1EQYA

Complex between rabbit muscle alpha-actin: human gelsolin domain 1
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
359
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
source organism Homo sapiens
publication title Structure of gelsolin segment 1-actin complex and the mechanism of filament severing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GELSOLIN
total genus 114
structure length 359
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1eqyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1eqyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1eqyA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1eqyA04
3GE1A 5AQVA 1MDUB 5AQTA 4K41A 4IZ9A 5AQWA 5BRHA 2IIRA 4BRQA 1SZ2A 2V52B 4H0VB 4BRKA 5AQSA 4JAXA 4BC2A 4YDUC 4BR5A 4GNIA 4HWIA 3MN7A 5AZJB 1NGBA 1TYQB 4RWTA 3M6GA 2YCHA 2F9TA 2CGJA 2YI1A 5AZIB 3H6EA 3FZFA 4FOIA 4FPAA 4GY2B 4BR4A 3LDNA 4IJAA 3D7EO 3LDQA 1NLVA 3C7NB 5AR0A 2HMPA 1ATRA 3GOIA 4EAHD 3VEZA 1C0FA 4CZIA 3EO3A 2Q1NA 1E4FT 1NGCA 4FO0A 4H5VA 1Z05A 3JXUA 3ATVA 3ZEUB 4BQZA 1NM1A 4IO8A 1EQYA 1SAZA 2Q0UA 3KZBA 3FZLA 1T6CA 4BRGA 1T44A 1D4XA 5CE3A 3HZ6A 1K8KB 4BG9A 3WQUA 1KAZA 3FFKB 2IVPA 3RSEA 3SK3A 3QDKA 1T6DA 2P9SA 3G25A 5KPZA 3L6QA 4BR9A 2GEMA 2FSJA 3MMVA 4E1JA 3ID8A 1HJOA 1BA0A 1HKBA 4PKGA 3WT0A 4B1XB 1V4TA 1XQSC 3DXKA 3CJ1A 4H0OA 5E84A 4B1ZA 2Q31A 3HSCA 3ATUA 3CHWA 3CETA 4BVOA 3FLCO 4WQ5A 4FWLA 3O5BA 3UKUB 5BREA 2PAVA 3U8XA 2VYPA 1NGIA 1GLLO 1QZ6A 1DEJA 2ASMA 4ISFA 1Y64A 4BRFA 3B8AX 3BF3A 1Q18A 4B1VA 5AQYA 1NGDA 2DPNA 2GUPA 1YAGA 1HLUA 3VENA 2WUSA 1CZAN 2QWQA 5LY3A 4XH4A 3LDOA 1RFQA 2YHWA 2VCPA 4I6MB 4FWMA 3VEXA 5BN8A 2QWPA 4BRMA 1HUXA 3MN6A 3QFUA 2E20A 1KAYA 5AQXA 1S3XA 2P9KB 3QB0A 5BRDA 3CJAA 1U2VA 1BWFO 3H3NO 4FWNA 4H0XB 1ESVA 1GLAG 2E2QA 2P9UA 4YDUA 4Y0WA 4BVPA 1QZ5A 4KBOA 5EXWA 2QWRA 1SQKA 5JICA 3UB5A 3U4LA 4H0TB 1C0GA 2CH6A 3O8MA 3SMSA 2A6AA 1JCFA 2A40A 5AQQA 3VESA 1U2VB 4XH1A 2W41A 3QBWA 5BPNA 1XC3A 4BC3A 5EVZA 4BRLA 2KHOA 2HF4A 4A62A 5BPMA 3VEOA 1BA1A 1R59O 2E1ZA 2FLOA 3FGUA 5AZJA 1TYQA 