1ATNA

Atomic structure of the actin:dnase i complex
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
372
structure length
371
Chain Sequence
DEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Atomic structure of the actin:DNase I complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN
molecule tags Endodeoxyribonuclease
total genus 107
structure length 371
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1991-03-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1atnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1atnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1atnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1atnA04
4NB4A 3GG4A 4BG8A 5BREA 1T6CA 3CERA 5AQPA 3ZETA 1JCGA 5JICA 3AAPA 5KPTA 1MA9B 4H5VA 5BPMA 1Z6RA 3ATUA 4H0PA 3DAWA 1BWFO 5B8HA 2E1YA 3HI0A 4FSVA 3UE5A 3VPZA 3WXLA 1SAZA 2HMPA 1NGBA 3W0LA 3A5OC 1IG8A 4WQ5C 1HKCA 3TPQA 4H0OA 3I8BA 4B1WB 2ITMA 3VGLA 3LDPA 4DHYA 2ASMA 3H1VX 5AQIA 3SJHA 1T44A 2VYPA 1CZAN 3M3ZA 3MDQA 4WQ4C 1RDWX 3SMPA 2V51B 3GBTA 3AAQA 3H46O 3A5NC 2P9UB 3VF4A 2QWMA 3WT0A 4K41A 4CD1A 3LDLA 5F1XA 4BRDA 3BP8A 1S3XA 3H45C 2Q2RA 4BC3A 1P8ZA 2GEMA 1NGJA 2F9TA 1NGHA 3CHWA 1ZXOA 4JN4A 3CIPA 2E2OA 3O08A 1TUYA 3FGUA 4I6MA 3VF2A 1ZC6A 2V7YA 1BDGA 2WUSA 5E84A 1NGGA 1X3MA 4M63C 3HTVA 4FOIA 4MLEA 1NGFA 1GLEG 3FFKB 2P9UA 1BO5O 2CH6A 2P9IB 1GLJO 3JXUA 2E20A 3BF1A 5AZIB 3MN5A 5AFUA 3FZKA 4FWSA 5AQGA 3FZHA 2FXUA 3WXKA 5ADXH 1EQYA 1R59O 3O6WA 1TUUA 2H3GX 4PKIA 1QZ5A 1ATRA 3R6MA 3MK6A 3IDHA 2P9LB 3L0QA 5FPDA 2W41A 3MCPA 3D2EB 4NO7A 1D4XA 3RSEB 4FWMA 1HLUA 4B1UB 4PKGA 4EIAA 4GNIA 2E2NA 2IVOA 4QS8A 3LM9A 3O1BA 5JLHA 2P9IA 3FZLA 2QWNA 3QBXA 1QQNA 5AZIA 3OHRA 1S22A 4BRGA 4BQZA 1C0FA 3QMLA 3MN9A 5ELZA 3FZMA 2A3ZA 1QQOA 2I7NA 3ULEB 4DQ8A 4BR0A 3GL1A 3HZ6A 2P9KB 2P9LA 4B1YB 4XH4A 3D2EA 3VEWA 4H0TB 3RSEA 3FE1A 1ZBSA 4BRCA 4B1VA 1TYQB 3CJBA 2GELA 4BR9A 5LJWA 2GWJA 4IXCA 5BR9A 5JLFA 1C0GA 1HKBA 3O4WA 2GWKA 3CETA 5AQZA 1SZ2A 3GE1A 4FPAA 3UKRB 2VCPA 4A61A 4K25A 2Q0UA 4WQ4A 3ULEA 1BA0A 4BRIA 2PBDA 4BRFA 2P9KA 