5LJWA

Mamk non-polymerising a278d mutant bound to amppnp
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
331
structure length
331
Chain Sequence
GEGQAKNRLFLGVDLGTSHTAVMSSRGKKFLLKSVVGYPKDVIGLKLLGRPYVVGDEAFEMRSYLDIRYPLQDGVLSEISDRDIEVARHLLTHVVKSAEPGPNDEICAVIGVPARASAANKALLLKMAQEVVHTALVVSEPFMVGYGLDKLINTIIVDIGAGTTDICALKGTVPGPEDQVTLTKAGNYVDERLQNAILERHPELQMNVNVACAVKEQFSFVGTPTEVASFEFRAAGKPVRADVTEPVKIACEALMPDIIESIETLLRSFQPEYQDTVLQNIVFAGGGSRIRGLAAYVKEKLRPFGDANVTCVKDPTFDGCRGALRLAEELP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-ray and cryo-EM structures of monomeric and filamentous actin-like protein MamK reveal changes associated with polymerization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like ATPase
molecule tags Hydrolase
source organism Magnetospirillum magneticum amb-1
total genus 106
structure length 331
sequence length 331
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ljwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ljwA02
5AQSA 2QM1A 4CZIA 4YDUC 4JNEA 2E8AA 4HTLA 3H1VX 4WQ4A 2A5XA 3U9DA 3SK3A 1RDWX 3CJ1A 4H5VA 4Z94A 5BPMA 4NB4A 4FWLA 3FGUA 3IDHA 1YAGA 1NLVA 2GELA 3M1FA 4H0OA 2FF3B 3H1QA 3VEZA 3KHYA 4CBWA 5AQOA 4RWTA 1MWKA 2A6AA 2V51B 4PL7A 5AQZA 3RSEB 4JN4A 3W0LA 3D2EB 3WXLA 4CD3A 1YVNA 1U2VB 5F0XA 5BN9A 3G25A 3R8EA 5EX5A 1NGBA 3ENHA 2P9UA 4FWKA 4WQ4C 4BR9A 4FWOA 5FPDA 4F9OA 4GNIA 1NGGA 5F1XA 4FWMA 1NGHA 1QZ5A 3WXJA 1P8ZA 1OKJA 3VETA 2IVNA 2W41A 3ZETA 4A61A 2CH5A 1KXPA 4K41A 2ASPA 3FZKA 3QMLA 3P4IA 3A5LC 4M7XA 4B1YB 4BQLA 2HOEA 1H1VA 2Q97A 3IFRA 2FSJA 5AQTA 2I7PA 2FLOA 2ZF5O 5AFUA 3HSCA 1IG8A 1X3NA 2P9NB 2PBDA 3GBTA 3UKRB 5KPZA 3WT0A 2D0PA 3CJCA 1MA9B 3SJHA 4BR7A 2D1KA 4BVPA 1GLEG 3BUZB 5FPEA 4ISGA 2Q0UA 4EFHA 1BG3A 4JD2A 4BQZA 1D4XA 2YHYA 2P9IB 1GLAG 1BA1A 3LDLA 2NZTA 2QXLA 4MLHA 3LDQA 4MLEA 4EAHD 1HKGA 1ATRA 3RSEA 3D2FA 2D4WA 3A8YA 3VEVA 4B1XB 1U2VA 3O1WA 3VGKA 3UKUB 2A40A 5AQMA 1T6CA 4BC4A 3FZFA 4WQ5A 5LY3A 1EQYA 3KZBA 3O6WA 1HUXA 2HMPA 3ENOA 1NGCA 3DXMA 3LM2A 4H5TA 4BROA 3TPQA 4CZJA 5B8HA 1TUUA 4BGAA 4QS7A 1XQSC 2ZGYA 4LC9B 4L3QA 3FZHA 3LL3A 3O80A 5AR0A 4WQ5C 3S41A 5E84A 