5LY3A

P. calidifontis crenactin in complex with arcadin-2 c-terminal peptide
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
427
structure length
427
Chain Sequence
ISDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Structural protein
source organism Pyrobaculum calidifontis
publication title Crenactin forms actin-like double helical filaments regulated by arcadin-2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin/actin family protein
total genus 139
structure length 427
sequence length 427
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ly3A01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ly3A02
2H3GX 4BVOA 2W41A 2CGJA 2W40A 3BUZB 5AQUA 3S41A 3TU5A 2NLXA 3AY9A 2HMPA 2A40A 2NRHA 3W0LA 3LDOA 1BG3A 1Q18A 3FGUA 4CZEA 5AQZA 3BEXA 4DB3A 2ITMA 1BA0A 2PBDA 3M6GA 3VGKA 1NGCA 1Z05A 4H5WA 4WYBA 2D0PA 4WQ5A 2P9NB 1BOTO 4RCHA 1HKGA 3DXKB 4M7XA 1Y64A 1HLUA 1U6ZA 3O8MA 3B8AX 2QWLA 2V51B 4CBXA 4BRLA 1BO5O 3QB0A 1NGHA 4ISGA 3IUCA 2E2NA 3M3ZA 4EAHD 2P9IB 4DCHA 3GL1A 2A6AA 4BC3A 3WXLA 1SAZA 4YDUC 5BRHA 3VPZA 3ZX3A 1OKJA 4FPBA 1HJOA 5AQFA 2A5XA 1RFQA 3DAWA 5EX5A 4BRGA 3D7EO 3UE5A 2I7PA 1T44A 3QBXA 3DXMB 3A0IX 3WQUA 4O8KA 4WQ4A 5BRDA 3LM9A 5KPTA 3A5OC 4CBUA 3KZBA 3SMPA 2GEMA 3CJCA 1TUYA 4MLHA 3BP8A 3UKRA 3MDQA 1U2VA 4CZGA 3ULEB 1GLJO 2BUPA 4PL8A 3M1FA 5AFUH 4BRMA 4A62A 2YJEA 1XUPO 1KAXA 1QQNA 2E1ZA 3A5MC 4I6MB 5F0XA 3ZETB 3JS6A 4YDUA 2IVOA 5EY4A 4K25A 5ADXA 5AQYA 1GLBG 4H0YB 4XEIA 5AZJB 4Z94A 2Q0RA 3L0QA 3ENHA 1GLDG 3VEOA 2QW9A 5BPLA 1CZAN 2Q2RA 1X3NA 3R6MA 4JN4A 4FWPA 4K43A 2YCHA 4BR9A 2VWBA 1DGKN 4FWQA 4A2BA 1ESVA 3HZ6A 5AQVA 2OANA 5AZIB 3O6WA 2FSNA 3LL3A 2E88A 4M63C 5EXWA 5AQOA 3WQTA 4FWLA 4BR5A 4CZJA 5LJWA 2ZGZA 2FF3B 3D2FA 3HTVA 2FF6A 5FPMA 1WUAA 3LDNA 4H5TA 4BRNA 1TYQB 4B1UB 5JMVA 3MCPA 3SLCA 4B1VA 2E1YA 4M7YA 