4Z0UA

Rnase hi/ssb-ct complex
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Interaction with Single-stranded DNA-binding Protein Stimulates Escherichia coli Ribonuclease HI Enzymatic Activity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase/peptide
source organism Escherichia coli o139:h28
molecule keywords Ribonuclease H
total genus 49
structure length 155
sequence length 155
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 2015-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4z0uA00
3F73A 2VWKA 2BDPA 4KB1A 1VSHA 3AVMA 3DRSA 4AILC 3DLEA 4DF8A 3NH2A 2ITGA 4LH5A 4FXDA 4DU3A 3T1AA 1S9EA 5HRRA 4M3RA 3A2FA 4CEFA 4OKKA 3H08A 2YNFA 1C6VA 3LWMA 2EX3A 1CZ9A 2G8FA 1VSIA 2PYLA 1U04A 4NCGA 4Z4EA 3LAMA 4EZ9A 3RRGA 1JL2A 1KVCA 3ITHA 2IAJA 2KZZA 3L2UA 4DTNA 1RT3A 2G8KA 2QKBA 2OPQA 2IOCA 1RILA 2D5RA 4CK2A 2Z1JA 1HYSA 4M41A 3M8SA 3SNNA 3VQ8A 4DTJA 4Z4HA 1XI1A 3KK2A 3KLGA 4CFBA 4TSXA 5C42A 2G8WA 2OPSA 1L3SA 1B9FA 3NGZA 3ZT4A 1CXQA 3VQCA 5J2NA 2P51A 4FLZA 3DLBA 3VQPA 3SQ2A 2IDOA 3M8QA 3QLHA 1RCHA 3PUFA 2YHAA 4C8NA 3SZ2A 1LWFA 3NGIA 1L3TA 4KHQA 1RBTA 3AVCA 3THVA 3PX0A 1RT2A 5CY4A 4YFUA 1D8YA 2NUBA 4NYFA 5CZ1A 4CJ3A 3HP9A 4H4OA 3VQ6A 4CJPA 4CGHA 2Q3SA 5HP1A 4ID5A 1BI4A 4J2AA 2R7YA 2HHWA 1B92A 4Z4CA 3HP6A 4HVJA 3O4QA 4DTRA 4AHUA 1WSFA 3SQ1A 1SKSA 3NHGA 1RTHA 4E89A 3AVHA 3AVLA 2F8TA 3VA0A 4RW7A 2FBYA 3C6UA 4GVMA 4CJRA 3O4NA 2P1JA 4YNQA 3OYBA 2HHVA 4C8KA 5DMRA 5FRNA 4M3WA 3AVBA 4CHZA 3TARA 1TKZA 3HVTA 3L3UA 1NK9A 2HHXA 3SYZA 3CG7A 5CYMA 2Y1IA 1T8EA 4FJMA 4Q0BA 4NYNA 2HHSA 5DK5A 3SJJA 1RDCA 1QHTA 1TVRA 4Y1DA 2ETJA 1YTUA 4CGFA 1FK9A 3OYGA 2AJQA 3HPHA 4E7KA 4RW6A 3PX6A 4CCHA 4NCBA 3MAQA 3U3GA 3LP1A 1KVAA 1WSGA 4CECA 3QEVA 1VK0A 