1D4XA

Crystal structure of caenorhabditis elegans mg-atp actin complexed with human gelsolin segment 1 at 1.75 a resolution.
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
372
structure length
368
Chain Sequence
EVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGVVLDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITVGNERFRCPEAMFQPSFLGMESAGIHETSYNSIMKCDIDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structure of nonvertebrate actin: implications for the ATP hydrolytic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords C. ELEGANS ACTIN 1/3
molecule tags Contractile protein
source organism Caenorhabditis elegans
total genus 116
structure length 368
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1d4xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1d4xA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1d4xA03
4FL9A 3MN9A 3DXKB 2IVOA 1G99A 4MO5A 5LJWA 4FWPA 2WUSA 4BRNA 3MN7A 3ATVA 4CZGA 5LY3A 2D0OA 3D7EO 2YI1A 3WXKA 3UKRB 4XH4A 1T6CA 1R59O 3FLCO 5FPNA 2QM1A 4BREA 3ZX2A 4EHUA 4CBUA 3LDQA 3A5OC 3DWLA 3SK3A 3HI0A 5AQKA 2IVNA 3B8AX 4BRCA 4FWOA 4QS9A 5F1XA 3C7NA 1X3NA 1QHAA 3CQYA 1NM1A 2PAVA 4FSVA 5EOYA 1NGHA 4RWTA 1HKGA 3MCPA 2A42A 3O5BA 2PBDA 4BR0A 3QFUA 4JD2A 3KVGA 5AQVA 3VGMA 1BU6O 3VEYA 2QWMA 5ADXH 2V51B 4IWVA 5AQZA 4BRHA 4H5NA 5FPMA 4IJAA 1RDWX 2P9IA 1NGIA 4WQ5A 3I8BA 3QDKA 4Z94A 1V4SA 1XC3A 2QWPA 2P9NA 4B1XB 3O1WA 3CJCA 3EKSA 3ENOA 1BA0A 2H3GX 3ZEUA 3A5NC 4FO0A 3UE5A 1LOTB 3QBWA 4JN4A 1GLLO 4XEIA 3U9ZA 3W3DA 2E2PA 3MDQA 3ENHA 3QBXA 1BUPA 4L3QA 5EXWA 1NGCA 2F9WA 3EKUA 1X3MA 5I9EB 3WT0A 4FWLA 3VEXA 3VF6A 3ULEA 3WXIA 3ZX3A 4BRGA 4BGAA 4CZHA 1P8ZA 1ATRA 5AQLA 1HJOA 1V4TA 4DHYA 2ZGZA 4I6MA 4Y0WA 3SMPA 4BR9A 3D2FB 3OHRA 5AQMA 1BWFO 5BPMA 2D0PA 3R6MA 1MDUB 2CH6A 1Q18A 4JHDA 4H5RA 5AQIA 1DGKN 1T44A 2AA4A 2FXUA 1K8KA 4J8FA 1MA9B 3WXJA 1S22A 3CHWA 4GNIA 2ITMA 