1C0FA

Crystal structure of dictyostelium caatp-actin in complex with gelsolin segment 1
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
368
structure length
367
Chain Sequence
DGEDVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the higher Ca(2+)-activation of the regulated actin-activated myosin ATPase observed with Dictyostelium/Tetrahymena actin chimeras
pubmed doi rcsb
molecule keywords GELSOLIN SEGMENT 1
molecule tags Contractile protein
source organism Homo sapiens
total genus 124
structure length 367
sequence length 368
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0fA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0fA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1c0fA03
3GE1A 1YVNA 5AQRA 1LOTB 1QQMA 3M6GA 2Q97A 3U9ZA 4BRNA 4CZIA 2E2QA 4ISFA 1NGBA 4BRIA 1NGJA 1BWFO 4LC9B 2P9IA 3VETA 4BQLA 4BR9A 2Q1NA 3FZKA 3WXIA 2HF4A 4CZLA 4BRQA 4FWOA 1NGHA 1S22A 1HLUA 3WEEA 3ID8A 2NRHA 4H5WA 1X3MA 2A5XA 3CETA 2EWSA 1X3NA 5ADXA 4K43A 4FWPA 2BUPA 3CIPA 3MMVA 2CH6A 1C0FA 1GLAG 3O5BA 1DKGD 3GDQA 3VEYA 4DCHA 3DXMA 1R59O 1BDGA 3MN5A 4BR0A 5ADXH 3WXKA 3BEXA 2I7PA 3VESA 1IG8A 1WOQA 3LDPA 1ATRA 1QZ6A 4MO4A 2QWRA 3I8BA 1DEJA 2E2PA 4JN4A 5BRHA 1GLDG 2D0PA 5AQXA 1NGAA 1NGGA 4H5RA 4FPBA 4FO0A 5LJVA 4IXCA 4BR4A 1S3XA 5AQNA 4BC5A 3GBTA 3LL3A 1HKGA 3ZETB 2FSNA 5JLHA 4BR2A 1GLFO 1SZ2A 2W40A 2HMPA 3IUCA 4K42A 1NLVA 4B1WB 3VGLA 3S41A 4JD2A 3CJ9A 3R6MA 4B1YB 1Q18A 2FXUA 1ESVA 4CBUA 3LDQA 3UB5A 5F1XA 4PKGA 4WYBA 2IVOA 5AQWA 2V51B 2YJEA 1JCFA 3EN9A 4O8KA 1K8KA 4BC2A 3CJBA 3ATVA 3DXKB 3L0QA 3DJCA 5FPNA 4IWVA 2VWBA 5JLFA 1ATSA 2FSJA 2F9TA 1WUAA 4EHTA 5BPMA 4FOIA 3R9PA 5BPNA 4CZKA 2P9LA 3MN6A 3OHRA 3KHYA 5AQYA 4QS9A 4WQ4C 1NGDA 3HI0A 3VEWA 1V4SA 3KZBA 4KBOA 2GWKA 4A2BA 2V7YA 5EXWA 3FFKB 4FL9A 2E1ZA 3CJ7A 3VEOA 4XH1A 2QWLA 4FWLA 2KHOA 2A41A 3UKUB 4CZEA 4PKHA 3HZ6A 1SAZA 3D2FB 4I6MB 3ZX2A 2ZWHA 5F0XA 3GG4A 5EVZA 2GEMA 4HWIA 1TYQB 3SJHA 3ULEB 1RDWX 3AAPA 1BO5O 4YDUA 1JCEA 3HM8A 5KPZA 1Y64A 3BF3A 2FF3B 3VERA 5AZIA 5KPRA 2I7NA 3ZEUB 1RFQA 3QFUA 3QFPA 2FLOA 