1DEJA

Crystal structure of a dictyostelium/tetrahymena chimera actin (mutant 646: q228k/t229a/a230y/a231k/s232e/e360h) in complex with human gelsolin segment 1
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
375
structure length
367
Chain Sequence
DGEDVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMKAYKESSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKHEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the higher Ca(2+)-activation of the regulated actin-activated myosin ATPase observed with Dictyostelium/Tetrahymena actin chimeras.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GELSOLIN
molecule tags Contractile protein
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 367
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1dejA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1dejA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1dejA03
4FPAA 3O1BA 1YAGA 4DQ8A 3L4IA 1KXPA 1BOTO 5AQGA 2Q97A 1HJOA 3QB0A 1ESVA 3QMLA 3I8BA 1TYQA 3O1WA 4H0XB 4Y0WA 1T44A 2E1ZA 1XUPO 2V52B 3QFPA 4EFHA 3BP8A 1GLAG 4BR0A 2AA4A 3FZMA 4RCHA 2P9PA 5F2RA 3ATUA 4JHDA 3LM9A 5ADXH 3VENA 5LY3A 4BRAA 1H1VA 5JLFA 3VF6A 5BN8A 3BF1A 2D0OA 2P9UB 4XH5A 4CI6A 4CZLA 4CZHA 3GG4A 4BG8A 3EZWA 3MDQA 2P9SB 4A2BA 1LCUA 1YXQA 2E2NA 1RFQA 3WQUA 1GLJO 2D4WA 3SMPA 3CQXA 3CERA 5KPTA 3QBXA 5BRFA 4IXCA 1U2VB 1ATSA 3H46O 3O6WA 1X3MA 4JD2A 3ZX2A 1D4XA 1K8KA 1E4FT 3C7NB 1KAZA 2Q31A 2P9LA 3CJCA 1HKCA 4B1YB 4FWSA 4CBWA 1DKGD 3LDQA 2GEMA 1NGGA 4CZMA 5BPLA 2KHOA 3MK6A 5AZIB 2ASMA 4B1UB 3H3NO 2A42A 4O8KA 3GOIA 4B9QA 3GDQA 3U8XA 5ELZA 3U4LA 1TUUA 3EN9A 1BWFO 3ZETA 4FWRA 3VOVA 3GL1A 5AQHA 4BRGA 2DPNA 2Q0UA 2WUSA 2GTDA 4H5WA 2E2QA 1GLDG 3MN9A 2A3ZA 2IIRA 1R59O 3CIPA 5AQKA 5TKYA 4BROA 1BA1A 1SQKA 1QQNA 2A5XA 3WXLA 5B8HA 2HOEA 1QHAA 3OHRA 3ENOA 1BA0A 1ATRA 4PKIA 4BVOA 4FWPA 4M63C 3HBTA 2IVOA 3SK3A 1Y64A 4BRKA 1BU6O 3CJ1A 4LC9B 1C0FA 4BREA 3UKUA 1NGCA 4FWLA 3O08A 3VF2A 3CQYA 2I7NA 3M6GA 3M1FA 4EIAA 3WEEA 3R6MA 4WYBA 5FPNA 4CBXA 4H0OA 1E4GT 2QXLA 3JXUA 4FPBA 2P9NA 3CJAA 1GLEG 3QDKA 2GELA 3VESA 2FLOA 3H6EA 4A61A 4DHYA 3DWLA 