1QZ5A 5AZJA 3AAQA 2P9SB 1E4FT 3VESA 4FWQA 1EQYA 3L4IA 2GELA 1XQSC 4K42A 3A0IX 4O8KA 4BG8A 3VF2A 2A6AA 1QZ6A 4FPBA 4H0YB 4PL8A 3VEWA 5BPLA 4E1JA 3ZX0A 3C0BA 2ZWHA 3IDHA 4DQ8A 5EY4A 4H0TB 3SJHA 2A5XA 3BP8A 2F9TA 4K43A 3FZKA 3CETA 3HSCA 5AQJA 2IVPA 4B9QA 3H3OB 1ATNA 2P9UB 2ZF5O 3O6WA 4JNEA 4BRFA 1CZAN 3GE1A 1BA1A 2P9PA 3SMSA 3H1QA 1NGDA 3IMXA 2HF3A 1TUUA 4HTLA 3CJ1A 1NBWA 3U9DA 3AARA 4EIAA 1HPMA 3CIPA 3CJBA 4FPAA 4JD2B 4JAXA 4YDUA 1NWKA 2Q1NA 4NB4A 3M6GA 1HKCA 4BRQA 4HWIA 4AM7A 3GL1A 4K41A 3JXUA 4ISFA 3LDLA 5EX5A 1IJJA 4CZIA 2Q97A 4RTFD 1GLDG 3HBTA 2Q31A 2QWLA 3A5LC 4NO7A 4PKIA 1BO5O 4B1ZA 1U2VA 3DJCA 3DXKA 4ISGA 2P9NB 5BRHA 4WQ5C 5BN8A 4BC5A 3EN9A 2FLOA 1C0FA 5AQGA 4BC3A 1U6ZA 1YAGA 4CBXA 3BF1A 1RGIA 3UKRA 1YXQA 3ID8A 5AQRA 2BTFA 1NGEA 1GLAG 3H45C 3LM9A 3UKUA 3EL2A 4H0XB 2YJEA 4ISEA 1RFQA 3F9MA 3FR0A 5FPDA 4FOIA 2I7NA 2FF3B 3MN5A 3MMVA 2E2QA 3QFPA 3ULEB 2ASPA 2D4WA 4BRKA 4FWRA 3S41A 1NGAA 2J4RA 4H5TA 2GWKA 5JICA 1YVNA 5LJVA 4I6MB 5AZIB 1QQMA 1E4GT 3DAWA 5AQHA 4CD3A 4IXCA 1OKJA 1TYQA 2QW9A 2E8AA 5AQWA 2V7ZA 4BR2A 5BR9A 4FWKA 1MWMA 1BDGA 1WUAA 4JHDB 4CD1A 4M63C 2P9LA 3RSEB 4IO8A 3VEOA 3DXMB 3HZ6A 3LDOA 5BPNA 1KAXA 5KPZA 3FZFA 1JCEA 2GWJA 3KHYA 3L0QA 3WEEA 3WXLA 2V7YA 3G25A 5BN9A 2P9KB 2A41A 4BRAA 4BR4A 1KXPA 3ZETA 3TPQA 1HLUA 3WQUA 1NGGA 5AQFA 2UYTA 1XUPO 4BC4A 4AM6A 5E26A 1Y64A 3AY9A 4BRMA 2E20A 4CBWA 5AQSA 1ZXOA 4A2AA 2YCHA 3P4IA 2CGKA 1JCGA 1DEJA 3A8YA 4BVOA 5F0XA 5AFUA 5JLFA 3J8AA 2IIRA 3ATUA 3LL3A 1JCFA 3LDPA 3FFKB 1LCUA 3HTVA 3LM2A 3MK6A 4CZLA 3D2FA 3U8XA 4F9OA 5BRDA 5JLHA 4M7XA 4BRDA 4H03B 3A5MC 3H46O 4DB3A 3GDQA 3R9PA 3I33A 2E88A 5AQOA 1GLCG 1NLVA 3VEVA 2E2OA 4WQ4C 1Z6RA 2FSNA 5BRFA 2GUPA 2FSJA 2P9SA 3FZMA 2YHXA 4FOEA 4WQ4A 1HUXA 4FWNA 2W41A 4XH5A 4H5WA 1BG3A 1QQNA 3GOIA 4EHTA 4BC2A 4CZKA 3AAPA 3EO3A 5E84A 3VERA 3C7NB 3FGUA 2QWQA 4RCHA 3VEZA 2VWBA 4PKGA 4YDUC 3M1FA 2I7PA 3D2EA 1SQKA 2GTDA 