1XC9A 1RT1A 1X9SA 3KK3A 4I2PA 4KHNA 1IKYA 2ZQBA 1NK8A 3ZSWA 4HUEA 1KCFA 1LWEA 1RBSA 2YKNA 4FVMA 4N47A 3BDPA 3EZ5A 4OKEA 4C8LA 1UA0A 1NK7A 4FZYA 3KLFA 1TK8A 1EKEA 4DLEA 4FLYA 3MXIA 4KB0A 2YHBA 4GMJB 1WAFA 4BWMA 3OYJA 1NOZA 5K14A 3LPUA 3DMJA 4CJKA 4CHPA 2KQ2A 4I9LA 1SV5A 3ULDA 5HRSA 4DS5A 2KFNA 1NJYA 3K57A 4Q5VA 2KW4A 2LSNA 3QNNA 3SUNA 4O0IA 1BIUA 2GV9A 3RMDA 2HB5A 1S1TA 1KLMA 2OPRA 3MEGA 1W9HA 4LH4A 3QEIA 2FBTA 1QSSA 3AVGA 4O0JA 4IKFA 1IKWA 4G1QA 3DLRA 1ASWA 1ASUA 3ZT1A 3AO4A 1JLAA 4PQUA 4PWDA 4KRFA 1WLJA 4DSJA 5C25A 1TK0A 4PUOA 3HL8A 3ZCMA 1JXEA 4CF2A 4FJKA 2P5GA 2B6AA 4JRPA 4FJLA 1SKRA 1B9DA 1YT3A 3DRPA 1NK5A 2HMIA 2QKKA 5FRMA 4AH9A 3SI6A 3SPYA 1EXQA 1LAVA 1JLBA 2IC3A 3AO2A 1L3VA 4ID1A 4OLAA 3PO5A 4DU4A 1NKCA 2RPIA 1RDBA 4CEEA 3SV4A 2BANA 3D0PA 3AA3A 1HQUA 3AVAA 1T05A 3NAEA 3LZJA 3WNGA 3QEXA 3NBPA 2E6MA 3KIOA 4ELTA 1KVBA 4JS5A 5I3UA 1JLFA 4CJ5A 4N76A 4IG0A 2VWJA 3HYFA 1RTIA 3UIQA 4KFBA 4AHTA 4C8OA 2X6SA 4DF4A 1HYZA 3RTVA 1SL2A 4CJEA 4DTMA 3ZT2A 3O3FA 4DTXA 1RBRA 1YVUA 1KLNA 4FLXA 1BQMA 2QXFA 1J54A 2YKMA 1VSMA 3AO5A 3OYFA 1RDAA 5E41A 4DQRA 2YV0X 4E1MA 3L8BA 4CEQA 2PY5A 4F4KA 3TANA 4H8KA 4UQGA 4L8RB 1KRPA 3QNOA 1S1XA 5KRTA 4MQ3A 3KLEA 1A5VA 4DLGA 3SUOA 4CJSA 1ZBLA 4OVLA 3TAEA 2D0BA 1IKXA 1FKPA 5KTQA 1D5AA 4O5BA 4CJVA 1ZBIA 2F96A 3CM6A 5HRNA 4FW2A 4N5SA 3V1OA 4E7JA 1LW0A 5JS1A 1QQCA 2KTQA 1RTJA 4FJNA 3QERA 3KKRA 1HYVA 3KJVA 4FK0A 1W0HA 4FJGA 4W5QA 3QEWA 4FJIA 4B3OA 4CEOA 1N6QA 3I8DA 3V9WA 4HTUA 1TKTA 4M3XA 1QSLA 4FK4A 1DLOA 3VQBA 4FW1A 2HHQA 4CGGA 4KTZA 4E7LA 1RNHA 3TI0A 4FK2A 4B8AB 3OYCA 4KPYA 1S1WA 5C24A 1U45A 3VQ9A 4JLHA 4ZHRA 3TAFA 3OJUA 1G15A 1U4BA 4FLWA 2GBZA 3K5NA 4KI4A 1LV5A 1BHLA 1CLQA 4RW8A 3V6DA 1WN7A 2HNDA 2Z1IA 5CYQA 1EX4A 