4YDUC 3A5LC 4RTFD 1V4SA 5AQTA 3VEYA 1KAYA 2Q1NA 5CE3A 4FPBA 4CZFA 4XH1A 2Q31A 1QZ6A 1NGIA 3AY9A 1U6ZA 3H1QA 5FPMA 1GLFO 3IFRA 5AQFA 2QWQA 3WQUA 3L6QA 4IJNA 1BA1A 1OKJA 3UKRA 3H3OB 4C23A 4EFHA 1V4TA 4BRQA 2BTFA 3R9PA 1E4FT 4EAHD 3KHYA 1GLBG 3R8EA 4MO5A 3A0IX 5AQRA 2NZTA 1JCEA 1JCFA 4QS7A 3D2FA 5LJVA 2GTDA 2NLXA 2QW9A 3EKUA 4ISEA 2QXLA 5EVZA 4I6MB 2OANA 4BR7A 3CJAA 2YI1A 5BPNA 1GLCG 5AQQA 4CZEA 4PL7A 3O1WA 4BVPA 4J8FA 5EXWA 5AQKA 4DB3A 4FWKA 4WYBA 3CI5A 4CJ7A 5KQ8A 4FWPA 4KBOA 1J6ZA 4O5FA 3VEZA 1NGEA 2CGJA 3C0BA 4XH5A 4BGBA 4FWOA 4M7YA 5BRFA 1E4GT 2IVPA 2ZGYA 4PKHA 2D0PA 5AQSA 3WQTA 2FLOA 4IO8A 3C7NA 3VEXA 3ZX3A 1LCUA 3AARA 4CBUA 3BUZB 3M1FA 2YHYA 2FF3B 3M6GA 4F9OA 1YXQA 4H5WA 1K8KA 2VWBA 3LDQA 2QWRA 3B8AX 4CZMA 3MN7A 3QDKA 3U8XA 5F0XA 1RGIA 3L4IA 3U9ZA 4JAXA 3ENOA 3BF3A 3CJ7A 3UKUB 3ATVA 3DWLA 5AQJA 2F9WA 5AQOA 4GY2B 3H3NO 5AFUH 4A2AA 1NWKA 1GLLO 4BRAA 2P9PB 3VETA 4CBWA 1ATSA 4B1ZA 3GDQA 3G25A 3LL3A 2ASPA 3HM8A 2FF6A 1BU6O 4BRPA 3F9MA 1RFQA 1MWMA 5FPEA 3CQXA 4FWQA 3VOVA 5AQWA 3LDNA 3UKUA 4H0YB 3ZX2A 2A5XA 2E88A 2E2QA 4AM6A 1DKGD 3EZWA 1KAZA 4CBXA 2HF3A 4BGAA 5AQHA 2UYTA 2YJFA 2ASOA 2P9PA 3CJ1A 4RWTA 4MLHA 5AZJB 4JD2B 3VERA 3ZEUA 4BG9A 1NGAA 3QFPA 4WQ5A 1XC3A 1BOTO 2D0OA 4H0XB 3O8MA 4BR5A 3J8AA 3O80A 4ISGA 3VGMA 1BG3A 4B9QA 2IIRA 3DXMB 2IVNA 3U4LA 2A42A 3DXKA 4BC5A 2E8AA 2YHWA 1ESVA 3EL2A 4K43A 5AQUA 3VF6A 5JMVA 2FSJA 5KQDA 5AZJA 1SQKA 3D2FB 4JD2A 1HKGA 2E2PA 4FWLA 2HF4A 1WOQA 1YVNA 5TKYA 4FWNA 4L3QA 3I33A 5AQVA 1XQSC 3DXMA 1DEJA 3ENHA 5BN8A 1NM1A 3MN6A 5I9EB 1X3NA 2CH5A 4BRNA 4BR4A 1NGCA 1G99A 4B1XB 2ZWHA 4BRHA 4RCHA 2CGLA 3ZX0A 2QWLA 2FSKA 5AR0A 4ISFA 2QWOA 2YHXA 3C7NB 5E26A 4A2BA 5AQNA 5BRHA 2QWPA 4FOEA 3S41A 1K8KB 4BQLA 4O8KA 2D4WA 1H1VA 3W3DA 4CZJA 2KHOA 3H6EA 3CQYA 1DGKN 5EX5A 2P9SB 2PAVA 2D1KA 3EN9A 2J4RA 3HBTA 4CZHA 1QQMA 2FSNA 2HOEA 2I7PA 4BC2A 4H0VB 2QM1A 1KAXA 3WUHA 2A40A 4BR2A 5BPLA 4CZLA 1KXPA 4EHUA 3U9DA 4FWRA 4LC9B 5BRDA 3FLCO 3LM2A 2ZF5O 3GOIA 4QS9A 4BRLA 1X9JA 2P9NB 3KZBA 5AQXA 4A62A 1HX1A 2P9SA 1T6DA 2CGKA 4CZIA 3EO3A 4IJAA 