4H0OA 1U2VB 4B1YB 2FF6A 2QXLA 3FZLA 3O1BA 5AQPA 1QQOA 1ESVA 3BEXA 5AQXA 4PL7A 3SLCA 2Q36A 4GY2B 5B8HA 2P9IB 3CI5A 1HX1A 3IFRA 4BRIA 2QWRA 3UKUB 3H1VX 3W0LA 2P9UA 3JS6A 5EVZA 1C0GA 3FE1A 3ZEUB 4M7YA 1T6DA 4BR5A 2CGJA 1J6ZA 3U4LA 4BRLA 3CQXA 3VGLA 4BVPA 3CJAA 3CERA 4MO4A 5AQTA 3IUCA 3O8MA 2E2NA 5AQUA 4BQZA 1DKGD 2CH5A 5ELZA 1H1VA 1KAYA 4IZ9A 1NMDA 5KPTA 1TYQB 1X9JA 2HOEA 4MLHA 4H5VA 1GLBG 4CZFA 2P9LB 3LDNA 3MN6A 5CE3A 3CJ7A 3VOVA 4K25A 2VYPA 3M3ZA 2EWSA 5ADXA 4IJNA 2HMPA 4LC9B 5JMVA 4BQLA 1NGJA 2HF4A 3WEEB 3WQTA 4DCHA 2KHOA 2ASMA 1IG8A 2A40A 4H0PA 2Q0UA 4WYBA 4BG9A 2QWOA 1K8KB 4PKHA 4EFHA 3ZETB 3VF4A 1TUYA 1MWKA 5KQ8A 1GLJO 4O5FA 2E1YA 2OANA 1WOQA 5AZJB 4EAHD 3VGKA 2ZGYA 4B1VA 2FSKA 4QS8A 1SAZA 2VCPA 1D4XA 3O08A 5AR0A 3WUHA 2YJFA 4BROA 4A2BA 2YHYA 4B1WB 3H3NO 2D1KA 4CZMA 5KPRA 4A61A 2Q2RA 5AQNA 3BUZB 3EZWA 5AFUH 5BREA 2GEMA 4BRPA 2QWNA 1GLFO 3CJ9A 5AZIA 5AQYA 4KBOA 5FPEA 1S3XA 1ZC6A 2NZTA 5TKYA 3GG4A 2NRHA 4FWSA 3QMLA 4FWMA 1NGBA 3FZHA 3KZBA 3RSEA 1ATSA 2ASOA 1GLEG 1Z05A 3O4WA 3DXMA 3UB5A 5AQQA 3QB0A 4QS7A 4CZJA 2W40A 4C23A 3HM8A 2E1ZA 3H6EA 3R8EA 3VENA 2P9PB 2AP1A 2P9KA 3L6QA 5F2RA 4CJ7A 3QICA 4H0VB 2V52B 2DPNA 2CGLA 4MLEA 3O80A 2Q0RA 2NLXA 4B1UB 1KAZA 2BUPA 1BOTO 3D2EB 1SZ2A 1HKBA 3VETA 4CZEA 1NGFA 4A62A 4BGBA 5KQDA 2YHWA 4XH1A 3TU5A 4CI6A 2A3ZA 1YUWA 3VPZA 3GBTA 4BR7A 1ZBSA 3BF3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FL9A 3C6AA 3MN9A 4CJWA 4B3OA 5FRMA 3VQ4A 3L2WA 3PUFA 1G99A 4DFMA 3LP0A 3DOLA 2WUSA 4BRNA 3MN7A 4B3RK 4NCBA 2HMIA 4FJLA 4J2EA 3NH0A 1HYVA 4DF4A 3T69A 3WXKA 3UKRB 1S5JA 1T6CA 5FPNA 3ZX2A 4EHUA 1KD1O 1EX4A 3DWLA 1VQ9N 4ILGB 1J53A 4YOXA 3CF5L 1ASVA 3HI0A 4B9LA 4DQQA 5F1XA 4QS9A 2X78A 5C2DA 1JLGA 2O8DB 2PAVA 3NF7A 1NGHA 4RWTA 2OTLN 3OS0A 4FJ7A 4J2AA 4DTUA 1TK0A 1A5VA 1HYZA 2QWMA 3VEYA 5ADXH 2ZM6K 4FCYA 4DV2K 4IJAA 4CJSA 3J81O 1NK6A 4DQIA 4WQ5A 5LL6Z 5GAHP 4DQPA 1NJIO 