5AQKA 4BR0A 3ID8A 3U4LA 3CHWA 1IG8A 2EWSA 1J6ZA 4FL9A 2KHOA 3VEZA 4ISFA 4J8FA 4PKGA 5BN9A 5FPDA 4H0VB 4CZIA 3FE1A 4EHUA 2CGKA 3A8YA 5AQXA 5AQHA 4EHTA 2P9LB 1HPMA 1D4XA 1QHAA 1YVNA 2QM1A 2P9KB 4NB4A 5AQGA 4BC4A 5BPMA 4K42A 4H03B 4FWKA 2YI1A 2V52B 4PKIA 4DHYA 2QXLA 2P9PA 4LC9B 1RDWX 4BQLA 2GWJA 2E2PA 3FFKB 3U8XA 4IJNA 5BPNA 1NGFA 5BR9A 3VETA 3A5LC 2D1KA 3QFUA 2YHYA 1HKCA 3RSEB 4B1YB 5LJVA 2CGLA 3BF3A 4BRFA 5F1XA 4BRCA 4F9OA 2GTDA 3FZFA 1NGBA 1E4FT 1NGIA 3WEEB 3A5NC 3VF2A 3F9MA 1QZ6A 1ZXOA 3G25A 2P9NA 3HM8A 3CJ9A 3AAPA 4H0TB 1NGAA 3KVGA 3R9PA 4EIAA 3DXKA 4JHDB 1K8KB 1QQOA 4BRHA 1NWKA 2YJFA 4EFHA 2P9UB 4AM7A 3C7NB 3CETA 5AQJA 4B9QA 3WXJA 4AM6A 2CH6A 5KPZA 2P9IA 3IDHA 3O08A 3SK3A 1NGJA 1JCEA 3CIPA 3WT0A 5KQ8A 4BRKA 3P4IA 4CZFA 2AA4A 2P9SB 4PL7A 4JNEA 4BG8A 5BN8A 1GLCG 3HI0A 2DPNA 4GY2B 4XH4A 4CZMA 1S3XA 4E1JA 2E2QA 1S22A 2YHXA 3CJBA 4BVPA 5E84A 1G99A 1XQSC 3LDQA 3ZEUB 3U9DA 2NZTA 4Y0WA 3DXMA 1RGIA 3FR0A 2VYPA 3ATVA 3J8AA 4JD2B 3FZHA 3VENA 3H6EA 5ELZA 1NGDA 4IXCA 1DEJA 4FWRA 4CD1A 4FSVA 3D2EB 4BR7A 3ULEA 2D4WA 2HOEA 3O1WA 1ZC6A 2UYTA 3OHRA 2FLOA 1HKBA 4I6MA 3ZETA 5KPRA 4FOEA 2GELA 2HF4A 4IZ9A 2A3ZA 4MLEA 5AZJA 4H0PA 1BDGA 3H46O 1C0FA 1GLLO 1HUXA 3ENOA 3HBTA 4CI6A 4C23A 2ZWHA 5AQLA 4BG9A 3LDLA 2F9TA 4BGBA 4BQZA 2Q97A 3VEVA 4MO4A 3UKUB 1ATRA 1LOTB 5AR0A 5FPNA 1WOQA 4CZKA 5ADXH 4XH5A 1NLVA 2A42A 3LDPA 5AZIA 5AQPA 1SZ2A 3MMVA 1MWMA 1V4SA 2ZGYA 1T6DA 4JAXA 1DKGD 3WXKA 1TYQA 3DJCA 3EZWA 2J4RA 4FPAA 3LM2A 3FZLA 3QDKA 1GLAG 3CQXA 3KHYA 4H5NA 3O1BA 4HWIA 1C0GA 4BGAA 4RTFD 3I33A 4H0OA 1YAGA 2Q31A 3WUHA 5AQMA 2AP1A 2I7NA 1NGEA 1YXQA 2P9LA 3VESA 3EN9A 4L3QA 2P9KA 3QICA 4H0XB 4CBWA 1MA9B 5EOYA 3AARA 2QWRA 3VERA 1QZ5A 2QWMA 3VGLA 1E4GT 3MN7A 4BRAA 2BTFA 1XC3A 1BUPA 2GWKA 3BF1A 2YHWA 3EL2A 3H45C 3EKSA 4DQ8A 3H1QA 5JLHA 4BREA 4WQ4C 5KQDA 3QFPA 3L4IA 