5I9EB 2E1YA 5AQUA 2V7ZA 2P9IB 4H03B 3U9ZA 4BRNA 5AZIA 1YXQA 1NGFA 3C7NA 4PL7A 5KQ8A 1BDGA 3VETA 1GLFO 2VWBA 1J6ZA 5FPMA 1S22A 1QQNA 3H45C 4O8KA 2YHYA 3CQXA 3IFRA 3VF4A 2F9WA 3ZEUA 4A2BA 4PL8A 5F1XA 4JHDB 3A5NC 3H1QA 3W3DA 3H3OB 5ELZA 4A2AA 1K8KA 4JD2B 4BREA 4BC4A 1G99A 4BR0A 3LL3A 3S41A 4BRPA 4FOEA 4H5NA 4NO7A 3ZX0A 3A5MC 3GL1A 3O1WA 4CZKA 4F9OA 1JCEA 2ITMA 3D2EA 5B8HA 2J4RA 3OHRA 4WYBA 3W0LA 3J8AA 3O4WA 4IJNA 5EY4A 4BG8A 2QW9A 1JCGA 2QWOA 4CD3A 1IG8A 4B1UB 1P8ZA 1MWKA 3GBTA 4CZEA 1NMDA 3SLCA 1XUPO 3WUHA 2Q97A 1HX1A 4H0PA 4BRHA 4BRDA 3DXMB 1BG3A 3D2EB 2H3GX 3UKUA 2D0OA 3EKUA 3QFPA 3IUCA 3A0IX 3FZMA 4EIAA 4WQ4C 5JMVA 3MN5A 4ISEA 3MCPA 3VEVA 2ASOA 3FZHA 4MLHA 4BC5A 2P9NB 1NWKA 4I6MA 3HTVA 3AY9A 4QS8A 3R9PA 3GDQA 2UYTA 1DGKN 4QS7A 5TKYA 2FSKA 1IJJA 2P9KA 4RCHA 3P4IA 2P9LB 3EKSA 4FWKA 3VOVA 4CI6A 1E4GT 5ADXH 5E26A 1BOTO 1GLCG 2CH5A 2EWSA 3EN9A 4BR7A 2P9PB 3LM9A 2V51B 5F2RA 3UKRA 1NGGA 5ADXA 3H1VX 3VEWA 3ULEA 1BO5O 4FL9A 1ZC6A 2GWJA 1X3NA 4H0YB 2D4WA 3ZX2A 5AFUH 4A61A 4XEIA 2E8AA 3BUZB 2NLXA 2Q2RA 2ASPA 2V7YA 4NB4A 1NGJA 5AQJA 2P9IA 3TPQA 3UKRB 4BR2A 2A5XA 2QXLA 5AQZA 3WXLA 3I33A 3ULEB 1HPMA 5LJVA 2QWLA 4FWQA 4B9QA 3HBTA 1HKCA 1YUWA 3A5LC 3VGKA 3LDPA 5AQNA 2CGKA 3IMXA 4WQ5C 3QICA 2GWKA 3WXIA 2A41A 4J8FA 3FZKA 2E2PA 1YVNA 2PBDA 3HI0A 3BF1A 4JHDA 2Q36A 4C23A 5AQPA 4JN4A 2NZTA 3CERA 4L3QA 4MLEA 3VGLA 4FWSA 3VGMA 3VF6A 4ISGA 5AQIA 5AQRA 3DWLA 4B1WB 1RGIA 4JD2A 4IWVA 3QMLA 3L0QA 2A3ZA 3R6MA 2QWMA 1OKJA 4K42A 3CIPA 3LDLA 3D2FB 2AP1A 1QQOA 4DCHA 4CJ7A 2IVOA 4M63C 3WEEA 5FPDA 1HKGA 5AQMA 2FF3B 3DJCA 4DQ8A 3CI5A 4WQ4A 2A42A 4H5TA 5JLFA 1ATSA 3ENOA 3I8BA 4LC9B 2FSNA 3WXJA 4BQLA 2FF6A 3JS6A 3LM2A 3L4IA 5EX5A 5BN9A 3WEEB 3FE1A 3DXMA 4M7YA 5AQFA 3AARA 5EOYA 4BGAA 3A8YA 3MN9A 3WQTA 4BRCA 4CZMA 2CGLA 3SMPA 3VEYA 1TUYA 2GTDA 2IVNA 3WXKA 3VPZA 2ZGYA 4CZFA 2E2OA 5FPNA 3F9MA 1X3MA 4H5RA 2AA4A 2P9NA 3C0BA 4CZLA 5BRFA 1NGAA 4QS9A 3GG4A 3ENHA 4B1YB 4Z94A 3FR0A 2D1KA 4CZJA 2NRHA 2D0PA 1ZBSA 3KVGA 4EHTA 1RDWX 1GLBG 4RTFD 3ZX3A 1BU6O 3MDQA 3CJBA 3O1BA 4CBWA 2OANA 