5BREA

Crystal structure of trypanosoma cruzi glucokinase in complex with inhibitor cbz-glcn
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
367
structure length
367
Chain Sequence
MNIKELSLHELCEELKTPAWNVPLTFVGDVGGTSARMGFVREGKNDSVHACVTRYSMKRKDITELIEFFNEIIELMPASVIKRVKAGVINVPGPVTGGAVGGPFNNLKGIARLSDYPKALFPPGRSAILNDLEAGGFGVLAVSDAHVFSEYFGVMWEGTQWRTCEQEPAGSVIGRGRCLVLAPGTGLGSSLIYYNPMNQQHIVVPLELGSQTIPMRKDIDYIQTLHAELKLLPNYENMVSGAGLEFHYRQVVRGSRPPCSAGEIAKLASEGDANACKAMKKYHEYLMRVGSEASMALLPLTIVLVGDNIVNNAFFYRNPQNLKEMHREALNHEMERFGFQSRVTYLRQKKLLNLNLMGCYRCGLDLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-based approach to the identification of a novel group of selective glucosamine analogue inhibitors of Trypanosoma cruzi glucokinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase 1, putative
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi (strain cl brener)
total genus 119
structure length 367
sequence length 367
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2015-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5breA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 5breA02
1GLDG 1Z6RA 2QWPA 1E4FT 1HUXA 2P9SB 1NWKA 3BP8A 4A2AA 4FO0A 4BRCA 2QWMA 3JS6A 1MA9B 4ISGA 5AQRA 4BRGA 5AZIB 3KZBA 5JICA 3M3ZA 2HF4A 1MDUB 2P9PB 3O8MA 1RGIA 4CZIA 3CI5A 4M63C 3VGMA 2Q2RA 5TKYA 3EL2A 4H0PA 4B1UB 1BOTO 2E2PA 1SAZA 2P9KB 5BR9A 2FLOA 4L3QA 1SQKA 3VGLA 3HZ6A 1P8ZA 4FPAA 1RDWX 1S3XA 4BRQA 3DAWA 5EVZA 4FWKA 5E26A 4BR0A 2CH6A 1BA0A 4FWQA 4PL8A 1X3NA 1CZAN 1ZXOA 1MWKA 4IO8A 4EAHD 1NGHA 2YI1A 3RSEA 4GY2B 3B8AX 5AQSA 1C0GA 3U9DA 4H0OA 1ESVA 3MN7A 5AQVA 2P9LA 5AQZA 3CJAA 5EX5A 3VEVA 2W40A 2H3GX 2P9UA 4BR5A 2IVPA 4H5WA 2YHYA 1Z05A 3F9MA 1NLVA 4I6MA 4IWVA 3D2EA 4F9OA 2A41A 3MDQA 3UB5A 1ZC6A 3VEZA 3WXKA 3ZX2A 5BN8A 3AAQA 4JD2A 4LC9B 3IMXA 5AQLA 4PKIA 3R9PA 4BC2A 3WXLA 1DKGD 5CE3A 4YDUC 3LDLA 5AQQA 3U9ZA 1HX1A 4CBWA 4FOEA 1NGFA 3GOIA 3CJCA 2NZTA 2FSNA 4CJ7A 5KQ8A 2QWRA 1QZ6A 3FZMA 3GG4A 3VEOA 2E2QA 3CJBA 4KBOA 1H1VA 2YJFA 1V4TA 2E2OA 2Q1NA 2P9NA 4BROA 2P9UB 2FXUA 4CZKA 4PKHA 5BRHA 5JLHA 3FZFA 1YXQA 3DJCA 3WUHA 3ID8A 3H6EA 4I6MB 2ZF5O 3IFRA 3SLCA 4BR9A 1NM1A 