1TAQA 3VA0A 1XC3A 2QWPA 2O4IA 1QVGM 1BA0A 4DV4K 4OLBA 3L8BA 3CG7A 4JN4A 5KTQA 4DTMA 3G4SN 3FFIA 3U9ZA 3SNNA 1Y97A 2E2PA 3P83D 4DR4K 3MDQA 1Q82O 4JI5K 4KHSA 1BUPA 3E9LA 3AA2A 3NDKA 5GADP 1C0UA 2ATQA 1NGCA 1L3SA 3AO1A 2F9WA 2FBXA 3BGRA 3WT0A 3VF6A 3ZX3A 3RWUA 2X74A 5JS2A 4CZHA 1P8ZA 2XY8A 3LWMA 3CFRA 4LH5A 3MWPA 3T19A 4I6MA 3J80O 3WNGA 1I94K 4MFBA 1JLCA 2PZSA 3R6MA 4YOVA 4Q0BA 4JLHA 1Q18A 1KLNA 4B9NA 1YF5L 4DLEA 1CZ9A 4DU3A 2HNDA 1EXQA 2C1GA 4DTJA 4GNIA 4CHPA 2PYLA 5AZJA 3AAQA 4OX9K 3NF8A 2HBMA 2BDPA 1WSJA 3K0SA 4FWQA 3VQ8A 1VSFA 2GELA 4NYNA 4BG8A 3KK7A 4NYFA 3SAGA 1QZ6A 2B4JA 2OTJN 4H0YB 5BPLA 1JLFA 3HPGA 4W5QA 4X66K 2ZWHA 1HQUA 2YV0X 4H0TB 5CYQA 2F9TA 2HBJA 4M3TA 3TR8A 1BIZA 3NF6A 1TGOA 2ZF5O 1WBDA 4DSIA 3KLEA 4ELVA 3K57A 1CZAN 4BACA 3H1QA 3O4NA 4E7JA 4HTLA 4LF4K 4EIAA 4JD2B 5C15A 4YDUA 3WXMB 3PX6A 1HKCA 3S5TA 1HNIA 3LDLA 3AGRA 1IJJA 4M3XA 2O8CA 3HBTA 4Q5VA 4FK4A 2P9NB 5BRHA 1BL3A 4DR3K 5BN8A 3VQ6A 3EN9A 3VQ7A 1CXQA 5HRSA 4GV3A 4E89A 4IOCL 1RGIA 2Q3SA 4BECA 3ZSXA 5AQRA 3LAKA 1S72N 4H0XB 3F9MA 1RT3A 2E6LA 4DU1A 3MN5A 1BQMA 4BRKA 3OBWA 1N32K 4JK9A 1HNZK 4CIGA 4E19A 3VQQA 4LSNA 4O44A 5AZIB 4CD3A 3V9WA 3P5JA 3JSMA 3HSTB 3K9KA 5SZTA 1XHZA 5BR9A 2V7ZA 4YFUA 4FWKA 1RDDA 1MWMA 1S6PA 4JHDB 1ZBLA 2UUCK 1VQPN 2P9LA 1VK0A 4EP4A 4IO8A 4DS4A 3HZ6A 2XY6A 5KPZA 4GV6A 3PX4A 3BZKA 2NNWA 2GWJA 4CGGA 4CJPA 1FKPA 4ZHRA 1VSHA 2V7YA 3ID6A 1XHXA 3I0RA 5GIOA 4BRAA 4Y1CA 3CMEN 1KXPA 3TPQA 4FJHA 4E7HA 4BC4A 4AM6A 1QTMA 3VTIA 5E26A 2E20A 4JI7K 4GKKK 3HVRA 3P4IA 5TKWA 1DEJA 1RT5A 4CK1A 1VQON 2IIRA 3QLHA 2VG6A 3LDPA 3Q7CA 3LM2A 4X62K 3D2FA 4L8RB 3HJFA 4FJMA 1VQ8N 4BDYA 3ASMA 3GDQA 3R9PA 1OVQA 3H08A 4CEAA 3SCXA 5DK5A 2UXCK 5C25A 2FSNA 5BRFA 1BHLA 3FZMA 4FOEA 3TANA 1HUXA 1HNXK 2W41A 3QEWA 2G8WA 1BG3A 4KTQA 3GOIA 4EHTA 4M41A 4NLBA 3TSUA 1LAWA 3AAPA 3C7NB 3FGUA 3LP3A 1HRHA 2OCEA 3LP2A 4WFNL 4RW8A 3DLLL 3M1FA 3I56N 1BI4B 2D0BA 