1EQYA

Complex between rabbit muscle alpha-actin: human gelsolin domain 1
Total Genus 114
50100150200250300350020406080100120
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
359
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
S1 (8-12)TVIII1 (27-30)TI1 (13-16)EMPTYTII1 (21-24)S2 (16-21)S3 (29-32)S5 (53-54)S4 (35-38)S6 (65-68)O1 (32-34)TIV1 (38-51)AH1 (56-61)TIV3 (72-76)TVIII2 (69-72)TIV2 (71-75)AH2 (79-93)3H2 (98-100)S17 (357-358)TI10 (352-355)S7 (103-107)AH3 (113-127)TII2 (108-111)AH12 (337-347)AH9 (274-284)S8 (131-136)S9 (150-155)TIV4 (129-132)AH4 (137-145)TIV7 (165-168)TI4 (260-263)TIV5 (147-150)TIV6 (156-159)3H4 (264-267)S10 (160-166)3H3 (172-174)S11 (169-170)S13 (238-241)AH5 (182-196)AH7 (223-231)AH10 (290-295)AH6 (203-216)TVIII3 (220-223)TI2 (234-237)TI3 (242-245)S14 (247-250)AH8 (252-260)3H5 (287-289)AH11 (309-320)S15 (297-300)3H6 (302-304)TII3 (306-309)S16 (329-330)TI5 (322-325)TI6 (332-335)TI7 (334-337)TI8 (349-352)TI9 (350-353)TI11 (353-356)3H1 (62-64)S12 (176-178)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Contractile protein
source organism Homo sapiens
publication title Structure of gelsolin segment 1-actin complex and the mechanism of filament severing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GELSOLIN
total genus 114
structure length 359
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1eqyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1eqyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1eqyA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1eqyA04
2FSJA 4IO8A 5B8HA 3O8MA 2Q97A 3MK6A 4MO5A 1DGKN 4CZEA 3CI5A 3HTVA 2AA4A 4BVPA 3R8EA 4FOIA 1G99A 4BVOA 1YAGA 2HOEA 1NMDA 3O6WA 4EFHA 5CE3A 3I33A 4B1UB 4A2AA 1HKBA 2D0OA 4H5VA 5TKYA 2EWSA 3SMPA 4BRNA 2I7NA 3QFPA 3CERA 3FLCO 3LDQA 1YVNA 4EAHD 2CH6A 1K8KB 3WXLA 3MDQA 3F9MA 3VESA 4FWNA 5AQPA 5BRHA 4JHDB 5EY4A 5BN9A 1QQMA 3L4IA 3LDLA 5AQWA 4MLHA 1ATNA 3UKUB 4K41A 1ZXOA 3VGKA 3GE1A 3WEEB 4B1YB 2E2PA 3S41A 4BQLA 5I9EB 3A5NC 3QBXA 5BRFA 3ZETA 1P8ZA 3U9DA 2A3ZA 3R6MA 3FZHA 2YJFA 4HWIA 1SZ2A 1KAXA 5AQIA 4XH1A 2OANA 5AQGA 3DJCA 1NGCA 3C7NB 3ULEB 2P9IB 2Q1NA 2QM1A 1TUUA 1NLVA 1QZ5A 2YHXA 3OHRA 1EQYA 4M63C 3AARA 2KHOA 3LM9A 5EX5A 1NBWA 4A2BA 4BRHA 3MMVA 5AQFA 1T6DA 4DHYA 3ENOA 