5BREA

Crystal structure of trypanosoma cruzi glucokinase in complex with inhibitor cbz-glcn
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
367
structure length
367
Chain Sequence
MNIKELSLHELCEELKTPAWNVPLTFVGDVGGTSARMGFVREGKNDSVHACVTRYSMKRKDITELIEFFNEIIELMPASVIKRVKAGVINVPGPVTGGAVGGPFNNLKGIARLSDYPKALFPPGRSAILNDLEAGGFGVLAVSDAHVFSEYFGVMWEGTQWRTCEQEPAGSVIGRGRCLVLAPGTGLGSSLIYYNPMNQQHIVVPLELGSQTIPMRKDIDYIQTLHAELKLLPNYENMVSGAGLEFHYRQVVRGSRPPCSAGEIAKLASEGDANACKAMKKYHEYLMRVGSEASMALLPLTIVLVGDNIVNNAFFYRNPQNLKEMHREALNHEMERFGFQSRVTYLRQKKLLNLNLMGCYRCGLDLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi (strain cl brener)
publication title Structure-based approach to the identification of a novel group of selective glucosamine analogue inhibitors of Trypanosoma cruzi glucokinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase 1, putative
total genus 119
structure length 367
sequence length 367
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2015-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5breA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 5breA02
1NBWA 3MN6A 3EKUA 5AZJB 4FL9A 4I6MA 3MDQA 5AQFA 3LL3A 1U6ZA 2P9SB 4BR0A 2P9IB 3A5OC 4PKIA 3WXKA 4O5FA 5TKYA 4EHTA 2W40A 4DB3A 5JICA 1T6DA 4HWIA 3FE1A 5AFUH 3C7NB 2HMPA 1BOTO 3D7EO 4H5WA 3HI0A 4DHYA 3HM8A 1WUAA 5AQPA 1NGCA 4CZJA 1C0FA 2YJFA 5AQMA 2Q0UA 2V52B 4FPAA 3BEXA 1NGIA 2GWJA 5LY3A 4M63C 1RGIA 4LC9B 2P9PB 2ZGZA 4A61A 4BGAA 3QMLA 4BC4A 4BGBA 3D2FA 2W41A 3VF4A 1ATRA 5LJVA 3FZKA 4H5VA 3ATVA 3CJAA 4FWPA 3FR0A 2V51B 4GY2B 5BR9A 1ZXOA 1V4TA 4BR4A 3GL1A 2Q36A 3O80A 5AQQA 2GUPA 3EL2A 4BRKA 4CZFA 4BR7A 4JHDA 1LCUA 1SAZA 1TYQB 3O4WA 3MN5A 1QHAA 3D2FB 1KAYA 3FFKB 3R9PA 5AZIA 4CZHA 2QWNA 4BG8A 1GLAG 4BRAA 4FWSA 5KQDA 3IUCA 