4KHNA 3NVKA 1HJRA 4DR2K 3O1BA 1ESVA 1NK0A 1I3AA 1KVCA 3BEXA 4AF1A 1VAZA 4GY2B 5I42A 4IO9L 4JEPA 3IS9A 3CC2N 3IFRA 3ISNC 2RPIA 3UKUB 1E3MA 3MWTA 5EU7A 1VQ7N 5T7BA 3VQ5A 1KVBA 3W0LA 4JI8K 2KZMA 3CFOA 1RT4A 1T6DA 2CGJA 3CQXA 4DTPA 5AQTA 4KTZA 4BQZA 3DMJA 2CH5A 4DSFA 3KKSA 4CJ5A 4CGDA 5HROA 1KCFA 3SQ0A 1A5XA 2RN2A 3ZSOA 3ENBA 1T3VA 4CZFA 2PY5A 2HHIA 1Q86O 2RF2A 1Q7YO 4CEOA 4DSKA 1TKZA 3CJ7A 4YOWA 4K25A 3AVCA 4O55A 1ASWA 2VYPA 3M3ZA 4I9LA 4CECA 4LC9B 3THXA 3M8PA 1NGJA 2O8EA 3WQTA 3WEEB 3LWLA 4FLXA 4BG9A 1B9DA 1X1PA 1NK5A 1RDUA 4PKHA 1RCHA 1TUYA 4YOUA 1MWKA 2KTQA 3AVHA 1GLJO 4O5FA 2E1YA 4FLYA 4BWMA 4Z4GA 3DYAA 4QS8A 5C0YA 3HK2A 5HL7L 2VCPA 5AR0A 3SYZA 1RBRA 1C1AA 4CK3A 1W9HA 4JV5K 1GOBA 2D1KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2ASM A;  1UAX A;  2YHA A;  2RKI A;  1QSL A;  1K8K B;  2O8F A;  2IS3 A;  3VF4 A;  2OPQ A;  1NOZ A;  1WOQ A;  4EAH D;  4X65 K;  5FDL A;  1IH7 A;  2FSK A;  3NGY A;  1SAZ A;  3DLR A;  2JWK A;  3O08 A;  4QAG A;  2YJF A;  3V9X A;  1VQM N;  4F4K A;  4DTO A;  3CCR N;  3BUZ B;  5HLF A;  1YJ9 N;  2GEM A;  4BRP A;  5AQY A;  4KBO A;  5FPE A;  1XMO K;  4NLC A;  2NZT A;  4FJ8 A;  2IOC A;  5TKY A;  1MU2 A;  3AVK A;  4LF9 K;  1NGB A;  3KZB A;  2OZS A;  2ASO A;  3EZ5 A;  1R0A A;  4M3Z A;  4IFY A;  3O4W A;  3UB5 A;  2HVI A;  1G15 A;  3F9K A;  4BE0 A;  4QS7 A;  4CZJ A;  1S1U A;  2W40 A;  1SL0 A;  4JS4 A;  1K6Y A;  5M1P A;  2P9P B;  4CJE A;  1W2B M;  4CJ7 A;  3DRR A;  2V52 B;  4CJF A;  4N76 A;  2BAN A;  3E9P A;  4PA1 A;  2DFF A;  2Q0R A;  3O80 A;  1IKX A;  2NRT A;  4JI0 K;  2BGG A;  1DLO A;  3D2E B;  1SZ2 A;  3WNH A;  2B6A A;  1EO1 A;  4B8A B;  1NGF A;  4A62 A;  5KQD A;  3E66 A;  4N47 A;  2XO7 A;  3TU5 A;  4F8R A;  3BY5 A;  2NRW A;  3GBT A;  1DTT A;  1SUQ A;  1VSD A;  4LH4 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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