4BGBA 4DHYA 1WUAA 4BRCA 1KAXA 4BR4A 1MDUB 1ZXOA 5BPNA 3HZ6A 5E26A 3ZEUA 1S22A 3WXKA 4CJ7A 4PKHA 5BR9A 3HM8A 5AQNA 3L0QA 5ADXH 4NO7A 3R6MA 1X3MA 3BF1A 1G99A 5AZIB 4CZKA 3FZMA 1GLDG 1HKBA 2A3ZA 5FPNA 4GY2B 2H3GX 4EIAA 4H0YB 3ZX3A 1IJJA 2QWNA 4CZGA 4BRHA 4IJAA 4BC5A 3GOIA 3MDQA 3FE1A 5LJWA 3AY9A 2P9KB 1ZBSA 3QFUA 4CBXA 1NGFA 4I6MB 1R59O 4M7YA 1BOTO 3IUCA 2YJEA 4BG8A 1C0GA 3CETA 3D7EO 1NBWA 2GUPA 2CGLA 2QWMA 1CZAN 1BO5O 3EL2A 4H5WA 3SMPA 1X9JA 4BRGA 3I8BA 5JICA 1XUPO 4H5NA 3QBWA 1QQNA 3ATUA 4M63C 1MWMA 2QWLA 3DAWA 4DB3A 3DJCA 3CQXA 4O8KA 3WEEB 2V7ZA 3WUHA 4BRFA 2FXUA 1NGIA 2P9PB 3FFKB 4EHTA 4CZFA 5AZJA 4C23A 2YHWA 2P9LB 3H3NO 4XH4A 3ZX2A 3GL1A 4AM7A 1E4GT 1TYQB 4AM6A 4BVOA 4CZMA 1DEJA 3F9MA 3BEXA 1Y64A 2P9SB 3B8AX 3QFPA 4FOEA 3O08A 4K43A 1KAYA 4CI6A 2AA4A 3LDPA 2HF4A 4BC3A 3A5OC 3VESA 3MMVA 3VEXA 5KPRA 2A42A 4JHDA 1T6DA 4I6MA 3JXUA 5AQWA 1JCGA 3HI0A 1K8KB 4BR2A 4CD1A 3UE5A 3SMSA 5AQYA 5F2RA 2QWRA 2ZGZA 2FSNA 2E20A 3H45C 3ATVA 5AQFA 5I9EB 1HKCA 4QS8A 1TUYA 2V52B 3CJ9A 3SLCA 4BRPA 1QQMA 1HPMA 4DCHA 4Y0WA 2I7NA 1ATSA 3D2EA 4BR0A 2FF6A 3EZWA 1NGEA 3HTVA 4JAXA 3ZX0A 3WXIA 2PAVA 5CE3A 3WEEA 4CZHA 4BR5A 1SQKA 5BRFA 1HX1A 2P9PA 3LDOA 1NGJA 2UYTA 2YCHA 3CJ7A 5ADXA 2EWSA 3EKUA 5AFUH 1ZC6A 2A41A 4MO5A 3JS6A 4B9QA 3MN5A 3CJBA 2AP1A 2ASMA 2E2NA 3VOVA 3O5BA 1SAZA 1V4TA 5AQRA 5AQPA 4XH1A 2CGKA 1LOTB 3AAQA 3VGLA 2D0OA 1S3XA 2W40A 2P9NA 4K42A 4H0XB 2CGJA 2CH6A 3H6EA 4MO4A 3C0BA 3UKRA 5JLFA 3CHWA 4CZEA 1K8KA 4IXCA 1GLCG 4BRNA 3MN9A 4BRDA 3MN7A 3VEYA 4BRMA 3AARA 1NM1A 2P9IA 5BN8A 1JCEA 4BRKA 3FR0A 3MCPA 3O1BA 3C7NB 1BU6O 5BRHA 1DKGD 5EXWA 1E4FT 3VEWA 2WUSA 2KHOA 5EOYA 2GWJA 3W3DA 3UKUA 3ZETB 3VERA 4BC2A 1RFQA 1HLUA 4YDUA 2E1YA 4FOIA 3ULEB 3VPZA 2ITMA 4BRLA 3M3ZA 2Q0RA 4XH5A 4QS9A 4IZ9A 1ATNA 1Z6RA 4PKIA 4BRQA 3U4LA 3M6GA 2ASOA 2VCPA 1GLLO 2ZWHA 3BF3A 1GLBG 4H0PA 1BUPA 4JD2B 1NGAA 5LJVA 3QDKA 3VF4A 5AQJA 3L4IA 4FSVA 3CJAA 5AZIA 2DPNA 3GG4A 1ESVA 3D2FB 5KQ8A 1YUWA 2E88A 3UB5A 4ISFA 4BG9A 4FL9A 1DGKN 1NMDA 2BTFA 2VWBA 2J4RA 4FPBA 5FPMA 5AQIA 3FLCO 1NWKA 1YXQA 2P9KA 1HJOA 4BRIA 1RGIA 3BP8A 1BA0A 3C7NA 3QICA 2OANA 3DXMB 5TKYA 1Z05A 3ID8A 3VEOA 