5AQZA 2EWSA 3UKRA 1DEJA 1J6ZA 2E2OA 4MO5A 2FLOA 5BPLA 3U9DA 1GLEG 3R6MA 4B1UB 4XH4A 4BR2A 3I8BA 2A3ZA 4M7YA 4H5NA 3VGKA 3LDLA 3WXJA 2ZF5O 2V7YA 1YUWA 4A62A 5JLHA 4CBWA 5AZIB 1X9JA 3O8MA 1MA9B 4BRMA 3LDQA 4NO7A 3S41A 5FPNA 4JN4A 4Y0WA 2QWQA 2CGLA 2PAVA 3UKRB 3MCPA 4BR5A 2A6AA 3CJ7A 1BG3A 1NGFA 4IXCA 4BRFA 1S3XA 4BREA 4PL7A 3IDHA 1KXPA 4RCHA 2IVNA 1GLBG 3M6GA 1G99A 2OANA 4BRNA 1MDUB 1TUUA 4JD2A 3WQUA 1HKBA 5BRDA 5FPMA 3CHWA 2FSNA 3IFRA 5KPZA 2NLXA 3RSEB 1NLVA 2WUSA 4H0OA 2YHYA 4IWVA 3QDKA 3VERA 3LDPA 3LM9A 1V4SA 1MWKA 5FPEA 2CH6A 4FO0A 4M7XA 3U8XA 2QW9A 3VEXA 4J8FA 2BUPA 5I9EB 2AP1A 2E2NA 3OHRA 4Z94A 1X3NA 1JCGA 5AFUA 4AM6A 1H1VA 3CJ9A 4WQ4C 4FOEA 4K41A 4MLHA 4BRHA 3DXMA 1NWKA 2QWMA 3AARA 2Q97A 3HTVA 4GNIA 3HZ6A 5AQLA 2ZGYA 2H3GX 3D2EA 3WXLA 2E1YA 2A40A 4L3QA 4C23A 3A5NC 3DJCA 1NGEA 5AQHA 1GLJO 5EOYA 1SQKA 5AQYA 4PKGA 5AQRA 3FZLA 3SMSA 4F9OA 4K25A 4BC3A 1C0GA 4CZLA 1NGJA 2Q2RA 2YJEA 4I6MB 1Q18A 3DXMB 4JNEA 4QS7A 2GEMA 3BF1A 3G25A 3A0IX 4H0XB 2NRHA 3UKUA 1HJOA 4BRIA 2ASOA 2ZWHA 5AQSA 2GTDA 3D2EB 3KHYA 3L0QA 3QB0A 2P9LA 3ATUA 5BRFA 4BRPA 3A5LC 5EVZA 3MN9A 5BREA 1KAXA 4PKHA 4RWTA 2A42A 3GE1A 2KHOA 3HSCA 1HPMA 1QZ6A 3DWLA 3MMVA 3IMXA 3EZWA 2AA4A 4B1ZA 3JS6A 3J8AA 1ESVA 4YDUC 3UKUB 3VF2A 3LDOA 1JCFA 2VYPA 5BRHA 3CQYA 1BA1A 4BQLA 4BRLA 2P9UA 2DPNA 3O6WA 1QQMA 1DGKN 1BDGA 2V7ZA 4BC5A 1U2VA 5AQXA 3A5MC 3VEZA 2GWKA 4H0YB 5KPTA 4JHDB 3WQTA 3BUZB 2D1KA 4FWRA 1R59O 4FSVA 3ZETA 5KQ8A 4FWOA 1BA0A 4FWKA 1GLFO 4CZMA 4WQ4A 1DKGD 2P9UB 3ZEUA 2QWRA 2E2QA 1U2VB 4DQ8A 3L4IA 5AQTA 2Q31A 4A2AA 3FZFA 1XC3A 5AQKA 2HF3A 1KAZA 3CERA 1BO5O 2FF3B 4BVOA 2F9WA 1ZBSA 3MK6A 3VGLA 3ZETB 3H46O 2E2PA 3KVGA 3ZX3A 2FSKA 3ZEUB 5AQUA 2HF4A 3FZMA 3R8EA 4QS9A 4EFHA 1RFQA 1NM1A 1WOQA 2P9NA 2ITMA 4KBOA 4EHUA 5ELZA 4QS8A 3CJ1A 1YVNA 