3VERA 3VF4A 1NGGA 3O6WA 3O5BA 4PKGA 4K41A 2PBDA 5AQFA 5LY3A 4H5RA 3WQUA 3AY9A 3VEXA 2GUPA 5JLFA 2FSJA 3SMSA 3HTVA 4BRFA 4H5VA 5LJVA 4CI6A 2V52B 3M1FA 4WQ5A 3VEYA 5F1XA 4QS7A 4JNEA 3TU5A 3W3DA 2ZWHA 1ATNA 2CGKA 3FGUA 2IVOA 4DCHA 3HSCA 4NO7A 3O80A 2QWQA 3S41A 2P9NB 4CD1A 4EHUA 1KAYA 4FOIA 2I7NA 3MN6A 3ZETA 4GNIA 2Q0UA 5F2RA 1RFQA 5AQJA 4BRAA 4WQ5C 3QFUA 1NGBA 5BPMA 3UKRB 2E1ZA 1QQMA 3CJ9A 4BVOA 3I33A 1KAZA 1NGJA 3FZHA 1BDGA 5ADXA 1S22A 4B1VA 1GLCG 2FF6A 2QXLA 3GE1A 4HTLA 4XH5A 4EHTA 5FPDA 3H3OB 3IDHA 4NB4A 3MN9A 2V51B 3VESA 1XC3A 2DPNA 2A3ZA 1QQOA 4BVPA 2IVNA 3AARA 2E1YA 5AQOA 1NGCA 3DXKA 5BPLA 1TUUA 1ATSA 3VENA 4FWSA 1WOQA 3ZETB 4CBUA 4ISEA 3CQXA 1GLLO 3A0IX 5AQMA 2GWJA 1MWMA 3CERA 1GLBG 1YAGA 3ZX3A 1YUWA 3EKUA 4YDUA 3EKSA 3H1VX 1SZ2A 3FR0A 4JHDA 3J8AA 5AQXA 2E2NA 3GL1A 3O4WA 1X3MA 4WQ4A 5AFUH 1BG3A 4JN4A 4H03B 4BC4A 2HF3A 2P9IA 3H3NO 2D1KA 2W41A 3JXUA 3L4IA 3QBWA 4A61A 2E8AA 1X9JA 3DWLA 3WXJA 4MLEA 1V4SA 3CQYA 5F0XA 4Y0WA 3VF6A 5BREA 3KHYA 3QFPA 3DXKB 1EQYA 4JAXA 3VGKA 1GLFO 3A5NC 3LM9A 1BO5O 2BUPA 3DXMA 1C0FA 4WQ4C 3ZEUA 4BRMA 3EZWA 3LDOA 4FWNA 5AZJB 4IJNA 4EIAA 1GLAG 3QDKA 4O5FA 4B9QA 2VCPA 5AQYA 3LL3A 3HI0A 4JHDB 3ATUA 3FFKB 2GEMA 2PAVA 3MCPA 3P4IA 5FPNA 2CGLA 4BG8A 4H0YB 4HWIA 1BU6O 1DEJA 1NBWA 5AQGA 4K25A 1TUYA 2P9IB 2WUSA 3UKUA 1Y64A 2ZGZA 3UKRA 3HM8A 4XEIA 3ENHA 3VETA 4M7XA 3I8BA 2NRHA 3SMPA 5KPTA 1T6CA 3W0LA 2E88A 4BR2A 4BRDA 3CHWA 3CETA 3DXMB 1Q18A 2GWKA 1IJJA 5ELZA 3ZEUB 4BRPA 1D4XA 1DGKN 1HKBA 3U8XA 3H45C 4K42A 3BF3A 3EN9A 2AP1A 3H46O 4EFHA 4CD3A 5I9EB 1LCUA 1NMDA 2CGJA 1NGDA 5AQKA 3MMVA 5AQTA 5KPZA 3L0QA 4BRNA 1JCFA 2OANA 3LDNA 4AM7A 3VOVA 1YVNA 4CZLA 4BGAA 4BG9A 4CZJA 4FWMA 3UKUB 1E4GT 1HJOA 2QW9A 3C7NA 3D7EO 4QS8A 5JMVA 1NGEA 3SK3A 3WXIA 4CBXA 1J6ZA 5AR0A 2V7YA 3ZX0A 3QMLA 4B1WB 3ULEA 4BRLA 2ASPA 4H0TB 2E20A 3BF1A 2QWLA 3QICA 4FWRA 1HKCA 5EXWA 4BC3A 3C0BA 4ISFA 3HBTA 4XH4A 1OKJA 3UE5A 4BREA 4FWOA 5EY4A 2D4WA 5AQIA 3FZKA 2V7ZA 4WYBA 1R59O 2A6AA 4H5TA 4M7YA 3VF2A 3G25A 3SJHA 3R6MA 5AQPA 3A5MC 3EO3A 3BEXA 3M6GA 4BRIA 4XH1A 5AZJA 3U4LA 4QS9A 2GTDA 4O8KA 4BC5A 1GLJO 3WT0A 5FPEA 2A5XA 5FPMA 3C7NB 1KXPA 1XUPO 4MO5A 1HLUA 2D0OA 3BUZB 3KVGA 4J8FA 