3WNE A; 3SZ2 A; 1VQN N; 4FLU A; 1CZB A; 4B1Z A; 5BPN A; 1C6V A; 3L2W A; 2HHU A; 3CXC M; 3S3O A; 1D9D A; 2YHA A; 3R6M A; 3P38 A; 3FZF A; 4J2A A; 1EWQ A; 4Z4C A; 4FJ7 A; 5KPT A; 4ELU A; 4OLA A; 4IO9 L; 1L3S A; 4FK2 A; 3KK2 A; 3TAE A; 1NJW A; 5ADX A; 2P9P B; 4QS8 A; 4DHY A; 1C0G A; 3WT0 A; 3VPZ A; 4DTX A; 2W6L A; 4PUO A; 2HBJ A; 1GLJ O; 5JLH A; 1OH7 A; 3HYF A; 1NNE A; 1XC3 A; 4F9O A; 2NRR A; 1SV5 A; 3ULD A; 4CK3 A; 4CJQ A; 1REV A; 4BRK A; 3BF1 A; 4RG8 A; 1Q8I A; 4M7X A; 3NGZ A; 1VQK N; 4DSJ A; 3LPT A; 1OH6 A; 5AQI A; 2P9L B; 3WEE B; 3ZCM A; 3M3Z A; 4JLH A; 4E1M A; 1W7A A; 4LH4 A; 3TU5 A; 3RRH A; 5BN8 A; 3VEX A; 3LWL A; 4HCB A; 4NLC A; 4KB1 A; 4TSX A; 4B3R K; 1NGH A; 4H5R A; 4HCC A; 3NFA A; 3MN6 A; 4ELV A; 4FLZ A; 5I9E B; 3ISN C; 1BI4 B; 4DTM A; 4CJK A; 1KD1 O; 3SCX A; 3AAQ A; 5F2R A; 4PKG A; 4C1N I; 4CE9 A; 2YHB A; 2HHS A; 4CFD A; 2IAJ A; 5BRD A; 4W5N A; 3VEY A; 4YOX A; 1Q9X A; 2FXU A; 2V52 B; 2I5J A; 3TSP A; 5CZ1 A; 1FKO A; 5I3U A; 5I42 A; 4CZJ A; 4FJK A; 4JI7 K; 2ATQ A; 4XEI A; 4HWI A; 4ZHR A; 2HNZ A; 3HVR A; 1RTJ A; 4JKE A; 4CJU A; 2UUA K; 1E3M A; 1IG8 A; 1MDU B; 3FLC O; 3WXK A; 4BRP A; 4DR6 K; 2QWO A; 2ZGY A; 4C8K A; 1HQU A; 3GOI A; 4RWT A; 2HVI A; 2DFE A; 1MWK A; 1RDC A; 4YOW A; 4JI3 K; 4EHU A; 2HHW A; 1KSP A; 3NAE A; 3PSI A; 1TGO A; 4FCY A; 2D0P A; 4GKK K; 3CCJ N; 3VEW A; 3P5J A; 3W3D A; 1NKB A; 1CLQ A; 3OYN A; 1JL1 A; 2FBY A; 3P31 A; 1S22 A; 3AA3 A; 4DFM A; 4FLX A; 2VCP A; 4RCH A; 3SMS A; 1YJ9 N; 3LP2 A; 3T3F A; 4CZM A; 2FSN A; 1NGE A; 1KAZ A; 3SUQ A; 2XY7 A; 3MMV A; 1HNZ K; 1WNS A; 3V9Z A; 3KWI A; 4FJL A; 2HOE A; 4F2S A; 3TAQ A; 4YDU C; 1S5J A; 4M3X A; 3H1V X; 2BDP A; 3LAK A; 1L3U A; 3V81 A; 3NVM A; 3K0S A; 4OGC A; 3SQ0 A; 3ZSO A; 4FW1 A; 3E9P A; 1SL1 A; 5BR9 A; 3M6G A; 2F9T A; 4DV1 K; 4AIL C; 2VG6 A; 2Q36 A; 3CET A; 3BEX A; 1U45 A; 4DV7 K; 1YTU A; 1R59 O; 3O3F A; 1P8Z A; 3EO3 A; 2VWK A; 4DSK A; 3ZSX A; 4FM0 A; 1UA1 A; 3ZLJ A; 1BCO