1C0FA

Crystal structure of dictyostelium caatp-actin in complex with gelsolin segment 1
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
368
structure length
367
Chain Sequence
DGEDVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the higher Ca(2+)-activation of the regulated actin-activated myosin ATPase observed with Dictyostelium/Tetrahymena actin chimeras
pubmed doi rcsb
molecule keywords GELSOLIN SEGMENT 1
molecule tags Contractile protein
source organism Homo sapiens
total genus 124
structure length 367
sequence length 368
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0fA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0fA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1c0fA03
1V4SA 2BTFA 3IFRA 3A0IX 2HMPA 4H0OA 3HSCA 3VEYA 4GY2B 1NGDA 2E20A 3H46O 5EVZA 1GLAG 2Q97A 3ZX0A 3ATVA 2KHOA 3C7NA 3D2EA 5EY4A 4BRIA 2V7ZA 1NGHA 4PKIA 3CI5A 4CZFA 4EHTA 1HUXA 5AQYA 2EWSA 2Q2RA 1BA0A 3L0QA 3MN7A 2F9TA 4O8KA 5JICA 5E26A 3VEVA 1E4GT 2P9SA 2QM1A 5AQKA 2GELA 2CGJA 3M3ZA 3QFUA 4K42A 4WYBA 2D4WA 3MK6A 5AFUH 4KBOA 2A3ZA 4AM6A 1DKGD 1GLBG 3B8AX 2CH6A 3ZEUB 4IJAA 2ITMA 3U8XA 1QQMA 3RSEB 5AQNA 3CQYA 4WQ5A 1BOTO 3VEXA 3W0LA 4BR0A 3U4LA 1QZ6A 4CZHA 1GLJO 1J6ZA 2E2QA 3H1QA 2V52B 4BRDA 4EIAA 5FPNA 4E1JA 1T6DA 5EOYA 3LDNA 3EKSA 4K41A 3G25A 3LM2A 4CZEA 1U2VA 5KPTA 3QMLA 2GWJA 2CH5A 4B1UB 2P9KB 5AZIB 2HF4A 4CZIA 3DXKB 3GDQA 3ZETB 4O5FA 3QDKA 1QZ5A 2I7NA 3HTVA 3U9DA 3VF2A 3WEEA 4BRNA 4B9QA 2YJEA 5FPDA 4IO8A 3VOVA 2E2NA 1C0GA 5FPEA 1JCFA 4FWKA 1YUWA 2P9IA 4BRKA 3WXKA 5JLFA 1EQYA 3H6EA 4DQ8A 2IVPA 3CJAA 1HLUA 1T44A 2A6AA 5AQHA 4CZGA 1HKBA 4A61A 2I7PA 4IXCA 3A5NC 3GOIA 1SZ2A 2IVOA 3O5BA 4JHDB 2H3GX 3UE5A 3ID8A 1KAYA 4BQZA 4QS8A 1NGIA 3BF3A 4H5WA 4ISEA 5AQXA 3MN9A 1DGKN 3LL3A 3MN6A 3QBWA 3CJ9A 4CD1A 4PL8A 3FZHA 4EHUA 4K43A 1GLEG 2QWQA 2E1YA 4IJNA 3WQUA 5CE3A 5BN8A 4M7YA 5ELZA 2GTDA 3A5LC 4A2AA 5BRFA 4L3QA 4BRPA 4BREA 2A40A 2BUPA 1S3XA 5AQIA 4XH1A 5F0XA 1S22A 4B1ZA 4B1VA 4MLHA 3O1WA 4BRHA 1JCEA 1OKJA 5ADXA 1TUYA 2IVNA 3CHWA 3EN9A 4GNIA 4YDUC 1KXPA 1GLCG 