1NBWA 1GLCG 5BREA 3UKRB 5AQUA 2CGKA 2QWPA 4Y0WA 5AQGA 3JS6A 5AQSA 4BG8A 3EL2A 4B1UB 1KAZA 4CBXA 4M63C 1YXQA 3LDOA 3VEVA 2DPNA 3C7NB 3H6EA 3H46O 4H03B 4IJNA 3VENA 3VGMA 5AQVA 5AQHA 1U6ZA 2ASPA 2P9KB 5ELZA 1MWKA 2P9PA 5AQTA 4BRLA 3H3OB 3M1FA 1Z6RA 3D2EA 3EZWA 4BR5A 4WQ5A 5FPMA 2YHXA 4QS7A 3UE5A 2E1YA 3FGUA 4WQ4A 1IJJA 4A61A 2YI1A 3CI5A 5AZJB 4BGAA 5E26A 3LDNA 5JMVA 1RGIA 3CQYA 2UYTA 3WT0A 2GUPA 5I9EB 3TU5A 2P9SA 1NWKA 3RSEA 1NGFA 4CJ7A 1MDUB 2A42A 4NO7A 3IMXA 4BREA 2V52B 1BG3A 3AY9A 3MN7A 2P9NB 5BRFA 4JHDA 1NGCA 1H1VA 5AQZA 2QWMA 3BF1A 1E4FT 1KAYA 3P4IA 1P8ZA 1TUYA 3O1WA 1MA9B 2NLXA 3QBWA 5KPTA 2NZTA 3U4LA 2CGLA 4GNIA 4GY2B 3ULEA 3L6QA 4BRPA 2Q2RA 1YUWA 5FPDA 2BTFA 2E8AA 4BC3A 4CBWA 5AQKA 2FF6A 3VF6A 3WXJA 5AQFA 1LCUA 1NGEA 3EKSA 1KAXA 3WQUA 1DGKN 3CQXA 5BN9A 4ISGA 5AQQA 2Q0RA 1T44A 4BGBA 3AARA 4FPAA 3H1QA 1GLJO 2OANA 1KXPA 4CZMA 3BP8A 4E1JA 2HF3A 3C0BA 2E2NA 4BRKA 4IZ9A 4MLHA 4BQZA 5AQOA 1ATNA 1XQSC 2P9UB 4BRCA 4XEIA 5KQ8A 2QWNA 4FOEA 4F9OA 3MN9A 3HBTA 4FWNA 2GTDA 3WEEB 1JCGA 4NB4A 3VF4A 2P9KA 3A5LC 1C0GA 2AA4A 3DAWA 3GOIA 4IO8A 4EHUA 2D0OA 3QB0A 5AQIA 4BRFA 3KVGA 5JICA 3FZMA 2E20A 5BPLA 4A2AA 1GLBG 4DHYA 5KQDA 3WQTA 3B8AX 3SMPA 3BUZB 3DXMB 1QQNA 5E84A 4Z94A 3O6WA 2YHYA 3QMLA 4MO5A 2Q0UA 2IVPA 3JXUA 4FWKA 2CGJA 2PAVA 4H0VB 2ZF5O 3H1VX 1J6ZA 1U2VB 3LM2A 3ZX3A 4M7XA 4BVPA 2J4RA 1HX1A 2GELA 4ISEA 4CD3A 1HKBA 2IIRA 4L3QA 3U8XA 2Q31A 3DWLA 3ZX0A 3A8YA 4K41A 1QHAA 2QXLA 3WUHA 1EQYA 3I33A 2IVNA 3ZETA 4BVOA 3FZLA 4XH4A 4AM7A 2CH5A 5EOYA 3R8EA 2QWQA 4RCHA 2H3GX 4AM6A 1BUPA 5BR9A 4PKIA 3A5OC 1HKCA 5B8HA 4JD2B 3F9MA 3W3DA 2QM1A 3G25A 1QZ5A 3ENOA 4HTLA 2PBDA 3FR0A 4BG9A 1HJOA 3TPQA 3O4WA 3MCPA 3VEZA 4MLEA 4A62A 4H5VA 5CE3A 3VGKA 1T6DA 3DXKA 4B9QA 1T6CA 3CJAA 3CJ1A 3W0LA 4CD1A 1K8KB 5BN8A 3CJCA 1BU6O 2P9UA 3H3NO 4CZFA 2QWOA 4JAXA 3O1BA 2P9LB 4IJAA 5LJWA 1ZXOA 2V7ZA 4FWRA 3VF2A 5AFUA 4PL7A 1OKJA 2ASOA 3A5MC 4FSVA 1BOTO 3D7EO 4C23A 2ITMA 1QQOA 4CZJA 1YAGA 2AP1A 2YCHA 3FZFA 3U9DA 4BR7A 3SK3A 3UKUA 2F9WA 4BRMA 4B1XB 3L4IA 2A3ZA 3A5NC 5AFUH 2YJFA 3GL1A 3SMSA 3D2FA 4I6MA 