5ELZA

Staphylococcus aureus type ii pantothenate kinase in complex with a pantothenate analog
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
272
structure length
272
Chain Sequence
KVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEKHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery of Potent Pantothenamide Inhibitors of Staphylococcus aureus Pantothenate Kinase through a Minimal SAR Study: Inhibition Is Due to Trapping of the Product.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Type II pantothenate kinase
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Staphylococcus aureus
total genus 98
structure length 272
sequence length 272
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2015-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5elzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5elzA01
2GELA 3CJ1A 3VF6A 1RGIA 1U2VB 3VEZA 4CZGA 4BR2A 3RSEB 1GLAG 3G25A 4M63C 4FPBA 2FSKA 2QWLA 4FWKA 5AQIA 3O1BA 2CH5A 3CJ9A 4O5FA 1GLFO 2V51B 3DAWA 4PKGA 2CGKA 2CGJA 2FXUA 4CBXA 4MLEA 1XQSC 1LOTB 1QHAA 2E20A 4ISEA 1U2VA 5B8HA 3I33A 1GLBG 3AY9A 3RSEA 1XUPO 5JMVA 4EHTA 5FPMA 5AQNA 3VEXA 2QXLA 3LL3A 2ZWHA 4NB4A 4PL7A 3H1VX 4M7XA 1BO5O 2CH6A 4WQ5C 3BP8A 1X3MA 2PAVA 1Y64A 3HM8A 5E84A 5AZJB 1EQYA 1HUXA 2ASPA 3VEWA 2W41A 4AM6A 4BR4A 3UE5A 2P9KA 2E2NA 2QM1A 4RCHA 3O5BA 4DCHA 4BRMA 1GLCG 4B1XB 2A3ZA 2IVPA 5AZJA 3HSCA 3ATVA 3P4IA 4LC9B 5LJWA 1ATSA 2NRHA 5EY4A 5BRFA 2P9LB 3D2FB 1DEJA 5FPEA 1CZAN 4BR0A 3CJAA 4Z94A 3S41A 3SJHA 3L4IA 2QWPA 2UYTA 1YUWA 3O08A 1QZ6A 1IJJA 1ATRA 3BEXA 2BUPA 3HZ6A 1NGIA 3WXLA 1NGGA 3BF3A 3MN7A 3W3DA 5AFUA 4NO7A 5AQTA 1TUYA 5KQDA 5AQUA 2P9LA 4EHUA 3D2FA 5AQFA 3UKRB 3TU5A 3H45C 5TKYA 2ZF5O 5BPMA 1HX1A 3VGKA 2QWNA 1BU6O 1E4GT 5BREA 2VCPA 4JN4A 1YAGA 1IG8A 3MN6A 1D4XA 4K43A 3UKRA 1HKGA 4DHYA 2H3GX 3F9MA 2A41A 4O8KA 3QBXA 3MN9A 2Q36A 5BN8A 2GUPA 2YHWA 4A62A 1S22A 3A5MC 3A8YA 3GBTA 1C0GA 5AQMA 4A2AA 3B8AX 1JCFA 5BR9A 3UKUB 5AQPA 5BN9A 4CD1A 3H46O 3D7EO 3VF2A 3A5LC 1QQNA 2A42A 4HWIA 1HKCA 3CI5A 2DPNA 4EFHA 1RDWX 1NGDA 4XH5A 1K8KB 4YDUA 5AQGA 3UKUA 