2Q2RA 4CZKA 5F0XA 4IWVA 2D1KA 2UYTA 4HWIA 1OKJA 1EQYA 4FWKA 5JICA 4MO5A 3A0IX 1J6ZA 2GWJA 5AFUH 5AR0A 4B1VA 3ZEUB 1BUPA 4XH1A 3LL3A 1CZAN 3R9PA 2E20A 3KVGA 3QBWA 3VETA 3HM8A 1NMDA 5AQQA 4WQ5A 2V7ZA 4FOIA 3KHYA 4JN4A 3D2FB 4H03B 4BC2A 5JLHA 2CGJA 4M7XA 4K42A 3D2EB 3ID8A 3VGMA 2QW9A 1HLUA 1NGDA 3RSEB 3VGKA 4CZFA 1ATNA 4K41A 1MA9B 1TYQB 3ULEA 5KQDA 2CGLA 2YHWA 4JNEA 2HMPA 2FSNA 3BEXA 3C0BA 4H5VA 3LDOA 2FXUA 4BGAA 4BRQA 4EHTA 3ENHA 3S41A 4B1XB 5AQMA 4BRNA 1BG3A 3W3DA 3UE5A 1DEJA 4M7YA 3VEYA 3DJCA 4DB3A 3O4WA 3VEXA 2QWMA 5AQRA 5I9EB 4CJ7A 2F9WA 4K25A 3AY9A 2Q36A 4FWMA 5AQZA 3VEZA 4BRPA 3A8YA 2YJEA 3FZHA 4ISFA 1C0GA 3W0LA 3LDPA 4CZEA 2FF6A 3EKUA 5AQSA 1RDWX 3H3OB 5AQYA 2E88A 2P9UA 3U9ZA 4BGBA 1BDGA 1U6ZA 2Q1NA 2ZGZA 2ZF5O 3AARA 2QM1A 3GE1A 5AQUA 5BREA 5KPZA 3QICA 3HZ6A 4I6MB 5EVZA 2EWSA 2OANA 4FO0A 1QQOA 4YDUC 4GY2B 4A2AA 2CGKA 4QS8A 1U2VA 1LOTB 3ATVA 3O5BA 2YHXA 2I7PA 3L6QA 3WUHA 3DXKB 3C7NA 1ZBSA 2ITMA 3B8AX 2QWLA 2VYPA 1YUWA 5BR9A 4XH4A 3EKSA 1HPMA 2HF4A 4B1WB 1NWKA 2V7YA 4BR7A 2YHYA 3UKRB 5AQFA 5AZIA 2YCHA 1GLLO 1QZ6A 2BTFA 3ZX3A 2F9TA 4BC4A 5CE3A 5FPDA 4IO8A 2E2PA 2W41A 5AQPA 3SJHA 4RTFD 3MN7A 3HTVA 2Q0RA 4QS9A 3DXMB 2QWPA 2IVNA 4K43A 2P9NB 2ZGYA 1KAXA 2P9IB 1ZC6A 3H45C 3VEWA 1TUYA 3L0QA 4IJNA 4MLHA 1S22A 5BRHA 3BUZB 4A62A 1NM1A 5E84A 5AFUA 5EOYA 3CETA 5AZJB 2NRHA 4H0YB 4CD3A 1SZ2A 1GLFO 4ISGA 5AQVA 3AAPA 3WT0A 5AQLA 4BRDA 4ISEA 5AQWA 3CHWA 3R8EA 4BQLA 4BRCA 4FWQA 5AQOA 4IZ9A 1S3XA 2ASPA 1G99A 1DGKN 2QWNA 4RWTA 1HKGA 1ZXOA 5AQJA 2GWKA 3MCPA 2P9KB 3UB5A 3DAWA 3WQTA 3I33A 2GUPA 3D7EO 2IVPA 2J4RA 4CZIA 3FGUA 5EX5A 1X9JA 4KBOA 3ULEB 4BR5A 2QWRA 1JCGA 3FR0A 5FPEA 4PL8A 5ADXA 3QFUA 3ZEUA 4NO7A 4BR2A 4L3QA 2FSKA 1Z05A 3IUCA 4BR9A 5LJVA 1HKBA 2P9PB 3FLCO 4JHDB 1Z6RA 4FL9A 5JMVA 4BVPA 4H5RA 4E1JA 5FPMA 4AM7A 3VGLA 4PL7A 3D2FA 4FOEA 4B1ZA 4FWOA 3A5MC 1SAZA 1NGHA 3D2EA 1T6CA 1NGBA 3AAQA 3RSEA 3EO3A 3FFKB 1YVNA 2HF3A 5KPRA 3GBTA 4IJAA 3O8MA 2BUPA 1GLCG 3FZFA 1WUAA 4O5FA 4WQ4A 4NB4A 4GNIA 3WXJA 3A5OC 4JD2B 5AQXA 3WXKA 1K8KB 3FE1A 3CJ7A 2P9LB 3IMXA 4CBUA 2H3GX 1Q18A 4BG9A 3MN5A 1WOQA 2E8AA 2D0PA 2QWQA 3VF4A 