1EQYA

Complex between rabbit muscle alpha-actin: human gelsolin domain 1
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
359
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of gelsolin segment 1-actin complex and the mechanism of filament severing.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords GELSOLIN
total genus 114
structure length 359
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1eqyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1eqyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1eqyA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1eqyA04
5BPLA 3GBTA 3JS6A 5AQIA 1BOTO 2I7NA 3C7NB 4WQ4A 4RCHA 3U9DA 3FZKA 4BRHA 3FZHA 5BR9A 1NBWA 3CI5A 4BR5A 4FWSA 4BC4A 5KQDA 3TPQA 2PBDA 1GLBG 4EIAA 1WUAA 3A5LC 2GUPA 1DEJA 4RTFD 3LDLA 4WQ5A 3MN7A 4XH1A 3CETA 1MA9B 2BTFA 4CZKA 2P9NB 1KXPA 1QHAA 3BF1A 2YHYA 5EXWA 3R8EA 2PAVA 3FZLA 3ID8A 4BR9A 3ATUA 4J8FA 1S3XA 1U2VB 2IVNA 4EFHA 1KAYA 2P9LA 2UYTA 3IMXA 5AQNA 4H0PA 5F2RA 5AQZA 4H5TA 1T6CA 3D2FB 1R59O 3CJ9A 1LCUA 2GTDA 4H0XB 3LDQA 4B1WB 4BRGA 2E2NA 4PKHA 5AQYA 2Q0RA 5AQMA 5AQPA 1BA1A 3CJCA 3O80A 4O8KA 2A42A 4IZ9A 2ZWHA 4B1XB 1K8KB 3SK3A 4I6MB 2D4WA 4BVPA 5F0XA 5AZJA 5BPMA 2GWJA 1JCFA 4PKIA 2NLXA 3UKUA 3VEYA 2P9UB 3WXIA 3VGKA 1LOTB 3M1FA 3MK6A 3QFUA 4MLEA 3ZX0A 3HM8A 3MN9A 3MMVA 3VF4A 4H5VA 2A41A 4FWNA 4HWIA 3ENHA 4B1UB 3O4WA 4BQLA 2YI1A 3WXLA 4PL7A 4BRPA 3JXUA 2QW9A 3UKRB 2J4RA 4DB3A 4E1JA 3MCPA 2ZF5O 3R9PA 3QICA 3D2EA 4C23A 3CERA 3H1VX 2HF4A 4ISFA 4YDUC 1ESVA 3SJHA 3LDNA 1V4SA 3BUZB 2E1ZA 1NM1A 3ZEUA 3O1BA 5AQGA 5AQJA 2A6AA 1MWMA 1IG8A 1CZAN 4BRLA 3F9MA 2W41A 1BA0A 3ZETB 2D0OA 5LJWA 5AQRA 4ISEA 4JHDA 3VEZA 3ZX2A 2CGKA 5AQLA 1HUXA 3FZFA 3MDQA 2D0PA 2P9IB 3QMLA 5ADXH 3FZMA 2YHXA 3UB5A 1C0GA 1Z05A 4CBXA 3FE1A 4H03B 3R6MA 4HTLA 4CZEA 3A8YA 3U8XA 1MWKA 1E4FT 3AY9A 1ZBSA 1QQNA 3VEXA 3IFRA 2IIRA 2YCHA 4BRFA 3GDQA 3CJ1A 5E84A 4M63C 3DXMA 2E2QA 3EO3A 3LDPA 3LM2A 1RDWX 3QDKA 3I33A 4ISGA 4PL8A 5ELZA 1NLVA 3VETA 1TYQB 3CIPA 1C0FA 4H5RA 3HBTA 4FOIA 4BRIA 4FO0A 