1NBWA 4CD3A 3VEWA 3VOVA 4FWOA 3UB5A 2FXUA 1BA1A 2WUSA 3L6QA 4KBOA 1IJJA 2HF3A 1TUUA 4FWNA 3RSEA 5I9EB 4A61A 4H5RA 1LCUA 4MO5A 3QBWA 2F9WA 4FOIA 1P8ZA 3O80A 2V7ZA 3WEEA 3CI5A 5AFUA 2FSJA 3C0BA 2V7YA 5AQNA 4BR2A 5JICA 1MWKA 3FZMA 4B1WB 1EQYA 1BWFO 3VGMA 1ATNA 4IJAA 5BRFA 3MN6A 1NGGA 4PKHA 3EO3A 3H1VX 4JHDA 3UKRB 3CJAA 3IMXA 1K8KA 1U2VB 5E26A 4CZLA 2P9UA 2D0OA 4FWSA 4BRPA 3C7NA 4CJ7A 1JCFA 1R59O 4O5FA 3ZX2A 1V4TA 1NMDA 1X9JA 4K41A 1ZBSA 5AQTA 4QS8A 2QWOA 3O4WA 3HSCA 2FSKA 2IIRA 2P9SA 3ZX0A 1X3MA 4QS7A 4H5VA 1JCGA 3SJHA 3VF6A 4B1ZA 1Z6RA 4BROA 2CH5A 2PAVA 3IFRA 4GNIA 5FPEA 1H1VA 1ATSA 2E20A 3GG4A 4BRQA 5JLFA 3U9ZA 3ZEUA 1KXPA 1QQMA 3H3OB 3VF4A 4XH1A 2IVPA 3R8EA 3TPQA 2ASMA 5EVZA 4JD2A 2VCPA 2GUPA 4A2AA 2E2OA 5AQSA 3D2FB 3VEXA 3MK6A 5TKYA 1KAZA 3D2EA 3I8BA 4RWTA 3H3NO 3QMLA 1NM1A 2IVNA 3O5BA 3JXUA 1T6CA 2ASOA 4NO7A 1SQKA 1HX1A 3CJ7A 3EKUA 5BREA 3MN9A 4IWVA 3GOIA 5AQRA 1KAYA 3WXIA 1GLFO 3MN5A 3GDQA 5F2RA 1MDUB 4BC5A 3FLCO 4WQ5C 4BR4A 5AQQA 3GE1A 4FWMA 3ATUA 3CERA 3CQYA 2Q0UA 3UKUA 3SMSA 3W3DA 4BRIA 3VEYA 2A41A 2ZF5O 2Q1NA 4BRDA 4BC2A 4CZHA 5CE3A 2P9PB 4ISEA 1GLEG 2QWNA 4QS9A 5LY3A 2QWPA 3AAQA 2E8AA 5AQWA 5AQIA 4IO8A 4B1XB 2QWQA 1YUWA 5B8HA 2Q36A 3FZKA 4FO0A 4HTLA 2ASPA 3GBTA 1BU6O 3DWLA 3CJ1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BVOA 3NGIA 3IRXA 3BUZB 5AQUA 3AVJA 5IWAK 3TU5A 4BE2A 2KKZA 3AY9A 1JJ2M 2D0CA 2HMPA 2PYLA 1IKVA 4DB3A 1BA0A 1WSJA 3M6GA 4CK1A 3L2QA 4H5WA 1IBMK 3SCXA 5LL6Z 3MCAB 4DSLA 4CHZA 3WXMB 4CHPA 1WBBA 1U6ZA 3B8AX 2QWLA 1VQON 5C15A 1BO5O 3QB0A 1NGHA 1QHTA 2E2NA 4EAHD 2P9IB 5K14A 3GL1A 3AO4A 1HNWK 4E1NA 3VPZA 3M5RA 1LW0A 3ZSOA 2NUBA 1NK6A 4I9QA 1WLJA 1RFQA 3DAWA 4R79A 5EX5A 5FROA 1T3VA 1VQ9N 3UE5A 1T44A 3I55N 3QBXA 4KI4A 3LP0A 1XI1A 4LF6K 4O8KA 5BRDA 3LM9A 4WF9L 2RN2A 3SMPA 4DMNA 5C42A 3TANA 1GOBA 4Z4IA 