4AM6A 4BR4A 4B1XB 4FL9A 3QB0A 3D2FA 2F9WA 1G99A 4FPBA 1T6DA 3ULEB 4H5NA 4BRKA 3R8EA 1NGAA 4H0VB 2CH5A 2GELA 4E1JA 1ZBSA 2I7PA 5BRFA 3A5OC 3A8YA 2F9TA 4FWLA 4BQZA 3FZLA 4IXCA 2QWNA 2YHXA 2ITMA 2Q31A 5BN9A 3A5LC 5AQWA 2YCHA 2Q97A 4K43A 1U2VA 1NGIA 3H1QA 2QWOA 3MK6A 4BR7A 5AQHA 3QBXA 1K8KA 2YJEA 5KPRA 1T44A 1TYQA 3O08A 5AFUA 1WUAA 2Q36A 3AAPA 3CIPA 1HPMA 4CZMA 3D2FB 3VPZA 4PL7A 4FWPA 4RCHA 4B1YB 1U6ZA 1IG8A 2ASMA 2EWSA 2IIRA 4Z94A 1GLEG 3O1BA 4BQLA 4IJAA 3RSEB 3VEWA 4B1ZA 4RWTA 3WEEA 2P9LB 1HKGA 1JCGA 1BA1A 4IZ9A 2ZGYA 4FSVA 1JCEA 3CJ7A 3ENOA 2A40A 3GDQA 4MO4A 3D2EB 1XQSC 3GBTA 4DHYA 4DQ8A 4RTFD 1BUPA 2KHOA 2P9SA 1ATRA 3L6QA 1U2VB 5LJWA 4JD2B 2NLXA 3O1WA 5BPNA 5AZIA 4H0XB 1K8KB 1QZ5A 2FSKA 2VWBA 5EOYA 1BWFO 1TYQB 2P9PA 1LOTB 5B8HA 5AQNA 2ASOA 4CZEA 5ADXH 3CJ1A 3WQTA 3OHRA 2HOEA 2FF3B 4CZFA 4A62A 4BRHA 2UYTA 3TPQA 2A42A 2D0PA 1QQNA 5AQUA 4CZHA 2P9KA 3LM2A 4CZGA 4C23A 3LDQA 4A2BA 1QHAA 2J4RA 1KAXA 3FE1A 2YHWA 4MLHA 5KQDA 3WEEB 2AA4A 4DB3A 3ATVA 3FLCO 2QM1A 2HMPA 2VYPA 5BRDA 3IUCA 3MN5A 4BGBA 2Q0RA 5E84A 3LDPA 2BTFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QWPA 1JJ2M 3O3FA 2F8TA 1CZ9A 3BP8A 4A2AA 4ISGA 5AQRA 4OX9K 4GW6A 3KK3A 4DU3A 1U45A 3M3ZA 1VRTA 3SV3A 1UOCA 5SWMA 3OJSA 2X6NA 3O8MA 2QK9A 4UQGA 2Q2RA 5TKYA 5C25A 4AILC 4H0PA 3VTHA 4KH5A 1IBMK 5M1QA 1SAZA 1Y97A 2FLOA 4M3RA 4FPAA 1RDWX 3PV8A 1KRPA 3R1XA 5E26A 3QEXA 2CH6A 1BA0A 4GMJB 1MWKA 4MQ3A 3IAYA 4FJ9A 4OPKA 4IO8A 2YI1A 1IKWA 4GV3A 1M90O 1ZBIA 3C94A 3B8AX 4DR6K 1IO2A 3U9DA 4H0OA 3VEVA 2W40A 2P9UA 1NKEA 1SL2A 1TKZA 5CYQA 3F9MA 5E41A 3HSTB 3VQ7A 3D2EA 3J80O 3TSUA 5HP1A 4F9OA 1W97L 3WXKA 3U6FA 4FJNA 1YT3A 4OPAA 1KLMA 4M41A 3IMXA 5AQLA 1JLBA 3BZKA 4BC2A 3NF9A 2YNIA 5CE3A 3RWUA 3OBYA 4KKOA 3AA5X 4CBWA 1N32K 4FOEA 3AA2A 3K9KA 2YNFA 5C12A 4JYAK 4KBOA 1NJWA 1I39A 4DV4K 1T05A 3KK7A 3D6RA 1Q86O 4BROA 3MXMA 4CZKA 4A59A 5IWAK 5LMNK 3FZFA 3SUNA 1YXQA 2HBJA 3DJCA 3WUHA 3LZIA 4I7FA 3ID8A 4I6MB 4CERA 1RTJA 2ETJA 4FJ8A 3SLCA 5HRNA 2OPPA 4WFBL 4ID1A 1EWRA 1JLFA 4PKGA 2KQ2A 3AVLA 5AQFA 3WQUA 5JLFA 3HTVA 4CHYA 1SKWA 2KLAA 1CZBA 1ASUA 3NGZA 1WSHA 4W5OA 4WQ5A 1JL1A 4C8MA 4QS7A 4R5PA 3OYEA 4ELTA 3DI6A 2NRTA 4CJEA 