4IWVA 3KHYA 4PL7A 4C23A 3VENA 3CJCA 2D1KA 3ULEB 3VGMA 4IZ9A 2OANA 5AQSA 3VGKA 4BR2A 5BREA 3L4IA 4XH5A 5LJVA 4FPAA 3D2FB 2FSKA 2QXLA 4WQ4A 3HBTA 4ISGA 3MMVA 2D0OA 2P9UB 4H0XB 3HM8A 3IUCA 4A62A 2V51B 1XQSC 3GE1A 4BRMA 1CZAN 1YXQA 2WUSA 5BPLA 1NGBA 2Q0UA 2E2PA 4AM7A 2GUPA 3AARA 4BRCA 2Q31A 3CETA 1LOTB 2P9PA 4XH4A 3KZBA 2Q36A 3WXLA 2A41A 3O80A 5B8HA 1P8ZA 3ZEUA 3SLCA 2QWPA 5AQZA 4MO5A 1ZXOA 3RSEA 4JD2B 5LY3A 3GBTA 4CZLA 4LC9B 2FF6A 4CI6A 5BR9A 1TUUA 2P9LB 3AY9A 3VEOA 4B1WB 4H0PA 3R9PA 1Y64A 1NWKA 1ATRA 4JN4A 4H5RA 5BRHA 4H5TA 4DHYA 2ZWHA 4FWMA 4FPBA 5AZIA 1KAZA 1DEJA 3ZETA 3OHRA 2FF3B 2UYTA 3D2EB 2J4RA 1MA9B 1Z05A 3FZLA 4Z94A 3BUZB 3VPZA 3LDPA 3F9MA 1GLFO 3CJ1A 3P4IA 3W3DA 1QHAA 2P9NA 2QW9A 5AQFA 3A8YA 4QS9A 5BPMA 3C0BA 4H5VA 4BRQA 3DWLA 4CZJA 5KPZA 4EFHA 1XUPO 1BWFO 5AZJB 1V4TA 4BGAA 5KPRA 1U6ZA 1ATSA 4YDUA 2ZF5O 1BDGA 3CERA 3VETA 4H5NA 4FOEA 3FZFA 4RTFD 5AQWA 3GG4A 5AR0A 1HKGA 2YHXA 1KAXA 4M63C 2FSNA 1JCGA 4A2BA 3SMSA 2F9WA 3AAQA 3QBXA 4BC2A 2YJFA 5AQUA 4CJ7A 4H0YB 1XC3A 3VEZA 4B1XB 3VEWA 1BA1A 3DXMB 2FSJA 4FSVA 1ZC6A 4FWOA 2QWLA 4CZKA 5AQOA 2YI1A 3ATUA 4MLEA 5I9EB 1Z6RA 4BR9A 1YVNA 3MDQA 3CIPA 4BVOA 2NZTA 2PBDA 3UKRB 1QQOA 1E4FT 1HX1A 2YCHA 3TU5A 3WXJA 2NRHA 3WXIA 3ZX2A 3ULEA 5EXWA 4DB3A 5BRDA 2P9IB 2YHYA 3L6QA 4JAXA 4FO0A 4BG8A 1MDUB 3GL1A 5AFUA 4H0VB 4CZMA 3HZ6A 2HF3A 2P9UA 3WT0A 5AQJA 3M6GA 1K8KB 3EKUA 3LDQA 3QICA 3IDHA 4NO7A 4PKHA 5AQPA 5JLHA 1TYQB 4BRLA 3M1FA 1WOQA 1G99A 1RDWX 2AP1A 5F2RA 4DCHA 3EO3A 3FR0A 1RGIA 3O4WA 4Y0WA 4I6MB 1H1VA 4H03B 4JD2A 1T6CA 2QWNA 3FE1A 3CJBA 1LCUA 3DJCA 3MN5A 3O08A 3VGLA 2ASOA 5EX5A 2FLOA 2P9LA 2ZGYA 1BG3A 5AQLA 1HJOA 2Q0RA 2D0PA 3R6MA 2VWBA 1WUAA 3H45C 3H1VX 3U9ZA 3O1BA 4NB4A 3UKUB 1NLVA 3VF4A 2ASMA 4FWPA 3VF6A 2Q1NA 4HTLA 4JNEA 1HKCA 1BO5O 3A5OC 2IIRA 1NGEA 2FXUA 2QWRA 3BEXA 2VYPA 4BROA 4FWRA 4BC4A 3O6WA 1X9JA 1QQNA 3TPQA 2QWMA 2A42A 4B1YB 1MWKA 4BRGA 2P9KA 3FLCO 5AZJA 3DXKA 3C7NB 3LM9A 5AQRA 3SMPA 4FWSA 3ZX3A 3R8EA 1GLDG 2E1ZA 5KQ8A 3A5MC 2P9PB 3QFPA 2E88A 3SJHA 2GWKA 5ADXH 4BG9A 1HPMA 3VESA 4CD3A 3S41A 4BQLA 2P9SB 