1JXBA 1U48A 3V4IA 4CGJA 2YNHA 2XY7A 4F2RA 4W5OA 3AA5X 3ALYA 3RMCA 1J9AA 5JS2A 3OYIA 3K5LA 2A1SA 3RR7A 3LWLA 3U3YA 4AHSA 3S3OA 1Q9YA 2XRIA 3MEEA 3OYMA 3OY9A 2O4IA 4CJLA 3NE6A 1NK0A 4BDPA 2OPPA 3CQ8A 3IS9A 4B9LA 2DFHA 4FJHA 4KHSA 3OYEA 4J2DA 2X78A 4OJRA 3HXMA 4CGDA 1C0UA 3SUPA 2G8IA 4PA1A 5J2MA 4B8CA 3QIPA 3L2RA 1QE1A 3VN5A 1XHXA 3NH0A 3LALA 4WE1A 3PX4A 4HCBA 2QK9A 1LW2A 2X74A 3AVIA 3DM2A 1I3AA 4CK1A 2WONA 1A5XA 3AVJA 4CFDA 4E7HA 4E7IA 4N41A 2BE2A 3HK2A 1GOBA 4KHWA 4DQSA 1Q8IA 1RT4A 4LSLA 3DI6A 3AVNA 3NF8A 3ZSRA 4BE1A 4OPJA 4M42A 3LP2A 1IG9A 2X6NA 4OLBA 4CEDA 1GOCA 4M45A 5HLFA 4FLTA 5KI6A 3MXMA 4B9SA 4B9UA 3SUQA 2BGGA 4N56A 1TKDA 3TR8A 2HVIA 1C0MA 5J2PA 1X9WA 4FJXA 3S3MA 4O4GA 3C94A 4FJ9A 1HPZA 1WNSA 4FM0A 1WSHA 4LSNA 4DFJA 1VSKA 3TAQA 3F9KA 4FM2A 4Z4IA 1REVA 3K59A 1KFSA 4OKJA 4HHTA 3RMBA 4KO0A 2RKIA 1SL1A 3L2WA 1RTDA 2G8HA 1UAXA 4F2SA 2E6LA 4Z4GA 3TAMA 3L2VA 4BACA 1S1VA 1IO2A 2XY6A 1N5YA 4CIEA 4AHRA 3QETA 3OYNA 1VSFA 1Y97A 1C0TA 4B9VA 3OYHA 1WSIA 3C95A 4DMNA 1TL1A 2G8VA 1I39A 1T7PA 3U6FA 3HO1A 4AHVA 3OS2A 3JSMA 1U47A 3LANA 4DQPA 4DQQA 3K58A 4F3TA 1UA1A 2XO7A 3P83D 1HRHA 1S1UA 3LP3A 4QAGA 4CESA 1S5JA 4CIFA 2G8UA 5KGXA 5KGWA 4IFYA 4DQIA 4RG8A 4CEZA 2RN2A 3QESA 1NOYA 1F21A 4DFPA 3LAKA 4JS4A 4BDYA 4FJ5A 1LWCA 4OGEA 3IG1A 3ZT3A 3CM5A 4IFVA 4DG1A 4KHYA 3DOLA 4IBNA 3ZSZA 2XY5A 2FC0A 1VSJA 4LY7A 3NF6A 3MEDA 3SQ0A 5HBMA 2DY4A 3O3HA 3TWHA 3SPZA 3HPGA 1WAJA 4E0DA 5KRSA 3HPOA 2OYQA 4DTOA 3V1QA 2KFZA 4DSKA 1BL3A 4DSFA 1S6PA 4I2QA 5FDLA 3VA3A 3EY1A 3TABA 1KSPA 3BGRA 4CJQA 3SV3A 3K5MA 3NF7A 4CF0A 3PV8A 3LPTA 4CERA 4CE9A 5J1EA 4FM1A 4O55A 3ASMA 1NJXA 4M3YA 3AA4A 1C1CA 2B5JA 4CJFA 1RBVA 3RR8A 2DFEA 1BIZA 5HROA 4C8MA 4CHYA 1QS4A 3V9SA 3DLKA 4R5PA 