1U2VA 4CZGA 1GLJO 3OYBA 4DQSA 1J9AA 1TK0A 1RCHA 3I0SA 5T7BA 1IG9A 1KAXA 2O8FB 4DQRA 1D9FA 2GUIA 4I6MB 2HHSA 2EHGA 3JS6A 5EY4A 1GOAA 3S3MA 1GLBG 4XEIA 2WTUA 4OX9K 2Q0RA 4GMJB 3VEOA 3SUPA 4FLXA 1NKEA 3V9UA 4CK3A 3OYFA 1QSLA 1W9HA 2UUBK 3PO4A 1IKWA 5M1FA 1U45A 1ESVA 3HZ6A 4YOUA 3ZT0A 4NLCA 5AZIB 3TSUA 4CCHA 2FSNA 1IH7A 4KHUA 4HUFA 3WQTA 4FWLA 2B6AA 2ZGZA 1YJWN 3HTVA 3LDSA 3HXMA 3OYCA 4KHYA 1TK5A 4LSLA 2X78A 2KZMA 4DQPA 1IG8A 1UA1A 4CF8A 3P83D 3VMFB 1YITN 2DY4A 3P1GA 4CZIA 3KLFA 4DTXA 4DTUA 5AQXA 4EHTA 2P9LB 2QM1A 1D4XA 4NB4A 4BC4A 4YFUA 1TL1A 5AQGA 4GV6A 1QE1A 4K42A 4H03B 1S72N 3OBYA 2YNGA 1YIJN 4J2BA 3THVA 2HHHK 1ZBLA 4CEEA 2E2PA 4CGDA 4DQQA 3OS0A 3K5MA 4MFBA 1NGFA 5BR9A 3VETA 1I94K 4OO1J 2D1KA 1Q9YA 4CIEA 3BF3A 4CFCA 4BRCA 1NGBA 4F8RA 4U7BA 1QVGM 3VF2A 2OPQA 3F9MA 4KV8A 1BCOA 3G25A 4OVLA 3I8DA 3CFRA 2P51A 2YV0X 4EIAA 1XHZA 1A5XA 1RT1A 4BRHA 4N5SA 4AM7A 3F5TA 5AQJA 4DU4A 2P9IA 5KTQA 3OJUA 3SK3A 1NGJA 1JCEA 4DR3K 2P9SB 3ZT3A 4DR2K 2D5RA 1Z26A 1KTQA 2YHAA 4DTJA 1WSIA 1VQKN 3CCSN 4CJTA 3NCIA 4DLEA 4JI4K 2XRIA 4CW7B 5E84A 1YHQN 1TGOA 3ZEUB 2NZTA 4Y0WA 4YOTA 5KRSA 1SUQA 4JD2B 3ZLJA 1VQ4N 3G6EN 4IXCA 4AH9A 2PYJA 4CIFA 3SUOA 1DEJA 3O9UA 1XWLA 1YT3A 4FWRA 5FRMA 2QXFA 4E7HA 2D4WA 4M42A 2HOEA 1LW2A 3O1WA 1QSYA 3OHRA 2KQ2A 2YKMA 2O8FA 2FLOA 4I6MA 1SKWA 2FC0A 4W5OA 3OVNA 2HF4A 1TL3A 2A3ZA 1L5UA 4FJJA 1HUXA 3ENOA 2Q3SA 3LZJA 4BG9A 2F9TA 3CYMA 3DOLA 3P39A 2W6KA 1KLNA 4Y1CA 5A2QO 1LOTB 3R3LA 5FPNA 4PWDA 4JK7A 4XH5A 3SUQA 5AZIA 2HB5A 3B6PA 5AQPA 2XY7A 3DOKA 1DKGD 3WXKA 4DF8A 4FZZA 2WC9A 4FPAA 1NK0A 4CK2A 1C6VA 1BIUA 1C0GA 4RTFD 1ASVA 5LMUK 1YAGA 2Q31A 5AQMA 1CZBA 1VQMN 5CYQA 3TSQA 5J2QA 3OY9A 4M3TA 2P9LA 1C1CA 4CBWA 4PUOA 2I5JA 4FJKA 5EOYA 4K8ZA 2QWRA 1JKHA 3SPZA 1VQ7N 3QNOA 3VGLA 4OPJA 1ZBFA 1E4GT 3T1AA 4BRAA 2QKKA 3CCEN 3V9WA 2YHWA 3TAMA 