1GLAG 1U2VB 1ATNA 3A8YA 4JHDB 5AQYA 3WXIA 2V7ZA 3FZFA 3QFUA 4K42A 1NGDA 2ZGZA 1HUXA 4CZGA 3FR0A 5AQLA 3VENA 5AQMA 4PL8A 4H5TA 4BVOA 4CI6A 3VEVA 5ADXA 4FL9A 5FPNA 5KPZA 3EKSA 4YDUA 3CJ9A 3SLCA 3SMSA 2P9NA 3ZEUB 3QBWA 2AP1A 2GUPA 2A41A 4H5NA 4E1JA 1YAGA 1NBWA 1Y64A 4HWIA 3DJCA 4BRMA 3KVGA 4H03B 1U2VA 3MMVA 4JHDA 4MO4A 1MDUB 2YCHA 3DXKB 3LDOA 2Q36A 3IMXA 3QICA 4CZKA 5LY3A 5EY4A 2W40A 3WEEB 3CJCA 3UB5A 3D7EO 3BEXA 2AA4A 3HSCA 3QB0A 1QHAA 1XUPO 3IUCA 2Q97A 2NRHA 1HJOA 1YUWA 3VGKA 3A5MC 3WXJA 2Q0RA 5KPRA 2A6AA 4IZ9A 3VEOA 4JNEA 1NMDA 4BRKA 1NLVA 4FO0A 4Z94A 4M7XA 4EHTA 4Y0WA 4BC4A 4CD3A 3TU5A 3O5BA 4XEIA 2YJEA 4HTLA 3WEEA 1HPMA 1GLDG 2EWSA 3ZETB 1LOTB 2V52B 2DPNA 3VESA 4BROA 2E1ZA 1BUPA 3JS6A 5F2RA 1MWKA 3SK3A 1Q18A 4BREA 2BUPA 4DCHA 4AM7A 3ID8A 4IWVA 5EOYA 3P4IA 1IJJA 1Z05A 1WUAA 4H5RA 5BN9A 1TYQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Z1IA 3GG4A 4BG8A 5BREA 3OYBA 3T3FA 2FBXA 4B3SK 4RW9A 2QKKA 5GAGP 1XC9A 1SKWA 3DM2A 1IKWA 4H0PA 4CF9A 3OYIA 4CFCA 1KVCA 3CCLN 4CESA 4YOWA 3HI0A 3VTIA 4J2EA 1CXUA 4E72A 2HMPA 3VQ7A 1SS6A 4JKHA 1IG8A 3OYJA 5KRTA 2ITMA 3AVHA 4DR1K 2E6LA 3H1VX 3CCSN 1T44A 4O55A 4PUOA 1CZAN 4E89A 4NLCA 3NE6A 1QQCA 3SJJA 2V51B 2E6MA 2P9UB 3VQ4A 3WT0A 4CD1A 4YHHK 3BP8A 1J5EK 3M8RA 4CGDA 3PUFA 2VQEK 2JLEA 4IFVA 4JN4A 5KTQA 1NK8A 2WBNA 4BACA 4CEFA 3RRHA 5E84A 3G4SN 2PY5A 1TL3A 1X3MA 2HSTA 1NGFA 4WFAL 1SL0A 2CH6A 2P9IB 3AVJA 3OS1A 4B9UA 1IBLK 1F21A 4EP5A 2HHSA 1EQYA 3KK3A 4FM0A 4DTJA 2H3GX 3RWUA 1QZ5A 2FBVA 4MQ3A 1T05A 4CIFA 2KZMA 2JWLA 2P9LB 3AV9A 3E9LA 5C42A 3D2EB 1DT9A 4KTQA 3SUOA 4IKFA 4QS8A 2IVOA 4OLAA 1CZBA 1HYZA 3O1BA 1HNWK 4CHQA 3DLHA 1KCFA 3CXCM 5AZIA 3MEEA 2YHAA 4BRGA 4BQZA 2WFBA 1KLMA 1C0FA 3P1GA 4LF7K 4OPAA 3MX5A 4ELTA 3NF6A 1Y97A 4J2AA 2KW4A 4DQ8A 4WF9L 1HYSA 1BGXT 1VSFA 1TKZA 3WNEA 4B1YB 3VEWA 4H0TB 4E19A 4B1VA 2HHXA 1TGOA 2BGGA 2RN2A 3L8BA 3CJBA 1RT6A 2GELA 5LJWA 2GWJA 3OJSA 1HQUA 3LWMA 5C0YA 5AQZA 3GE1A 3UKRB 2VCPA 1BA0A 3ULEA 3S3MA 4BRIA 3L3UA 2PBDA 3L4QA 2Z1JA 2HVIA 1OH8A 1VRTA 3CCUN 4FVUA 1G15A 2Q1NA 2KFZA 