4F9OA 1KAZA 3VETA 1V4TA 3BF1A 3R6MA 5EVZA 3KHYA 3ZETB 4IXCA 3FLCO 3ZX2A 4FSVA 4H0TB 1K8KA 3A0IX 4RTFD 4BC4A 1NM1A 4Y0WA 1HPMA 4FL9A 5AQWA 1ZC6A 2WUSA 2J4RA 3SMSA 4CZMA 4JHDB 2E1YA 2BTFA 3ZETA 2HF4A 4A2BA 4B9QA 3FZHA 4FPAA 4BC5A 5JICA 1GLJO 3MMVA 5AQOA 4BRQA 4KBOA 2YI1A 4C23A 3WXKA 2ASMA 3GE1A 5AQZA 5AZIB 4CZKA 2P9KB 4K41A 4XH1A 3VENA 4CBUA 2F9TA 1S3XA 2V7YA 4IJAA 4JHDA 4BROA 5JLFA 3M1FA 4A61A 4IJNA 2D0OA 4CZIA 2NZTA 5KPZA 3W0LA 2QWQA 1E4FT 3QBWA 1KAXA 5F0XA 2IVOA 5AZIA 5FPNA 2V7ZA 1V4SA 5ADXA 4FWPA 4FWOA 5E26A 5F2RA 3WQUA 2W40A 4K25A 1ESVA 1ATNA 2D1KA 5BRDA 4ISFA 3DXMB 3EN9A 2IVNA 1GLDG 3U4LA 3WXJA 4J8FA 2P9SA 5AQHA 3MN5A 1BA0A 1QQMA 3LDLA 4B1UB 4PKIA 1KXPA 2GTDA 2Q97A 4H0YB 2E88A 3DXKB 4BC2A 4CBWA 4HTLA 5AQRA 2P9NB 5AQQA 2ITMA 3EL2A 3GG4A 2YHYA 3FZKA 2ZGZA 5KPRA 3DXMA 3H6EA 4E1JA 1DKGD 2FLOA 3IDHA 4B1WB 2AP1A 3H3OB 5EXWA 4BR7A 5LJVA 4FOEA 3CQYA 3BUZB 3U9ZA 2I7NA 1NGCA 4BQLA 4WYBA 5AQVA 1WUAA 4IZ9A 1JCEA 3DXKA 4H0XB 2A40A 3FZLA 2P9NA 3QMLA 3VEOA 5BPLA 5CE3A 1BDGA 4H0VB 4H0OA 4FWLA 3A5NC 4FO0A 2D0PA 4JNEA 2VWBA 3DJCA 4BRAA 3GL1A 3M3ZA 2A6AA 3CJ7A 4RWTA 3O6WA 3L6QA 3EZWA 1RFQA 4PKHA 4YDUC 1MA9B 5KPTA 3VGLA 3FZMA 3AARA 4BRGA 3VOVA 2I7PA 5JLHA 2VYPA 1QZ5A 4BVPA 4BR5A 2Q0RA 1NGAA 2ZGYA 4BR9A 4BC3A 5AFUH 3WT0A 2KHOA 4BRHA 1ZBSA 1YXQA 4H5VA 5I9EB 3ULEB 1H1VA 4FWSA 3ZEUB 3VGMA 3L0QA 1G99A 2IIRA 1MWKA 4M7YA 5LY3A 2GWKA 2Q1NA 1Z6RA 3FFKB 3R9PA 3WXIA 2Q31A 1TYQA 3ULEA 5AQJA 3SK3A 2E2OA 1T6CA 4PL8A 1T6DA 4FWRA 3ZEUA 3MDQA 4BRIA 4BG9A 4MO4A 5EOYA 2E2PA 1BOTO 3CJBA 4H5TA 4BRDA 3QDKA 3M6GA 4GY2B 5AQLA 4QS8A 3J8AA 3LM2A 1NGJA 2YJFA 4CD3A 3FR0A 4B1YB 3IFRA 3LDPA 3VESA 3GOIA 2FSNA 1OKJA 3KZBA 3ENHA 3U8XA 3O1WA 5F1XA 3O4WA 1JCGA 2FF6A 3EO3A 4ISGA 5AR0A 4JD2B 4BRKA 4BGAA 2A5XA 2FF3B 3KVGA 3FZFA 4CZFA 1NGBA 2P9SB 4FWQA 4H5RA 1DGKN 5AQKA 4BRLA 4CZHA 4WQ4A 1KAYA 1C0FA 2AA4A 4FWNA 3ZX3A 3O80A 4JD2A 4QS7A 5BRHA 1HLUA 1X3NA 4H0PA 3VF4A 1GLLO 2P9PB 3ATUA 1BUPA 2YHXA 3I8BA 4BRNA 1U6ZA 3AAPA 2Q2RA 2HMPA 1XC3A 4JAXA 1NMDA 1WOQA 3CETA 4CZJA 4XEIA 3WEEB 3VEYA 2P9UB 4CJ7A 2P9IB 1Z05A 3HI0A 1X9JA 2CGLA 3C0BA 1MDUB 1P8ZA 