3WXKA 5AQTA 4I6MB 1GLAG 4NB4A 3WXJA 1E4GT 1D4XA 5AQKA 3FGUA 3M6GA 3IFRA 2YHWA 3U9ZA 4JD2B 5E84A 2E8AA 3H3OB 4CBXA 3VEWA 3MN5A 3EKUA 2CGLA 3B8AX 1DKGD 3W3DA 4H5TA 4IXCA 2BUPA 2H3GX 3M3ZA 3GL1A 4XH5A 3FR0A 1GLFO 2GEMA 3HZ6A 1KAZA 3QBWA 5ADXH 5BPNA 3QFUA 2IVNA 3ENHA 5ADXA 5F2RA 5AQHA 3DWLA 4A61A 3KVGA 2IVPA 3H6EA 1E4FT 3HI0A 1RFQA 5AQZA 3VOVA 3UKRA 3FZMA 4CD3A 2FXUA 4BRPA 4JNEA 1JCEA 5AQJA 4IZ9A 3BF3A 4IWVA 4YDUC 4C23A 5LJWA 1JCFA 2ASMA 4IJNA 5JLFA 3MN6A 4CZMA 2E2OA 1HLUA 2D4WA 4CZKA 1S3XA 1MWMA 1BOTO 1TUYA 1OKJA 3HM8A 4FPBA 2I7PA 5AQOA 1V4SA 5FPNA 1Q18A 4K25A 2FSKA 1C0GA 3LDPA 2P9LA 2F9TA 3IUCA 4HTLA 2GELA 4FWKA 2E2NA 1NWKA 4WQ5C 2P9PA 2QWMA 4F9OA 2NRHA 3VEZA 2DPNA 3H3NO 1JCGA 3D2EB 1BWFO 4LC9B 4QS8A 4YDUA 3LL3A 3WQTA 4BREA 2J4RA 2QWPA 1YUWA 2W41A 3DXMA 2QWRA 3H1QA 4XH4A 5AQSA 4BRIA 5AQYA 2E2QA 3TPQA 5KPTA 1HPMA 4WQ4C 3UE5A 5AZIA 2Q2RA 2V7YA 3BEXA 3AAPA 3C0BA 5F0XA 2YCHA 3FZLA 3EZWA 1XQSC 5AFUH 4XEIA 3QB0A 3ZETB 4E1JA 4BRQA 3CJCA 3LDOA 4O5FA 3VEYA 5AFUA 2YJEA 4H5NA 1U6ZA 2ZF5O 2PBDA 4B1XB 3GOIA 3HSCA 3CETA 3L0QA 2P9NA 4J8FA 4H0YB 4BR7A 2V7ZA 1X3MA 4CI6A 3QICA 5F1XA 4PKIA 3P4IA 2D1KA 3CJAA 3AAQA 3VGLA 3VERA 5AZJB 3GG4A 4EHUA 3FZFA 2IIRA 5BR9A 4BRCA 3EN9A 3WQUA 4BC2A 1J6ZA 4JAXA 3ZX0A 4BR9A 4MO4A 2QWNA 2A41A 3KZBA 1WUAA 5AQRA 4ISEA 2A40A 4PKGA 1ZBSA 3CIPA 3GBTA 1SAZA 4CZGA 5LY3A 1BA0A 3GDQA 1HX1A 5BRDA 2Q36A 4FPAA 1U2VA 1H1VA 4GNIA 4JHDA 1X3NA 4BQZA 3JXUA 2Q0UA 5KPRA 2FF3B 4BR0A 4CZFA 1QHAA 3J8AA 1RGIA 4O8KA 1NGEA 1XUPO 4Y0WA 3BF1A 4H0OA 5AQMA 3DAWA 3A5OC 2IVOA 3ID8A 5BPMA 1QZ6A 4B1WB 1NGGA 3QMLA 2V51B 2QW9A 4FWQA 1XC3A 3ZEUB 4WYBA 2P9KA 1BDGA 3VF6A 2P9LB 3UB5A 3QDKA 1IJJA 4QS9A 3SK3A 5AQVA 2W40A 4FWLA 3C7NA 3SMSA 3ZX2A 2P9PB 4H5WA 2AP1A 3L6QA 2GWJA 1ZC6A 2VYPA 3H1VX 4BRFA 3O08A 5ELZA 2WUSA 3MN9A 5AQUA 1T44A 4BRMA 4QS7A 1GLJO 1C0FA 2FLOA 2E20A 2NZTA 2V52B 4CZHA 1SQKA 1GLCG 4BRKA 3DXMB 5BPLA 4BR2A 2ZWHA 4KBOA 4BR4A 3WXIA 3LDNA 2ZGYA 2HF3A 5AZIB 3ZX3A 1RDWX 1QQNA 3VF4A 1BG3A 4H5RA 3ATVA 2HF4A 4M7YA 1LOTB 4PKHA 1MA9B 3RSEA 1LCUA 3HBTA 2GTDA 4GY2B 4CBWA 1TYQA 3DXKA 3CQYA 3I8BA 4H0PA 3CJ1A 3EO3A 2ASOA 2P9SA 1HUXA 4RCHA 1V4TA 2CH5A 4L3QA 1BUPA 4Z94A 4WQ5A 4BC5A 2P9NB 3D2FA 5JICA 2E1ZA 4A62A 3JS6A 2QXLA 4ISGA 1NGAA 2A6AA 4FO0A 4BRAA 4FWRA 5JMVA 1WOQA 3W0LA 4H03B 4DCHA 1ATRA 2P9UA 