2OZSA 5EU7A 3QINA 2Z1GA 3M8PA 1L3UA 2WOMA 2D0CA 3LDSA 4F3OA 2HHUA 3NGYA 2HVHA 3NFAA 4CEAA 3B6PA 3PO4A 4RW4A 1LAWA 4CJWA 4CJ4A 4CK3A 1BI4B 3V9ZA 4K8ZA 3E01A 4FYDA 3MXJA 3DYAA 3VQ4A 4M3UA 1BQNA 1JLCA 4BE0A 3KLHA 1HMVA 4XIUA 3TAGA 1TAUA 1SUQA 3ZSOA 1X9MA 3G10A 3QIOA 3AA2A 2JLEA 1C1AA 3V9UA 1YTAA 1BCOA 3CFPA 1ZBUA 4O44A 3V9XA 1KTQA 3L2QA 2FBXA 1JL1A 2HHTA 1HQEA 1UWBA 1TKXA 4FLUA 3KLIA 1NK6A 4QOZB 1BGXT 1J53A 1NJWA 4J2EA 1DTTA 1FKOA 3HVRA 4ZTJA 2E4LA 1ITGA 2PZSA 1NKBA 2DTUA 4RW9A 1XHZA 3I0SA 4Z0UA 3D45A 1HNVA 3OJSA 1NJZA 1VSLA 3OYAA 1T03A 1Z26A 1RT5A 1VSEA 3HM9A 3VQAA 1U49A 5SZTA 3IAYA 1RDDA 3DLHA 4KKOA 3OS0A 4M3ZA 2DFFA 5SWMA 4GW6A 4CF1A 3K5OA 1JKHA 4CF8A 4B9TA 1CZBA 1VSDA 2B4JA 1NK4A 4W5NA 1HJRA 1KFDA 4CHNA 3HT3A 4HCCA 1FXXA 4CEBA 2P5OA 4FJJA 1BCMA 2IS3A 1IH7A 1RT6A 1UOCA 5I42A 3S9HA 1RT7A 3S3NA 1MU2A 5FROA 1S6QA 3RRHA 2ZE2A 4IG3A 3JYTA 2W42A 1D9FA 4EZ6A 4E1NA 1ASVA 1CXUA 4BWJA 1ZBHA 1GOAA 3VQ5A 1JLQA 1C1BA 5D3GA 4B9MA 2VG7A 3AO3A 3OYKA 2OA8A 4I9QA 3B6OA 3QO9A 1Q9XA 3RMAA 4HUFA 1VRTA 4FJ7A 2IGIA 1NKEA 2O4GA 1O1WA 3AVKA 1D9DA 3K2PA 3CFOA 4DFMA 1SKWA 4ELUA 4J2BA 4FLVA 2YNGA 1TK5A 1TV6A 3VQEA 4DTSA 3FFIA 3OYLA 1TGOA 3DLGA 4B9NA 4LD0A 2RF2A 2HNYA 3NH1A 3L3VA 4CIGA 3CFRA 2Y1JA 4KREA 4Y1CA 4JRQA 4DSLA 1S9GA 3KD5E 4F8RA 1BISA 3LZIA 4HUGA 4BDZA 3G0ZA 3KKSA 3QEPA 3SCXA 1HNIA 1QTMA 4FJ8A 4M3TA 3CYMA 3AO1A 4EP4A 4I7FA 4KV8A 2EHGA 3KTQA 2ZD1A 2I5JA 4E3SA 2D0AA 1ZBFA 2GUIA 3P1GA 1A5WA 1WSEA 3P5JA 5T7BA 2XHBA 1DTQA 3I0RA 1EETA 4W5TA 3NDKA 4IDKA 4NCAA 4CHQA 3HJFA 3MECA 4CGIA 3OVNA 3PY8A 3WNEA 5J2QA 4OPKA 3ZSVA 2ATQA 4K8XA 1Z25A 4PY5A 1VRUA 2HNZA 2JGUA 2HW3A 4CJTA 4CJUA 4H4MA 2Z1HA 3AVFA 4B08A 3VQQA 3WNFA 3DOKA 3WNHA 4KHUA 2OZMA 3NCIA 4DSEA 4QCLA 