5CE3A 4FPBA 4CZFA 1EWQA 2Q31A 4OJRA 3CD6N 1C1BA 3C6TA 2OYQA 3TAFA 5AQFA 2QWQA 3T1AA 1OKJA 4C23A 1N34K 4EFHA 4BRQA 4EAHD 3HP9A 3KHYA 3MXJA 3V1OA 4CEBA 4CJPA 1XI1A 3L2UA 4LF6K 1HNZK 3RR7A 1JCFA 4JRPA 2GTDA 3TWHA 2UXBK 3TTCA 3VQQA 3VTHA 2O8CA 4DB3A 1VQON 3CI5A 4CJ7A 4A57A 3EYZA 3OTOK 1NGEA 1DLOA 2HHVA 3HVTA 5BRFA 3CYGA 5AQSA 3WQTA 4ILHA 2PFUA 5M1NA 3ZX3A 1LCUA 3HO1A 3D45A 4CJQA 4CBUA 1HJRA 3M1FA 2RPIA 3M6GA 4R5PA 1Q8IA 1YXQA 3LP3A 4H5WA 1ASUA 3CFPA 4CZMA 3MN7A 3F5TA 5H1SQ 3V9XA 4K0KK 3U9ZA 4FXDA 1X9MA 2YX6A 3ATVA 2YKNA 1N8RO 4GY2B 2YHBA 4X66K 5AFUH 4ID5A 4RG8A 4A2AA 4CJSA 4DFKA 1NK7A 4DSIA 2P9PB 4B9MA 3GDQA 3NFAA 4GW6A 3G25A 4CFBA 1SL2A 1NNEA 3HM9A 2R7YA 1U48A 3IAYA 3HP6A 3F9MA 4EZ9A 3RMBA 5FPEA 5AQWA 3LDNA 3O4QA 3ZX2A 2O8DB 5HROA 1KAZA 2FBYA 2HF3A 4KV8A 5SZTA 2WTUA 2UYTA 1TKTA 4DTRA 2ASOA 4RWTA 1K8AO 3TABA 2G8VA 3CC7N 4BG9A 3I55N 1NGAA 1RTDA 4U67L 4B8AB 4DR3K 4H0XB 1QHTA 2QA4N 1IKXA 3C94A 3VGMA 2YNHA 4I2QA 4FJIA 1WLJA 3VA0A 2BE2A 3DRSA 3EL2A 3VF6A 4W5TA 3QNNA 5KQDA 4Z4IA 2ITGA 4JD2A 4CJUA 3M8QA 4CF8A 2GX9A 1WOQA 1K9MO 1YVNA 1C0UA 5TKYA 3O3GA 4DLGA 4CGHA 2RKIA 3KD5E 4HCCA 2D0CA 4BE0A 3ZSOA 5HRPA 3ENHA 1TKDA 3PO5A 3MN6A 2UXDK 2QEXN 5I9EB 4Z4GA 4BRNA 1NGCA 4YY3K 4EZ6A 4B1XB 4FJHA 3HL8A 4BE1A 2CGLA 3K5LA 2FSKA 3IRXA 5EU7A 1WNSA 4ISFA 2QWOA 1CZ9A 3TAMA 2RE2A 4Y1DA 3B6PA 3AA3A 4O4GA 3J7YP 5AQNA 5BRHA 1RT3A 1TK8A 5D3GA 4CHYA 4JS5A 4FOEA 2KTQA 1JKHA 4BQLA 3W3DA 3CQYA 2P9SB 1DTTA 2IAJA 2W6LA 5M1QA 4JYAK 2WC9A 4BC2A 4H0VB 2QM1A 1KAXA 4LH5A 4BR2A 1RT4A 2QTDA 4RW7A 4CZLA 3U9DA 2ZF5O 4Z4HA 3LZJA 3AGKA 1JLCA 4JI1K 2XHBA 3VQBA 2EX3A 4JKCA 3SAFA 3QIPA 4CZIA 4B9LA 1GLAG 1U2VB 1ATNA 4JHDB 4O0JA 5AQYA 4KAZA 3SBTA 4M3YA 4K42A 1S9GA 2ZGZA 1HUXA 3LP1A 3FR0A 4OVLA 4BVOA 3L2WA 3K0SA 3EKSA 4YDUA 1C0MA 1LAWA 4H5NA 2A41A 4FZYA 3K5NA 4JV5K 1Y64A 4A59A 1D9FA 4BRMA 3KVGA 3V81A 4CEDA 1FXXA 3ITHA 3PV8A 1T03A 4C8MA 4E7LA 3TAPA 2OCEA 3DXKB 3LDOA 5M1KA 3K9JA 5LMNK 5KGXA 1TV6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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