3A5OC 5FPEA 4FWPA 2P9LA 2YJFA 3ZETA 1BUPA 1ZXOA 2I7NA 4FSVA 4H5WA 5AQGA 3EZWA 5AQHA 2QM1A 5KQDA 2P9PA 5AQOA 2BUPA 4HTLA 4DHYA 2BTFA 4MO4A 2GELA 1KAXA 3AAPA 3RSEB 4BGBA 3ZETB 4AM6A 1V4SA 2P9SB 4BRIA 1GLEG 4FWOA 4O5FA 5BR9A 4BRAA 4BROA 4MO5A 3MK6A 1TUUA 1U6ZA 3IDHA 3VF2A 1DKGD 3U9DA 1GLJO 1QQMA 3DXKB 3EL2A 3R8EA 1LCUA 1NGHA 4IXCA 4XH5A 1WUAA 1QHAA 5JLHA 1Z6RA 4FWRA 3DAWA 2QWNA 3HM8A 4DB3A 2YHXA 3H46O 3O08A 4K25A 4EHUA 4M7XA 1GLDG 3BEXA 2HOEA 4PKHA 4CD1A 5AFUA 3TU5A 4CBUA 2ZF5O 5LJWA 3QBXA 3CJ7A 3UE5A 2W40A 2Q0RA 3CQYA 1H1VA 3AAQA 2I7PA 1LOTB 2ZGZA 2FXUA 3SJHA 3D2FA 1X9JA 2E2NA 5KPTA 5AQKA 3CJ9A 1NGEA 2YJEA 5AQLA 2HF3A 3M3ZA 1NBWA 1ATNA 3O6WA 1WOQA 4AM7A 3VERA 4JNEA 5KPRA 2E88A 3O80A 3KHYA 3BP8A 2ZWHA 5F0XA 3M1FA 4CZGA 4EFHA 1MA9B 4FPBA 2P9UB 4CZHA 1MWMA 4CBXA 4K43A 1KXPA 3CJCA 5BPLA 4PKIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AQVA 5MLCQ 3DLBA 1VSFA 2IIRA 4JLHA 4E0DA 2V52B 3VN5A 1HNWK 4OGCA 1HNXK 4M3WA 4BC2A 4YDUC 5J2MA 3E66A 2HHIA 4HWIA 3MN7A 5AZJB 1WNSA 4O4GA 4FK2A 1VSMA 3NVKA 3NF7A 5AZIB 4LF6K 3FZFA 4FPAA 4RW7A 1M1KO 4QCLA 3ZSYA 1BHLA 5AR0A 1WSEA 3D6RA 4DR4K 3VEZA 1C0FA 4IOXA 1N6QA 1NGCA 4CHYA 3JXUA 1KVBA 3ATVA 4BQZA 3HOTA 3M5RA 3SBTA 1T6CA 4BRGA 1KLNA 1NOZA 2X6NA 3HZ6A 3AVLA 3THYA 4U67L 5C0YA 3FFKB 4M3RA 1KFDA 3RSEA 4N56A 4W5RA 1T6DA 1S1VA 3G25A 3BZKA 4BR9A 3CF5L 3ID8A 4IOCL 1V4TA 1XQSC 4CEFA 1NK0A 4FJGA 3CJ1A 1S1XA 4B8AB 2FBXA 4B1ZA 1J53A 2VWKA 3AGRA 4Q5VA 3HSCA 1ZBHA 1K8AO 3PIPL 3CETA 3BZCA 4WQ5A 3OBWA 3NFAA 4PA1A 1FW6A 1DT9A 2PAVA 1C1CA 4K0KK 2ASMA 4BRFA 3ZSQA 3VA0A 4F3TA 4JI1K 4CVNE 3MXMA 1IBLK 1VSLA 4HVJA 2WUSA 2G8KA 1OH7A 2QWQA 2YHWA 2F4VK 3OS0A 1HUXA 1WN7A 2HBKA 3QFUA 2XO7A 4Z4EA 1Q7YO 2JWKA 1S3XA 3SQ1A 1SV5A 1GOBA 1U2VA 3CJAA 1BWFO 4H0XB 3CCEN 1GLAG 2UUCK 2W6LA 2P9UA 4BVPA 3TSQA 3EE9A 5EXWA 2QWRA 4QOZB 1QSYA 4EZ9A 3NAEA 1CXQA 4NCAA 5GAHP 5AQQA 3CCJN 3QBWA 4FJ8A 4BC3A 3O9RA 5EVZA 4E72A 1NK5A 4H4OA 2HF4A 3I55N 1RBSA 1BA1A 5HRPA 2E1ZA 3FGUA 1TYQA 3K5MA 3THWB 2P9IB 4BRNA 5AJ3K 3VQ9A 3AA2A 5JVGL 3K59A 3VETA 2VWBA 4O8KA 