A; 3VQ5 A; 4WFB L; 1L3V A; 4H0X B; 3M1F A; 4DV2 K; 4L8R B; 3VES A; 3PO5 A; 4M3T A; 2VWB A; 1YIT N; 5C24 A; 3CQY A; 4CHN A; 4C8M A; 2I7P A; 4ILG B; 4KH5 A; 3K5L A; 4M3Z A; 3QES A; 4R5P A; 1N36 K; 3C94 A; 3QNN A; 2PYL A; 3HJF A; 5HBM A; 3K5M A; 3THW B; 2PZS A; 1RBT A; 3B8A X; 1RT2 A; 1XMQ K; 4O0I A; 2EHG A; 3A2F A; 4M63 C; 3VF2 A; 4LSN A; 4DTP A; 1VK0 A; 4BQZ A; 2Y1J A; 4IEI A; 3DI6 A; 4FM1 A; 4E7L A; 5HRR A; 4AHT A; 2OTL N; 5B8H A; 4QCL A; 3I8B A; 4E1J A; 2KW4 A; 3RSE A; 2VYP A; 1LAV A; 1TUU A; 4B9N A; 1SKR A; 5AJ3 K; 3V9U A; 1BOT O; 4NLB A; 4CIF A; 2RE2 A; 1S9G A; 1IKY A; 2HST A; 5AQG A; 3S3M A; 2W41 A; 4BR9 A; 1VQ5 N; 1TYQ B; 2E5L K; 4W5O A; 3FZK A; 1EP4 A; 4EHT A; 3SNN A; 4CJT A; 3S41 A; 3MEE A; 1X9J A; 1BA1 A; 3IRX A; 3MXI A; 1WBD A; 4KHU A; 3THY A; 1RT3 A; 5DK5 A; 5M1F A; 2AJQ A; 1OVY A; 3VGK A; 4BRL A; 4DSF A; 3B6O A; 3LDL A; 4CIG A; 4FPA A; 4A5A A; 2O4I A; 3SJJ A; 4OPH A; 3DLB A; 4FJX A; 2WC9 A; 4DB3 A; 1W0H A; 1C0M A; 3D2F A; 3I55 N; 4CJS A; 1YVN A; 4LF8 K; 3VQA A; 1YF5 L; 2VQE K; 4AM6 A; 3T7Z A; 4QAG A; 1A5V A; 2HW3 A; 2V51 B; 1WOQ A; 3DJC A; 3OYB A; 3OYJ A; 4DQR A; 1NMD A; 3DXK B; 1NK0 A; 4OGE A; 4DUZ K; 4FJ8 A; 2ZWH A; 5KQ8 A; 4CGJ A; 5T7B A; 2FC0 A; 1WSJ A; 3MAQ A; 3ENH A; 4U67 L; 4QS7 A; 1GLD G; 2QWR A; 2P1J A; 3PV8 A; 3C7N B; 3CI5 A; 5FPD A; 2HHT A; 4ISG A; 1EKE A; 1K9M O; 3VF4 A; 4F4K A; 4IFV A; 4FLT A; 3ZSR A; 1I3A A; 4R79 A; 3GG4 A; 3J7Z O; 4LF4 K; 3CYM A; 4IG0 A; 1Q82 O; 4IFE A; 4IJN A; 3O3G A; 2P9L A; 3EEQ A; 3CCR N; 3ZET A; 1K8A O; 4JKC A; 3T19 A; 4CEQ A; 3KLG A; 3ASM A; 4KPY A; 1KAY A; 3ZEU B; 2OAN A; 2D0C A; 3OS2 A; 3HVT A; 5AQL A; 3E9L A; 1EQY A; 2NRZ A; 4FWN A; 3CJC A; 3MCA B; 2B6A A; 5HL7 L; 1S72 N; 4UY8 O; 1VRT A; 3ZT2 A; 1TK0 A; 4CK2 A; 1B9D A; 3D2E A; 3N4Q A; 1VSD A; 3BY5 A; 3AO2 A; 3ZT4 A; 1U2V B; 1Z26 A; 2OPR A; 4FSV A; 4CHP A; 1SUQ A; 4IBN A; 3ATV A; 4J2D A; 4K8X A; 3ULE A; 2H3G X; 4NO7 A; 2E4L A; 3IAY A; 