3P5JA 4RG8A 4CJSA 4FOIA 2WC9A 2WBNA 3TAFA 2IAJA 1TL1A 3ZT0A 2YKMA 5FROA 2G8KA 4CJ4A 1Q8IA 4B3TK 2LSNA 3E9LA 3ZSRA 4WQ5C 4BRAA 3C6TA 4NCGA 4B8AB 4JI3K 4CIEA 2E1ZA 5FLXO 1QQMA 4BVOA 4AHSA 4FLYA 4IBNA 3FZHA 4M45A 3AO3A 3TTDA 5ADXA 1VSJA 2EHGA 5T7BA 2HHUA 4OPJA 2DFHA 4JI5K 2FF6A 3GE1A 4HTLA 4XH5A 1HYVA 4OLAA 4CK1A 4NB4A 4GKJK 2V51B 3VESA 1TL3A 1Z26A 3DLGA 3J7ZO 1LAWA 1XC3A 2DPNA 4B8CA 4BVPA 4IG0A 4RW9A 3J81O 3NH2A 2IVNA 4H4MA 2E1YA 3NF6A 3DXKA 1TUUA 3ZT2A 1RDUA 2O4IA 3CCEN 3B6PA 1XHZA 5AJ3K 3SUPA 3A0IX 4M3XA 1RDBA 3KK2A 3VQPA 1MWMA 1CXQA 3HVRA 1YAGA 3T1HK 1BHLA 5MLCQ 2P1JA 3CXCM 3J8AA 1QE1A 1QVGM 2O8FB 3GL1A 1BL3A 3CCSN 3VQ5A 4JK8A 4H03B 3F2KA 5CZ2A 4BC4A 1CXUA 2HF3A 4JKFA 2D1KA 4KHSA 1J5OA 4LSLA 2F4VK 4DR1K 3V81A 3DWLA 4FLXA 1LWCA 4ID5A 3CQYA 3PX0A 4LD0A 5CY4A 5GADP 4Q5VA 3KHYA 3QFPA 1VQ6N 3AA3A 4EZ6A 2BUPA 2HHQA 4BDZA 3ZEUA 4BRMA 3MAQA 2PZSA 1G15A 4CHPA 4KV8A 5AZJB 1C1AA 4U67L 4IJNA 2BH1A 3MEEA 1UAXA 1HJRA 3MWPA 2IGIA 3SUOA 2DFEA 2GEMA 3MCPA 4BWJA 2P5OA 1MU2A 5IT9O 4H0YB 1BU6O 1DEJA 3Q7CA 1TV6A 2OPQA 2WUSA 3QNNA 3UKRA 1WBDA 1VQ8N 1VQKN 1NJXA 4M7XA 5C2DA 3M8PA 1NKCA 4GVMA 2NRHA 1VQMN 3W0LA 3CHWA 3CETA 3DXMB 1HNVA 5TKWA 1HKBA 5JS1A 4DV0K 1LCUA 1RILA 1YIJN 1NGDA 1RT3A 5AQTA 1X9SA 5KPZA 1VSLA 2OANA 1OH8A 4CHNA 4YOVA 2O8CB 1YVNA 5KRTA 3TI0A 1KC8O 4DV6K 4CZJA 4FWMA 3UKUB 5HOOA 2E6LA 4JKDA 1E4GT 1HJOA 3D7EO 4QS8A 3AO2A 4CBXA 1J6ZA 3MCAB 1JLAA 3OY9A 4CJVA 1X9MA 4H0TB 3BF1A 3QICA 3OVNA 3HBTA 3QNOA 4LF6K 3NGIA 5EY4A 1C1BA 3IKMA 5AQIA 1VSKA 1C0UA 1W2BM 2HB5A 2E4LA 4H5TA 4M7YA 5HRRA 3LANA 4HVJA 4CF8A 3EO3A 3OS1A 3M6GA 4JLHA 4MDAA 1T03A 4KHNA 1GLJO 1TK5A 2A5XA 1KXPA 2HNZA 2W6LA 4J8FA 4FJIA 3DOLA 4FL9A 4FYDA 4FPBA 3D2FA 1T6DA 4AHVA 4H5NA 1L3VA 3R8EA 2CH5A 4PUOA 2I7PA 3CCLN 3A5OC 5DK5A 3B6OA 1JKHA 3TR8A 3FZLA 4IXCA 1EO1A 4DSKA 2YX6A 2UUCK 1QSLA 3SQ0A 2B4JA 4DWIA 5AQWA 2YCHA 4DQPA 2HHWA 1ASWA 5AQHA 3QBXA 4IKFA 2YJEA 2UU9K 1S72N 5KPRA 1T44A 5AFUA 1W9HA 1EKEA 3T1YK 1HPMA 2WONA 3VPZA 4N5SA 4FW1A 4RCHA 5A2QO 4IEEA 3L2RA 4KAZA 3CCJN 1BQNA 1GLEG 4IJAA 4CHZA 4OLBA 4O5BA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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