5KQDA 3I33A 2CGLA 1ZBSA 2E8AA 3FGUA 4K25A 1NM1A 4BC5A 5AQMA 3H3NO 1NGJA 3HI0A 3ENHA 4JHDA 4HWIA 3DXMA 1GLLO 4H0TB 3JS6A 3EZWA 2NLXA 4WQ4C 2YHWA 1NGFA 4FL9A 4BR7A 4BGBA 1MWMA 1BU6O 5AQQA 4CBWA 2HOEA 1IJJA 3JXUA 3ENOA 5LJWA 4PKGA 1NMDA 4QS7A 3UKRA 3QB0A 5FPMA 3WUHA 4CBXA 5F1XA 4BVPA 3I8BA 3DAWA 3BF1A 5BPNA 2ZGZA 2W41A 1X3MA 1SAZA 2E2OA 2P9NB 3CJ7A 3D7EO 5TKYA 3FZMA 4BC3A 1U2VB 4BRAA 3SK3A 2ASPA 4BR5A 2PAVA 2A5XA 3AAPA 1IG8A 1SQKA 4J8FA 4M7XA 4RCHA 5AQVA 4BR4A 3UB5A 4F9OA 1K8KA 3BP8A 3WEEB 4EAHD 3H3OB 4FWNA 3VERA 3IMXA 2AA4A 3LDOA 3J8AA 1BUPA 1TYQA 3CQXA 1RFQA 1R59O 2V7YA 3D2FA 4ISFA 2DPNA 2W40A 4FWQA 5JMVA 4XEIA 1ESVA 1C0FA 4WQ5C 3O8MA 4I6MA 2CGKA 1NBWA 4FOIA 1NGAA 1NGGA 3LDLA 5E84A 1Q18A 4MO4A 2QWOA 3FZKA 4BRFA 2VCPA 3FFKB 1NGCA 3KVGA 3WQTA 3MCPA 1YAGA 3EL2A 2GEMA 4FWLA 5AQTA 4CBUA 4RWTA 1X3NA 5BN9A 3UKUA 5AQGA 1ATNA 1D4XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FJHA 5T7BA 3P39A 4R79A 2DFFA 3HSCA 1GOCA 4IEEA 2NRVA 2HBMA 5EVZA 1O1WA 4K8XA 4BE7B 2RF2A 4B08A 1VQ6N 4AHSA 1TKZA 1UWBA 2ZD1A 3ATVA 2WC9A 2KHOA 3D2EA 2GV9A 1KSPA 3CI5A 1L5UA 1HUXA 4C8NA 5AQYA 2EWSA 5J2PA 1BHLA 3K9JA 3U3YA 4F4KA 1VSDA 3IRXA 3VEVA 1QE1A 4E7HA 3HVTA 4DQQA 3F9KA 5H1SQ 4DFMA 3M3ZA 1KVAA 2D4WA 3MK6A 5AFUH 4KBOA 4HHTA 3SYZA 4Z4FA 1FKPA 2F96A 1R0AA 2NRZA 1S9EA 1VQ7N 1HNVA 5JVGL 4WQ5A 1BCOA 3W0LA 3B6OA 1CLQA 4GMJB 4YOUA 2E2QA 4EIAA 5EOYA 4CFCA 4GKKK 2DTUA 5CY4A 5KRTA 3KLGA 3KK3A 3V9WA 2CH5A 1T3VA 4DR1K 3DXKB 3EEQA 4WFAL 1RBSA 4O5FA 2I7NA 4CCHA 4FJLA 4B9QA 3F5TA 1QVGM 1YVUA 5FPDA 4IO8A 3PSFA 3VOVA 1EP4A 5FLXO 4FWKA 2O8CA 4CE9A 3WXKA 4OVLA 1HYVA 3NGIA 2PY5A 2IVPA 5C0YA 1T44A 2FBXA 2A6AA 1UA0A 4QOZB 1SZ2A 2IVOA 1ASWA 2H3GX 3ID8A 4QS8A 1RBRA 1DGKN 1ILYA 3CJ9A 4CD1A 4CJKA 4K43A 1GLEG 2E1YA 4IJNA 3WQUA 4B8AB 5CE3A 1RBTA 3TAMA 5ELZA 4EP4A 2GTDA 4KHYA 2W42A 4BRPA 5F0XA 1VSKA 4DTOA 2O8FB 1IKYA 3HO1A 3LPTA 3THVA 2PFUA 3EN9A 2ETJA 4OGEA 3Q7BA 4IWVA 4CERA 2YX6A 4KI6A 4X66K 4C23A 3KWGA 3VENA 4NCAA 4E7KA 1XMOK 3ULEB 3L2QA 4IZ9A 3L4IA 3QNOA 4FPAA 3O3GA 3MMVA 5M1OA 2D0OA 3KKRA 4H0XB 4BEBA 2P51A 