3CIPA 3EN9A 2FXUA 4JD2B 3GOIA 3O1WA 4WQ5C 3QICA 3CI5A 1QQNA 3CJBA 1XUPO 5AQWA 2ASMA 5AZJA 3TPQA 3LM2A 2UYTA 5CE3A 4WYBA 4FWQA 4YDUA 3VGMA 4B1XB 3L6QA 3H3NO 2Q1NA 1GLCG 3C7NA 2QXLA 3EKSA 4CZIA 4ISGA 4H5TA 4B1WB 1JCEA 3A8YA 4MO4A 1X3MA 4CBXA 3H45C 5EY4A 1T6CA 4CZKA 4E1JA 1ATSA 5AQNA 3GG4A 3VEWA 4CZEA 1QQOA 1OKJA 2IIRA 5F2RA 2E20A 3EO3A 3W3DA 2P9PA 1E4FT 1BU6O 2GELA 3O5BA 5EX5A 3VETA 5FPDA 4B1YB 3SMPA 1RDWX 1YXQA 2PBDA 4MLEA 1GLLO 3HBTA 5AR0A 4H5RA 4IJNA 1HKGA 4FPBA 4FWNA 3VENA 5AQOA 4CBUA 3UE5A 3F9MA 4FWLA 1GLDG 4H0TB 1Z05A 3VF6A 3WXIA 1Y64A 3AY9A 3BF3A 4XH1A 2A41A 3QFUA 1K8KA 1TYQA 2I7PA 2ASPA 2VCPA 2IVOA 1T44A 4NB4A 3U4LA 3VESA 4B1VA 4CD1A 4CZGA 3B8AX 2HOEA 5F0XA 2P9LB 2YHWA 3H1VX 5E84A 2CGJA 2J4RA 3O1BA 5E26A 5AQVA 3SLCA 4ISEA 3SK3A 4BRQA 1NGBA 2D0OA 2D0PA 2VWBA 3SJHA 4BC2A 5AQIA 1XQSC 4XEIA 4B9QA 4H0PA 3H6EA 3P4IA 5AQGA 1E4GT 2BTFA 2P9KA 1K8KB 2QWOA 4BRCA 4IJAA 4O8KA 4IZ9A 3AAPA 2QWPA 5B8HA 1S22A 1YAGA 2YI1A 5JMVA 4K42A 4BVPA 4WQ5A 3VOVA 4IO8A 5LJWA 4CJ7A 3FLCO 4JAXA 4BRDA 3CETA 1ATNA 1BUPA 3VEOA 1SZ2A 3CJCA 3DAWA 5F1XA 3VEVA 4H03B 4BR9A 4EIAA 3GBTA 3QBXA 3WEEA 1BWFO 3WT0A 1HLUA 1P8ZA 2P9KB 5ADXA 2YHXA 3FZHA 5BN9A 1MWMA 1ZC6A 1NGGA 2E1ZA 3AAQA 4BG9A 3FGUA 2YCHA 1EQYA 1CZAN 4PL8A 4XH5A 1Z6RA 1HX1A 4H0VB 3ZX0A 3ULEA 3H1QA 1HKCA 5ADXH 3MN7A 3QFPA 1NGDA 3DXKA 3UB5A 3RSEA 1IJJA 4FOIA 5EXWA 3ZX2A 3H3OB 3WEEB 4K43A 2QM1A 3W0LA 5KPRA 3M3ZA 3WUHA 2E8AA 4EAHD 3CQXA 3LDNA 5AQJA 1QZ5A 1D4XA 2E88A 3TU5A 3ENHA 4ISFA 4CI6A 2QWLA 2FSJA 2CH5A 2NZTA 3ID8A 5BPNA 1NMDA 3GDQA 3ULEB 3ENOA 2A5XA 3VEYA 1HUXA 3DXKB 4AM7A 4BROA 1TUYA 3QBWA 5JLFA 2P9SA 1NGAA 2P9IA 4HTLA 4CD3A 2P9NB 2I7NA 3VPZA 4BRGA 3O08A 4FWMA 2IVPA 3JXUA 3C0BA 1NGHA 3BP8A 4A2BA 4RTFD 3KZBA 2Q0RA 3U9ZA 4DCHA 1LOTB 2CGKA 3M1FA 2FF6A 5BPMA 