4BROA 3VOVA 1NMDA 1TYQA 1U2VA 2ASMA 3WXLA 5FPEA 2QW9A 4B1ZA 5EX5A 1GLEG 4JNEA 5TKYA 3M3ZA 3O80A 1HPMA 3ZEUA 4DQ8A 1MWMA 1E4GT 2VCPA 5LY3A 4YDUC 1Z05A 5AZIB 1XC3A 5EY4A 1BA1A 3UKRA 1CZAN 4CZGA 4H0YB 4O5FA 3A0IX 2ZGYA 1D4XA 2P9IB 4XH5A 5BRDA 3HSCA 2E88A 4RWTA 3O8MA 2W41A 5AQJA 4M7YA 3LM9A 3C7NA 3HTVA 2WUSA 2E2OA 4H0PA 4QS8A 4BRDA 2ZGZA 4CZHA 3SLCA 3IDHA 4FWMA 4BRHA 2P9PB 2A6AA 3CHWA 2D4WA 1NM1A 4FWSA 3D2EB 1ZBSA 1X9JA 1GLLO 3MDQA 5AZJA 3CERA 3QBXA 1XUPO 5AQLA 5AQMA 1V4TA 3EO3A 3FE1A 2D1KA 2Q36A 3H45C 4WQ5C 2FSKA 1G99A 3J8AA 3O08A 5AR0A 1NGIA 1SQKA 3EKUA 4PL8A 3VEXA 4B1VA 2VYPA 4FWQA 2A40A 2P9SB 3RSEB 3QICA 3ATUA 4K25A 4DB3A 3FLCO 4BRGA 3ENHA 2HOEA 3LDLA 1ZC6A 2P9NA 3AAQA 3QDKA 4CI6A 4EIAA 5AQPA 2YHWA 4RTFD 4H0OA 4EAHD 3VPZA 5F2RA 4JHDB 3FZHA 1HUXA 4EFHA 4H0TB 4J8FA 4H5NA 3MK6A 4H0XB 4BRAA 1TUUA 4H5TA 2GWJA 3IFRA 1BA0A 4BC4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JKEA 1LAVA 2Q97A 3V6DA 4CZIA 2E2QA 3MXIA 3VETA 4CJTA 4JV5K 4CFBA 3T19A 2B4JA 4JLHA 3WXIA 1VQON 2G8HA 2HHSA 3DMJA 1VSIA 1S22A 3G71N 1NJZA 3LP2A 1EWQA 1BIZA 3E9OA 1FW6A 5I42A 4HUGA 2KZMA 3MMVA 4CK3A 1YJWN 1LWCA 4YY3K 1GLAG 2O4IA 1DKGD 3AVMA 1NK9A 4DCHA 3DXMA 3ZSVA 1L5UA 1L3SA 1BDGA 4BR0A 2QXFA 2NRZA 1W9HA 2FBXA 3LDPA 4AF1A 2GV9A 4I9LA 2ZJRL 4F3OA 4FW2A 3LP1A 4ELUA 2QK9A 1DEJA 2E2PA 5BRHA 3TAGA 4IO9L 1RDAA 3T1AA 4CEAA 4NCBA 3I8DA 4FO0A 1Q7YO 4BR4A 3F73A 4JK9A 1N34K 1S3XA 4NCAA 4OO1J 1BGXT 3GBTA 4CFAA 3M8PA 5JLHA 3VQDA 3IUCA 3AVLA 4K42A 2NRVA 1XNRK 3R6MA 4JKFA 1JLFA 1ESVA 5MLCQ 3AVIA 1JCFA 1RDUA 4O8KA 5HL7L 3KLGA 4I2PA 3DJCA 4BWMA 4IWVA 2VWBA 1ATSA 3TAQA 1WUAA 3B6OA 4EHTA 2P1JA 4Z4CA 1LWFA 1W97L 3KHYA 4JI2K 1IKXA 3KZBA 4KHYA 4KBOA 2V7YA 3FFKB 1TV6A 4JI7K 4FJNA 3O3GA 4PA1A 1YTAA 3IG1A 3VEOA 3O3FA 1XNQK 1RT7A 2B6AA 3HPGA 3MEDA 4WF9L 4CZEA 5GIPA 4ILJA 2ZWHA 4FJGA 3GG4A 3LZJA 1GOBA 4M3TA 1EETA 5EVZA 3VQEA 4JI8K 3ITHA 3CC4N 1I3AA 4M3YA 4DU4A 4CVNE 1BO5O 1TKTA 5C15A 3E9LA 3CC2N 3CYGA 4LF7K 2Y1JA 2HNDA 2FF3B 3AVBA 4AHRA 4DQRA 4B9UA 3IRXA 1ZYQA 3UKRB 1Z26A 2CGKA 4Y0WA 5HRRA 5AQSA 4M63C 4M42A 4KHSA 