3H3OB 3H45C 5AR0A 1SQKA 2HF3A 2Q0UA 4JD2A 1GLEG 4XEIA 1BUPA 4BR0A 3ULEB 5AZIB 1P8ZA 2W40A 3BP8A 3VERA 2QWPA 2ASPA 3MN6A 4H0TB 2P9SB 3WEEB 2KHOA 4IWVA 2NRHA 4O5FA 2Q97A 3C7NA 4CZFA 5AQUA 2IVPA 3EL2A 2BUPA 2QWMA 3CQXA 1T6DA 2YJEA 1NGAA 3CJAA 1HPMA 1BG3A 4BR7A 3O1WA 1YXQA 4BG9A 2VCPA 1NGGA 2F9TA 1KAXA 1HX1A 1NGCA 3GL1A 2WUSA 1GLAG 5E26A 2P9NA 3VF2A 1ATSA 3B8AX 2E1YA 3H1QA 4FWQA 4JN4A 3VGMA 4CD1A 2GELA 3S41A 2A40A 5AQTA 3VEOA 1NGEA 5AQWA 3A5NC 2AA4A 3ENOA 1U2VA 4QS8A 5EY4A 3BEXA 4QS7A 2VYPA 3M3ZA 3MN5A 4FWKA 4BGAA 4EHTA 1HJOA 2FF6A 4EAHD 1GLJO 2V52B 5AFUH 3D2FA 3O08A 3EN9A 3QB0A 2V51B 1D4XA 3O6WA 4H5NA 4F9OA 2QWOA 5F1XA 4BGBA 4FWLA 5EOYA 1NMDA 1RFQA 1K8KA 3O5BA 4I6MA 1BWFO 3VF6A 1TUYA 4B1ZA 3CJBA 2P9UA 1NGDA 3VENA 1QQOA 2D1KA 5I9EB 3RSEB 3SMPA 3W3DA 4CZGA 4L3QA 3SMSA 4DQ8A 3QFPA 4H0YB 4PKGA 1J6ZA 2P9PB 1Z6RA 2E20A 4M7XA 1X3MA 4MO4A 3TU5A 3DXKB 2A5XA 4H5WA 2FSKA 3UKRA 4K42A 4FL9A 4KBOA 4JAXA 5JLFA 5LY3A 1S22A 2ITMA 1TUUA 4GY2B 1ZXOA 5KPRA 4NO7A 3G25A 4BC2A 4FPAA 1YVNA 4CZLA 1YAGA 2HOEA 5AQQA 3WXKA 3J8AA 1HLUA 3AARA 5FPMA 5FPDA 1ZC6A 3SLCA 5AQKA 2E2OA 3HZ6A 4FPBA 5ADXA 1OKJA 3VPZA 5FPEA 1GLCG 2E88A 5JICA 3ZETA 3M6GA 3LL3A 5AQHA 2P9KB 2FLOA 1GLFO 1X9JA 3FLCO 3HSCA 1QZ6A 2H3GX 2P9IA 2V7ZA 3VESA 4B1YB 4A2BA 3FFKB 5TKYA 1NGFA 4FWMA 1GLDG 3CHWA 4CI6A 3GE1A 2Q2RA 4CBUA 4FSVA 5BRHA 4EHUA 1H1VA 2GWKA 3WT0A 4A61A 1Q18A 4FOEA 1ATNA 4Y0WA 2Q31A 2QWNA 3P4IA 5B8HA 5KQ8A 3IDHA 1TYQA 3ATVA 3VEWA 2P9LB 3L4IA 4AM7A 4BRMA 2ZGZA 4BRCA 4BQZA 4BROA 1KAZA 3AAQA 3VGLA 1NGBA 4BVOA 4XH4A 2CGLA 3ULEA 2OANA 5AZIA 4NB4A 4IJNA 5BRDA 2V7YA 4XH5A 4CZIA 4H0OA 1XC3A 2Q1NA 4RWTA 1IJJA 2P9SA 3KZBA 2EWSA 3WEEA 5JLHA 1NGJA 4WQ4C 3EKUA 1BDGA 4BRKA 4K41A 2IVOA 4FWOA 2Q36A 3L6QA 4K43A 4CD3A 5AQVA 5AZJB 5AQOA 3UKUB 4QS9A 4BREA 3U4LA 4AM6A 4MLHA 3WXJA 4M7YA 4WQ5C 3VOVA 3U9ZA 5AFUA 3W0LA 4DCHA 4YDUA 1EQYA 2FSNA 3DWLA 3QBWA 5BPNA 3BF3A 3QBXA 2AP1A 2QXLA 3LM9A 2VWBA 2CGJA 4FWRA 5FPNA 1SZ2A 4GNIA 5JMVA 2ZGYA 1MDUB 1NGHA 4H0VB 2NZTA 3WQUA 2F9WA 3OHRA 2E2PA 4CZMA 4BRNA 2QM1A 