4BQZA 1IG8A 2F9TA 3I33A 5BN8A 2D4WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MN6A 3EKUA 3RMCA 2HNYA 4I6MA 3O9RA 4LSNA 4FJ8A 1U6ZA 3CFPA 4F2SA 4PKIA 4GV3A 4DB3A 5AFUH 4KHWA 2HMPA 4FZYA 1BOTO 1NK7A 4GV6A 3D7EO 4DHYA 3CCQN 3DMJA 1NGCA 5HRPA 4M42A 3OYHA 3DLGA 3BEXA 3U3YA 2P9PB 1IH7A 3QMLA 5I3UA 1HJRA 4C8NA 2OCEA 3Q7BA 4H5VA 3HSTB 4DQIA 1RT7A 5BR9A 3OYBA 1JLCA 3CM5A 3GL1A 3O9UA 2Q36A 3VQPA 5AQQA 2GUPA 4CK1A 2P5GA 3NF9A 4CF2A 3MN5A 1P90A 4R79A 4JKCA 2YV0X 3LANA 1ZBHA 4BG8A 1QSYA 1NG9A 2PFUA 4FM0A 4BRAA 3AVLA 4ILGB 4KAZA 1DTQA 2HVIA 2EWSA 3UKRA 1J6ZA 2FLOA 4AHUA 3I8BA 2A3ZA 2NRTA 3DOLA 4DTRA 4DF4A 5EU7A 4FZXC 3L3VA 3NCIA 1YUWA 5TKWA 5JLHA 4KTWA 3OS1A 3CXCM 2IGIA 3O8MA 1MA9B 4NO7A 2HHTA 4KI6A 3PSIA 4KHUA 3JAMO 3LWMA 3SQ2A 2NUBA 2PAVA 3KK7A 3UKRB 3JYTA 3RTVA 2PZSA 3I8DA 1NGFA 3OBWA 1S3XA 3KWIA 3Q7CA 4AHRA 3T3FA 4RCHA 3CCMN 3DM2A 1GLBG 2VG6A 2D0CA 1TUUA 3F2KA 5FPMA 1TK8A 2VWJA 4CGGA 5JS1A 4KH5A 2G8HA 2YHYA 2G8KA 4YNQA 4OJRA 4M7XA 1VQPN 2QW9A 1UA1A 1S1UA 4HUFA 2BUPA 2AP1A 2E2NA 4FLYA 2NRZA 1JCGA 3K5LA 4AM6A 4F3TA 2FBVA 4CJEA 3VQ5A 4FOEA 1K9MO 3AARA 5GIOA 3P1GA 1J9AA 4LD0A 2A1SA 3HZ6A 2Y1IA 3OYJA 1NJWA 5AQLA 3SZ2A 1L3SA 2ZGYA 2H3GX 2BANA 1UAXA 2F96A 4WE1A 5JVHL 2EHGA 3HVTA 3ZSYA 4ELVA 5EOYA 5JS2A 2G8UA 3AVJA 1BISA 1C0GA 3SI6A 3TAFA 4JNEA 3AA2A 2GEMA 4MDBA 4CEQA 1WAJA 3A0IX 3V1OA 4H0XB 2NRHA 3UKUA 1S1VA 2YHBA 1HJOA 1D9DA 3TABA 3DRRA 3L0QA 3CF5L 2OTLN 2I5JA 5BRFA 3SQ4A 1C6VA 3A5LC 1KFSA 4JI3K 4O5BA 4PKHA 2A42A 4Z4FA 1VQKN 4M3WA 1BL3A 3DWLA 3MMVA 2YKNA 3IMXA 5J1EA 3K58A 3TANA 4B1ZA 3OS0A 4B9LA 3UKUB 3DOKA 3PIOL 3KKRA 1C0MA 5MLCQ 3CQYA 1BA1A 1OH6A 1E3MA 3L2RA 3L8BA 4BC5A 3TTCA 5KI6A 5AQXA 3VEZA 1WSHA 4RW6A 3HRGA 1RDAA 1IKYA 4DSJA 4JHDB 2KW4A 4DR7K 3BUZB 4DKWA 3QEIA 1R59O 4FJ5A 2YX6A 4CGIA 