3VEOA 3H46O 3VPZA 3D7EO 4H0TB 1HKGA 3A5MC 1KAYA 3FE1A 4FWOA 3WT0A 2FF6A 4WQ4A 1NGFA 1QQOA 3D2EA 5LJVA 3A0IX 3SLCA 4CZLA 1Z05A 1GLDG 1GLLO 3CJBA 3O5BA 1U2VB 2NLXA 1S22A 4PL7A 4EIAA 1NGJA 4FWMA 1CZAN 5KQ8A 2YHYA 3VEVA 4DB3A 3MN7A 1GLBG 1MDUB 2CGKA 3A5LC 3LM2A 4FSVA 1NGIA 4BC4A 4ISFA 5AQLA 1BU6O 1BA1A 1K8KA 5EVZA 4BGBA 1YXQA 5AQNA 2HMPA 5AR0A 3VETA 5AQQA 1GLEG 2P9KB 5EXWA 2ITMA 2F9WA 3O4WA 3VF2A 4B1VA 2GUPA 3MCPA 4FOEA 3WUHA 4H0VB 3UKRB 2ZGZA 4AM7A 5E26A 4CD1A 1T6CA 3VGMA 1NGDA 1NGHA 1DEJA 3U8XA 4BG9A 5EOYA 3CQXA 3UKUA 2QWOA 3O1WA 4RWTA 3KHYA 3WEEA 1KXPA 3CJ9A 2VWBA 3FZKA 4B1ZA 1MWKA 3TU5A 4FL9A 4BROA 5KQDA 1ESVA 2E1YA 1NM1A 5AZJA 4K42A 3SJHA 1R59O 3CHWA 3O80A 3IMXA 4CZJA 3FFKB 2CGJA 3ULEA 3BP8A 2P9IA 5BREA 2ASPA 1HJOA 2FSNA 2QWQA 4NO7A 4EHTA 5BN8A 2D0PA 2E88A 5KPZA 4BG8A 4BGAA 3VENA 5JLHA 4CZIA 1X9JA 4IJAA 4K43A 2BTFA 4CBUA 4BR5A 3CJ7A 3U4LA 1IG8A 1Y64A 3AY9A 5FPEA 3RSEB 4BRDA 4RTFD 1BO5O 4H0XB 1TYQB 3DXKB 3O1BA 4I6MA 3EKSA 4FWSA 4MLEA 3G25A 4PL8A 2Q31A 2P9SB 4JD2A 4JN4A 4CJ7A 1NGBA 3IDHA 2A5XA 2VCPA 3R9PA 3D2FB 5FPMA 5AQXA 4AM6A 3EL2A 4BRGA 4DQ8A 3BUZB 1Z6RA 3VEXA 2QWLA 4BRLA 1HKCA 3A8YA 2Q0RA 2GWKA 4B9QA 2UYTA 3ZEUA 2PAVA 3H45C 2A42A 3ATUA 5FPDA 1ATSA 3M1FA 4BC3A 2P9UB 2YI1A 4FWPA 4M7XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4M3YA 3ZT0A 5HLFA 3PSFA 2Q97A 5FLXO 3THXB 3PV8A 2ATQA 2O8DA 1XC9A 4GW6A 4BVOA 3MXIA 4EFHA 3VQAA 1E3MA 4X64K 3NF7A 3BZKA 2HHIA 1K8AO 5FRNA 4JKGA 4A2AA 4CF1A 5TKYA 1SL0A 4CJQA 2D5RA 2EWSA 4C8MA 2HW3A 2HHVA 3CCJN 4LF5K 3QFPA 3CERA 1YVNA 2CH6A 3ASMA 2GUIA 1ASWA 2UXDK 4N56A 4FWNA 2RN2A 4DTSA 2X6SA 3AV9A 5BRHA 2NRTA 3T7ZA 3QO9A 3LDLA 2NUBA 4K41A 5KGWA 3O9SA 4B1YB 4FM1A 3S41A 4CJPA 3RMBA 1QVFM 4J2BA 2O8BB 2HNZA 2HMIA 2IC3A 3EYZA 2BH1A 4KHYA 5BRFA 3ZETA 3U9DA 4HWIA 1P90A 1SZ2A 2R7YA 4F3TA 5AQGA 1XNQK 3TR8A 3LZIA 2KQ2A 1NLVA 1QZ5A 2YHXA 1JLBA 3OYDA 3VQDA 4M63C 1IG9A 5C0YA 3O9QA 4WFAL 1VSKA 1VAZA 1BI4B 4CJKA 3O9TA 2ZJQL 1HYVA 3ENOA 3WXKA 5AQTA 3AO1A 1GLAG 2HNDA 1D4XA 5AQKA 4FYDA 2B6AA 5J2NA 5E84A 1VQ9N 2Z1IA 3VEWA 3B8AX 3TAQA 2H3GX 4IFYA 4JLHA 1GLFO 4IOCL 3OS1A 2IVNA 3DLEA 4JS5A 5ADXA 3SQ1A 2NRWA 3U6FA 1U04A 2BE2A 3KVGA 2IVPA 4TSXA 3HI0A 5AQZA 3UKRA 4RG8A 4CD3A 3LWLA 2YV0X 2QA4N 4C8NA 4WE1A 3QEIA 2O4IA 3EZ5A 4IZ9A 2NRZA 1CXUA 3M8SA 3MN6A 1EX4A 