2HND A; 1QSY A; 1WB9 A; 3SI6 A; 3CD6 N; 4DU3 A; 2P51 A; 4JI1 K; 3DLL L; 1S1T A; 4JKF A; 5LJV A; 1ATS A; 4KHQ A; 1H1V A; 3K2P A; 3LP3 A; 1NGD A; 4H03 B; 1L3T A; 1FKP A; 4KH4 A; 2IVN A; 3J7Y P; 4FLY A; 3TAN A; 3SBT A; 3E9O A; 4ICL A; 5A2Q O; 4JRP A; 4BE2 A; 3FZH A; 3BZK A; 3AVM A; 3TAB A; 4FJG A; 4ILH A; 1IBK K; 1N8R O; 3O5B A; 3FFI A; 4CJF A; 4PY5 A; 1RIL A; 3AV9 A; 2ZM6 K; 2E2P A; 4DQQ A; 2DFF A; 3CCU N; 2WON A; 5AZI A; 5IT9 O; 2KLA A; 2YNG A; 3LP1 A; 4DLG A; 4J2E A; 3MXJ A; 3AVJ A; 5HRN A; 2HHV A; 1XQS C; 2BUP A; 3AVG A; 1RT1 A; 4YFU A; 1HRH A; 2KZZ A; 4GMJ B; 1RBU A; 5GAD P; 3WQU A; 4MO4 A; 4MLE A; 4CZI A; 3ZX3 A; 5KPZ A; 4EIA A; 4CES A; 3VQP A; 3CMA N; 4JI5 K; 3EL2 A; 1NJY A; 1QSL A; 1RDA A; 2D4W A; 4WQ4 C; 2GUI A; 4B3T K; 3ENB A; 4ISF A; 3KZB A; 4HUG A; 1FK9 A; 2DPN A; 5GAG P; 4Z4E A; 2OYQ A; 3P83 D; 3V9S A; 1U47 A; 3K9J A; 5GAH P; 1RTH A; 1X1P A; 4DWI A; 4JAX A; 5AQH A; 2I7N A; 2UUC K; 3W0L A; 4DR1 K; 5GIP A; 2EWS A; 3DAW A; 4IZ9 A; 2D0O A; 3CJA A; 1NOY A; 4FOE A; 4Z4H A; 3RWU A; 2V7Z A; 4DTJ A; 3WXL A; 5LL6 Z; 3HK2 A; 1GLF O; 3EE8 A; 3RMB A; 1YVU A; 3A5L C; 4C23 A; 3FR0 A; 4JI6 K; 1NJZ A; 1NGI A; 3KTQ A; 4ISE A; 4JKG A; 1DEJ A; 4A2B A; 1N6Q A; 2E20 A; 3VQC A; 4DFP A; 4MDB A; 4N5S A; 3VEV A; 3SJH A; 2E6L A; 4BRM A; 3KHY A; 2Q2R A; 2V7Y A; 2X78 A; 4CJE A; 2GEL A; 1IG9 A; 4JI2 K; 5C2D A; 3HRG A; 3NE6 A; 4Z94 A; 4FLW A; 1NGG A; 3AO3 A; 4MFB A; 1JLB A; 1ZXO A; 3M8Q A; 3MX5 A; 3OHR A; 3DRS A; 4NB4 A; 4NXM K; 2CH5 A; 3CHW A; 4CEO A; 5KQD A; 2O8F A; 5BPL A; 2O8C B; 1NM1 A; 4CZL A; 4WYB A; 5JLF A; 4BR7 A; 4OX9 K; 1YXQ A; 1DTQ A; 4I2P A; 3BP8 A; 2B4J A; 4B1X B; 3O9U A; 4YDU A; 3OYG A; 3CC4 N; 3CQ8 A; 2OA8 A; 1JCF A; 4IXC A; 3MEG A; 3WNG A; 3RMD A; 1BCM A; 4B8A B; 2RF2 A; 1EO1 A; 3WQT A; 3LWM A; 3SQ4 A; 3B6P A; 3NCI A; 1NJI O; 3CJ7 A; 2P9S A; 4EAH D; 4CEC A; 2O8B A; 4B9L A; 2KFZ A; 4XH4 A; 3IS9 A; 3UKR A; 1VSE A; 1X3M A; 2HBL A; 2P9I B; 1WSI A; 