2P9PA 1ZXOA 1NLVA 2F9WA 3LM9A 1NGHA 3OHRA 2D4WA 2QWOA 1LCUA 5KQ8A 2ASOA 3FGUA 4WQ5A 4GNIA 4H03B 3D2EB 3TPQA 5FPDA 3WEEA 2P9UA 2QWRA 5ADXH 3EKUA 2P9IA 3VPZA 1BWFO 3H1QA 1T44A 1NGFA 4H5WA 4B1VA 3VERA 2EWSA 3LDNA 2E8AA 4DB3A 4BRFA 4DQ8A 4IO8A 4EAHD 2HOEA 1HJOA 1TUUA 4BVOA 3CERA 4L3QA 3D2EA 1BG3A 4XH4A 1J6ZA 2E1ZA 2QW9A 3HTVA 4CZLA 4QS9A 3QICA 3VEVA 3MK6A 1YVNA 1NWKA 2V52B 1R59O 5EX5A 3DWLA 3QFUA 4EIAA 3IMXA 3LDQA 4MO5A 1NGEA 5AQXA 4CZEA 3MCPA 1TYQB 1SZ2A 4MLHA 1HKBA 5AQYA 3CQXA 2GWJA 4K42A 2GEMA 3R8EA 2YJEA 3GDQA 4FOIA 1QQOA 3C7NB 3JXUA 5AQSA 4AM7A 4B1ZA 3FE1A 4BREA 3CHWA 2E2QA 2OANA 1SQKA 5BPNA 2YCHA 3H3NO 4BG8A 1MWMA 3A5OC 3AAQA 3U9DA 4FWMA 4IWVA 3ENOA 3QB0A 2PBDA 4I6MB 2HF3A 5ELZA 2Q0UA 1GLEG 1Q18A 2QWMA 3EKSA 1BA1A 3WUHA 4BGBA 4CI6A 3C7NA 4BRCA 3UB5A 3LDOA 3CJCA 1NBWA 3WQTA 3JS6A 3SLCA 3ZX0A 4H5NA 4BRPA 3CIPA 3HBTA 3QFPA 1SAZA 2NLXA 4WQ4C 3O8MA 4BQZA 3IUCA 4I6MA 3SMPA 2FSJA 3ID8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3B6OA 1HYSA 3SQ1A 3SYZA 1TV6A 3RSEB 4KHWA 4M63C 2DY4A 2FSKA 2KW4A 4KHNA 4FWKA 3AVLA 1HMVA 3WNGA 2HMIA 3BZCA 1ZBHA 4I7FA 1GLFO 3OYKA 4LY7A 2FXUA 3ZT0A 1ASWA 1I3AA 1XQSC 3NH2A 2X78A 3AVNA 4DR4K 3I33A 1HRHA 3G6EN 5JMVA 5AQNA 4JS4A 4PL7A 3MWTA 3VMFB 3CCMN 3C6AA 2HHTA 2ZJQL 4FXDA 1X3MA 1WSEA 3THYB 4DFMA 3PO5A 4M3YA 1OH8A 4BDZA 2F8SA 4Z4IA 3VEWA 4TSXA 4YFUA 4KH4A 3T1HK 2QM1A 1TAUA 3E9OA 5AZJA 4B3MK 4HUFA 4CGIA 3OS0A 4KAZA 2BGGA 4FCYA 4CE9A 2P9LB 2UUBK 3PO4A 3NF7A 3O08A 2O8EA 1IJJA 3VQPA 1NGGA 1YITN 5DM6L 1N5YA 2E5LK 1TUYA 1IKVA 4DFPA 1HNZK 3D2FA 5AQFA 3UKRB 2ATQA 3V1QA 4F8RA 4YHHK 5BPMA 4MQ3A 5LL6Z 1BU6O 4DTNA 2Z1JA 5BREA 1YAGA 2OYQA 1MU2A 5HLFA 3MN6A 1D4XA 4K43A 3S3OA 1HYVA 3F9MA 2A41A 4O8KA 1RILA 5C2FA 3HPHA 4Z4HA 2Q36A 3AA3A 3BGRA 4FK2A 4JRPA 3TR8A 1UA0A 3A5MC 4KH5A 4A2AA 3B8AX 1Z25A 5AQPA 4HUGA 3JAMO 3H46O 3VF2A 1RTDA 1QQNA 4BDPA 2A42A 4CGJA 5JS2A 4ILJA 2UXDK 3AVIA 2QK9A 4DSLA 1IBLK 2DFHA 1KTQA 4O44A 3AO5A 4YDUA 3DMJA 3E01A 4JI4K 3VETA 3NGZA 3BF1A 3R6MA 5EVZA 3LAKA 5GADP 4DTPA 1K8KA 3I8DA 3DLHA 3OJSA 4FL9A 5AQWA 4C8NA 1ZC6A 4KHPK 2NUBA 4LF5K 3SMSA 5LMUK 5HL7L 