4BREA 2F9WA 4IWVA 5AQLA 3VF2A 2YJFA 1QHAA 5EY4A 3R9PA 1QQOA 3ULEA 5AQQA 1V4SA 4FWSA 3H46O 3DXKB 5AQXA 3EKSA 3CI5A 2QWOA 4O5FA 1JCFA 1BWFO 3J8AA 3ZEUB 3EN9A 4FO0A 2YI1A 4H03B 3GE1A 2QWQA 4HWIA 1T44A 4WYBA 3OHRA 4PL8A 5KQDA 5KPTA 2V7YA 2Q31A 4KBOA 2Q1NA 4H5RA 4B1WB 4FWRA 4B1VA 4EHUA 2GTDA 5ELZA 2E2OA 1BDGA 1GLJO 2P9LA 3IMXA 4FWNA 3L6QA 3MK6A 4E1JA 4RTFD 1TYQA 3O8MA 3MN6A 1GLFO 2BUPA 2Q2RA 4CZLA 3LDNA 3HBTA 2P9SA 4RCHA 3WQTA 3H3OB 2HF3A 4PKGA 2E1ZA 4IJNA 1NGDA 4BRAA 4DQ8A 1Q18A 3VENA 4XEIA 1J6ZA 2GEMA 2Q36A 3LM9A 4A62A 2E2QA 1SZ2A 3QBXA 3U9ZA 1XC3A 4IO8A 2NRHA 3I33A 2GWKA 2IVPA 4A2AA 4ISEA 5AQVA 3CIPA 2VYPA 3EO3A 4FWQA 3A5NC 2E2PA 5BRDA 4K25A 2P9UB 2IIRA 3A0IX 3DXKA 2FSKA 4H0TB 5JMVA 4B1ZA 5BPLA 4B1UB 2QW9A 3VGMA 3DWLA 3FZLA 1C0FA 4J8FA 5AZJB 3QB0A 3VF6A 1QZ6A 3AAPA 3KVGA 4FPAA 2QWPA 1LCUA 4H0VB 3A5MC 5AQUA 3CERA 4A2BA 2IVOA 5EVZA 3U8XA 3CQYA 3O4WA 3GDQA 5BREA 5AQHA 2F9TA 3TU5A 4FWPA 1U6ZA 3WQUA 5AQGA 4CBUA 5JLHA 5AQKA 2NLXA 1WOQA 2YHXA 4JHDB 1KAZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1S72N 5FROA 4CJEA 3T3FA 4CF2A 1HNXK 4JNEA 2E8AA 4WQ4A 3VQ7A 3U9DA 2XY5A 4H5VA 4NB4A 1RTIA 1N8RO 3NFAA 4DV0K 3IDHA 4FJXA 3KTQA 3W0LA 3ZSVA 4CGIA 4Z4CA 3SZ2A 3K57A 3C6UA 3TAPA 4DFKA 3ENHA 3DMJA 4RG8A 5FPDA 1Q86O 4FK4A 1L5UA 3RMBA 1YJWN 1N36K 1P8ZA 1VSMA 4KHQA 4JI1K 2IVNA 3MEDA 3QEVA 3M8RA 2IS3A 3E66A 4A61A 3OYLA 2G8IA 1JXBA 1RDUA 3LP1A 3THWB 2HOEA 1H1VA 2Q97A 3F73A 2ZF5O 5A2QO 1VQ5N 1IG8A 2VGMA 4B8CA 3WT0A 3AA5X 3CJCA 4W5NA 3MXMA 2NRTA 4BVPA 3QEXA 4N56A 3VA0A 1KFDA 1FW6A 4KAZA 3AO5A 4ISGA 4DV7K 1BISA 3DLGA 1HNZK 4JD2A 3L2WA 4BQZA 4QAGA 1GLAG 3BY5A 1BA1A 3HM9A 3SUQA 4MLHA 4IDKA 5J2NA 3CMEN 1HKGA 4B1XB 1U2VA 3UIQA 3CM6A 5AQMA 3FZFA 4H4MA 3SI6A 4OKEA 3KZBA 3HXMA 5MLCQ 3LDSA 1XMOK 3ENOA 1NGCA 1RTDA 3RWUA 4L8RB 2HHSA 2RF2A 5B8HA 3OYCA 2Z1JA 3P5JA 1TUUA 3PUFA 3P1GA 3HOTA 2ZGYA 5DK5A 4LC9B 3VQEA 1Z26A 2OPRA 2ZJRL 1W0HA 3O80A 2WC9A 5E84A 4BGBA 3OYDA 2O4IA 1WUAA 4CIEA 5IWAK 1RBVA 4BR4A 3F2KA 1MDUB 1YVUA 1S1TA 1VQON 4FJIA 5BPNA 5E26A 3MCAB 4PKHA 1EO1A 4DV5K 3T69A 2X6SA 3CFRA 4CZKA 3SBTA 2H3GX 4AQYK 1IJJA 4CZGA 4O8UA 4WCEL 4J2EA 4Z4IA 4BDYA 