4CEZ A; 3E66 A; 5AQZ A; 3MWP A; 4XH1 A; 2P5G A; 1RDB A; 5LY3 A; 4B3M K; 2HMP A; 1R0A A; 1LW2 A; 3HBT A; 1T6D A; 2GTD A; 2E8A A; 4C1N K; 2A1R A; 4BRF A; 3LDN A; 4IOX A; 3O4Q A; 2G8F A; 3AAP A; 3GE1 A; 3NGY A; 1U6Z A; 1WSH A; 4YOV A; 3QEV A; 3QER A; 1S9E A; 1QQO A; 5AQK A; 3TSQ A; 2JWL A; 4DV0 K; 1KFD A; 1XI1 A; 2YV0 X; 3ITH A; 2ITM A; 3DMJ A; 1S6Q A; 1JXE A; 1WSG A; 1D8Y A; 4FWQ A; 1WN7 A; 1QSS A; 1NGC A; 2F4V K; 5CR4 A; 4KHS A; 2ASO A; 3H3O B; 5AQN A; 2P9N B; 4EP4 A; 1HPZ A; 3PLA A; 3F73 A; 1MU2 A; 1IBL K; 4I6M B; 3JYT A; 3O9T A; 4DR4 K; 1VRU A; 1VSL A; 1P90 A; 1NU0 A; 3S3N A; 3CFR A; 3LDS A; 4BWM A; 2KFN A; 3AY9 A; 1QHA A; 4JNE A; 4KI4 A; 3OVN A; 2W42 A; 1QZ5 A; 1SQK A; 5LMN K; 3KVG A; 5F1X A; 3DOL A; 2Z1H A; 4K25 A; 4FVU A; 4CZE A; 1SL2 A; 1JLG A; 3LDO A; 1NKE A; 1X9S A; 3CC2 N; 3CPE A; 5EVZ A; 4X64 K; 4E7H A; 4CGI A; 1C0U A; 1BQM A; 4WE1 A; 4CED A; 3U4L A; 1JKH A; 2ZJR L; 3J81 O; 1BG3 A; 3CIP A; 4FXD A; 3ZSQ A; 3MED A; 1LW0 A; 3CQX A; 2A5X A; 3O08 A; 4H4M A; 1XNQ K; 1GOC A; 4FL9 A; 1J5O A; 4CEE A; 4DCH A; 5TKW A; 2WOM A; 2DFH A; 3A0I X; 3MN5 A; 1JLC A; 4BC4 A; 3HTV A; 2Y1I A; 3ID6 A; 1QTM A; 4CK1 A; 4K43 A; 1KVA A; 4CFB A; 1GLL O; 2AA4 A; 2GEM A; 1KVB A; 3DXM A; 3AVH A; 3H3N O; 1KQS M; 5CYQ A; 2B5J A; 1T7P A; 1RDD A; 3K5O A; 2WFB A; 3I0R A; 4JS4 A; 4MO5 A; 2GWK A; 2YCH A; 5JVH L; 2QKB A; 1J53 A; 1J9A A; 3OYD A; 3OS1 A; 3ZSY A; 1W2B M; 4KH6 A; 3L2V A; 4B9M A; 1JCE A; 2A40 A; 3THX A; 4IKF A; 5FPN A; 1KCF A; 3QB0 A; 4AHS A; 4QS9 A; 1RBR A; 4BG8 A; 3L6Q A; 4JK9 A; 1VSJ A; 2GWJ A; 1KAX A; 4BRQ A; 1V4T A; 1ZYQ A; 3CER A; 1RT7 A; 3HPO A; 4PL7 A; 4BRC A; 2GUP A; 2HBM A; 3BGR A; 1ZBF A; 3PX0 A; 2F8T A; 4ID5 A; 3L8B A; 1VAZ A; 1K73 O; 3OS0 A; 3LDQ A; 3TAG A; 1C0F A; 1T05 A; 4M41 A; 4JD2 A; 3IMX A; 4FJM A; 3BF3 A; 4IWV A; 3VQB A; 3ZT3 A; 4HTU A; 4KHN A; 3O8M A; 4H5N A; 4L3Q A; 2XY8 A; 3GBT A; 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