3ZETA 4FJLA 5KRSA 4A57A 1I94K 1GLJO 3QNOA 5AQOA 4KBOA 4NYNA 5FDLA 4C23A 4RW8A 2UU9K 1EWQA 4CZKA 3D6RA 2Z1HA 2P9KB 4CBUA 3L8BA 4AHTA 1Q86O 4CK3A 2NZTA 4LD0A 4CGFA 2HNZA 1YJ9N 2QWQA 3QERA 5FPNA 4FWOA 2NRWA 5E26A 4CJ5A 1WBBA 2PZSA 2W40A 4PA1A 3ZT2A 5BRDA 2D1KA 2KKZA 1S72N 1GLDG 1SKSA 3C94A 4GV6A 3K5OA 1BA0A 3LDLA 2OZSA 4PKIA 4O8UA 1KXPA 2Q97A 3L2UA 2E88A 5C12A 2HHXA 4CFBA 3DXKB 4CBWA 3CFPA 2P9NB 4BE1A 3NH1A 2ZGZA 1RDAA 3L3UA 2FLOA 3EE9A 3IDHA 2UXCK 5EXWA 4KB1A 1IG9A 3U9ZA 2OPQA 1NGCA 1WSGA 2HNDA 5AQVA 3O9TA 4B9SA 3FZLA 1SL2A 4IEIA 3HOTA 4E7LA 3SQ2A 1SL1A 1KCFA 1Y97A 4RW6A 3IG1A 1EKEA 2VWBA 3O6WA 4YOWA 4ELTA 2HHWA 3L6QA 1D9DA 3E9PA 1D9FA 4OLAA 1DTTA 4J2EA 1QZ5A 3CD6N 2HHUA 1NGAA 4WCEL 1XNQK 5AFUH 4OKKA 3MAQA 1U47A 1YXQA 4M3TA 3RMAA 2VGMA 4ZTFA 3ULEB 1EXQA 5C15A 4PUOA 1TKXA 4IO9L 3VGMA 1G99A 4QOZB 4M7YA 5GIPA 1KLMA 2IAJA 1Z6RA 4DTOA 2P51A 2G8VA 4FM0A 3R9PA 3QNNA 2Q31A 2KLAA 5AQJA 3SK3A 2E2OA 1RCHA 4CJFA 5LMNK 1CXQA 4BRIA 1HYZA 4JKBA 3O9QA 4B3TK 4CECA 3P83D 1ITGA 4GY2B 2QKKA 3FR0A 2Y1JA 3LDPA 1C1BA 1RTJA 4ELUA 2FSNA 2YNHA 3L2WA 3QEVA 3SPZA 1Q81O 4DLEA 4B8AB 4MFBA 3KZBA 2FBTA 3ULDA 3O1WA 5F1XA 3L3VA 2FBYA 4FJ9A 2FF6A 4M42A 4CFCA 4CVNE 3P39A 1T05A 1Q82O 1IBMK 4BGAA 4O0IA 4UY8O 2FF3B 1OVYA 3FZFA 1NGBA 4FWQA 2JGUA 3F73A 1OVQA 1RT7A 2QI2A 1KAYA 4N5SA 3HOSA 3ZT3A 3AO2A 5M1FA 1YIJN 3AVBA 3O3GA 1HLUA 4H0PA 4CJQA 5J2NA 3DLBA 2O8FB 3VQ9A 5CZ2A 4K8XA 3I8BA 5J2MA 4BRNA 5KRTA 4OKJA 3WNHA 4I2QA 1YVUA 2OPRA 1XMQK 3CC4N 1XC9A 1XC3A 4JAXA 4W5QA 4YORA 5HROA 4KHQA 3CETA 3ENBA 2JWLA 4MDAA 1Z05A 3HI0A 3SZ2A 2O8BA 1X9JA 2CGLA 3C0BA 1P8ZA 2P9PA 1ZXOA 5HRSA 4HTUA 3SV3A 2F9WA 4DTSA 3LM9A 1VQ4N 1NGHA 2OA8A 3DOLA 1BQNA 5KQ8A 3KLEA 1NK8A 4WQ5A 1NJZA 4C8LA 1U48A 4E0DA 3WEEA 3ZYYX 5ADXH 1YTUA 2KFZA 1JL1A 3CYMA 4C1NK 1T44A 4O0JA 2XY7A 1WLJA 3KLGA 3LDNA 2OTLN 2VG5A 4CW7B 4BRFA 4YOTA 3V9ZA 2HOEA 2PFUA 4BVOA 4JV5K 4JYAK 4M3UA 1JKHA 1RDBA 1JLGA 2ZJPL 4CK2A 4ILGB 3VEVA 1NK6A 1YVNA 2XY5A 1WSJA 3BZKA 4JK7A 1RDCA 3LWMA 3C6UA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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