1NGIA 3D2EB 4K25A 4A62A 2YHWA 4CZHA 3IUCA 4LC9B 4CBWA 4BRQA 4WYBA 1XUPO 3DAWA 2HMPA 4DHYA 3EZWA 3I8BA 2CH5A 1U6ZA 2QWRA 1G99A 2ASOA 4BRDA 5KPTA 1QQMA 4A2AA 3ZEUB 2FXUA 2FSJA 3FR0A 1DGKN 2A3ZA 3H6EA 2I7PA 3WQTA 1GLLO 3HTVA 3LDOA 1SAZA 4BC3A 3A0IX 4JNEA 3O8MA 1T44A 3KHYA 5BRFA 4JHDB 4BR2A 3AAPA 5LJVA 2E8AA 3RSEA 3A5OC 3L0QA 4BRAA 5BREA 1E4GT 4BR4A 5EX5A 5AQFA 2ASMA 1WOQA 3CJ7A 1BO5O 2P9PA 5BN9A 1RGIA 1V4TA 3WUHA 5CE3A 1JCEA 5EVZA 1XQSC 3C0BA 3KVGA 3DJCA 1HKCA 4BG8A 3DXKA 4B1VA 4IO8A 1BU6O 3ZX3A 1HKGA 1X3NA 1DKGD 5AQXA 2QWQA 1Y64A 4B9QA 3A5MC 1HKBA 5KPZA 4MO5A 2CH6A 3DXMB 5BN8A 2YJFA 3GOIA 3HI0A 4CJ7A 3H3NO 1QZ5A 4FWPA 3EKSA 4CZJA 2GEMA 3UE5A 2FF3B 4Z94A 5AQSA 3D7EO 4IXCA 3CQYA 3FGUA 1YUWA 3VEVA 4JD2B 2QWLA 4BC5A 1JCGA 4IJAA 3H46O 2DPNA 1ATRA 3GG4A 1NWKA 2P9KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3E1YA 3GBTA 1RT1A 4WFNL 3RR8A 3C6HA 3ZT2A 1NBWA 4FWSA 3VQCA 1XMQK 4CJSA 1N5YA 1WUAA 4I2PA 4JS5A 1DEJA 4GV9A 3MN7A 1WBDA 4K0KK 2AJQA 2P9NB 5J2QA 4E7HA 3TTFA 5FRMA 2QK9A 3OJSA 4CIFA 2PYJA 4F2SA 1OH5A 2HHWA 4EFHA 3K5LA 1QE1A 4LFCK 1KCFA 2UYTA 3RWUA 1Q8IA 2HNDA 2GTDA 4CERA 4HUEA 3V9XA 4BRGA 4FCYA 4HUFA 1IV0A 4PKHA 5AQMA 5GIOA 4FW1A 3SUQA 3THXA 3KK3A 3V1OA 2IS3A 3TR8A 3ZSXA 3SQ1A 1RDUA 3ITHA 4CGJA 5LL6Z 5HP1A 1NG9A 2GWJA 1GOAA 1T8EA 3UKUA 2NLXA 3PIPL 4RW9A 3VGKA 2ETJA 3VQEA 3NF8A 3D6RA 1LOTB 3M1FA 3MK6A 2HB5A 4JK7A 4O0IA 4CFCA 3SQ4A 2YKNA 3MMVA 4ID5A 3ZT4A 1L3SA 4H5VA 2A41A 3ENHA 1TK0A 3CCLN 3K59A 4BQLA 2YI1A 4PL7A 3AA4A 3AA3A 4BRPA 2QW9A 1NJYA 3O4NA 2HSTA 5DM7L 3DM2A 3SQ0A 4CJQA 3MXMA 3MCPA 2ZF5O 2KZMA 2QEXN 2PZSA 4CJLA 3CERA 1WSGA 2W00A 3K0SA 4ISFA 3E66A 1ESVA 3C6AA 3BUZB 2E1ZA 2PY5A 3OYCA 3ZEUA 5AQJA 4BRLA 1ZBHA 4ILGB 4OKJA 2D0OA 5LJWA 1KSPA 5LMUK 3CFRA 4ISEA 4I9LA 1TKDA 3ZX2A 1VHXA 3KK7A 5CZ1A 3QMLA 5ADXH 3S9HA 2G8IA 5GAEP 1Z05A 1S1VA 5D3GA 3FE1A 5M1NA 3R6MA 1KLNA 4HTLA 4FZYA 1YTUA 1JLGA 2NRRA 2E6LA 3U8XA 5GAHP 4KRFA 3G71N 1SL1A 4JKBA 1REVA 3E9OA 3GDQA 5K14A 4FJLA 2YKMA 5JS2A 4WFBL 3OY9A 3AVKA 3I33A 2GBZA 3VETA 2WOMA 