3IUCA 2O4GA 1WSHA 4CHNA 4A62A 3GE1A 1XQSC 2I5JA 4BRMA 3OS0A 1YXQA 2WUSA 3HJFA 1NGBA 2Q0UA 3HP6A 2G8IA 3ZT1A 3I8DA 2YNHA 1RTIA 4XH4A 4A5AA 1RCHA 2F8SA 3E9PA 3C95A 4B9MA 3T1YK 3VQBA 3D45A 1P8ZA 4F8RA 3OYGA 4M3YA 4CZLA 2Z1GA 2FF6A 4KO0A 1SL0A 1TUUA 2P9LB 3AY9A 3VQ8A 4PHTX 3RMAA 1XWLA 2YNGA 1RTHA 4M3RA 1VSHA 1NWKA 1KC8O 1ATRA 3T3FA 2HBJA 4FVUA 4FLTA 3V1OA 4N5SA 3K5NA 3OBYA 2C1IA 1KAZA 2FF3B 3D2EB 2HVIA 2J4RA 3HK2A 3NBPA 1IKWA 1Z05A 3LDPA 3CJ1A 3P4IA 3C6HA 3NGZA 2R7YA 3C0BA 3DWLA 2VQEK 4FLWA 1KQSM 1XUPO 1WNSA 5AZJB 4CF2A 3O9TA 1QS4A 5KPRA 2YNFA 4KH4A 1UOCA 2ZF5O 1BDGA 4AILC 4Z0UA 4W5TA 4FOEA 4DFJA 5C12A 1HKGA 3QO9A 3VN5A 4CECA 4A2BA 3AVLA 3QBXA 4BC2A 4M3XA 5AQUA 3EYZA 4DTPA 4CK3A 3EZ5A 2FSJA 4DMNA 1XHXA 4MFBA 4C1NI 4FSVA 1JLBA 4DV1K 1HNIA 4CZKA 3CMAN 5AQOA 2YI1A 3MEDA 4JK7A 4DUZK 3TR8A 4K0KK 4PY5A 2HHXA 1Z6RA 1WB9A 1RTDA 2O8DB 4JKEA 3RTVA 1E4FT 2YCHA 3M8PA 4IO9L 3ASMA 1EETA 3WXIA 5DM7L 3ZX2A 4E7LA 4JV5K 5EXWA 5BRDA 1LV5A 3L6QA 4FO0A 5AFUA 1JLAA 3SV3A 4I9LA 1TAUA 3WT0A 2O8BA 3AVAA 4BDPA 4FJ7A 4AHCA 1OVYA 4CEAA 4X62K 2VG6A 4DQRA 4NO7A 4DS4A 4DSJA 5DM6L 1G99A 3F2KA 4GVEA 5C2FA 1RGIA 2DFEA 1VSMA 4I6MB 3NH1A 1H1VA 2XY6A 1YIJN 3DJCA 3O08A 5A2QO 2ASOA 5EX5A 2FLOA 3K0SA 1TK5A 1YJWN 1BG3A 5AQLA 1VQLN 4OKEA 1WBDA 1K73O 5M1FA 3CMEN 2KZZA 4ILHA 3O1BA 2IOCA 2VWJA 3UKUB 3D0PA 2Q1NA 1OH5A 1BO5O 2XRIA 4LSNA 3A5OC 1RBUA 1X9JA 2XY8A 2ZQBA 1XHZA 2OYQA 4FJXA 3CYGA 4FZXC 5J2QA 3C6AA 2P9KA 4CIEA 3VA0A 3CM6A 3C7NB 4LD0A 3OS2A 4IOAL 3SMPA 4FWSA 1NG9A 4OLBA 4LH4A 3SAFA 5FROA 3VQDA 3VQ7A 3QFPA 2E88A 3SJHA 2HHWA 1BI4B 1HPMA 3VESA 4HTUA 1VQMN 2P9SB 4LF5K 4CJWA 2CGLA 2B5JA 2UUAK 1ZBSA 2E8AA 4OJRA 1BL3A 3C6TA 3H3NO 3HI0A 1WSGA 4JHDA 1Q86O 5CZ1A 1N32K 5HP1A 1GLLO 3CQ8A 3JS6A 2GX9A 4CGDA 5CHIA 2YHWA 4CK2A 4BGBA 1BU6O 4FLZA 1VQON 2HOEA 2C1GA 1IJJA 1KLNA 4DSKA 4FXDA 5KI6A 1NMDA 4FLXA 1YTAA 3TSPA 4B9SA 3DAWA 5BPNA 2ZGZA 2A1SA 1X3MA 2E2OA 2HBLA 3CJ7A 4BC3A 3MXIA 1U2VB 4BRAA 1LWEA 4B9VA 2PAVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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