4YOUA 3VQ6A 1LWCA 3G6EN 3V9XA 3VQCA 4WQ4A 1S1XA 1NOZA 3AVKA 2E2QA 4I9QA 4FVMA 1VK0A 2Q31A 4CJTA 1XC9A 2G8IA 3KK2A 4A2AA 3FZFA 4A5BA 2KTQA 1D9FA 1NJZA 1KAZA 1BO5O 3ZSOA 3TWHA 3AO5A 1YHQN 3VGLA 5M1FA 4LY7A 1Q9XA 1QSSA 3H46O 4LF9K 2IS3A 2KZMA 4AHCA 3VTIA 2XHBA 4KPYA 2X6NA 3PO5A 3HOSA 4CJ4A 2FSKA 4ZHRA 2XY8A 3ZT2A 2OYQA 3AVNA 5KRSA 1ASUA 3FZMA 3R8EA 4EFHA 4IKFA 2XY7A 1BCOA 3E9PA 1YI2N 4E0DA 4FYDA 1T3VA 4C1NK 5GAEP 4OPHA 4RW8A 2FXUA 1IBMK 2FC0A 3O1WA 3HYFA 4WQ5C 5HLFA 2UUBK 3CJBA 4DTOA 3PX4A 5CE3A 3KD1E 4YDUA 3I0SA 3L6QA 4DQPA 1GLCG 3TAPA 3C7NA 3ITHA 2QXLA 1BHLA 4JEPA 4CZIA 1IV0A 1NMNA 1BI4A 3SQ1A 1JCEA 3SUQA 3H45C 4BWJA 1T6CA 4CZKA 2P5OA 4I2QA 4CW7B 2D0BA 3VN5A 3ZSXA 4CZEA 4DTNA 4JI5K 3W3DA 1O1WA 3L2VA 1E4FT 1BU6O 3NHGA 1XHZA 3LPUA 3SYZA 4B1YB 2NRVA 3SMPA 3A2FA 3L4QA 5HBMA 3SPYA 5LMUK 1BI4B 4I7FA 3KLHA 1M90O 5AR0A 4IOXA 4H5RA 5SZTA 4IJNA 4MFBA 1WSFA 3OYDA 2ZJRL 1RTIA 3HT3A 1HYVA 1VQ7N 1ZBUA 1YJ9N 1Y64A 4WFAL 4NLBA 3THWA 4CJWA 1FJGK 2ASPA 3U4LA 4DV6K 4CD1A 4J2DA 1WSJA 3QETA 4LF4K 1NNEA 4C8MA 1J5EK 1ASVA 2YHWA 4F3OA 2O8FA 2CGJA 5AQVA 3O1BA 5E26A 4DR6K 4G1QA 1NGBA 4MQ3A 1U47A 1YTUA 2D0PA 2O8DA 2IOCA 4BC2A 1C1CA 5AQIA 3RMDA 2A1RA 3RRGA 4LSLA 3THWB 3AO3A 2P9KA 2QWOA 3TARA 5J2NA 4BRCA 1QE1A 2WFBA 4B8AB 1HYSA 2WC9A 3KK3A 4K42A 4IDKA 3AV9A 2HHXA 4IO8A 4F2RA 2O8FB 3FLCO 4BRDA 3CETA 3VEOA 2O8DB 3ENBA 3PUFA 3QBXA 4EIAA 4R5PA 3WEEA 3F5TA 4CJPA 1K6YA 1S9GA 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2QK9A 2D0AA 3D2FB 1KAYA 3FFKB 5FLXO 4CZHA 3WNEA 2QWNA 4B8CA 5C2FA 1L3UA 4FWSA 1SL0A 3L3UA 1B9FA 1IBKK 4CCHA 4MO5A 5GADP 3QINA 4DG1A 3R6MA 3NF8A 3BGRA 4KO0A 4CGDA 3OJUA 3VGKA 3ZSVA 2F8SA 1C0UA 2V7YA 4KH6A 3ZT1A 1X9JA 3OY9A 1VSFA 3ISNC 1GOAA 3NBPA 1O13A 5FPNA 1W2BM 4CIEA 4Y0WA 5FRMA 2QWQA 1R0AA 2RF2A 