1TYQB 1C0FA 4YHHK 4FOIA 4W5OA 3T69A 4M3TA 2Q0UA 1GLEG 3ULEB 5AZIB 1EO1A 4F8RA 1RDAA 1UAXA 1F21A 3M8QA 3V1QA 3MAQA 1ASUA 2Q97A 4A57A 1HNIA 1SV5A 4AH9A 3I55N 2IVPA 2BUPA 2WFBA 3RRHA 4KH6A 1IH7A 2A1SA 1GOBA 1NGAA 4KI6A 4KO0A 1BG3A 5JENA 1YXQA 2KW4A 4PY5A 2WONA 1NGCA 4EP4A 3GL1A 3Q7BA 2WUSA 3QEIA 1GLAG 5E26A 2P9NA 3VF2A 1HQEA 3VGMA 2E1YA 2IDOA 4JN4A 4RW7A 3SV4A 4CD1A 1IO2A 3S41A 1ASWA 5AQTA 3VEOA 1NGEA 5AQWA 3ENOA 1TL1A 1KVAA 5EY4A 4JI0K 4QS7A 2YHBA 3O3GA 4FWKA 2V52B 1S6QA 5AFUH 3O08A 3TSQA 4F9OA 2QWOA 5F1XA 4N5SA 3SYZA 1XHXA 4DUYK 4JKDA 1CXQA 1T7PA 2O8BB 3QEPA 2QXFA 5T7BA 4FJJA 1NGDA 1EP4A 4BDPA 4F3TA 4Y1DA 1QQOA 2D1KA 4CJEA 3TAGA 2HVHA 3DOKA 3SMPA 3W3DA 4CZGA 4L3QA 3SMSA 2B6AA 3QFPA 1TK8A 3QLHA 1FJGK 3L2QA 2E20A 4M7XA 1X3MA 3TU5A 3UIQA 2YX6A 3DXKB 4LFBK 4ILJA 4H5WA 4NXMK 3F73A 2FSKA 4KPYA 5CZ2A 2X6NA 4JAXA 3D45A 3J81O 1BQNA 4M3WA 4GKJK 1QQCA 4GY2B 3T19A 4NO7A 3NVMA 4DU1A 5M1OA 3C65A 3O4QA 1Q82O 4B3RK 3NBPA 3CPEA 4CZLA 1VQPN 3WXKA 5FPDA 1I3AA 3SLCA 3V4IA 4FJ7A 1S1WA 2OPRA 2E2OA 4FPBA 4FLTA 1L3TA 1RBVA 3CCQN 1HNVA 5FPEA 2ATQA 2E88A 1S1XA 4DTXA 1CZBA 2DFHA 3P31A 1YHQN 5C10A 2D5RA 4JI4K 2P9KB 1EX4A 2Z1GA 1J9AA 1X9JA 1OVQA 2HBKA 3VESA 4J2EA 3NF6A 4FWMA 3CCRN 3HJFA 1JLCA 2BE2A 2HHQA 4JLHA 1JKHA 1H1VA 2GWKA 1J5OA 4NXNK 1Q18A 3IRXA 3HSTB 3VQQA 3AVLA 2O8FB 4E0DA 1Y97A 3E9PA 3OYDA 3CCJN 2QWNA 3HPGA 4DFKA 5FRNA 4DR5K 1TYQA 3WNFA 2YV0X 1IKYA 2P9LB 3CFPA 4CCHA 2ZGZA 1T05A 1KAZA 4FLZA 1WSJA 4CK2A 3CC4N 2CGLA 2RN2A 2E4LA 3ULEA 5AZIA 4R5PA 5BRDA 3OS1A 3MECA 4H0OA 4DR3K 1VSLA 4RWTA 3KZBA 2EWSA 1NGJA 1BISA 1BDGA 4BRKA 3VTIA 2ZJPL 2KFNA 2Q36A 4A5AA 3L2RA 5FLXO 4Z4CA 5AQOA 4E1NA 4QS9A 3VQ4A 4FVMA 3MEDA 4M7YA 4FM2A 4DQQA 1XHZA 2HHHK 5HRPA 5HROA 4JI1K 3DWLA 1TK5A 4KV8A 2CGJA 5FPNA 5JMVA 2ZGYA 2W6KA 3QESA 1JLBA 2F9WA 3C6UA 4OPJA 3NFAA 4CFDA 3MCAB 3LDSA 1NGIA 3D2EB 2UXDK 3EYZA 2Y1JA 3D0PA 4LC9B 4CBWA 1JJ2M 3SNNA 3DAWA 3CFOA 4DHYA 4LF5K 2ITGA 4DS5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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