1ZYQA 4DFKA 5CZ2A 4ZTFA 4ICLA 4FCYA 1J5OA 2KZMA 4Z4FA 3AV9A 1IKVA 4DS4A 3RWUA 4MFBA 1JLGA 4CFCA 3T19A 4BE2A 3NF9A 4DSIA 3O3GA 3ZSYA 2VG5A 3T3FA 3ISNC 3V1RA 1XWLA 3V81A 1K6YA 1WSJA 3VQ7A 4CFAA 4ELVA 3IRXA 2VG6A 1TL3A 3M8RA 4DU1A 4KTWA 4EP5A 3SQ4A 1SL0A 4E19A 3OS1A 4FZXC 2F8SA 3TAPA 1RBUA 2XY8A 3KD1E 3LP0A 3ZSQA 4OGCA 3EYZA 4KTQA 3ZT0A 4AHCA 4DTPA 1R0AA 4DWIA 4KI6A 4CHOA 3KK1A 4CF9A 3ZSXA 2PYJA 2A1RA 1L5UA 3OYDA 1EP4A 1TAQA 3DRRA 2YNIA 4FZZA 1X1PA 4W5RA 1JLEA 4KAZA 3C6TA 3VQDA 4DTUA 3HSTB 5HRPA 2FBVA 1QSYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YOUA 3DRSA 4AILC 2ITGA 1GLLO 3T1AA 4M3RA 4CEFA 3MWTA 3LWMA 2EX3A 1CZ9A 1VSIA 5LL6Z 3GG4A 1JL2A 3ITHA 1S72N 2IAJA 3R6MA 2BH1A 4DTNA 3KLGA 4BR4A 4FWNA 2G8WA 1B9FA 1E4FT 3ZT4A 1BOTO 3T69A 4BC3A 3QLHA 3SZ2A 3PUFA 2YHAA 5DM7L 1LWFA 3NGIA 1L3TA 4JKFA 3AVCA 3CJBA 3PX0A 4CJ7A 4OO1J 4NYFA 5CZ1A 4H0XB 3GDQA 3MN6A 3O8MA 3QFPA 4HVJA 3O4QA 4CD3A 1IV0A 4IWVA 4RW7A 4YNQA 4JKEA 3O4NA 5LMNK 3K9KA 1HKBA 2V52B 4LF5K 1TKZA 3D2EB 1SZ2A 4K42A 5BN9A 3SYZA 2Y1IA 2KLAA 3U9DA 2ETJA 3TTCA 1YTUA 1FK9A 2W40A 3HPHA 3PX6A 2AJQA 5BRHA 4CECA 3LP1A 3AGRA 3D7EO 4F9OA 5LJWA 1VK0A 2E2OA 1RT1A 4KHNA 3R3LA 4HUEA 1KCFA 1LWEA 4DV2K 1RBSA 4FVMA 2UUCK 4C8LA 2KKZA 3ENHA 3KLFA 3HOSA 4DLEA 3CC2N 1KAXA 3MXIA 4GMJB 1WAFA 5K14A 5AQQA 3ULDA 2KFNA 2O8BA 3K57A 2LSNA 2GV9A 5AQKA 3UE5A 3SJHA 1S1TA 1QSSA 5BN8A 2FBTA 3AVGA 4O0JA 1NU0A 2H3GX 3T1YK 1IKWA 3O9RA 3AO4A 4JYAK 1QHAA 3OBYA 1WB9A 4JKDA 4KRFA 3E9PA 1TK0A 5AQHA 4BQZA 1M90O 4FJKA 2VGMA 2HMIA 1B9DA 5FRMA 2QKKA 4BG9A 2VQFK 2IC3A 3UKUB 3AO2A 4BRMA 4OLAA 1T6DA 2A42A 1T05A 3WNGA 4ELTA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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