5T7BA 5DMRA 3CJ7A 3K2PA 4BREA 1NK9A 4DU4A 3T1AA 1RCHA 1W0HA 1SL1A 2E5LK 4FJXA 1HR0K 4GKJK 4JK7A 2Z1GA 2OANA 4BRNA 4JD2A 2HHVA 1HKBA 3QEVA 1D8YA 3DRSA 1ILYA 4IEIA 4Z4IA 2HHHK 1RTHA 3MECA 4Z4CA 1NLVA 3B6OA 5FROA 1U48A 4DR4K 3C95A 3TSUA 2ZD1A 3VERA 4X65K 3LM9A 1RDUA 4E7HA 4FK4A 3OYIA 4K8ZA 1NKCA 2D5RA 4JI7K 3DI6A 5HRSA 1BCMA 5I9EB 2VWKA 4JI8K 1X3NA 2F8TA 5AFUA 1H1VA 4DV4K 3CJ9A 4J2AA 4HTUA 3LPTA 4WQ4C 4AQYK 1YJWN 3KKSA 3DXMA 3OBYA 4DS4A 4JKAA 4BY9C 1NOYA 4BWMA 1RBVA 2E1YA 2A40A 4J2EA 4DFMA 4DTPA 5AQHA 5AQYA 1SQKA 4IG0A 4F9OA 2D4WA 3FZLA 3SMSA 4CVNE 4BC3A 3CCEN 3LAMA 3V1QA 2Q2RA 4I6MB 3DXMB 4QS7A 3BF1A 1RT2A 4DTXA 1RTJA 1VSEA 5HOOA 3AGRA 1ZBIA 2ASOA 1W97L 3CYMA 3QNOA 1BIZA 3KHYA 3K5NA 3QB0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1YIT N;  2YI1 A;  1WNS A;  4JK8 A;  1QQC A;  4WQ5 A;  4DSF A;  3N4Q A;  5LJW A;  4FJL A;  4CJ7 A;  4JAX A;  1ATN A;  4DWI A;  1YTA A;  2Q3S A;  5F1X A;  4CHO A;  5GAG P;  4H03 B;  4F8R A;  3GBT A;  4HUE A;  1BWF O;  1HLU A;  1S1T A;  3FZH A;  3LWL A;  4OGC A;  3J7Z O;  2HHU A;  1NGG A;  3AO1 A;  2E1Z A;  4YY3 K;  3AAQ A;  4NXM K;  2YCH A;  4CGF A;  4OPK A;  1Z6R A;  4H0V B;  3ZX0 A;  3H1Q A;  5C15 A;  1VSL A;  5JVG L;  1S72 N;  2DTU A;  4GVM A;  5DM7 L;  3IS9 A;  1VSI A;  1QS4 A;  3ZSR A;  2E8A A;  1XHX A;  3LDN A;  1WN7 A;  3TU5 A;  4ISF A;  3VQ9 A;  2O8C A;  2QWL A;  3OYE A;  3AA3 A;  1BIU A;  1NKB A;  1NMD A;  5KGX A;  4ILJ A;  2A5X A;  1HUX A;  1VRU A;  3QBW A;  4FLT A;  3CME N;  2WTU A;  4HTL A;  1OH5 A;  2I7N A;  4CJR A;  2IVP A;  3P31 A;  4W5Q A;  3KZB A;  2Q0R A;  2O8C B;  4CGH A;  1LOT B;  4W5N A;  2FF6 A;  5BPM A;  4FJ9 A;  4CJ5 A;  3I33 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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