4XEIA 1GLBG 4FWNA 3SLCA 1KAYA 4BRIA 3CJBA 2A41A 3LDNA 3A5NC 4PKHA 2P9SA 3ZX0A 3ZETB 1QZ5A 5BN9A 4EHUA 4MO4A 3FZLA 4H0VB 4Z94A 4BQZA 1NGEA 4CD1A 4FSVA 4H5TA 1HX1A 3HI0A 2ZWHA 4JAXA 4C23A 4MLEA 3KZBA 3H1VX 3VERA 3P4IA 3JS6A 4BRLA 2AP1A 3TU5A 1NLVA 5AQIA 4WQ5C 3VPZA 5BRDA 3F9MA 4I6MA 1NGFA 4QS7A 4DCHA 2PBDA 3UKUB 1JCEA 4H0PA 5BPNA 1P8ZA 3TPQA 3VEVA 2V51B 1T6DA 2ASOA 3MN6A 3WEEB 3J8AA 1RGIA 3DXKA 4BRFA 4CZGA 2E1YA 3VEOA 4H5NA 4BR4A 3CI5A 1NGIA 2A6AA 5EXWA 4EAHD 3IDHA 2PAVA 3EL2A 3M3ZA 4PKGA 3UKRA 3WXIA 1NBWA 2E2OA 4BC3A 3O80A 4BRMA 3G25A 3A5LC 5EY4A 2W40A 1BO5O 1X3NA 3MMVA 3H1QA 3IFRA 1NGJA 3BF3A 3DXMA 2VWBA 4J8FA 1V4SA 2P9IA 2FF3B 2VCPA 1V4TA 1IJJA 3U9DA 4WQ4C 3SMSA 5AQNA 1XC3A 4YDUA 1MWMA 4HTLA 5AZJA 1JCFA 1QQMA 1MDUB 1HUXA 2NLXA 2NZTA 4AM6A 1XQSC 5E26A 3LDLA 1MWKA 2QWOA 5AQTA 2CH5A 3LM2A 4H0TB 3FZKA 4BC5A 2YI1A 2YJFA 3CJ9A 5LJWA 2A40A 1NGAA 2CH6A 4CZJA 1IG8A 4BRHA 5F1XA 3HSCA 2P9KA 4F9OA 2FSJA 5KQ8A 5BPMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YAGA 4DQ8A 1KXPA 3CM6A 1ESVA 3QMLA 4NCBA 4EFHA 4GV3A 3PV8A 4Z4CA 4BR0A 3HPOA 4LSNA 3PIPL 4JI7K 3CG7A 5BR8K 1K8AO 5ADXH 3LP3A 4DTOA 3VF6A 1VQ5N 3ZT1A 1C0UA 4FK0A 3VQCA 1Q9XA 1VSDA 3VQ5A 3KK1A 1N8RO 4XH5A 4BG8A 3EZWA 4DTMA 5GADP 4DR5K 2E2NA 1YXQA 4IOXA 1RFQA 3AA5X 2QKBA 2D4WA 3QO9A 3SMPA 5HRNA 3CM5A 3CQXA 4OX9K 3AO2A 1JXBA 3QBXA 5BRFA 4IXCA 1U2VB 1JL1A 4NLBA 2G8WA 4JD2A 1NK6A 1K8KA 4RW4A 4KTWA 2Q31A 3L2WA 4OPJA 4DR3K 4IO9L 3LDQA 4RW9A 3DLKA 3MK6A 3SV3A 3H3NO 3TABA 4DUZK 5ELZA 3U4LA 4FWRA 2WBNA 5HP1A 2HHTA 2DPNA 2HNYA 2WUSA 1CZ9A 1QVGM 3MN9A 2A3ZA 1SL2A 2F8TA 4K8XA 3NF7A 4BROA 2NRZA 3DRPA 1SQKA 1QQNA 3WXLA 3HPHA 5B8HA 1WSFA 1YF5L 3J81O 3OHRA 4KKOA 4PKIA 4BVOA 4FWPA 4ELTA 1YJNN 2VGMA 3CYMA 3CJ1A 1ITGA 4MQ3A 3OYKA 4LC9B 4BREA 3LWLA 3C95A 2D0AA 3KK3A 2I7NA 3M1FA 4EIAA 3WEEA 4FVUA 5FPNA 4BE0A 5E41A 3SV4A 2HW3A 2P9NA 1GLEG 1RTDA 3VESA 2FLOA 1S1TA 1IKVA 4CIGA 4E89A 4OO1J 3C94A 3H6EA 4CEAA 3PIOL 3DWLA 2GV9A 4KRFA 2UYTA 1OKJA 3QEWA 4MO5A 2Q3SA 1RDUA 2GWJA 3T7ZA 4C8LA 4B1VA 2O8EA 3C6UA 4CEQA 4HUEA 3TI0A 3P38A 1WLJA 3KJVA 1EWRA 2JWKA 4B3RK 3HM8A 2HHSA 2O4IA 