2E2OA 3VQPA 4CZKA 1HQUA 1TUYA 3SI6A 2I7PA 4KTQA 1VSJA 4ELTA 4Y1CA 4GKJK 2FSKA 3OBWA 1S1WA 3L3UA 2E4LA 4B9MA 2GELA 3SUPA 3QESA 1RT5A 3NF8A 3QEVA 2QWMA 2NRHA 2DPNA 3LP3A 4YNQA 4FZXC 3LL3A 4OKJA 3P83D 5K14A 1D5AA 1N34K 2QWPA 5CYQA 5LMUK 3ENBA 1IKXA 1HYSA 3DXMA 3H1QA 3TPQA 4O4GA 4Z4HA 1VSFA 3OYEA 4JKEA 3C0BA 4KKOA 4BACA 3FZLA 3EZWA 1QQCA 3DOLA 1A5WA 2A1RA 4E1JA 1GOAA 4JI7K 4WCEL 5AFUA 1JLEA 4H5NA 4JI3K 1VQKN 3OYCA 4JV5K 1EWQA 3HSCA 4CHYA 5M1OA 3CETA 4AHCA 4AHRA 3V9XA 4MDAA 4AF1A 3DRPA 4I7FA 2D1KA 3LAMA 4E89A 4MDBA 4RW6A 3CG7A 2G8HA 4EHUA 3V1QA 4JI8K 4CF8A 4L8RB 4BRCA 1TK5A 1EO1A 2O4GA 2G8KA 4BC2A 3EEQA 4ISEA 2A40A 4N76A 3SQ4A 2OTLN 1NKBA 2OZMA 3CC2N 3RMAA 1CLQA 2Z1GA 3AA5X 3K9JA 1UOCA 4JHDA 2YKNA 1GOBA 4BQZA 3KK7A 2O8FA 1RGIA 1K6YA 4FLZA 2X78A 3WNHA 1KVAA 3BF1A 4GVMA 2IVOA 4B1WB 1NGGA 4KHQA 3J81O 3QMLA 3ZEUB 4H8KA 3MXMA 4WYBA 3HXMA 3Q7CA 2P9LB 3CC4N 3F73A 2VWJA 4LF4K 2G8VA 3LALA 2XO7A 4XIUA 4FWLA 2FBYA 4Z0UA 3N4PA 2P9PB 5HP1A 4H5WA 1N5YA 2GWJA 1ZC6A 3H1VX 3RWUA 3PLAA 3O08A 3C95A 5GINA 2WUSA 3J7YP 4LFAK 3SUNA 4BRMA 3O4NA 3IRXA 5M1FA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4M3Y A;  3ZT0 A;  5HLF A;  3PSF A;  2Q97 A;  5FLX O;  3THX B;  3PV8 A;  2ATQ A;  2O8D A;  1XC9 A;  4GW6 A;  4BVO A;  3MXI A;  4EFH A;  3VQA A;  1E3M A;  4X64 K;  3NF7 A;  3BZK A;  2HHI A;  1K8A O;  5FRN A;  4JKG A;  4A2A A;  4CF1 A;  5TKY A;  1SL0 A;  4CJQ A;  2D5R A;  2EWS A;  4C8M A;  2HW3 A;  2HHV A;  3CCJ N;  4LF5 K;  3QFP A;  3CER A;  1YVN A;  2CH6 A;  3ASM A;  2GUI A;  1ASW A;  2UXD K;  4N56 A;  4FWN A;  2RN2 A;  4DTS A;  2X6S A;  3AV9 A;  5BRH A;  2NRT A;  3T7Z A;  3QO9 A;  3LDL A;  2NUB A;  4K41 A;  5KGW A;  3O9S A;  4B1Y B;  4FM1 A;  3S41 A;  4CJP A;  3RMB A;  1QVF M;  4J2B A;  2O8B B;  2HNZ A;  2HMI A;  2IC3 A;  3EYZ A;  2BH1 A;  4KHY A;  5BRF A;  3ZET A;  3U9D A;  4HWI A;  1P90 A;  1SZ2 A;  2R7Y A;  4F3T A;  5AQG A;  1XNQ K;  3TR8 A;  3LZI A;  2KQ2 A;  1NLV A;  1QZ5 A;  2YHX A;  1JLB A;  3OYD A;  3VQD A;  4M63 C;  1IG9 A;  5C0Y A;  3O9Q A;  4WFA L;  1VSK A;  1VAZ A;  1BI4 B;  4CJK A;  3O9T A;  2ZJQ L;  1HYV A;  3ENO A;  3WXK A;  5AQT A;  3AO1 A;  1GLA G;  2HND A;  1D4X A;  5AQK A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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