3MDQA 2VWKA 3FE1A 3THYB 3OYJA 1RDCA 3AY9A 4FLUA 1ZBSA 5HROA 1R59O 1BOTO 3IUCA 2OZSA 4O44A 1GOCA 3CETA 3D7EO 4BG8A 1NK7A 5HRRA 4B9LA 1NBWA 4FJHA 2CGLA 1X9SA 4F3OA 5FDLA 1CZAN 4DU3A 1TKDA 4CHNA 1BO5O 1TK5A 3SMPA 3S9HA 1X9JA 4XIUA 4CHYA 4BRGA 4NXNK 3O9TA 1IBKK 1XUPO 2JGUA 4K8ZA 3QEIA 1QQNA 1KC8O 1W97L 1X1PA 4M63C 3HL8A 3IS9A 3CCEN 4DB3A 3DJCA 3CQXA 4MDBA 4FJKA 5CYMA 4BRFA 4W5TA 2P9PB 4EHTA 2F7TA 3PX4A 4M3RA 3IAYA 3RTVA 3F9KA 2WOMA 2P9LB 3GL1A 2HNZA 4DSJA 4AM7A 4CZMA 1VQLN 4OGEA 3OJUA 3QFPA 2HHWA 4DV6K 3ID6A 1HPZA 3ISNC 1IV0A 1VQKN 4YNQA 4GV6A 4KB1A 1N6QA 1MU2A 1RT5A 2VGNA 4JHDA 4I6MA 3JXUA 1JCGA 1K8KB 2G8WA 1SS6A 4A5BA 5D3GA 3TAQA 3DRPA 2IGIA 2ETJA 4JI8K 4H4OA 4QS8A 1TUYA 1TAQA 1EWRA 4C1NK 2V52B 3CJ9A 3SLCA 1QQMA 4Y0WA 3AVIA 2I7NA 2FF6A 3VQCA 5GINA 2BDPA 3OYKA 1ASUA 2PAVA 3CPEA 4CJWA 3C94A 4CK2A 5BRFA 4FVUA 3LDOA 2YCHA 3HPGA 3KLGA 3HVTA 1OH5A 5ADXA 3PSFA 3EKUA 5AFUH 1ZC6A 2A41A 4JKBA 4MO5A 3G4SN 5KRTA 3PY8A 2DFHA 4NCAA 2YNIA 1NOZA 4IEEA 2AP1A 2E2NA 3THWA 1WLJA 4B9TA 2QKBA 4CEAA 1ZBIA 3KK1A 1X9WA 1NKCA 5AQPA 2AJQA 1BI4B 4OKKA 4K42A 2CGJA 4QOZB 3CHWA 2P51A 2JWKA 4DR1K 1WSJA 1GLCG 1A5XA 3MN9A 3VEYA 2DFFA 2HVIA 3T7ZA 1QVGM 4DTRA 3O1BA 3Q7CA 2IOCA 5BRHA 1DKGD 5EXWA 4K0KK 3DLEA 5GADP 2KHOA 5EOYA 1YTUA 2KFZA 3CF5L 4YDUA 2YHBA 4KH5A 3VQ5A 1VSHA 4BRLA 3B6OA 1S1UA 1T8EA 4AILC 4DR5K 4GKKK 1RT4A 3AA4A 4KHUA 5DM7L 1C1BA 4U7BA 4CFCA 4CEBA 3FFIA 1Z6RA 3U4LA 4FJ7A 1Q7YO 1GLLO 3AO1A 2ZWHA 1XNQK 1GLBG 4E3SA 1W2BM 1C6VA 1JLAA 3AVBA 2QXFA 3V9ZA 3OYGA 1OH8A 1ESVA 3RMCA 3NF6A 1YUWA 3UB5A 3CC2N 2BH1A 4ISFA 4BG9A 2HNYA 1D9DA 1EP4A 3THYA 1YJ9N 1RGIA 1C0TA 3QICA 2HMIA 3KJVA 4CJLA 1VRTA 4FJMA 4CFDA 4O5BA 4FM0A 2F9WA 4IWVA 3J7YP 1N33K 1L3TA 3ZT1A 1QHAA 4YHHK 4ILHA 3R9PA 1QQOA 5SZTA 3O9QA 1KSPA 3DXKB 3EKSA 4O5FA 3DOLA 1JCFA 3ZEUB 4J2AA 3CXCM 1K73O 3NBPA 3TI0A 2V7YA 2UUCK 4B1WB 1JL2A 4CHZA 4CF0A 2P9LA 1KCFA 4CJ4A 3MK6A 1NJYA 4RTFD 3O8MA 3MN6A 1GLFO 3D45A 2BUPA 1N5YA 3LDNA 4JYAK 2FBXA 5HRNA 1VSKA 3KLEA 4JKFA 1ZBUA 3KKRA 4YOTA 4KO0A 4CE9A 3K5LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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