4WQ5A 1VQNN 4CEZA 4FOIA 4JRPA 3KHYA 1TAQA 2WC9A 3IKMA 3P1GA 4I9LA 2KFZA 2OTJN 4YNQA 3SYZA 1HYSA 2QW9A 4OKKA 3ULEA 4JKBA 4WF9L 1N36K 2YHWA 2F96A 4JK9A 3BEXA 3C0BA 1XNQK 3OYMA 4DS5A 1N32K 4BRQA 2AJQA 1HPZA 3NGYA 4EHTA 2FC0A 4KHQA 3ENHA 1Q7YO 3MX5A 3W3DA 3OYCA 3VEYA 3DJCA 4Z4EA 4FVMA 3AY9A 3WXMB 4HUGA 1IO2A 2QTDA 3AVMA 4XJXA 4FWMA 3V6DA 2YJEA 3TANA 3FZHA 1WSJA 3EKUA 3P39A 3DLLL 2KQ2A 5HROA 5GAHP 5CYMA 3ZCMA 3NGZA 4O4GA 4DV6K 4ICLA 1VQMN 4I9QA 2Q1NA 2ZF5O 2P5OA 3AARA 4CHOA 3B6PA 5AQUA 4RW7A 3KLHA 5CZ2A 3HOSA 4EP5A 1RT2A 1U2VA 1LOTB 2XY8A 2YX6A 3K9KA 2Z1JA 4BE7B 2ITMA 3B8AX 2QWLA 3V4IA 4CJQA 4XH4A 2WFBA 4B1WB 4BR7A 2KW4A 4ELVA 4K0KK 5AQFA 3TAEA 3QEIA 4E72A 3ZX3A 1TKZA 2UXBK 2W41A 4Y1CA 3SJHA 4DFMA 4OGCA 1DT9A 2HHXA 2QK9A 4RTFD 4QS9A 4FJJA 1X9WA 3TARA 2ZGYA 3M5RA 1KAXA 1RDBA 2P9IB 3PUFA 4KO0A 3H45C 3CCQN 4DLEA 1YHQN 2OA8A 1S9GA 5BRHA 3MCAB 5AFUA 3RTVA 1QSLA 3CETA 4CD3A 4H0YB 5AJ3K 3NMUA 3AAPA 3WT0A 1VQ7N 4BRDA 5AQWA 4E7LA 1N6QA 4PUOA 3AVGA 5FLXO 5AQOA 1X9MA 4NLCA 1S3XA 2ASPA 1VSMA 1YJWN 5C2DA 5J1EA 3EZ5A 1ZXOA 5AQJA 4DV5K 4KH6A 2P9KB 3L3UA 4HHTA 3ZYYX 4KHPK 3O9UA 1KFDA 2J4RA 4CZIA 3FGUA 3LP0A 1VHXA 1JCGA 4OKJA 3FR0A 1TKDA 1YI2N 3Q7BA 5LJVA 4E1NA 2W42A 1HKBA 4BEBA 4B9LA 4B9TA 1VQ6N 4C1NI 1SAZA 1NGHA 4AHRA 4J2EA 4FM1A 1QSYA 4FJ9A 1OVYA 3MEDA 1BCMA 2BUPA 1GLCG 3RR8A 3VQ7A 4WQ4A 2I5JA 3ZSVA 3P5JA 4GNIA 3A5OC 3WXJA 1VK0A 2DY4A 4DG1A 3L2QA 4BG9A 3P31A 2E8AA 2D0PA 5GAGP 4CF8A 3PLAA 4AH9A 3ZX0A 2D5RA 4U7BA 1NJZA 4DFKA 4E7IA 3OYAA 1Q86O 3R1XA 1J5OA 4LF7K 4H5TA 1HX1A 4KV8A 4M42A 3IS9A 3T69A 4C23A 4MLEA 3TU5A 4B9UA 1KTQA 5AQIA 4WQ5C 3VPZA 5BRDA 2G8IA 3F9MA 1EP4A 1NGFA 3HO1A 4W5NA 3UKUB 1EO1A 3RRHA 1P8ZA 4A5AA 3VEVA 1T6DA 4IFEA 2ASOA 3QIOA 3H08A 4FLXA 4FZZA 2B4JA 1HJRA 1BQMA 3E9OA 2E1YA 4I2QA 2WTUA 3MECA 1NGIA 2A6AA 2UXDK 4CEOA 4JI6K 2KTQA 1GOBA 5KGWA 2PAVA 4DTPA 3WXIA 3AVCA 2ETJA 3AVIA 5EY4A 4KH5A 2W40A 3OA9A 3VQ9A 3H1QA 2YNFA 2P9IA 5GAEP 4FJ5A 4M3WA 3RRGA 3NE6A 1TK8A 1HUXA 1WNSA 4AHSA 3ZT4A 3D6RA 4QAGA 1XQSC 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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