3CQXA 1S6QA 2VG7A 4WFBL 3CCUN 1L5UA 1IBKK 4CIGA 1EETA 1O13A 3PO5A 5CZ2A 3ZEUA 4AHUA 3K9KA 1N33K 3H1QA 3WNEA 2NNWA 3SPZA 1QQCA 1IH7A 4Y1DA 2HMIA 4A2AA 3SJJA 4YOVA 4KTQA 3QEPA 4OLBA 4LF5K 1P90A 4BRPA 3SQ2A 3EZ5A 4NO7A 3NBPA 3O9UA 1IKWA 4DV7K 1T7PA 5B8HA 3OHRA 3W0LA 3AVHA 3HP6A 1TKZA 5EY4A 1LV5A 2QW9A 4B1UB 3SI6A 5E41A 1MWKA 3WNFA 3TWHA 3VQ8A 1XUPO 2D5RA 4FYDA 1T05A 3D2EB 3J7AP 4I2QA 2D0OA 2W6KA 2HBLA 3A0IX 3E9PA 4EIAA 3NHGA 4F4KA 2C1GA 3LP1A 3O4QA 4KH4A 4ISEA 3VEVA 3CCRN 3ZCMA 3QNNA 1C0MA 3FZHA 3I0SA 4M3XA 4J2EA 4BY9C 4FW2A 5M1QA 4AHVA 4DTXA 3CCLN 4I6MA 3V1QA 4JKBA 3IG1A 1FK9A 3P38A 3DRPA 3ZSWA 3VQ7A 3CG7A 3ZT1A 3TABA 1IJJA 1RDDA 1UA0A 3P4IA 1VQNN 4M41A 3SBGA 4E7KA 3ZSVA 1LAVA 4HUFA 3OYBA 4DTSA 5H1SQ 5ADXH 3KJVA 4R79A 1K73O 4F8RA 2CH5A 2EWSA 2D0CA 3J7ZO 1NGGA 3ZT4A 4QAGA 2HHWA 3VEWA 1BO5O 5J2NA 1X3NA 1C1BA 3TSPA 4NXNK 4IG3A 2V7YA 4BE0A 5AQJA 2A5XA 1IV0A 4CFCA 2PZSA 4B9QA 3NH0A 1HKCA 1YUWA 3LDPA 2UUBK 4LFCK 1S72N 2GWKA 3WXIA 4DTNA 1JLEA 1C0TA 4J8FA 4IOAL 2JWLA 4GMJB 2NZTA 1Q8IA 3T3FA 5C2DA 4KHPK 1RGIA 2E4LA 1N8RO 3HPHA 4IWVA 3AO2A 3QMLA 2A3ZA 1NJXA 4K42A 1REVA 4JKEA 4LH4A 4A5BA 4CFAA 2OCEA 3T7ZA 4DCHA 2IVOA 4LFAK 1RDCA 1VQ7N 1TK5A 4M42A 1GOCA 3RRHA 2ZJPL 2A42A 4CJTA 1J54A 3VQBA 3DLEA 3I8BA 4LC9B 4ILHA 4IO9L 2FF6A 3JS6A 3LM2A 3L4IA 5EX5A 1VQ4N 1SS6A 3R1XA 4M7YA 1TKDA 5EOYA 4CF9A 4BGAA 3A8YA 4WE1A 4BRCA 3HT3A 2YNHA 5KGXA 1NKBA 2IVNA 3O4NA 3WXKA 3VPZA 2OPPA 2ZGYA 3AA3A 1JKHA 4H5RA 4GV9A 1XC9A 3TANA 1IKVA 2B6AA 3K57A 2BGGA 4CZLA 3SNNA 3AVKA 4QS9A 5HROA 4B1YB 3PO4A 2D1KA 2KQ2A 4IFEA 2NRHA 2D0PA 2ITGA 1ZBSA 5HP1A 2YNFA 3CM5A 1T03A 2Z1HA 3CJBA 2O4GA 1J5EK 5FPEA 2KTQA 1ZXOA 4FM0A 4CJVA 4RG8A 3KWGA 4JKDA 1RILA 4MFBA 3WXMB 3EZWA 5AQHA 4CF8A 4RW4A 5KQDA 1U48A 2P9PA 4FCYA 2OPQA 3L2QA 2HBMA 4BGBA 4CIEA 1W7AA 4AF1A 1HQUA 1V4SA 2P9SB 3OY9A 3NH1A 4FWOA 1EXQA 1JLFA 1N34K 3EE8A 1U45A 1TUUA 1S1WA 4JKCA 3IDHA 3VF2A 1DKGD 4CF2A 4TSXA 4FK4A 1GLJO 3TTCA 5GIOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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