1RBUA 2HNYA 4IFEA 5HBMA 2XRIA 3H6EA 3VENA 3L2RA 1U45A 2ASPA 5ELZA 4BRLA 1C0TA 5C0YA 3Q7BA 4E89A 1S1VA 1RT4A 3KK3A 4DR7K 3OYMA 4OPKA 3FGUA 2OTLN 1IJJA 3CI5A 1RBSA 3TAMA 3LDNA 3C94A 4O44A 1FKOA 4F2SA 3KJVA 1RGIA 1WSFA 3L3UA 3CQYA 4KAZA 3SAHA 4FJ9A 4E1NA 2OZSA 4FCYA 2F4VK 1NK7A 5HOOA 2O8EA 1WSIA 1FJGK 1NGFA 4O4GA 1MDUB 4DS5A 4BREA 1JLGA 3V9WA 4XIUA 4HTUA 4GV9A 2I5JA 3BF1A 3MWTA 1OH8A 1P8ZA 4LD0A 3G4SN 1TUYA 3O1WA 4CGJA 1MA9B 1WSGA 4JRQA 1B92A 1QSYA 1E3MA 3EE8A 5KPTA 2NZTA 3NMUA 4E7HA 2CGLA 3AA3A 4W5OA 1IKVA 4CHYA 3AGRA 1QQCA 4BRPA 5HRNA 2WONA 4RW8A 4BE0A 5LL6Z 4Z4GA 4M3ZA 3WXJA 1BL3A 5AQFA 1TL3A 3EKSA 3KLEA 3CQXA 4DQSA 3OYEA 3SUNA 5AQQA 4BGBA 3AARA 3I0RA 5FDLA 2FC0A 1KXPA 2OANA 4CGGA 2FBVA 3C0BA 3HRGA 4DSIA 4N47A 4IZ9A 4FLYA 3KTQA 4BRCA 2O8BA 3TTDA 3VQPA 3A5LC 4A5AA 2AA4A 3GOIA 1EWRA 3ZSXA 4IO8A 3WXMB 3NDKA 3QEIA 3QB0A 4LF4K 5JICA 3THYB 1N36K 3L4QA 3HM9A 3THVA 1GLBG 4DHYA 3AV9A 3Q7CA 3WQTA 3SMPA 5E84A 3OYHA 1JXEA 1SKWA 4PHTX 1Z25A 4X62K 4NLCA 2D5RA 2CGJA 4YNQA 1U2VB 5IWAK 3S3MA 4MQ3A 3TSQA 3HPHA 4CD3A 4DV5K 5D3GA 4L3QA 4KH6A 3SJJA 4BDYA 1QHAA 1TK5A 4CJKA 2ITGA 4XH4A 1CZBA 3KK7A 2JWLA 1HRHA 2YV0X 2QWQA 4RCHA 1K6YA 4AM6A 1CLQA 1C1BA 1IH7A 3QLHA 5BR9A 3OYGA 3PIOL 5B8HA 4JD2B 3W3DA 4DU3A 2W00A 3CCUN 3DYAA 1XC9A 1HYSA 3FR0A 4BG9A 4OLAA 3THWA 3LAMA 2JLEA 1VK0A 3P83D 4OGEA 1OVQA 5CE3A 3NGZA 3VGKA 3HVTA 3PX4A 3ZLJA 3DXKA 3PIPL 2E5LK 3CJ1A 1K8KB 4W5RA 5BN8A 3IS9A 3OYDA 5A2QO 3H3NO 4CW7B 4LF9K 2NRWA 3EY1A 1S9EA 4JAXA 4CJQA 2V7ZA 2WFBA 5AFUA 4PL7A 2P51A 1CXQA 3A5MC 3RTVA 4C1NK 1QQOA 2BH1A 3T1YK 2W42A 1Q9XA 5J2NA 1L3TA 4L8RB 2YCHA 3AA2A 3SK3A 1OH7A 3UKUA 4M3UA 4K0KK 3BZKA 3CF5L 4BECA 2G8IA 4UY8O 4CHNA 4FJ5A 1NMDA 1UAXA 4CEDA 1TYQA 1U2VA 1HR0K 4CEQA 4DR6K 4HCCA 2QW9A 2HW3A 4PY5A 1D9FA 4CJ3A 4CJLA 3PSIA 4AILC 2VG6A 3O80A 4O8UA 1KTQA 3NGIA 1NKEA 4DQ8A 4BDPA 1MWMA 4BWJA 1RBTA 2HHIA 5AZIB 1S9GA 5EY4A 1BA1A 1TK0A 4LFAK 1KVAA 3HSCA 4E1MA 2E88A 1WN7A 1OVYA 1RDBA 4B3RK 3NCIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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