4DQ8A 3H1QA 5C25A 3OYDA 2NRZA 1RBRA 1NBWA 4CD3A 1U49A 3VEWA 4FWOA 3M8SA 3UB5A 1BA1A 4FJNA 4KBOA 1IJJA 4O0IA 1VHXA 3CM5A 3C95A 2O4GA 4H4MA 4KTZA 4IBNA 3QBWA 4Q0BA 3VQPA 4KPYA 1WAFA 3LP3A 2V7ZA 5AQNA 4DS4A 4W5RA 2E6LA 4IJAA 4MDAA 3D0PA 1K8AO 3EZ5A 1X1PA 3MN6A 4PKHA 1VSEA 3IMXA 5E26A 2D0OA 4CEOA 2KLAA 3MAQA 4E7KA 3TAQA 4KHNA 3SAFA 4AILC 3VQ6A 2QWOA 4KI6A 3QETA 3O4WA 3RMDA 2IIRA 2P9SA 4V19S 1X3MA 2QTDA 1C0UA 4JS4A 4OGEA 1JCGA 3TAGA 4BDPA 2Y1IA 4JKEA 5DK5A 3S3NA 1GOCA 2IAJA 4OGCA 4B9SA 4BRQA 3ZEUA 2IGIA 3CCRN 3V6DA 4DTNA 3M8RA 5EVZA 4JD2A 4JI2K 2FBYA 4DR1K 3K9JA 3OS2A 3D2FB 1B92A 1FW6A 4KHSA 1ZYQA 2JWKA 3VN5A 4HUEA 3QMLA 4YHHK 1WBDA 3RMBA 4PHTX 3JXUA 2PZSA 3DYAA 1I3AA 3CM6A 4IWVA 1GLFO 2YNFA 3GDQA 1TKZA 1RDAA 1U04A 3NAEA 1W2BM 4FWMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4WFN L;  1QVF M;  1X9J A;  1ZBS A;  3LAM A;  3HOT A;  2G8F A;  2Z1H A;  3L2R A;  3HSC A;  4C1N K;  4QS7 A;  2UUA K;  3OYK A;  4OLB A;  3SJH A;  3TAP A;  4DU1 A;  4IEE A;  1T7P A;  4B1Z A;  2CH5 A;  5FPE A;  1H1V A;  1ATS A;  5JLF A;  1HR0 K;  1JLA A;  1KXP A;  4DFP A;  4ELV A;  3VF4 A;  4FXD A;  2G8W A;  3TPQ A;  3NF9 A;  3QIN A;  1FK9 A;  1VSD A;  4O4G A;  4C8M A;  1YI2 N;  2FBV A;  4CE9 A;  4M3R A;  3VQC A;  4F3O A;  3QEI A;  3QER A;  3TAF A;  3I8B A;  3DM2 A;  3MWT A;  1T6C A;  2DFH A;  2ASO A;  1EKE A;  1SQK A;  3CJ7 A;  5BRE A;  3C6A A;  3GOI A;  5AQR A;  1BCM A;  3SZ2 A;  3WXI A;  4Z4C A;  5HL7 L;  3LAL A;  5F2R A;  4HHT A;  3FLC O;  1EWR A;  3ATU A;  2Q0U A;  3D6R A;  3UKU A;  2A41 A;  4Z4H A;  3HT3 A;  4J2E A;  5J2N A;  3AAQ A;  2QI2 A;  5AQI A;  1VQ5 N;  3VA3 A;  1YUW A;  3AGK A;  3KLI A;  4IKF A;  2ASP A;  4NLB A;  3SQ4 A;  4BWM A;  4B3S K; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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